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Estudo da produção do bioconservante nisina por Lactococcus lactis subsp lactis

Flores, Simone Hickmann 26 July 2018 (has links)
Orientador: Ranulfo Monte Alegre / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-26T20:02:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Flores_SimoneHickmann_D.pdf: 22660567 bytes, checksum: db69c472e3fdbdbc9735e3ed718c6c3e (MD5) Previous issue date: 2000 / Resumo: o grande interesse em novos métodos de conservação biológica de alimentos, com a finalidade de reduzir o uso de aditivos, sem comprometer a segurança dos mesmos, tem incentivado a pesquisa na área de conservantes seguros de origem alimentícia e biológica (bioconservantes) Peptídeos antibacterianos ou bactericidas produzidos por diferentes tipos de bactérias ácido lácticas (LAB) tem gerado interesse no uso destes como bioconservante. Bactérias ácido lácticas e seus metabólitos, incluindo os bactericidas, têm sido consumidos a milhares de anos, através de alimentos fermentados, sem nenhum efeito adverso conhecido. Estas bactérias podem atuar como bioconservantes, tendo efeito inibidor contra vários microorganismos. O presente trabalho trata do estudo da produção do bioconservante nisina por Lactococcus lactis subps lactis, consistindo nas seguinte etapas: seleção do melhor microrganismo produtor, seleção da melhor fonte de substrato e do meio de cultura; avaliação e otimização das variáveis experimentais e fermentação em reator de bancada, para obtenção das condições de operação que influenciam na produção de nisina. A primeira etapa consistiu na seleção do melhor microrganismo produtor a ser utilizado nos estudos posteriores. Partiu-se das seguintes culturas de Lactococcus lactis subsp lactis, tidas como boas produtoras de nisina: ATCC 7962, ITAL SL-0256, NCDO 176, ITAL BL-008 E ATCC 11454. Nesta fase, os ensaios foram realizados em frascos agitados. Com base nos resultados obtidos, selecionou-se o Lactococcus lactis subsp lactis ATCC 7962, que chegou a uma produção máxima de 496 UI/rnL de meio. A escolha da melhor fonte de substrato e do meio de cultura com melhor composição ocorreu paralelamente à escolha do microrganismo. Foram testados sacarose, permeado de soro de queijo, melaço de cana-de-açúcar e mais 4 composições de meios. Lactose, na forma de permeado de soro de queijo, proporcionou a maior produção de nisina alcançando 2476 VI de nisinaJmLde meio. Na terceira etapa, estudou-se a influência de 4 variáveis experimentais na produção do bioconservante nisina. Foram elas: concentração da fonte de carbono, concentração da solução salina, concentração da solução de vitaminas e concentração da solução de aminoácidos. As variáveis que influenciaram significativamente na produção de nisina foram concentração da fonte de carbono (8g/L) e adição de aminoácidos (22%). O planejamento experimental permitiu um aumento de 73% na produção de nisina, alcançando um máximo de (4280UI/rnL de meio). Os ensaios em fermentador de bancada objetivaram estudar a influência do controle de pH e aeração na produção de nisina. A aeração e controle de pH influenciaram significativamente na produção de massa celular seca, porém não influenciaram na atividade de nisina. / Abstract: Current consumers interest for commercially processed foods that are not preserved with non-food preservatives has provided an incentive to search for safe and food-grade preservatives (biopreservatives) of biological origin. Antibacterial peptides or bacteriocins produced by several strains of lactic acid bacteria (LAB), have generated interest as potencial food preservatives. Cells of LAB and their metabolites, incluing the bacteriocins, have been consumed by humans for thousands of years through fermented food without any know adverse effect. This bacteriocins are bactericidal to many strains. The present is about the study of the biopreservative nisin production by Lactococcus lactis subps lactis, consisting of the following stages: selection of the best producing microorganism, substrate source and culture medium; evaluation and optimization of the experimental variables and fermentation in a bench-fermentor to obtain the operation conditions that influence in the nisin production. The first phase consisted of the selection of the best producer microrganism to be used in the posterior studies. The following strains of Lactococcus lactis subsp lactis were used:ATCC7962, ITAL SL-0256,NCDO 176,ITALBL-008AND ATCC 11454.In this phase, the experiments were conducted in shake-flasks. Based on the obtained results, the Lactococcus lactis subsp lactis ATCC 7962 produced a maximum of 496 DI nisin/rnL. The selection of the best substrate source and medium composition was done parallelly to the microorganism selection. It was tested sucrose, whey permeate, molasses sugar cane and more 4 compositions of medium. Lactose in the form of whey permeate provided the argest nisin production reaching2476DI nisin/rnL. In the third stage, it was studied the influence of four experimental variables in the biopreservative nisin production: carbon source concentration, saline solution concentration, vitamins solution and amino acids solution concentration. The variables that presented significant influence in the nisin production were carbon source concentration (8g1L) and amino acids addition (22%). The experimental design allowed an increase of 73% in the nisin production reaching a maximum of 4280UI/mL. The experiments in the bench-fermenter were done to verify the influence ofthe pH control and aeration in the nisin production. The aeration and pH control influenced significantly the mass cellular production, even so they did not influence on the nisin activity. / Doutorado / Doutor em Engenharia de Alimentos
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Clostridium botulinum em sedimentos lacustres e peixes de aquicultura, alternativas no seu isolamento e identificação e desenvolvimento em files de tilapia (Oreochtomis niloticus) refrigerados

Junqueira, Valeria Christina Amstalden 01 August 2018 (has links)
Orientador: Mauro Faber de Freitas Leitão / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-01T09:13:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Junqueira_ValeriaChristinaAmstalden_D.pdf: 13817901 bytes, checksum: 0c1da99e3160e894aef54f77134aeacc (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: Nesta pesquisa procurou-se avaliar a validade e adequacidade de métodos alternativos aplicados no isolamento e identificação de Clostridium botulinum, a ocorrência do mesmo em sedimentos lacustres e em peixes de aqüicultura e a influência da temperatura, composição da atmosfera na embalagem e do lactato de sódio no desenvolvimento de esporos desta bactéria, inoculados experimentalmente em filés de tilápia. Os estudos efetuados permitiram otimizar o meio de Ágar Tripticase Glicose Extrato de Levedura para contagem em placas pela técnica de inoculação em profundidade, permitindo uma diferenciação na triagem inicial, podendo também ser utilizado adicionado dos antibióticos cicloserina, sulfametoxazole e trimethoprim, tornando-se seletivo para contagem preliminar de cepas proteolíticas da bactéria. Para avaliação da ocorrência de C. botulinum, foram analisadas um total de 200 amostras de vísceras de peixes e 100 amostras de sedimentos de tanques de criação através das técnicas de Número Mais Provável (NMP) e de contagem em placas por inoculação em profundidade, indicando ocorrência de 1% e 8%, respectivamente, constatando-se apenas a presença de cepas dos tipos C e E da bactéria. Em termos quantitativos, as populações de C. botulinum verificadas nas amostras positivas de vísceras e sedimentos foram muito reduzidas, na faixa de 0,01 a 0,05NMP/g. Os filés de tilápia inoculados experimentalmente com esporos de C. botulinum não se apresentaram tóxicos após armazenamento a 4°C durante 45 dias, em atmosfera modificada com ou sem tratamento com lactato. No entanto, pela elevação da temperatura para 12°C a toxicidade foi comprovada, independentemente do uso de outros obstáculos como o lactato de sódio ou a atmosfera modificada. / Abstract: In this research we aim to evaluate the validity and adequacy of alternative methods applied to the isolation and identification of Clostridium botulinum, its occurrence in lake sediments and farmed fish and the influence of temperature, atmospheric composition on the packaging and of sodium lactate in the development of its spores inoculated experimentally in tilapia fillets. The studies carried out led to the optimization of the Agar Tripticase Peptone Glucose Yeast Extract for pour-plate counting allowing for a preliminary differentiation as well as being able to be utilized when the antibiotics cicloserine, sulfametoxazole and trimethoprim are added, becoming selective for preliminary counting of proteolytic strains of the bacteria. To evaluate the occurrence of C. botulinum, a total of 200 fish gut samples and 100 samples of sediment from fish farm tanks were analyzed by the Most Probable Number (MPN) and by pour-plate techniques, indicating levels of 1% and 8%, respectively, and showing only the presence of the C and E C. botulinum types. In quantitative terms, the population of C. botulinum verified in the positive gut and sediment samples was very low, around 0.01 to 0.05 MPN/g. The tilapia fillets experimentally inoculated with C. botulinum spores did not become toxic after storage at 4°C for 45 days in modified atmosphere packaging with or without lactate treatment. However, when the temperature was increased to 12°C the toxicity was proven independently of the use of other barriers such as sodium lactate and modified atmosphere. / Doutorado / Doutor em Tecnologia de Alimentos
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Genética aplicado no estudo da cadeia produtiva de Serrasalmídeos : identificação de espécies e híbridos comercializados /

Martins, Diego Galetti January 2017 (has links)
Orientador: Fábio Porto Foresti / Resumo: O consumo per capta de proteína animal vem crescendo de forma significativa no Brasil e no mundo. Dentre as distintas fontes para este recurso, o pescado destaca-se como a mais comercializada mundialmente, com 167.2 milhões de toneladas produzidas em 2014. No Brasil, atualmente, a maior parcela do comércio de espécies de peixes continentais é proveniente de pisciculturas, tendo como prática comum a hibridação interespecífica. Dentre as espécies nativas mais utilizadas para os cruzamentos interespecíficos em cultivos brasileiros estão: Colossoma macropomum (tambaqui), Piaractus mesopotamicus (pacu) e Piaractus brachypomus (pirapitinga), que juntamente a seus híbridos recíprocos, corresponderam a 39,2% da produção aquícola brasileira em 2015, com 190 mil toneladas produzidas. Entretanto, devido à dificuldade de diferenciação morfológica em relação às espécies puras, híbridos podem ser erroneamente manejados, ocasionando problemas para a produção, comércio e ambiente. Dentro deste contexto, o presente estudo objetivou a identificação molecular de exemplares comercializados em uma das maiores feiras atacadistas da América Latina, a Companhia de Entrepostos e Armazéns Gerais de São Paulo (CEAGESP). O diagnóstico genético revelou que 75,9% das amostras analisadas não condiziam com a nomenclatura comercial utilizada durante a venda, havendo exemplares de diferentes linhagens híbridas na composição dos lotes. Além de presentes, os exemplares híbridos foram notados em altas frequência... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The per capita consumption of animal protein has been growing significantly in Brazil and in the world. Among the different sources for this resource, the fish stands out as the most commercialized in the world, with 167.2 million tons produced in 2014. In Brazil, currently the largest share of the trade in inland fish species comes from fish farms, with interspecific hybridization as a common practice. Among the native species most used for interspecific crosses in Brazilian crops are Colossoma macropomum (tambaqui), Piaractus mesopotamicus (pacu) e Piaractus brachypomus (pirapitinga), which together with their hybrids, corresponded to 39.2% of Brazilian aquaculture production in 2015, with 190 thousand tons produced. However, due to the difficulty of morphological differentiation in relation to the pure species, hybrids can be mistakenly handled, causing problems for production, trade and environment. In this context, the present study aimed the molecular identification of 364 specimens marketed in one of the largest wholesale fairs in Latin America, the Company of Warehouses and General Warehouses of São Paulo (CEAGESP). The genetic diagnosis revealed that 75.9% of the analyzed samples did not match the commercial nomenclature used during the sale, with different hybrid lines in the composition of the lots. Further existing, the hybrid specimens were noticed at high frequencies, with a correspondence of 51.6% of the samples with advanced hybrid individuals and 25.2% of F1 ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Aplicação da modelagem preditiva de distribuição de espécies como ferramenta de estudo da biodiversidade /

Brito, Gustavo Reis de. January 2018 (has links)
Orientador: Fernando Frei / Banca: José Celso Rocha / Banca: Maria Cecília Barbosa de Toledo / Resumo: A Biologia da Conservação é uma ciência multidisciplinar surgia em meados dos anos 80 através da necessidade da junção de diferentes áreas do conhecimento frente às mudanças ambientais que afetam a biota como um todo. De maneira concomitante, o avanço das tecnologias permitiu a integração de áreas como a Ecologia com a computação, permitindo estudos que fossem capazes de gerar predições não só atuais, mas futuras em relação às espécies e o ambiente em que estas estão inseridas. Conhecido como modelagem preditiva de distribuição de espécies, modelagem de nicho ecológico ou simplesmente modelagem preditiva, o processo de modelamento da relação entre espécies e ambiente se baseia em diferentes tipos de algoritmos computacionais visando atender não só a demanda por um conhecimento ecológico, mas atender principalmente estudos de conservação. O presente trabalho, demonstrou que a modelagem preditiva de distribuição de espécies é uma importante ferramenta aliada à Ecologia e à Biologia da Conservação e que, embora seja uma área em ascensão, ainda necessita de estudos quanto aos processos utilizados na produção dos modelos. Neste trabalho foi avaliada a interferência do tamanho da amostra no resultado final do modelo através da utilização de diferentes tamanhos amostrais para seis espécies de aves brasileiras, produzindo resultados que demonstram que o tamanho amostral é um dos principais pontos críticos para o processo de modelagem, requerendo atenção por parte do pesquisador para ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Emerged in the mid-80s as a multidisciplinary science, the Conservation Biology was the result of the need to bring together different areas of knowledge in the face of environmental changes that affect the biota as a whole. At the same time, the advance of technologies permitted the integration of Ecology with Computation, allowing studies capable of generating not only current but future predictions regarding the species and the environment in which they are inserted. Known as species distribution modeling, ecological niche modeling, or simply, predictive modeling, the process of modeling the relationship between species and the environment is based on different types of computational algorithms, aimed at meeting not only the demand for ecological knowledge, but to attend the studies of conservation. The present work showed that the predictive modeling of species distribution is an important tool for Ecology and Conservation Biology and that although it is a growing area, it still needs studies on the process used in the production of the models. This study evaluated the interference of sample size in the final result of the model through the use of different sample sizes for six species of Brazilian birds, producing results that demonstrate that sample size is one of the main critical points for the modeling process, requiring attention on the part of the researcher to avoid low quality models or that contain information that under or overestimates the real distribution of... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Variabilidade genética e estruturação populacional do Bicudinho-do-brejo-paulista, Formicivora paludicola (aves: Thamnophilidae) uma espécie criticamente ameaçada do estado de São Paulo /

Camargo, Crisley de. January 2014 (has links)
Orientador: Adriane Pinto Wasko / Coorientador: Mercival Roberto Francisco / Coorientador: Luis Fábio Silveira / Banca: Cristina Yumi Miyaki / Banca: Ricardo Belmonte-Lopes / Resumo: Populações pequenas são mais susceptíveis aos efeitos causados por deriva genética e endocruzamento o que, geralmente, está associado à perda de variabilidade genética. Baixos níveis de diversidade genética podem resultar em drásticas consequências nos indivíduos, como alterações nas taxas de fertilidade e capacidade de se adaptar a mudanças ambientais. Embora estes fatores possam elevar o risco de extinção, o fluxo gênico pode balancear estes efeitos, mantendo a variabilidade genética e diminuindo a divergência entre populações. Deste modo, conhecer as características genéticas intra e interpopulacionais é essencial quando se trata da conservação de espécies ameaçadas. Marcadores moleculares, como microssatélites e SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), são importantes ferramentas para acessar níveis de variabilidade genética e padrões de fluxo gênico em populações e vêm sendo amplamente utilizados em espécies alvo de programas de conservação. O bicudinho-do-brejo-paulista (Formicivora paludicola) é uma pequena ave restrita a brejos da Mata Atlântica que foi recentemente descrita na região metropolitana da cidade de São Paulo. Ocorre em 15 localidades isoladas situadas nas bacias do Alto Tietê e do rio Paraíba do Sul e, especialmente devido à destruição do seu hábitat, já está classificada como "Criticamente em Perigo" no estado de São Paulo. Ações prioritárias para a conservação da espécie incluem estudos genéticos para estabelecer o monitoramento e o manejo das populações naturais. Visto isso, o presente trabalho teve como objetivo avaliar os níveis de variabilidade genética e os padrões de fluxo gênico de duas populações de bicudinho-do-brejo-paulista, visando fornecer subsídios para futuras estratégias de conservação a serem desenvolvidas para a espécie. Para tanto, foram analisados 9 loci de microssatélites espécie-específicos e ... / Abstract: Small populations are more susceptible to genetic drift and inbreeding effects which, generally, can be associated to loss of genetic variability. Low levels of genetic diversity can result in severe effects in the individuals, as fertility alterations and capability of adaption to environmental changes. Although these factors can, in turn, increase the risk of extinction, gene flow may balance these effects, maintaining the genetic variability and reducing genetic divergences among populations. Therefore, it is essential to understand intra and inter population genetic data, in order to conserve threatened species. Molecular markers, such as microsatellites and SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), are reliable tools for assessing levels of genetic variability and patterns of gene flow in populations and have been widely used to analyze target species on conservation programs. The São Paulo marsh antwren (Formicivora paludicola) is a small bird restricted to marshes of Atlantic Forest that was recently described in the metropolitan region of São Paulo city. It occurs in 15 isolated localities spread on High Tietê and Paraíba do Sul River basins and, especially due to its habitat destruction, it is already considered as "Critically Endangered" in São Paulo State. Priorities actions for this species' conservation include genetic studies to establish the monitoring and management of natural populations. Therefore, the present study aimed to evaluate the genetic variability levels and the gene flow patterns of two populations of F. paludicola in order to support future conservation strategies for the species. As so, we analyzed 9 species-specific microsatellite loci and 8 additional heterologous loci, and also 1.227 SNPs loci that were developed by a RAD-seq (Restriction-site Associated DNA sequencing) approach. A total of 44 animals were collected in two marsh areas near Mogi das Cruzes city (MC) (N = 26) and Salesópolis city (SL) ... / Mestre
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Superabundância de bambus em paisagens fragmentadas é influenciada pela forma do fragmento, distância de estradas e tipo de matriz

ZANATTA, Mariane Patrezi 09 February 2015 (has links)
A fragmentação florestal e os diferentes usos da terra pelo ser humano podem atuar como facilitadores do processo de invasão de espécies exóticas. No entanto, pouca atenção tem sido dada à expansão de espécies nativas que se tornam localmente superabundantes. Estas espécies superabundantes podem afetar negativamente outras espécies nativas, causando extinções locais, mas seus efeitos e suas causas ainda são pouco compreendidos. Portanto, este estudo tem como objetivo investigar se as características da paisagem, como a urbanização, os atributos de cobertura da terra, índice de proximidade, e média da complexidade da forma, influenciam a abundância e cobertura de duas espécies de bambu superabundantes. O estudo foi conduzido em 15 fragmentos florestais ao redor de Alfenas, Minas Gerais, sudeste do Brasil. Calculamos parâmetros de composição e de configuração em três distâncias de buffer (600 m, 800 m e 1000 m). A densidade e a cobertura de bambu foram quantificadas em cada fragmento 30 parcelas circulares (2 m de raio): 15 a partir da borda (0 m) e 15 no interior (50 m) do fragmento. Ambos os bambus são espécies florestais sensíveis às variações de luz. Descobrimos que a abundância de Paradiolyra micrantha e Merostachys sp. aumentam com a distância das estradas e cidades em habitats moderadamente perturbados, caracterizados por possuírem um formato de fragmento mais irregular e próximos a tipos de matrizes mais abertas. No entanto, observou-se que as espécies de bambu não responderam de forma semelhante às espécies invasoras e foram favorecidas apenas em áreas de perturbação moderada, na qual os remanescentes estão mais afastados das cidades e estradas, circundados por maior proporção de matrizes agrícolas e pouca porcentagem de pastos, e também quando os fragmentos apresentam uma forma mais regular. Estes resultados são importantes para melhorar o nosso conhecimento da história natural das espécies superabundantes e para programas de conservação em paisagens fragmentadas. Projetos de gestão que visem melhorar a qualidade dos remanescentes devem procurar manter os fragmentos com formas mais regulares e as matrizes agrícolas perto deles deve ser arbustivas ou arbóreas. / Forest fragmentation and anthropogenic land uses may act as invasion facilitators of alien plant species. However, little attention has been given to the expansion of native species that become locally overabundant. These overabundant species could negatively affect others native species, causing local extinctions, but the effects and causes of the native overabundance species are poorly understood. Therefore, this study aims to investigate whether landscape characteristics, such as urbanization, land-cover attributes, proximity index, and mean shape complexity, influence the abundance and coverage of two overabundant bamboo species. The study was conducted in 15 forest fragments around Alfenas, Minas Gerais, southeastern Brazil. We calculated composition and configuration parameters at three buffer distances (600 m, 800 m and 1000 m). Bamboo density and coverage in each fragment were quantified for 30 circular plots (2 m radius): 15 from the edge (0 m) and 15 within the interior (50 m) of the fragment. Both bamboos are forest species that are sensitive to light variations. We found that the abundance of Paradiolyra micrantha and Merostachys sp. increases with distance from roads and cities in moderately disturbed habitats, characterized by having a more irregular fragment shape and the proximity of open matrix types near the fragments. However, it was observed that the bamboo species did not respond similarly to invasive species, and where favored only in areas of moderate disturbance, which forest fragments are far from cities and roads, surrounded by a higher proportion of agricultural matrices like coffee and sugarcane, low percentage of pasture, and also when fragments have a more regular shape. These results are important to improve our knowledge of the natural history of overabundant plant species and for fragmented landscape conservation programs. Management projects to improve the quality of remnants should aim to maintain more regular fragment shapes and the agricultural matrices near them should be shrub or tree based. / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - FAPEMIG
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As influências da paisagem urbana em grupos funcionais e riqueza de aves /

Aguiar, Albert Gallon de January 2015 (has links)
Orientador: Wagner Andre Pedro / Banca: Augusto João Piratelli / Banca: Denise de Cerqueira Rossa-Feres / Resumo: Paisagens urbanas suportam padrões macroecológicos, como as relações de espécie e área, abundância e biomassa. Por este motivo, as cidades têm um importante papel na preservação da biodiversidade global. Para o grupo das aves, 20% das espécies ocorrem em centros urbanos pelo mundo. No entanto, o processo de crescimento da urbanização promove profundos efeitos na diversidade de aves, podendo ser negativos para espécies não tolerantes a ambientes urbanos, ou positivos para aquelas que se adaptam bem. Esta dissertação é dividida em dois estudos, no primeiro buscou-se identificar as conclusões científicas atuais sobre os efeitos da paisagem em comunidades urbanas de aves. Para tanto, e por meio de uma análise sistemática da literatura, foram analisadas as publicações científicas tratando da ecologia de aves em ambientes urbanizados, na perspectiva da escala da paisagem. Mais de mil artigos foram encontrados referenciando aves em paisagens urbanas, e destes, apenas um décimo mediu esta relação de forma objetiva por meio de métricas de análise da paisagem. De todas as publicações revisadas, 65% fizeram análises da paisagem em apenas uma escala. A maior parte dos estudos teve como objetivo a conservação da biodiversidade no processo de urbanização em países ricos, os países em desenvolvimento, que mais transformam a paisagem pelo crescimento urbano, são geralmente negligenciados. A riqueza de espécies foi a variável resposta mais comum e 20% dos estudos utilizaram algum tipo de dado funcional sobre as espécies avaliadas. As conclusões deste estudo sugerem que as publicações buscando a compreensão dos efeitos da urbanização têm focado, em sua maioria, em estudos apenas na escala do fragmento. Seguindo as conclusões da análise sistemática da literatura, o segundo estudo desta dissertação testou a hipótese da quantidade de habitat remanescente... / Abstract: Urbanized landscapes support classical macroecological patterns as specie-area relationship, abundance and biomass. Cities play an important role in the conservation of global biodiversity for those reasons. For birds, 20% of the total species occur in urban centers worldwide. Nonetheless, the growth urbanization process promotes profound effects on bird diversity, negative for non-urban species and positive for urban-tolerant. This study aimed to identify the scientific conclusions presented up to date on landscape effects on urban bird communities. We applied a systematic review, searching for scientific publications regarding bird ecology in urban environment from the landscape scale perspective. More than a thousand articles were found referring to birds in urban landscapes. However, just a tenth of them applied landscape metrics to understand the relationships between birds and urban landscapes. The single-scale approach was the option adopted by 65% of all publications. Most of the studies aimed a biodiversity conservation view of the urbanization process using bird communities in high-incoming areas. Developing countries are usually neglected by those studies, though currently they promote higher urban landscape transformation. Bird richness was the most common response variable, whereas just 20% of the studies considered functional data for species. Our conclusions in this work suggest that research efforts to understand urbanization effects on biodiversity have focused mostly at the patch scale only. Following the systematic review conclusions, we produced a second study to test the habitat amount hypothesis, verifying the relationship between avian community and urban areas, and to test whether patch or landscape scale would better explain the biodiversity. The results disagree with the habitat amount hypothesis and suggest that in urban landscapes the size of the native vegetation patches are more important than forest areas... / Mestre
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Composição, riqueza e abundância de anfíbios e répteis no Alto e Médio Paranapanema, estado de São Paulo. / Composition, species richness and abundance of amphibians and reptiles in the Upper and Middle Paranapanema, São Paulo state, Brazil.

Araujo, Cybele de Oliveira 04 April 2012 (has links)
O objetivo deste estudo foi coletar e reunir informações sobre a diversidade de anfíbios e répteis nas bacias hidrográficas do Alto e Médio Paranapanema, estado de São Paulo e avaliar os impactos que o pastoreio de gado pode provocar na riqueza e abundância de anuros e lagartos de formações abertas de Cerrado. A riqueza de anuros registrada no Alto Paranapanema é muito superior a encontrada no Médio Paranapanema, existindo um gradiente decrescente na riqueza de espécies partindo da porção sul e sudeste do Alto Paranapanema, onde predominam a floresta ombrófila, em direção ao Médio Paranapanema que apresenta formações de Cerrado e floresta estacional. O pastoreio de gado não causou efeitos negativos na riqueza e abundância total dos anuros e lagartos amostrados. É possível que a intensidade de pastoreio ocorrida nestas formações não foi suficiente para promover modificações consideráveis na estrutura das fitofisionomias, o que pode ter minimizado alterações nos nichos ecológicos das espécies. / The aim of this study is to collect information on the diversity of amphibians and reptiles in the hydrographic basins of the Upper and Middle Paranapanema, São Paulo state and assess the impact that cattle grazing can provoke on the species richness and abundance of anurans and lizards of open Cerrado formations. The species richness of anurans reported in the Upper Paranapanema is far greater to that found in the Middle Paranapanema, with a decreasing gradient in the richness from the southern and southeastern portion of Upper Paranapanema, where the ombrophilous forest predominates, towards the Middle Paranapanema in which Cerrado formations and seasonal forests are dominant. Cattle grazing did not cause negative effects on the species richness and total abundance of the anurans and lizards sampled. It is possible that the intensity of grazing was insufficient to cause significant changes in the structure of the phytophysiognomies, which could have minimized alterations in the ecological niches of the species.
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Estrutura da comunidade de anfíbios da região de Bauru, SP

Rolim, Daniel Contieri [UNESP] 15 March 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:34Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-03-15Bitstream added on 2014-08-13T18:01:14Z : No. of bitstreams: 1 000734591_20160315.pdf: 127535 bytes, checksum: a1782b80512836097cf9680fcc2f00c3 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-03-15T12:06:56Z: 000734591_20160315.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-15T12:07:33Z : No. of bitstreams: 1 000734591.pdf: 12563553 bytes, checksum: 66a404ef9ee14c6279d474e173d6f5e5 (MD5) / Estudos sobre a ecologia de comunidades e identificação de padrões de distribuição de anfíbios são de suma importância para conservação de espécies. Foi realizado o inventário da anurofauna da região de Bauru, caracterizando os padrões de distribuição geográfica em âmbito regional e estadual das espécies registradas, bem como foi analisado a ecologia e a plasticidade na ocupação do hábitat destas espécies. A hipótese deste trabalho é que a composição e a estrutura da comunidade de anfíbios da região apresentam características próprias, associadas às variáveis ambientais e aos aspectos físico-estruturais, diferindo de outras comunidades, inclusive de regiões próximas. O estudo foi desenvolvido entre 2009 e 2012. Foram registradas 37 espécies, as quais representam 15,61 % dos anfíbios do Estado de São Paulo. Dentre as espécies registradas, uma é endêmica do estado, Scinax hiemalis. As espécies com maior abundância no estudo foram Dendropsophus minutus, D. nanus, Hypsiboas albopunctatus, H. caingua, Scinax fuscomarginatus, S. fuscovarius, Physalaemus cuvieri e Leptodactylus podicipinus, que representam 72,2% do total de indivíduos registrados. O pico de atividade de vocalização dos anuros ficou concentrado durante a estação chuvosa. Entre os ambientes ocupados pelos anuros, durante o período reprodutivo, na região, apenas quatro espécies foram exclusivas de corpos d’água no interior de mata: H. lundii, S. hiemalis, C. caramaschii e L. mystaceus. As demais ficaram divididas entre aquelas que utilizaram exclusivamente, corpos d’água em área aberta (44,5%) e espécies que utilizaram corpos d’água tanto no interior de mata como em área aberta (44,5%). Houve um predomínio de espécies que apresentam distribuição na região centro-oeste do estado, com 16 espécies. Doze espécies possuem ocorrência em todo estado, oito apresentam ocorrência na região centro-leste e apenas ... / Studies about the ecology of communities and identification of amphibians distribution patterns are extremely important for species conservation. Was realized an anurofauna inventory in the region of Bauru, characterizing the geographic distribution patterns at the regional and state levels of the recorded species, as well as discussed the ecology and habitat occupation and plasticity on these species. The hypothesis is that the composition and amphibians community structure on that region has specific characteristics, associated with environmental variables and physical-structural aspects, differing from other communities, including nearby regions. The study was conducted between 2009 and 2012. Were recorded 37 species, which represent 15.61% of the amphibians at São Paulo state. Among the species reported, one is state endemic, Scinax hiemalis. The species with the highest abundance in the study were Dendropsophus minutus, D. nanus, Hypsiboas albopunctatus, H. caingua, Scinax fuscomarginatus, S. fuscovarius, and Leptodactylus podicipinus Physalaemus cuvieri, representing 72.2% of all individuals recorded. The peak in of anurans activity calling was concentrated during the rainy season. Between the occupied environments by anurans during the reproductive period in the region, only four species were exclusive of water bodies inside the forest: H. lundii, S. hiemalis, C. caramaschii and L. mystaceus. The others were divided into those who used exclusively water bodies in open area ...
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Viabilidade de embriões de piracanjuba (Brycon orbignyanus) submetidos a diferentes protocolos de resfriamento

Paes, Maria do Carmo Faria [UNESP] 28 February 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:29Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-28Bitstream added on 2014-06-13T20:40:28Z : No. of bitstreams: 1 paes_mcf_dr_jabo.pdf: 652606 bytes, checksum: 36fc9416b423c16aa4b65e4486ef48e2 (MD5) / O gênero Brycon tem despertado grande interesse nas instituições de pesquisa, não só pela excelente qualidade e sabor da carne, mas também por características adequadas à pesca esportiva, rápido crescimento e ganho de peso. A piracanjuba tem sofrido drástica redução dos estoques em decorrência da ação antrópica estando na lista do IBAMA de espécies ameaçadas de extinção. A criopreservação de gametas e embriões de espécies migradoras e espécies raras surge como uma alternativa para a reprodução, repovoamento, criação de banco genético, transporte e possível obtenção de larvas ao longo do ano. Assim, este trabalho teve por objetivo ampliar os conhecimentos de criogenia utilizando embriões de piracanjuba (Brycon orbignyanus), com o intuito de estabelecer um protocolo de resfriamento para ser utilizado em projetos de reprodução e conservação desta espécie. Após a obtenção dos embriões por meio de reprodução induzida, estes, quando na fase de fechamento do blastóporo, foram contados e subdivididos em parcelas, considerando como unidade experimental um tubo (vacutainer) contendo 100 embriões. Cada tratamento teve oito repetições. Com exceção dos grupos controles, os demais tratamentos foram submetidos a diferentes combinações e concentrações de crioprotetores (sacarose, metanol, etilenoglicol e DMSO), diferentes temperaturas (0,0±2,0°C e 8,0±2,0ºC) e tempos de estocagem em refrigerador (6h, 10h, 24h, 72h, 168h). Transcorridos os tempos de estocagem, os embriões foram aclimatados, rehidratados e transferidos para incubadoras para monitoramento do desenvolvimento e aferições das taxas de eclosão, sobrevivência e deformidade. Para avaliar o desenvolvimento de tecidos e células após a realização do experimento, amostras foram fixadas, observadas em estereomicroscópio e... / The genus Brycon have aroused great interest of research institutions, not only for the excellent quality and flavor of the meat, but also for characteristics suited to sport fishing, quick growth and weight gain. Piracanjuba suffers drastic reduction in natural environment as a result of human action and is in the list of endangered species of IBAMA. The cryopreservation of gametes and embryos of migratory and rare species is an alternative to reproduction, repopulation, creating genetic database, transport of larvae and obtainment of larvae throughout the year. The aim of this study is expand the knowledge of cryogenics using embryos of piracanjuba (Brycon orbignyanus) and establishing a cooling protocol to be used in projects of reproduction and conservation of this species. After obtaining embryos from induced reproduction, those ones that were in this phase of blastopore closuring, were colected, counted and divided into groups, considering as experimental unit each tube (vacutainer) containing 100 embryos. Each treatment had eight replications. Except for the control groups, the other treatments were subjected to different combinations and concentrations of cryoprotectants (sucrose, methanol, ethylene glycol and DMSO), different temperatures (0,0 ± 2,0ºC and 8,0 ± 2,0°C) and storage time on refrigerator (6h, 10h, 24h, 72h, 168h). Elapsed times of storage, the embryos were acclimated, washed and transferred to incubators for monitoring the development of measurements and hatching rates, survival and deformity. To evaluate the development of tissues and structures after the experiment, samples were put on fixative solution and observed under stereomicroscope, and after that were processed and analyzed by light microscopy and transmission electron microscopy. It was observed that... (Complete abstract click electronic access below)

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