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Estudo das caracteristicas clinicas e histomorfometricas da pele de gatos cronicamente exposta ao sol

Almeida, Ellen Maria Pestili de 04 August 2018 (has links)
Orientadores: Maria Leticia Cintra, Elemir Macedo de Souza / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-04T10:55:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Almeida_EllenMariaPestilide_D.pdf: 894147 bytes, checksum: 43a95b2b09ff719ce01f32082c825c23 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: Fotodano tem sido bastante estudado em humanos, mas pouco nos gatos. O propósito deste estudo foi o de investigar a evolução clínica e características histomorfométricas dos efeitos da exposição solar crônica na pele do gato (dermatose solar: DS). Pele da orelha de 34 gatos domésticos, sem raça definida, cronicamente exposta ao sol foi classificada, com base clínica, em: grupo 0: normal (n= 13); grupo 1: estágio inicial de DS (n= 10); grupo 2: estágio avançado de DS (n= 11). Sexo e idade do gato, assim como a cor da orelha que foi selecionada para biopsia foi anotada. Secções histológicas foram coradas com hematoxilina-eosina e as características microscópicas foram examinadas às cegas e independentemente por dois pesquisadores em 10 campos seqüenciais lineares. A celularidade dérmica foi estudada através do uso de uma gratícula morfométrica de ciclóides posicionada em 10 campos seqüenciais. Espessura da epiderme e área relativa de anexos foi obtida através de imagens digitalizadas, com ajuda de um fotomicroscópio Axiophot (Carl Zeiss - KS300 system). Os resultados foram avaliados através dos seguintes métodos estatísticos: ANOVA, Kruskall Wallis, correlação Spearman, Análise de Variância com pós-teste de Duncan, e Análise Discriminante Linear. Idade mais avançada, orelha de cor branca, edema dérmico, esclerose, telangiectasia, redução da área de anexos e escamotização das células epidérmicas basais foram significantemente associados com o estágio avançado da dermatose solar. Os animais desenvolveram espessamento da epiderme desde a fase inicial. Nossos resultados indicam um alto nível de hipersensibilidade ao sol da pele de gatos, cujas características são comparáveis aos efeitos da radiação crônica em humanos / Abstract: Photodamage has been extensively studied in man but little is known about it in the cat. The purpose of the present study was to investigate the evolutionary clinical and histomorphometric features of chronic solar exposure effects in the cat skin (solar dermatosis: SD). Ear skin of 34 domestic shorthair cats that were chronically exposed to sun were classified, on clinical basis, as follows: group 0: normal (n= 13); group 1: initial stage of SD (n= 10); group 2: advanced stage of SD (n= 11). Sex and age of the cat, as well as the colour of the ear that was submitted to biopsy were recorded. Histological sections were stained with haematoxylin-eosin and microscopic features were blindly and separately recorded by 2 examiners in 10 sequential linear high power fields (HPF). Dermal cellularity was studied through a cycloid morphometric grid positioned in ten sequential HPF. An objective assessment of the epidermal thickness and relative adnexal unit area was obtained in digitalized images, with the aid of an Axiophot photomicroscope (Carl Zeiss - KS300 system). Results were evaluated through the following statistical methods: ANOVA, Kruskall Wallis, Spearman correlation, Variance analysis with post test of Duncan, and Linear Disciminant Analysis. Older age, white-colour ear, dermal oedema, sclerosis, telangiectases, reduced adnexal area and squamotization of epidermal basal cells were significantly associated to advanced stage of sun dermatosis. The animals developed thickening of epidermis since the initial phase. Our results indicate a high level of skin hypersensibility to sun rays in cats whose characteristics are comparable to human chronic radiation effects / Doutorado / Anatomia Patologica / Doutor em Ciências Médicas
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Análise dos subtipos imunoistoquímicos de câncer de mama em um hospital de referência oncológica no Amazonas / Analysis of immunohistochemical subtypes of breast cancer in an oncological reference hospital in Amazonas

Paolino, Bruno Monção, 92 994661778 19 October 2018 (has links)
Submitted by BRUNO PAOLINO (bmpaolino@yahoo.com.br) on 2018-12-07T02:36:08Z No. of bitstreams: 3 Dissertação completa.pdf: 1803621 bytes, checksum: 6081a3c88de2cedb56635e73dd3dc24b (MD5) Ata Bruno PPGRACI.pdf: 1156318 bytes, checksum: 0034d1e6f901914b8f0073e03b9e2a27 (MD5) carta de encaminhamento.pdf: 383483 bytes, checksum: 08477f290b8c4ad0cb60c0a0421f6c04 (MD5) / Approved for entry into archive by PPGRACI Cirurgia (ppgraci@ufam.edu.br) on 2018-12-12T02:32:22Z (GMT) No. of bitstreams: 3 Dissertação completa.pdf: 1803621 bytes, checksum: 6081a3c88de2cedb56635e73dd3dc24b (MD5) Ata Bruno PPGRACI.pdf: 1156318 bytes, checksum: 0034d1e6f901914b8f0073e03b9e2a27 (MD5) carta de encaminhamento.pdf: 383483 bytes, checksum: 08477f290b8c4ad0cb60c0a0421f6c04 (MD5) / Approved for entry into archive by PPGRACI Cirurgia (ppgraci@ufam.edu.br) on 2018-12-12T02:31:21Z (GMT) No. of bitstreams: 3 Dissertação completa.pdf: 1803621 bytes, checksum: 6081a3c88de2cedb56635e73dd3dc24b (MD5) Ata Bruno PPGRACI.pdf: 1156318 bytes, checksum: 0034d1e6f901914b8f0073e03b9e2a27 (MD5) carta de encaminhamento.pdf: 383483 bytes, checksum: 08477f290b8c4ad0cb60c0a0421f6c04 (MD5) / Approved for entry into archive by PPGRACI Cirurgia (ppgraci@ufam.edu.br) on 2018-12-12T02:29:36Z (GMT) No. of bitstreams: 3 Dissertação completa.pdf: 1803621 bytes, checksum: 6081a3c88de2cedb56635e73dd3dc24b (MD5) Ata Bruno PPGRACI.pdf: 1156318 bytes, checksum: 0034d1e6f901914b8f0073e03b9e2a27 (MD5) carta de encaminhamento.pdf: 383483 bytes, checksum: 08477f290b8c4ad0cb60c0a0421f6c04 (MD5) / Approved for entry into archive by PPGRACI Cirurgia (ppgraci@ufam.edu.br) on 2018-12-12T02:42:10Z (GMT) No. of bitstreams: 3 Dissertação completa.pdf: 1803621 bytes, checksum: 6081a3c88de2cedb56635e73dd3dc24b (MD5) Ata Bruno PPGRACI.pdf: 1156318 bytes, checksum: 0034d1e6f901914b8f0073e03b9e2a27 (MD5) carta de encaminhamento.pdf: 383483 bytes, checksum: 08477f290b8c4ad0cb60c0a0421f6c04 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-12-12T02:42:10Z (GMT). No. of bitstreams: 3 Dissertação completa.pdf: 1803621 bytes, checksum: 6081a3c88de2cedb56635e73dd3dc24b (MD5) Ata Bruno PPGRACI.pdf: 1156318 bytes, checksum: 0034d1e6f901914b8f0073e03b9e2a27 (MD5) carta de encaminhamento.pdf: 383483 bytes, checksum: 08477f290b8c4ad0cb60c0a0421f6c04 (MD5) Previous issue date: 2018-10-19 / BACKGROUND:Breast cancer is the most frequent neoplasm in female population worldwide. In Brazil, a total of 59,700 new cases is estimated for 2018, being the main oncological cause of female death in the country. The expression of estrogen receptors (ERs) and progesterone receptors (PRs) and overexpression of human epidermal growth factor receptor-2 (HER2) have been identified as important predictive factors among breast cancer patients, being currently used to define the treatment and establish the prognosis of the disease. GOALS: The purpose of the present analysis was to identify the frequency of immunohistochemical subtypes of invasive breast cancers treated at Fundação Centro de Controle de Oncologia do Estado do Amazonas (FCECON), which are registered in the pathology laboratory of the institution, and to reach its purpose, specific objectives were set: i) to identify the frequency of hormone-receptor positivity in carcinomas-in-situ (CIS); ii) to identify the frequency of the histopathological subtypes of the case series; iii) to relate the age and gender of patients in the case series according to the histopathological and immunohistochemical status of the lesion; and; iv) suggest strategies that facilitate the dissemination and understanding of the meaning of the results of immunohistochemistry for breast cancer patients using research data. METHOD: For this, an observational, descriptive and retrospective study was conducted with breast cancer diagnosed patients and also those with an immunohistochemistry medical report in the files of the FCECON pathology laboratory, in Manaus, Amazonas, during a 9-year period. Data was obtained from secondary data sources and later included in an EXCEL database and transferred to STATA® Version 13 where the statistical calculations were performed. RESULTS: It had been studied 1604 cases of patients diagnosed with breast cancer treated at the FCECON from 2008 to 2016, averaging 178.2 cases per year. Of these cases, 1597 (99.6%) were female and 7 (0.4%) were male. In the female cases, the age ranged from 25 to 95 years (average 52.6 years). The percentage of women under 40 years was 14.8%, within 40 years to 65 years was 68.2% and more than 65 years was 17%. The most frequent histopathological type was invasive ductal carcinoma (IDC) with 89.9%. The most common subtype was Luminal B (LB) with 32.6% of cases, followed by Negative Triple (TN) 24.3%. In the frequency of immunohistochemical subtypes a difference was observed between age groups (p <0.001), with the average age of LA being the highest at 57.2 years and LH the lowest at 49.9 years followed by TN 51, 1 year (p <0.001). CONCLUSION: In general, thr patients are predominantly female, IDC and LB were the most frequent histological and immunohistochemical type. There was a statistically significant difference in the frequency by histological and immunohistochemical types. The most frequent carcinoma-in-situ was DCIS and most had negative hormone receptors. In men, IDC and LB were the most frequent histological and immunohistochemical types. It was suggested the development of an Android Platform software with these data in order to help in understanding prognostics and predictive meanings of these exams as well as to help in health policies for this sector. / JUSTIFICATIVA: O câncer de mama é a neoplasia mais frequente na população feminina mundial. No Brasil estima-se para 2018, 59.700 casos novos, sendo a principal causa oncológica de óbito feminino no país. A expressão dos receptores hormonais receptores de estrogênio (RE) e de progesterona (RP) e a superexpressão do receptor-2 do fator de crescimento epidérmico humano (HER2) foram identificadas como importantes fatores preditivos entre as pacientes com câncer de mama, sendo atualmente usados para definição do tratamento e estabelecimento do prognóstico da doença. OBJETIVOS: O objetivo geral foi caracterizar a frequência dos subtipos imunoistoquímicos dos cânceres de mama invasivos atendidos na Fundação Centro de controle de Oncologia do Estado do Amazonas (FCECON) que possuem registro no laboratório de patologia daquela instituição, e como objetivos específicos:i) identificar a frequência de positividade de receptores hormonais nos carcinomas in situ (CIS); ii) identificar a frequência dos subtipos histopatológicos dos casos da casuística; iii) associar a idade e o sexo dos pacientes da casuística segundo o status histopatológico e imunoistoquímico da lesão; e; iv) sugerir estratégias que facilitem a divulgação e o entendimento do significado dos resultados da imunoistoquímica para pacientes com câncer de mama usando dados da pesquisa. MÉTODO: Foi realizado um estudo observacional,transversal, descritivo, retrospectivo de pacientes com diagnóstico de câncer de mama e com laudo imunoistoquímico nos arquivos do laboratório de patologia da FCECON, Manaus, Amazonas, no período de 9 anos. Os dados foram obtidos de fontes secundárias de dados e posteriormente incluídos em banco de dados no EXCEL e transferidos para STATA® Versão 13 onde foram realizados os cálculos estatísticos. RESULTADOS: Foram estudados 1604 casos de pacientes com diagnóstico de câncer de mama atendidas na FCECON no período de 2008 até 2016, média 178,2 casos por ano. Destes 1597 (99,6%) foram casos femininos e 7 (0,4%) masculinos. Nos casos femininos a idade variou de 25 a 95 anos (media 52,6 anos). A porcentagem de mulheres abaixo de 40 anos foi de 14,8%, ≥ 40 anos e < 65 anos foi de 68,2% e ≥ 65 anos foi de 17%. O tipo histopatológico mais frequente foi o carcinoma ductal invasivo sem outra especificação (CDI) com 89,9 %. Pela classificação imunoistoquímica dos carcinomas invasivos o subtipo mais comum foi o luminal B (LB) com 32,6 % dos casos seguido pelo Triplo Negativo (TN) 24,3%. Foi observada uma diferença entre a frequência dos subtipos imunoistoquímicos entre as faixas etárias (p<0,001), sendo a média de idade do LA a mais alta com 57,2 anos e LH a mais baixa com 49,9 anos seguido pelo TN 51,1 anos (p<0,001). CONCLUSÃO: De um modo geral as pacientes são predominantemente do sexo feminino, o CDI e o LB foram respectivamente o tipo histológico e imunoistoquímico mais frequentes dos cânceres invasivos. Houve uma diferença estatisticamente significativa na frequência por idades dos tipos histológicos e imunoistoquímicos nos cânceres invasivos. O CIS mais frequente foi o CDIS e a maioria apresentou receptores hormonais negativos. Nos homens o CDI e o LB foram os tipos histológicos e imunoistoquímicos mais frequentes. Foi sugerido o desenvolvimento de um software em Plataforma Android com estes dados de forma a auxiliar no entendimento dos significados prognósticos e preditivos destes exames assim como ajudar nas políticas de saúde para este setor. / Trabalho sobre pacientes com câncer de mama na cidade de Manaus, Estado do Amazonas.
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Avaliação imuno-histoquimica com enfase para CD7 no diagnostico diferencial entre infiltrações linfocitarias cutaneas benignas e micose fungoide

Cotta, Ana Cristina da Silva 04 August 2018 (has links)
Orientador: Jose Vassallo / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-04T10:59:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cotta_AnaCristinadaSilva_D.pdf: 741571 bytes, checksum: 3587b25cef0824942ecc681152c99878 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: Micose fungóide (MF) é a forma mais comum de linfoma cutâneo de células T. Nos estágios iniciais, pode mimetizar dermatites crônicas. MF é, geralmente, CD3+ e CD4+. CD7 é expresso em cerca de 90% dos linfócitos T CD4+ e está, freqüentemente, ausente nas células T malignas. O objetivo deste estudo foi avaliar a utilidade da detecção imuno-histoquímica de CD3 e CD7 (clone CBC.37) no diagnóstico diferencial de MF e dermatites benignas. Todos os casos foram submetidos a um painel imuno-histoquímico constituído pelos anticorpos CD3, CD7, CD20, CD4, CD8 e CD30. Foram selecionados 42 pacientes. Correlação clínico-patológica havia estabelecido o diagnóstico de MF em 31 e, infiltrações linfocitárias cutâneas benignas, em 11. Foi realizada avaliação semi-quantitativa da porcentagem de células coradas às reações imuno-histoquímicas para todos os anticorpos avaliados, tanto em visão panorâmica de menor aumento, quanto em 10 campos consecutivos em maior aumento. Para análise estatística, foi utilizado o teste t de Student. As médias das porcentagens de células CD3 positivas foram similares em pacientes com MF e dermatites benignas, respectivamente, 86 (+/-9)% versus 79 (+/-26)% (p=0,807). Já a média das porcentagens de células CD7 positivas foi de 54 (+/-32)% nos pacientes com MF e de 74 (+/-22)% nas dermatites benignas (p=0,048). A avaliação semi-quantitativa revelou perda considerável do CD7 em relação ao CD3 nos pacientes com MF. A média de células coradas na MF foi de 86 (+/-9)% para CD3 e 54 (+/-32)% para CD7 (p<0,001), e, nas dermatites benignas, 79 (+/-26)% para CD3 e 74 (+/-22)% para CD7 (p=0,669). Concluímos que o estudo do CD7 pode ser ferramenta valiosa para a distinção entre inflamação e neoplasia, nas desordens linfoproliferativas da pele / Abstract: Mycosis fungoides (MF) is the most common form of primary cutaneous T-cell lymphoma. In early stage, it may mimic benign dermatoses both, on clinical and histological basis. MF usually expresses CD3 and CD4 (T-cell) markers. CD7 is expressed on about 90% of CD4+ T cells and is often deficient on malignant T cells. Thus, CD7 is of potential aid in the evaluation of the nature of dermal lymphoid infiltrates. The aim of this study was to evaluate the usefulness of immunohistochemical detection of T-cell markers on paraffin-embedded sections, CD3 and CD7 (clone CBC.37) in the differential diagnosis of MF and benign dermatoses. All cases were submitted to CD3, CD7, CD20, CD4, CD8, and CD30 panel of antibodies. Forty-two patients with diffuse dermal T-lymphocytic infiltrates were selected. Previous clinicopathologic correlation and follow-up had established the diagnosis of MF in 31 patients and benign dermatoses in 11. A semiquantitative evaluation for the percentage of stained cells on immunohistochemistry was performed for all antibodies in low power and 10 consecutive high power fields. Student t test was used for statistical analysis. The mean percentage of CD3 stained cells was similar in MF and benign dermatoses patients, respectively 86 (+/-9)% versus 79 (+/-26)% (p=0.807). On the other hand, the mean percentage of CD7 stained cells was 54 (+/-32)% in patients with MF, and 74 (+/-22)% in patients with benign dermatoses (p=0.048). A semiquantitative evaluation revealed a considerable loss of CD7 immunolabeling in comparison with CD3 in patients with MF. Mean value of stained cells in MF was 86 (+/-9)% for CD3 and 54 (+/-32)% for CD7 (p< 0.001) while in benign dermatoses it was 79 (+/-26)% for CD3 and 74 (+/-22)% for CD7 (p= 0.669). We concluded that CD7 study may represent a valuable tool in the distinction between inflammation and neoplasia in T lymphoproliferative skin disorders / Doutorado / Anatomia Patologica / Doutor em Ciências Médicas
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Extração de informações de narrativas clínicas / Clinical reports information retrieval

Oleynik, Michel 02 October 2013 (has links)
Narrativas clínicas são normalmente escritas em linguagem natural devido a seu poder descritivo e facilidade de comunicação entre os especialistas. Processar esses dados para fins de descoberta de conhecimento e coleta de estatísticas exige técnicas de extração de informações, com alguns resultados já apresentados na literatura para o domínio jornalístico, mas ainda raras no domínio médico. O presente trabalho visa desenvolver um classificador de laudos de anatomia patológica que seja capaz de inferir a topografia e a morfologia de um câncer na Classificação Internacional de Doenças para Oncologia (CID-O). Dados fornecidos pelo A.C. Camargo Cancer Center em São Paulo foram utilizados para treinamento e validação. Técnicas de processamento de linguagem natural (PLN) aliadas a classificadores bayesianos foram exploradas na busca de qualidade da recuperação da informação, avaliada por meio da medida-F2. Valores acima de 74% para o grupo topográfico e de 61% para o grupo morfológico são relatados, com pequena contribuição das técnicas de PLN e suavização. Os resultados corroboram trabalhos similares e demonstram a necessidade de retreinamento das ferramentas de PLN no domínio médico. / Clinical reports are usually written in natural language due to its descriptive power and ease of communication among specialists. Processing data for knowledge discovery and statistical analysis requires information retrieval techniques, already established for newswire texts, but still rare in the medical subdomain. The present work aims at developing an automated classifier of pathology reports, which should be able to infer the topography and the morphology classes of a cancer using codes of the International Classification of Diseases for Oncology (ICD-O). Data provided by the A.C. Camargo Cancer Center located in Sao Paulo was used for training and validation. Techniques of natural language processing (NLP) and Bayes classifiers were used in search for information retrieval quality, evaluated by F2-score. Measures upper than 74% in the topographic group and 61% in the morphologic group are reported, with small contribution from NLP or smoothing techniques. The results agree with similar studies and show that a retraining of NLP tools in the medical domain is necessary.
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Expressão da p16INK4 em lesões precursoras de baixo grau do carcinoma escamoso do colo uterino : estudo prospectivo de seguimento

Godoy, Alessandra Eifler Guerra 23 June 2010 (has links)
O carcinoma escamoso do colo uterino é uma das neoplasias de maior incidência em todo o mundo, inclusive no Brasil, sendo responsável pela morte de milhares de mulheres a cada ano, grande parte delas ocorrendo em plena idade produtiva. Ao longo dos últimos cinqüenta anos, diversos pesquisadores têm estudado esta neoplasia. Sabe-se que a fase invasora do carcinoma escamoso do colo uterino é precedida por uma fase intra-epitelial, precursora (neoplasias intra-epiteliais cervicais/ NICs). As lesões precursoras podem ser divididas em dois grandes grupos: as de baixo grau e as de alto grau (Sistema de Bethesda). Se por um lado, o percentual de lesões de alto grau que evoluem para carcinoma escamoso invasor é grande, por outro lado, somente uma pequena parcela de mulheres que têm lesões precursoras de baixo grau vai desenvolver uma lesão invasora. Entretanto, ainda não somos capazes de identificar entre estas mulheres, quais são as que irão progredir para carcinoma escamoso do colo uterino. O presente estudo procurou avaliar a expressão da p16INK4 em pacientes com lesão de baixo grau do colo uterino, correlacionando com a presença de HPV-DNA e sua evolução ao longo do tempo. O estudo acompanhou 118 pacientes por um período máximo de 33 meses, examinando-as com intervalos de 6 meses. A conclusão foi que a p16INK4 se relacionada positivamente com infecção múltipla por HPV e que nestas pacientes a expressão da mesma chega a 100% de células neoplásicas coradas. Algumas pacientes evoluíram para lesão de alto em um período curto de tempo (alguns meses). / The squamous carcinoma of the cervix uterine is one of the neoplasias of bigger incidence in the whole world, also in Brazil, being responsible for the death of thousand of women to each year, great part of them occurring in full productive age. Throughout last the fifty years, diverse researchers have studied this neoplasia. We know that the invading phase of the squamous carcinoma of the cervix uterine is preceded by an intra-epithelial phase, precursory (cervical intraepithelial neoplasia - CIN). The precursory injuries can be divided in two great groups: of low degree and of high degree (Bethesda System). If on the other hand, the percentage of injuries of high degree that evolve for invading squamous carcinoma is great, on the other hand, a small parcel of women whom they have precursory injuries of low degree only goes to develop an invading injury. However, not yet we are capable to identify between these women, which are the ones that will go to progress for squamous carcinoma of the cervix uterine. The present study it looked for to evaluate the expression of p16INK4 in patients with injury of low degree of the uterine col, correlating with the presence of HPV-DNA and its evolution throughout the time. The study it folloied 118 patients for a maximum period of 33 months, examining them with intervals of 6 months. The conclusion was that p16INK4 if related positively with multiple infection for HPV and that in these patients the expression of the same one arrives the 100% of neoplastic cells stained. Some patients developed high lesion in a short period of time (several months).
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Extração de informações de narrativas clínicas / Clinical reports information retrieval

Michel Oleynik 02 October 2013 (has links)
Narrativas clínicas são normalmente escritas em linguagem natural devido a seu poder descritivo e facilidade de comunicação entre os especialistas. Processar esses dados para fins de descoberta de conhecimento e coleta de estatísticas exige técnicas de extração de informações, com alguns resultados já apresentados na literatura para o domínio jornalístico, mas ainda raras no domínio médico. O presente trabalho visa desenvolver um classificador de laudos de anatomia patológica que seja capaz de inferir a topografia e a morfologia de um câncer na Classificação Internacional de Doenças para Oncologia (CID-O). Dados fornecidos pelo A.C. Camargo Cancer Center em São Paulo foram utilizados para treinamento e validação. Técnicas de processamento de linguagem natural (PLN) aliadas a classificadores bayesianos foram exploradas na busca de qualidade da recuperação da informação, avaliada por meio da medida-F2. Valores acima de 74% para o grupo topográfico e de 61% para o grupo morfológico são relatados, com pequena contribuição das técnicas de PLN e suavização. Os resultados corroboram trabalhos similares e demonstram a necessidade de retreinamento das ferramentas de PLN no domínio médico. / Clinical reports are usually written in natural language due to its descriptive power and ease of communication among specialists. Processing data for knowledge discovery and statistical analysis requires information retrieval techniques, already established for newswire texts, but still rare in the medical subdomain. The present work aims at developing an automated classifier of pathology reports, which should be able to infer the topography and the morphology classes of a cancer using codes of the International Classification of Diseases for Oncology (ICD-O). Data provided by the A.C. Camargo Cancer Center located in Sao Paulo was used for training and validation. Techniques of natural language processing (NLP) and Bayes classifiers were used in search for information retrieval quality, evaluated by F2-score. Measures upper than 74% in the topographic group and 61% in the morphologic group are reported, with small contribution from NLP or smoothing techniques. The results agree with similar studies and show that a retraining of NLP tools in the medical domain is necessary.
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IMPACTO DO ESTRESSE DO RETÍCULO ENDOPLASMÁTICO HIPOCAMPAL SOBRE O SURGIMENTO DE DECLÍNIOS COGNITIVO E MOTOR EM RATOS COM SÍNDROME METABÓLICA INDUZIDA POR DIETA RICA EM SACAROSE / IMPACT OF STRESS IN THE ENDOPLASMIC RETICULUM PARAHIPPOCAMPAL REGION ABOUT THE EMERGENCE OF DECLINES COGNITIVE AND MOTOR IN RATS WITH SYNDROME -INDUCED METABOLIC DIET RICH IN SUCROSE

PINTO, Bruno Araújo Serra 07 April 2017 (has links)
Submitted by Maria Aparecida (cidazen@gmail.com) on 2017-04-26T12:29:41Z No. of bitstreams: 1 Bruno Araújo Serra Pinto.pdf: 5546725 bytes, checksum: 07839b14efcc510ac5ecfa62b980626e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-26T12:29:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bruno Araújo Serra Pinto.pdf: 5546725 bytes, checksum: 07839b14efcc510ac5ecfa62b980626e (MD5) Previous issue date: 2017-04-07 / FAPEMA / Background: The epidemiological rise of metabolic syndrome (MS) is directly related to the exponential increase of added sugar consumption. Studies describes that MSmetabolic disorders, mainly insulin resistance and obesity, are related to development of oxidative stress, cognitive declines and dementias, and neuronal senescence acceleration. Even with several evidences correlating MS to neuronal damage, the molecular mechanisms involved are still unclear, and the endoplasmic reticulum stress (ER stress), in this context, could be placed like an intermediary condition that interconnects those morbidities. Objective: To investigate the deleterious effects of hippocampal ER stress about progression of cognitive, behavioral and motor declines in rats with metabolic syndrome-induced by sucrose-rich diet in different ages. Methods: Weaned Wistar rats were divided into 4 groups: two control groups (CTR, n = 7-9), fed a standard diet and followed up to 3 and 6-months-old, respectively; and two obese groups (HSD, n = 7), fed a sucrose-rich diet (25% sucrose) followed by the same periods. Was assessed in these groups: MS development; redox profile; Cognitive, behavioral and motor functions; And the hippocampal gene/protein expression of UPR sensors (Ire1α, Perk and Atf6), chaperones (Grp78, Grp94, Pdi, Calnexin and Calreticulin), neuronal plasticity (Bdnf), antioxidant defense (Nrf2), apoptosis (Bcl2, Chop and Parp-1) and senescence (p53 and p21). For aging control, rats at 20 months of age (OLD, n = 7) fed standard chow were included as aging control for gene/protein expression and neurological assessments. Results: The sucrose-rich diet was successful in establish the SM-phenotype. At 3 months, we observed central obesity even with lower energy intake, fasting and fed dysglycemia, hypertriglyceridemia, hapatic ectopic fat deposit, decreased lipolysis rates, glucose intolerance and hepatic insulin resistance. In unpublished data, we observed mild lipid peroxidation without exepressive antioxidant enzymes activity, and absence of peripheral insulin resistance. In animals with 6 months, we observed a deepening of metabolic dysfunctions encountered in 3-months-old. In addition we observed weight gain, free fatty acids, hyperinsulinemia, peripheral insulin resistance, increased lipid peroxidation, higher SOD, CAT and GPx reduction activity in 6-months-old rats. The lipolysis rate wasn't performed. Regarding the neurofunctional assessment at 3-months-old, the animals presented motor deficit and anxiogenic behavior, however without cognitive dysfunctions. In 6-months-animals, we observed anxiogenic behavior and important motor and cognitive impairments (learning and memory), similar to OLD group. Hippocampal molecular analysis revealed a different signaling between HSD groups of 3 and 6-months. In HSD at 3 months, we observed a switch-over from UPR-adaptive to pro-apoptotic signaling, marked by increased gene expression of Perk, Atf6 and Pdi A2 (adaptive), reduction of Grp78 and Bcl2, and increases of Chop and Caspase 3 (Apoptotic). In 6-months-HSD, we observed a complete failure of UPR adaptive signaling (UPR sensors and chaperones) and increased apoptotic signaling, featured by Bcl2 reduction and increased gene/protein expression of Chop. Additionally, we observed a reduction in the Bdnf gene expression and protein cleavage of Parp-1 compatible to calpain presence (necrosis/apoptosis marker). The expressions found in the 6-month-HSD were similar to OLD group, but the cell death markers (Chop and Calpain) were found only in HSD. As expected, senescence markers (p53 and p21) were increased in the OLD group and only p21 shown increased in HSD. Conclusions: Our data set supports that prolonged exposure to sucrose-rich diet promotes SM and oxidative stress, which disrupt hippocampal ER homeostasis, leading to senescence acceleration and cell death, and subsequently leads to severe cognitive, behavioral and motor impairments. / Introdução: O crescimento epidemiológico da síndrome metabólica (SM) está diretamente relacionado ao exponencial aumento do consumo de açucares de adição. Estudos descrevem que as desordens metabólicas que compõem a SM, principalmente a resistência insulínica e obesidade, estão relacionadas ao desenvolvimento de estresse oxidativo, declínios cognitivos, demências e aceleração da senescência neuronal. Mesmo com diversas evidências correlacionando a SM a danos neuronais, os mecanismos moleculares envolvidos ainda não são totalmente conhecidos. Neste contexto, o estresse do retículo endoplasmático (ERE) pode ser apontado como uma condição intermediária que interconecta estas morbidades. Objetivo: Investigar os efeitos deletérios do ERE hipocampal sobre a instalação de declínios cognitivos, comportamentais e motores em ratos com síndrome metabólica induzida por dieta rica em sacarose em diferentes faixas etárias. Métodos: Ratos Wistar com 21 dias de vida (desmame) foram divididos em 4 grupos: dois grupos controle (CTR, n = 7-9), alimentados com uma dieta padrão e acompanhados até os 3 e 6 meses de idade, respectivamente; e dois grupos obeso (HSD, n = 7), alimentados com dieta rica em sacarose (sacarose a 25%) acompanhados pelos mesmos períodos. Foi avaliado nos grupos: desenvolvimento de SM; perfil redox; funções cognitivas, comportamentais e motoras; e expressão gênica/proteica hipocampal de sensores da UPR (Ire1α, Perk e Atf6), chaperonas (Grp78, Grp94, Pdi, Calnexina e Calreticulina), plasticidade neuronal (Bdnf), defesa antioxidante (Nrf2), apoptose (Bcl2, Chop e Parp-1) e senescência (p53 e p21). Como um controle de envelhecimento, ratos com 20 meses de idade (OLD, n = 7) alimentados com dieta padrão foram incluídos aos experimentos de expressões gênica/proteica e avaliações neurológicas. Resultados: A dieta rica em sacarose teve sucesso em estabelecer o fenótipo de SM. Com 3 meses, o grupo HSD desenvolveu obesidade central mesmo com menor ingestão energética, disglicemia em estados de jejum e alimentado, hipertrigliceridemia, acúmulo de gordura ectópica hepática, diminuição da taxa de lipólise, intolerância à glicose e resistência hepática à insulina. Em dados não publicados, observamos discreta peroxidação lipídica sem expressiva atividade de enzimas antioxidantes e sem resistência insulínica periférica. Nos animais com 6 meses, observamos um aprofundamento das disfunções metabólicas dos animais de 3 meses. Adicionalmente, observamos ganho de peso, ácidos graxos livres, hiperinsulinemia, resistência insulínica periférica, maior peroxidação lipídica, maior atividade das enzimas SOD, CAT e redução da GPx. No que se refere à avaliação neurofuncional, aos 3 meses de idade, o grupo HSD apresentou déficit motor e comportamento ansiogênico, no entanto sem disfunções cognitivas. Contudo, nos animais de 6 meses observamos comportamento ansiogênico e importantes prejuízos motores e cognitivos (aprendizado e memória), semelhantes ao grupo OLD. A análise molecular hipocampal evidenciou uma sinalização diferente entre os grupos HSD de 3 e 6 meses. No HSD com 3 meses, observamos uma transição da sinalização adaptativa da UPR para a pró-apoptótica, marcada pelo aumento das expressões gênicas de Perk, Atf6 e Pdi A2 (adaptativa), redução da Grp78 e aumento da Chop e Caspase 3 (apoptótica). No HSD de 6 meses, observamos uma falência total da sinalização adaptativa da UPR (sensores da UPR e chaperonas), e aumento da sinalização apoptótica, caracterizada pela redução do Bcl2 e aumento da expressão gênica/proteica de Chop. Adicionalmente, observamos também redução da expressão gênica do Bdnf, redução da expressão proteica de Grp94 e clivagem proteica do Parp-1 compatível com a presença de Calpaína (marcador de necrose/apoptose). As expressões encontradas no HSD de 6 meses foram semelhante as alterações observadas no grupo OLD, mas os fatores de morte celular (Chop e Calpaína) foram encontrados apenas no HSD. Como esperado, os marcadores de senescência (p53 e p21) estavam aumentados no grupo OLD e apenas o p21 se mostrou aumentado no HSD. Conclusões: Nosso conjunto de dados apoia que a exposição prolongada à dieta rica em sacarose promove SM e estresse oxidativo, que perturba a homeostase do RE hipocampal, acarretando aceleração da senescência e morte celular, e subsequentes prejuízos cognitivos, comportamentais e motores.

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