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Associações entre borboletas frugívoras em áreas de floresta com diferentes históricos de perturbação antrópica / Associations between fruit-feeding butterflies in forest areas with different historics of anthropic disturbances

Guidelli, Rodrigo Vieira [UNESP] 28 February 2016 (has links)
Submitted by Rodrigo Vieira Guidelli null (rguidelli4@gmail.com) on 2016-03-26T16:03:57Z No. of bitstreams: 1 Rodrigo Vieira Guidelli - Dissertação de Mestrado.pdf: 2574087 bytes, checksum: c4570e90e2f553c165e4cbcb47a0f339 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-03-28T16:40:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 guidelli_rv_me_rcla.pdf: 2574087 bytes, checksum: c4570e90e2f553c165e4cbcb47a0f339 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-28T16:40:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 guidelli_rv_me_rcla.pdf: 2574087 bytes, checksum: c4570e90e2f553c165e4cbcb47a0f339 (MD5) Previous issue date: 2016-02-28 / Pró-Reitoria de Extensão Universitária (PROEX UNESP) / Pró-Reitoria de Pós-Graduação (PROPG UNESP) / Em 2009 Uehara Prado et al., coletaram uma grande quantidade de dados para avaliar o papel das borboletas da família Nymphalidae como bioindicadoras, porém esses dados não foram utilizados em sua totalidade. O presente estudo está direcionado à experimentação e modelagem de interações ecológicas, a partir dos dados obtidos por Uehara-Prado et al. (2009), juntamente com aqueles não previamente utilizados que, no intuito de extrair o máximo de informação de relevância biológica e ecológica. Para tanto, foram utilizados três diferentes tipos de abordagens: (1) Biclusterização (Cheng & Church, 2000; Madeira & Oliveira, 2004); (2) Árvores de decisão (Quinlan, 1986; Bell, 1999; De’ath & Fabricius, 2000; Olden et al., 2008) e (3) Redes Bayesianas (Korb & Nicholson, 2003; McCann et al., 2006; Chen & Pollino, 2012; Pearl, 2014). Os resultados se mostraram bastante promissores, e as três ferramentas atingiram as expectativas; em biclusterização, conseguimos identificar todos os padrões de correlação dentro dos cenários apresentados, árvores de decisão se mostraram extremamente eficazes na classificação das variáveis apresentadas e as Redes Bayesianas conseguiram identificar quais variáveis influenciavam ou eram influenciadas pelas outras. Com este trabalho esperamos incentivar outros pesquisadores à revisitarem antigas bases de dados com ferramentas computacionais mais modernas, pois seu potencial é extraordinário. / Elucidating the complex interactions networks in ecological systems is not an easy task (Proulx et al., 2005) and, in order to extract information in an efficient way, powerful computational tools and the right approach, to the types of scenario to be studied, are required. In 2009 UeharaPrado et al., collected a great amount of data to assess the role of the Nymphalidae family of butterflies as bio-indicators, but these data were not used in its entirety. This study is aimed at experimentation and modeling of the ecological interactions from the data obtained by UeharaPrado et al. (2009), along with those not previously used, in order to extract the maximum information of biological and ecological significance. Therefore, three different approaches were used: (1) Biclusterization (Cheng & Church, 2000; Wood& Olive, 2004); (2) Decision Trees (Quinlan, 1986; Bell, 1999; De'ath & Fabricius., 2000; Olden et al, 2008) and (3) Bayesian Networks (Korb & Nicholson, 2003; McCann et al., 2006; Chen & Pollino, 2012; Pearl, 2014). The results were very promising, and the three tools reached our expectations; with Biclusterization we managed to identify all the correlation patterns inside the scenarios presented, Decision Trees proved to be extremely effective in the classification of the variables and the Bayesian Networks were able to identify what variables influenced or were influenced by the others. With this work, we hope to encourage other researchers to revisit old databases with more modern computational tools, because its potential is extraordinary.
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Agrupamento de dados baseado em predições de modelos de regressão: desenvolvimentos e aplicações em sistemas de recomendação / Data clustering based on prediction regression models: developments and applications in recommender systems

Pereira, André Luiz Vizine 12 May 2016 (has links)
Sistemas de Recomendação (SR) vêm se apresentando como poderosas ferramentas para portais web tais como sítios de comércio eletrônico. Para fazer suas recomendações, os SR se utilizam de fontes de dados variadas, as quais capturam as características dos usuários, dos itens e suas transações, bem como de modelos de predição. Dada a grande quantidade de dados envolvidos, é improvável que todas as recomendações possam ser bem representadas por um único modelo global de predição. Um outro importante aspecto a ser observado é o problema conhecido por cold-start, que apesar dos avanços na área de SR, é ainda uma questão relevante que merece uma maior atenção. O problema está relacionado com a falta de informação prévia sobre novos usuários ou novos itens do sistema. Esta tese apresenta uma abordagem híbrida de recomendação capaz de lidar com situações extremas de cold-start. A abordagem foi desenvolvida com base no algoritmo SCOAL (Simultaneous Co-Clustering and Learning). Na sua versão original, baseada em múltiplos modelos lineares de predição, o algoritmo SCOAL mostrou-se eficiente e versátil, podendo ser utilizado numa ampla gama de problemas de classificação e/ou regressão. Para melhorar o algoritmo SCOAL no sentido de deixá-lo mais versátil por meio do uso de modelos não lineares, esta tese apresenta uma variante do algoritmo SCOAL que utiliza modelos de predição baseados em Máquinas de Aprendizado Extremo. Além da capacidade de predição, um outro fator que deve ser levado em consideração no desenvolvimento de SR é a escalabilidade do sistema. Neste sentido, foi desenvolvida uma versão paralela do algoritmo SCOAL baseada em OpenMP, que minimiza o tempo envolvido no cálculo dos modelos de predição. Experimentos computacionais controlados, por meio de bases de dados amplamente usadas na prática, comprovam que todos os desenvolvimentos propostos tornam o SCOAL ainda mais atraente para aplicações práticas variadas. / Recommender Systems (RS) are powerful and popular tools for e-commerce. To build its recommendations, RS make use of multiple data sources, capture the characteristics of items, users and their transactions, and take advantage of prediction models. Given the large amount of data involved in the predictions made by RS, is unlikely that all predictions can be well represented by a single global model. Another important aspect to note is the problem known as cold-start that, despite that recent advances in the RS area, it is still a relevant issue that deserves further attention. The problem arises due to the lack of prior information about new users and new items. This thesis presents a hybrid recommendation approach that addresses the (pure) cold start problem, where no collaborative information (ratings) is available for new users. The approach is based on an existing algorithm, named SCOAL (Simultaneous Co-Clustering and Learning). In its original version, based on multiple linear prediction models, the SCOAL algorithm has shown to be efficient and versatile. In addition, it can be used in a wide range of problems of classification and / or regression. The SCOAL algorithm showed impressive results with the use of linear prediction models, but there is still room for improvements with nonlinear models. From this perspective, this thesis presents a variant of the SCOAL based on Extreme Learning Machines. Besides improving the accuracy, another important issue related to the development of RS is system scalability. In this sense, a parallel version of the SCOAL, based on OpenMP, was developed, aimed at minimizing the computational cost involved as prediction models are learned. Experiments using real-world datasets has shown that all proposed developments make SCOAL algorithm even more attractive for a variety of practical applications.
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Agrupamento de dados baseado em predições de modelos de regressão: desenvolvimentos e aplicações em sistemas de recomendação / Data clustering based on prediction regression models: developments and applications in recommender systems

André Luiz Vizine Pereira 12 May 2016 (has links)
Sistemas de Recomendação (SR) vêm se apresentando como poderosas ferramentas para portais web tais como sítios de comércio eletrônico. Para fazer suas recomendações, os SR se utilizam de fontes de dados variadas, as quais capturam as características dos usuários, dos itens e suas transações, bem como de modelos de predição. Dada a grande quantidade de dados envolvidos, é improvável que todas as recomendações possam ser bem representadas por um único modelo global de predição. Um outro importante aspecto a ser observado é o problema conhecido por cold-start, que apesar dos avanços na área de SR, é ainda uma questão relevante que merece uma maior atenção. O problema está relacionado com a falta de informação prévia sobre novos usuários ou novos itens do sistema. Esta tese apresenta uma abordagem híbrida de recomendação capaz de lidar com situações extremas de cold-start. A abordagem foi desenvolvida com base no algoritmo SCOAL (Simultaneous Co-Clustering and Learning). Na sua versão original, baseada em múltiplos modelos lineares de predição, o algoritmo SCOAL mostrou-se eficiente e versátil, podendo ser utilizado numa ampla gama de problemas de classificação e/ou regressão. Para melhorar o algoritmo SCOAL no sentido de deixá-lo mais versátil por meio do uso de modelos não lineares, esta tese apresenta uma variante do algoritmo SCOAL que utiliza modelos de predição baseados em Máquinas de Aprendizado Extremo. Além da capacidade de predição, um outro fator que deve ser levado em consideração no desenvolvimento de SR é a escalabilidade do sistema. Neste sentido, foi desenvolvida uma versão paralela do algoritmo SCOAL baseada em OpenMP, que minimiza o tempo envolvido no cálculo dos modelos de predição. Experimentos computacionais controlados, por meio de bases de dados amplamente usadas na prática, comprovam que todos os desenvolvimentos propostos tornam o SCOAL ainda mais atraente para aplicações práticas variadas. / Recommender Systems (RS) are powerful and popular tools for e-commerce. To build its recommendations, RS make use of multiple data sources, capture the characteristics of items, users and their transactions, and take advantage of prediction models. Given the large amount of data involved in the predictions made by RS, is unlikely that all predictions can be well represented by a single global model. Another important aspect to note is the problem known as cold-start that, despite that recent advances in the RS area, it is still a relevant issue that deserves further attention. The problem arises due to the lack of prior information about new users and new items. This thesis presents a hybrid recommendation approach that addresses the (pure) cold start problem, where no collaborative information (ratings) is available for new users. The approach is based on an existing algorithm, named SCOAL (Simultaneous Co-Clustering and Learning). In its original version, based on multiple linear prediction models, the SCOAL algorithm has shown to be efficient and versatile. In addition, it can be used in a wide range of problems of classification and / or regression. The SCOAL algorithm showed impressive results with the use of linear prediction models, but there is still room for improvements with nonlinear models. From this perspective, this thesis presents a variant of the SCOAL based on Extreme Learning Machines. Besides improving the accuracy, another important issue related to the development of RS is system scalability. In this sense, a parallel version of the SCOAL, based on OpenMP, was developed, aimed at minimizing the computational cost involved as prediction models are learned. Experiments using real-world datasets has shown that all proposed developments make SCOAL algorithm even more attractive for a variety of practical applications.

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