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We Grow Wild : Experimenting and learning about wild botanical allies to reclaim our food sovereigntyTomasin, Martina January 2021 (has links)
The biology and the patterns of wild environments and their organisms have solutions to the many environmental, social and economical challenges that we are facing globally. As an emerging designer, I believe that the tendencies of the ecological environments can be analyzed, mimicked and implemented by designers into different socio-cultural systems. In my design process I have been exploring practices that promote food sovereignty as a right that every living being should have. The results of my exploration is a guide to help to learn about and from wild edibles to deepen our connection with nature. My design includes my own process and iteration as well as one designed for those who are interested in exploring foraging practices.This project recognizes the different spheres and complexities of sustainability. It analyzes how our cultural and social practices impact the ecological environment, while, at the same time, it brings practical examples to understand the effects that our economy has on the overall well-being of the ecology, and suggests that we all can be beneficial participants as and in nature.The title “We grow wild” refers to the plants, which grow wildly in parks, hedgerows, paths and forests, as well as it encourages to rediscover the wild nature that re-emerges in us through active participation in the ecological environment we inhabit.
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Staudenknöterich: Untersuchungen zur Bekämpfung von Staudenknöterichen (Fallopia japonica Houtt, Fallopia sachalinensis): Ergebnisse der Freilandversuche des LfULG 2005 – 2018Meinlschmidt, Ewa 24 November 2020 (has links)
Im Rahmen des Vorhabens des LfULG „Untersuchungen zur Bekämpfung von Staudenknötericharten“ wurden von 2007 bis 2018 auf fünf Standorten in Sachsen Exaktversuche in der natürlichen Population durchgeführt. Getestet wurden Glyphosat-haltige und Glyphosat-freie Herbizide in unterschiedlichen Anwendungsverfahren sowie die Wirkung von mechanischen Maßnahmen. Die Schriftenreihe informiert über die Ergebnisse der Untersuchungen und gibt Empfehlungen zur Eignung der Verfahren. Die Veröffentlichung richtet sich insbesondere an Landwirte, Kommunen, Fachbehörden und Agrarfachleute.
Redaktionsschluss: 22.07.2020
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Genetic analysis of Helosciadium repens (Jacq.) W.D.J.Koch populations in Germany - Fundamental research for conservation managementHerden, Tobias 03 February 2020 (has links)
Crop wild relatives (CWR) are an indispensable and at the same time threatened genetic resources for plant breeding. The study uses wild species related to celery to demonstrate how genetic resources of CWRs can be actively maintained in their natural surroundings (in-situ). Genetic reserves should be designated for long term conservation of selected occurrences.
The study presents the selection procedure in detail, aiming at the identification of occurrences and sites suitable for the designation of genetic reserves, the spatial model of a genetic reserve and first practical results of the project. The overall aim of the project is the establishment of a nationwide network of genetic reserves for Apium graveolens, Helosciadium repens, H. nodiflorum and H. inundatum, the four wild celery species native to Germany.
Helosciadum repens (Jacq.) W.D.J.Koch is threatened by genetic erosion due to a decline in population numbers and sizes. The loss of any population is an irretrievable loss of diversity and opportunity to enhance crops in the future. Genetic reserves are one way to conserve these populations and their genetic potential.
Twenty-seven populations were selected for the analysis in a decision process based on site information. Microsatellites (SSR) were used to elucidate the genetic diversity of German populations. A cluster analysis was performed to see if the individuals form clusters of similarity. For that, a discriminate analysis of principal components (DAPC) was conducted, as the inbreeding index indicated a high number of inbreeding events in the populations and thus discordance with HWE (Hardy-Weinberg equilibrium). The analysis identified six genetic groups, which coincide well with the geographic origin of the analysed plants. The allelic richness (mean counts of alleles per individual per population) was higher in the southern populations compared to the northern ones. This North-South discrepancy was also visible as a high heterogeneity in the cluster assignments in the DAPC analysis. These differences in genetic diversity might be a result of the biogeographic history of Europe, especially the last glacial maximum.
For the establishment of genetic reserves, two populations were considered as most important: The population that differs the most from the average genetic composition and the population that represents the average genetic composition of a population the best. The two extremes of differentiation were interpreted as such that the former has a specific adaptation to its local environment, and the latter represents all populations the best.
DifferInt was used to analyse the SSR data and validate the differentiation of all populations compared to a pool of populations. However, SSRs are not capable of detecting adaptive traits. Populations were additionally chosen from different eco-geographic units (EGU), to increase the chance of capturing different traits. EGUs (Naturräume) are areas of specific abiotic and biotic features. These features may influence selection pressures and induce local adaptations. Based on site parameters and genetic data, 14 most appropriate wild populations (MAWP) were identified for genetic reserves establishment.
For H. repens, two eco-forms are known and described in the literature. Besides their different habitats (terrestrial/semi-terrestrial and aquatic) they can be differentiated by morphological traits. Leave and stolon sizes and flowering behaviour differ significantly. Furthermore, the roots of the aquatic forms do not anchor in soil but on other aquatic plants, wood or roots of trees, while the terrestrial form exhibits a shallow root system network similar to other perennial species.
To this end, no genetic analysis was conducted to clarify the phylogenetic status of the putative forms and authors avoided the usage of any specific noun rather than form. The SSR data from the previous study was evaluated, particularly with regards to the two forms. Additionally, an ISSR analysis was conducted, and the data was used to perform a PCA. There was no genetic clustering regarding the two forms neither in the SSR nor in the ISSR data. Nonetheless, the North-South discrepancy in the genetic diversity that was visible in the DAPC plot was confirmed in the PCA of the ISSR data.
However, markers may fail to detect quantitative variation for adaptively important traits. As the most obvious difference in the two habitats was the water availability, the adaptation of both forms to drought stress was studied by measuring the relative water content of leaves, system water content and water loss during drought stress conditions. The stomatal index was measured for different water treatment levels. The results indicate that phenotypic plasticity rather than genotypic adaptation is responsible for different H. repens phenotypes.
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Invasive Wasserpflanzen im Aquarium03 January 2025 (has links)
Mit Aquarien lassen sich zu Hause faszinierende Unterwasserwelten herstellen. Daher sind im Handel viele verschiedene Pflanzenarten zur Bereicherung von Aquarien erhältlich. Einige wenige dieser Arten können jedoch problematisch werden, wenn sie in Gewässer der freien Natur gelangen und dort ein invasives Verhalten zeigen. Sie sind in der Lage, die Vielfalt heimischer, wildlebender Arten zu verdrängen und zu gefährden. In diesem Faltblatt werden beliebte Arten vorgestellt und Hinweise zum Umgang mit diesen gegeben.
Redaktionsschluss: 01.12.2020
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Verschiedenblättriges Tausendblatt (Myriophyllum heterophyllum): Erfassung der Verbreitung und des Managements in Leipzig im Jahr 2022Fischer, Silvia 04 December 2024 (has links)
Der Bericht informiert über die Verbreitung des Verschiedenblättrigen Tausendblattes, eine invasive gebietsfremde Wasserpflanze, in Leipzig. Die Hinweise zum Umgang mit dieser Art können als beispielhaft für viele invasive gebietsfremde Wasserpflanzen betrachtet werden. Die Veröffentlichung richtet sich an alle Akteure, die in den Bereichen Gewässer sowie Naturschutz tätig sind.
Redaktionsschluss: 14.03.2024
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The Botanical CollectionMüller, Frank 03 September 2024 (has links)
Describing plants and exploring their appearance, occurrence and usefulness have been common practice from antiquity. Even though the term “herbarium” underwent various changes in meaning over the centuries, it generally referred to a book on herbs, listing plants that were believed to possess pharmaceutical properties. Illustrations – some of them of high artistic quality – in books on herbs have been known since the Early Modern Period. Illustrative woodcuts created between 1530 and 1546, depicting the herbaria of the three pioneers of botany, Otto Brunfels, Leonhart Fuchs and Hieronymus Bock, had additional value as botanical reference points (Dressendörfer 2011). Nature printing, using the plant itself as the printing plate, was another method used in illustrating botanical books. It drew on the idea of nature inscribing itself to determine the technique of illustration. The rather elaborate procedure, described by Leonardo da Vinci and perfected during the 19th century, allowed for a detailed image of the plant in question.
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Phagentyp-RNA-Polymerasen in Tabak und Arabidopsis / neue Aspekte ihrer entwicklungsspezifischen Rolle und zu potentiellen InteraktionspartnernSobanski, Johanna 24 February 2014 (has links)
Die Transkription in Plastiden höherer Pflanzen erfolgt durch die plastidärkodierte, bakterienähnliche RNA-Polymerase PEP und die kernkodierten Phagentyp-RNA-Polymerasen RpoTp und RpoTmp (NEP). Da für NEP bislang keine Transkriptionsfaktoren identifiziert wurden, wurden die entsprechenden Enzyme aus A. thaliana und N. tabacum mit verschiedenen, N-terminalen Epitopen in E. coli exprimiert und für pulldown assays zur Identifikation interagierender Proteine eingesetzt. Des Weiteren wurden Epitop-markierte Tabak RpoTp und Arabidopsis RpoTp und -Tmp in vivo exprimiert und zur Co-IP verwendet. In diesen Studien wurden als potentielle Interaktionspartner von RpoTp Ycf1 und Ycf2 gefunden. Des Weiteren konnte mit 3xFLAG-RpoT-exprimierenden Arabidopsis-Mutanten gezeigt werden, dass RpoTp und -Tmp teilweise membranassoziiert sind. Außerdem wurde die duale Lokalisation der Arabidopsis RpoTmp in den Chloroplasten und Mitochondrien nachgewiesen. Mittels RIP-Chip wurden mit RpoTp assoziierte RNAs analysiert und mögliche, bisher unbekannte NEP-Transkripte gefunden. Plastidäre Haushaltsgene besitzen meist sowohl PEP- als auch NEP-Promotoren. Anhand transplastomischer Tabakpflanzen, in denen NEP-Promotoren von accD , rpoB und rrn16 gegen einen PEP-Promotor ausgetauscht bzw. durch Mutagenese ausgeschaltet wurden, sollte die Arbeitsteilung von NEP und PEP in Abhängigkeit vom Entwicklungsstadium beleuchtet werden. Dabei wurde gezeigt, dass die Transkription durch PEP für accD zu einer leichten Überexpression, für rpoB hingegen zu einer verzögerten Entwicklung und verringerten Transkriptmengen führte. Zudem wurden durch RNA-Seq die Aktivierung zusätzlicher TSSs in den Mutanten gezeigt, welche die Effekte auf RNA- und Proteinebene erklärte, und der alternative Promotor PaccD-158 identifiziert, welcher auch im Wildtyp genutzt wird. Es wird diskutiert, inwiefern die Rolle von NEP und PEP individuell für einzelne Gene in Abhängigkeit ihrer jeweiligen Funktion betrachtet werden muss. / The transcription in plastids of higher plants is accomplished by the plastid encoded, bacterial-type RNA polymerase PEP and by the nuclear encoded, phagetype RNA polymerases RpoTp and RpoTmp (NEP). As the identification of transcription factors for NEP failed so far, in this work the corresponding enzymes from A. thaliana and N. tabacum containing different, N-terminally fused epitope tags were expressed in E. coli and used for pulldown assays to identify interacting proteins. Furthermore epitope-tagged tobacco RpoTp and Arabidopsis RpoTp and -Tmp were expressed in vivo and applied for co-immunoprecipitation. In these studies Ycf1 and Ycf2 were found as potential interaction partners of RpoTp. In addition, the 3xFLAG-RpoT-expressing Arabidopsis mutants were used to show, that RpoTp and -Tmp are partly associated with the thylakoid membrane. Further, immunoblot assays confirmed the dual localization of the Arabidopsis RpoTmp in chloroplasts as well as in mitochondria. Moreover, via RIP-Chip analyses RNAs associated with RpoTp were analysed and potential new NEP transcripts were found. Most plastidial housekeeping genes possess PEP as well as NEP promoters. The division of labor between NEP and PEP according to the developmental stage was studied on the basis of transplastomic tobacco plants, in which NEP promoters of accD, rpoB and rrn16 have been exchanged with a PEP promoter or knocked out by mutagenesis. It was shown, that transcription of accD by PEP lead to a slight overexpression, but PEP-dependent transcription of rpoB led to a delayed development and decreased transcript levels. Via RNA-seq an activation of additional TSSs could be shown in the mutants, which explains the effects on RNA and protein level, and the alternative promoter PaccD-158 was identified, that is also used in the wildtype. It is discussed, how the roles and the division of labor of NEP and PEP should be considered individually for each gene according to its function.
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Untersuchungen zu den Folgen der Photosensibilisieung durch akkumulierende Tetrapyrrole in transgenen TabakpflanzenKeetman, Ulrich 27 September 2000 (has links)
Zusammenfassung Transgene Tabakpflanzen, in denen wegen der Expression von Antisense-RNA für zwei Enzyme der Tetrapyrrolbiosynthese die Aktivität der Uroporphyrinogen-Decarboxylase bzw. Coproporphyrinogen-Oxidase vermindert ist, akkumulieren in starkem Ausmaß die Substrate der betroffenen Enzyme. Diese Porphyrinogene werden bei Anwesenheit von Sauerstoff autoxidativ oder durch unspezifische Peroxidasen in ihre photosensibilisierenden Derivate (Porphyrine) umgewandelt, welche die Ursache für zelluläre Schäden darstellen, die sich makroskopisch in Form von Blattläsionen zeigen. Im Verlauf der durch die angehäuften Porphyrine ausgelösten Reaktionen, die u.a. den Folgen der Behandlung von Pflanzen mit photodynamisch wirksamen Herbiziden und auch den Symptomen von Porphyria-Erkrankungen des Menschen ähneln, werden Membranlipide durch Peroxidation geschädigt und alle lichtexponierten Zellen massivem oxidativem Streß ausgesetzt. Dieser läßt sich anhand der kompartiment-übergreifenden und alle Ebenen der Expression umfassenden Aktivierung des antioxidativen Schutzsystems belegen. So können die Transkriptakkumulation und verstärkte Anhäufung der Proteine sowie der damit verbundene Anstieg der Aktivität von Superoxid-Dismutase und Ascorbat-Peroxidase nachgewiesen werden. Die erhöhte Aktivität der Schutzenzyme führt zu beschleunigtem Umsatz und größerem Bedarf an niedermolekularen Antioxidantien wie Ascorbat und Tocopherol. Gleichzeitig kommt es lokal beschränkt auf Blattgewebe in der Umgebung von Nekrosen zur Kreuzinduktion von pathogenese-assoziierten Prozessen, wie der Akkumulation von "pathogenesis related" (PR)-Proteinen, von Salicylsäure und der antimikrobiell wirksamen phenolischen Verbindung Scopolin. Diese Aktivierung der Pathogenabwehr wird durch die verminderte Ausbreitung einer Infektion der Pflanzen mit dem Tabak Mosaikvirus (TMV) widergespiegelt. Der Prozeß der Photosensibilisierung ist stark licht- und sauerstoffabhängig und wird außerdem durch erhöhte Temperaturen beschleunigt. Wird eine bestimmte Lichtdosis überschritten, werden die Porphyrine durch die dann rasch irreversibel geschädigten Plastiden freigesetzt, und es kommt wegen des nachfolgenden Absterbens von Gewebe zur Ausbildung der Blattläsionen. Dieser Effekt wurde ausgenutzt, um die Kinetik von Prozessen der antioxidativen und Pathogenabwehr in den Pflanzen zu untersuchen. Mittels Subtraktiver Suppressions-Hybridisierung (SSH) wurde eine subtrahierte cDNA-Bank angelegt, in der Gene vertreten sind, deren Expression bereits sehr früh als Reaktion auf die Photosensibilisierung induziert wird. Unter diesen Genen sind auch vermutete Komponenten von Signaltransduktionskaskaden einschließlich Transkriptionsfaktoren. Etwas überraschend war die Erkenntnis, daß vor allem pathogenese- und zelltod-assoziierte Prozesse frühzeitig aktiviert werden, die klassischen Enzyme der antioxidativen Streßabwehr aber erst später reagieren. Bei letzteren kommt es vor Veränderungen in der Expression zuerst zu einem Anstieg der Aktivität, der sich in verändertem Gehalt und Redoxstatus der niedermolekularen Antioxidantien niederschlägt. Insgesamt stellt sich die durch Antisense-Expression verursachte Deregulation der Tetrapyrrolbiosynthese und die daraus resultierende Photosensibilisierung als komplexes System dar, in dem antioxidative und Pathogenabwehr kreuzinduziert werden und welches als Modell zur Aufklärung von Mechanismen der Streßabwehr wertvolle Aussagen liefert. / Abstract Transgenic tobacco plants expressing antisense RNA for two enzymes of the tetrapyrrole biosynthetic pathway are characterized by decreased enzyme activity of either uroporphyrinogen decarboxylase or coproporphyrinogen oxidase and accumulate the substrates of these enzymes in large amounts. If oxygen is present the accumulated porphyrinogens are transformed either by autoxidation or unspecific peroxidases into their photosensitizing derivatives (porphyrins). They are the molecular basis for cellular damage which eventually becomes visible as leaf lesions. During photosensitization membrane lipids are damaged due to peroxidation reactions and most of the symptoms observed are similar to the effects caused by the treatment of plants with photodynamic herbicides, or resemble the characteristics of porphyria diseases in human. These plants suffer from oxidative stress which is concluded from the general and intercompartimental activation of the antioxidative stress defense system. Transcripts and proteins of superoxide dismutase and ascorbate peroxidase accumulate and the corresponding enzyme activities are increased. This increase leads to accelerated turnover and enhanced demand of low molecular weight antioxidants like ascorbate and tocopherol. Simultaneously, cross induction of pathogenesis-related responses is observed in the plants, like the accumulation of PR proteins, salicylic acid and the antimicrobial phenolic compound scopolin. The activation of the pathogen defense system leads to restricted spread of Tobacco Mosaic Virus (TMV) infection in the transgenic plants. Photosensitization strongly depends on light and oxygen and is enhanced by elevated temperature. Porphyrins are only released from rapidly damaged plastids into other cellular compartments if a certain light dose is exceeded. Then cell death commences and dead tissue becomes visible as leaf lesions. This light dosage effect was exploited to investigate the kinetics of antioxidative and pathogen defense responses upon light shift. By the use of Suppression Subtractive Hybridization (SSH) a subtracted cDNA library was established that contains genes which are early induced in response to photosensitization. The library also contains putative components of signal transduction chains and transcription factors. Unexpectedly, the expression of genes related to pathogenesis and cell death is rather early induced while the cellular antioxidative stress defense system responds later. The activity of antioxidative enzymes is increased before changes in transcript or protein accumulation occur, resulting in changes of content and redox ratio of low molecular weight antioxidants. In summary, photosensitization caused by the expression of antisense RNA and resulting in the deregulation of tetrapyrrole biosynthesis is a complex model system in which antioxidative and pathogen defense responses are induced. The approach can be used to further elucidate mechanisms of stress response.
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Untersuchungen zur Eisenassimilation in PflanzenEckhardt, Ulrich 19 December 2000 (has links)
In der vorliegenden Arbeit wurden Experimente zur pflanzlichen Eisenassimilation durchgeführt. Zwei cDNAs aus Tomatenwurzeln (LeIRT1 und LeIRT2, GenBank Acc-Nr. AF176579 und AF176580) wurden isoliert. Sie komplementierten Fe-aufnahmedefiziente Hefestämme in Bezug auf das Wachstum auf Fe-limitierendem Medium. Die durch die LeIRT-Proteine vermittelte Fe-Aufnahme wurde in Hefezellen charakterisiert. Sie war temperaturabhängig, sättigbar und Fe2+, nicht Fe3+ wurde transportiert. Kompetitions- und Komplementationsexperimente mit metall-aufnahmedefizienten Hefemutanten legten die Vermutung nahe, daß die beiden cDNAs für Kationentransporter codieren, die eine breite Substratspezifität für Übergangsmetalle aufweisen. Die Transkripte der LeIRT-Gene konnten fast ausschließlich in Wurzeln nachgewiesen werden, wobei LeIRT1 durch Fe-Mangel induziert war, während für LeIRT2 keine Regulation durch die Fe-Ernährung der Pflanzen erkennbar war. Die Genstruktur wurde aufgeklärt (GenBank Acc-Nr. AF246266). Schwierigkeiten in der Analyse der Fe-Assimilation höherer Pflanzen machten es notwendig, einen neuen Modellorganismus zu suchen. Dabei wurde die einzellige Alge Chlamydomonas reinhardtii ausgewählt. Physiologische Studien zeigten, daß diese Alge ähnliche Fe-Mangelreaktionen wie die meisten höheren Pflanzen aufweist. Insbesondere die starke Induktion einer Fe3+-Chelatreduktase und die parallele Induktion der Fe-Transportkapazität unter Fe-Mangel waren deutlich. Mindestens zwei Fe-Transportsysteme wurden postuliert, von denen das höheraffine durch Cu-Ionen gehemmt wurde. / In the present study, experiments were conducted to analyze the iron assimilation in plants. Two cDNAs from tomato roots (LeIRT1 and LeIRT2, GenBank Acc-Nr. AF176579 and AF176580) were isolated that complemented the growth defect of Fe uptake-deficient yeast mutants. The Fe uptake mediated by the LeIRT proteins was characterized in yeast. It was temperature-dependent, saturable and Fe2+ rather than Fe3+ was transported. Competition and complementation experiments with metal uptake-deficient yeast mutants suggested that both cDNAs code for cation transporters exhibiting broad substrate specificity for transition metals. The transcripts of both genes were predominantly detected in roots, LeIRT1 being induced by Fe deficiency whereas LeIRT2 was unaffected by the Fe status of the plants. The gene structure was determined (GenBank Acc-Nr. AF246266). Problems in the analysis of Fe assimilation in higher plants made it necessary to establish a new model organism. The unicellular eucaryotic alga, Chlamydomonas reinhardtii, was chosen. Physiological studies indicated that this alga reacted to Fe deficiency similar to most higher plants. Particularly the strong induction of an Fe3+-chelate reductase paralleled by the induction of Fe transport capacitiy under Fe deficiency were evident. At least two Fe transporters were postulated, one of which was inhibited by Cu ions.
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Evaluation of the role of mitochondrial citrate synthase, mitochondrial and cytosolic isoforms of isocitrate dehydrogenase in tomato leaf metabolismSienkiewicz-Porzucek, Agata 29 January 2010 (has links)
Der Citratzyklus (TCA) ist einer der bedeutendsten Stoffwechselwege für alle lebenden Organismen. Trotz der zentralen Rolle dieses Prozesses im Pflanzenmetabolismus ist er nur relativ wenig untersucht worden. In dieser Arbeit berichte ich über die Produktion und die funktionale Analyse von Tomatenpflanzen (Solanum lycopersicum), die unabhängig eine leicht eingeschränkte Aktivität der mitochondrialen Citrat-Synthase (CS) und zweier Isocitrat-dehydrogenasen (mitochondriale NAD-IDH und cytosolische NADP-ICDH) zeigen. Die transgene Pflanzen wiesen mehrheitlich keine erkennbare Veränderung eines Wachstumphänotyps auf. Obwohl die photosyntetische Leistung keine Änderungen gezeigt hatte, war die mitochondriale Respiration gestiegen, begleitet von einem reduzierten Kohlenstoff-fluss durch den Citratzyklus. Darüber hinaus waren die CS Pflanzen charakterisiert durch wesentliche Änderungen im Blattmetabolismus, einschließlich eines eingeschränkten Niveaus des photosynthetischen Pigments und Zwischenprodukten des Citratzyklus zusammen mit einer Akkumulation von Nitraten, verschiedenen Aminosäuren und Stärken. Zusammengefasst deuten diese Ergebnisse auf eine Einschränkung der Nitrat-Aufnahme hin. Das mit Hilfe von TOM1 Mikroarrays und quantitativer RT-PCR durchgeführte Transcript-profiling hat gezeigt, dass die fehlende Aktivität der mitochondrialen CS teilweise von einer gestiegenen, peroxisomalen CS Isoform ausgeglichen wird. Die metabolische Verschiebung ergab eine Verstärkung der photorespiratorischen Leistung, die vermutlich eine ausgleichende Rolle in der Produktion organischer Säuren und der Wiederherstellung der Redox-Balance spielt. Interessantenweise war die metabolische Antwort von Blättern auf Stickstoffmangel in NADP-ICDH Pflanzen dramatischer als in NAD-IDH Pflanzen, was darauf hindeutet, dass die cytosolische Isoform der Hauptlieferant von 2-Oxoglutarat im Tomatenmetabolismus sein könnte. / Although the TCA cycle is a respiratory metabolic pathway of central importance for all living organisms, relatively few molecular physiological studies of plants were performed to date. Here, I report the generation and functional analysis of tomato plants (Solanum lycopersicum) independently displaying mildly limited activity of mitochondrial citrate synthase (CS) and two isocitrate dehydrogenases, namely mitochondrial NAD-IDH and cytosolic NADP-ICDH. The transgenic plants revealed minor phenotypic alterations. Although the leaf photosynthetic performance was largely unaltered, the changes in mitochondrial respiration and carbon flux through the TCA cycle were observed. Moreover, the plants were characterized by significant modifications in the leaf metabolic content and in maximal catalytic activities of several enzymes involved in primary C and N metabolism. These results hint towards limitations in nitrate assimilation pathway. The transcript profiling performed by utilizing TOM1 microarrays and quantitative RT-PCR approach revealed that the deficiency in mitochondrial CS activity was partially compensated by up-regulation of peroxisomal CS isoform. The limitations in the activities of isocitrate dehydrogenases resulted in up-regulation of the photorespiratory pathway, which presumably played a compensatory role in supporting organic acid production and re-establishing redox balance in the transgenic leaves. Interestingly, the leaf metabolic response towards nitrogen starvation conditions was far more dramatic in NADP-ICDH transgenic plants than NAD-IDH plants, hinting that the cytosolic isoform may be the major 2-oxoglutarate supplier in tomato metabolism.
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