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Distribui??o espacial, biologia populacional das esp?cies de braqui?ros e crescimento som?tico de Uca rapax (Smith, 1870) no manguezal de Jabaquara/ Paraty - RJ / Spatial distribution, population biology of the brachyuran crabs (Crustacea, Decapoda) and somatic growth of Uca rapax (Smith, 1870) (Crustacea, Decapoda, Ocypodidae) in the Jabaquara`s mangrove/Paraty - RJ

BED?, Luciane Marins 30 June 2011 (has links)
Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2016-08-31T13:55:01Z No. of bitstreams: 1 2011 - Luciane Marins Bed?.pdf: 3568218 bytes, checksum: dd8b031aa116daa6b17232d9004b198b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-31T13:55:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011 - Luciane Marins Bed?.pdf: 3568218 bytes, checksum: dd8b031aa116daa6b17232d9004b198b (MD5) Previous issue date: 2011-06-30 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / This study was conducted in the Jabaquara mangrove, Paraty, Rio de Janeiro, with the aim of investigate the spatial distribution, population biology of brachyuran species and somatic growth of Uca rapax (Smith, 1870) (Crustacea, Decapoda, Ocypodidae) in the Jabaquara`s mangrove/Paraty - RJ. Sampling was performed in two grids from July 2007 to June 2008, using the capture effort per unit. Two collectors captured the crab monthly, during 15 minutes in low tide. Sediment samples from all the selected plots were collected to determinate particle size and organic matter. Air temperature and salinity also were measured. Eight species of brachyuran were captured, U. rapax, U. thayeri, U. vocator, U. uruguayensis, U. cumulanta, Neohelice granulata, Ucides cordatus and Eurytium limosum. U. rapax was the most abundant species in number of individuals and ovigerous females. The results indicated that distribution of the species was influenced by abiotic factors. The most species were more abundant in the inner portions of the mangroove and near of the sea. The ovigerous females of U. rapax were more abundant in the inner portions of the mangroove and near from the sea and N. granulata more distant from the sea. U. rapax showed a positive correlation with organic matter. U. thayeri, U. uruguayensis and E. limosum negatively correlated to distance from the sea. U. vocator showed positive correlation for sand and organic matter and negatively correlated to distance from the sea. U. cumulanta was positively correlated to sand. The ovigerous females of U. rapax showed a positive correlation to air temperature and organic matter. N. granulata and U. cordatus were the species more versatile in habitat colonization. The size of the crabs in the Jabaquara?s Mangrove were the smallest size than those found in other Brazilian mangroves. However, the males attained a larger size than females. The size frequency distribution was unimodal for the most species. In general, the males were predominant in all size classes, and more evident in larger classes. The sex ratio differ significant from 1:1 proportion (male: female), which most of the time dislocated for males. The most species showed a seasonal reproductive period, with more abundance of ovigerous females during the spring and summer. The growth curves in width (mm) for males and females were described by the equations: LC= 24,28 [ 1- e -0,0038(t-2,8) ] and LC= 22,0 [ 1- e -0,0031(t-2,3)], respectively. The males reach larger sizes and a higher growth rate than females. The longevity was estimated at three years for males and four years for females / Este trabalho foi realizado no manguezal de Jabaquara, em Paraty, Rio de Janeiro com o objetivo de analisar a distribui??o espacial, a biologia populacional das esp?cies de braqui?ros e o crescimento som?tico de Uca rapax (Smith, 1870) no manguezal de Jabaquara/ Paraty ? RJ. As coletas foram realizadas em dois grides de julho 2007 a junho2008, utilizando-se a t?cnica de esfor?o por unidade de captura. Dois coletores capturaram os caranguejos mensalmente, durante 15 minutos em per?odo de mar? baixa. Amostras de sedimento foram coletadas nas parcelas selecionadas, para determinar o tamanho das part?culas e mat?ria org?nica e a temperatura do ar e a salinidade tamb?m foram tomados. Foram capturadas oito esp?cies de braqui?ros: U. rapax, U. thayeri, U. vocator, U. uruguayensis, U. cumulanta, Neohelice granulata, Ucides cordatus e Eurytium limosum. U. rapax foi ? esp?cie mais abundante em n?mero de indiv?duos e de f?meas ov?geras. Os resultados revelaram que a distribui??o das esp?cies foi influenciada pelos fatores abi?ticos. A maioria das esp?cies foi mais abundante nas parcelas mais internas do manguezal e pr?ximas ao mar. As f?meas ov?geras de U. rapax e N. granulata foram mais abundantes nas parcelas mais internas do manguezal e mais pr?ximas e mais distantes do mar, respectivamente. U. rapax apresentou correla??o positiva para mat?ria org?nica. U. thayeri, U. uruguayensis e E. limosum apresentaram correla??o negativa para dist?ncia do mar. U. vocator apresentou correla??o positiva para areia e mat?ria org?nica e correla??o negativa para dist?ncia do mar. U. cumulanta apresentou correla??o positiva para areia. As f?meas ov?geras de U. rapax apresentaram uma correla??o positiva para temperatura do ar e mat?ria org?nica. N. granulata e U. cordatus foram as esp?cies mais vers?teis em formas de colonizar ambientes. Com rela??o ao tamanho dos indiv?duos, observou-se que os braqui?ros do Manguezal de Jabaquara, de maneira geral, apresentam tamanhos maiores que os encontrados em outros manguezais do Brasil. Contudo, os machos atingiram tamanhos maiores que as f?meas. A distribui??o de freq??ncia em classes de tamanho foi unimodal para a maioria das esp?cies. De maneira geral, os machos foram predominantes em todas as classes de tamanho, sendo mais evidente nas maiores classes. A raz?o sexual diferiu significativamente da propor??o 1:1, estando na maioria das vezes deslocada para os machos. A maioria das esp?cies apresentou um per?odo reprodutivo sazonal, ocorrendo maior abund?ncia de f?meas ov?geras na primavera e no ver?o. O modelo de von Bertalanffy foi utilizado para a descri??o do crescimento. As curvas de crescimento em largura (mm) para machos e f?meas de U. rapax, foram descritas pelas equa??es: LC= 24,28 [ 1- e -0,0038(t-2,8) ] e LC= 22,0 [ 1- e -0,0031(t-2,3)], respectivamente. Os machos apresentaram uma taxa de crescimento maior do que as f?meas. A longevidade foi estimada em 3 anos para os machos e 4 anos para as f?meas.
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Fatores estruturadores das assembl?ias de peixes em tr?s distintas zonas (rio, mistura e costeira) do estu?rio do rio Mambucaba, Angra dos Reis- RJ. / Factors structuring fish assemblages in three distinct zones (river, mixture and coastal) of the rio Mambucaba estuary, Angra dos Reis-RJ.

Neves, Leonardo Mitrano 05 March 2009 (has links)
Submitted by Leticia Schettini (leticia@ufrrj.br) on 2016-09-19T13:26:00Z No. of bitstreams: 1 2009 - Leonardo Mitrano Neves.pdf: 932793 bytes, checksum: 1e42ee61916afbed6020d0c2430fa7a4 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-19T13:26:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009 - Leonardo Mitrano Neves.pdf: 932793 bytes, checksum: 1e42ee61916afbed6020d0c2430fa7a4 (MD5) Previous issue date: 2009-03-05 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPQ / The estuarine systems influence fish assemblages, throughout their longitudinal gradients and remarkable salinity changes. Such assemblages adapt to different habitat constraints and change in spatial and temporal scales. The aim of this study was to assess the ichthyofauna composition and structure in three zones of the Mambucaba estuary (CZ ? coastal zone; MZ ? mixture zone and RZ ? river zone) and their relationship with environmental variables and habitat characteristics. Systematic fish collections (2 months in each seasons) were performed between October 2007 and August 2008, by using otter trawl at two sites in CZ (C1 e C2), beach seine at three sites in MZ (M1, M2, M3) and mesh trays at two sites in RZ (R1 e R2). At each fish sampling occasion, both surface and depth environmental variables of temperature, salinity, conductivity, turbidity and dissolved oxygen were taken and depth was measured. A total of 14,320 individuals, in 111 species (RZ ? 18; MZ ? 50, and CZ - 66) were collected. Distinct fish assemblages were found for each zone, as indicated by low number of common species (14 - MZ and CZ; 8 - MZ and RZ; and 2 - CZ and RZ), and only one abundant species (> 1% of the total number of fish within the zone) being common in more than one zone (Eucinostomus argenteus in CZ and MZ). Such pattern can be related to high salinity variation in MZ and narrow (20 m) channel width connecting the estuary with the sea, which can limit fish movement (into/out of the estuary). In CZ, the three more abundant species were Paralonchurus brasiliensis, Ctenosciaena gracillicirrhus, Anchoa lyolepis, Larimus breviceps and Stellifer brasiliensis, with large contribution of fish from the Scieanidae family in this zone (18 species). Spatial changes inf fish species were not consistent in CZ, probably due to lack of spatio-temporal estuarine plume influence on depth environmental variables (ANOVA, p>0.05). Depth was the main factor to influence spatial changes for Diapterus rhombeus (negative association) more abundant in C1 (average depth = 10 m; ANOVA, p<0.05) and Micropogonias furnieri, P. brasiliensis and Pellona harroweri (positive association) more abundant in C2 (average depth = 17 m; ANOVA, p<0.00). Diapterus rhombeus and Etropus crossotus occured mainly in Spring and Summer, and Eucinosomus gula in Spring. The most abundant species in CZ, typical of high salinty influence, is a indication that this zone have characteristics to inner continental shelf. In MZ, most abundant species (Eugerres brasilianus, Eucinostomus melanopterus, Trinectes paulistanus, Gobionellus shufeldti, G. oceanicus, Geophagus brasiliensis, Centropomus parallelus and Citharichthys arenaceus) have higher number and weight of individuals in M1 (ANOVA, p<0.01), an adjacent lagoon connected to the main channel. In spite of the significant negative correlation between this species and salinity (r-Spearman>0.32, p<0.01), the more sheltered areas in M1 seem to be more important to determine this pattern than salinity itself. The site M1 also have more number of individuals and species (ANOVA, p<0.01), and larger number of fish of smaller size (CT median = 58mm) compared to M2 and M3, located in the main channel (median = 106mm) according to Median and Kruskall-Wallis tests (p<0.01; 2 = 1167.5), indicating the importance of this area for species recruitment. Low average similarity (SIMPER) for sites M2 (38.7%) and M3 (17.8%) indicate larger variability of assemblage in these sites, probably due to lesser habitat structure e higher dynamism. In RZ, the fish assemblage have few species (5) with abundance higher than 1% of the total number of fishes, being dominated by Dormitator maculatus, Astyanax sp and ix Microphis brachyurus lineatus, species typical of upper estuaries and lower river reaches. Spatial variation was detected for D. maculatus only, more abundant at R2, a site with abundant riparian vegetation, mainly grass. Dormitator maculatus was more abundant in Summer and Autumn, M. brachyurus lineatus, in Spring, Autumn and Winter and Astyanax sp was absent in Spring only. Patterns in fish assemblage structure were at large scale, primarily species-specific responses to dominant environmental gradient, while at small scale, results of association with the habitat. / Os sistemas estuarinos influenciam as assembl?ias de peixes, ao longo de seus gradientes longitudinais e das marcadas varia??es da salinidade. Estas assembl?ias se adaptam ?s diferentes condicionantes do habitat e variam em escalas espaciais e temporais. O objetivo do presente estudo foi avaliar a composi??o e estrutura da ictiofauna em tr?s zonas do estu?rio do rio Mambucaba (ZC ? zona costeira; ZM ? zona de mistura e ZR ? zona de rio) e suas rela??es com as vari?veis ambientais e caracter?sticas do habitat destas zonas. Coletas sistem?ticas de peixes (2 meses por esta??o do ano) foram realizadas entre outubro de 2007 e agosto de 2008, com arrastos de fundo em dois locais da ZC (C1 e C2), arrasto de praia em 3 locais da ZM (M1, M2, M3) e peneira em 2 locais da ZR (R1 e R2). Em cada amostragem de peixes, foram tomadas, para a superf?cie e fundo, as vari?veis ambientais de temperatura, salinidade, condutividade, turbidez e oxig?nio dissolvido, bem como medida a profundidade. Um total de 14320 indiv?duos, constitu?dos por 111 esp?cies (ZR ? 18; ZM ? 50 e ZC - 66) foram coletados. Assembl?ias de peixes distintas foram identificadas para cada zona, indicadas pelo baixo n?mero de esp?cies comuns (14 - ZM e ZC; 8 - ZM e ZR; e 2 - ZC e ZR), e com apenas uma esp?cie abundante (> 1% do numero total de peixes na zona) comum em mais de uma zona (Eucinostomus argenteus na ZC e ZM). Tal padr?o pode estar relacionado ? maior variabilidade da salinidade existente na ZM e a estreita (20 m) largura do canal de conex?o com o mar, fatores que podem ser limitantes aos movimentos (entrada/sa?da) de peixes. Na ZC, as tr?s esp?cies mais abundantes foram Paralonchurus brasiliensis, Ctenosciaena gracillicirrhus, Anchoa lyolepis, Larimus breviceps e Stellifer brasiliensis, com a maior participa??o de peixes da fam?lia Sciaenidae nesta zona (18 esp?cies). As varia??es espaciais das esp?cies foram pouco consistentes na ZC, provavelmente relacionado a influencia da pluma estuarina n?o ter provocado mudan?as espa?o-temporais nas vari?veis ambientais de fundo (ANOVA, p>0,05). A profundidade foi o principal fator respons?vel pela separa??o espacial encontrada para Diapterus rhombeus (associa??es negativas) mais abundante em C1 (profundidade m?dia = 10 m; ANOVA, p<0,05) e Micropogonias furnieri, P. brasiliensis e Pellona harroweri (associa??es positivas) mais abundantes em C2 (profundidade m?dia = 17 m; ANOVA, p<0,00). Diapterus rhombeus e Etropus crossotus ocorreram principalmente na primavera e ver?o, e Eucinosomus gula na primavera. As esp?cies mais abundantes da ZC, t?picas de ?guas com maior influencia salina, ? um indicativo de que esta zona tem caracter?sticas mais associadas ? plataforma continental interna. Na ZM, a maioria das esp?cies mais abundantes (Eugerres brasilianus, Eucinostomus melanopterus, Trinectes paulistanus, Gobionellus shufeldti, G. oceanicus, Geophagus brasiliensis, Centropomus parallelus e Citharichthys arenaceus) apresentou maior n?mero e peso de indiv?duos em M1 (ANOVA, p<0,01), uma lagoa adjacente conectada ao canal principal. Apesar das correla??es negativas significativas observadas entre estas esp?cies e a salinidade (r-Spearman>0.32, p<0,01), as ?reas mais abrigadas em M1 parecem ser mais determinantes neste padr?o do que a salinidade em si. O local M1 tamb?m apresentou o maior n?mero de indiv?duos e de esp?cies (ANOVA, p<0,01), com maior n?mero de peixes de menor tamanho (CT mediana = 58mm) do que dos locais M2 e M3, situados no canal principal (mediana = 106mm) de acordo com o Teste das Medianas e Teste de Kruskallvii Wallis (p<0,01; 2 = 1167,5), indicando a import?ncia desta ?rea para o recrutamento das esp?cies. A baixa similaridade m?dia (SIMPER) para os locais M2 (38,7%) e M3 (17,8%) indicam uma maior variabilidade na assembl?ia destes locais, possivelmente devido a menor estrutura??o do habitat e maior dinamismo. Na ZR, a assembl?ia de peixes apresentou poucas esp?cies (5) com abund?ncia maior que 1% do n?mero total de peixes, sendo dominada por Dormitator maculatus, Astyanax sp e Microphis brachyurus lineatus, esp?cies t?picas de ?reas lim?trofes entre a zona superior do estu?rio e a zona baixa de rio. Varia??es espaciais foram detectadas apenas para D. maculatus, mais abundantes em R2, um local com abundante vegeta??o marginal composta principalmente por gram?neas. D. maculatus foi mais abundante no ver?o e outono, M. brachyurus lineatus, na primavera, outono e inverno e Astyanax sp foi ausente somente na primavera. Os padr?es na estrutura da assembl?ia de peixes s?o, em maior escala, primariamente resultado das respostas individuais das esp?cies ao gradiente ambiental dominante, enquanto em menor escala, resultado das associa??es com o habitat.
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Comunidades de formigas (Hymenoptera: Formicidae) do estrato arbustivo-arb?reo em fragmentos florestais de Mata Atl?ntica no Rio de Janeiro / Ant communities (Hymenoptera: Formicidae) of the woody layer in forest fragments of Atlantic Forest in Rio de Janeiro

COELHO, Renata Cristina de Souza 02 May 2011 (has links)
Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2016-10-03T11:27:04Z No. of bitstreams: 1 2011 - Renata Cristina de Souza Coelho.pdf: 1271616 bytes, checksum: 7e462a30d8cdde8325d226c9741f0141 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-03T11:27:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011 - Renata Cristina de Souza Coelho.pdf: 1271616 bytes, checksum: 7e462a30d8cdde8325d226c9741f0141 (MD5) Previous issue date: 2011-05-02 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / In the Atlantic forest, deforestation and the resulting forest fragmentation have been worsening since the sixteenth century. Recent data estimate that the area covered with forest of Mata Atlantica represents between 11.6% and 16% of its original length, resulting in the extinction of species due to habitat reduction and isolation and edge effect. Among animals, insects are noted for presenting the largest number of species and participate in a large number of interactions with other organisms. Being good bioindicators in studies of environmental impact assessment, including the effects of forest fragmentation. Ant communities (Hymenoptera: Formicidae) have been used as bioindicators because of their high species richness and respond to environmental changes. The main objective was to study the effects of forest fragmentation on the richness, diversity and community composition of ants foraging on plants. Moreover, there was the spatial and temporal variations of this community and the influence of vegetation structure and in the richness and diversity of arboreal ant fauna. The study was conducted during the dry season of 2009 and the rainy season of 2010. We sampled eight forest fragments in the City of Vassouras, besides Tingu? Biological Reserve, State of Rio de Janeiro. In a plot of 120 m2, 20 trees with CAP between 15 to 40 cm were marked, these being distant about 10 m apart. The same amount of sardines in edible oil, was placed in the trunk of each tree and on white paper, 10 cm x 12 cm, distributed over 20 bushes near their trees, the approximate height of 1 m. The baits were placed in the schedule between 10:30 and 11:00, one hour remaining on the vegetation. To sample the vegetation structure, we used the method of touch. All trees with CAP over 5 cm were counted and morphospecies and were also obtained the percentage of canopy cover. In order to study the influence of abiotic factors were recorded temperature and relative humidity. We collected a total of 73 morphospecies of ants distributed in 20 genera and six subfamilies, Myrmicinae (33), Dolichoderinae (15), Formicinae (12), Pseudomyrmecinae (7), Ponerinae (3), Ectatomminae (2) and Ecitoninae (1). Pheidole was the largest genus with species richness (13), followed by Linepithema (9) Solenopsis (8), Pseudomyrmex (7) and Brachymyrmex (6). Overall, the diversity index and species richness of ants were higher in the rainy season than in dry season. We found 12 unique species in the dry season and 32 in the rainy season. The variation of fragment size did not influence the species richness of ants on a local scale. The multiple regression analysis step by step to the data of vegetation structure of the fragments revealed that the richness and diversity (H') of ant species depended mainly on the density of shrubs and trees away all the vegetation structure has influenced ant community. This shows that for the arboreal ant community, the habitat quality is more important than the size of the area, stressing the importance of conservation of the Atlantic. / No bioma Mata Atl?ntica, o desmatamento e o consequente processo de fragmenta??o florestal v?m se agravando desde o s?culo XVI. Dados recentes estimam que a ?rea coberta com remanescentes florestais de Mata Atl?ntica representa entre 11,6% a 16% de sua extens?o original, tendo como consequ?ncia a extin??o de esp?cies, devido ? diminui??o e isolamento dos h?bitats e ao efeito de borda. Dentre os animais, os insetos se destacam por apresentarem o maior n?mero de esp?cies e participarem de um grande n?mero de intera??es com outros organismos. Sendo bons bioindicadores em estudos de avalia??o de impactos ambientais, incluindo os efeitos da fragmenta??o florestal. Comunidades de formigas (Hymenoptera: Formicidae) t?m sido utilizadas como bioindicadoras em fun??o de sua elevada riqueza de esp?cies e por responderem a mudan?as no ambiente. O principal objetivo deste trabalho foi estudar os efeitos da fragmenta??o florestal sobre a riqueza, a diversidade e a composi??o das comunidades de formigas que forrageiam sobre plantas. Al?m disso, verificou-se as varia??es espaciais e temporais desta comunidade e a influ?ncia da estrutura da vegeta??o e sob a riqueza e diversidade da mirmecofauna arbor?cola. O estudo foi realizado durante a esta??o seca de 2009 e a esta??o chuvosa de 2010. Foram amostrados oito fragmentos florestais do Munic?pio de Vassouras, al?m da Reserva Biol?gica do Tingu?, no Estado do Rio de Janeiro. Em uma parcela de 120 m2, 20 ?rvores com CAP entre 15 a 40 cm foram marcadas, estando estas distantes em cerca de 10 m entre si. Uma mesma quantidade de sardinha, em ?leo comest?vel, foi colocada no tronco de cada uma das ?rvores e sobre papel branco, com 10 cm x 12 cm, distribu?das sobre 20 arbustos, pr?ximos das respectivas ?rvores, a altura aproximada de 1 m. As iscas foram colocadas no hor?rio entre 10:30h e 11:00h, permanecendo 1 hora sobre a vegeta??o. Para estudar a estrutura da vegeta??o, foi utilizado o m?todo do toque. Todas as ?rvores com CAP acima de 5 cm foram contadas e morfoespeciadas e tamb?m foram obtidas a porcentagem de cobertura do dossel. A fim de estudar a influ?ncia dos fatores abi?ticos, foram registradas, com termohigr?metro, a temperatura e a umidade relativa do ar. Foi coletado um total de 73 morfoesp?cies de formigas distribu?das em 20 g?neros e seis subfam?lias: Myrmicinae (33), Dolichoderinae (15), Formicinae (12), Pseudomyrmecinae (7), Ponerinae (3), Ectatomminae (2) e Ecitoninae (1). Pheidole foi o g?nero com maior riqueza de esp?cies (13), seguido de Linepithema (9) Solenopsis (8), Pseudomyrmex (7) e Brachymyrmex (6). No geral, o ?ndice de diversidade e a riqueza de esp?cies de formigas foram maiores na esta??o chuvosa que na esta??o seca. Foram encontradas 12 esp?cies exclusivas na esta??o seca e 32 na esta??o chuvosa. A varia??o de tamanho dos fragmentos n?o influenciou a riqueza de esp?cies de formigas numa escala local. As an?lises de regress?o m?ltipla passo a passo para os dados da estrutura da vegeta??o dos fragmentos revelaram que a riqueza e a diversidade (H?) de esp?cies de formigas dependeram, principalmente, da densidade de arbustos e ?rvores. Isto mostra que para a comunidade de formigas arbor?colas, a qualidade do h?bitat ? mais importante do que o tamanho da ?rea, ressaltando a import?ncia do estado de conserva??o dos fragmentos para a prote??o da biodiversidade da Mata Atl?ntica
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Ensino de Parasitologia no Curso de Gradua??o em Medicina Veterin?ria da Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro: Um estudo descritivo. / Teaching of Parasitology on the Graduation Course of the Veterinary Medicine of the Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro: A descriptive study.

Ferreira, Maria do Carmo 06 February 2004 (has links)
Submitted by Leticia Schettini (leticia@ufrrj.br) on 2016-10-06T12:56:06Z No. of bitstreams: 1 2004 - Maria do Carmo Ferreira.pdf: 732238 bytes, checksum: 3529c6b0217ed6fa6db3e6fa39514831 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-06T12:56:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2004 - Maria do Carmo Ferreira.pdf: 732238 bytes, checksum: 3529c6b0217ed6fa6db3e6fa39514831 (MD5) Previous issue date: 2004-02-06 / Veterinary Parasitology teaching has becoming an important issue by several scientific magazines publications. However these studies are rare in Brazil. The current research had the purpose to set out the way knowledge changes and therefore the teaching-learning, can be reflecting on the pedagogic-didactic experience of the Veterinary Parasitology teaching in the Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro (UFRRJ) Veterinary Medicine Graduation Course. The descriptive study was the methodology used. The research was developed with the Animal Parasitology Department Teachers and the Veterinary Medicine Students, from October 2000 to December 2000. The data was obtained by applying student questionnaires, teachers interviews and theoretical and practical classes survey. It was divided into three articulated chapters. First we look for the relation between the university knowledge and the society, the University history, the today University crisis and its renewal proposals. Second we tried to understand the teaching-learning process in the University. In the third chapter we linked the themes from the first and second to the questionnaires results. They reveal teachers and students points of view as well as the way practical and theoretical classes can dialogue with the teacher-student-knowledge in the UFRRJ Veterinary Parasitology teaching context. The results analysis indicate the teachers are considered competent at their functions. A better theoretical and practical classes time management is required in some cases. The practical classes became the most democratic forum for the pedagogical doing and a more progressive educational action. The results also indicate a study organization difficulty among the students, nevertheless they are aware of the parasitology knowledge importance for their professional lives. Testing was considered the best evaluation method. Practical evaluation with free consultation, CD ROM and specific revision aid utilization were initiatives praised by the students. The university teacher attributions go beyond the simply teaching by teachers points of view. They are all involved with research and, although they don?t have a pedagogic specific education, they consider themselves as full educators. Teaching changes, due to the new social realities, are also mentioned as an important necessity. A conjugation of conservative and emancipative pedagogic conceptions exists and the transforming of the teaching into a research field would be a direction to renew and amplify the Parasitology in UFRRJ. / O ensino de Parasitologia Veterin?ria no mundo tem se revelado importante tema de investiga??o, fato comprovado pelo grande n?mero de artigos publicados em revistas cient?ficas. Entretanto, ainda s?o raros estes estudos no Brasil. O presente trabalho teve como objetivos explicitar de que forma as mudan?as em rela??o ao conhecimento e, conseq?entemente, sobre o ensino-aprendizagem, podem estar se refletindo na viv?ncia did?tico-pedag?gica, do ensino de Parasitologia Veterin?ria, no Curso de Gradua??o em Medicina Veterin?ria da Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro (UFRRJ). Utilizou-se, como metodologia, o estudo descritivo, sendo a pesquisa desenvolvida com os docentes do Departamento de Parasitologia Animal e discentes do referido curso, no per?odo de outubro de 2000 a dezembro de 2001. Os dados foram obtidos atrav?s da aplica??o de question?rios aos discentes, entrevistas com os docentes e observa??o de aulas te?ricas e pr?ticas. O estudo se organizou em tr?s cap?tulos articulados. No primeiro, buscou-se compreender a rela??o existente entre o conhecimento produzido pela universidade e a sociedade, bem como a trajet?ria desta institui??o, a crise vivenciada hoje e as propostas para a sua renova??o. No segundo, procurou-se entender o processo de ensino aprendizagem na universidade, reconhecendo-o como complexo. No terceiro, vincularam-se as tem?ticas dos dois primeiros cap?tulos, costurando-as aos resultados encontrados. S?o reveladas as vis?es dos discentes e docentes, bem como a configura??o das aulas te?ricas e pr?ticas no confronto professoraluno- conhecimento para o ensino de Parasitologia Veterin?ria da UFRRJ A an?lise dos resultados mostrou que os docentes s?o considerados profissionais competentes no trabalho que v?m realizando. Em alguns casos, observou-se que seria importante realizar a adequa??o melhor do tempo das aulas te?ricas e pr?ticas. As aulas pr?ticas se mostraram como o espa?o mais democr?tico do fazer pedag?gico, no que diz respeito ? possibilidade de uma a??o educacional progressista. Entre os discentes, os resultados mostraram dificuldades na organiza??o dos estudos, mas, mesmo assim, eles possuem consci?ncia da import?ncia do conhecimento em Parasitologia para o seu exerc?cio profissional. A prova foi considerada a melhor forma de avalia??o, embora n?o fosse a ?nica. A realiza??o da avalia??o pr?tica, com consulta, utiliza??o de CD-ROM e apostilas espec?ficas, foi iniciativa elogiada pelos alunos. Na concep??o dos docentes, as atribui??es do professor universit?rio v?o al?m do mero ensinar, estando todos envolvidos com pesquisa e, mesmo sem terem tido uma forma??o pedag?gica espec?fica, consideram-se educadores. Revelaram, tamb?m, a necessidade de mudan?as no ensino, frente ?s novas realidades sociais. Conclui-se que existe uma conjuga??o de concep??es pedag?gicas conservadoras e emancipadoras, e que transformar o ensino em campo de pesquisa seria um dos caminhos para a renova??o e amplia??o da Parasitologia na UFRRJ.
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Efeito de borda em um contexto de Florestas Urbanas: Resultantes estruturais de usos pret?ritos do solo / Edge effect in urban forests: structural resultants of land use history.

Monteiro, Flavia de Carvalho Dias 25 March 2008 (has links)
Submitted by Leticia Schettini (leticia@ufrrj.br) on 2016-10-06T13:37:28Z No. of bitstreams: 1 2008 - Flavia de Carvalho Dias.pdf: 1024569 bytes, checksum: dce04583187d6844d4d0b0611035a201 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-06T13:37:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008 - Flavia de Carvalho Dias.pdf: 1024569 bytes, checksum: dce04583187d6844d4d0b0611035a201 (MD5) Previous issue date: 2008-03-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPQ / The Atlantic Rain Forest is one of the world?s most endangered biomes. Long before its discovery by western civilization, the forest had already been occupied and used by native populations. The increasing occupation of this biome has generated landscapes composed of a mosaic of forests of different ages that resulted from its usage and that overlap in space and time. Remaining fragments are still subject to manmade impacts including edge effects. Based on these concepts, a study was conducted aiming at understanding the edge effects, on structure and composition, of two areas of Atlantic Rain Forest in the Pedra Branca State Park in Rio de Janeiro, RJ; one located in the valley basins (Ca?ambe river basin), and the other at the limit of the drainage (Grande river basin). At each area, were choosed two sites; one near to the edge and other over 100m from the edge (forest interior). The sites were: valley basin?s edge (Bfv), valley basin?s interior (Ifv), limit of the drainage?s edge (Bdd) and limit of the drainage?s interior (Idd). Changes caused by the existence of a edge, included the assess of a biotic edge effects, using for it changes in the species richness, individuals density, diameter and height. Individual trees and shrubs with diameter at breast height (dbh) > 5 cm were sampled within 32 plots of 10 x 10 m for a total sample size of 0.32 ha. The samples yielded 309 individuals of 77 species, 70 genera and 32 families. The total basal area was 28,89 m2/ha and density was 966 ind./ha. Leguminosae, Meliaceae e Sapotaceae were found to be the richest families. The number of total species is comparable to the referenced values for preserved forests, inventoried in the southeast. The edges species richness (Bfv and Ifv) similar to the interiors species richness (Ifv and Idd). Mean diameter varied form 32, 9 cm and 36,2 cm in the edges and 42,2 cm and 53,1 cm in the forests interiors. Probably, the sampled edges finds itself in a state of natural regeneration and represents an inicial successional state, different to the intermediary sucessional state in the interiors. The index of S?rensen between the four sites may occurs due to the different slope orientation, geomorphologic situation and land use history. / A Mata Atl?ntica ? um dos biomas mais amea?ados do mundo. Desde antes de sua descoberta pelo ocidente, a floresta j? era utilizada e apropriada por popula??es nativas. Com a intensifica??o da ocupa??o deste bioma, geraram-se paisagens compostas por mosaicos de florestas de diferentes idades, provenientes de usos diversos, que se sobrep?em no tempo e no espa?o. Os fragmentos remanescentes est?o ainda sujeitos a v?rios impactos antr?picos, tais como os efeitos de borda. Desta forma, procura-se analisar como a din?mica homem-natureza exerce suas influ?ncias na transforma??o da paisagem. Procurou-se compreender os efeitos de borda na estrutura e composi??o de duas ?reas de Mata Atl?ntica, localizadas no Parque Estadual de Pedra Branca na cidade do Rio de Janeiro, RJ; uma localizada no fundo de vale (bacia do rio Ca?ambe) e a outra no divisor de drenagem (bacia do rio Grande). Em cada ?rea de estudo, foram selecionados 2 s?tios amostrais; um adjacente ? borda e o outro distante a cerca de 100 metros da borda (interior de floresta). Os quatro s?tios amostrais foram denominados borda de fundo de vale (Bfv), interior de fundo de vale (Ifv), borda do divisor de drenagem (Bdd) e interior do divisor de drenagem (Idd). As mudan?as provocadas pela exist?ncia de uma borda envolveram avalia??es de efeitos biol?gicos, utilizando como ferramenta a riqueza de esp?cies, a densidade, estrutura diam?trica e de tamanho dos indiv?duos. Para a amostragem das ?reas, foram implantadas 32 parcelas, de 100 m? (0,32 ha), sendo que o crit?rio de inclus?o adotado foi DAP ? 5 cm. Foram amostrados 309 indiv?duos de 77 esp?cies, 70 g?neros e 32 fam?lias. A ?rea basal total foi de 28,89 m2/ha e densidade de 966 ind./ha. Leguminosae, Meliaceae e Sapotaceae apresentaram os maiores valores de riqueza de esp?cies. O n?mero total de esp?cies amostradas foi compat?vel com forma??es assemelhadas do sudeste Brasileiro. As bordas apresentaram uma riqueza de esp?cies pr?xima ? das ?reas interioranas. Os di?metros m?dios variaram entre 32,9 cm e 36,2 cm nas bordas e 42,2 cm e 53,1cm nos interiores de floresta. Provavelmente, as bordas amostradas encontramse em est?gio de regenera??o natural, representando grupos sucessionais iniciais, distintos daqueles que ocorrem no interior da floresta. A n?o similaridade das ?reas, aferida com o uso do ?ndice de S?rensen mostrou que cada uma das ?reas ? constitu?da por conjuntos de esp?cies caracter?sticas. Estes resultados podem ser atribu?dos ?s diferentes orienta??es de encosta, situa??o geomorfol?gica e aos usos pret?ritos das ?reas.
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Fidelidade de Habitat e Estimativa Populacional de Sotalia guianensis (Cetacea, Delphinidae) da Ba?a de Sepetiba ? RJ, por meio da t?cnica de marca??o-recaptura. / Site fidelity and Abundance Estimate of Sotalia guianensis (Cetacea, Delphinidae) in Sepetiba Bay, RJ ? using mark-recapture technique.

Nery, Mariana Freitas 29 February 2008 (has links)
Submitted by Leticia Schettini (leticia@ufrrj.br) on 2016-10-11T12:43:48Z No. of bitstreams: 1 2008 - Mariana Freitas Nery.pdf: 1375816 bytes, checksum: bd4782a39d8f360fea682ab10c5c0d70 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-11T12:43:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008 - Mariana Freitas Nery.pdf: 1375816 bytes, checksum: bd4782a39d8f360fea682ab10c5c0d70 (MD5) Previous issue date: 2008-02-29 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior-CAPES / This study had two main objectives: assess information about site fidelity and abundance estimation of Sotalia guianensis in Sepetiba Bay (22o35'S, 44o03'W), State of Rio de Janeiro, southeastern Brazil. To evaluate site fidelity, we used a photo-identification catalogue from February 1994 and July 2006, which have 217 identified individual dolphins. Seventy-nine animals (36.4%) were resighted at least once during the study period, and the average interval between resightings was 40.6 ? 31.1 months. Large numbers of mother-and-calf pairs were recorded throughout the 12 years of study, and new individuals were constantly identified in the area as shown by the photographic records. The results suggest that part of the dolphin population depends on the habitat provided by Sepetiba Bay for feeding and for the purposes of reproduction, whilst other members use it only for short periods of time. To estimate the population size, a new catalogue was made from 14 boat-based surveys from April 2006 to April 2007. We took 9,990 photographs of dolphin and, of these, 2,567 images were of sufficient quality for analysis. We identified and cataloged 382 dolphins from distinctive nicks and notches on their dorsal fins. 153 dolphins were photographed on more than one occasion. Estimates of population size were obtained by using capture-recapture models for closed population. The resulting estimates, scaled to account the proportion of marked dolphins in the population (0.53), are 989 animals (IC 95% 965-1057) to Schnabel Estimator; 1060 animals (IC 05% 1004-1117) to Schumacher-Eschmeyer Estimator; 1043 animals (IC 95% 999-1115) to Model Mt; and 1085 animals (IC 95% 1016-1154) to Model Mth. These results represent the largest population ever reported to Sotalia guianensis. / Este estudo teve por objetivos principais acessar informa??es a respeito da fidelidade de habitat e estimar o tamanho da popula??o de Sotalia guianensis da Ba?a de Sepetiba (22?35?S, 44?03?W) Estado do Rio de Janeiro, sudeste do Brasil. Para verificar a fidelidade de habitat, foi utilizado o cat?logo de fotografias do per?odo de fevereiro de 1994 a julho de 2006 onde est?o fotoidentificados 217 botos, sendo que 79 destes (36,4%) foram reavistados pelo menos uma vez durante esses 12 anos e o intervalo m?dio entre reavistagens foi de 40,6 ? 31,1 meses. A presen?a de pares de m?es-filhotes foi numerosa ao longo do per?odo de estudo e novos indiv?duos foram constantemente identificados na ?rea. Os resultados sugerem que parte desta popula??o depende substancialmente do habitat fornecido pela Ba?a de Sepetiba, tanto para alimenta??o quanto para fins de reprodu??o, apesar de haver indiv?duos que usam menos esta ?rea. Para estimar o tamanho da popula??o, um novo cat?logo foi iniciado, produzido a partir de 14 sa?das de campo de Abril de 2006 a Abril de 2007. Foram tomadas 9990 fotografias dos golfinhos, e destas, 2567 imagens eram de qualidade ?tima o suficiente para as an?lises. 382 golfinhos foram identificados atrav?s de marcas e entalhes em suas nadadeiras dorsais. 153 indiv?duos foram fotografados em mais de uma ocasi?o. As estimativas populacionais foram obtidas usando modelos de marca??orecaptura para popula??es fechadas. As estimativas resultantes, calculadas com a propor??o de animais marcados na popula??o (0,53) foram de 989 animais (IC 95% 965-1057) para o Estimador de Schnabel; 1060 animais (IC 05% 1004-1117) para o Estimador de Schumacher- Eschmeyer; 1043 animais (IC 95% 999-1115) para o Modelo Mt; e 1085 animais (IC 95% 1016- 1154) para o Modelo Mth. Esses resultados representam a maior estimativa populacional para Sotalia guianensis em toda sua ?rea de ocorr?ncia.
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Diagn?stico morfol?gico das larvas de Anisakidae (Nematoda: Ascaridoidea) parasitas de tr?s esp?cies de peixes do litoral do estado do Rio de Janeiro, Brasil. / Diagn?stico morfol?gico das larvas de Anisakidae (Nematoda: Ascaridoidea) parasitas de tr?s esp?cies de peixes do litoral do Estado do Rio de Janeiro, Brasil

Saad, Caroline Duarte ribeiro 20 December 2010 (has links)
Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2016-10-11T12:55:16Z No. of bitstreams: 1 2011 -Caroline Duarte Ribeiro Saad.pdf: 2978508 bytes, checksum: f9f5e929ce4a24c4f1d5568ac64c15ce (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-11T12:55:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011 -Caroline Duarte Ribeiro Saad.pdf: 2978508 bytes, checksum: f9f5e929ce4a24c4f1d5568ac64c15ce (MD5) Previous issue date: 2010-12-20 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / In order to investigate and identify anisakid larvae present in the viscera, the general cavity, mesentery and muscles of marine fish of commercial importance from the coast of Rio de Janeiro, Brazil, were examined 36 specimens of Lophius gastrophysus, 34 specimens Pagrus pagrus and four specimens of Trichiurus lepturus. The vast majority of fish used was obtained from fish warehouses located in Cabo Frio coast of Rio de Janeiro (23? S and 42 ? W), 36 specimens of L. gastrophysus and 31 P. pagrus. We also obtained three specimens of P. pagrus and four T. lepturus at Mercado S?o Braz, located in Campo Grande, west of the city of Rio de Janeiro, commum fish fauna from the coast of Rio de Janeiro, (21- 23 ? S and 41-45 ? W). Six anisakid species of nematode larvae were found in the mesentery, the general cavity, liver and muscles. Those species are: Anisakis simplex, Terranova sp. Contracaecum sp. Hysterothylacium sp.1, sp.2 and Raphidascaris sp.. Anisakis simplex larvae were found in L. gastrophysus with prevalence (P) of 22.2% and mean abundance (MA) 0.53 for T. lepturus P = 50%; Terranova sp. From L. gastrophysus P = 8.3% and AM = 0.08, T. lepturus P = 25% and P. pagrus P = 5.8%; Contracaecum sp. From L.gastrophysus P = 8.3% and AM = 0.08; Hysterothylacium sp.1 from T. lepturus P = 75% and P. pagrus from P = 100%; Hysterothylacium sp.2 from L. gastrophysus P = 25% and AM = 0.47 and T. lepturus with P = 25%; Raphidascaris sp. From L. gastrophysus from P = 11.1% and AM = 0.42 and P. pagrus from P = 55.8%. These nematodes are described and illustrated herein. A revision of available literature, concerning nematodes belonging to these genera, was made. This is the first record of occurrence of Anisakis simplex, Terranova sp. e Contracaeum sp. parasitizing L. gastrophysus the coast of the state of Rio de Janeiro. It was concluded that infection in fish of high consumption and commercial importance, make the consumption of these fish, especially without prior adequate thermal processing, a potential risk from the point of view public health. / Com o objetivo de pesquisar e identificar as larvas de anisak?deos presentes nas v?sceras, cavidade geral, mesent?rio e musculatura de peixes marinhos de import?ncia comercial provenientes do litoral do estado do Rio de Janeiro, Brasil, foram examinados 36 esp?cimes de Lophius gastrophysus, 34 esp?cimes de Pagrus pagrus e 4 esp?cimes de Trichiurus lepturus. A grande maioria dos peixes utilizados foi obtida de entrepostos de pescados localizados em Cabo Frio, litoral do estado do Rio de Janeiro (23? S e 42? W), sendo 36 exemplares da esp?cie L. gastrophysus e 31 de P. pagrus. Foram obtidos ainda 3 exemplares de P. pagrus e 4 de T. lepturus no Mercado S?o Braz, localizado em Campo Grande, zona oeste da cidade do Rio de Janeiro, peixes estes oriundos da costa mar?tima do estado do Rio de Janeiro, (21-23? S e 41-45? W). Seis esp?cies de larvas de nemat?ides anisak?deos foram encontradas, Anisakis simplex, Terranova sp., Contracaecum sp., Hysterothylacium sp.1, Hysterothylacium sp.2 e Raphidascaris sp., provenientes do mesent?rio, cavidade geral, f?gado e musculatura. Larvas de Anisakis simplex foram encontradas em L. gastrophysus com preval?ncia (P) de 22,2% e abund?ncia m?dia (AM) 0,53 e em T. lepturus com P=50%; Terranova sp. em L. gastrophysus com P=8,3% e AM=0,08, em T. lepturus com P=25% e P. pagrus com P=5,8%; Contracaecum sp. em L. gastrophysus com P=8,3% e AM=0,08; Hysterothylacium sp.1 em T. lepturus com P=75% e em P. pagrus com P=100%; Hysterothylacium sp.2 em L. gastrophysus com P=25% e AM=0,47 e em T. lepturus com P=25%; Raphidascaris sp. em L. gastrophysus com P=11,1% e AM=0,42 e em P. pagrus com P=55,8%. Estes nemat?ides foram descritos e ilustrados, junto ? revis?o da literatura existente a respeito dos nemat?ides pertencentes aos presentes g?neros. Este ? o primeiro registro da ocorr?ncia de Anisakis simplex, Terranova sp. e Contracaeum sp., parasitando L. gastrophysus do litoral do estado do Rio de Janeiro. Concluiu-se que a presen?a de larvas de anisak?deos dos presentes g?neros com preval?ncias de infec??o consider?veis em peixes de elevado consumo e import?ncia comercial, torna o consumo destes peixes, principalmente sem pr?vio e adequado processamento t?rmico, um risco em potencial sob o ponto de vista de sa?de p?blica.
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Polimorfismo no Gene que Codifica a ?-lactoglobulina e associa??o com caracter?sticas de produ??o em caprinos leiteiros / Polymorphism in the gene encoding the ?-lactoglobulin and Association with Traditional Production in Dairy Goats

Rego, Ramon de Sousa 26 August 2014 (has links)
Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2016-10-18T11:49:54Z No. of bitstreams: 1 2014 - Ramon de Sousa Rego.pdf: 1491511 bytes, checksum: 746021e21f53b13713de3e8e94d03121 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-18T11:49:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014 - Ramon de Sousa Rego.pdf: 1491511 bytes, checksum: 746021e21f53b13713de3e8e94d03121 (MD5) Previous issue date: 2014-08-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / The protein quality of milk of goats and digestibility of the lipid fraction are important factors that stand out when compared to milk from cows. The ?-lactoglobulin is the higher abundant protein in whey ruminants being produced in the mammary gland during lactation. It may represent up to 12% of the total protein. We seek to present work was to evaluate the gene ?-Lactoglobulin (BLG) with their genetic polymorphisms in the promoter regions 5 'and 3' UTR and associate them the characteristics of milk production in experimental goat herd. For this 150 goats (Capra hircus) of Saanen and Alpine, genotyped for polymorphisms of the BLG gene were used. For genotyping 10 mL of blood per animal were collected. The blood was used for DNA extraction and amplification of two fragments of the BLG gene by means of polymerase chain reaction (PCR). The amplified fragments were submitted to electrophoresis on polyacrylamide gel and evaluated by by restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). The SmaI and SacII enzymes were used for the promoter (promoter + exon 1 region) region and the region of exon 7 (exon 7 + region 3 '), respectively. The differences in cutting patterns were visualized on a polyacrylamide gel. In the promoter region of the single nucleotide polymorphism (SNP) at position -60 (C/T) was identified and was associated with the percentage of protein in milk. This result suggests a relationship between genotypes of the promoter region of the BLG gene and the protein level of the milk. The presence of two polymorphisms +4641 (I2/I3) and +4601 (A/G) was observed in the region of exon 7. The I2-I3 variation is characterized by a repeat sequence of 10 bp, varying in two and three times, and it being possible to identify by electrophoresis. The I3 variation was often very low, and there was no association between this polymorphism and any production trait. Polymorphism +4601 (G/A) was identified by enzyme SacII digestion. Alleles were identified frequencies close to those reported by other authors and were associated with the percentage of fat in milk goats, and the animals with the S1S2 genotype had higher fat percentage than S1S1 animals and S2S2. The increased production of lipid content may be related to the characteristic of transporting fatty acids ?-lactoglob / A qualidade proteica do leite de cabras e a digestibilidade da fra??o lip?dica s?o importantes fatores que o destacam, quando comparado ao leite de vacas. A ?-Lactoglobulina ? a prote?na de maior abundancia no soro do leite em ruminantes sendo produzida na gl?ndula mam?ria durante o per?odo de lacta??o. Ela pode representar at? 12% do total proteico. Buscamos com o presente trabalho, avaliar o gene da ?-Lactoglobulina (BLG) com seus polimorfismos gen?ticos nas regi?es promotoras 5? e 3? UTR e associ?-los as caracter?sticas de produ??o de leite no rebanho caprino experimental. Para isso foram utilizadas 150 cabras (Capra hircus) das ra?as Saanen e Alpinas, genotipadas para os polimorfismos do gene BLG. Para a genotipagem foram coletados 10 mL de sangue por animal. O sangue foi utilizado para a extra??o de DNA e amplifica??o de 2 fragmentos do gene BLG por interm?dio da rea??o em cadeia da polimerase (PCR). Os fragmentos amplificados foram ent?o submetidos ? eletroforese em gel de poliacrilamida e avaliados pelo polimorfismo no tamanho do fragmento por restri??o (PCR-RFLP). Foram utilizadas as enzimas SmaI e SacII, para a regi?o promotora (regi?o promotora + ?xon 1) e para a regi?o do ?xon 7 (?xon 7 + regi?o 3?), respectivamente. As diferen?as nos padr?es de corte foram visualizadas em gel de poliacrilamida. Na regi?o promotora o polimorfismo de base ?nica (SNP) na posi??o -60 (C/T) foi identificado e apresentou associa??o com a percentagem de prote?nas no leite. Esse resultado sugere uma rela??o entre os gen?tipos da regi?o promotora do gene BLG e o n?vel proteico do leite. Foi observado na regi?o do ?xon 7 a presen?a de dois polimorfismos +4641 (I2/I3) e +4601 (A/G). A varia??o I2-I3 ? caracterizada pela repeti??o de uma sequ?ncia de 10 pb, variando em duas e tr?s vezes, e sendo poss?vel identifica-la por eletroforese. A varia??o I3 teve frequ?ncia muito baixa, e n?o houve associa??o entre esse polimorfismo e nenhuma caracter?stica de produ??o. O polimorfismo +4601 (A/G) foi identificado por meio da digest?o da enzima SacII. Os alelos identificados tiveram frequ?ncias pr?ximas ?s relatadas por outros autores e apresentaram associa??o com a percentagem de gordura no leite cabras, sendo que os animais com o gen?tipo S1S2 apresentaram maior percentagem de gordura que animais S1S1 e S2S2. A maior produ??o de conte?do lip?dico pode estar relacionada com a caracter?stica de transporte de ?cidos graxos da ?-Lactoglobulina
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Diagn?stico morfol?gico das larvas de Anisakidae (Nematoda: Ascaridoidea) parasitas de tr?s esp?cies de peixes do litoral do Estado do Rio de Janeiro, Brasil. / morphological diagnosis Anisakidae das larvae (Nematoda: Ascaridoidea) parasitic species do peixes tr?s coast of the State of Rio de Janeiro, Brazil.

Saad, Caroline Duarte Ribeiro 20 December 2010 (has links)
Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2016-10-21T10:29:56Z No. of bitstreams: 1 2010 - Caroline Duarte Ribeiro Saad.pdf: 2978488 bytes, checksum: 8e2ece3be63cb39291f012f0bb36a1dc (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-21T10:29:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010 - Caroline Duarte Ribeiro Saad.pdf: 2978488 bytes, checksum: 8e2ece3be63cb39291f012f0bb36a1dc (MD5) Previous issue date: 2010-12-20 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / In order to investigate and identify anisakid larvae present in the viscera, the general cavity, mesentery and muscles of marine fish of commercial importance from the coast of Rio de Janeiro, Brazil, were examined 36 specimens of Lophius gastrophysus, 34 specimens Pagrus pagrus and four specimens of Trichiurus lepturus. The vast majority of fish used was obtained from fish warehouses located in Cabo Frio coast of Rio de Janeiro (23? S and 42 ? W), 36 specimens of L. gastrophysus and 31 P. pagrus. We also obtained three specimens of P. pagrus and four T. lepturus at Mercado S?o Braz, located in Campo Grande, west of the city of Rio de Janeiro, commum fish fauna from the coast of Rio de Janeiro, (21- 23 ? S and 41-45 ? W). Six anisakid species of nematode larvae were found in the mesentery, the general cavity, liver and muscles. Those species are: Anisakis simplex, Terranova sp. Contracaecum sp. Hysterothylacium sp.1, sp.2 and Raphidascaris sp.. Anisakis simplex larvae were found in L. gastrophysus with prevalence (P) of 22.2% and mean abundance (MA) 0.53 for T. lepturus P = 50%; Terranova sp. From L. gastrophysus P = 8.3% and AM = 0.08, T. lepturus P = 25% and P. pagrus P = 5.8%; Contracaecum sp. From L.gastrophysus P = 8.3% and AM = 0.08; Hysterothylacium sp.1 from T. lepturus P = 75% and P. pagrus from P = 100%; Hysterothylacium sp.2 from L. gastrophysus P = 25% and AM = 0.47 and T. lepturus with P = 25%; Raphidascaris sp. From L. gastrophysus from P = 11.1% and AM = 0.42 and P. pagrus from P = 55.8%. These nematodes are described and illustrated herein. A revision of available literature, concerning nematodes belonging to these genera, was made. This is the first record of occurrence of Anisakis simplex, Terranova sp. e Contracaeum sp. parasitizing L. gastrophysus the coast of the state of Rio de Janeiro. It was concluded that infection in fish of high consumption and commercial importance, make the consumption of these fish, especially without prior adequate thermal processing, a potential risk from the point of view public health / Com o objetivo de pesquisar e identificar as larvas de anisak?deos presentes nas v?sceras, cavidade geral, mesent?rio e musculatura de peixes marinhos de import?ncia comercial provenientes do litoral do estado do Rio de Janeiro, Brasil, foram examinados 36 esp?cimes de Lophius gastrophysus, 34 esp?cimes de Pagrus pagrus e 4 esp?cimes de Trichiurus lepturus. A grande maioria dos peixes utilizados foi obtida de entrepostos de pescados localizados em Cabo Frio, litoral do estado do Rio de Janeiro (23? S e 42? W), sendo 36 exemplares da esp?cie L. gastrophysus e 31 de P. pagrus. Foram obtidos ainda 3 exemplares de P. pagrus e 4 de T. lepturus no Mercado S?o Braz, localizado em Campo Grande, zona oeste da cidade do Rio de Janeiro, peixes estes oriundos da costa mar?tima do estado do Rio de Janeiro, (21-23? S e 41-45? W). Seis esp?cies de larvas de nemat?ides anisak?deos foram encontradas, Anisakis simplex, Terranova sp., Contracaecum sp., Hysterothylacium sp.1, Hysterothylacium sp.2 e Raphidascaris sp., provenientes do mesent?rio, cavidade geral, f?gado e musculatura. Larvas de Anisakis simplex foram encontradas em L. gastrophysus com preval?ncia (P) de 22,2% e abund?ncia m?dia (AM) 0,53 e em T. lepturus com P=50%; Terranova sp. em L. gastrophysus com P=8,3% e AM=0,08, em T. lepturus com P=25% e P. pagrus com P=5,8%; Contracaecum sp. em L. gastrophysus com P=8,3% e AM=0,08; Hysterothylacium sp.1 em T. lepturus com P=75% e em P. pagrus com P=100%; Hysterothylacium sp.2 em L. gastrophysus com P=25% e AM=0,47 e em T. lepturus com P=25%; Raphidascaris sp. em L. gastrophysus com P=11,1% e AM=0,42 e em P. pagrus com P=55,8%. Estes nemat?ides foram descritos e ilustrados, junto ? revis?o da literatura existente a respeito dos nemat?ides pertencentes aos presentes g?neros. Este ? o primeiro registro da ocorr?ncia de Anisakis simplex, Terranova sp. e Contracaeum sp., parasitando L. gastrophysus do litoral do estado do Rio de Janeiro. Concluiu-se que a presen?a de larvas de anisak?deos dos presentes g?neros com preval?ncias de infec??o consider?veis em peixes de elevado consumo e import?ncia comercial, torna o consumo destes peixes, principalmente sem pr?vio e adequado processamento t?rmico, um risco em potencial sob o ponto de vista de sa?de p?blica.
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Estudo da intera??o entre albuminas s?ricas e mol?culas biologicamente ativas / A Study of the Interaction between Serum Albumins and Biologically Active Molecules

Chaves, Ot?vio Augusto 19 July 2016 (has links)
Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2017-01-12T11:50:46Z No. of bitstreams: 1 2016 - Otavio Augusto Chaves.pdf: 6300833 bytes, checksum: 156947ce06fa4e3b0674f5eaeaa4ef06 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-12T11:50:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016 - Otavio Augusto Chaves.pdf: 6300833 bytes, checksum: 156947ce06fa4e3b0674f5eaeaa4ef06 (MD5) Previous issue date: 2016-07-19 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / The interactions between human serum albumin (HSA) with 18-PF, BZL, MTZ and MZ and between bovine serum albumin (BSA) with t-DCTN, PF, LF-B, PIA and ?-lap were studied by spectroscopic techniques (molecular absorption in the UV-Vis region, circular dichroism, emission fluorescence in the steady state and temporal resolution) under physiological conditions. Theoretical calculations by molecular docking were performed to complement the experimental data and thus offer accurate to the results. The results obtained for the fluorescence quenching rate constant (kq) is greater than the diffusion rate constant in water (kdiff ? 5,00x109 L/mol), indicating that there is formation of complex between albumin and biologically active molecules in the ground state (for the sample PIA we confirmed this data with time resolved fluorescence experiments). For t-DCTN and LF-B beyond the static mechanism it was observed the presence of dynamic fluorescence quenching mechanism. Finally, for PF and PIA F?rster theory shows that the energy transfer between the fluorophore and the quenchers can occurs with high probability. The thermodynamic values for Gibbs? free energy are in accordance with the spontaneity of the association, for all the samples. Thermodynamic parameters ?H? and ?S? provided evidence of the main intermolecular interactions in the association. The samples 18-FP, t-DCTN, LF-B, PIA, ?-lap, BZL and MTZ interact with albumin by hydrogen bonding and hydrophobic interactions. On the other hand, PF and MZ interact by hydrogen bonding and electrostatic forces. The number of binding sites shows that there is only one main cavity of the protein to the interaction. For 18-PF, PF and LF-B the binding is weak, for t-DCTN the binding is moderate and for PIA, ?-lap, BZL, MTZ and MZ the binding is strong. Circular dichroism results show that upon binding of samples with the albumin there are no significant perturbations on the secondary structure of the protein. Theoretical calculations by molecular docking are in full agreement with the spectroscopic results / As intera??es entre albumina s?rica humana (ASH) com 18-FP, BZL, MTZ e MZ e entre albumina s?rica bovina (ASB) com t-DCTN, PF, LF-B, PIA e ?-lap foram estudadas por t?cnicas espectrosc?picas (absor??o molecular no UV-Vis, dicro?smo circular, emiss?o de fluoresc?ncia no estado estacion?rio e com resolu??o temporal) sobre condi??es fisiol?gicas. C?lculos te?ricos por ancoramento molecular (do ingl?s molecular docking) foram executados para complementa??o dos dados experimentais e dessa forma obter resultados mais precisos. Os resultados obtidos para as constantes de velocidade de supress?o de fluoresc?ncia das albuminas (kq) s?o maiores do que a velocidade de difus?o em ?gua (kdiff ? 5,00x109 L/mols), indicando que h? forma??o de um complexo no estado fundamental entre as albuminas com as mol?culas biologicamente ativas (para amostra PIA tal dado foi confirmado com a fluoresc?ncia resolvida no tempo). Para as amostras t-DCTN e LF-B al?m do mecanismo est?tico foi observado ? presen?a do mecanismo din?mico e j? para as amostras PF e PIA o c?lculo de F?rster mostra alta probabilidade de ocorr?ncia de transfer?ncia de energia entre o fluor?foro e os supressores. Os valores termodin?micos de energia livre de Gibbs, calculados para todas as amostras est?o de acordo com a espontaneidade da associa??o. Par?metros termodin?micos de ?H? e ?S? forneceram ind?cios das principais intera??es intermoleculares na associa??o. As amostras 18-FP, t-DCTN, LF-B, PIA, ?-lap, BZL e MTZ associam com a albumina via liga??o de hidrog?nio e intera??es hidrof?bicas e j? PF e MZ por liga??o de hidrog?nio e intera??es eletrost?ticas. O n?mero de s?tios de liga??o para todas as amostras indicam que h? apenas uma principal cavidade da prote?na para a associa??o das mol?culas estudadas, sendo que essa associa??o ? moderada para 18-FP, PF e LF-B, fraca para t-DCTN e forte para PIA, ?-lap, BZL, MTZ e MZ. Estudos de dicro?smo circular demonstram que n?o h? perturba??es significativas na estrutura secund?ria da albumina com a associa??o. C?lculos te?ricos via ancoramento molecular est?o em total acordo com os resultados espectrosc?picos

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