Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 2007. / Vita. Includes bibliographical references (leaves 89-100).

Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 1998. / Vita. Includes bibliographical references (leaves [64]-73).

Thesis (Ph. D.)--University of Missouri--Columbia, 1996. / Typescript. Vita. Includes bibliographical references (leaves: 196-206). Also available on the Internet.

Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 2000. / Vita. Includes bibliographical references (leaves 135-155).

Thesis (Ph. D.)--Brandeis University, 2010. / "UMI:3390510." MICROFILM COPY ALSO AVAILABLE IN THE UNIVERSITY ARCHIVES. Includes bibliographical references.

No description available.

Les complexes histones méthyltransférases SET1, hautement conservés de la levure aux mammifères, sont ciblés aux régions promotrices par la protéine CFP1/CXXC, résultant en l’implémentation de la méthylation de la lysine 4 de l’histone H3 (H3K4me), modification post-traductionnelle influençant l’expression des gènes selon le contexte chromatinien. La présence de plusieurs complexes SET1 distincts dans différents systèmes modèles eucaryotes a compliqué l’étude de leurs fonctions dans un contexte développemental. Caenorhabditis elegans contient une seule protéine homologue de SET1, SET-2, et d’uniques homologues des autres sous-unités du complexe, RBBP5, ASH2, WDR5, DPY30 et CFP1. Cependant, la composition biochimique du complexe n’a pas été décrite. En couplant des expériences de co-immunoprécipitation avec des analyses de spectrométrie de masse, j’ai identifié le complexe SET-2/SET1 dans les embryons de C. elegans. D’autre part, j’ai montré que le complexe SET-2/SET1 co-immunoprécipite aussi un autre complexe conservé modifiant la chromatine et j’ai mis en évidence les interactions mises en jeu entre ces deux complexes. Mon analyse génétique a démontré que les mutants de perte de fonction des sous-unités des deux complexes partagent des phénotypes communs, en cohérence avec des fonctions développementales communes. Le laboratoire a également entrepris des expériences de transcriptomique et d’immunoprécipitation de la chromatine montrant un nouveau rôle de CFP-1 dans le recrutement de ce complexe au niveau de sites spécifiques de la chromatine. / The highly conserved SET1 family complexes are targeted by CFP1/CXXC protein to promoter regions through multivalent interactions to implement methylation of histone H3 Ly4 (H3K4me), a modification that correlates with gene expression depending on the chromatin context. The presence of distinct SET1 complexes in multiple eukaryotic model systems has hampered studies aimed at identifying the complete array of functions of SET1/MLL regulatory networks in a developmental context. Caenorhabditis elegans contains one SET1 protein, SET-2, one MLL-like protein, SET-16, and single homologs of RBBP5, ASH2, WDR5, DPY30 and CFP1. The biochemical composition of the complex however, has not been described. Through the use of co-immunoprecipitation coupled to mass spectrometry-based proteomics, I identified the SET-2/SET1 complex in C. elegans embryos. Most importantly, I showed that the SET-2/SET1 complex also co-immunoprecipitates another conserved chromatin-modifying complex and I highlighted the interactions involved between these two complexes. My genetic analysis revealed that loss of function mutants of the two complex subunits share common phenotypes, consistent with common developmental functions. The laboratory has also undertaken transcriptomic and chromatin immunoprecipitation experiments showing that CFP-1 has a role in the binding of this complex at specific chromatin regions.

Un nouveau gène de la longévité ouvre de nouvelles pistes pour vieillir mieux. L'accroissement de la longévité induit par la suppression des tissus reproducteurs a été observé chez la drosophile et chez le ver. Chez ce dernier, l'opération lui donne 60% de vie en plus et lui permet un vieillissement harmonieux et en bonne santé. Les mécanismes moléculaires qui induisent cette réponse font l'objet d'intenses recherches. Certains gènes étaient déjà connus pour être associés à l'accroissement de la longévité des vers sans lignée germinale, et nous avons démontré l'existence d'une nouvelle voie impliquant le récepteur nucléaire NHR-80. Les nématodes dépourvus de lignée germinale et dont nhr-80 est muté ne voient pas leur longévité augmenter. En outre, la surexpression du gène allonge davantage leur durée de vie: elle est 150% plus longue que celle de leurs congénères sauvages. Cela démontre l'importance de ce récepteur nucléaire dont l'activation par une hormone encore inconnue enclenche l'expression ou la mise sous silence de centaines d'autres gènes. Notamment, nous avons montré que l'une des cibles de NHR-80, l'enzyme FAT-6 qui transforme l'acide stéarique en acide oléique est fondamentale, puisque les vers dépourvus de lignée germinale ne présentent plus aucun gain en longévité en l'absence de FAT-6. À terme, nous espérons pouvoir récapituler les effets de l'ablation de la lignée germinale chez un organisme fertile, c'est à dire, d'induire les réarrangements métaboliques qui ont lieu suite à cette opération afin d'en tirer les effets positifs sur la santé, sans affecter la reproduction. / Discovery of a key longevity gene opens new perspectives for healthy aging.Increased longevity induced by reproductive tissues removal (germline ablation) is observed in the fly Drosophila melanogaster and in the worm Caenorhabditis elegans. In the latter, the operation increases lifespan by 60%, and enables the nematode to age harmoniously and in good health. The molecular mechanisms that induce this response are subject of intensive research. Our study reveals the existence of a new powerful longevity gene, nhr-80, which mediates this longevity effect. We have shown that inactivation of nhr-80 prevents lifespan increase. Furthermore, nhr-80 overexpression lengthens the nematodes' lifespan by 150%! nhr-80 encodes a nuclear receptor, which activation by a still unknown hormone controls the expression of hundreds of other genes. We showed that one of the critical NHR-80 targets, the enzyme FAT-6, which transforms stearic acid into oleic acid, is necessary to prolong lifespan since a mutation of the fat-6 gene suppresses the effects of germline ablation on longevity. The next step will be to determine how an increase in the level of oleic acid induces an adaptive response resulting in increased longevity. This research may lead to the exciting possibility of recapitulating the benefits of germline ablation in fertile animals; in other words, to activate the longevity effects normally triggered by germline ablation in order to fight, in one go, a host of diseases associated with aging, without affecting reproduction.

No description available.

No description available.