Orientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Esteban Orlando Lavilla / Banca: Luciana Barreto Nascimento / Resumo: Scinax fuscomarginatus, S. parkeri, S. trilineatus e a recentemente descrita S. lutzorum são espécies muito similares morfologicamente que ocorrem em formações abertas da America do Sul ao leste dos Andes. Scinax parkeri e S. trilineatus tiveram sua validade taxonômica questionada enquanto S. fuscomarginatus é considerada por vários autores como um complexo de espécies. Levando em conta a similaridade morfológica e a incerteza taxonômica, nesse trabalho revisamos a taxonomia de Scinax fuscomarginatus, S. trilineatus, S. parkeri e S. lutzorum usando dados de morfologia externa, cantos de anúncio e sequências moleculares. Os principais objetivos foram investigar a existência de outras espécies sob o nome S. fuscomarginatus e avaliar o "status" taxonômico de S. parkeri, S. trilineatus, S. lutzorum e Hyla madeirae (único sinônimo de S. fuscomarginatus). Nas análises filogenéticas com dados moleculares encontramos uma profunda e rica estrutura genética tanto intra quanto inter-especifica. As amostras incluídas formaram um grupo monofilético bem suportado que está estruturado em vários clados e subclados. Hyla madeirae e a população da Serra do Cachimbo correspondem a subclados distintos enquanto as espécies atualmente válidas (S. fuscomarginatus, S. parkeri, S. trilineatus e S. lutzorum) se agrupam em um único clado. Este clado apresenta subestrutura marcada, mas a concordância entre subclados e as espécies reconhecidas é limitada. A alta variação intraespecífica e intrapopulacional encontrada nos caracteres morfológicos usados para a diagnose original das espécies não permitiu a diferenciação entre S. parkeri, S. trilineatus, S. lutzorum e S. fuscomarginatus. Entretanto, alguns caracteres permitem a distinção de Hyla madeirae e dos espécimens da Serra do Cachimbo / Abstract: Scinax fuscomarginatus, S. parkeri, S. trilineatus and the recently described S. lutzorum are morphologically very similar species that occur in open formations of South America east of the Andes. Scinax parkeri and S. trilineatus had its taxonomic validity questioned, and S. fuscomarginatus is considered by many authors as a species complex. Given the morphological similarity and taxonomic uncertainty, we review the taxonomy of Scinax fuscomarginatus, S. parkeri, S. trilineatus, and S. lutzorum using data from external morphology, advertisement calls and molecular sequences. The main goals were to investigate the existence of other species under the name S. fuscomarginatus and assess the taxonomic status of S. parkeri, S. trilineatus, S. lutzorum and Hyla madeirae (the only synonym within S. fuscomarginatus). In the phylogenetic analysis obtained with the molecular data we found rich and deep genetic structure both within and between species. The samples included formed a well supported monophyletic group that is divided into several clades and subclades. The specimens of Hyla madeirae and those from Serra do Cachimbo corresponded to distinct subclades while the currently valid species (S. fuscomarginatus, S. parkeri, S. and S. trilineatus lutzorum) were grouped into a single clade. This clade showed marked substructure, but the concordance of the recognized species to subclades were limited. The high intrapopulation and intraspecific variation found in morphological characters used for the original diagnoses did not allow us to differ among S. parkeri, S. trilineatus, S. lutzorum and S. fuscomarginatus. However, some characters support the distinction of Hyla madeirae and specimens from Serra do Cachimbo. Similarly, none of valid species were distinguishable in morphometric analysis while Hyla madeirae and the specimens from Serra do Cachimbo showed a trend in having wider heads / Mestre

Resumo: Nessa tese, utilizamos uma série de métodos filogeográficos para investigar a diversificação em Rhinella gr. crucifer, um grupo de espécies próximas de sapos endêmicos da Mata Atlântica. No primeiro capítulo fizemos uma primeira abordagem da estrutura genética no grupo utilizando amostragem grosseira. Foram analisadas seqüências de DNA mitocondrial e nuclear de DNA de 65 indivíduos representando as cinco espécies atualmente válidas. Encontramos que a diversidade genética é geograficamente estruturada. A divergência mais antiga, datada do Plioceno, separa as populações mais ao sul do bioma enquanto que o restante das populações estão distribuídas em clados que divergiram desde o Pleistoceno. Modelos de distribuição paleoecológica suportam fragmentação de habitat associada a ciclos glaciais, mas a congruência de padrões filogeográficos com os refúgios inferidos é limitada. Algumas quebras genéticas coincidem geograficamente com barreiras associadas à atividade neotectônica. Os dados refutam a hipótese recentemente proposta de colonização Holocênica do sul da Mata Atlântica, sugerindo persistência de habitat nessa região. No segundo capítulo, utilizamos amostragem em nível populacional para delimitar melhor as unidades genéticas no grupo. Utilizamos seqüências de DNA mitocondrial e nuclear de 404 indivíduos, métodos baseados em árvores e freqüência alélica, considerando um cenário de divergências recentes e hibridação. Ambos marcadores apoiaram a existência de cinco unidades genéticas, três distribuídas na área núclear de distribuição do grupo, e duas com distribuições isoladas. Encontramos evidência clara da existência de zonas de contacto para dois pares de unidades genéticas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In this dissertation, we used phylogeographic methods to investigate diversification in the Rhinella gr. crucifer, a group of closely related toads endemic to the Brazilian Atlantic Forest. In the first chapter we described the genetic structure in the group using coarse sampling. We analyzed mitochondrial and nuclear DNA sequences of 65 individuals representing the five currently valid species. We found that genetic diversity is geographically structured; the oldest divergence, dating from the Pliocene, separates the southernmost populations. The remaining population are distributed in clades that diverged throughout the Pleistocene. Palaeoecological distribution models support habitat fragmentation associated with glacial cycles, but the congruence of phylogeographic patterns and inferred refugia is limited. Some genetic breaks coincide geographically with barriers related to neotectonic activity. The data refute the recently proposed hypothesis of Holocene southern colonization of the biome, suggesting instead habitat persistence in this region. In the second chapter, we used sampling at the population level to delimit genetic units within the group. We used DNA sequences of mitochondrial and nuclear markers from 404 individuals. We combined tree and frequency- based methods, assuming a scenario of recent divergence and hybridization. Both marker types supported the existence of five genetic units, three being distributed within the core distribution of the group, and two with more isolated distributions. We found evidence of contact zones between two pairs of units... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: João Miguel de Barros Alexandre / Coorientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Fernando Jorge Guimarães Sequeira / Banca: Sergio Furtado dos Reis / Banca: Cinthia Aguirre Brasileiro / Banca: Cristina Y. Myaki / Doutor

Orientador: Cynthia Peralta de Almeida Prado / Banca: Cinthia Aguirre Brasileiro / Banca: Denise de Cerqueira R. Feres / Resumo: O gênero Physalaemus inclui 42 espécies distribuídas do norte da Argentina às Guianas. Uma característica interessante do gênero é a capacidade de ocupar uma ampla variedade de ambientes, desde a serrapilheira de florestas úmidas até ambientes sazonais tais como os encontrados no Cerrado, Chaco e Caatinga. Esta dissertação é apresentada em dois capítulos. No primeiro capítulo, dados sobre a biologia reprodutiva de Physalaemus crombiei, uma espécie endêmica da Mata Atlântica, são apresentados, juntamente com as relações tamanho-fecundidade, investimento reprodutivo da espécie, modos reprodutivos e uma comparação com dados obtidos na literatura para mais 12 espécies do gênero. No segundo capítulo foi verificado se fêmeas de diferentes espécies vivendo em ambientes contrastantes investem diferentemente em reprodução. Estas comparações foram feitas entre fêmeas de quatro espécies de Physalaemus associados a áreas florestadas e quatro espécies de área aberta. Neste contexto, as correlações entre os componentes de história de vida destas espécies foram investigadas, bem como a existência de variação no tamanho dos ovos dentro das desovas. Physalaemus crombiei se reproduz ao longo do ano, com seu pico de reprodução nos meses mais chuvosos. Exibe o modo de reprodução típico para o gênero (modo 11), mas pode exibir modos reprodutivos alternativos (modos 14 e 28), assim como outras espécies do grupo de P. signifer. As espécies do grupo de P. signifer depositam desovas com ovos maiores e em menor número do que as outras espécies do gênero. Esta diferença pode ser explicada não apenas pelo menor tamanho destas espécies, mas também por depositarem desovas terrestres. Na comparação entre espécies de mata e área aberta, o tamanho do corpo da fêmea foi correlacionado com o número de ovócitos em apenas duas dentre as sete espécies analisadas / Abstract: The genus Physalaemus includes 42 species distributed from northern Argentina to the Guyanas. An interesting attribute of the genus is the ability to occupy a wide variety of environments, from the leaf litter of rainforests to seasonal environments, such as those found in the Cerrado, Chaco and Caatinga. This work presents two chapters. In the first chapter, data on the reproductive biology of Physalaemus crombiei, an endemic species of the Atlantic Forest, are presented along with the size-fecundity relationships, reproductive modes, and species reproductive investment (RI). A comparison with data from the literature for other 12 Physalaemus species was also made. In the second chapter, we verified if females of different species living in contrasting environments invested differently in reproduction. These comparisons were made between females of four species of Physalaemus associated with forested areas and four species from open areas. In this context, correlations between species' life history components were investigated, as well as intra-clutch variation in egg size. Physalaemus crombiei reproduces throughout the year with a peak in the rainy months, exhibits the typical mode of reproduction for the genus (mode 11), but also presents alternative reproductive modes (modes 14 and 28), such as other species in the P. signifer group. Females in the P. signifer species group produce larger eggs but fewer in number than other species in the genus. This difference can be explained by the smaller size of these species, but also by the ability to place terrestrial clutches. In the comparison between forest and open area species, female body size correlated with the number of oocytes in only two out of seven species analyzed / Mestre

Resumo: Os vertebrados ectotérmicos apresentam um desenvolvido sistema de células com pigmentos melânicos em seu citoplasma, localizado em diversos órgãos e membranas. A dispersão dos grãos de melanina dentro dos melanócitos responde fortemente à exposição ao hormônio estimulante de melanócitos (MSH) e aos hormônios sexuais, promovendo alteração na coloração. Este trabalho buscou avaliar o efeito dos esteróides cipinato de testosterona, 17 β-estradiol e do MSH sobre a pigmentação hepática e testicular de Eupemphix nattereri, mediante análise histológica, e ultra-estrutural. Foram coletados 60 machos adultos na região de São José do Rio Preto, SP. Para cada experimento, dez machos adultos receberam doses subcutâneas contendo 0,5 mg/kg de cipionato de testosterona e 0,5 mg/kg de 17 β-estradiol, dissolvidos em óleo vegetal e, 2,5x10-7 mmol/10g de α-MSH dissolvido em PBS, durante 7 dias, a cada 48h. O grupo controle recebeu apenas óleo vegetal ou PBS. Grupos com cinco animais foram eutanasiados 24h após do término do tratamento, e outros cinco, após 15 dias. Foram realizados estudos morfológicos utilizando microscopia de luz e microscopia eletrônica de transmissão. No tecido hepático foram encontradas células de Kupffer. No interstício testicular observou-se melanócitos, com inúmeros melanossomos. Para o grupo tratado com cipionato de testosterona, foi observado um aumento de aproximadamente 2x na área ocupada pelas células pigmentadas no fígado e 4x nos testículos mediante analise a curto prazo. Para o mesmo tratamento, foi observado aumento de 1,8x no fígado dos animais eutanasiados após 15 dias. Tal resposta pode ser decorrente do aumento da atividade melanossintética, do aumento do número de células, ou ambos. Os animais tratados com 17 β-estradiol e α- MSH não apresentaram alterações na pigmentação hepática e testicular mediante... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Ectothermic vertebrates have a well-developed system of melanin-containing cells, which are distributed throughout several organs and tissues. The dispersion of melanin-containing granules within melanocytes responds to prolonged exposure to high concentration of MSH and sexual hormones inducing color change. The present study aimed to characterize morphological and stereological patterns of pigmented cells in liver and testis of the Eupemphix nattereri under effect of testosterone cypionate, 17 β-estradiol and α-MSH. Sixty adult males were collected in São José do Rio Preto, São Paulo State, Brazil. For each experiment, ten adult males were treated with the following hormones injected in the dorsal lymph sac during seven days: (1) 5 mg/kg dose of testosterone cypionate or (2) 5 mg/kg dose of 17 β-estradiol (dissolved in vegetal oil) or (3) 2,5x10-7 mmol/10g of α-MSH (dissolved in PBS). The control group received only vegetal oil or PBS solution at the same hormonal concentration. Groups of five animals were euthanatized after 24h and the other five, after 15 days. Morphological studies with light and transmission electron microscopy were carried out in the groups. In the hepatic tissue were found Kupffer cells, which are characterized by multivesicle bodies in the cytoplasm and large amount of melanosomes. In the testis, melanocytes-like cells are present in the interstitium. They presented large and irregular aspect and a great amount of intensely pigmented cytoplasm. For the groups treated with testosterone cypionate an increase of approximately 2x in the occupied area by the pigmented cells in the liver and 4x in the testis was observed in the treatment group against the control. The observed response can be due to increase of melanosynthesis Introdução 3 Zieri et al., 2010 activity, increase in the number of pigmented cells, or both. Moreover, for the same treatment... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Classius de Oliveira / Coorientador: Sebastião Roberto Taboga / Banca: Rejane Maira Góes / Banca: Patrícia Simone Leite Vilamaior / Banca: Selma Maria Almeida Santos / Banca: Wagner José Fávaro / Doutor

Orientador: Classius de Oliveira / Banca: Maria Tercília V. de Azeredo Oliveira / Banca: Eliana Morielle Versute / Banca: Patrícia Simone Leite Vilamaior / Banca: Karina Simões / Resumo: Os vertebrados ectotérmicos apresentam um desenvolvido sistema de células com pigmentos melânicos em seu citoplasma, localizadas em diversos órgãos e estruturas formando um sistema pigmentar extracutâneo. Esses tipos celulares são grandes e irregulares, com o citoplasma abundante e intensamente pigmentado e variam de um aspecto estrelado ao puntiforme. São encontrados também associados ao aparelho reprodutor de algumas espécies de anuros, conferindo uma tonalidade escura. Esta característica anatômica de coloração testicular faz parte da arquitetura somática do órgão e na literatura não há qualquer dado que aponte para uma inter-relação entre estes componentes. Células contendo pigmentos melânicos são encontradas também no fígado, onde apresentam atividade fagocítica, sendo denominadas melanomacrófagos ou células de Kupffer, e não eram incluídas na classificação de célula pigmentar, pois se pensava que os macrófagos presentes no fígado e baço apenas fagocitavam os melanossomos, e não os sintetizavam. Entretanto, análises sobre a função melanogênica das células pigmentares nesses órgãos em algumas espécies demonstraram que há melanogênese. Para os anfíbios anuros, os estudos relativos aos melanócitos viscerais e aos melanomacrófagos são recentes e se referem à poucas espécies. Alguns estudos demonstraram que alterações do sistema melanogênico pode estar relacionado ao aumento da pigmentação no fígado e a hemocaterese hepática. Há também, trabalhos que relatam modificações metabólicas e estruturais das células hepáticas durante o inverno, não sendo descritas funções para as células pigmentares presentes nos demais órgãos. Assim, neste trabalho objetivamos analisar a resposta das células... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Ectothermic vertebrates present a well-developed system composed of cells with melanin in its cytoplasm. These cells are distributed in several organs and tissues constituting an extracutaneous pigmentary system. These cells types are big and irregular, with shapes that vary from a star-shaped to a punctiform format. In addition, its cytoplasm is abundantly pigmented. In anuran amphibians this pigmented cells are also found associated to the reproductive system, what gives to the gonads a dark coloration. This coloration makes part of the somatic architecture of the organ, but there is no data in the literature that suggest a function for this pigmentation. Melanin-contemning cells are also found on the liver, where show phagocytic activity, being called melanomacrophages or Kupffer cells, and were not included in the classification of pigmentary cell, since it was thought that the macrophages in the liver and spleen only phagocyted the melanosomes, not synthesizing them. However, some analysis about the melanogenic function of these pigmentary cells in these organs show that melanogenesis indeed takes place. To anuran amphibians, the studies concerning to the viceral melanocytes and to the melanomacrophages are recent and refer to just a few species. Some studies show that changes in the melanogenic system can be related to the increase in the pigmentation on the liver and to the hepatic hemocateresis. Furthermore, some studies report modifications both metabolic and structural in hepatic cells during the winter, but not designating any function for the pigmented cells present in other organs. Our aim in this study was to analyze the response of the cells of the extracutaneous pigmentar system of the anuran Eupemphix nattereri to a varying thermal condition... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Resumo: Durante o período de fevereiro de 2007 a janeiro de 2009, foram estudadas as taxocenoses de anuros de quatro Municípios do Lagamar Paulista, litoral sul do Estado de São Paulo, um complexo estuarino-lagunar caracterizado por três ilhas continentais e porções continentais adjacentes a esta ilhas. Com o objetivo de inventariar as comunidades de anuros da costa (Iguape e Pariquera-Açu) e das ilhas (Ilha de Cananéia, Ilha do Cardoso e Ilha Comprida) e revelar padrões de diversidade e similaridade faunística, foram realizadas campanhas mensais com duração de três a quatro dias consecutivos nos quais as espécies de anuros foram registradas através do uso de duas metodologias complementares (armadilhas de interceptação e queda e procura ativa). Os resultados obtidos através da análise dos dados de composição comparada de espécies revelaram que as comunidades estudadas estão estruturadas. As comunidades das ilhas de Cananéia e Comprida apresentaram um alto grau de similaridade em diversidade de espécies. O mesmo pode ser dito para Pariquera-Açu em relação à Iguape. A análise molecular da estrutura de populações de cinco espécies de anuros ocorrentes nos cinco locais estudados [Rhinella ornata, Dendrophryniscus leucomystax, Hypsiboas albomarginatus, Scinax sp. 1 (aff. alter) e Haddadus binotatus] revelou padrões diferenciados de estrutura e diferentes cenários de formação destas populações. Mecanismos pretéritos relacionados à colonização das ilhas por espécies de anuros, bem como características intrínsecas das espécies colonizadoras podem ter sido os maiores responsáveis pelos padrões de estrutrura de comunidades e estruturas populacionais observados para os locais estudados. O presente estudo evidencia a importância de estudos multidisciplinares para a compreensão da estrutura e evolução de populações e comunidades de anuros. / Abstract: From February 2007 to January 2009 we studied the anuran taxocenosis of four municipalities of an estuary-lagoon complex in the south coast of São Paulo State (Lagamar) composed by three continental Islands and continental areas adjacent to these Islands. In order to survey the anuran communities from the continental areas (Iguape Pariquera-Acu) and Islands (Cananéia, Cardoso, and Comprida), and to determine patterns of diversity and faunal similarity we conducted monthly surveys lasting three to four days each in which anuran species were registered through two complementary methods (pitfall traps with drift fences and active search). The species composition analysis revealed that the anuran communities of the Lagamar are structured. Anuran communities from Cananéia and Comprida Island, as well as Pariquera-Açu and Iguape, were more similar regarding species composition. The analysis of molecular diversity patterns of five species shared among the studied areas [Rhinella ornata, Dendrophryniscus leucomystax, Hypsiboas albomarginatus, Scinax sp. 1 (aff. alter), and Haddadus binotatus] revealed different structural patterns and historical scenarios of populations arrangements. Historical mechanisms related to island colonization by some anuran species as well as intrinsic characteristics of these species may account for contemporary patterns of community and population structure. The present study reinforces the importance of interdisciplinary studies for the comprehension of population and community structure and evolution. / Orientador: Célio F.B. Haddad / Coorientador: Cynthia Peralta de Almeida Prado / Banca: Cinthia Aguirre Brasileiro / Banca: Denise de Cerqueira Rossa Feres / Banca: João Miguel de Barros Alexandrino / Banca: Hélio Ricardo da Silva / Doutor