Made available in DSpace on 2014-07-29T15:07:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao FINAL RICARDO.pdf: 485243 bytes, checksum: 1906f1911ad5edaec8d73c8546aaca3e (MD5) Previous issue date: 2010-07-02 / The arboviruses are diseases that affect humans, horses and other animal species causing in the majority of cases an asymptomatic infection to neurological disorders. The Flaviviruses are important arbovirus found in Brazil. A descriptive study was conducted from serological surveys in 1775 horses for detection of anti-Flavivirus antibodies in the State of Paraná (Foz do Iguaçú, Maringá and Barracão), Santa Catarina (São Miguel do Oeste, Guaraciaba, Iraceminha, Dionisio Cerqueira, Guarujá do Sul and São José do Cedro) and Rio Grande do Sul (Uruguaiana, São Borja, Itaqui Alegrete and Porto Alegre) in the years of 2007 and 2008. By testing hemagglutination inhibition (HI) were detected HI antibodies of Saint Louis and Ilhéus and other Flaviviruses included in the tests, as well as cross-reactivity for Flaviviruses. By HI test, 14.3% (254/1775) of animals were positive for Flavivirus, monospecific reactions were observed in 42.9% (109/254) serum samples, being that 78.9% (86/109) for St. Louis, 17.4% (19/109) for Ilhéus and 3.7% (4 / 109) for Rocio and cross-reactions were detected in 57.1% (145/254). Among the positives, there was no difference between the sexes. The age group ≥ 10 years old was the most affected with 35.4% (73/206). The animals used for the practice of sport were positive in 34.3% (87/254). The state of Paraná showed 16.3% (107/657) of reacting animals, followed by Rio Grande do Sul with 15.1% (142/939) and Santa Catarina with 2.8% (5/179). This study brings new data regarding the immunity of horses against Flaviviruses in Brazil, and confirms the wide distribution of St. Louis and Ilhéus and the diversity of Flavivirus in the country, as well as the apparent absence of clinical disease in horses infected with the virus studied. / As arboviroses são enfermidades que acometem o homem, equinos e outras espécies animais causando na sua maioria das vezes infecções que vão desde assintomáticas até neurológicas. Os Flavivirus são importantes arbovírus encontrados no Brasil. Foi realizado um estudo descritivo a partir de inquéritos sorológicos em 1775 equinos para detecção de anticorpos anti-Flavivirus no Estado do Paraná (Foz do Iguaçu, Maringá e Barracão), Santa Catarina (São Miguel do Oeste, Guaraciaba, Iraceminha, Dionísio Cerqueira, Guarujá do Sul e São Jose do Cedro) e Rio Grande do Sul (Uruguaiana, São Borja, Itaqui, Alegrete e Porto Alegre) nos anos de 2007 e 2008. Por meio de testes de inibição da hemaglutinação (IH) foram detectados anticorpos IH de Saint Louis e Ilhéus e outros Flavivirus incluídos nos testes, assim como reações cruzadas para Flavivirus. Pelo teste de IH, 14,3% (254/1775) dos animais foram reagentes para Flavivirus, reações monoespecíficas foram observadas em 42,9% (109/254) amostras de soro, sendo que 78,9% (86/109) para Saint Louis, 17,4% (19/109) para Ilhéus e 3,7% (4/109) para Rocio e reações cruzadas foram detectadas em 57,1% (145/254). Dentre os animais reagentes, não foi observada diferença entre os sexos. A faixa etária ≥ 10 anos foi a mais acometida com 35,4% (73/206). Os animais utilizados para a prática do esporte foram reagentes em 34,3% (87/254). O Paraná apresentou 16,3% (107/657) dos animais reagentes, seguido do Rio Grande do Sul com 15,1% (142/939) e Santa Catarina com 2,8% (5/179). Este estudo traz novos dados a respeito da imunidade de equinos contra Flavivirus no Brasil, e confirma a ampla distribuição de Saint Louis e Ilhéus e a diversidade de Flavivirus no País, bem como a aparente ausência de doenças em equinos infectados pelos vírus estudados.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-06-03T19:16:30Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_SoroprevalenciaArbovirosesHumanas.pdf: 3702616 bytes, checksum: 4478cb2e56395ed0358a31dafa9de6de (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-06-04T12:19:45Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_SoroprevalenciaArbovirosesHumanas.pdf: 3702616 bytes, checksum: 4478cb2e56395ed0358a31dafa9de6de (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-04T12:19:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_SoroprevalenciaArbovirosesHumanas.pdf: 3702616 bytes, checksum: 4478cb2e56395ed0358a31dafa9de6de (MD5) Previous issue date: 2011 / Eletronorte - Centrais Elétricas do Norte do Brasil S/A / Os arbovírus constituem um importante problema de saúde pública no Brasil, especialmente na Amazônia por sua capacidade de causar epidemias com indices consideráveis de morbi-mortalidade tanto em humanos quanto em animais. Quatro, Vírus, dengue (VDEN), Vírus da febre amarela (VFA), Vírus Mayaro (VMAY) e Vírus Oropouche (VORO) tem especial relevância para a região, principalmente naqueles ambientes onde os impactos ambientais são iminentes. Estudos de prevalência de anticorpos para arboviroses nessa região são limitados. Este estudo teve como objetivo estimar a prevalência de anticorpos para as principais arboviroses de interesse em saúde pública nas comunidades que vivem sob a influência da Usina Hidrelétrica de Tucuruí no estado do Pará. O estudo foi observacional do tipo transversal analítico, realizado em indivíduos de ambos os sexos, maiores de 18 anos, residentes à margem esquerda e direita do lago UHE de Tucuruí e proveniente das RDS de Alcobaça e Pucuruí-Ararão. A coleta das amostras de sangue e o preenchimento do questionário foram realizados em dois momentos distintos, cheia e vazante do lago. Todas as amostras foram analisadas pelo Instituto Evandro Chagas onde foram submetidas ao teste de Inibição da Hemaglutinação para a pesquisa de anticorpos contra 19 tipos de Arbovírus e teste de MAC-ELISA para detecção de anticorpos IgM. A análise dos dados foi descritiva e analítica, sendo empregado o cálculo de razão de chances com intervalo de confiança de 95% para verificar a associação entre as variáveis do estudo e o teste qui-quadrado e/ou exato de Fisher a fim de verificar a significância das associações estatísticas entre as variáveis do estudo com um nível alfa de 0,05. Ao todo, foram estudados 635 indivíduos e a pesquisa de anticorpos para arbovírus teve associação estatisticamente significante com as características sociodemográficas dos indivíduos, como sexo, profissão e tempo de residência na área do estudo. Não foi observada associação estatisticamente significante entre a presença de anticorpos arbovirais e as demais características estudadas. / The arboviruses are a major public health problem in Brazil, especially in the Amazon for its ability to cause epidemics with considerable rates of morbidity and mortality in both humans and animals. Four, Virus dengue (VDEN), Virus yellow fever (VYF), Virus Mayaro (VMAY) and Virus Oropouche (VORO) has special relevance for the region, particularly in those environments where environmental impacts are imminent. Studies on the prevalence of antibodies to arboviruses in this region are limited. This study aimed to estimate the prevalence of antibodies to arboviruses of the major public health concern in the communities that live under the influence of the Tucuruí dam in the state of Pará. The study was observational, cross-sectional analytical study carried out in individuals of both sexes, aged over 18, resident at the left and right margin of the lake Tucuruí power plant and from the RDS and Alcobaça Pucurui-ararão. The collection of blood samples and filling in the questionnaire were performed at two different times, flood and ebb of the lake. All samples were analyzed by the Evandro Chagas Institute where they were tested with hemagglutination inhibition for detection of antibodies against 19 types of Arboviruses and MAC-ELISA test for detection of IgM antibodies. Data analysis was descriptive and analytical, are used to calculate odds ratio with confidence interval 95% to determine the association between the study variables and chi-square or Fisher exact test to verify the significance statistical relationships between the variables of the study with an alpha level of 0.05. In all, 635 individuals were studied and the antibodies to arboviruses was significantly associated with sociodemographic characteristics of individuals such as sex, ossupation and residence time in study area. No association was found between the presence of antibodies arboviral and other traits.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-06-03T19:14:07Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_CaracterizacaoRespostaImune.pdf: 1244558 bytes, checksum: c43d999fb552fb479140d57b56fda3a4 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-06-04T14:13:21Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_CaracterizacaoRespostaImune.pdf: 1244558 bytes, checksum: c43d999fb552fb479140d57b56fda3a4 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-04T14:13:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Tese_CaracterizacaoRespostaImune.pdf: 1244558 bytes, checksum: c43d999fb552fb479140d57b56fda3a4 (MD5) Previous issue date: 2011 / IEC - Instituto Evandro Chagas / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A tese aqui apresentada trata-se do primeiro estudo em nível mundial que pesquisa e caracteriza a resposta imune citocínica em infecções humanas pelo Orthobunyavirus Oropuche. Como metodologia para o alcance dos objetivos aqui apresentados foi utilizado um total de 320 amostras de soros humanos, onde 60 destas foram provenientes de Banco de Sangue (Controle negativo) e 260 foram obtidas mediante dois surtos do Vírus Oropouche nos Estados do Pará e Amapá (Brasil), sendo estas últimas divididas em oito subgrupos para obtenção dos dados com exatidão. Nas amostras coletadas foram realizadas análises dos dados clínicos/sintomatologia através dos prontuários, dados sorológicos através da titulação de anticorpos por Inibição da Hemaglutinação (IgM/IgG) e detecção do nível de citocinas plasmáticas por citometria de fluxo a qual permitiu a descrição técnica da dosagem de citocinas possibilitando ainda a análise de frequência de baixos e altos produtores de citocina. Os dados obtidos permitiram observar as variáveis e o comportamento das assinaturas de citocinas expressas pelos pacientes mediante a confirmação sorológica do vírus, bem como o comportamento destes analitos séricos quando da presença de sintomas específicos como febre, calafrios, cefaléia e tontura, permitindo assim que se chegasse à conclusão que a) existe um padrão na síntese de citocinas pró-inflamatórias e reguladoras; b) observa-se um balanço no perfil da resposta imune entre citocinas pró-inflamatórias (Th1) e moduladoras (Th17); c) a infecção pelo Vírus Oropouche altera a produção das citocinas nos indivíduos; d) os resultados mostram também que ao comparar os indivíduos Não respondedores com os Respondedores precoces, houve aumento da IL-1β e diminuição da IL-12; Não respondedores com Respondedores tardios, houve diminuição da IL-8, e aumento da IFN-α, IL-23 e IL-17; Não respondedores comparados com Respondedores precoces ocorreram o aumento de IL-4 e IFN-; Já quando comparado Respondedores precoces e respondedores tardios houve diminuição de IFN-α e IL-6; Respondedores precoces de forma geral apresentaram diminuição da IL-10 e Respondedores tardios apresentaram aumento da IL-5; e) Os resultados mostram ainda a expressão de IL-5 em pacientes que manifestaram os sintomas específicos para a infecção pelo Oropouche (febre, calafrios, cefaléia e tontura), sugerindo este sinal estar associado diretamente à patogênese do vírus; f) há a necessidade da complementação desta pesquisa com mais estudos como àqueles relacionados com a expressão de quimiocinas. / This thesis is the first global study that researches and analyzes the immune response of cytokine in human infections by Orthobunyavirus Oropuche virus. The study used 320 samples of human serum. Sixty were from the Blood Bank (negative control) and 260 were obtained from two outbreaks of the Oropouche virus in the State of Pará and Amapá (Brazil). The latter was divided into 8 subgroups for better data accuracy. The collected samples were analyzed for clinical data/symptoms with serologic testing by titration of antibodies by the hemagglutination inhibition (IgM/IgG) and the detection cytokines plasma levels by flow cytometry. This allowed for the technical description of cytokine. The data obtained allowed for the observation of the characteristics and the behavior of the cytokines signatures expressed by patients by the presence or not of the virus. This also allowed for the observation of changes to serum through the presence of specific symptoms such as fever, chills, headache and dizziness. This led to the following conclusions a) there is a pattern in the synthesis of pro-inflammatory and regulatory cytokines; b) there is a balance in the profile of the immune response between pro-inflammatory cytokines (Th1) and modulators (Th17); c) an infection by the Oropouche virus alters the production of cytokines in individuals; d) the results also show that whem comparing individuals no responders with early responders, there was an increase of IL-1β and decreased IL- 12; no responders with late responders, there was a decrease of IL-8, and increased IFN-α, IL-23 and IL-17; No responders occurred early responders compared with the increase IL-4 and IFN-g; However, when compared early responders and late responders, decreased IFN-α and IL-6; early responders generally showed a decrease in IL-10 and late responders showed an increase in IL-5; e) The results also show the expression of IL-5 in patients who showed symptoms specific for Oropouche infection (fever, chills, headache and dizziness), suggesting this signal to be directly associated with pathogenesis of the virus; f) there is a need to complement this research with more studies such as those related to the expression of chemokines.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-11T12:04:23Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EpidemiologiaMolecularVirusOropouche.pdf: 8072606 bytes, checksum: 4583fd996c0fca9e376db310de118adb (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-08T15:49:26Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_EpidemiologiaMolecularVirusOropouche.pdf: 8072606 bytes, checksum: 4583fd996c0fca9e376db310de118adb (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-08T15:49:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_EpidemiologiaMolecularVirusOropouche.pdf: 8072606 bytes, checksum: 4583fd996c0fca9e376db310de118adb (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2009 / O Virus Oropouche (VORO; Bunyaviridae, Orthobunyavirus) é um dos mais importantes arbovírus que infecta humanos na Amazônia brasileira, e é causador da febre do Oropouche. Entre 1961 e 2009, um grande número de epidemias foi registrado em diferentes centros urbanos dos Estados Brasileiros do Acre, Amapá, Amazonas, Maranhão, Pará, Rondônia e Tocantins, e também no Panamá, Peru e Trinidad & Tobago. Este trabalho teve por objetivo desenvolver um estudo retrospectivo dos aspectos epidemiológicos e moleculares do VORO enfatizando sua distribuição, a dinâmica das epidemias ocorridas no período, bem como a dispersão de diferentes genótipos na América Latina e no Brasil como contribuição à epidemiologia molecular do VORO. Para tanto 66 isolamentos do VORO pertencentes ao acervo do Instituto Evandro Chagas foram propagados em camundongos e em cultura de células VERO, seguida da extração do RNA viral e obtenção do cDNA por RTPCR; os amplicons foram purificados e submetidos ao sequenciamento nucleotídico para análises moleculares e evolução, incluindo o rearranjo genético, estudo de relógio molecular e análise de dispersão viral. Foi demonstrada a presença de quatro linhagens distintas do VORO na Amazônia brasileira (genótipos I, II, III e IV), sendo os genótipos I e II, respectivamente os mais frequentemente encontrados em áreas da Amazônia ocidental e oriental. Esses e o genótipo III estão constantemente evoluindo, mediante o mecanismo “boom and boost” que resulta na emergência seguida de substituição das sublinhagens (subgenótipos) circulantes por outras mais recentes. O genótipo III do VORO, previamente encontrado somente no Panamá, foi descrito na Amazônia e Sudeste do Brasil. Os dados obtidos pela análise filogenética comparativa das topologias para os segmentos PRNA e MRNA sugerem que o VORO utiliza o rearranjo genético como mecanismo de geração de biodiversidade viral, sendo o genótipo I o mais estável e o II o mais instável e, portanto, mais sensível às pressões evolutivas; foi reconhecido um novo genótipo do VORO neste estudo em amostras isoladas em Manaus no ano de 1980, que foi denominado de genótipo IV. O estudo do relógio molecular mostrou que a emergência do VORO se deu no Estado do Pará provavelmente há 223 anos e daí ao longo dos anos se dispersou pela PanAmazônia bem como para o Caribe, sendo que o genótipo I foi o que originou os demais genótipos do VORO. / Oropouche Virus (OROV; Bunyaviridae, Orthobunyavirus) is one of most important arbovirus which infects humans in the Brazilian Amazon, and is also the causal agent of Oropouche fever. Between 1961 and 2009, dozens of epidemics were registered in several urban centers of the Brazilian states of Acre, Amapá, Amazonas, Maranhão, Pará, Rondônia and Tocantins, and also in Panama, Peru and Trinidad & Tobago. This work aimed to develop a retrospective epidemiologic and molecular study of OROV emphasizing its distribution, epidemic dynamics in the period, as well as the dispersion of the OROV genotypes in Brazil and other Latin American countries as a contribution to understanding of the molecular epidemiology of it. A total of 66 OROV isolates of the Instituto Evandro Chagas collection were growth into VERO cells and suckling mice; then, RNA was extracted and cDNA prepared by RT-PCR; the amplicons were purified and submitted to nucleotide sequencing to further molecular and evolution analyzes including genetic reassortment, molecular clock and viral dispersion. It was demonstrated the circulation of four different genetic lineages of OROV in the Brazilian Amazon (genotypes I, II, III, and IV); the genotypes I and II were respectively the most distributed OROV genotypes in Occidental and Oriental Amazon areas. These and the genotype III have been continuously under evolution pressure and changing by the mechanism “boom and boost” which result in an emergence of new OROV sub-genotypes that replace the older circulating sub-lineages in an area. The genotype III which was previousouly recognized in Panama it was identified in the Amazon and Southeast regions. The results obtained by the comparative phylogenetic analyses of the SRNA and MRNA topologies suggest that OROV uses the genetic reassortment as mechanism to further generate its viral biodiversity, and the genotype I is the most stable, while the genotype II is the most unstable, and therefore under higher evolutionary pressure; it was recognized a new OROV genotype in this study, the genotype IV. The molecular clock analysis showed that OROV emerged in Pará State approximately 223 years ago, and along of the years did its dispersal and evolution through the Pan- Amazon as well as to the Caribbean and Central America regions, and the genotype I was responsible by the emergence of all other OROV genotypes.

Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-02-11T16:15:35Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_InfeccaoExperimentalHamsters.pdf: 2790075 bytes, checksum: 7188971dc75068f0e71978c12c97f993 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-04-14T14:16:05Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_InfeccaoExperimentalHamsters.pdf: 2790075 bytes, checksum: 7188971dc75068f0e71978c12c97f993 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-04-14T14:16:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_InfeccaoExperimentalHamsters.pdf: 2790075 bytes, checksum: 7188971dc75068f0e71978c12c97f993 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2007 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os flebovírus (família Bunyaviridae; gênero Phlebovirus), possuem importância considerável em saúde publica, pois podem causar uma variedade de síndromes clínicas. Na região amazônica brasileira até o momento já foram isolados 23 flebovírus sendo que quatro se destacam por terem sido isolados de humanos: Virus Alenquer, Virus Candiru, Virus Morumbi e Virus Serra Norte. Estes mais o Virus Itaituba, isolado de Didelphis marsupialis, fazem parte do Complexo Candiru (grupo Candiru) e foram utilizados para estudos de caracterização genética e de infecção experimental em hamsters dourados (Mesocricetus auratus). Os Hamsters mostraram-se suscetíveis a infecção por esses flebovírus, apesar de não terem apresentado sinais de doença. A análise histopatológica demonstrou aspectos lesionais no fígado, nos rins, no baço, nos pulmões e no sistema nervoso central, sendo as lesões mais intensas no fígado comprovadas pela presença dos antígenos virais empregando a técnica de imunohistoquímica. A análise das seqüências nucleotídicas parciais dos segmentos PRNA e MRNA obtidas para os cinco flebovírus estudados mostraram maior similaridade genética entre si do que com outros membros do gênero Phlebovirus. Sendo as mesmas geneticamente mais relacionadas ao Virus Punta Toro. Filogeneticamente, independentemente do segmento genômico analisado, os cinco flebovírus constituem um grupo monofilético, sendo que a análise pelo método de máxima verossimilhança demonstrou diferentes origens evolutivas para os segmentos de RNA o que sugere a ocorrência de rearranjo genético em natureza entre estes cinco flebovírus amazônicos. / The phleboviruses (family Bunyaviridae, genus Phlebovirus) are of considerable public health importance, due to their association with human diseases causing different clinical syndromes. In the Brazilian Amazon region, 23 phlebovirus were presently isolated, four of them have been isolated from humans: Alenquer virus, Candiru virus, Morumbi virus, and Serra Norte virus. These and Itaituba virus, isolated from Didelphis marsupialis belong to the Candiru Complex (Candiru group) and were used for studies on genetic characterization and experimental infection using gold hamsters (Mesocricetus auratus) as animal model. Hamsters showed to be susceptible to infection by these viruses; however signs of disease were not observed. The histophatological analysis demonstrated damages in the liver, kidneys, lung, and central nervous system. More intense lesions were observed in the liver which were characterized by the presence of viral antigens detected by immunohistochemistry assay. The analysis of the partial SRNA and MRNA nucleotide sequences obtained for the five studied phleboviruses showed more similarity among them than with other members of the genus Phlebovirus.More over, is was demonstrated that these phleboviruses were more genetically related to Punta Toro virus. Phylogenetically, regardless of the genome segment analyzed, the five phleboviruses constitute a monophyletic group. In addition the analysis by maximum likelihood method demonstrated different evolutionary origins for the RNA segments, suggesting the occurrence of natural genetic reassortment among the five Amazonian phleboviruses.