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Sensitivity analysis as a tool for tumor growth modeling / Análise de sensibilidade como ferramenta para a modelagem do crescimento tumoralResende, Anna Claudia Mello de 13 April 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-04-13 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Mathematical and computational modeling of tumor growth have become valuable tools for learning and understanding various aspects of tumor onset and development. They can also help to generate new hypotheses for experimental testing and to verify the efficiency or optimize clinical therapies. From the computational point of view, a huge challenge is to deal with highly nonlinear and multi-components mathematical models that aim to display multiple types of biological interactions across different biological, temporal and physical scales. Computational and numerical difficulties usually appear. Also, nonlinear interactions may give rise to interesting and unexpected dynamics which make it difficult to anticipate a model's outcome. Here we make a step towards developing a model-building framework to improve the understanding of the model itself and the key issues to drive model modifications and simplifications.
We develop a family of deterministic tumor growth models based on a mathematical model built in the literature, which is a continuous model of seven coupled nonlinear partial differential equations that can capture both avascular and vascular phases of the disease. Although simple, this model provides considerable insight about important mechanisms related to tumor progression, as angiogenesis, for example, which is the fundamental strategy tumors acquire to keep and improve growth. Its main assumptions and mathematical formulation are discussed in details, and we propose some modifications to fix ambiguities in the original model. The extension to multidimensional problems is considered, for which we develop reliable approximate finite element solution.
We propose in this work a simple framework to build a hierarchical family of tumor growth models by selecting a subset of the most important parameters of our base model with respect to the evolution of the tumor volume. The importance of each parameter is identified through two model-free sensitivity analysis techniques, the construction of scatterplots and the elementary effects, due to their simplicity and low computational costs.
This model framework encompasses the essential hypotheses and the limited set of important parameters acquired from the sensitivity analysis. In this way, we are able to create a family of models described by at least the same essential conditions and parameters but with different complexities regarding the number of parameters used. Numerical experiments are conducted to provide a comprehensive understanding of the hierarchical developed family of tumor growth models.
Finally, we emphasize that the modeling framework in this manner provides a powerful way for studying a model itself or either its simplification or extension. The framework can also be tailored to form the basis for future models, incorporating new processes and phenomena. / A modelagem matemática e computacional do crescimento tumoral tornou-se uma ferramenta importante para o aprendizado e entendimento de vários aspectos relacionados ao surgimento e desenvolvimento de tumores. Esta ferramenta é também capaz de ajudar a construir novas hipóteses para testes experimentais, verificar a eficiência e até mesmo otimizar terapias. Do ponto de vista computacional, um grande desafio consiste em resolver e entender modelos matemáticos não-lineares com múltiplos componentes que objetivam representar interações que ocorrem em diferentes escalas biológicas, de tempo e espaço. Dificuldades numéricas e computacionais ocorrem frequentemente. Interações não-lineares dão também origem a dinâmicas interessantes e até mesmo inesperadas, dificultando antecipar os resultados de muitos modelos. Neste trabalho, dá-se um passo na direção do desenvolvimento de uma abordagem para a construção de modelos que permite tornar mais claro o entendimento destes e de seus aspectos-chave, auxiliando modificações e simplificações para tornar o processo de modelagem mais simples.
Desenvolvemos uma família de modelos determinísticos para o crescimento tumoral baseada em um modelo não-linear e contínuo apresentado na literatura que contém sete equações diferenciais parciais acopladas, capaz de capturar as fases avascular e vascular da doença. Embora simples, este modelo proporciona o entendimento dos importantes mecanismos relacionados à progressão de tumores, como a angiogênese, por exemplo, que é a estratégia utilizada por um tumor para manter e impulsionar seu crescimento. As principais hipóteses e formulação matemática deste modelo-base são discutidas em detalhes, e algumas modificações são propostas para corrigir ambiguidades presentes no modelo original. A extensão para problemas multidimensionais é considerada, para a qual desenvolvemos uma solução robusta de elementos finitos.
Neste trabalho, propomos uma abordagem simples para a construção de uma família hierárquica de modelos de crescimento tumoral através da seleção do conjunto de parâmetros mais importantes de um modelo-base com respeito à evolução do volume tumoral. A importância de cada parâmetro é identificada através de duas técnicas de análise de sensibilidade consideradas simples, de baixo custo computacional e independentes do modelo utilizado: a construção de scatterplots e efeitos elementares.
A abordagem de modelagem inclui as hipóteses essenciais e um conjunto limitado de parâmetros identificados como importantes na análise de sensibilidade. Deste modo, é possível criar uma família de modelos descrita no mínimo pelas mesmas condições essenciais e parâmetros importantes, mas com diferentes complexidades com relação ao número de parâmetros utilizados na modelagem. Experimentos numéricos são realizados para promover o entendimento sobre a família hierárquica de modelos desenvolvida.
Finalmente, enfatizamos que a abordagem de modelagem desenvolvida desta maneira proporciona um potencial mecanismo para estudar um modelo e suas simplificações e extensões. Esta abordagem pode ser ajustada para formar a base para modelos futuros, incorporando novos processos e fenômenos.
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Associação do vírus da Hepatite C com o grupo sanguíneo ABO e Rh(D) em doadores de sangue da Fundação Hemopa, Pará, BrasilNÓBREGA, Letícia de Souza 25 June 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-06-25 / Vários estudos têm demonstrado associação de sistemas de grupos sanguíneos com diversas patologias. Neste contexto este trabalho teve como objetivo investigar associação entre o vírus HCV e os grupos sanguíneos ABO e Rh em doadores de sangue da Fundação Hemopa no período de 2000 a 2010. Entre janeiro de 2000 a dezembro de 2010 foram analisadas 565.614 amostras de indivíduos que doaram sangue no Hemopa, sendo destes 1064 apresentaram teste reagente para pesquisa sorológica do HCV, 1246 inconclusivos e 563304 negativos. Entretanto, foram incluídos neste estudo somente os doadores de sangue que não possuíam qualquer tipo de co-infecção para nenhuma outra patologia pesquisada, de naturalidade paraense e pele de cor parda. Após, a seleção destes critérios gerou-se um tamanho amostral de 838 (0,15%) soropositivos, 1181 (0,21%) inconclusivos e 551.991 (99,64%) soronegativos de um total de 554.010 doadores de sangue. Para o diagnóstico sorológico da hepatite C foram empregados testes sorológicos de ELISA (Ensaio Imunoenzimático) de 4ª geração para detecção de anticorpos específicos anti-HCV no soro dos doadores e nas amostras de resultado positivo pela sorologia (ELISA) foi realizado extração do RNA viral. Os grupos sanguíneos ABO e Rh foram determinados através das pesquisas de antígenos A e/ou B, de anticorpos anti-A e/ou anti-B e de antígeno Rh(D) na amostra sanguínea do indivíduo. Ao longo destes anos observou-se que a soroprevalência de anticorpos HCV específico nos doadores de sangue vem sofrendo redução, variando de 132 a 38 casos sororeagentes. A maioria dos doadores estavam entre a faixa etária de 30 a 49 anos (57,64%), pertencendo predominantemente ao sexo masculino 74.5% (624/838) e procedentes de Belém 72,5% (607/838). Comparando a distribuição dos fenótipos do sistema de grupo sanguíneo ABO e Rh entre o grupo de doadores sororeagentes e não reagentes ao HCV, verificou-se que não há variação significativa na frequência destes fenótipos entre os doadores reagentes e não reagentes na pesquisa de anticorpos HCV específicos. Dos doadores de sangue que apresentaram resultado de PCR, quando comparado com os grupos sanguíneos ABO e Rh dos pacientes não se observou associação entre eles. / Several studies have demonstrated association of blood group systems with different pathologies. Therefore, this work aimed to investigate the association between HCV and blood groups ABO and Rh blood donors Hemopa Foundation from 2000 to 2010. Between January 2000 and December 2010 were analyzed 565,614 samples from individuals who donated blood in Hemopa, and 1064 showed these test reagent for HCV serologic survey, 1246 inconclusive and 563.304 negative. However, this study included only those blood donors who did not have any kind of co-infection to any other pathology researched, naturally Pará and brown skin. After the selection of these criteria led to a sample size of 838 (0.15%) seropositive in 1181 (0.21%) inconclusive and 551,991 (99.64%) seronegative for a total of 554.010 blood donors. For serological diagnosis of hepatitis C were used serological test ELISA (enzyme immunoassay) 4th generation for detection of specific anti-HCV in the serum of donors and the samples positive by serology (ELISA) was carried out extraction of viral RNA. The ABO and Rh blood groups were determined by the research of antigens A and / or B, anti-A and / or anti-B antibodies and Rh (D) antigens in the blood sample from the individual. Over the years we found that the seroprevalence of HCV-specific antibodies in blood donors has undergone reduction, ranging from 132 to 38 cases reactive serum. Most donors were between the age group 30-49 years (57.64%), belonging to the predominantly male 74.5% (624/838) and coming from Belém 72.5% (607/838). When the distribution of the phenotypes of the ABO and Rh blood groups systems between the donor reactive serum and non-reactive to HCV, it was found that no significant variation in the frequency of these phenotypes donor reagents and reactants in the non-HCV-specific antibodies. Donor blood PCR results showed that when compared to Rh and ABO blood groups of patients there was no association between them.
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Avaliação das funções neurológicas do hanseniano: a queixa clínica e os achados sensitivo-motores em membros superiores e inferioresBORGES, Mariana Garcia Lisboa January 2016 (has links)
Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-10-18T16:04:54Z
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Previous issue date: 2016 / Apesar de curável, a hanseníase ainda representa um relevante problema de saúde pública. Trata-se de uma doença infecciosa crônica causada pelo Mycobacterium leprae e caracterizada por acometimento dermatoneurológico, que quando não tratado adequadamente pode levar a graves incapacidades. A avaliação das funções neurológicas do paciente é de relevante importância para o diagnóstico precoce e tratamento das lesões dos nervos periféricos. Tendo em vista a quantidade de exames subjetivos presentes na avaliação neurológica do hanseniano e preocupando-se com a sua consistência em mostrar, de forma fidedigna, a situação dos pacientes, este estudo busca correlacionar as queixas clínicas apresentadas pelos hansenianos com os achados sensitivos e motores de membros superiores e inferiores. Para isso, foi realizado um estudo do tipo transversal analítico composto de duas etapas. A primeira etapa contou com 97 hansenianos, atendidos no serviço entre os anos de 2014 e 2015, neles foi aplicada a avaliação neurológica simplificada, na qual foram feitos o exame de palpação de nervos, teste de força muscular, teste de sensibilidade tátil em mãos e pés com monofilamentos de Semmes-Weinstein, além da coleta da queixa clínica. Para a segunda etapa foram selecionados aleatoriamente 14 pacientes, que foram submetidos também aos testes de sensibilidade superficial (térmica, dolorosa e tátil) no trajeto dos nervos mais comumente afetados. Para análise dos dados foram utilizados o teste de Qui-quadrado, teste G e teste t, quando pertinentes à comparação com o esperado para população ou entre grupos. Para correlação de variáveis ordinais o teste correlação de Spearman, considerando-se o nível alfa de significância igual a 0,05. Dos 97 hansenianos, 77 (79,4%) apresentaram queixas, sendo as mais comuns aquelas relacionadas às fibras sensoriais, entre elas dor e dormência foram as mais referidas. À palpação, o nervo ulnar e o tibial foram os mais acometidos e os pacientes multibacilares apresentaram maiores médias de nervos acometidos e maior dano sensitivo. O dano motor não foi muito comum entre os pacientes, mas os baixos índices de força muscular encontrados foram relacionados com estágios de dano sensitivo mais elevados, maior grau de incapacidade e maior quantidade de nervo acometida. Quando comparados quanto à ocorrência de queixa, os pacientes queixosos apresentaram estágios de dano sensitivo mais avançados, grau de incapacidade mais elevado em membros inferiores e ocorrência de dano motor com maior freqüência, porém o tipo de queixa não influenciou esses resultados. Na avaliação da sensibilidade superficial no trajeto do nervo, observou-se uma maior ocorrência de alterações sensitiva também entre os queixosos, sendo a térmica a mais afetada. Percebe-se, então, que os pacientes queixosos estão mais sensíveis aos danos sensitivo e motor, ao elevado grau de incapacidade, e à alteração de sensibilidade em trajeto de nervo. Portanto, os profissionais de saúde devem ficar atentos com este grupo de paciente, destinando maior atenção no momento da avaliação a fim de evitar as temidas incapacidades. / Although curable, leprosy is still a major public health problem. This is a chronic infectious disease caused by Mycobacterium leprae and characterized by dermatological and neurological involvement. If not treated, this disease can lead to serious disability. The evaluation of the neurological function of the patient is very important for the early dignosis and treatment of nerves damage. The exams in neurological evaluation of leprosy are too subjective. This study, worrying about the consistency of neurological evaluation in showing in a reliable manner the situation of patients, aims to correlate the clinical complaints from leprosy patients with sensory and motor findings in upper and lower limbs. For this, an analytical cross-sectional study was conducted in two steps. The first stage included 97 leprosy patients treated at the service between the years 2014 and 2015, in them was applied the simplified neurological evaluation, which was made the examination of nerve palpation, voluntary muscle strength test, tactile sensitivity test at hand and feet with Semmes-Weinstein, in addition to the collection of clinical complaints. For the second stage were randomly selected 14 patients who were submitted to surface sensitivity tests (thermal, painful and tactile) in the path of the most commonly affected nerves. Data analysis was performed using the chi-square test, G test and t test, when relevant to the comparison with the population or between groups. For correlation ordinal variables the Spearman correlation test, considering the alpha significance level of 0.05. Of the 97 leprosy patients, 77 (79.4%) had complaints, the most common being those related to sensory fibers, including pain and numbness were the most mentioned. On palpation, the ulnar nerve and tibial were the most affected and multibacillary patients had higher averages of affected nerves and most sensitive damage. Engine damage was not very common among patients, but low levels of muscle strength found were related to higher sensory damage stages, higher degree of disability and greater amount of affected nerve. When compared to the occurrence of complaint, the complainants patients had more advanced stages of sensory damage, higher degree of disability in the lower limbs and motor damage occurring more frequently, but the type of complaint did not influence these results. In the evaluation of the surface sensitivity in the nerve pathway, there was a higher incidence of sensory changes also among the plaintiffs, and the heat the most affected. It is clear, then, that the complainants patients are more sensitive to sensory and motor damage, the high degree of disability, and the sensitivity of changes in nerve path. Therefore, health professionals should be alert to this patient group, allocating more attention at the time of evaluation in order to avoid the dreaded disabilities.
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Aspectos hematológicos e clínicos de crianças leucêmicas no período de indução da quimioterapiaMÉLO, Flávia Maria Lessa 22 September 2012 (has links)
Submitted by Rosana Moreira (rosanapsm@outlook.com) on 2018-08-03T17:13:03Z
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Previous issue date: 2012-09-22 / A leucemia é responsável por aproximadamente 30% dos casos de doenças malignas pediátricas, envolvendo o sistema hematopoiético, acometendo preferencialmente os leucócitos, caracterizando-se pela substituição de células sanguíneas normais por células jovens anormais na medula óssea. Na infância é a causa mais comum de óbitos oncológicos, sendo os principais tipos: linfóide aguda (LLA) e mielóide aguda (LMA) ou crônica (LMC). A quimioterapia é o tratamento específico mais utilizado para alcançar a cura ou prolongar a vida desses pacientes, sendo necessária muitas vezes a internação hospitalar, uma vez que estes pacientes apresentam alterações significativas no hemograma, tornando-os imunocomprometidos. Isto aumenta o risco de infecções potencialmente graves além de outras complicações, que muitas vezes prolongam o tempo de internação hospitalar e elevam as taxas de morbi-mortalidade. Com o intuito de ampliar os conhecimentos sobre o hemograma e as características clínicas dos pacientes pediátricos leucêmicos no período de indução da quimioterapia internados em um hospital de referência em oncologia na região norte do Brasil de 2005 a 2010 com idade de 0 a 12 anos. Para tanto foi realizado um estudo retrospectivo com coleta de dados secundários de prontuários arquivados na divisão de arquivo médico e estatístico do hospital envolvido no estudo. Na analise estatística dos resultados obteve-se média, desvio padrão e mediana das variáveis contínuas e frequência das variáveis categóricas, sendo a significância estatística verificada por meio da obtenção de Intervalos de Confiança a 95% e pelos testes de ANOVA 1 critério e Wilcoxon considerado α=5%. Tais análises foram executadas no software Epi-Info 3.5.1. Dos 556 prontuários, 141 encontravam-se completos, sendo observada maior prevalência de acometimentos no sexo masculino, faixa etária de 1 a 4 anos, procedentes do interior do estado do Pará, com classificação clínica para LLA, com protocolo brasileiro GBTLI selecionado na maioria dos casos, fazendo uso de antibioticoterapia empírica, principalmente de ceftazidima, amicacina e ceftriaxona, além de registro de uso de bolsa de sangue no decorrer da internação, com desfecho de internação do tipo alta hospitalar. O estudo revelou ainda alteração dos dados encontrados em todas as variáveis analisadas no hemograma para série branca e vermelha, tanto no primeiro como no décimo quinto dia de internação, períodos estes escolhidos para a coleta dos dados hematológicos, sendo constatada utilização de bolsas de sangue em praticamente todos os pacientes internados (92,20%) com predomínio de concentrado de plaquetas (CP5), hemácias pobre em leucócitos (CHPL) e hemácias. Diante do exposto, recomenda-se a elaboração de ações estratégicas e políticas públicas regionalizadas que contemplem não somente o nível terciário especializado em oncologia pediátrica, mas todos os níveis de atenção à saúde da criança, visando reduzir o impacto causado por esta doença na população infantil da região norte do país. / The leukemia happens in approximately 30% of cases of pediatric malignant diseases involving the hematopoietic system, affects preferentially the white blood cells, characterized by replacement of normal blood cells to young abnormal cells in the bone marrow. Te leukemia is the most common cause of cancer deaths in childhood, and the main types are: acute lymphoblastic leukemia (ALL) and acute myeloid leukemia (AML) or chronic (CML). Chemotherapy is a specific treatment and the most used for healing or prolong life of these patients, often requiring hospitalization, since these patients show significant changes in blood counts, making them immunocompromised. This increases the risk of potentially serious infections and other complications that often prolong hospital stay and increase the rates of morbidity and mortality. In order to broaden the knowledge about the hematology and clinical characteristics of pediatric leukemia patients during chemotherapy induction in an oncology hospital reference in the northern region of Brazil from 2005 to 2010 aged 0-12 years. Therefore was made a retrospective study with secondary data collection from records filed on the division of medical records and statistics of the hospital involved in the study. In the statistical analysis of the results we obtained mean, standard deviation and median of continuous variables and frequency of categorical variables, and statistical significance assessed by means of obtaining confidence intervals at 95% and by an ANOVA test and Wilcoxon considered α = 5%. These analyzes were performed in Epi-Info software 3.5.1. Of the 556 medical records, 141 were complete, and observed higher prevalence in masculine gender, age group between 1-4 years, coming from the state of Pará, with clinical classification for ALL, with Brazilian protocol GBTLI selected in most cases, making use of empirical antibiotic therapy, especially ceftazidime, amikacin and ceftriaxone, and records of use of blood bag during hospitalization, and the outcome of the type of hospital discharge. The study also revealed alteration of the data found in all variables in the blood count to the white and red, both the first and the fifteenth day of hospitalization these periods chosen for data collection hematological, and found use in blood bags virtually all hospitalized patients (92.20%) with predominance of platelet concentrate (CP5), leukocyte-poor red blood cells (CHPL) and red blood cells. Given the above, it is recommended the development of strategic actions and local policies that address not only the tertiary specialist in pediatric oncology, but all levels of health care for the child, to reduce the impact of this disease in the pediatric population the northern region.
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Análise de citocinas no soro de pacientes com câncer gástricoHAGE, Pedro Antonio Mufarrej 16 August 2017 (has links)
Submitted by Rosana Moreira (rosanapsm@outlook.com) on 2018-10-22T17:45:45Z
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Previous issue date: 2017-08-16 / Apesar da redução na incidência mundial do câncer gástrico, essa neoplasia continua sendo a segunda maior causa de morte por câncer no mundo. O diagnóstico tardio ocorre, principalmente, devido à ausência de sintomas ou à presença de sintomas não específicos nos estágios iniciais da doença. Nesse caso, poucas opções terapêuticas eficientes estão disponíveis, resultando em altas taxas de morbidade e mortalidade. O estudo contínuo de novas estratégias para o diagnóstico precoce, definição do prognóstico e identificação de novos métodos terapêuticos é de grande interesse nesse tipo neoplásico. No presente estudo, foi realizada a quantificação de proteínas inflamatórias candidatas a biomarcadores no soro de 19 pacientes com adenocarcinoma gástrico e 13 indivíduos saudáveis para constituirem o grupo controle do experimento. A metodologia utilizada para quantificação de proteínas foi o sistema MAGPIX e o painel de biomarcadores Bio-Plex Pro Human Pro-Cytokine, Chemokine and Growth Factors. Na comparação entre pacientes com adenocarcinoma e grupo controle, foi observado níveis elevados de IL-1β,IL-1RA, IL-2, IL-6, IL-8, IL-10, IL12, IL-15, G-CSF, GM-CSF, IFN-γ, MIP1α, RANTES e VEGF no soro de pacientes com adenocarcinoma. Em relação as características clinicopatologicas, foi observado aumento da expressão de IL-5, IL-7, IL-10 e IL-17A no adenocarcinoma gástrico do tipo difuso em relação ao intestinal. Adicionalmente, a associação da expressão das citocinas em tumores gástricos com a sobrevida global (OS) e sobrevida livre de recaída (PFS) foram realizadas usando a KM Plotter Online Tool. A superexpressão de G-CSF, GM-CSF e VEGF no tumor foi associado com a menor OS e PFS dos pacientes com câncer gástrico, entretanto a superexpressão de IL-10 foi associada apenas com PFS. Assim, podemos concluir que as citocinas IL-1β, IL-1RA, IL-2,IL-6, IL-8, IL-10, IL-12, IL-15, G-CSF, GM-CSF,IFN-γ, MIP1α, RANTES e VEGF são potenciais biomarcadores de câncer gástrico, e que o adenocarcinoma do tipo difuso pode está relacionados a uma maior resposta inflamatória em relação ao tipo intestinal. A análise de sobrevida sugere que elevados níveis de IL-10, G-CSF, GM-CSF e VEGF no soro possam ser utilizados como biomarcadores de prognóstico dos pacientes com câncergástrico. / Despite the reduction in the worldwide incidence of gastric cancer, this neoplasm remains the second largest cause of cancer death in the world. Late diagnosis occurs mainly due to the absence of symptoms or the presence of non-specific symptoms in the early stages of the disease. In this case, few effective therapeutic options are available, resulting in high rates of morbidity and mortality. The continuous study of new strategies for the early diagnosis, definition of the prognosis and identification of new therapeutic methods is of great interest in this neoplastic type. In the present study was quantified inflammatory proteins candidate to biomarkers in the serum of 19 patients with gastric adenocarcinoma before surgical resection and 13 healthy individuals as control. The methodology used for quantification of proteins was the MAGPIX system and panels of cancer biomarkers inventoried by the manufacturer (Bio-Plex Pro Human Pro-Cytokine, Chemokine and Growth Factors). In the comparison between patients with gastric adenocarcinoma and control group was observed the levels of IL-1β, IL-1RA, IL-2, IL-6, IL-8, IL-10, IL-12, IL-15, G-CSF, GM-CSF, IFN-γ, MIP1α, RANTES and VEGF were higher in serum of gastric adenocarcinoma patients. According clinicopathological characteristics, was observed elevated levels of IL-5, IL-7, IL-10 and IL-17A in diffuse-type gastric adenocarcinoma in relation intestinal-type. In addition, the association of the expression of the cytokines studied with overall survival (OS) and relapse-free survival (PFS) were performed using the KM Plotter Online Tool. Overexpression of G-CSF, GM-CSF and VEGF in tumor was associated with lower OS and PFS of gastric cancer patients. However, the overexpression of IL-10 was associated only with PFS. Thus, we can conclude that the IL-1β, IL-1RA, IL-2, IL-6, IL-8, IL-10, IL-12, IL-15, G-CSF, GM-CSF, IFN-γ, MIP1α, RANTES and VEGF cytokines are potential biomarkers of gastric cancer, and diffuse-type adenocarcinoma can related to a greater inflammatory response than intestinal-type. Survival analysis suggests that elevated levels of IL-10, G-CSF, GM-CSF and VEGF in serum are potential biomarkers of prognosis in gastric cancerpatients. / UFPA/ICS/FAMED
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Associação entre polimorfismos em genes envolvidos no metabolismo do folato e risco materno para a síndrome de Down.Mendes, Cristiani Cortez 05 August 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-08-05 / Down syndrome is the most common genetic disorder and, in about 90% of the cases, is characterized by free trisomy of chromosome 21, caused by the failures of chromosomal segregation during maternal meiosis. Studies suggested that the occurrence of DS independent of maternal age is associated with DNA hypomethylation due to impairments in folate metabolism, and genetics polymorphisms involved in this metabolic pathway have been appointed as maternal risk factors for DS. Addition to the genetic polymorphisms, micronutrients deficiencies, as folate and B12 vitamin, can change the products of the folate pathway and result in DNA hypomethylation, genomic instability and reduced DNA repair capacity. Objectives: We evaluated the influence of the 19-base pairs (bp) deletion polymorphism of Dihydrofolate reductase (DHFR) gene, DNA methyltransferase 3B (DNMT3B) -149C→T and -283T→C on the maternal risk for DS and investigated the association between these polymorphism and variations in the concentrations of serum folate and plasma homocysteine (Hcy) and methylmalonic acid (MMA). Methods: 105 mothers of DS individuals with free trisomy 21 and 185 mothers of individuals without the syndrome were studied. Molecular analysis of the DHFR polymorphism was performed by the Polymerase Chain Reaction (PCR) by difference in the size of fragments and DNMT3B -149C→T and -283T→C were analyzed by real-time PCR. Folate was quantified by chemiluminescence and Hcy and MMA by liquid chromatography-tandem mass spectrometry. Results: The analysis of DHFR polymorphism showed no difference between the groups in relation to allele and genotype frequencies (P = 0.44; P = 0.69, respectively). In relation to gentoype, folate, Hcy and MMA concentrations did not differ between the groups (P > 0.05). The DNMT3B -149TT/-283TC combined genotypes were associated with increased maternal risk for DS (OR = 4.61, CI 95% = 1.35 15.79; P = 0.02) and higher folate concentration was observed in mothers with DNMT3B -149CT/-283CC genotypes compared to other combined genotypes (P = 0.03). Conclusions: The 19-bp deletion polymorphism of DHFR gene is not a maternal risk factor for DS and is not related to variations in the concentrations of serum folate and plasma Hcy and MMA. On the other hand, the DNMT3B polymorphisms increase the maternal risk for DS and modulate the folate concentration in studied population. / A síndrome de Down (SD) é a cromossomopatia humana mais frequente e, na maioria dos casos (cerca de 90%), é caracterizada pela trissomia livre do cromossomo 21, resultante de falhas na segregação cromossômica durante a meiose materna. Estudos sugerem que a ocorrência da SD independente da idade materna está relacionada à hipometilação do DNA centromérico como conseqüência do metabolismo anormal do folato e, polimorfismos genéticos envolvidos nesta via metabólica têm sido apontados como fatores de risco materno para a síndrome. Além dos polimorfismos genéticos, deficiências de micronutrientes, tais como folato e vitamina B12, podem alterar os produtos resultantes da via metabólica do folato e resultar em hipometilação do DNA, instabilidade genômica e redução da capacidade de reparo do DNA. Objetivos: Avaliar a influência dos polimorfismos de deleção de 19 pares de base (pb) do gene Dihidrofolato redutase (DHFR), DNA metiltransferase 3B (DNMT3B) -149C→T e -283T→C como fatores de risco materno para a SD e investigar a associação entre esses polimorfismos e as concentrações de folato sérico, homocisteína (Hcy) e ácido metilmalônico (MMA) plasmáticos. Casuística e Métodos: Foram incluídas no estudo 105 mães de indivíduos com trissomia livre do cromossomo 21 e 185 mães de indivíduos sem a síndrome. O polimorfismo do gene DHFR foi avaliado por meio da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) por diferença de tamanho de fragmentos e os polimorfismos DNMT3B -149C→T e -283T→C foram analisados por PCR em tempo real. O folato sérico foi quantificado por quimioluminescência, e Hcy e MMA plasmáticos foram determinados por cromatografia líquida/espectrometria de massas sequencial. Resultados: Em relação ao polimorfismo de deleção do gene DHFR, não houve diferença entre os grupos em relação às frequências alélica e genotípica (P = 0,44; P = 0,69, respectivamente) e as concentrações de folato, Hcy e MMA não mostraram diferença significativa entre os genótipos, entre grupos (P > 0,05). Os genótipos combinados DNMT3B -149TT/-283TC foram associados com o aumento do risco materno para a SD (OR = 4,61, IC 95% = 1,35 15,79; P = 0,02) e, concentração de folato aumentada foi observada em mães com os genótipos DNMT3B -149CT/-283CC quando comparados com os demais genótipos combinados (P = 0,03). Conclusões: O polimorfismo de deleção de 19 pb do gene DHFR não é um fator de risco materno para SD e não está relacionado com variações nas concentrações de folato sérico, Hcy e MMA plasmáticos. Por outro lado, os polimorfismos do gene DNMT3B aumentam o risco materno para a SD e modulam a concentração de folato na população estudada.
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Polimorfismos dos genes MTHFR (metilenotetrahidrofolato redutase) e ECA (enzima conversora da angiotensina) em pacientes submetidos a transplante renal.Alvarenga, Maria Paula Sanches de 15 December 2006 (has links)
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Previous issue date: 2006-12-15 / The chronic allograft nephropathy (CAN) accounts for
approximately 60% of late renal allograft loss. High homocysteine level (Hcy) and genetic variability of renin-angiotensin system are the possibly risk factors. Objectives:
To investigate the frequency of Angiotensin Conversion Enzyme (ACE I/D) gene deletion, and Metilenetetrahydrofolate reductase (MTHFR C677T and A1298C)
variants, as well as to quantify the plasma homocysteine concentrations in 300 patients submitted to renal transplantation to evaluate these factors participation in CAN development. Furthermore the ingestion of micronutrients and the frequency of MTHFR T1317C polymorphism have been investigated.
Material and Method: The molecular study was performed by polymerase chain reaction (PCR) and RFPL (Restriction fragment length polymorphism)techniques for polymorphism investigation. In accordance with clinical criteria established, the patients had been subdivided in patients
with CAN and patients with normal renal function (NRF). The automatic sequencing was performed for MTHFR polymorphism A1298C confirmation and identification of MTHFR T1317C polymorphism. Plasma Hcy concentration was measured by liquid chromatography tandem mass spectrometry (LS-MS/MS) technique. Dietary intakes were evaluated by a validated dietary questionnaire. Results: There was no correlation between the ingestion of micronutrients and CAN. The 1317C polymorphism frequency was 7% in Brazilian recipients. The presence, at least, of one MTHFR (677T/1298C)variant was significantly more frequent in CAN (p=0.049; OR = 1.7; 95% IC: 1.0 3.1), and a higher risk for disease was observed in the presence of the polymorphic $&( (D) variant (677T/1298AC/ACED) (p=0.009; OR = 2.2; 95% IC: 1.2 4.2). The hyperhomocysteinemia was observed in 82.1% of the CAN group patients, and 68.2% from MRF group. and plasmatic medium values of Hcy have presented statistical
significant difference between the groups (p=0.005 and p<0.0005, respectively). High medium level of Hcy were associated with 677TT genotype and 677TT1298AA
combined genotype in CAN group (p=0.002 and p=0.018, respectively) and with the 1298A allele from NRF group (p=0.009). The individuals of NRF group with 1298AA
genotype have presented higher medium levels than 1298AC (p=0.033) genotype, suggesting a protector factor for 1298A allele. In relation to the distribution of Hcy levels, the CAN group has presented greater number of patients classified with severe and intermediate yperhomocysteinemia (>30μmol/L) (p=0.0005), in relation to NRF group. The 1298C allele presence, as well as the combination, at least, one 07+)5 (677T/1298C) polymorphic allele in patients with hyperhomocysteinemia, were more frequent in CAN group (p=0.007 and p=0.002). A risk for CAN was observed in this
combination (MTHFR 677T/1298C) in hyperhomocysteinemia patients (OR = 2.8; 95% IC: 1.4 6.0). This risk is increased in the presence of the polymorphic $&( (D)
variant (OR = 3.4; 95% IC: 1.5 8.1). This suggests that the combination of, at least, one polymorphic 07+)5 allele and ECA(in those patients with hyperhomocysteinemia
can predispose recipients to CAN development. / A disfunção crônica do transplante (DCTx) constitui
aproximadamente 60% das causas de perda do transplante. Entre os possíveis fatores envolvidos estão o aumento do nível da homocisteína (Hcy) no plasma e a variabilidade
genética no sistema angiotensina renina. Objetivos: investigar as freqüências do polimorfismo de deleção do gene ECA (enzima conversora da angiotensina) e das variantes 677 e 1298 do gene MTHFR (metilenotetrahidrofolato redutase), bem como dosar a concentração plasmática de Hcy em pacientes submetidos a transplante renal, visando avaliar a participação destes fatores no desenvolvimento da DCTx. Também foram investigadas a ingestão de micronutrientes e a freqüência do polimorfismo MTHFR T13317C.
Casuística e Métodos: Foram investigados 300 pacientes submetidos a transplante renal há no mínimo 12 meses. De acordo com critérios clínicos estabelecidos os pacientes foram subdivididos em pacientes com DCTx e pacientes com função renal normal (FN). O estudo molecular utilizou as técnicas de reação em cadeia da polimerase seguida de digestão enzimática para a investigação dos polimorfismos. O seqüenciamento automático foi realizado para confirmação do polimorfismo MTHFR A1298C e para identificação do polimorfismo MTHFR T1317C. A concentração plasmática de Hcy foi dosada por meio da técnica de cromatografia líquida/espectrometria de massas seqüencial. A ingestão de micronutrientes foi avaliada por meio de questionário validado cientificamente. Resultados: Não foi encontrada associação entre a ingestão de micronutrientes e a DCTx. A freqüência do polimorfismo 1317C foi de 7% na população de indivíduos transplantados brasileiros. A presença de pelo menos uma variante MTHFR (677T/1298C), foi significantemente mais freqüente em DCTx (p=0,049; OR = 1,7; 95% IC: 1,0 3,1) e um risco aumentado para doença foi observado na presença da variante polimórfica ECA (D) (677T/1298AC/ECAD) (p=0,009; OR = 2,2; 95% IC: 1,2 4,2). A hiper-homocisteinemia foi observada em 82,1% dos pacientes do grupo com DCTx e 68,2% do grupo de FN e os valores médios de Hcy plasmática apresentaram diferença estatisticamente significante entre os grupos (p=0,005 e p<0,0005, respectivamente). Nível médio elevado de Hcy foi associado com o genótipo 677TT e com o genótipo combinado 677TT/1298AA no grupo DCTx (p=0,002 e p=0,018, respectivamente) e ao alelo 1298A do grupo FN (p=0,009). Os
indivíduos FN com o genótipo 1298AA apresentaram níveis médios mais elevados que àqueles com o genótipo 1298AC (p=0,033), sugerindo um fator protetor para o alelo 1298A. Em relação à distribuição dos níveis de Hcy, o grupo DCTx apresentou maior número de pacientes classificados com hiper-homocisteinemia intermediária e grave
(>30μmol/L) (p=0,0005), em relação ao grupo FN. A presença do alelo 1298C, bem como a combinação de pelo menos um alelo polimórfico MTHFR (677T/1298C) em pacientes com hiper-homocisteinemia foi mais freqüente no grupo DCTx (p=0,007 e p=0,002, respectivamente). Um risco para DCTx foi observado para essa combinação MTHFR 677T/1298C) (OR = 2,8; 95% IC: 1,4 6,0) e é aumentado na presença da variante polimórfica ECA (D) (OR = 3,4; 95% IC: 1,5 8,1). Conclusão: A combinação de pelo menos um alelo polimórfico MTHFR e ECA naqueles pacientes que apresentam hiper-homocisteinemia parece predispor o paciente transplantado a DCTx.
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As correlações clínico-topográficas das afasias.Madalozzo, Danielle 26 January 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-01-26 / Aphasia is a disorder that affects the language in its receptive and expressive, syntactic, semantic and morphologic aspects. The most common cause is the
cerebrovascular accident (CVA). The authors of studies about the clinical-topographical correlations of the aphasias have been presenting variable results regarding the cerebral location of the language. The objective of this study was to establish the clinicaltopographical
correlations of the fluent and non-fluent aphasias, observing the contributions of Spect scanning to map the affectec areas in the aphasias. A total of 29 patients with
aphasia due to first episode of CVA comprised the study. They were submitted to language evaluation by means of selected proofs of the Boston Diagnosis Aphasias Examination
(BDAE). Spect scanning was used to evaluate perfusion alterations in the whole encephalon , and it was analyzed by a nuclear doctor and a radiologist, in order to supply
fidelity to the location data. After clinical evaluation, it was observed that 62% of the patients presented non-fluent aphasia and 38% fluent aphasia. It was not possible to classify 17% of the sample according to the classic types of aphasia. The analysis of the main components based on covariances allowed to relate the non-fluent aphasias mainly to the left and right frontal regions , left temporal region, presence of contralateral cerebelar
diasquise to the left, subcortical regions , among others. The fluent aphasias are related to the inferior and superior left parietal regions . These data have corroborated for the concept of neural net in which several cortical , subcortical and cerebelar regions are involved to
perform a linguistic task. In this way, this study showed that other cerebral regions participate in the language process as a neural circuit. Cerebral Spect provided different xi contributions from other image methods, adding important information on the participation of subcortical and cerebelar areas in the language process. / A afasia é uma desordem que afeta a linguagem nos seus aspectos receptivo e expressivo, sintático, semântico e morfológico. Sua causa mais comum é o acidente vascular cerebral (AVC). Os autores de estudos sobre as correlações clínico-topográficas das afasias apresentam resultados variáveis quanto à localização cerebral da linguagem. O
objetivo desse trabalho foi estabelecer as correlações clínico-topográficas das afasias fluentes e não fluentes, verificando as contribuições do Spect cerebral para mapear as áreas
comprometidas nas afasias. Foram sujeitos desse estudo 29 pacientes com afasia decorrente de primeiro episódio de AVC, os quais foram submetidos à avaliação de linguagem por
meio de provas selecionadas do Teste de Boston para o diagnóstico das afasias (BDAE). O Spect cerebral foi utilizado para avaliar alterações perfusionais em todo o encéfalo e foi
analisado por médico nuclear e radiologista, a fim de fornecer fidelidade aos dados de localização. Após avaliação clínica, observou-se que 62% dos pacientes apresentaram afasia não fluente e 38% afasia fluente. Não foi possível classificar 17% da amostra dentro
dos tipos clássicos de afasia. A análise dos componentes principais com base em
covariâncias permitiu relacionar as afasias não fluentes principalmente às regiões frontal
esquerda e direita, temporal esquerda, presença de diásquise cerebelar contralateral à
esquerda, regiões subcorticais, entre outras. As afasias fluentes estão relacionadas às
regiões parietal inferior e superior esquerda. Esses dados corroboram para o conceito de
rede neural nas quais estão envolvidas várias regiões corticais, subcorticais e cerebelares
para a execução de uma tarefa lingüística. Dessa forma, este estudo mostrou que outras
regiões cerebrais participam do processamento da linguagem como um circuito neural. O
Spect cerebral ofereceu contribuições diferentes das obtidas por outros métodos de imagem
ix
e acrescentou informações importantes sobre a participação de regiões subcorticais e
cerebelares no processamento da linguagem.
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Efeitos do ciclamato de sódio e do aspartame na placenta de uma ratas: estudo morfométricoMatos, Marcelo Alexandre de 13 May 2008 (has links)
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Previous issue date: 2008-05-13 / To evaluate the effects on the placenta of the administration to rats during embryogenesis, of sodium cyclamate or aspartame. Method: Administration of respectively, 14 mg/kg of aspartame via an orogastric sound to a group of rats during their tenth to fourteenth day of pregnancy, of 60 mg/Kg of sodium cyclamate intraperitonially to another group, and of equivalent volumes of saline by the same routes to controls. On the twentieth day of pregnancy five foetuses of each group were aleatorily selected for study. Karyometry was used to evaluate nuclear parameters of the decidua, spongy layers and chorionic villi of the placenta. Results: Weights of foetuses and placentas, as well as lengths of umbilical cords were lower in treated rats, compared to control. While no changes were observed in the decidual layer of the cyclamate-treated group, this layer was altered by aspartame treatment. Nuclear parameters in the spongy layer and chorionic villi were altered in both, cyclamate and aspartame-treated groups. Conclusions: The study numerically demonstrated placenta intoxication by sodium cyclamate or aspartame, and consequent repercussion on foetuses of the use of these substances during pregnancy. / Avaliar os efeitos do ciclamato de sódio na placenta de ratas com sua administração no período da embriogênese. Método: Foi administrado por sonda orogástrica nas ratas de um grupo tratado a dose de 14 mg/Kg de aspartame, e nas ratas do outro grupo tratado a dose de 60 mg/Kg de ciclamato de sódio por via intraperitoneal, do décimo ao décimo quarto dia de gestação, e volume equivalente de solução salina no grupo controle, pela mesma via. No vigésimo dia de prenhez, 5 fetos de cada grupo foram escolhidos ao acaso para estudo. A técnica de cariometria foi utilizada para avaliação dos parâmetros nucleares das células das camadas decídua, esponjosas e das vilosidades coriônicas da placenta. Resultados: O peso dos fetos tratados e de suas placentas, e o comprimento do cordão umbilical, foram menores do que o grupo controle. Não ouveram alterações na camada decídua do grupo tratado com ciclamato de sódio, enquanto tal camada mostru-se alterada no tratamento com aspartame. Foram alterados parâmetros nucleares nas camadas esponjosas e vilosidades coriônicas do grupo tratado com ciclamato de sódio, e do grupo tratado com aspartame. Conclusão: Este estudo demonstrou numéricamente a intoxicação placentária com o ciclamato de sódio e com aspartame, e a conseqüente repercussão fetal com o uso destas substâncias durante a gravidez.
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Prevalência de cefaléia em crianças e adolescentes da cidade de São José do Rio Preto SP.Albuquerque, Regina Celia Ajeje Pires de 23 November 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009-11-23 / Several population-based studies have shown been headache as one of the most common symptoms in childhood. These have provided important consequences in headache diagnosis and treatment, since only about 11% of children with chronic headache seek medical treatment. Objectives: This study aimed at selecting a sample of school-aged children who complained headache in the last year, and to assess the headache prevalence in children and adolescents in São José do Rio Preto city (SJRP), SP. Casuistic and Methodology: A total of 5,232 children and adolescents (aged from 6 to 18 years) from SJRP randomly comprised this sample. They have been attended from the 1st to 8th grade in the year of 2004 in 13 schools: 10 public and 3 private. A questionnaire answered by parents and/or responsibles of children and adolescents was handed out in the schools to collect data. The used variables for descriptive demographic profile of the population were: age, gender, color, grade, and school for descriptive analysis of this population s demographic profile. Results: The majority was women (53.3%), white color (74.7%), and attending from the 1st to 4th grade (60%) and from the 5th to 8th grade (40%) of the elementary school. The returning of questionnaires was 61.7% in the public schools and 60% in the private. Out of the children and adolescents who have answered the questionnaire, 70% reported headache complain in the last year, only 7.2% of them did not. Out of the ones who have complained headache in the last year, 51.5% presented it occasionally during the year; 15.5%% once a month at least, 11.9% monthly and 5.2% daily. A significant difference observed in the study was regarding to the complain between the girls and the boys. More frequent headaches were reported by the girls; daily headache was twice higher than the percentile of the boys (6.6% and 3.6%, respectively). A higher headache frequency with the increase of age was observed in relation to headache and age. Our study has pointed out that headache prevalence was high in this studied population; predominantly the frequency being higher (monthly, weekly and daily) in girls and older age group. / Uma série de estudos populacionais tem mostrado que a cefaléia é um dos sintomas mais comuns na infância. Estes estudos têm importantes implicações no diagnóstico e tratamento das cefaléias, desde que somente 11% das crianças com cefaléia crônica procuram atendimento médico. Objetivos: O objetivo deste estudo foi selecionar uma amostra de escolares que declararam ter sentido dor de cabeça no último ano e estimar a prevalência de cefaléia em crianças e adolescentes da cidade de São José do Rio Preto (SJRP), SP. Casuística e Método: O grupo amostral foi constituído por 5.232 crianças e adolescentes (idades de 6 18 anos) de SJRP, que cursaram da 1ª a 8ª série no ano de 2004 em 13 escolas, sendo 10 públicas e 3 particulares, feita por seleção aleatória. A coleta de dados foi realizada por aplicação de um questionário distribuído nas escolas, respondido pelos pais e/ou responsáveis. As variáveis utilizadas foram: idade, gênero, cor, série e escola para a análise descritiva do perfil demográfico desta população. Resultados: O grupo amostral foi composto na maioria por mulheres (53,3%), cor branca (74,7%), cursando da 1ª a 4ª série (60%) e da 5ª a 8ª série (40%) do ensino fundamental. A taxa de devolução dos questionários foi de 61,7% nas escolas públicas e 60,1% nas particulares. Das crianças e adolescentes que participaram do estudo, 70% declararam ter sentido dor de cabeça no último ano, sendo que somente 7,2% nunca se queixaram de dor. Dos que responderam ter sentido cefaléia no último ano, 51,5% apresentaram cefaléia somente algumas vezes ao longo do ano, 15,5% pelo menos uma vez ao mês, 11,9% semanalmente e 5,2% diariamente. Uma diferença significativa observada em nosso estudo foi relacionada à queixa entre meninas e meninos. Cefaléias mais freqüentes foram relatadas pelas meninas, sendo que a queixa de cefaléia diária entre as meninas foi duas vezes maior que o percentual para os meninos (6,6% contra 3,6%). Observou-se uma relação da cefaléia com a idade, indicando que houve um aumento da freqüência da cefaléia com o aumento da idade. Nosso estudo indicou que a prevalência de cefaléia na população estudada foi alta, com maior predomínio de cefaléias mais freqüentes (mensalmente, semanalmente e diariamente) nas meninas e na faixa etária mais velha.
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