Orientador: Paulo Sérgio Moreira Carvalho de Oliveira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-26T11:02:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mota_LuisaLimae_M.pdf: 2431693 bytes, checksum: af49f66454904ecb2d987348646ea0e0 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: A escolha do local de oviposição tem grande influência na aptidão das fêmeas de Lepidoptera, uma vez que as larvas têm mobilidade restrita. Pistas químicas, visuais e/ou táteis provindas da planta hospedeira costumam ser utilizadas, mas também são importantes a presença de inimigos naturais ou parceiros mutualistas. No caso de espécies mirmecófilas, a oviposição pode ser mediada pelas formigas atendentes, mas pouco se sabe sobre como as borboletas percebem as formigas e as utilizam como sinal. Parrhasius polibetes, um licenídeo polífago que apresenta mirmecofilia facultativa, é comumente encontrada em Schefflera vinosa (Araliaceae), uma planta que também pode abrigar agregações do membracídeo Guayaquila xiphias. P. polibetes e G. xiphias podem ser atendidas pelas mesmas formigas, e larvas de P. polibetes tem sua sobrevivência aumentada quando ocorrem próximas às associações G. xiphias + formigas, e as borboletas adultas preferem ovipositar em ramos onde a associação está presente, embora não se conheça qual sinal é utilizado para essa escolha. Este trabalho teve por objetivo investigar se P. polibetes reconhece visualmente a associação e a utiliza como pista para oviposição. Foram feitos experimentos com formigas e membracídeos secos montados em ramos pareados de S. vinosa, entre os quais a borboleta poderia escolher. Fêmeas de P. polibetes preferiram ovipositar em ramos contendo a pista visual de formigas + membracídeos ou apenas de formigas, não havendo preferência quando apenas membracídeos estavam presentes. O número de ovos foi maior apenas quando a pista visual de formigas + membracídeos estava presente. Isso revela a importância da visão para a escolha do local de oviposição por P. polibetes, embora não se descarte o uso de pistas químicas ou táteis. A imagem de formigas deve ser recorrente em muitas espécies de plantas hospedeiras utilizadas por P. polibetes, e fêmeas capazes de utilizá-la na hora da oviposição teriam vantagem dada a importância das formigas para a sobrevivência das larvas. As pistas utilizadas por borboletas com diferentes níveis de mirmecofilia para escolha do local de oviposição representam um campo de estudo pouco explorado, que poderá revelar novos aspectos sobre a interação entre lepidópteros e formigas / Abstract: Because the larvae have restricted mobility, the location chosen for oviposition and immature development may have a crucial effect on Lepidoptera fitness. Chemical, visual and/or tactile cues from the host plant are usually utilized during host plant selection, but the presence of natural enemies or mutualistic partners is also important. In the case of myrmecophilous species, oviposition can be mediated by the tending ants, but little is known about how the female perceive ants, and use them as cues. Parrhasius polibetes, a poliphagous lycaenid that presents facultative myrmecophily, is commonly found in Schefflera vinosa (Araliaceae), a bush commonly hosting aggregations of the treehopper Guayaquila xiphias. P. polibetes and G. xiphias can be tended by the same ants, and P. polibetes larvae have their survivorship increased when they occur close to associations of G. xiphias + ants. Female butterflies prefer to oviposit on branches where the association is present, even though the signal used in this choice is unknown. The objective of this study was to investigate whether P. polibetes visually recognize ant-treehopper associations and use them as clue for oviposition. Behavioral trials consisted of dried ants and treehoppers mounted on paired S. vinosa branches, between which the butterfly could choose. P. polibetes females preferred to oviposit on branches containing ants + treehoppers or only ants, and showed no preference when only treehoppers were present. The number of eggs was greater only when both ants and treehoppers were present on a branch. These results reveal the importance of vision during the oviposition process in P. polibetes, even though chemical and tactile clues may also be used. The image of ants is probably recurrent in many host plant species used by P. polibetes, and females capable of perceiving them during oviposition would have an advantage, given the importance of ants for larval survival in this species. So far, the cues used during egg-laying by butterflies with different levels of myrmecophily have not been explored in detail; and further investigations might reveal new aspects about the behavioral interface of butterfly-ant interactions / Mestrado / Ecologia / Mestra em Ecologia

Orientador : Gil Martins Felippe / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-18T19:40:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Arasaki_FelicioRyoji_D.pdf: 7595523 bytes, checksum: 5bc0eb2b7813ae04dc73dd05e9a76101 (MD5) Previous issue date: 1993 / Resumo: Neste trabalho foi investigado o crescimento lento que ocorre na parte aérea de Kielmevera coriacea, característica esta que parece ser comum em espécies perenes dos cerrados. O estudo foi realizado em plântulas mantidas em casa de vegetação (UNICAMP) e em câmara de crescimento (Universidade de Edinburgo), assim como em árvores no campo (região de cerrado no município de Itirapina, SP). Os dados de TCR obtidos em plântulas mantidas em condições de casa de vegetação apresentaram valores baixos. Aparentemente, as diferenças de TCR com outras espécies lenhosas, em intervalos de tempo semelhantes, dizem respeito à velocidade de crescimento que cada espécie apresenta durante o seu primeiro ano de vida. Os valores de TCR para plântulas de K. coriacea mantidas em casa de vegetação não são muito diferentes do que os obtidos para plântulas de outras espécies arbóreas do cerrado, tampouco para a mesma espécie, quando as plântulas foram mantidas em condições diferentes. O padrão das curvas de TCR em casa de vegetação e câmara de crescimento foi semelhante e com valores maiores que em plântulas crescendo no cerrado. A TAL mostrou padrões semelhantes em casa de vegetação e câmara de crescimento, sendo diferentes e com valores menores em plântulas de cerrado. Os padrões de RAF entre casa de vegetação e câmara de crescimento foram semelhantes e com valores maiores que em plântulas no cerrado. Diferenças no crescimento relativo poderiam ser explicadas através das condições de germinação e desenvolvimento inicial diferentes entre as plântulas mantidas em casa de vegetação e câmara de crescimento. Além disso, o teor de umidade da terra de cerrado nos sacos plásticos das plântulas foi diferente e poderia ser a responsável pela melhor resposta de crescimento das plântulas em casa de vegetação, quando comparadas com as plântulas no cerrado. Os valores superiores em TCR, TAL e RAF das plântulas mantidas em câmara de crescimento, em relação às que cresceram em casa de vegetação, no final dos dois experimentos, podem estar relacionados com a quantidade de nutrientes disponíveis no sistema de plantio utilizado para as plântulas em casa de vegetação. Em termos absolutos, o crescimento de plântulas em casa de vegetação mostrou que em comprimento, as raízes cresceram mais rapidamente que a parte aérea. O número de órgãos foliares visíveis foi baixo, comparado com o de plântulas mantidas em condições controladas. As plântulas em câmara de crescimento mostraram também ser mais eficientes como produtoras de área assimiladora, área esta que é distribuída entre um número maior de órgãos foliares produzidos, tornando-os visíveis. Os valores de extensibilidade das paredes celulares das duas primeiras folhas foram muito semelhantes quando feitas as comparações durante suas fases de crescimento. Isto parece indicar que as propriedades mecânicas das paredes celulares em crescimento seriam as mesmas nas duas folhas. Tanto a extensibilidade total como a extensibilidade plástica aumentaram inicialmente, declinando depois até o final da expansão da lâmina. A extensibilidade elástica foi praticamente constante nas duas folhas. Pelas dosagens de ABA feitas nas folhas 1 e 2 em plântulas de K. coriacea mantidas em câmara de crescimento observou-se um conteúdo elevado no 50 dia. Como o crescimento destas duas folhas parece ter ocorrido de maneira independente desse aumento, tal pico poderia ser um sinal enviado pelo sistema radicular para uma diminuição do crescimento da parte aérea. O ABA atuaria provavelmente como um mediador do crescimento entre a parte aérea e o sistema radicular, inibindo o crescimento da parte aérea. Primórdios foliares não se desenvolveram na mesma proporção em que foram sendo produzidos. Com isso, a lentidão do crescimento da parte aérea das plântulas seria conseqüência não só da baixa produção de primórdios foliares, mas também reforçado pelo atraso do desenvolvimento de tais primórdios, pelo menos em plântulas com até 60 dias de idade. O plastocrono entre os primórdios 1 e 2 destas plântulas foi de aproximadamente 21 dias. Este valor foi baixo comparado com outras espécies de cerrado. O crescimento em termos de comprimento dos ramos produzidos por árvores de K. coriacea no cerrado mostrou-se bastante lento pois a contribuição anual em comprimento dos laterais não passou de 14,O cm. Os padrões de brotamento e sincronia na perda de folhas parecem sofrer influência das variações sazonais do ambiente. A permanência de folhas parece estar relacionada com as baixas tempereturas que ocorrem no inicio da estação seca. Primórdios foliares em ramos de K. coriacea já estão presentes nos ápices caulinares vegetativos após o término de produção foliar do ano. Estes primórdios devem ser de catafilos, já que eles são os primeiros a serem produzidos. O aparecimento de folhas reduzidas no fim de um período de crescimento foliar é comum em muitos arbustos de regiões tropicais, sendo este fenômeno considerado como regressão foliar. Em ramos de K. coriacea podem-se distinguir dois processos distintos durante o crescimento das últimas folhas N: o surgimento de brácteas em ramos induzidos para a floração e o aparecimento de folhas com regressão foliar em ramos não induzidos. Em árvores de K. coriacea, a queda da maioria das folhas B, bem como a interrupção abrupta no crescimento das folhas B remanescentes, parecem indicar que existe uma relação nutricional envolvida na interrupção do crescimento meristemático, como parece ocorrer em plantas das savanas neotropicais. O período de brotamento normal dos ramos laterais de K. coriacea foi ao redor de 50 dias e as folhas N, concluíram o seu crescimento entre 30 e 85 dias. Elas permanecem fotossinteticamente ativas por um período longo, em torno de 8 a 9 meses. A espécie pode ser definida como intermediária entre brevidecídua e verdadeiramente decidua. As plantas adultas de K. coriacea tem folhas grandes e podem ser consideradas como sendo escleromorfas através dos resultados da razão área foliar/peso. Esse escleromorfismo foliar estaria relacionado com deficiências minerais. K. coriacea possui estômatos em ambas as faces das folhas N, o que indicaria que esta espécie não tem restrição à perda de água, ou, em última análise, para a fotossíntese. O número de estômatos das folhas N foi superior ao observado para plântulas desta espécie. Os níveis de açúcares solúveis em folhas de K. coriacea realmente aumentaram somente perto da senescência foliar. Já no período em que as folhas N começaram a cair, o conteúdo de açúcares diminuiu bastante. Os valores da taxa fotossintética das folhas de K.coriacea foram baixos, quando comparados com os dados de plantas C3, porém, ainda dentro da faixa observada para outras de regiões tropicais e temperadas. Estes foram também semelhantes aos encontrados em espécies de cerrado e savanas neotropicais. As folhas de K. coriacea mostraram variações no conteúdo de clorofila entre os meses estudados. Altos níveis foram observados durante a expansão foliar e uma queda pôde ser vista apenas um pouco antes da senescência; o conteúdo de clorofila, porém, é praticamente estável ao longo da vida das folhas. Podemos dizer que K. coriacea é uma espécie que não possui limitações para a realização da fotossíntese, ou, pelo menos para a captação de C02, e que, pelo menos aparentemente, os carboidratos produzidos não são estocados nas folhas. Com isso, os fotoassimilados seriam transportados e estocados nos xilopódios, como acontece em plântulas desta espécie ou em outras espécies dos cerrados. Os fotoassimilados poderiam ainda contribuir no crescimento secundário das plantas, em épocas fora do brotamento e crescimento foliar / Doutorado / Doutor em Ciências Biológicas

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2015. / O presente estudo é inovador porque além de determinar os padrões da dinâmica temporal e espacial dos Nymphalidae no Cerrado relacionou os mecanismos (preditores) que melhor explicam esses padrões. As borboletas frugívoras foram capturadas de julho/2012 a junho/2013 em 60 armadilhas igualmente distribuídas em duas alturas (dossel e sub-bosque) no cerrado sensu stricto e na mata de galeria das proximidades de Brasilia-DF. Foram capturadas 3.459 borboletas de 62 espécies. Em geral os meses mais quentes e úmidos (mar–abr) foram aqueles com maior abundância e riqueza de borboletas. Borboletas grandes foram temporalmente mais restritas e ocorreram em maior sincronia com a oferta ótima de recurso alimentar do que seus relativos menores. No cerrado sensu stricto houve maior variação temporal da abundância e da riqueza de espécies do que na mata de galeria. Maior abundância e a riqueza de borboletas estiveram associadas às menores variações de temperatura e umidade do ar em micro-escala. Na mata de galeria, houve maior substituição de espécies ao longo do tempo do que no cerrado sensu stricto. O presente estudo mostra que a variação na diversidade temporal dos Nymphalidae é influenciada por uma série de fatores, muitas vezes dependentes e é bem mais complexa do que a simples associação da dinâmica dos Nymphalidae com as variáveis climáticas regionais. Com relação às variações espaciais, mais borboletas foram capturadas próximo ao solo do que no dossel como também no cerrado sensu stricto do que na mata de galeria. Maior riqueza de espécies ocorreu na mata de galeria (55 spp.) do que no cerrado sensu stricto (34 spp.). A composição de espécies de Nymphalidae foi distinta na dimensão horizontal (mata de galeria e cerrado sensu stricto) e, na mata de galeria, foram observadas comunidades distintas na dimensão vertical (dossel e sub-bosque). A altura das armadilhas influenciou negativamente a abundância de Nymphalidae. Áreas com maior densidade de plantas herbáceas foram aquelas com maior abundância de borboletas. Áreas com maior densidade de plantas lenhosas estiveram associadas à maior riqueza de espécies de Nymphalidae. O presente estudo ressalta a heterogeneidade de habitat como um importante componente de diversidade dessas borboletas no Cerrado. A dimensão vertical, até então negligenciada em estudos prévios no Cerrado, é determinante para a estruturação da comunidade de Nymphalidae na mata de galeria e contribui para a maior riqueza de espécies nesse habitat. Vale ressaltar que a riqueza e a composição de espécies vegetais, além da distância espacial, em menor porção, foram determinantes para a estruturação da comunidade dessas borboletas. Assim, as matas de galeria, espacialmente heterogêneas nas dimensões horizontal e vertical, agrupam maior parte da diversidade de borboletas observadas nesse estudo e devem ser priorizadas frente à intensa transformação da paisagem nesse bioma. / This study is inovative to the field of community ecology by describing spatial and temporal dynamics of fruit-feeding butterflies (Nymphalidae) in Cerrado, and defining relationships among the predictors that better explain these patterns. The Nymphalidae were captured from July/2012 to June/2013 in 60 bait-traps equally distributed into different vertical strata (canopy and understory) in areas of cerrado sensu stricto (savanna-like vegetation) and gallery forests around Brasilia, Brazil. A total of 3,459 butterflies from 62 species were captured. Generally, warmer and humid months (Apr-Mar) were related to higher Nymphalidae abundance and species richness. Larger butterflies were temporally more restricted and more related to periods of optimum food resource availability (ripe fruits) than smaller butterflies. Butterfly abundance and species richness showed higher temporal variation in savanna areas than gallery forest areas. Additionally, these variables were related to periods of lower variation in air temperature and humidity in a micro-scale. In gallery forest areas there was higher temporal species composition turnover than in savanna sites. This study also showed that the temporal diversity pattern in Nymphalidae is influenced by a number of factors, often inter-dependent. Regarding the spatial dynamics, there was a higher abundance of butterflies in the understory than in the canopy, and also in the savanna areas than in the gallery forest areas. Higher species richness was observed in the gallery forest (55 spp.) than in the savanna areas (34 spp.). A distinct community structure was observed in each savanna and gallery forest and between canopy and understory in the gallery forest. The butterfly abundance was negatively influenced by the height where the traps were installed. Butterfly abundance was positively correlated to higher herbaceous plant density, and species richness was correlated to higher woody plant density. This study highlights the habitat heterogeneity as an important factor that promotes high butterfly diversity in the Cerrado biome. The vertical dimension of the gallery forest is crucial to the understanding of the spatial species turnover, and contributes to the higher butterfly diversity in this habitat compared to the savanna areas. Besides the spatial distance, plant species composition was important in structuring the butterfly community. Thus, the gallery forests, as an heterogeneous habitat at the vertical and horizontal dimensions, contain most of the butterfly diversity and need to be protected against the intense landscape conversion in this biome.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2016. / Texto liberado parcialmente pelo autor. Conteúdo restrito: Capítulo 2 e Apêndice I. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-05-18T18:32:08Z No. of bitstreams: 1 2016_DéboraFarageKnuppdosSantos_Parcial.pdf: 6708225 bytes, checksum: 0340ad0794bc4ae6a1b51344c09e8c3c (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2016-05-27T12:23:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_DéboraFarageKnuppdosSantos_Parcial.pdf: 6708225 bytes, checksum: 0340ad0794bc4ae6a1b51344c09e8c3c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-27T12:23:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_DéboraFarageKnuppdosSantos_Parcial.pdf: 6708225 bytes, checksum: 0340ad0794bc4ae6a1b51344c09e8c3c (MD5) / A resistência antimicrobiana tem sido uma grande ameaça à saúde humana, dada a disseminação de genes de resistência a antibióticos (ARGs) em patógenos e micro-organismos clinicamente importantes, promovendo o aparecimento de cepas multirresistentes de difícil tratamento, complicado também pela queda na quantidade de novos antibióticos lançados no mercado. Assim, pesquisas por determinantes genéticos da resistência a antibióticos em isolados clínicos têm sido intensificadas desde os primeiros relatos de resistência antimicrobiana no começo do século XX. Neste contexto, a diversidade ambiental dos ARGs vem sendo subestimada, apesar do conhecimento de que a origem destes genes são os ambientes naturais, em particular o solo. Os micro-organismos presentes nesses ambientes são, em sua maioria, ainda não cultiváveis e consequentemente desconhecidos, o que os torna importantes fontes de novos genes e biomoléculas de interesse biotecnológico. Entretanto, analisar sua totalidade depende de técnicas independentes de cultivo. A metagenômica apresenta-se como uma ferramenta importante, já que acessa os micro-organismos de uma dada amostra ambiental pela extração do seu DNA total, permitindo identificar genes de interesse por abordagem de sequência ou funcional. Na pesquisa por novos ARGs, a metagenômica funcional é de grande valia para identificar novos mecanismos de resistência antimicrobiana e inferir a real diversidade de ARGs no meio ambiente, além de investigar os papéis ecológicos destes genes fora do ambiente clínico. Em trabalho anterior, observou-se a presença de três genes para putativas dioxigenases em dois clones resistentes isolados de biblioteca metagenômica de pequenos insertos (com insertos de 3-8 Kb) construída com DNA de amostras de solo de Cerrado. Nesta Tese, apresentam-se dois capítulos: o primeiro aborda a hipótese de que as dioxigenases putativas estão associadas ao fenótipo resistente observado. Dessa forma, três subclones foram construídos e denominados AMX3(2), AMX3(3) e CRB2(1), para posteriores análises fenotípicas e estruturais, onde CRB2(1) mostrou-se capaz de causar resistência à carbenicilina em Escherichia coli – adicionalmente, também mostrou-se capaz de resistir à ação do fenol. Em análises estruturais e enzimáticas, inferiu-se que o inserto é uma extradioldioxigenase com domínio bicupina, sendo uma provável gentisato 1,2-dioxigenase (GDO). Estas enzimas são importantes no metabolismo de compostos aromáticos, o que as torna potenciais em processos de biorremediação. No segundo capítulo está descrita a análise das sequências de seis clones resistentes isolados de biblioteca metagenômica de grandes insertos (com insertos de mediana de 35 Kb), também construída com amostras de DNA de micro-organismos de solo de Cerrado. A anotação gênica somou um conjunto de dados de aproximadamente 0,27 Mb, num total de 172 prováveis genes. Tais ORFs foram agrupadas em oito diferentes classes, de acordo com funções selecionadas. Dentre elas, 1,2% eram referentes a enzimas previamente relacionadas à resistência antimicrobiana e 5,8% a transportadores, que também são importantes protagonistas na resistência a xenobióticos. Apesar da grande diversidade de funções observadas, a maior parte das ORFs foi anotada como hipotéticas, sendo fontes para descrição de possíveis novos ARGs, assim como de genes de interesse biotecnológico. Essas observações indicam que a diversidade de ARGs em ambientes naturais difere daquela classicamente encontrada em isolados clínicos, o que evidencia a importância em acessar micro-organismos ambientais na tentativa de revelar novos mecanismos de resistência a antibióticos, que vem a enriquecer o conhecimento sobre seus papéis ecológicos e auxiliar pesquisas das indústrias biotecnológicas, como na prospecção de antimicrobianos e em processos de biorremediação. _________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Antimicrobial resistance poses a grave threat to human health given the dissemination of antibiotic resistance genes (ARGs) in pathogens and in clinically important microorganisms, promoting the rise of multiresistant strains of difficult treatment, also aggravated by the decreasing quantity of new antimicrobials launched onto the market. Hence, since the first reports of antimicrobial resistance in the beginning of the 20th century, the research for the genetic determinants of antimicrobial resistance have been intensified. In this context, the environmental diversity of ARGs was underestimated, despite the knowledge that such genes are environmental-born, especially on the soil. The majority of environmental microorganisms are not yet cultivable and remain unknown, being an important source for novel genes and biomolecules of biotechnological interest. However, analyzing them requires culture independent techniques. Metagenomics rise as a powerful tool, since it access the microorganisms from an environmental sample by the extraction of their total DNA, allowing for the identification of genes of interest by sequence and functional approaches. In the search for new ARGs, functional metagenomics is a valuable method to identify novel mechanisms for antibiotic resistance and infer the actual diversity of environmental ARGs, while exploring their ecological roles outside the clinical setting. In a former work, three putative dioxigenase genes were observed in two resistant clones isolated from a small-insert metagenomic library (insert size 3-8 Kb) constructed with DNA samples from Cerrado soil. In this Thesis, two chapters are provided: the former addresses the hypothesis in which putative dioxygenases are involved in the resistant phenotype observed. In this manner, three subclones were constructed and named AMX3(2), AMX3(3) and CRB2(1), for further phenotypical and structural analysis, where CRB2(1) proved resistant to carbenicillin in Escherichia coli – additionally, it was also able to resist the action of phenol. In the structural and enzymatic assays, the insert was presupposed as an extradioldioxygenase with a bicupin domain, most probably a gentisate 1,2-dioxygenase (GDO). These are important enzymes on aromatic metabolism and potential resources in the bioremediation industry. The latter chapter describes the sequence analysis of six resistant clones isolated from a large-insert metagenomic library (insert size around 35 Kb), also constructed with DNA samples from Cerrado soil. Gene annotation comprised a 0.27 Mb dataset, summing 172 probable genes. Such ORFs were grouped in eight different classes, according to preselected functions. Within these, 1.2% were related to enzymatic mechanisms of resistance and 5.8% were classified as transporters, that also play important roles on xenobiotic resistance. Although a great diversity of functions were observed, a greater number of ORFs was classified as hypothetical, being sources for the description of novel ARGs as well as of other genes of biotechnological relevance. These observations imply that the diversity of environmental ARGs differ from that classically observed in clinical isolates, which shows the importance in accessing environmental microorganisms in the attempt to reveal new mechanisms to antibiotic resistance, which may enrich the knowledge on their ecological roles and aid biotechnological researches, such as in antimicrobial bioprospection and in bioremediation processes.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Microbiana, 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-05-25T13:17:39Z No. of bitstreams: 1 2016_ElisaCatãoCaldeiraPires.pdf: 4049925 bytes, checksum: 9cecb3c146413346dd17da262923150a (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2016-05-26T16:27:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_ElisaCatãoCaldeiraPires.pdf: 4049925 bytes, checksum: 9cecb3c146413346dd17da262923150a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-26T16:27:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_ElisaCatãoCaldeiraPires.pdf: 4049925 bytes, checksum: 9cecb3c146413346dd17da262923150a (MD5) / A interação entre as variáveis do solo e a microbiota influencia os processos que ocorrem no solo, tanto que, em ambientes terrestres o N é reciclado primariamente pela microbiota. No ciclo do N, a nitrificação é a etapa em que nitrato se torna disponível no solo para as plantas, mas também N é perdido por lixiviação de nitrato ou pela emissão de gases nitrogenados. Entretanto, as mudanças climáticas, a modificação do uso da terra e a aplicação de fertilizantes nitrogenados veem alterando a dinâmica de N. Um especial interesse é direcionado à maior savana na América do Sul, o bioma tropical sazonal seco que é o Cerrado, cuja paisagem vem sendo alterada pela agricultura. Fazendo uso da técnica de metagenômica, os atributos funcionais da microbiota do solo do Cerrado quanto ao ciclo do N foram comparados entre dois parques de conservação do bioma, distantes 500 km entre si, com variação na textura e no conteúdo de água do solo. Os tipos de vegetação amostradas dentro de cada parque mascararam os efeitos de altitude e distância entre os parques, e todas as amostras apresentaram uma maior abundância de genes para assimilação de amônia e amonificação. Isso corrobora a literatura encontrada sobre o metabolismo de amônia como forma principal de N no Cerrado. Em particular, o Campo limpo alagado, presente somente em um dos parques, apresentou a maior abundância de genes fixadores de nitrogênio. Ainda, foram detectados genes para denitrificação, mas somente dois hits foram observados para nitrificação. Sucessivamente, foi acessado o impacto do manejo do solo sobre a abundância de Archaea e Bacteria oxidantes de amônia por quantificação do gene marcador amoA ao longo do cultivo da soja no bioma Cerrado. A análise molecular, tal como as técnicas clássicas e de isótopos mostraram um maior conteúdo de C orgânico e de NH4+-N no pousio em comparação à área nativa de reserva legal adjacente ao plantio da soja. De mesma forma, observou-se um aumento na abundância de oxidantes de amônia e da taxa de nitrificação no solo agrícola em comparação à área nativa, com a menor razão amônia/nitrato observada no solo após revolvimento. A abundância de AOB apresentou correlação com o aumento de pH ao longo do cultivo da soja. Experimentos seguintes testaram o efeito de água e de pH em microcosmos contendo solo do Cerrado, tal como a possível inibição de nitrificação em slurries contendo uma mistura de solo do Cerrado com um solo agrícola (Craibstone) com reconhecida atividade de oxidação de amônia. No entanto, o acúmulo de NO3- estava abaixo do nível de detecção na maior parte das amostras, tanto naquelas com aumento no teor gravimétrico de água ou com aumento de pH, independente da alta concentração de amônia. A nitrificação não foi inibida nas misturas de slurries incubadas, e, ainda, após 21 dias de incubação foi possível detectar transcritos de amoA de AOA no slurry de solo de Cerrado. Os perfis de DGGE mostraram um maior número de bandas de AOA amoA nos slurries de Craibstone e das misturas dos dois solos, do que o perfil observado nos slurries incubados somente com solo do Cerrado. Considerando o exposto acima, este foi o primeiro trabalho apresentado sobre o metabolismo de N e mais especificamente sobre a oxidação de amônia, utilizando dados de metagenomas e de PCR em tempo real. A baixa detecção de nitrato nas amostras de campo e de incubações em laboratório sugerem que algum outro mecanismo ocorre nos solos do bioma Cerrado no sentido de preservação de N inorgânico preferencialmente na forma de amônia. Sugerimos que a nitrificação depende da presença de oxidantes de amônia, mas também da composição da comunidade microbiana, sendo que a sua diversidade afeta a dinâmica de N no solo. Provavelmente condições abióticas e bióticas influenciam na limitação de crescimento da comunidade de oxidantes de amônia autotróficos no Cerrado. Por exemplo a competição por amônia entre esses oxidantes autotróficos e plantas ou com microorganismos heterotróficos. Ainda a redução dissimilatória de nitrato a amônia ou a imobilização abiótica de nitrato podem influenciar o desenvolvimento daquela comunidade. ______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Interactions between soil characteristics and microbiota influence the processes in soil ecosystem, as the terrestrial N is primarily cycled by the microbiota. In the N cycle, nitrification enables plants’ access to nitrate, although N can be lost through nitrate leaching, or N trace gas emission. These N dynamics are being disturbed by climate change, land use modification and the employment of nitrogenous fertilizers. A special interest goes to the largest savanna in South America, the seasonally dry Cerrado biome, where agriculture is changing the biome landscape. Shotgun metagenomics was used to compare the functional attributes of N cycling from the soil microbiota present in two conservation parks of the Cerrado biome, 500 km distant from each other, with varying soil texture and water content. Types of vegetation sampled within each park masked the altitude and distance effects, but all samples showed higher abundance of genes for assimilation of ammonia and ammonification. This corroborates Cerrado literature of ammonia as the main soil N form. In addition, a flooded grassland presented the highest abundance of N fixation genes. Despite the detection of denitrification genes, only two hits for the nitrification process were described. Subsequently, we assessed the impact of soil management on the abundance of Archaea (AOA) and Bacteria (AOB) ammonia oxidizers by quantification of the marker gene (amoA)during different stages of soybean cultivation within the Cerrado. Molecular analysis and classic and isotope techniques exhibited higher content of organic C and NH4+-N during fallow than in the adjacent undisturbed field, and an increase in ammonia oxidizers abundance and nitrification rates in the agricultural soil than in the undisturbed site, with the lowest ammonium/nitrate ratio in tilled soil. AOB abundance was correlated with the increase in pH during soybean cultivation. Further experiments tested the effect of moisture and pH in microcosms containing Cerrado soil, and the possible nitrification inhibition in slurries assembled with a mixture of Cerrado and agricultural soil known for actively oxidizing ammonia (Craibstone soil). Nevertheless, very little NO3- accumulation was observed in Cerrado microcosms with either increasing moisture or pH, despite high ammonia concentration. Nitrification was not inhibited in the mixed soilslurries, and after 21 days it was possible to detect the activity of AOA with the quantification of amoA transcripts. Moreover, DGGE profiles showed a higher number of AOA amoA gene in the Craibstone-only slurries and similar to the mixed slurries, but lower in the Cerrado-only slurries. This was the first assessment of the N metabolism with metagenomic data and qPCR for ammonia oxidation in the Cerrado. However, the little accumulation of NO3- in the field soils or in the treated microcosms or slurries advocates that some other mechanism occurs in this ecosystem to preserve inorganic N preferentially in the NH3 form. Taken these findings together, it is likely that not only the presence of ammonia oxidizers is fundamental for nitrification to occur, but that the microbial community composition and diversity affects the direction in which N process occur in soil. Most possibly there is a correlation between abiotic and biotic conditions that limits the abundance of autotrophic ammonia oxidizers, as for example the competition for NH4+ by plants or heterotrophic microbes or through dissimilatory reduction of NO3- to NH4+.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, 2006. / Submitted by mariana castro (nanacastro0107@hotmail.com) on 2009-09-23T01:13:23Z No. of bitstreams: 1 2006_Joana Dias Bresolin.pdf: 2181735 bytes, checksum: 5d37a03210880abc75471b85cac79e11 (MD5) / Approved for entry into archive by Gomes Neide(nagomes2005@gmail.com) on 2010-12-22T16:16:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2006_Joana Dias Bresolin.pdf: 2181735 bytes, checksum: 5d37a03210880abc75471b85cac79e11 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-12-22T16:16:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006_Joana Dias Bresolin.pdf: 2181735 bytes, checksum: 5d37a03210880abc75471b85cac79e11 (MD5) Previous issue date: 2006-03 / O Cerrado vem sofrendo intensas mudanças no uso da terra em especial devido ao desenvolvimento agrário. O manejo inadequado dos solos tem resultado em sua degradação afetando propriedades físicas, químicas e biológicas. A diversidade da comunidade microbiana de solos e os processos que regulam esta comunidade são ainda pouco conhecidos. Com o objetivo de avaliar o impacto de diferentes usos do solo sobre a comunidade microbiana, amostras de Latossolo Vermelho (0-5 cm) foram coletadas na Fazenda Dom Bosco (Cristalina-GO) em áreas de cerrado sentido restrito e nas lavouras sob plantio direto de soja (Glicine max) e feijão (Phaseolus vulgaris) irrigado com pivô central, na linha e entrelinha de plantio. Determinou-se o teor gravimétrico de água do solo, pH e carbono da biomassa microbiana. A estrutura da comunidade microbiana foi avaliada através do uso de PCR-DGGE-Seqüenciamento de16S e 18S rDNA. Em geral, o conteúdo gravimétrico de água, pH, carbono da biomassa microbiana e análises de PCR-DGGE 16S e 18S rDNA não diferiram nas amostras coletadas na linha e entrelinha de plantio nas áreas de cultivo de feijão e soja. Os valores médios de pH nas áreas agrícolas foram aproximadamente 14% maiores que na área nativa. área nativa e sob cultivo de soja foi possível observar um padrão sazonal nos valores de teor gravimétrico de água no solo e de biomassa microbiana. Entretanto, na área cultivada com soja, houve uma redução de 66% dos valores mínimos de biomassa em relação ao cerrado sentido restrito. Já na área de feijão irrigado, os valores de biomassa microbiana tenderam a não variar ao longo do ciclo de cultivo. Os dendrogramas das comunidades bacteriana e fúngica da área de soja e feijão irrigado obtidos a partir da análise do DGGE indicam primeiramente a influência do tipo de cobertura vegetal (áreas nativas x cultivadas), da presença ou ausência de cobertura (pré e pós-plantio e período de cultivo) e posteriormente do período de desenvolvimento da cultura e/ou da sazonalidade. A fertilização ocorrida na área de feijão irrigado parece ter influenciado mais a comunidade fúngica que bacteriana, pois os índices de similaridades entre as coletas foram menores. Com o seqüenciamento de bandas escolhidas nos géis de DGGE foi possível verificar a predominância das divisões actinobactéria,gammaproteobactéria, ascomicetos, basidiomicetos, chitridiomicetos e um membro do reino Protozoa. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The Cerrado is subjected to intense land use changes associated to agricultural development. The inadequate management of soils can lead to their degradation with impacts to physical, chemical and biological properties. The diversity of soil microbial community and the processes that regulate this community are still poorly understood. The objective of this study was to determine the effects of different land uses on the soil microbial structure. Soil samples (Red Latossol) (0-5 cm) were collected at the “Fazenda Dom Bosco” (Cristalina-GO) in a cerrado sentido restrito area, in an area cultivated with soybean (Glicine max) under no-tillage and another one cultivated with irrigated common bean (Phaseolus vulgaris) (central pivot), from row and inter-row. Soil gravimetric water content, pH, microbial biomass C were determined. The structure of soil microbial community were analysed by PCR-DGGE-Sequencing of 16S and 18S rDNA. In general, gravimetric water content, pH, microbial biomass C and PCR-DGGE 16S and 18S rDNA showed no difference between samples collected from row and inter-row in soybean and common bean areas. Mean soil pH values in soybean and common bean areas were approximately 14% higher than in the native area. In the native and soybean areas, a seasonal pattern was observed for gravimetric water content and microbial biomass C but in soybean area a reduction of 66% in microbial biomass was observed comparing minimum values in relation to cerrado sentido restrito. In the common bean area, microbial biomass tended to show no variation along the cultivation period. Cluster analysis from DGGE patterns of bacterial and fungal communities in soybean and common bean areas showed initially an influence of the type of vegetation (native areas x croplands), and then of the presence or absence of vegetation cover (fallow and growing period) and finally of plant development stage or seasonality. The soil fertilization on common bean area seems to produce more effect on fungal communities than on bacterial communities because similarity coefficients were lower when comparing different samples. Sequencing of selected bands showed a predominance of the following divisions: actinobacteria, gammaproteobacteria, ascomycetes, basidiomycetes, chitridiomycetes and a member of Protozoa Kingdom.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Ecologia, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2006. / Submitted by mariana castro (nanacastro0107@hotmail.com) on 2009-09-27T20:29:33Z No. of bitstreams: 1 2006_Joice Nunes Ferreira.pdf: 4854618 bytes, checksum: 6407c418df122bf1733653158d84c0e0 (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Maia(luanna@bce.unb.br) on 2009-09-29T15:05:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2006_Joice Nunes Ferreira.pdf: 4854618 bytes, checksum: 6407c418df122bf1733653158d84c0e0 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-09-29T15:05:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006_Joice Nunes Ferreira.pdf: 4854618 bytes, checksum: 6407c418df122bf1733653158d84c0e0 (MD5) Previous issue date: 2006-06-23 / O Cerrado exibe grande heterogeneidade espacial na estrutura da vegetação e extraordinária diversidade de espécies. Água no solo vem sendo extensivamente debatida como um dos principais fatores influenciando as características do Cerrado. Entretanto, a dificuldade em acessar a variabilidade espacial da água no solo, particularmente nas camadas profundas, sempre limitou esta investigação. Neste estudo, foi utilizado um método inovador para caracterizar a variabilidade da água disponível para as plantas (ADP), no solo profundo (0-10m), através de perfis de resistividade elétrica. É apresentada a relação espacial, em fina escala, entre a distribuição de água, estrutura e diversidade de espécies lenhosas. A variação espacial da água disponível para as plantas e dos atributos da vegetação lenhosa foi medida em três transectos (275 m) localizados na mesma fitofisionomia (cerrado denso). Os transectos não mostravam, portanto, qualquer gradiente estrutural óbvio na vegetação. A posição das plantas, altura, circunferência basal e dimensões da copa, individuais, e índice de área de foliar, riqueza e diversidade de espécies, foram examinados dentro de parcelas de 100 m2 centrados no transecto de resistividade/ ADP. A heterogeneidade espacial em ADP e na estrutura da vegetação foi avaliada através de medidas de autocorrelação espacial (Coeficiente I de Moran). Comparações com modelos nulos indicaram que as plantas estão distribuídas aleatoriamente no transecto com maior ADP e baixa heterogeneidade, e agregadas no transecto mais seco e heterogêneo. A densidade de plantas foi relacionada positivamente com ADP. Atributos da vegetação, indicadores de biomassa, exibiram padrão de variação espacial muito similar ao padrão de variação espacial de ADP. As médias para as parcelas de 100 m2 para todos os atributos da vegetação foram correlacionadas negativamente com ADP no solo profundo (abaixo de 400 cm) nos três transectos. As correlações negativas sugerem maior absorção de água do solo profundo (até 10 m) por plantas com maior estatura. Apesar de mostrarem riqueza de espécies similar, os três transectos diferiram em aspectos da diversidade. A diversidade de espécies foi mais baixa no transecto mais seco e heterogêneo; e mais elevada no transecto intermediário em ADP. As diferenças na diversidade de espécies entre transectos foram relacionadas a diferenças nos padrões de diversidade alfa (dentro dos plots) e beta (entre plots). O transecto mais seco e heterogêneo teve a menor diversidade alfa; entretanto mostrou a maior variação espacial na composição de espécies (diversidade beta). O transecto mais úmido e menos heterogêneo Teve diversidade alfa maior, porém menor diversidade beta. A riqueza de espécies foi positivamente correlacionada com ADP de 0- 400 cm, em ambas as estações. A eqüitabilidade e diversidade de Simpson, entretanto, foram negativamente relacionadas com ADP abaixo de 400 cm. Variações em ADP foram significativamente correlacionadas com variações florísticas nos três transectos. Ampla heterogeneidade espacial em ADP, em escala de dezenas de metros, foi encontrada no sítio de estudo. A estrutura da vegetação, riqueza e diversidade de espécies lenhosas co-variaram espacialmente com a água disponível no solo. _____________________________________________________________ ABSTRACT / The Brazilian savanna (Cerrado) shows large structural heterogeneity And rich plant species diversity. Soil water has been extensively debated as one of the major factors influencing vegetation features in savannas. However, this factor has not been well investigated because spatial heterogeneity of the belowground environment is difficult to assess through the usual ecological methods. Here, I have applied a novel methodological approach (soil electrical resistivity profiling) to convert interpolated data of soil electrical resistivity to volumetric water content. Then, I assessed the spatial and temporal variation of plant available water (PAW). Spatial variation in PAW and vegetation attributes of the woody vegetation were measured along three 275-m transects placed in a core area of the Cerrado (Águas Emendadas Ecological Station, Distrito Federal). The three transects were placed in the same physiognomy and they have not showed any obvious vegetation gradient. Plant position, height, basal circumference, crown dimensions, leaf area index, species identity, richness and diversity were surveyed within 22 100-m2 plots centered on the resistivity transect. Resistivity profiling has revealed strong PAW spatial variability among and within transects. Strong co-organization was found between structural attributes and PAW, in the most heterogeneous transect. Plant density was positively related with PAW. Comparisons with null models suggest that plants were randomly distributed over the transect with greater PAW and low ADP heterogeneity, and clustered in the driest and most heterogeneous transect. Averages for 100-m2 plots for all vegetation attributes were negatively correlated with PAW below 400 cm in the three transects, suggesting a greater water uptake from the deep soil by plants with greater stature. Despite their similar total species richness, the three transects showed differences in species diversity. Differences in species diversity among transects seemed related to unlike patterns of alpha (within plot) and beta-diversity (among plots). The driest and most heterogeneous transect showed lower alphadiversity; however it showed the highest beta diversity. The most humid and less heterogeneous transect showed higher alpha-diversity, but the lowest betadiversity. Species richness was positively correlated with PAW 0-400 cm depth. Simpson’s diversity, however, was negatively related to PAW beneath 700 cm. Dominance of one species, as more soil water became available at depth, contributed to the decline in species diversity. Overall, this study has revealed a strong spatial heterogeneity of the PAW, at fine-scale, which was coupled to structure and diversity of woody species in the studied savanna.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Ecologia, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2008. / Submitted by Danyelle Mayara Silva (danielemaiara@gmail.com) on 2009-09-14T20:54:08Z No. of bitstreams: 1 Tese_Leonardo Franca.pdf: 816757 bytes, checksum: 8e8164904f504a55081d57666227f34d (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2010-02-25T15:39:10Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese_Leonardo Franca.pdf: 816757 bytes, checksum: 8e8164904f504a55081d57666227f34d (MD5) / Made available in DSpace on 2010-02-25T15:39:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_Leonardo Franca.pdf: 816757 bytes, checksum: 8e8164904f504a55081d57666227f34d (MD5) Previous issue date: 2008 / As atuais estimativas de extinção da biodiversidade terrestre são centenas de vezes maiores que as estabelecidas para qualquer outro período da existência de vida na Terra. Neste contexto de extinções antropogênicas, estudos populacionais são essenciais para a conservação da biodiversidade e são um dos enfoques atualmente adotado pela biologia da conservação. O Cerrado, considerado centro de alta biodiversidade no mundo, é um dos biomas brasileiros com maior número de espécies de aves ameaçadas. No entanto, pouco esforço é empregado para gerar informações demográficas e ecológicas que determinem a probabilidade de persistência das populações de aves da região. Neste estudo, estabelecemos padrões de variação em parâmetros demográficos vitais para uma população de Suiriri islerorum, passeriforme endêmico do Cerrado. Além disso, traçamos alguns mecanismos ecológicos que interferem nestes parâmetros. Com estas informações, determinamos a probabilidade de extinção da população estudada e definimos aspectos da conservação desta espécie no Cerrado. Realizamos o estudo na Estação Ecológica de Águas Emendadas (ESECAE) entre 2003 e 2007. Avaliamos aspectos da sobrevivência em um estudo de marcação-captura-reavistamento de indivíduos e aspectos do sucesso reprodutivo com base em ninhos vistoriados em campo. Analisamos os dados de sobrevivência (Programa MARK) e sucesso reprodutivo (Programa SAS) com base na análise de modelos lineares/não-lineares generalizados. Implementamos uma análise de viabilidade desta população (Programa Vortex) para determinar a probabilidade de extinção e estabelecer aspectos da conservação da espécie. Detectamos uma taxa média de extinção de territórios de 13% ao ano. Esta tendência caracterizou um processo de decréscimo no tamanho populacional e evidenciou a existência de problemas demográficos. Os modelos usados para avaliar a sobrevivência indicaram que este parâmetro foi diferente entre grupos sociais (flutuantes e indivíduos reprodutivamente ativos), porém não foi diferente entre sexos e entre anos. A sobrevivência dos indivíduos não esteve abaixo dos valores esperados para Passeriformes neotropicais. Portanto este parâmetro 2 não deve estar negativamente afetado por outros fatores antrópicos e não deve ser responsável por taxas negativas de crescimento da população. Os fatores tempo-específicos que melhor explicaram a variação no sucesso reprodutivo de S. islerorum na ESECAE foram o ano e o estágio de desenvolvimento do ninho. Constatamos que os valores de sucesso reprodutivo (média = 15%) foram mais baixos e anualmente mais variados do que o observado para outros Passeriformes neotropicais. A predação de ninhos foi responsável por 88% dos insucessos. O sucesso reprodutivo apresentou maior potencial de estar relacionado a problemas demográficos do que a sobrevivência de adultos. Um mecanismo ecológico que mostrou potencial para afetar a variação no sucesso reprodutivo foi a interação indireta entre S. islerorum e Elaenia chiriquensis. Interações indiretas ocorrem quando o efeito que uma espécie exerce sobre a outra é mediado por uma terceira espécie ou grupo de espécies, neste caso, os predadores de ninho. Segundo os modelos avaliados o risco de predação dos ninhos de S. islerorum depende da abundância de ninhos de E. chiriquensis. Detectamos que a população de S. islerorum da ESECAE apresenta alta probabilidade de extinção (entre 52 e 100%) em um curto espaço de tempo (entre 17 e 58 anos). Uma análise de sensibilidade e as demais evidências aqui levantadas revelam que fatores relacionados à reprodução estão ligados ao processo de extinção. As tendências deste processo mostraram ser irreversíveis mesmo com a implementação de estratégias de manejo. Essas avaliaram possíveis programas de manejo traçados com base nos parâmetros demográficos e condições ecológicas descritos para esta população de S. islerorum. As populações de S. islerorum com alta probabilidade de persistência foram aquelas com mais de 800 indivíduos (= 5000 ha de habitat apropriado) e com fecundidade cerca de 50% maior que a registrada na ESECAE. S. islerorum certamente é uma espécie de ave do Cerrado que requer maior esforço para sua conservação. _________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The current estimates of species extinction are much higher than the ones for any other period of life on Earth. Under this scenario of anthropogenic extinctions, populational studies are essential to conserve biodiversity and are one of the thermes adopted by conservation biology. The Cerrado, considered a biodiversity hotspot, is currently one of the Brazilian biomes with more endangered species. However, little effort has been done to study demographical and ecological characteristics that determine the probability of persistence of bird populations in the region. Here, we estimated patterns of variation of vital demographic parameters of a population of Suiriri islerorum, a passerine endemic to the Cerrado. Also, we studied some ecological mechanisms that interfere with these parameters. This information was used to estimate the extinction probability of the population and analyze some conservation aspects of this species in the Cerrado. The study took place at the “Estação Ecológica de Águas Emendadas” (ESECAE) from 2003 to 2007. We evaluated survival aspects in a markrecapture- resight study of birds and reproductive success through nest monitoring. Birds survival analyses were run using Program MARK, and nest survival analyses using program SAS, considering generalized linear/non-linear models. Also, we ran a population viability analysis using the Program Vortex with the purpose to estimate the extinction probability of this population and evaluate conservation status of the species. We detected a territory extinction rate of 13% per year. This tendency showed a process of decrease in population size and the existence of demographic problems. The models used to evaluate birds survival indicate that this parameter was different between social groups (breeders vs. non-breeders), even though it did not differ between the sexes or years. Birds’ survival was not below the values reported for other Neotropical passerines. Thus, this parameter should not be a factor negatively affected by anthropogenic factors and not responsible for the negative population grown rates. The time-specific factors that best explained the variation in nest survival of S. 4 islerorum at ESECAE were the year and the nest development stage. We found that nest survival values (mean = 15%) were lower and more annual variate than the observed values of other Neotropical passerines. Nest predation was responsible for 88% of unsuccessful nests. Nest survival showed a greater chance of being related to demographic problems than to adult survival. An ecological mechanism that demonstrated a potential to affect nest survival was the indirect interaction between S. islerorum and Elaenia chiriquensis. Indirect interactions occur when the effect of one species on another is mediated by a third species/group of species, in this case, nest predators. According to the models evaluated the risk of S. islerorum nest predation depends on the abundance of E. chiriquensis nests. We detected that the S. islerorum population at ESECAE has a high probability of extinction (from 50 to 100%) in a short time frame (from 17 to 58 years). A sensibility analysis together with evidence raised in the previous chapters reveal that factors related to reproduction are responsible for the extinction process. The trends of this extinction process reveal to be irreversible even with the implementation of management strategies, evaluating potential management programs designed on the basis of demographic parameters and ecological conditions described for the population at ESECAE. Populations of S. islerorum with a higher probability of persistence are those with more than 800 birds (=5000ha of appropriate habitat) and with a fecundity around 50% higher than that observed at ESECAE. This species is certainly one of the Cerrado birds that require major conservation efforts.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Programa de Pós-Graduação em Química, 2011. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2012-04-24T15:48:21Z No. of bitstreams: 1 2011_LeandroAndradeMoreira.pdf: 8210868 bytes, checksum: 61a0ec79a5b533c7f9d3c4a970f0ce06 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-04-27T14:00:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_LeandroAndradeMoreira.pdf: 8210868 bytes, checksum: 61a0ec79a5b533c7f9d3c4a970f0ce06 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-04-27T14:00:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_LeandroAndradeMoreira.pdf: 8210868 bytes, checksum: 61a0ec79a5b533c7f9d3c4a970f0ce06 (MD5) / A potencialidade do Cerrado Brasileiro (Savana), como fonte de substâncias interessantes sob o ponto de vista químico e farmacológico, tem estimulado uma série de pesquisas visando à descoberta de novas entidades químicas e o desenvolvimento de fármacos. A quantidade do alcalóide indólico bufotenina em sementes de espécies de Anadenanthera vem despertando especial atenção quanto ao seu potencial como matéria-prima para preparação de derivados triptamínicos capazes de agir sobre sistema nervoso central, de exibir propriedade antimicrobiana, antitumoral ou de atuar como capturadores de radicais livres. Neste trabalho, sementes de duas árvores nativas do gênero, A. peregrina (var. peregrina) e A. peregrina (var. falcata), foram coletadas em dois períodos distintos. O alcalóide bufotenina foi isolado das sementes Anadenanthera com elevado padrão de pureza empregando uma adaptação do método de Stromberg. O alcalóide bufotenina foi isolado das sementes com elevado pureza empregando uma adaptação do método de Stromberg. Transformações químicas realizadas na bufotenina forneceram diversos derivados triptamínicos, os quais foram caracterizados por meio de técnicas de CG-EM, IV, RMN 1H e 13C (uni e bidimensionais). A triagem citotóxica realizada em diferentes linhagens de células tumorais humanas HCT-8 (cólon), SF295 (glioblastoma) e MDA-MB435 (melanoma) por meio do método do MTT mostrou que a bufofetina não é citotóxica enquanto que alguns dos seus derivados exibem potente e seletivo efeito antiproliferativo MDA-MB435, merecendo investigação adicional. Esses dados sugerem que modificações químicas na bufotenina podem fornecer substâncias com atividade antitumoral. A bufotenina juntamente com seus derivados estão sob investigação quanto ao perfil antioxidante. _____________________________________________________________________________ ABSTRACT / The potentiality of the Brazilian Cerrado (Savannah), as source of interesting substances from the point of view chemical and pharmacological, has stimulated a series of researches aiming the discovery of new chemical entities and the development of drugs. The amount of indole alkaloid bufotenin in seeds of Anadenanthera species has attracted special attention regarding its potential as starting material for the preparation of tryptamine derivatives able to act on central nervous system, to exhibit antimicrobial and antitumoral properties or to work like catchers of free radical. In this work, seeds of two native plant of the genus, A. peregrina (var. peregrina) e A. peregrina (var. falcata), were collected in two distinct periods. The alkaloid bufotenine was isolated from the seeds of Anadenanthera in high purity by using a modification of Stromberg method. Chemical modifications performed on bufotenin furnished several tryptamine derivatives, which were characterizated by GC-EM, FT-IR and RMN 1H and 13C (one and two-dimensional) techniques. The cytotoxicity screening performed in different human cancer cell lines HCT-8 (colon), SF295 (glioblastoma) and MDA-MB435 (melanoma) by the MTT method showed no activity for bufotenin whereas some of its derivatives exhibited potent and selective antiproliferative effect against MDA-MB435, deserving further investigation. These data suggest that chemical modification on bufotenin can provide substances antimural activity. Bufotenin together with its precursors are under investigation concerning the antioxidant profile.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Biologia, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2012. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2012-05-15T14:43:37Z No. of bitstreams: 1 2012_FranciscoDiogoRochaSousa.pdf: 37390572 bytes, checksum: aeef7dee27a2fb70765a7ff455a327a8 (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2012-05-15T15:02:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_FranciscoDiogoRochaSousa.pdf: 37390572 bytes, checksum: aeef7dee27a2fb70765a7ff455a327a8 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-05-15T15:02:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_FranciscoDiogoRochaSousa.pdf: 37390572 bytes, checksum: aeef7dee27a2fb70765a7ff455a327a8 (MD5) / Embora a convenção de Ramsar tenha verificado a importância das áreas úmidas para biodiversidade, estudos com este enfoque, no Brasil, têm sido conduzidos quase que exclusivamente em grandes áreas de planície, e dados sobre a diversidade da fauna de Cladocera são conhecidos principalmente nas planícies do Rio Paraná e Pantanal. Em áreas úmidas de menor porte, como as encontradas no Cerrado do Brasil Central, estudos são escassos e pouco se conhece sobre padrões de diversidade das assembléias de Cladocera. Este estudo objetivou investigar a diversidade da fauna de Cladocera em áreas úmidas localizadas em duas áreas que protegem fragmentos de Cerrado no Brasil Central. Três áreas no Parque Nacional de Brasília (Lagoa do Henrique, Lagoa do Exército e Peito de Moça) e três no Campo de Instrução de Formosa (Lagoa Cabocla I, Lagoa Cabocla II e Lagoa Grande) foram amostradas. As coletas foram conduzidas em 2009 em duas campanhas, uma no período seco e uma no chuvoso. Os dados de macrófitas, variáveis limnológicas e Cladocera foram obtidos obedecendo um gradiente de profundidade ou modificação na vegetação. Foram encontradas no total, 31 espécies de Cladocera, distribuídas em cinco famílias, com maior contribuição em número de espécies para Chydoridae. A utilização de estimadores de riqueza de espécies baseados em abundância evidenciou, por meio da análise assintótica de curvas de acumulação e porcentagem média de extrapolação, eficiência na obtenção dos dados de riqueza para assembléia de Cladocera. A avaliação composicional da fauna mostrou similaridade entre o Parque Nacional de Brasília e o Campo de Instrução de Formosa, contudo, a avaliação por área úmida apresentou composição especifica segundo os resultados da ANOSIM (R = 0,311; p = 0,001), sendo corroborado pela presença de espécies indicadoras destas áreas. Os resultados das variáveis limnológicas mostraram características de ambientes prístinos, principalmente baixas concentrações de nutrientes e valores de condutividade elétrica reduzidos, as quais não foram boas descritoras da diversidade da fauna de Cladocera para as áreas úmidas estudadas (r = 0,0367; p = 0,8). Por outro lado, a diversificação de habitats gerada pela riqueza de macrófitas parece ter um papel importante para a diversidade local de Cladocera, dado a importância relativa das regressões confrontando os dados de riqueza para macrófita e Cladocera, que em cinco das seis áreas úmidas estudas apresentaram valores de R2 > 0,5. Ainda, a avaliação da diversidade α para assembléia de Cladocera mostrou ser maior, em média, no Campo de Instrução de Formosa segundo os resultados da rarefação e dos índices de Shannon, Equitabilidade, Simpson e Distinção taxonômica (p < 0,05). Por outro lado, a avaliação diversidade β foi maior no Parque Nacional de Brasília quando comparado ao Campo de Instrução de Formosa (F = 10,384; p = 0,002). Apesar disto, a variabilidade na composição de espécies para ambas as áreas parece ser determinada, especialmente, pela variabilidade ambiental gerada pelas macrófitas aquáticas. Os resultados deste estudo apontam que nas áreas úmidas palustres localizadas no Cerrado Brasileiro, a heterogeneidade espacial fornecida pelas macrófitas podem ser importantes descritoras da diversidade local e regional de Cladocera. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Although the Ramsar Convention has noted the importance of wetlands for biodiversity, studies with this focus in Brazil have been conducted almost exclusively in large floodplains, and data on the diversity of Cladocera fauna are known mainly in the Paraná River floodplain and Pantanal. In smaller wetlands, such as those found in the Cerrado of Brazil Central, studies are scarce and knowledge about diversity patterns of Cladocera assemblages is reduced. This study aimed to investigate the diversity of the Cladocera fauna in paludal wetlands located in two protected areas of Brazil Central. Three areas in Parque Nacional de Brasília (Henrique Pond, Exército Pond and Peito de Moça) and three in Campo de Instrução de Formosa (Cabocla I Pond, Cabocla II pond and Grande Pond) were sampled. Sampling was performed during the dry and rainy season of the year 2009. The data of macrophytes, Cladocera and limnological variables were obtained obeying a gradient of change in the depth or aquatic vegetation. We found 31 species of Cladocera in total, distributed in five families, with major contribution in number of species for Chydoridae. The use of estimators of species richness based in abundance showed, by analyzing the asymptotic curves of accumulation and mean percentage of over-estimate, efficiency in collect of good data set of richness for Cladocera assemblage. The analyze of species composition showed similarity between the Parque Nacional de Brasília and Campo de Instrução de Formosa, however, the analyze by wetland sampled presented specific species composition according to the results of ANOSIM (R = 0.311; p = 0.001), being corroborated for the presence of indicator species of these wetlands. The results of limnological variables showed characteristics of pristine environments, specially low concentrations of nutrients and low values of conductivity electric, which were not good descriptors of diversity Cladocera fauna for the wetlands studied (r = 0.0367; p = 0.8). On the other hand, diversification of habitats created by richness of macrophytes seems to have an important hole to the local diversity of Cladocera, given the relative importance of regressions confronting the data for macrophyte richness and Cladocera, which in five of six wetlands studied presented values of R2 > 0.5. Besides, the analyze of diversity α, showed mean higher to the Campo de Instrução de Formosa according to the results of Shannon, Evenness, Simpson and taxonomic distinctness index (p < 0.05). On the other hand, the evaluation of diversity β was higher in the Parque Nacional de Brasília when compared to the Campo de Instrução de Formosa (F = 10.384; p = 0.002). Nevertheless, the variability in species composition in both protected areas seems to be determined, specially, by environmental variability generated by aquatic macrophytes. The results of this study indicate that in paludal wetlands located in Brazilian Cerrado, the spatial heterogeneity provided by macrophytes can be a important descriptor of local and regional diversity of Cladocera.