Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação, 2008. / Submitted by Jaqueline Oliveira (jaqueoliveiram@gmail.com) on 2008-11-28T12:09:59Z No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO_2008_GilbertoOliveiraHiragi.pdf: 895106 bytes, checksum: 181e2a9a782456ffe4637fc5519e09c8 (MD5) / Approved for entry into archive by Georgia Fernandes(georgia@bce.unb.br) on 2009-02-11T16:01:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO_2008_GilbertoOliveiraHiragi.pdf: 895106 bytes, checksum: 181e2a9a782456ffe4637fc5519e09c8 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-02-11T16:01:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO_2008_GilbertoOliveiraHiragi.pdf: 895106 bytes, checksum: 181e2a9a782456ffe4637fc5519e09c8 (MD5) / Os bancos de germoplasma do SIBRARGEN (Sistema Brasileiro de Informações em Recursos Genéticos) funcionam como um grande catálogo das espécies vegetais e de seus acessos (tipos característicos dentro de um grupo ou variabilidades dentro da espécie), contendo mais de 100 mil acessos catalogados. Esses bancos incluem a identificação do acesso (passaporte), descrição dos aspectos genótipos (caracterização) e descrição dos aspectos fenótipos (avaliação) e permitem aos pesquisadores dessa área realizarem consultas SQL mas recuperando apenas os dados armazenados, resultantes da resolução das expressões booleanas utilizadas como critérios de busca. Essas consultas não facilitam a descoberta de novos conhecimentos ou a construção de modelos de previsão ou descrição. Essa pesquisa propõe uma metodologia de mineração de dados, derivada do modelo de referência CRISP/DM, que auxilie a exploração dessas bases de dados por pesquisadores não vinculados à área de informática (por exemplo, biólogos ou agrônomos) visando facilitar a realização de tarefas previstas nas seguintes fases do CRISP/DM: entendimento do negócio, compreensão dos dados, preparação de dados, modelagem, avaliação dos modelos gerados e colocação em uso. Para materializar a metodologia proposta e automatizar a sua utilização por parte de não-informatas, foi implementada a ferramenta HaDog (Hiragi Approach for Data Mining of Germoplasm). HaDog foi implementada utilizando a linguagem Java, banco de dados Oracle® versão 10g release 2 e é acessível através de uma interface Web, disponível aos pesquisadores credenciados para acesso ao SIBRARGEN. A metodologia de mineração de germoplasma proposta foi avaliada de forma experimental através de dois estudos de casos conduzidos com o apoio de pesquisadores da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia: determinação de acessos representativos de uma espécie ou grupo de espécies e proposição de coletas direcionadas, ambos problemas típicos de interesse do curador (pesquisador responsável pelo banco de germoplasma de uma espécie). Essa avaliação experimental mostrou que é possível introduzir os especialistas na área na utilização de técnicas de mineração de dados na base de germoplasma sem requerem que eles se envolvam em atividades de programação. Os resultados experimentais obtidos até o momento demonstram que o HaDog pode se constituir em um importante facilitador para a mineração das bases do SIBRARGEN, visando, principalmente, a descoberta de novos conhecimentos pelos especialistas. _________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The banks of germplasm of the SIBRARGEN (Brazilian Information System in Genetic Resources) function as a great catalogue of the vegetal species and of its accesses (characteristic types inside of a group or variabilities inside of the species), contend more than 100 thousand catalogued accesses. These banks include the identification of the access (passport), description of the genotypes aspects (characterization) and phenotype description (evaluation) and allow researchers of this area to carry through SQL queries but recouping only the stored data, resultant of the resolution of the used boolean expressions as criteria search. These queries don’t facilitate to the discovery of new knowledge or the construction of forecast models or description. This research considers a data mining methodology, derived from the model of reference CRISP/DM, that assists the exploration of these databases for researchers tied with the computer science area (for example, biologists or agronomists) aiming to facilitate the accomplishment of tasks foreseen in the following phases of the CRISP/DM: business understanding, data understanding, data preparation, modeling, evaluation of the generated models and deployment. To materialize the methodology proposal and to automatize its use by people who aren’t of the computer science area, the HaDog tool was implemented (Hiragi Approach of Data Mining of Germplasm). HaDog was implemented using the Java language, database Oracle® version 10g release 2 and is accessible through a Web interface, available to the credential researchers for access to the SIBRARGEN. The methodology of mining of germplasm proposal was evaluated of experimental form through two studies of cases lead with the support of researchers of the Embrapa (Genetic Resources and Biotechnology: determination of representative accesses of a species or group of species and proposal of directed collections, both typical problems of interest of the custodian (responsible researcher for the Bank of germplasm of a species). This experimental evaluation showed that it is possible to introduce the specialists in the area in the use of techniques of mining of data in the base of germplasm without require that they become involved themselves in activities of programming. The experimental results obtained so far show that HaDog can be a major facilitator for the mining of foundations of SIBRARGEN, targeting mainly, the discovery of new knowledge by specialists.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-05-04T11:37:24Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2811528 bytes, checksum: 4991505eae55f570a52d7083c84d6347 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-04T11:37:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2811528 bytes, checksum: 4991505eae55f570a52d7083c84d6347 (MD5) Previous issue date: 2002-08-12 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Realizaram-se a avaliação e descrição das características morfológicas e agronômicas de 36 acessos de taro, do Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa (BGH/UFV), objetivando definir um padrão característico para cada acesso ou grupo de acessos, visando criar subsídios para programas de melhoramento genético com a cultura. O experimento foi conduzido na horta de pesquisas da Universidade Federal de Viçosa, no período de 19.09.2000 a 13.06.2001. Foi utilizado o delineamento de blocos casualizados, com 36 tratamentos (acessos) e cinco repetições. A parcela foi composta de quatro fileiras espaçadas de 1,0 x 0,5 m, com quatro metros de comprimento, totalizando 32 plantas; e a área, de 16,0 m2. Para as características morfológicas foram utilizados os descritores para o taro do International Plant Genetic Resources Institute (IPGRI). Dentre as características avaliadas, as que mais contribuíram para a distinção entre os acessos pertencentes ao BGH/UFV foram: número máximo de folhas por planta, margem da lâmina foliar, modelo da nervura, cor do pecíolo (terços superior, intermediário e basal), cor do anel basal do pecíolo, cor da bainha foliar, comprimento do rizoma principal e peso médio de rizomas laterais. Já as características que menos contribuíram, por não apresentarem variação entre os acessos, foram: posição predominante da superfície do limbo foliar, cor da nervura principal, espessura da periderme do rizoma principal e uniformidade de cor das raízes. Com poucas exceções, os acessos de taro pertencentes ao BGH/UFV apresentaram crescimento vegetativo com o seguinte perfil: porte alto (superior a 100 cm), expansão horizontal da planta média (50 a 100 cm), número máximo de folhas por planta entre 4 e 5 e número de rebentos máximo por planta entre 1 e 5. A formação de inflorescência, tipo aplanada ou encapuchada, foi observada em 30,56% dos acessos. Os acessos com inflorescências do tipo aplanada, com maior exposição da espádice, podem favorecer a polinização cruzada pela ação de polinizadores, enquanto os com inflorescência do tipo encapuchada são passíveis de autopolinização. Ambos os tipos de inflorescências, aplanada e encapuchada, apresentaram constrição na espata entre as partes feminina e masculina, o que pode ter impedido a polinização e, conseqüentemente, a fecundação, contribuindo para a não- formação de sementes de maneira natural. Os acessos BGH 5916, BGH 5917, BGH 6137, BGH 6298, BGH 6307 e BGH 6308 apresentaram as maiores produtividades de rizomas comerciáveis, não diferindo do clone Japonês-BGH 5925 e superando o Chinês-BGH 5928, ambos cultivados comercialmente. Os componentes primários com maiores correlações positivas e significativas com a produtividade de rizomas comerciáveis foram peso médio de rizomas comerciáveis, número de rizomas comerciáveis por planta e produtividade de rizomas filho grande. Os acessos Japonês-BGH 5925, BGH 5916, BGH 5917, BGH 6137, BGH 6298, BGH 6307 e BGH 6308, com as maiores produtividades de rizomas comerciáveis, apresentaram rizomas de formato cilíndrico ou oblongo, que são comercialmente desejáveis. / A description of the morphological characteristics and yield of 36 accesses of taro was conducted at the Horticultural Germplasm Bank, owned by the Federal University of Viçosa, from 09.19.2000 to 06.13.2001, to define a characteristic standard for each access or group of accesses, aiming to create a basis for genetic breeding programs using this culture. A randomized block design was used, consisting of 36 treatments (accesses) and five replicates. The plot was composed by four rows 1.0 x 0.5 m spaced and 4 m long, totaling 32 plants in an area of 16.0 m2. International Plant Genetic Resources Institute (IPGRI) taro descriptors were utilized for the morphological characterization. Among the characteristics appraised, the ones that most contributed to distinguish among the BGH/UFV taro accesses were: maximum number of leaves per plant, margin of the leaf lamina, vein model, petiole color (thirds superior, intermediate and basal), color of the basal ring of the petiole, color of the leaf sheath, length of the main rhizome and fresh weight of lateral rhizomes. Conversely, following, the following characteristics contributed little, for they did not show variation between the accesses: predominant position of the leaf lamina, color of the main vein, thickness of the periderm of the main rhizome and uniformity of color of the roots. With a few exceptions, the BGH/UFV taro accesses had vegetative growing with the following profile: height superior to 100 cm, average horizontal expansion of the plant from 50 to 100 cm, maximum number of leaves per plant between 4 and 5, and maximum number of lateral stems per plant between 1 and 5. The formation of inflorescence, flat or encapsulated, was observed in 30.56% of the accesses. The accesses with flat inflorescence, with greater spadix exposure, may favor crossed pollination due to pollinator action, while the accesses with inflorescence of the encapsulated type (hooded) allow self pollination. Both inflorescence types presented a constriction in the spathe, between the male and female portions, what may prevent pollination and, consequently, the fecundation, contributing to the non- formation of seeds, in a natural way. The clones BGH 5916, BGH 5917, BGH 6137, BGH 6298 BGH 6307 and BGH 6308 had the highest rhizome commercial productivity, similarly to the clone Japanese-BGH 5925 and higher than the clone Chinese-BGH 5928, both cultivated commercially. The primary components with the highest positive and significant correlations with commercial rhizome productivity were average fresh weight of commercial rhizomes (0.6370), number of commercial rhizomes per plant (0.7133) and productivity of large offspring rhizomes (0.9107). The accesses Japanese-BGH 5925, BGH 5916, BGH 5917, BGH 6137, BGH 6298, BGH 6307 and BGH 6308, which had the highest commercial rhizome productivity, presented rhizome of cylindrical or oblong shapes, which are commercially desirable.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-12T18:18:48Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 896730 bytes, checksum: fa1cb8d5d773efa7ed1f192f02a3e0b1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-12T18:18:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 896730 bytes, checksum: fa1cb8d5d773efa7ed1f192f02a3e0b1 (MD5) Previous issue date: 2003-12-05 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Os objetivos deste trabalho foram a obtenção de coleção núcleo, a partir da Coleção Ativa de Milho da Embrapa Milho e Sorgo, a avaliação de metodologias para obtenção de coleções núcleo de milho e a avaliação de sua adequação por meio de marcadores AFLP. Foi realizado levantamento da situação atual da coleção ativa, sendo considerados dados de passaporte, caracterização e avaliação dos acessos. As estratégias de amostragem foram baseadas em estratificação considerando, principalmente, a origem ecogeográfica e o tipo de grão, variando quanto à intensidade de amostragem, a forma de se determinar o número de acessos amostrados por extrato e no modo de identificar os acessos a serem amostrados nos extratos. A coleção núcleo adotada foi aquela com base em análise multivariada com intensidade de amostragem de 10% dos acessos. A partir das análises de dados moleculares (AFLP) foi verificada adequada representatividade da coleção núcleo adotada. / The objectives of this work were to obtain a nucleus collection from the Maize Active Collection of Maize and Sorghum Embrapa, to evaluate the methodologies available for obtaining maize nucleus collections and to assess its adequability by means of AFLP markers. The present situation of the active collection was assessed, considering passport, characterization and evaluation data of the accesses. The sampling strategies were based on stratification, considering mainly the ecogeographic origin, and grain type, varying in relation to sampling intensity, mode of determining the number of accesses sampled per extract and mode of identifying the accesses to be sampled in the extracts. The nucleus collection adopted was the one based on multivariate analysis with sampling intensity of 10% of the accesses. Based on the analyses of molecular data (AFLP), an adequate representativity of the nucleus collection adopted was verified. / Tese importada do Alexandria

Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-12-04T15:35:16Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 791377 bytes, checksum: eecc2873f556f6348ae12840ea578852 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-04T15:35:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 791377 bytes, checksum: eecc2873f556f6348ae12840ea578852 (MD5) Previous issue date: 2015-05-20 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O setor de tomate industrial se desenvolveu muito nos últimos anos, principalmente por causa da mecanização no campo de produção. Entretanto, podem ocorrer danos na colhedora e perda de qualidade do fruto porque a planta se desenvolve prostrada e o fruto sobre o solo. O objetivo foi caracterizar metabólica e bioquimicamente e, selecionar progenitores de tomate quanto a características agronômicas e de qualidade dos frutos para introgredir o gene de nanismo em germoplasma de tomate industrial, visando obter plantas de tomateiro com porte reduzido e frutos com alta qualidade industrial. Foram realizados dois experimentos, o primeiro em casa de vegetação para caracterizações metabólica e bioquímica e o segundo em campo para avaliação da capacidade combinatória e divergência genética. Para isso, foram utilizados quatro acessos de tomate de fenótipo anão e oito híbridos comerciais de tomate industrial. Observou-se nos resultados que plantas de fenótipo anão possuem menor crescimento, bem como, padrões de crescimento, alocação de biomassa, parâmetros fisiológicos e bioquímicos diferenciados, apesar de possuírem capacidade de assimilação de carbono parecida com as plantas de fenótipo normal. BGH-2006 é o acesso mais promissor para ser utilizado em programas de melhoramento para obter ganhos com características agronômicas e de qualidade do fruto, mas, maiores ganhos de redução do porte podem ser obtidos com o acesso BGH-2086. Contudo, é importante destacar que acessos devem ser utilizados basicamente para obter ganhos com porte da planta, sendo necessária a fixação de alelos para qualidade dos frutos a partir de germoplasma comercial. Por fim, a divergência genética pode ser utilizada na seleção de progenitores, tomando a estimativa da distância genética média como método eficaz na seleção dos melhores progenitores por possuir relação com a capacidade combinatória, podendo ser utilizada na redução de grande número de progenitores. / The processing tomato sector has grown in recent years, mainly because of mechanization in the production field. However, they can damage the harvester and loss of quality fruit because the plant develops prostrate and the fruit on the soil. The objective was to characterize metabolic and biochemical and, select tomato parents as the agronomic characteristics and fruit quality for introgress dwarfism gene in processing tomato germplasm in order to obtain tomato plants with reduced size and fruit with high industrial quality. Two experiments were conducted, the first in a greenhouse for metabolic and biochemical characterizations and the second in the field to test the combining ability and genetic divergence. For this, we used four dwarf phenotype tomato access and eight commercial hybrids of processing tomato. It was observed that the results dwarf phenotype plants have less growth, as well as patterns of growth, biomass allocation, different biochemical and physiological parameters, although they have similar carbon assimilation capacity with normal plant phenotype. BGH-2006 is the most promising access to be used in breeding programs for gains on agronomic characteristics and fruit quality, but greater size reduction gains can be achieved with BGH-2086 access. However, it is important to note that access should be used primarily for possession with gains of plant, requiring the establishment of alleles for fruit quality from commercial germplasm. Finally, the genetic divergence can be used in parental selection, taking an estimated average genetic distance as an effective method in the best parental selection for having relation with the combining ability and can be used in reducing the large number of parents.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-04-13T14:37:43Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 15404926 bytes, checksum: a8b04ee9995e204011a460fb2d269cc9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-13T14:37:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 15404926 bytes, checksum: a8b04ee9995e204011a460fb2d269cc9 (MD5) Previous issue date: 2016-02-23 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O Brasil é apontado como o mais importante centro de diversidade do maracujá e maior produtor mundial da fruta. Entretanto, a ocorrência de virose do endurecimento do fruto e a falta de variedades melhoradas, mais produtivas e com resistência às principais doenças limitam a qualidade e o potencial da cultura. A exploração da variabilidade genética dentro do gênero Passiflora constitui uma atividade importante no melhoramento para identificação de fontes de resistência às principais doenças do maracujazeiro e obtenção de novas variedades com atributos desejáveis. O primeiro capítulo teve como objetivo avaliar a reação de acessos do Banco de Germoplasma de Passiflora spp., ao CABMV e verificar a variabilidade genética disponível por meio de descritores morfológicos. Os resultados permitiram indicação e seleção de indivíduos com resistência/tolerância genética ao CABMV com destaque para os acessos BGP188 (P.edulis f. flavicarpa) e BGP 170 (P. malacophylla). Os agrupamentos indicaram grupos com potencial a serem utilizados em programas de melhoramento genético. Os descritores possibilitaram um melhor ordenamento das espécies P.edulis f. flavicarpa e nas demais espécies silvestres. O segundo capítulo teve com objetivo estimar a diversidade genética entre os acessos de maracujazeiro por meio de características físicos e químicas de frutos e indicar combinações para futuros trabalhos de melhoramento genético em Passiflora. As variáveis massa de casca, massa do fruto, diâmetro e comprimento de fruto contribuíram para a máxima variabilidade observada nos acessos de Passiflora. Para essas características cinco frutos são suficientes para predizer o valor real dos indivíduos com 90% de acurácia. Os caracteres rendimento de suco e acidez titulável apresentam baixa repetibilidade, indicando cautela na seleção de genótipos com base nessas características. O agrupamento UPGMA indicou a existência de variabilidade genética entre os acessos avaliados, apresentando grupos com acessos mais dissimilares com potencial a serem utilizados em futuras etapas de seleção e cruzamentos de genótipos. O terceiro capítulo teve como objetivo caracterizar morfologicamente e avaliar progênies da primeira geração de retrocruzamento para resistência ao CABMV. A incidência de virose avaliada nas progênies híbridas indicou que as progênies das séries RC1-H44 e RC1-H57, foram mais similares ao P. cincinnata, mais tolerantes ao CABMV e apresentaram baixos valores de absorvância. O híbrido RC1-H57-83 se destacou por apresentar menor índice de severidade do CABMV (15,6%), podendo ser utilizado como genitor feminino na geração RC2. A caracterização morfológica nas progênies híbridas possibilitou a identificação de indivíduos com características mais similares aos parentais e com diferentes graus de tolerância ao CABMV. O quarto capítulo teve como objetivo avaliar a recuperação do genoma recorrente em híbridos da primeira geração de retrocruzamento de Passiflora por meio de marcadores moleculares iPBS e selecionar genitores mais tolerantes ao CABMV. Os marcadores iPBS foram capazes de distinguir progênies RC1 de seus parentais e quantificou a recuperação do genoma recorrente. As progênies RC1-H57-89 e RC1-H49-77 com maior percentagem do genoma do genitor recorrente apresentam também maior severidade de virose. As progênies RC1-H57-85 e RC1-H57-91 por serem mais tolerantes ao CABMV são promissoras ao próximo ciclo de retrocruzamento. A análise de agrupamento revelou variabilidade genética entre as progênies RC1, o que demonstra potencial para serem utilizadas nas gerações seguintes de retrocruzamento. / Brazil is named as the most important passion diversity center and largest producer in the world of fruit. However, the occurrence of the virtual hardening of the fruit and the lack of improved varieties, more productive and resistance to major diseases limit the quality and potential of culture. The exploitation of genetic variability within the genus Passiflora is an important activity in improving to identify sources of resistance to major diseases of passion fruit and obtain new varieties with desirable attributes. The first study aimed to evaluate the reaction of hits the Germplasm Bank of Passiflora spp., to CABMV and verify the genetic variability available through morphological descriptors. The results allowed the nomination and selection of individuals with resistance / tolerance to genetic CABMV highlighting the BGP188 access (P. edulis f. flavicarpa) and BGP 170 (P. malacophylla). The groups indicated groups with potential to be used in breeding programs. The descriptors enabled better planning of species P. edulis f. flavicarpa and in other wild species. The second study was in order to estimate the genetic diversity among passion fruit accesses through physical-chemical characteristics of fruits and point combinations for future work on genetic improvement in Passiflora. The mass variables bark, fruit weight, fruit diameter and length contributed to the maximum variability observed in Passiflora hits. For these five fruit characteristics are sufficient to predict the actual value of individuals with 90% accuracy. The characters juice yield and acidity have low repeatability, indicating caution in the selection of genotypes based on these characteristics. The UPGMA indicated the existence of genetic variability among accessions, with groups with more dissimilar access with potential to be used in future stages of selection and genotypes crossings. The third study aimed to characterize morphologically and evaluate progeny of the first generation of backcrossing to resistance CABMV. The incidence of virus assessed in hybrid progenies indicated that the progenies of RC-H44 and RC1-H57 series, were more similar to P. cincinnata, more tolerant CABMV and had low absorbance values. The hybrid RC1-H57-83 stood out with less CABMV severity index (15,6%) and can be used as female parent in RC2 generation. Morphological characterization in hybrid progeny, allowed the identification of individuals with the most similar characteristics to parental and with different degrees of tolerance CABMV. The fourth study was to evaluate the recovery of recurrent genome in hybrids of the first generation of backcrossing Passiflora through molecular markers IPBS and select more tolerant parents to CABMV. The IPBS markers were able to distinguish RC1 offspring of their parents and quantified the recovery of recurrent genome. The RC1- H57-89 and RC1-H49-77 progenies with the highest percentage of recurrent parent genome also have greater severity of virus. The RC1-H57-85 and RC1-H57-91 progenies to be more tolerant CABMV are promising the next backcross cycle. Cluster analysis revealed genetic variation among progenies RC1, which demonstrates the potential to be used in the following generations of backcrossing.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-04-20T15:13:03Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 990368 bytes, checksum: e7f37a22972a6cdd2df052c7cb12529c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-20T15:13:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 990368 bytes, checksum: e7f37a22972a6cdd2df052c7cb12529c (MD5) Previous issue date: 2016-02-12 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O melhoramento de pimenteiras tem sido feito por meio de seleção massal em raças crioulas e, nos últimos tempos, alguns melhoristas têm dado ênfase ao uso da hibridação, portando o conhecimento da diversidade gerada a partir dos cruzamentos é de suma importância para o sucesso de um programa de melhoramento, assim os objetivos desse trabalho foram estudar a diversidade genética, selecionar genótipos resistentes ao etileno, indicar as pimenteiras como ornamentais de flores. Inicialmente foram selecionados seis acessos de pimenteira ornamental para compor um experimento em dialelo 6x6 de tabela completa, após produzidas e avaliadas todas as 30 F 1 do experimento, foram selecionadas as 6 mais promissoras. A (134x01), B (77.1x01), C (137x134), D (132x77.1), E (01x132), F (137x77.1), as seis populações F 2 originadas a partir da autofecundação das F 1 foram caracterizadas com base nos descritores de Capsicum sendo 13 descritores quantitativos e 17 qualitativos, cada população F 2 utilizada no experimento foi composta de 36 plantas, exceto as populações F e D com 26 e 35 plantas respectivamente. Para a análise da diversidade genética buscando uma que utilize todos essas características foram geradas três matrizes de diversidade genética, a distância Euclideana média para dados quantitativos, o complemento do índice de compatibilidade simples para dados qualitativos, e a terceira foi o produto do somatório das duas últimas, sendo esta utilizada para o agrupamento de Tocher, a população que teve maior diversidade genética foi a B, a C foi a que apresentou menor diversidade genética, porém a população C apresentou maior probabilidade de produzir linhagens resistentes ao etileno, pelo método de Jinks e Pooni (1976). Também foi estudada a possibilidade de pimenteira ser uma planta ornamental de flor, onde a população D apresentou os maiores valores para diâmetro da corola, 2,18 cm, um aumento de quase 1 cm em relação a média das variedades cultivadas atualmente. Concluísse que foi possível gerar diversidade genética com base nos cruzamentos, a população C foi a menos sensível ao etileno, a D a população com maior potencial para produção de linhagem de pimenta ornamental de flor. / The breeding of pepper has been achieved through mass selection in native races and, in recent times, some breeders have emphasized the use of hybridization in genetic enhancement programs. Therefore, the knowledge of the diversity generated by crossbreeds is critical to the success of genetic enhancement programs. In this context, the objectives of this study were to investigate the genetic diversity, the potential to produce strains resistant to ethylene, and whether it is possible to commercialize peppers before fruiting. Initially, six ornamental pepper accesses were selected to compose a 6x6 diallel complete table experiment. After the production and evaluation of all 30 F 1 of the experiment, the 6 most promising were selected. Six populations F 2 originated by selfing, identified as A (134x01), B (77.1x01), C (137x134), D (132x77.1), E (01x132), F (137x77.1), were characterized based on 13 quantitative and on 17 qualitative descriptors proposed by the Capsicum descriptors. Each F 2 population used in the experiment consisted of 36 plants, except for the F and D populations, each with 26 and 35 plants, respectively. For the genetic diversity analysis that would cover all the above mentioned features, three genetic diversity matrices were generated. The first was the mean Euclidian distance for quantitative data, the second was the complement of the simple compatibility index for qualitative data and the third was the product of the sum of the latter two matrices. The third matrix was used for the Tocher grouping. The population showing the highest genetic diversity was B, whereas population C showed the lowest. However, population C had the highest probability to produce ethylene resistant strains by the Jinks and Pooni method (1976). The possibility that pepper could be a flower ornamental plant was also investigated. Population D showed the highest values for corolla diameter (2.18 cm), meaning an increase of almost 1 cm with respect to the mean of the varieties cultivated nowadays. In conclusion, the potential of these populations to produce varieties of ornamental pepper is quite high, especially for containing materials that exhibit tolerance to ethylene.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2017-10-03T04:17:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 348734.pdf: 1809825 bytes, checksum: 0c27bb32dc90ca0cff2b73c913b100f2 (MD5) Previous issue date: 2017 / A utilização de sementes de qualidade garante rápida e uniforme germinação, com estabelecimento de plântulas vigorosas em uma ampla faixa de ambientes. A qualidade fisiológica, como um dos atributos da qualidade de sementes, é importante fator que precisa ser considerado pelos programas de conservação e de melhoramento de milho. O trabalho teve como objetivo verificar as alterações na qualidade fisiológica durante a obtenção de linhagens e o quanto as características de viabilidade, vigor e composição bioquímica podem ser controlados geneticamente. O trabalho foi desenvolvido com uma variedade de polinização aberta crioula (CRI), duas variedadeS de polinização aberta comerciais (VPA1 e VPA2) e dois híbridos simples comerciais (HIB1 e HIB2). As populações foram submetidas a sucessivas autofecundações até a quinta geração (S5). Para o estudo avaliou-se a influência da endogamia e o controle genético na viabilidade e no vigor de sementes; a estimativa da heterose e da capacidade geral e específica de combinação; a divergência genética e o perfil bioquímico das sementes de linhagens e híbridos e sua associação com o vigor de sementes; a influência da hidrólise e mobilização de proteínas, fósforo total, ácido fítico, fósforo inorgânico, amido e açúcares solúveis sobre o vigor das plântulas no estabelecimento inicial; e, a atividade das enzimas fitase e a-amilase durante a germinação associadas a plântulas com maior vigor. As populações apresentam comportamento distinto quanto aos efeitos da endogamia, de modo geral, todas apresentaram redução na viabilidade e vigor de sementes. Os híbridos apresentaram maior qualidade fisiológica em função da manifestação da heterose. A qualidade fisiológica das sementes está associada a mobilização e hidrólise de reservas. O padrão de hidratação, a maior hidrólise de proteínas de reserva e a maior mobilização de proteína solúvel explicaram o maior vigor de sementes. A maior hidrólise de amido e a maior mobilização de açúcares solúveis está associada a sementes de maior vigor, assim como a maior atividade das enzimas fitase e a-amilase, que apresentaram aumento gradual ao longo do processo germinativo.<br> / Abstract : The use of seeds with quality ensures rapid and uniform germination, with establishment of vigorous seedlings in wide environments. Physiological quality, one aspect of seed quality, is important for maize conservation and breeding programs. The objective of this work was to verify changes in physiological quality during inbred lines obtainment and how much the characteristics of viability, vigor and biochemical composition can be controlled genetically. The work was developed with a landrace (CRI), two commercial open pollinated varieties (VPA1 and VPA2) and two commercial single hybrids (HIB1 and HIB2). Populations were submitted to successive self-pollination up to a fifth generation (S5). For the study, influence of inbreeding and genetic control on the viability and vigor of seeds was evaluated; estimative of heterosis and general and specific combining ability; genetic divergence and biochemical profile of inbred lines and hybrids seeds and their association with seed vigor; influence of hydrolysis and mobilization of proteins, total phosphorus, phytic acid, inorganic phosphorus, starch and soluble sugars on the vigor of the seedlings in the initial establishment;and, phytase and a-amylase activity during germination associated with seedlings with higher vigor. Populations are different behavior in terms of the effects of inbreeding, in general, all populations reduced viability and seed vigor. The hybrids showed higher physiological quality due the heterosis manifestation. Physiological seeds quality was associated with mobilization and hydrolysis of reserves. Hydration pattern, higher hydrolysis of proteins and higher mobilization of soluble protein explained higher seed vigor. Higher starch hydrolysis and higher mobilization of soluble sugars were associated with seed vigor as well as higher activity of phytase and a-amylase enzymes, which also showed a gradual increase throughout the germination process.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-01-27Bitstream added on 2014-06-13T19:34:15Z : No. of bitstreams: 1 almeida_cim_me_botfca.pdf: 945601 bytes, checksum: 6435d3ea2562f66771326449a1fed1c5 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O presente trabalho objetivou coletar germoplasma sexuado (aquenios) de uma populacao de Lychnophora ericoides Mart, avaliar caracteristicas germinativas de seus aquenios e o efeito de doses de fosfato sobre o crescimento inicial e atividade in vivo da enzima fosfatase acida. A 2 L.erioides e uma especie medicinal brasileira com potencial farmacologico e vulneravel a extincao. Em 29 de maio de 2004 foi avaliada a populacao Paraiso Perdido na cidade de Sao Joao Batista do Gloria- MG. Durante a coleta, obteve-se as coordenadas geograficas por GPS (20º 37' 54 S e a 46º 19' 37 W a 833,6m de altitude), coletou-se germoplasma (aquenio (frutos secos indeiscentes)). O solo da populacao e litolico com fracao intemperizada de textura franco arenosa, muito acida, distrofica. A densidade populacional e de 0,16 individuos por m2 com 0,078 jovens por adulto. A fenofase predominante foi a frutificacao (100% dos individuos) seguida pela floracao (21,62 individuos). A porcentagem de germinacao dos frutos totais (PGT) foi de 0,33 % e dos frutos viaveis (PGV) foi de 21 % com numero medio de dias para germinacao (MD) de 40 l 5 dias apos o semeio. O indice de sincronismo da germinacao de (. bits) foi de .0,36. A L. ericoides foi classificada como planta de germinacao lenta (MD>10 dias). O experimento de efeito de doses de P2O5 (0; 40; 80; 160 mg dm-3) sobre mudas de L.ericoides foi realizado por 130 dias em casa de vegetacao em DIC com cinco repeticoes. A L.ericoides apresentou eficiencia em absorver o P com reflexo significativo na taxa de crescimento diario e producao de massa de materia seca com variacao nos indices de distribuicao de massa entre as partes da planta. A producao de massa de materia seca foliar foi linear com maximo na dose de 160 mg dm-3 de P2O5, contudo, a ditribuicao da massa de materia seca para 90 % da resposta maxima foi na dose de 101,15 mg dm-3 P2O5. A atividade da enzima... / The objetive of this work was collet achenes of one population of Lychnophora ericoides Mart., to evaluate germination of achenes and the efect of phosphorus levels in the initial 4 growth and in vivo activity of the acid phosphatase. The L. ericoides is brasilian medicinal specie with pharmacology potential aplication, and is vulnerable to extinction. In May 29 of 2004 was evaluated Paraiso Perdido population of Sao Joao Batista do Gloria city-MG (20ØX 37LOE 54L S; 46o 19LOE 37 W; 833 meter of altitude). The soil of this population is litolic with texture sandy, acid and distrofic. The population density is 0,16 plant per square meter, and 0,078 young plant/adult plants. The predominante fenology phase was frutification (100% of plants) folowed for flour phase (21,62 % of plants). The germination pecentage of total achenes was 0,33 %, but after densimetric selection in water the germination was 21 %. The mean days to germination or emergence (MD) was 40 LÓ 5 days after to sow, with index sincronism . (bits) was LV0,36. L. ericoides was classified as a plant slow germination (MD> 10 days). On the study of the efect of phosphorus levels (0; 40; 80; 160 mg dm LV3) in the L. ericoides was realized during 130 days in green house conditions. The experimental design was enterely randomized with five repetitions. The L. ericoides presented efficiency in absorbing phosphorus. This fact had significant consequence in the grwth tax, production and partition of dry mass matter. The production of leaf dry mass matter was bigger with 160 mg dm-3, however, the best of the dry mass partition was in level steem of 101, 15 mg dm-3. The acid phosphatse presented a minimum of activity in the phosphorus leaf text of 0,83 g Kg-1. Key Words: Arnica-da-serra...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:41Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-08-31Bitstream added on 2014-06-13T18:54:58Z : No. of bitstreams: 1 isobe_mtc_me_botfca.pdf: 987112 bytes, checksum: 67b1de5e7f11df70311b90461e76ad6f (MD5) / A espécie Lychnophora pinaster, espécie microendemica do Cerrado brasileiro, encontra-se na categoria vulnerável da lista vermelha das espécies ameaçadas de extinção da flora de Minas Gerais. Amplamente utilizada na medicina popular, esta espécie sofre o impacto do constante extrativismo desordenado e a degradação do seu ambiente natural. O objetivo deste tabalho foi avaliar a influência de duas épocas de colheita (verão e inverno) no rendimento e na composição química dos óleos essenciais de populações nativas de Lychnophora pinaster Mart e caracterizar morfologicamente as folhas e os tricomas glandulares, gerando informações relevantes para potencial uso da espécie. Foram amostradas três populações nativas de L. pinaster, oriundas dos municípios de Carrancas, Lavras e Itumirim no Estado de Minas Gerais. O óleo essencial das folhas de cada indivíduo foi extraído por hidrodestilação e analisados em cromatógrafo a gás acoplado a espectrômetro de massas (CG-EM, Shimadzu, QP-5000). Para a caracterização da anatomia foliar foram selecionadas folhas jovens e adultas de um indivíduo proveniente do banco de germoplasma localizado em Campinas-SP. Foram analisadas lâminas permanentes e semi-permanentes e realizados testes histoquímicos para identificar e localizar as principais classes químicas dos metabólitos presentes nas folhas. Todo o laminário obtido foi analisado em microscópio Olympus BX41 equipado com câmera digital Olympus C7070. As análises da morfologia do indumento foliar foram... / Lychnophora pinaster Mart is one of the microendemical species of the Brazilian Cerrado and it is in the vulnerable category of the Red List of endangered species of the Minas Gerais flora. Widely used in folk medicine, this species suffers the impact of constant non-organized extractivism and degradation of its natural environment. The objective of this research was to evaluate the influence of two harvest seasons (summer and winter) on the yield and chemical composition of the essential oil from native populations of L. pinaster and the morphological characterization of the leaves and glandular trichomes, generating relevant information about the potential use of the species. Was sampled three native populations of L. pinaster, at Carrancas, Lavras and Itumirim localities in the State of Minas Gerais (Brazil). The essential oil from the leaves of each individual was extracted by hydrodistillation and analyzed by gas chromatography coupled to mass spectrometry (GC-MS, Shimadzu QP-5000). To characterize the leaf anatomy, old and young leaves were selected 4 from a single plant of the Campinas-SP germoplasm bank. We analyzed permanent and semipermanent slides and histochemical tests were performed to identify and locate the main chemical classes of metabolites present in the leaves. The entire slide collection obtained was analyzed in Olympus BX41 microscope equipped with Olympus C7070 digital camera. The morphological analysis of the leaf indumentum was performed in scanning electron microscope (SEM), FEI Quanta 200 (Philips). The results of seasonality showed no significant difference in the average yield of the essential oil production within populations, but we observed a lower average yield of essential oil in the population from Carrancas. Trans-methyl cinnamate and trans-caryophyllene were... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-03-24Bitstream added on 2014-06-13T19:21:42Z : No. of bitstreams: 1 batistini_ap_dr_jabo.pdf: 647626 bytes, checksum: 4539039c5222292b6b064ca5d3f95e8a (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Unaerp / Anemopaegma arvense é uma planta medicinal endêmica do cerrado com princípios ativos contra o câncer, a malária e a AIDS. O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade morfológica, genética e química de sete populações naturais coletadas no cerrado remanescente do estado de São Paulo nos municípios de Itatinga, Bauru, Brotas, Iaras, Pedregulho, Estação Experimental de Paraguaçú Paulista e Reserva Biológica de Moji-Guaçú. As metodologias realizadas foram: a identificação taxonômica com uma chave de identificação; análise genética, com a técnica de Polimorfismo de DNA Amplificado ao Acaso (RAPD) e análise química com os marcadores triterpenos betulina, ácido betulínico, ácido oleanólico e ácido ursólico. Na identificação taxonômica foram registradas as quatro variedades: arvense, pubera, latifolia e petiolata, sendo que as variedades pubera e arvense predominaram nos locais de coleta à leste do estado, a variedade latifolia predominou no oeste, e no centro do estado há uma ocorrência de todas as variedades indistintamente. Na análise genética, a maior parte da variação foi encontrada dentro de populações, e a alta estruturação populacional encontrada segue o modelo de ilhas. Os indivíduos coletados apresentaram quimiotipos distintos que foram separados em 4 grupos. Trinta e sete dos 106 indivíduos coletados (cerca de 1/3 do total) foram selecionados para serem conservados em banco de germoplasma in vitro. Assim, a conservação da diversidade genética de A. arvense pode ser garantida e disponibilizada como matéria-prima na indústria farmacêutica brasileira. / Anemopaegma arvense is an endemic species native to Brazilian cerrado regions with bioactive agents effective on the treatment of cancer, malaria and HIV. The objective of this work was to evaluate to morphologic, genetic and chemical diversity of seven natural populations of A. arvense collected in remaining areas of cerrado in the state of São Paulo more specifically in the localities of Itatinga, Bauru, Brotas, Iaras, Pedregulho, Experimental Station of Paraguaçú Paulista and Biological Reserve of Moji-Guaçú. Taxonomic identification was developed using an identification key; RAPD genetic analysis and chemical analysis using the triterpenoid markers betulin, betulinic acid, oleanolic acid and ursolic acid. Based on the taxonomic identification four varieties were recorded: arvense, pubera, latifolia and petiolata. The varieties pubera and arvense occur mainly in the East of the state, the variety latifolia happens in the West and the four varieties were found indistinctly in the interior of the state. Genetic analysis demonstrated great variability inside populations and that the populational structure found follows the model of islands. The accessions collected, presented different chemotypes and were divided in 4 groups. Among the 106 individuals collected, 37 were selected (about 1/3 of the total) and were introduced in the in vitro germplasm bank to assure the genetic diversity preservation of A. arvense and permit supplying pharmaceutical industry with crude material.