Submitted by Alexandre Sousa (alexandre.sousa@incqs.fiocruz.br) on 2015-02-09T12:08:56Z No. of bitstreams: 1 Mestrado_Jorge_Possas.pdf: 2405516 bytes, checksum: 670ec740bf14634ac4f95c8209ae9eb6 (MD5) / Approved for entry into archive by Alexandre Sousa (alexandre.sousa@incqs.fiocruz.br) on 2015-02-09T12:09:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Mestrado_Jorge_Possas.pdf: 2405516 bytes, checksum: 670ec740bf14634ac4f95c8209ae9eb6 (MD5) / Approved for entry into archive by Alexandre Sousa (alexandre.sousa@incqs.fiocruz.br) on 2015-02-09T12:09:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Mestrado_Jorge_Possas.pdf: 2405516 bytes, checksum: 670ec740bf14634ac4f95c8209ae9eb6 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-09T12:09:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mestrado_Jorge_Possas.pdf: 2405516 bytes, checksum: 670ec740bf14634ac4f95c8209ae9eb6 (MD5) Previous issue date: 2014 / Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / A abordagem do conceito do Erro Total é ferramenta para efetuar validações que apresenta desempenho superior à abordagem clássica, que avalia os componentes de veracidade e precisão isoladamente, e é capaz de identificar deficiências na Exatidão de um modelo de cálculos de resultados de um imunoensaio. O uso do conceito do Erro Total em validação de métodos analíticos é abordagem que incorpora a expressão da soma da veracidade e da precisão. Esse método utiliza ainda os Perfis de Exatidão baseados em intervalos de tolerância (ou intervalos de predição) para decidir se um modelo de calibração dará resultados de qualidade e prevê o controle do risco de aceitar uma metodologia imprópria. Com a finalidade de avaliar o uso dessas ferramentas para: a) decidir qual o modelo de cálculo de curva de calibração de maior exatidão; b) documentar a validação de imunoensaios, foram aplicados o Conceito do Erro Total, os perfis de Exatidão e os Índices de Exatidão no estudo de validação em uso de um ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay) para determinar o teor de ovoalbumina em vacinas, fortificando-se as vacinas com três concentrações de ovoalbumina em relação à concentração existente na vacina (5,0μg/0,5mL) na faixa 25 a 300%, testadas em relação à vacina pura. O Estudo de validação em uso demonstrou que, quando utilizado ométodo de cálculo de curva logística de 5 parâmetros, os resultados mostraram-se mais exatos em relação aos outros dois modelos testados. O ensaio apresenta exatidão, precisão, linearidade e veracidade em conformidade ao intervalo de concentrações estudado, e mostrou ser um ensaio confiável para avaliar o teor de ovalbumina. / The Total Error approach is a validation tool that shows superior performance, when compared to the classical analysis, which assesses the trueness and precision components separately, and it is qualified to identify the deficiencies in the accuracy of an immunoassay. The use of the Total Error approachfor validating of analytical methods incorporates the expression of the sum of trueness and precision. This analysis also uses the Accuracy Profiles based on tolerance intervals (or prediction intervals) to determine whether a calibration modelwill provide quality results and to predict the control of risk in accepting an inadequate methodology. In order to evaluate the use of the Total Error, the Accuracy Profiles and the Accuracy Index approaches for validating immunoassays, these tools were used in the in use study of validation of an ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay) for determining the ovalbumin contents in vaccines. It covered the range of 25-300% of a concentration existent on the vaccine (5.0 ug/mL) in relation to the pure vaccine. The in use study validation showed that, by using the five parameters logistic curve for calculating results, this assay demonstrates complying accuracy, precision, linearity and accuracy in the concentration range of 1.25-300μg/0,5mL; and it is a reliable methodology to assess the ovalbumin contents.

O serviço veterinário oficial é responsável por proteger a saúde pública e animal. Uma ferramenta que auxilia na busca desse objetivo é a análise de risco, que começou a ser utilizada na década de 1990 pelos serviços veterinários oficiais. Para a realização de uma análise de risco, inicialmente deve-se identificar o perigo, o qual na área da saúde animal, geralmente, é o agente patogênico causador de uma doença. A etapa subsequente é a avaliação de riscos, na qual devem ser ponderadas, com suporte de técnicas específicas, as formas de ocorrência do perigo, bem como a magnitude de suas consequências. Entre as técnicas utilizadas nessa etapa, a análise de decisão por múltiplos critérios tem tido um crescente uso. Essa metodologia consegue associar e analisar, conjuntamente, diversas variáveis e, quando integrada ao sistema de informação geográfica, incorpora a dimensão espacial, tornando a ferramenta mais potente. A terceira etapa da análise de risco refere-se ao manejo dos riscos, que visa a propor medidas que mitiguem o risco, bem como avaliar o custo/benefício de cada medida. A última fase é a comunicação dos riscos, que deve ser iniciada juntamente com a análise de risco em si, deixando aberto um canal permanente de comunicação com todos os atores sociais interessados no estudo. O presente trabalho, inicialmente, realizou uma revisão da literatura sobre análise de risco, objetivando expor sua definição e processo de elaboração, assim como verificar como ela está sendo utilizada, quais são as limitações e os desafios do uso dessa ferramenta pelo serviço veterinário oficial brasileiro. Posteriormente, realizou-se uma avaliação de riscos para determinar as áreas de risco para a ocorrência de febre aftosa no Rio Grande do Sul e, ainda, avaliar o desempenho do sistema de vigilância estadual para essa enfermidade. Como resultado, verificou-se que os desafios para o desenvolvimento de uma análise de risco pelo serviço veterinário oficial brasileiro ainda são grandes, destacando-se aqueles relacionados à falta de dados e de pessoal capacitado, o que, por sua vez, pode estar relacionado com a realização de poucas análises de risco no Brasil. Na avaliação de riscos realizada pela técnica de múltiplos critérios, identificou-se que as regiões de fronteira internacional, além da região de Estrela, foram aquelas que apresentaram as áreas de maior risco de ocorrência da febre aftosa no estado do Rio Grande do Sul. As variáveis “proximidade da fronteira internacional”, “densidade de ruminantes” e “densidade de propriedades com suínos de subsistência” foram as que mais influenciaram no modelo. A “presença da unidade veterinária local no município” e a “quantidade de notificações de suspeita de enfermidade animal” foram as variáveis de maior relevância no indicador criado para avaliar o desempenho do sistema de vigilância. As regiões sudeste e sudoeste apresentaram os melhores desempenhos quando comparados com outras regiões do estado. A avaliação de riscos tornou-se um importante instrumento utilizado pelos gestores dos serviços veterinários oficiais na tomada de decisões, contribuindo para a escolha de alternativas que confiram, cientificamente, o menor risco sanitário. Com base neste estudo, os gestores gaúchos poderão escolher as ações sanitárias específicas para cada região do Rio Grande do Sul, servindo, portanto, como uma ferramenta de auxílio, a fim de mitigar o risco de ocorrência da febre aftosa. / As the main responsibility of the Official Veterinary Service is protecting animal and public health, an important tool to achieve this goals is the risk analysis, which began to be used in the 1990s. In order to conduct a risk analysis, it is initially necessary to identify the hazard, which in animal health is generally the pathogen causing a disease. The next step is risk assessment, which consists in evaluating different forms where hazard occurs as well as the magnitude of its consequences. Among various techniques that could be employed in this stage, the multiple criteria decision analysis has been increasingly used nowadays. This methodology associates and analyses jointly many variables and, when integrated with geographic information system, incorporates the spatial dimension, making it a powerful tool. The third risk analysis step refers to risk management, which aims to propose measures to mitigate the risk and assess costs and benefits of each measure. The communication of the risk is the last stage. It should be initiated along with the risk analysis itself, allowing an open and permanent communication with all interested stakeholders in the study. This work commenced with a literature review of risk analysis, so as to expose its definition and development process, as well as checking how it is being used, what limitations exist and the challenges of this tool usage by the Brazilian Official Veterinary Service. Subsequently, there was conducted a risk assessment to determine the risk areas for Foot and Mouth Disease occurrence in Rio Grande do Sul and also evaluate the State performance on surveillance system for this disease. As a result, the challenges for a development of a risk analysis by the Brazilian Official Veterinary Service are still found large, especially those related to the lack of data and trained personnel, resulting in a small number of this type of studies in Brazil. In this risk assessment study it was observed that international border areas, in addition to Estrela/RS region, were the ones which presented the greatest risk of Foot and Mouth Disease occurrence. The most important variables in the model were “international border proximity”, “ruminant density” and “pig farming properties density”. The “presence of a local veterinary unit in the city” and “the amount of suspected animal disease notifications” were the most relevant variables in the indicator created to evaluate the surveillance system performance. The Southeast and Southwest mesoregions showed the best results when compared with other mesoregions of the State. The risk assessment has become an important tool utilized by Official Veterinary Service managers in decision-making, owing to its scientifically proved contribution, which results in a better sanitary risk judgment by them. Based on this study, local managers can select specific animal health actions for each Rio Grande do Sul mesoregion, providing a supportive tool in order to mitigate the risk of Foot and Mouth occurrence.

A febre aftosa é causada por um vírus do gênero Aphtovirus, cujas proteínas não estruturais (PNE) estão relacionadas diretamente a replicação viral e são comuns a todos os sorotipos e, portanto, são mais adequadas à pesquisa de anticorpos contra este vírus. Métodos de diagnóstico capazes de diferenciar animais infectados de vacinados aliados ao uso de vacinas purificadas quanto à PNE são imprescindíveis na estratégia para comprovação de ausência de transmissão viral. Através da Instrução Normativa nº 50/2008, o Brasil passou a realizar o controle oficial da pureza nas vacinas contra a febre aftosa. O objetivo deste trabalho foi avaliar se as chances de encontrar bovinos reativos aos testes sorológicos serão maiores antes da implantação do controle oficial, tanto nos resultados do controle oficial das vacinas, quanto nos inquéritos. Para isto, foram utilizados modelos de regressão logística com efeitos aleatórios, interações e controle de possíveis confundidores. Os resultados demonstraram que no realizado em laboratório oficial em 1016 partidas de vacinas, observou-se que a chance de ocorrência de resultados reativos antes da implantação da norma utilizando o método de triagem ELISA 3ABC NCPanaftosa foi 2,86 (IC95%,1,92-4,14) vezes a chance de ocorrência nos testes de vacina feitos após a norma, utilizando-se o mesmo método de triagem. Já a chance de resultados reativos antes da norma, utilizando-se o método NCPanaftosa, foi 19,70 (IC 95%,8,55- 45,37) vezes a chance de ocorrência após a norma com o uso do método PrioCHECK como triagem Já, a partir da comparação entre inquéritos soroepidemiológicos, foi possível observar que antes da implantação da IN50/2008 a chance de ocorrência de resultados reativos em bovinos que receberam uma dose de vacina foi 2,22 (IC 95%, 1,22-4,06) vezes a chance da ocorrência em bovinos não vacinados. Já, a chance de ocorrência de resultados reativos em bovinos que receberam duas ou três vacinas foi 5,94 (IC 95%, 3,25-10,87) vezes a de bovinos não vacinados. Nas estimativas modeladas para os inquéritos soroepidemiológicos realizados após a implantação da norma, independentemente do método de triagem utilizado, não houve associação significativa entre diferentes doses de vacinas e a ocorrência de animais reativos. Os resultados obtidos sugerem que há uma associação do controle oficial com a melhoria da produção de vacinas no que diz respeito a purificação do antígeno, assim como, indicam que a melhoria na pureza está associada à diminuição na chance de ocorrência de bovinos reativos em inquéritos soroepidemiológicos, ou seja, redução nos falso-positivos a campo. / Foot and mouth disease (FMD) is a highly contagious disease caused by an Aphtovirus. Non-structural proteins (NSP) of this virus are directly related to viral replication and are common to all serotypes. Therefore, are more suitable for antibodies-based serological diagnosis. Diagnostic methods capable of differentiating infected from vaccinated animals (DIVA) are important surveillance tools; however, strategies should be in step with the development of vaccines. Since January 2009, the Brazilian government has been conducting an official control to evaluate NSP purity in vaccines production through the Normative Instruction No. 50 from 2008. This paper evaluates the situation of the vaccines produced in Brazil regarding NSP purification based on the results of the official control carried out by MAPA, as well as the adequacy of the surveillance system based on seroepidemiological surveys. Logistic regression with random effects, interactions and control for potential confounders were the chosen models. For the data obtained from the control of vaccines carried out in the official laboratory, the model estimated that the chance of occurrence of seroreactive results before the application of the official control using the 3ABC NCPanaftosa ELISA as screening method was 2.86 (95% CI, 1.92-4.14) times the chance of occurrence in the vaccine tests made after the standard, using the same method. The chance of seroreactive results before the official control, using the NCPanaftosa method as screening, was 19.70 (95% CI, 8.55 to 45.37) times the chance of occurrence after the official control with the use of the PrioCHECK method Comparing the seroepidemiological surveys results, the model indicated that, before the official control of vaccine purity, the chance of occurrence of reactive results in cattle receiving a single dose of vaccine was 2.22 (95% CI, 1.22 -4.06) times the chance of occurrence in unvaccinated animals. Furthermore, the chance of occurrence of reactive results in animals receiving two or three vaccines was 5.94 (95% CI, 3.25-10.87) times that of unvaccinated animals. Despite that, there was no significant difference in the estimates of the odds ratio between different doses of vaccines regardless of the screening method used for the seroepidemiological surveys performed after the official control of vaccines purity,. The present study suggests that there is an association of the implementation of Normative Instruction No. 50 from 2008 with the improvement of the NSP purity of vaccines, as well as indicates that this improvement is associated with a decrease in chance of occurrence of reactive animals in seroepidemiological surveys, i.e., reduction of false-positives in field monitoring.

Os Flavivírus são vírus de 40 50 nm de diâmetro, com formas esféricas e RNA de fita simples, com sentido positivo e aproximadamente 11 kb de comprimento. O Vírus da Febre Amarela, protótipo do grupo, é o agente causador da Febre Amarela, uma antiga doença que causou epidemias generalizadas na África, Américas do Norte e do Sul e Europa do século XVII ao início do século XX, e depois ressurgiu nas últimas décadas na África sub- saariana e América do Sul tropical. O presente trabalho busca a reconstrução da transmissão da Febre Amarela na América do Sul, no tempo e espaço, em especial, considerando a provável influência das populações humanas, primatas não humanos e mosquitos, na evolução e distribuição das linhagens genéticas de Febre Amarela, aplicando modelos de inferência Bayesiana para análises filogenéticas e filogeográficas e testando hipóteses de distribuição geográfica com modelagem de nicho ecológico. Os dados dão poucas evidências de que as estratégias de vacinação vigentes tenham efetivamente colaborado para a diminuição da ocorrência de Febre Amarela, indicando possíveis erros na estratégia de vacinação. A partir da análise Coalescente da população viral de Febre Amarela, a população viral apresentou um decréscimo importante iniciado em meados dos anos 90. A análise filogeográfica sugere um padrão geral de transmissibilidade Source-Sink destacando a região amazônica como fonte de diversidade para as outras áreas estudadas, com uma estrutura filogeográfica secundária em ondas. Assim, as introduções do vírus em áreas fora da amazônia tem ocorrência aleatória e podem ser ligadas temporalmente e geograficamente ao norte da America do Sul. Os modelos de distribuição geográfica corroboram esse padrão e indicam uma área possível para circulação da Febre Amarela ampla, englobando diversos ecótonos. Os resultados indicam um possível efeito em longo prazo da vacinação atuando diretamente sobre a evolução e dinâmica filogenética da Febre Amarela e sugere que monitorar a evolução do vírus da Febre Amarela é uma estratégia válida para compreender sua distribuição geográfica e evidenciar mecanismos complexos de transmissão e introdução. Por sua vez, os modelos de Nicho Ecológico mostraram ser ferramentas adequadas para calcular o risco da doença em determinadas áreas, sem sua ocorrência prévia, contribuindo como um modelo preditivos para orgãos de Vigilância prepararem suas estratégias de prevenção e controle no caso de possível introdução de patógenos / The flaviviruses are viruses of 40-50 nm in diameter, with spherical shaped and single-strand RNA with positive sense and approximately 11 kb in length. The Yellow Fever virus is the prototype of the group and the causative agent of Yellow Fever, a disease which caused widespread epidemics in Africa, North America, South America and Europe of the seventeenth century to the early twentieth century. The disease reemerged in recent decades in sub-Saharan Africa and tropical South America. This manuscript aims to reconstruct, in time and space, the transmission of yellow fever in South America, through the applying of a Bayesian inference model, considering the probable influence of human populations, nonhuman primates and mosquitoes on the evolution and distribution of Yellow Fever genetic lineages. Distributional pattern hypothesis will be tested by computational modeling of ecological niche. The data provide little evidence that current vaccination strategies have effectively contributed to reducing the occurrence of Yellow Fever, indicating possible errors in the vaccination strategy. From the analysis of the Yellow Fever population Coalescence, the viral population showed a significant decrease started in the mid-90s. The phylogeographic analysis suggests a general pattern of transmissibility \"Source-Sink\" highlighting the Amazon region as a source of diversity for the other areas studied, with a secondary phylogeographic wave like structure. Thus, the introductions of the virus into areas outside the Amazon has random occurrence and can be linked temporally and geographically to the north of South America The geographical distribution models corroborate this pattern and indicate a broad possible area for Yellow Fever circulation, encompassing many ecotones. The results indicate a possible long-term effect of vaccination acting directly on the evolution and phylogenetic dynamics of Yellow Fever and suggests that monitoring the evolution of the Yellow Fever virus is a valid strategy to understand the geographical distribution and highlight complex transmission mechanisms and spatial movements. In turn Ecological Niche models showed as an appropriate tool to calculate disease risk in certain areas without previous occurrence of the disease, working as a predictive model for Surveillance institutions prepare their strategies for prevention and control in the case of possible pathogen introduction

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The Brazilian spotted fever is an infectious disease transmitted by ticks to humans. The occurrence of Rickettsia rickettsii agent has been reported in Brazil since 1920 and is considered the main bacteria involved in Brazilian Spotted Fever. Since 2000, four other current species have been identified in the country, as follows: Rickettsia riphicephali, Rickettsia amblyommi, Rickettsia parkeri and Rickettsia felis. R. parkeri was first isolated in Amblyomma maculatum on the Gulf Coast of the United States in 1937, but until 2004 was considered as non-pathogenic agent, when was the first recognized case of spotted fever in humans caused by this species. Recently a new human rickettsial infection was reported to cause disease in São Paulo, being called Rickettsia parkeri Strain Atlantic Forest. This study aimed to detect and identify proteins with potential to stimulate the immune system of the host of this new strain described. Therefore, we performed total protein extraction R. parkeri Strain Atlantic Forest from infected VERO cell samples. The extracted proteins were fractionated by electrophoresis in polyacrylamide gel in the presence of sodium dodecyl sulfate (SDS-PAGE). The proteins were transferred to nitrocellulose membranes by semi-dry electrotransfer system and subjected to Western blot. Subsequently, the membrane was incubated with domestic rabbit hyperimmune serum against R. parkeri Strain Atlantic Forest (primary antibodies) followed by incubation with anti-rabbit IgG peroxidase-conjugated antibody (secondary antibody) to detect the primary antibodies bound to the proteins . Obtaining the hyperimmune rabbit serum was performed by experimental infection of R. parkeri Strain Atlantic Forest in domestic rabbit, intraperitoneally. After incubation, the disclosure of immunoreactive proteins was performed using a chromogenic substrate. 2 immunoreactants were detected proteins with more than 78 kDa (200 e 130 kDa) and 5 with less than 78 kDa. By comparing existing proteomic maps and the molecular weight of these proteins showed that, it is suggested that rOmpA (200 kDa) and rOmpB (130 kDa) are among the proteins detected and the remaining proteins found are members of the family of surface antigens cell (Sca - Surface cell antigen). However, one can not say that these proteins represent only reactive immunity to R. parkeri Strain Atlantic Forest, or that are homologous to other species. However, studies using the Modern Liquid Chromatography technique associated with mass spectrometry (LC/MS/MS) must be conducted for protein characterization. Preliminary results obtained in this study allowed further elucidation of protein profile of this agent, providing subsidies for the development of highly sensitive and specific diagnoses, as well as studies allow for the realization of a vaccine, as an alternative for the control and prevention of Brazilian Spotted Fever. / A Febre Maculosa Brasileira é uma doença infecciosa, transmitida por carrapatos ao homem. A ocorrência do agente Rickettsia rickettsii tem sido relatada no Brasil desde 1920, sendo considerada a principal bactéria envolvida na Febre Maculosa Brasileira. Desde 2000, outras quatros espécies circulantes foram identificadas no país, sendo: Rickettsia riphicephali, Rickettsia amblyommi, Rickettsia parkeri e Rickettsia felis. R. parkeri foi isolada pela primeira vez em Amblyomma maculatum, na Costa do Golfo dos Estados Unidos da América em 1937, porém até 2004 era considerada como agente não patogênico, quando então houve o primeiro caso reconhecido de Febre Maculosa em humanos ocasionado por essa espécie. Uma nova riquetsiose humana foi descrita como causadora da doença no Estado de São Paulo, sendo denominada de Rickettsia parkeri cepa Mata Atlântica. O presente trabalho teve como objetivo detectar e identificar proteínas com potencial de estimular o sistema imune do hospedeiro desta nova cepa descrita. Para tanto, foi realizado a extração proteica total de R. parkeri cepa Mata Atlântica a partir de amostras de células VERO infectadas. As proteínas extraídas foram fracionadas por eletroforese em gel de poliacrilamida na presença de dodecil-sulfato de sódio (SDS-PAGE). Estas proteínas foram transferidas para membranas de nitrocelulose através do sistema semi-seco de eletrotransferência e submetidas à técnica de Western blot. Posteriormente, a membrana foi incubada com soro hiperimune de coelho doméstico contra R. parkeri cepa Mata Atlântica (anticorpos primários), seguido de incubação com anticorpo anti-IgG de coelho conjugado com peroxidase (anticorpo secundário), para detectar os anticorpos primários ligados às proteínas. A obtenção do soro de coelho hiperimune foi realizada através da infecção experimental de R. parkeri cepa Mata Atlântica em um coelho doméstico, via intraperitoneal. A revelação das proteínas imunorreativas foi efetuada através de substrato cromogênico. Foram detectadas 2 proteínas imunorreagentes com mais de 78 kDa (200 e 130 kDa ) e 5 com menos de 78 kDa. Através da comparação de mapas proteômicos existentes e pelo peso molecular que estas proteínas apresentaram, sugere-se que rOmpA (200 kDa) e rOmpB (130 kDa) estejam entre as proteínas detectadas e as demais proteínas encontradas, sejam membros da família de antígenos de superfície celular (Sca Surface cella ntigen). No entanto, não se pode afirmar que estas proteínas apresentam imunidade reativa única para R. parkeri cepa Mata Atlântica, ou se são homólogas a outras espécies de riquetsias. Contudo, estudos empregando a técnica de Cromatografia Líquida Moderna associada a Espectrometria de Massas (LC/MS/MS) deverão ser conduzidos para a caracterização proteica. Os resultados preliminares obtidos neste estudo permitiram maior elucidação do perfil proteico deste agente, fornecendo assim subsídios para o desenvolvimento de diagnósticos altamente sensíveis e específicos, bem como permitir estudos para a realização de uma vacina, como alternativa para o controle e prevenção da Febre Maculosa Brasileira.

The recent and human caused environmental changes interfered with the evolutionary interactions between parasites and hosts. These changes accidentally benefited those few animals species, more adapted to the altered environment. However, the biodiversity of parasites was affected, and some parasitic species were benefited as well. In the case of ticks, those species which, after the changes, found abundant hosts and suitable environment were benefited. In Brazil, capybara (Hydrochaeris hydrochaeris Linnaeus 1766) and the associated ticks Amblyomma cajennense Fabricius 1787 and Amblyomma dubitatum Neumann 1899, expanded in many urban areas where they threaten human well-being and domestic animals. These ticks cause pruritic skin lesions and blood feed on their hosts moreover, they are associated, in some places, with the transmission of Spotted fever, a highly lethal disease for man. This study aimed to analyze the factors that determine the establishment and expansion of capybaras and ticks in urban areas in the city of Uberlandia, Minas Gerais State, Brazil. For this purpose in 2008 monthly direct counting of capybaras per transect in four urban areas and an ecological reserve were held and abundance and density index were calculated. Ticks were collected from the environment in the summer of 2008 using CO2 traps and flannel dragging on the same transects. It was observed that populations of capybara, in groups with number of individuals higher then those found in natural areas, were established in such places that, in addition to food and water bodies, were protected day and night surveillance. The greater abundance of ticks of the species A. cajennense and A. dubitatum was found at the site with the greatest abundance of capybaras. The results therefore indicate that beyond the minimum requirements for the establishment of capybaras such as food and water, protection from men itself, even though accidentally, is a major factor in the establishment and proliferation of capybaras in urban areas. This increase in the number of such host always implies in high environmental infestation of ticks and increased risk of bites and of pathogen transmission. Therefore, capybaras in urban areas should be considered synanthropic and effective methods of population control must be developed. / As modificações ambientais de origem antrópica beneficiaram acidentalmente alguns animais que se adaptaram a áreas modificadas. Contudo, a biodiversidade de parasitos também foi afetada com o favorecimento de algumas espécies em detrimento de outras. No caso de carrapatos foram beneficiadas aquelas espécies que encontraram hospedeiros e ambientes propícios. No Brasil capivaras (Hydrochaeris hydrochaeris Linnaeus 1766) e os carrapatos Amblyomma cajennense Fabricius 1787 e Amblyomma dubitatum Neumann 1899, se expandiram em muitas áreas urbanas onde ameaçam o bem estar humano e de animais domésticos pelas lesões cutâneas infligidas e espoliação. Além disso, estão associados, em alguns locais, á transmissão da febre maculosa, doença de elevada letalidade ao homem. Este trabalho teve por objetivo analisar os fatores que determinam o estabelecimento e expansão de capivaras e carrapatos em áreas urbanas na cidade de Uberlândia. Em 2008 realizou-se mensalmente em quatro áreas urbanas e uma reserva ecológica a contagem direta de capivaras por transectos lineares calculando-se o índice de abundância e densidade. Coletou-se carrapatos do ambiente no verão de 2008 utilizando-se armadilhas de gelo seco e arraste de flanela nos mesmos transectos. Observou-se que populações de capivara em grupos com número de indivíduos superior ao encontrado em áreas naturais se estabeleciam em locais que, além de alimentação e corpos d água eram protegidos em locais com vigilância dia e noite. A maior abundância de carrapatos das espécies A. cajennense e A. dubitatum foi encontrada no local com a maior abundância de capivaras com 79% da amostra de carrapatos coletados. Os resultados indicam, portanto, que além das exigências mínimas para estabelecimento de capivaras como alimentação e água a proteção do próprio homem é um fator primordial no estabelecimento e proliferação de capivaras em áreas urbanas. Este aumento no número de hospedeiro sempre implica em maior infestação de carrapatos e maior risco de picadas e transmissão de patógenos. Portanto, capivaras em áreas urbanas devem ser consideradas espécies sinantrópicas e métodos eficazes de controle populacional precisam ser desenvolvidos. / Mestre em Ecologia e Conservação de Recursos Naturais

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Rickettsiosis is a human disease caused by bacteria of the genus Rickettsia, and its main vector ticks (Ixodidae), which are also considered reservoirs of the Spotted Fever Group rickettsiae in Brazil. Small mammals are frequent hosts for immature stages of rickettsial diseases vector ticks, and it is known that some species of small mammals are hosts amplifiers for Rickettsia sp..The aim of this study was to determine seropositivity against five species of Rickettsia and tick fauna of small mammals captured in periurban region of Uberlândia, MG, Brazil. For this purpose, 416 small mammals representing 13 species of wild rodents and marsupials were captured between the months of July 2011 to August 2012. Of these, 48 were infested with ticks of the genus Amblyomma and Ixodes, and 70 (16.8%) of the animals were seropositive for Rickettsia spp.. Our results indicate the circulation of four species of Rickettsia, R. rickettsii, R. parkeri, R. rhipicephali and R. bellii, in the periurban area of Uberlândia. The first two Rickettsia species are considered pathogenic to man and thus a more thorough investigation to confirm the species of bacteria and epidemiological aspects related to these Rickettsia spp. is the detection locations. / Riquetsiose é uma doença causada em humanos por bactérias do gênero Rickettsia, e tem como principais vetores os carrapatos, que são considerados também reservatórios de riquétsias do grupo da febre maculosa no Brasil. Frequentemente os estágios imaturos de carrapatos vetores de riquetsioses têm pequenos mamíferos como hospedeiros, e sabe-se que algumas espécies de pequenos mamíferos são hospedeiros amplificadores para Rickettsia sp.. O objetivo deste trabalho foi determinar a sororreatividade contra cinco espécies de riquétsias e a fauna de carrapatos de pequenos mamíferos na região periurbana de Uberlândia, MG, Brasil. Foram capturados, entre julho de 2011 a agosto de 2012, 416 animais representando 13 espécies de roedores silvestres e marsupiais. Destes, 48 estavam infestados com carrapatos dos gêneros Amblyomma e Ixodes, e 70 (16,8%) dos animais foram soropositivos para Rickettsia spp.. Nossos resultados indicam a circulação de quatro espécies de riquétsias, R. rickettsii, R. parkeri, R. rhipicephali e R. bellii, próximo à área urbana do município de Uberlândia. As duas primeiras espécies são consideradas patogênicas ao homem, evidenciando a necessidade de se realizar uma investigação mais minuciosa tanto para a confirmação das espécies de bactérias circulantes, quanto para a compreensão do ambiente que mantém as riquétsias nos locais de detecção. / Mestre em Imunologia e Parasitologia Aplicadas

A febre aftosa é causada por um vírus do gênero Aphtovirus, cujas proteínas não estruturais (PNE) estão relacionadas diretamente a replicação viral e são comuns a todos os sorotipos e, portanto, são mais adequadas à pesquisa de anticorpos contra este vírus. Métodos de diagnóstico capazes de diferenciar animais infectados de vacinados aliados ao uso de vacinas purificadas quanto à PNE são imprescindíveis na estratégia para comprovação de ausência de transmissão viral. Através da Instrução Normativa nº 50/2008, o Brasil passou a realizar o controle oficial da pureza nas vacinas contra a febre aftosa. O objetivo deste trabalho foi avaliar se as chances de encontrar bovinos reativos aos testes sorológicos serão maiores antes da implantação do controle oficial, tanto nos resultados do controle oficial das vacinas, quanto nos inquéritos. Para isto, foram utilizados modelos de regressão logística com efeitos aleatórios, interações e controle de possíveis confundidores. Os resultados demonstraram que no realizado em laboratório oficial em 1016 partidas de vacinas, observou-se que a chance de ocorrência de resultados reativos antes da implantação da norma utilizando o método de triagem ELISA 3ABC NCPanaftosa foi 2,86 (IC95%,1,92-4,14) vezes a chance de ocorrência nos testes de vacina feitos após a norma, utilizando-se o mesmo método de triagem. Já a chance de resultados reativos antes da norma, utilizando-se o método NCPanaftosa, foi 19,70 (IC 95%,8,55- 45,37) vezes a chance de ocorrência após a norma com o uso do método PrioCHECK como triagem Já, a partir da comparação entre inquéritos soroepidemiológicos, foi possível observar que antes da implantação da IN50/2008 a chance de ocorrência de resultados reativos em bovinos que receberam uma dose de vacina foi 2,22 (IC 95%, 1,22-4,06) vezes a chance da ocorrência em bovinos não vacinados. Já, a chance de ocorrência de resultados reativos em bovinos que receberam duas ou três vacinas foi 5,94 (IC 95%, 3,25-10,87) vezes a de bovinos não vacinados. Nas estimativas modeladas para os inquéritos soroepidemiológicos realizados após a implantação da norma, independentemente do método de triagem utilizado, não houve associação significativa entre diferentes doses de vacinas e a ocorrência de animais reativos. Os resultados obtidos sugerem que há uma associação do controle oficial com a melhoria da produção de vacinas no que diz respeito a purificação do antígeno, assim como, indicam que a melhoria na pureza está associada à diminuição na chance de ocorrência de bovinos reativos em inquéritos soroepidemiológicos, ou seja, redução nos falso-positivos a campo. / Foot and mouth disease (FMD) is a highly contagious disease caused by an Aphtovirus. Non-structural proteins (NSP) of this virus are directly related to viral replication and are common to all serotypes. Therefore, are more suitable for antibodies-based serological diagnosis. Diagnostic methods capable of differentiating infected from vaccinated animals (DIVA) are important surveillance tools; however, strategies should be in step with the development of vaccines. Since January 2009, the Brazilian government has been conducting an official control to evaluate NSP purity in vaccines production through the Normative Instruction No. 50 from 2008. This paper evaluates the situation of the vaccines produced in Brazil regarding NSP purification based on the results of the official control carried out by MAPA, as well as the adequacy of the surveillance system based on seroepidemiological surveys. Logistic regression with random effects, interactions and control for potential confounders were the chosen models. For the data obtained from the control of vaccines carried out in the official laboratory, the model estimated that the chance of occurrence of seroreactive results before the application of the official control using the 3ABC NCPanaftosa ELISA as screening method was 2.86 (95% CI, 1.92-4.14) times the chance of occurrence in the vaccine tests made after the standard, using the same method. The chance of seroreactive results before the official control, using the NCPanaftosa method as screening, was 19.70 (95% CI, 8.55 to 45.37) times the chance of occurrence after the official control with the use of the PrioCHECK method Comparing the seroepidemiological surveys results, the model indicated that, before the official control of vaccine purity, the chance of occurrence of reactive results in cattle receiving a single dose of vaccine was 2.22 (95% CI, 1.22 -4.06) times the chance of occurrence in unvaccinated animals. Furthermore, the chance of occurrence of reactive results in animals receiving two or three vaccines was 5.94 (95% CI, 3.25-10.87) times that of unvaccinated animals. Despite that, there was no significant difference in the estimates of the odds ratio between different doses of vaccines regardless of the screening method used for the seroepidemiological surveys performed after the official control of vaccines purity,. The present study suggests that there is an association of the implementation of Normative Instruction No. 50 from 2008 with the improvement of the NSP purity of vaccines, as well as indicates that this improvement is associated with a decrease in chance of occurrence of reactive animals in seroepidemiological surveys, i.e., reduction of false-positives in field monitoring.

O serviço veterinário oficial é responsável por proteger a saúde pública e animal. Uma ferramenta que auxilia na busca desse objetivo é a análise de risco, que começou a ser utilizada na década de 1990 pelos serviços veterinários oficiais. Para a realização de uma análise de risco, inicialmente deve-se identificar o perigo, o qual na área da saúde animal, geralmente, é o agente patogênico causador de uma doença. A etapa subsequente é a avaliação de riscos, na qual devem ser ponderadas, com suporte de técnicas específicas, as formas de ocorrência do perigo, bem como a magnitude de suas consequências. Entre as técnicas utilizadas nessa etapa, a análise de decisão por múltiplos critérios tem tido um crescente uso. Essa metodologia consegue associar e analisar, conjuntamente, diversas variáveis e, quando integrada ao sistema de informação geográfica, incorpora a dimensão espacial, tornando a ferramenta mais potente. A terceira etapa da análise de risco refere-se ao manejo dos riscos, que visa a propor medidas que mitiguem o risco, bem como avaliar o custo/benefício de cada medida. A última fase é a comunicação dos riscos, que deve ser iniciada juntamente com a análise de risco em si, deixando aberto um canal permanente de comunicação com todos os atores sociais interessados no estudo. O presente trabalho, inicialmente, realizou uma revisão da literatura sobre análise de risco, objetivando expor sua definição e processo de elaboração, assim como verificar como ela está sendo utilizada, quais são as limitações e os desafios do uso dessa ferramenta pelo serviço veterinário oficial brasileiro. Posteriormente, realizou-se uma avaliação de riscos para determinar as áreas de risco para a ocorrência de febre aftosa no Rio Grande do Sul e, ainda, avaliar o desempenho do sistema de vigilância estadual para essa enfermidade. Como resultado, verificou-se que os desafios para o desenvolvimento de uma análise de risco pelo serviço veterinário oficial brasileiro ainda são grandes, destacando-se aqueles relacionados à falta de dados e de pessoal capacitado, o que, por sua vez, pode estar relacionado com a realização de poucas análises de risco no Brasil. Na avaliação de riscos realizada pela técnica de múltiplos critérios, identificou-se que as regiões de fronteira internacional, além da região de Estrela, foram aquelas que apresentaram as áreas de maior risco de ocorrência da febre aftosa no estado do Rio Grande do Sul. As variáveis “proximidade da fronteira internacional”, “densidade de ruminantes” e “densidade de propriedades com suínos de subsistência” foram as que mais influenciaram no modelo. A “presença da unidade veterinária local no município” e a “quantidade de notificações de suspeita de enfermidade animal” foram as variáveis de maior relevância no indicador criado para avaliar o desempenho do sistema de vigilância. As regiões sudeste e sudoeste apresentaram os melhores desempenhos quando comparados com outras regiões do estado. A avaliação de riscos tornou-se um importante instrumento utilizado pelos gestores dos serviços veterinários oficiais na tomada de decisões, contribuindo para a escolha de alternativas que confiram, cientificamente, o menor risco sanitário. Com base neste estudo, os gestores gaúchos poderão escolher as ações sanitárias específicas para cada região do Rio Grande do Sul, servindo, portanto, como uma ferramenta de auxílio, a fim de mitigar o risco de ocorrência da febre aftosa. / As the main responsibility of the Official Veterinary Service is protecting animal and public health, an important tool to achieve this goals is the risk analysis, which began to be used in the 1990s. In order to conduct a risk analysis, it is initially necessary to identify the hazard, which in animal health is generally the pathogen causing a disease. The next step is risk assessment, which consists in evaluating different forms where hazard occurs as well as the magnitude of its consequences. Among various techniques that could be employed in this stage, the multiple criteria decision analysis has been increasingly used nowadays. This methodology associates and analyses jointly many variables and, when integrated with geographic information system, incorporates the spatial dimension, making it a powerful tool. The third risk analysis step refers to risk management, which aims to propose measures to mitigate the risk and assess costs and benefits of each measure. The communication of the risk is the last stage. It should be initiated along with the risk analysis itself, allowing an open and permanent communication with all interested stakeholders in the study. This work commenced with a literature review of risk analysis, so as to expose its definition and development process, as well as checking how it is being used, what limitations exist and the challenges of this tool usage by the Brazilian Official Veterinary Service. Subsequently, there was conducted a risk assessment to determine the risk areas for Foot and Mouth Disease occurrence in Rio Grande do Sul and also evaluate the State performance on surveillance system for this disease. As a result, the challenges for a development of a risk analysis by the Brazilian Official Veterinary Service are still found large, especially those related to the lack of data and trained personnel, resulting in a small number of this type of studies in Brazil. In this risk assessment study it was observed that international border areas, in addition to Estrela/RS region, were the ones which presented the greatest risk of Foot and Mouth Disease occurrence. The most important variables in the model were “international border proximity”, “ruminant density” and “pig farming properties density”. The “presence of a local veterinary unit in the city” and “the amount of suspected animal disease notifications” were the most relevant variables in the indicator created to evaluate the surveillance system performance. The Southeast and Southwest mesoregions showed the best results when compared with other mesoregions of the State. The risk assessment has become an important tool utilized by Official Veterinary Service managers in decision-making, owing to its scientifically proved contribution, which results in a better sanitary risk judgment by them. Based on this study, local managers can select specific animal health actions for each Rio Grande do Sul mesoregion, providing a supportive tool in order to mitigate the risk of Foot and Mouth occurrence.

A hipótese básica do presente trabalho é que embora a ocorrência de uma determinada doença possa apresentar impactos econômicos expressivos para a pecuária de um país - onerando não apenas a atividade produtiva - alguns produtores não reconhecem, individualmente, a importância devida em adotar medidas preventivas, uma vez que a ocorrência da doença não é frequente. Ademais, a existência de externalidades faz com que a ação de um produtor em relação às medidas sanitárias de seu rebanho afete os demais produtores da mesma região, o que também pode não ser percebido por eles. Diante disso, o presente trabalho desenvolve um procedimento teórico para a análise de decisões estratégicas dos produtores quanto à prevenção contra doenças em animais, face ao risco de contaminação de seu rebanho. O desenvolvimento do modelo é baseado nos preceitos da Teoria dos Jogos, e na análise econômica de benefício/custo como suporte da tomada de decisão do produtor. Depois de modelado o problema e determinados os possíveis equilíbrios do jogo, infere-se sobre as possíveis atuações do governo, no uso de incentivos econômicos (como indenizações e multas) para que o equilíbrio seja o da prevenção. Em seguida, o modelo teórico é aplicado a um caso específico de surto de febre aftosa no Brasil. Os resultados mostram que quando não se tem um mercado diferenciado para animal não vacinado, o equilíbrio do jogo tende para a situação onde os produtores decidem vacinar seu rebanho, sugerindo que não existe a necessidade de intervenção do governo para estimular a prevenção. Na prática, no entanto, o governo brasileiro estabelece políticas de incentivo, visto que alguns produtores não vacinam seu rebanho mesmo conhecendo os riscos, o que se traduz na falta de racionalidade dos mesmos. Considerando essa irracionalidade por parte de alguns produtores, o presente estudo é importante para que estes possam delinear panoramas de decisão, de forma a identificar as melhores ações a serem tomadas de forma coletiva. / The basic hypothesis of this study is that producers do not perceive, individually, the importance of adopting prevention measures, even when aware of the economic risks for them and for the local economy, because the outbreaks of some diseases are not frequent. Moreover, the presence of externalities is such that the action of one producer regarding sanitary measures of the herd affects other producers in the same region, which also cannot be perceived by them. This study aims to develop a theoretical procedure to infer about strategic decisions taken by producers to prevent animal disease in their herds, in face of the risk of contamination. The development of the model is based on the Game Theory, and the benefit cost analysis as support for producer\'s decision. After modeling the problem and determining the equilibriums, these are used to elaborate inferences about possible actions of the government through economic incentives (such as indemnities and fines) to encourage the prevention. Then, the theoretical model is applied to a specific case of a foot-and-mouth disease (FMD) outbreak in Brazil. The results indicate that in the absence of a differential market for non-vaccinated animals, the game equilibrium tends to the situation where producer\'s decisions are to vaccinate their herd, suggesting that government intervention is not necessary. Even though, the Brazilian government uses incentive policies for the cattle vaccination since some producers do not vaccinate their animals, despite of their awareness of the risks, which suggests lack of rationality. Considering the irrationality of some producers, this study is important for them to delineate decisions scenes, identifying the best actions to be taken in the collective context.