Orientador: Estevam Guilherme Lux Hoppe / Banca: Daniel Fontana Ferreira Cardia / Banca: Marcos Rogério André / Resumo: A Amazônia é o maior Bioma brasileiro, com uma das maiores biodiversidades mundial. Foram descritas 167 espécies de morcegos no Brasil, com 120 espécies registradas no Estado do Pará, das quais 10 têm registro exclusivo neste estado. Entretanto, apesar da elevada diversidade, são raros os estudos voltados para a descrição de endoparasitas em quirópteros pertencentes a este Bioma. Diante disso, o presente estudo teve como objetivo estudar a helmintofauna de diferentes espécies de quirópteros amazônicos, calcular os índices de infecção comparando-os com aspectos fenotípicos dos hospedeiros e avaliar os índices ecológicos populacionais e de cada guilda alimentar. Para tal, foram utilizados 67 morcegos de 21 espécies provenientes de várias cidades do Estado do Pará. Os animais foram separados em guildas alimentares e necropsiados. Os parasitas obtidos foram identificados taxonomicamente e quantificados. Dos animais estudados, 20,89% (14/67) encontraram-se parasitados. No total, foram recuperados 182 exemplares de helmintos das seguintes espécies: Anenterotrema eduardocaballeroi, Anenterotrema liliputianum, Ochoterenatrema caballeroi, Tricholeiperia sp., Parahistiostrongylus octacanthus, Litomosoides guiterasi, Litomosoides brasiliensis, Capillariinae gen. sp. e Hymenolepididae gen. sp. Pelos resultados obtidos verificou-se que não houve impacto do endoparasitismo na condição corporal dos quirópteros e não foram observadas diferenças entre a intensidade parasitária de machos e de ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Amazonia, the largest Brazilian Biomes, is one of the most biodiverse Biomes around the world. Considering the Brazilian chiropteran species, 120 of out 167 are registered in Pará State, with 10 endemic species. Despite the high diversity of bats in Amazonia, studies on their parasites, especially on helminths, are scarce. Therefore, the present study aims to study the helminthfauna of different bat species from the Pará State, Amazon Biome, determine the descriptors of infection and evaluate the host-parasite relationship, as well as evaluate diferences in ecological indexes in accord to the alimentary guilds. The study was developed on 67 bats of 21 species captured in several áreas of the Pará State. The animals were identified, divided in alimentary guilds and necropsied. The parasites obtained were identified and quantified. Parasites were found in 20.89% of the bats, a total of 182 specimens belonging to Anenterotrema eduardocaballeroi, Anenterotrema liliputianum, Ochoterenatrema caballeroi, Tricholeiperia sp., Parahistiostrongylus octacanthus, Litomosoides guiterasi, Litomosoides brasiliensis, Capillariinae gen. sp. and Hymenolepididae gen. sp. The results indicate that there was no impact of endoparasitism on host body condition and no relationship between sex and parasite intensity. In relation to the alimentary guilds, the omnivores showed higher prevalence and mean intensity. Animals from regions closer to the equator tend to have greater richness parasites species... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Carlos Camargo Alberts / Banca: Sérgio Nascimento Stampar / Banca: Gelson Genaro / Resumo: As relações evolutivas da Ordem Carnivora são extensivamente estudadas e contraditórias, principalmente entre os caniformes. Embora as filogenias baseadas em dados moleculares tenham feito uma contribuição importante, elas também podem ser comparadas a reconstruções usando outros tipos de caracteres, como comportamentais. O comportamento vem conquistando espaço no cenário da biologia evolutiva, e entre os comportamentos exibidos pelos animais, a autolimpeza se apresenta como uma boa fonte de caracteres filogenéticos. Este estudo teve como objetivo reconstruir uma filogenia das principais Famílias de carnívoros caniformes usando o comportamento de autolimpeza como caractere. Foi criada uma reconstrução filogenética por meio de caracteres moleculares como forma de comparação e evidência adicional. Nas análises comportamentais, excetuando-se os representantes dos grupos externos, uma grande politomia é o resultado para os demais terminais analisados. Os terminais dentro dessa politomia, no entanto, apresentam algumas relações interessantes e com grande sustentação em verificações de bootstrap e jackknife. Os resultados com dados moleculares, nos quais foram empregados setores específicos do gene citocromo b mostraram uma filogenia clássica da Subordem, exceto no que diz respeito à posição do representante da Família Canidae, mas com baixo suporte em verificação bootstrap em alguns ramos, exceto no que diz respeito à posição do representante da Família Canidae. A rápida radiação adaptativa, bem como especiação recente e grande diversidade ecológica dos grupos do estudo representam dificuldades ao se tentar estabelecer o exato relacionamento entre as espécies, independente dos dados biológicos utilizados para reconstrução filogenética. / Abstract: The evolutionary relationships inside the Order Carnivora are extensively studied and sometimes contradictory, especially among caniforms. Although phylogenies based on molecular data have made a significant contribution, they can also be compared to reconstructions using other types of characters, such as the behavioral ones. Behavior has aided space on the current state of evolutionary biology, and among the various possible behaviors exhibited by animals, grooming is a very good source of phylogenetic characters. Grooming has stereotyped patterns and it has been shown that differences in patterns of grooming are observable between closely related species, which makes it a good source of phylogenetic characters. Thus this study aimed to reconstruct a phylogeny of the major families of caniforms carnivores using the grooming behavior as character. A molecular phylogenetic reconstruction was created for comparison and also as further evidence. In the behavioral reconstruction, except for the representatives of the external groups, it resulted a large polytomy. Terminals within this polytomy, however, present some interesting and highly bootstrap and jackknife supported associations. The results with molecular data, in which specific sectors of the cytochrome b gene were employed, showed a classical phylogeny of the suborder, except for the position of the Canidae‟s representative, but with low bootstrap support in most branches. Rapid adaptive radiation, recent speciation and great ecological diversity of the studied group turn difficult to establish the exact relationship between the terminals, independent of the biological data used. / Mestre

Orientador: Valter José Cobo / Banca: Marcos Domingos Siqueira Tavares / Banca: Rogério Caetano da Costa / Resumo: O objetivo desta investigação é descrever e comparar a comunidade de decápodos braquiúros associados a bancos da alga S. cymosum (C. Agardh, 1820), em duas praias do litoral norte paulista. Foram realizadas coletas mensais durante o período de janeiro a dezembro de 2001, na região do entre-marés no substrato rochoso em bancos de S. cymosum nas praias Grande (23º23'S-45º03'W) e Domingas Dias (23º29'S-45º08'W), em Ubatuba. Em laboratório, os caranguejos foram submetidos a identificação taxonômica, mensurados quanto a largura de carapaça (LC) e identificados quanto ao sexo e fase do desenvolvimento. Foram obtidos 1948 indivíduos, reunidos em 23 espécies. Na praia Grande foram coletados 1115 indivíduos, distribuídos em 20 espécies, pertencentes a 5 superfamílias. Para a praia Domingas Dias foram obtidos 833 indivíduos, entre os quais foram registradas 21 espécies, de 4 superfamílias. Para a praia Domingas Dias Epialtus bituberculatus foi a espécie dominante enquanto que para a praia Grande, a dominância foi compartilhada por E. bituberculatus, Menippe nodifrons. Houve diferença significativa acerca do índice de diversidade (Mann-Whitney; p=0,0130) entre as praias, sendo que a praia Grande apresentou o maior valor para o índice (1,86nats/ind.). Essa diferença observada para a diversidade entre as praias Grande e Domingas Dias, pode refletir o fato de que ambientes mais heterogêneos geralmente abrigam maiores diversidades, sendo a praia Grande considerada como um ambiente mais heterogêneo e sujeita a maior exposição aos distúrbios ambientais, como ação de ondas, apresentando dominância compartilhada entre duas espécies enquanto a praia Domingas Dias, mais estável, apresentou expressiva dominância de uma única espécie, o que promoveu um baixo valor para o índice de diversidade. Desse modo, a maior ou menor exposição às ondas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of this research was to describe and compare the communities of brachyuran decapods associated with banks of the seaweed Sargassum cymosum (C. Agardh, 1820), on two beaches of the northeastern coast of São Paulo State. Monthly collections were conducted from January to December 2001, in seaweed banks on the intertidal rocky bottoms of the Grande (23º23'S-45°03'W) and Domingas Dias beaches (23º29'S-45º08'W). In the laboratory, the crabs were identified to species level and measured for carapace width (CW), sexed, and their developmental stage identified. A total of 1948 individuals were obtained, representing 23 species. On Grande Beach, 1115 individuals were captured, of 20 species in 5 superfamilies. On Domingas Dias Beach, 833 individuals were obtained, of 21 species in 4 superfamilies. On Domingas Dias Beach, Epialtus bituberculatus was the dominant species, whereas on Grande Beach, dominance was shared between E. bituberculatus and Menippe nodifrons. The diversity index differed significantly (Mann-Whitney, p=0.0130) between the beaches, being higher at Grande (1.86 bits/ind.). This difference in diversity is due to the fact that more heterogeneous environments generally show a greater diversity. Two co-dominant species occurred at Grande Beach, which is a more heterogeneous environment, exposed to environmental disturbances such as wave motion. A significant dominance of only one species was recorded at the more stable Domingas Dias Beach, which showed a low diversity index. In this investigation, wave motion appeared to have a strong influence on the species selection process on the rocky shore... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Reinaldo José Fazio Feres / Banca: Antonio Carlos Lofego / Banca: Denise Navia Magalhães Ferreira / Resumo: A árvore nativa Triplaris americana L. (Polygonaceae) é dióica e ocorre preferencialmente nas margens de rios e áreas ciliares das Florestas Latifoliadas Semidecíduas nos estados de Mato Grosso, Mato Grosso do Sul e região oeste do estado de São Paulo. No período de floração, que ocorre entre os meses de agosto a outubro, os indivíduos masculinos, pela produção de pólen, podem servir como reservatório para ácaros preponderantemente predadores, mantendo-os e promovendo seu aumento populacional. Em geral, ácaros dessa família constituem um grupo eficiente de predadores de ácaros fitófagos, pois vários estudos indicam que esses ácaros são importantes agentes para controle biológico e elementos essenciais para programas de manejo integrado de pragas. O presente trabalho teve como objetivo analisar a diversidade e ocorrência sazonal de ácaros em indivíduos masculinos e femininos de T. americana. As coletas foram realizadas em cinco indivíduos masculinos e cinco femininos, presentes em área urbana de São José do Rio Preto, São Paulo. Para comparar a abundância de ácaros entre os indivíduos masculinos e femininos de T. americana, foi aplicada a análise de variância (ANOVA) de medidas repetidas. Para verificar possíveis relações entre a abundância e riqueza de espécies com a pluviosidade, foi usada regressão linear. A diversidade máxima teórica também foi determinada. Nos exemplares masculinos foram coletados 29.968 ácaros pertencentes a 29 espécies, e nos femininos, 22.767 ácaros de 30 espécies. A diversidade de espécies de ácaros em exemplares de ambos os sexos de T. americana estudados foi inferior a 50% da diversidade máxima teórica prevista. As espécies fitófagas mais abundantes em ambos os sexos foram Lorryia formosa Cooreman, Allonychus brevipenis Feres, Aculus sp. e Lorryia sp.1. Entre os ácaros predadores, Euseius citrifolius... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The native tree Triplaris americana L. (Polygonaceae) is dioecious and occurs mainly along rivers and riparian areas of semi-deciduous broadleaf forest in the states of Mato Grosso, Mato Grosso do Sul and west of the state of São Paulo. During flowering, which occurs between the months of August to October, the production of pollen in male individuals may serve as a reservoir for mites mainly predators, keeping them and promoting increase of their population. In general, mites of this family are a group of efficient predators of phytophagous mites, as several studies indicate that these mites are important biological control agents and essential programs for integrated pest management. This study aims to analyze the diversity and seasonal occurrence of mites in male and female individuals of T. americana. Samples were collected from five male and five females trees, present in the urban area of São José do Rio Preto, São Paulo. To compare the abundance of mites between male and female subjects of T. americana, was applied to analysis of variance (ANOVA) with repeated measures. To verify the relationship between the abundance and species richness with rainfall, was used linear regression. The maximum theoretical diversity was also determined. In male specimens were collected from 29,968 mites belonging to 29 species, and in female, 22,767 mites of 30 species. The diversity of species of mites in samples of both sexes of T. americana study was less than 50% of the maximum theoretical diversity. As phytophagous species more abundant in the sexes were Lorryia formosa Cooreman, Allonychus brevipenis Feres, Aculus sp. and Lorryia sp.1. The highest abundance of predators occurred during flowering, Euseius citrifolius Denmark & Muma and Metapronematus sp.1., predatory mites, were the most common and of constant occurrence. Euseius citrifolius presented its highest abundance... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-27Bitstream added on 2014-06-13T20:39:56Z : No. of bitstreams: 1 barros_sp_me_botib.pdf: 672196 bytes, checksum: 1db93b923a596f273a88194379f68c37 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O objetivo desta investigação é descrever e comparar a comunidade de decápodos braquiúros associados a bancos da alga S. cymosum (C. Agardh, 1820), em duas praias do litoral norte paulista. Foram realizadas coletas mensais durante o período de janeiro a dezembro de 2001, na região do entre-marés no substrato rochoso em bancos de S. cymosum nas praias Grande (23º23’S–45º03’W) e Domingas Dias (23º29’S–45º08’W), em Ubatuba. Em laboratório, os caranguejos foram submetidos a identificação taxonômica, mensurados quanto a largura de carapaça (LC) e identificados quanto ao sexo e fase do desenvolvimento. Foram obtidos 1948 indivíduos, reunidos em 23 espécies. Na praia Grande foram coletados 1115 indivíduos, distribuídos em 20 espécies, pertencentes a 5 superfamílias. Para a praia Domingas Dias foram obtidos 833 indivíduos, entre os quais foram registradas 21 espécies, de 4 superfamílias. Para a praia Domingas Dias Epialtus bituberculatus foi a espécie dominante enquanto que para a praia Grande, a dominância foi compartilhada por E. bituberculatus, Menippe nodifrons. Houve diferença significativa acerca do índice de diversidade (Mann-Whitney; p=0,0130) entre as praias, sendo que a praia Grande apresentou o maior valor para o índice (1,86nats/ind.). Essa diferença observada para a diversidade entre as praias Grande e Domingas Dias, pode refletir o fato de que ambientes mais heterogêneos geralmente abrigam maiores diversidades, sendo a praia Grande considerada como um ambiente mais heterogêneo e sujeita a maior exposição aos distúrbios ambientais, como ação de ondas, apresentando dominância compartilhada entre duas espécies enquanto a praia Domingas Dias, mais estável, apresentou expressiva dominância de uma única espécie, o que promoveu um baixo valor para o índice de diversidade. Desse modo, a maior ou menor exposição às ondas... / The objective of this research was to describe and compare the communities of brachyuran decapods associated with banks of the seaweed Sargassum cymosum (C. Agardh, 1820), on two beaches of the northeastern coast of São Paulo State. Monthly collections were conducted from January to December 2001, in seaweed banks on the intertidal rocky bottoms of the Grande (23º23'S-45°03'W) and Domingas Dias beaches (23º29'S-45º08'W). In the laboratory, the crabs were identified to species level and measured for carapace width (CW), sexed, and their developmental stage identified. A total of 1948 individuals were obtained, representing 23 species. On Grande Beach, 1115 individuals were captured, of 20 species in 5 superfamilies. On Domingas Dias Beach, 833 individuals were obtained, of 21 species in 4 superfamilies. On Domingas Dias Beach, Epialtus bituberculatus was the dominant species, whereas on Grande Beach, dominance was shared between E. bituberculatus and Menippe nodifrons. The diversity index differed significantly (Mann-Whitney, p=0.0130) between the beaches, being higher at Grande (1.86 bits/ind.). This difference in diversity is due to the fact that more heterogeneous environments generally show a greater diversity. Two co-dominant species occurred at Grande Beach, which is a more heterogeneous environment, exposed to environmental disturbances such as wave motion. A significant dominance of only one species was recorded at the more stable Domingas Dias Beach, which showed a low diversity index. In this investigation, wave motion appeared to have a strong influence on the species selection process on the rocky shore... (Complete abstract click electronic access below)

The effect of sand mining on model groups of organisms (vascluar plants, beetles, amphibians and birds) was studied in South Bohemia. The studies were made in the next biotopes by model area sand pit Roudná II southern from Planá nad Lužnicí: unforested area (after mining), forest (on recultivated plots and seminatural forest) and water biotopes (depressions after mining). The next characteristics of biodiversity were determined: the diversity of communites, the frequency of protected, rare and vulnerable species. The protected species occur mainly in amphibians and birds. The suitable recultivation measures were proposed on the base of biodiversity studies.

Magister Scientiae (Biodiversity and Conservation Biology) - MSc (Biodiv and Cons Biol) / The collection of biological information has a long history, motivated by a variety of reasons and in more recent years is largely being driven for research and academic purposes. As a result biological information is often linked to a specific species or ecosystem management and is discipline specific, not relating to general management actions at a specific conservation site. The biological data that exists is often not consolidated in a central place to allow for effective management of conservation sites. Different databases and formats are often used to cover biological, infrastructural, heritage and management information. Biological information has traditionally not influenced real-time site-specific conservation management, with long term data sets being used to draw conclusions before they can influence management actions. In order to overcome this problem of scattered and unfocused data a biodiversity database related to specific site management was developed. This study focuses on the development of this database and its links to the management of spatially defined sites. Included in the solution of scattered data are the applications of information management tools which interpret data and convert it into management actions, both in terms of long term trends and immediate real- time management actions as the information is received and processed.

Em resposta à crescente perda de biodiversidade, diversos países adotam políticas de compensação que buscam equilibrar a destruição do habitat local restaurando, aprimorando e / ou protegendo áreas. Tais mecanismos são cada vez mais importantes no setor de mineração, onde a perda de habitat pode ser inevitável devido à rigidez locacional dos recursos minerais e com a coincidência com as áreas de importância da biodiversidade. Buscando contribuir para o avanço da compreensão da prática atual de compensação por perda de biodiversidade, investigamos as práticas adotadas em três minerações de calcário, em conformidade com a Lei da Mata Atlântica, lei federal que visa proteger este hotspot. Foram adotados os mecanismos de proteção e restauração em razões de área de 1: 1 a 1: 5. As principais dificuldades relatadas pelos atores chave foi encontrar áreas adequadas, métodos para calcular perdas residuais e incertezas sobre o sucesso da restauração. As melhores práticas recomendadas internacionalmente são parcialmente seguidas, com maior aderência observada para o caso cuja avaliação de impacto ambiental foi mais detalhada e forneceu uma base mais forte para planejar a compensação. Os resultados sugerem que a qualidade do planejamento e implementação de compensações está diretamente relacionada à qualidade da avaliação de impacto ambiental e, portanto, do licenciamento ambiental. / In response to the increasing loss of biodiversity, several countries have adopted offsetting policies that seek to balance local habitat destruction by restoring, enhancing and/or protecting equivalent values offsite. Such mechanisms are increasingly important in quarrying, where habitat loss may be unavoidable due to colocation of mineral resources and areas of biodiversity importance. Seeking to contribute to advance understanding of the current practice of biodiversity offsetting, we investigated actions required for environmental approval of three limestone quarries in compliance with Brazil\'s Atlantic Forest Act, a federal law that aims at protecting this biodiversity hotspot. Both protection and restoration offsets were applied at area ratios from 1:1.1 to 1:5. The main difficulties reported by practitioners are to find suitable areas, methods to calculate residual losses and uncertainties about the success of restoration. Internationally recommended best practices are partially followed with the highest adherence observed for the case whose environmental impact statement was more detailed and provided a stronger basis for designing the offset. Results suggest that the quality of offset planning and implementation is directly related to the quality of the environmental impact assessment.

Orientadores: Zanoni Dias, Guilherme Pimentel Telles / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação / Made available in DSpace on 2018-08-23T01:03:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Peixoto_BrunoMalveira_M.pdf: 1497265 bytes, checksum: 9127980450af9b4a7d8fe679c48f2310 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Metagenômica é o estudo genético de uma amostra ambiental, e permite a análise de organismos incultiváveis em laboratório. É uma área de estudo nova e possui muitos desafios computacionais, com poucas ferramentas dedicadas disponíveis. O objetivo deste trabalho é realizar um estudo metagenômico da diversidade de organismos microbianos de amostras da unidade de compostagem da Fundação Parque Zoológico de São Paulo, analisando e comparando os programas e métodos existentes. O estudo das comunidades microbianas que ali vivem é de grande importância para um melhor entendimento do papel biológico desses organismos. Dados simulados foram testados para validar os métodos utilizados com os dados reais e os resultados mostram que mesmo programas conhecidos são sensíveis aos bancos de dados de referência que utilizam / Abstract: Metagenomics is the genetic study of an environmental sample, and allows the analysis of non-culturable organisms. It is a new area of genetic study and has many computational challenges, with few dedicated tools available. The objective of this work is to realize a metagenomic study of the microbial diversity of samples from the composting unit of Fundação Parque Zoológico de São Paulo, analyzing and comparing existing programs and methods. The study of the microbial communities that live there is of great importance to a better understanding of the biological role of these organisms. Simulated data were tested to validate the methods we used with the real data and the results show that even well-known tools are biased by the reference databases it uses / Mestrado / Ciência da Computação / Mestre em Ciência da Computação

In this article we develop a comprehensive conceptual framework for resource efficiency indicators with a consistent link of resource use to the socio-economic system and activities therein as well as to the natural system and its ecosystem functioning. Three broad groups of indicators are defined: (1) resource use indicators representing pressures on the environment; (2) resource efficiency indicators relating resource use indicators to the socio-economic side; and (3) environmental impact indicators linking resource use impacts on the state of the natural system. Based on this conceptual framework we develop a structure for possible resource efficiency indicators and conduct a RACER evaluation on the Relevance, Acceptance, Credibility, Easiness and Robustness of indicators. With the RACER evaluation, we identify areas where indicators are well established and available as well as areas where indicators still need further development or even need to be designed first.