Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina. Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia. / Made available in DSpace on 2012-10-21T08:29:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 195580.pdf: 642656 bytes, checksum: 23ca54a36dcd034d40bc7b31793b886a (MD5) / O vírus rábico pertence à Ordem Mononegavirales e Família Rhabdoviridae, sendo constituído por um RNA de sentido negativo, não-segmentado e que codifica para cinco proteínas (N, NS, M, G e L). São conhecidos até o momento 7 genótipos virais, sendo o genótipo 1 formado pelo vírus rábico clássico, com distribuição mundial. A genotipagem de amostras do vírus é realizada mais comumente pela análise dos genes da nucleoproteína e glicoproteína, embora a região não-codificante G-L tenha sido sugerida para caracterização de amostras mais homogêneas. O presente trabalho descreve a genotipagem e a análise filogenética de amostras de vírus rábico isoladas em SC durante o ano de 2002, através do seqüenciamento automatizado de produtos de RT-PCR. A extração de RNA viral, transcrição para cDNA e amplificação via RT-PCR do gene da nucleoproteína e da região não-codificante G-L, são descritas em detalhes. Os resultados demonstraram que a porção 5´ do gene da nucleoproteína é altamente conservada entre as amostras estudadas e divergentes das amostras padrão de laboratório, sendo todas classificadas como genótipo 1. A comparação da seqüência nucleotídica destas amostras com outros isolados brasileiros disponíveis no GenBank, questiona a distribuição espécie-específica, sugerida por outros autores, levantando a possibilidade de que os agrupamentos por regiões geográficas possam ser relevantes. A análise da região não-codificante G-L revelou alto grau de variabilidade entre as amostras catarinenses, possibilitando a distribuição das mesmas em dois grupos. Nenhuma destas amostras apresentou o sinal clássico de parada de transcrição na extremidade 5´ do gene da glicoproteína, relatado no modelo de pseudogene viral. Além disso, três isolados também não apresentaram este sinal na extremidade 5´ da região não-codificante G-L, sugerindo uma possível transcrição bicistrônica entre o gene da glicoproteína e a polimerase viral. Outra possibilidade é que existam novos sinais de parada de transcrição (para o gene da glicoproteína e da região não-codificante G-L) e de início de transcrição (para o gene da polimerase) ainda não descritos. A relevância destes achados é discutida em detalhes.

Made available in DSpace on 2016-01-13T13:27:04Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-04-17. Added 1 bitstream(s) on 2016-01-13T13:32:23Z : No. of bitstreams: 1 000855485.pdf: 7534024 bytes, checksum: 3199f68c4c86807d828a2b5a85013760 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Amphisbaenia é um importante grupo de amniotas reptilianos, providos de corpo cilíndrico e alongado, usualmente desprovidos de membros, com a exceção da Família Bipedidae, que apresentam os anteriores desenvolvidos. Esta anatomia facilita a vida fossorial. São alocados aos Squamata, por possuírem hemipênis, dente para romper e sair do ovo, cloaca transversal e tegumento coberto de escamas. Por assemelharem-se a lacertílios e ofídios, seu posicionamento filogenético tem sido amplamente discutido e sua ancestralidade é ainda controversa. São limitados às regiões subtropicais e tropicais, constituindo importante informação para abordagens paleoecológicas e paleobiogeográficas. Confeccionam profundos túneis compactando o solo, o que implica em grandes modificações morfológicas, tais como crânio robusto, formado por placas ósseas rígidas, e ligações interdigitais na região frontal, podendo ser sobrepostas, o que lhes confere maior resistência contra impactos na escavação. Sua anatomia é bastante convergente com aquela dos fósseis de lacertiformes mesozóicos, demonstrando um provável ancestral em comum com estes diápsidos. Um espécimen de Cryptolacerta, oriundo da Alemanha, compartilha características com Amphisbaenia. Entretanto sua filogenia ainda é incerta. De todo modo, junto com Sineoamphisbaena, pode indicar características convergentes entre lagartos laurasianos, possivelmente com aqueles que originaram Amphisbaenia. Os fósseis de anfisbênios são geograficamente restritos, predominantemente encontrados nos Estados Unidos, em quantidade relativamente escassa. A maior parte está relacionada à Família Rhineuridae, que poderia ser considerada primitiva. No entanto Bipedidae, um grupo recente, também é considerado como primitivo, devido à presença de cintura escapular e membros anteriores. Entretanto não há registros fósseis seguros, pois até então não foram encontrados restos fossilizados.. / Amphisbaenia is an important group of reptilian amniotes, provided with cylindrical and elongated body, usually limbless, with the exception of the Family Bipedidae, which presents limbs. This anatomy facilitates fossorial life. They are allocated to Squamata, by having hemipenis, tooth to break the egg, cross cloacal vent and integument covered with scales. Resembling lacertilians and snakes, their phylogenetic position has been widely discussed and their ancestry is still controversial. They are limited to subtropical and tropical regions, providing important paleoecological and paleobiogeographical informations to the group. They cave deep tunnels, compacting soil, which implies major morphological changes, such as robust skull bones, with rigid plates, and strong osteological connections in the frontal region, with superimposed bones, giving them greater resistance to impacts during excavation. Their anatomy is quite convergent with Mesozoic lacertiform fossils, showing a probable common ancestor with these diapsids. A specimen of VIII Cryptolacerta, from Germany, shares features with Amphisbaenia. However its phylogeny is still uncertain. But Sineoamphisbaena may indicate convergent features between Laurasian lizards, possibly with those originated Amphisbaenia. The fossil records are geographically restricted, predominantly from USA, in relatively small quantity. Most are related to the Family Rhineuridae, which could be considered primitive. However the Family Bipedidae, a recent group, is classified also as primitive, due to the presence of shoulder girdle and forelimbs. But Bipedidae does not present fossils, because until now there are not fossilized remains assigned to them. Morphological convergence occurs in Rhineuridae, detailed in phylogenetic analyses, placing it as a apomorphic group. Anyway it is clear that the origin of Amphisbaenia remains obscure. There are not well preserved fossil materials before beginning of Eocene

Made available in DSpace on 2016-01-13T13:28:01Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-04-24. Added 1 bitstream(s) on 2016-01-13T13:33:34Z : No. of bitstreams: 1 000855644.pdf: 12006624 bytes, checksum: ebdef53dd60214df61e00ed63cee2be3 (MD5) / Crocodilomorfos são o grupo de vertebrados fósseis mais expressivo do Grupo Bauru, contando com 25 espécies formalmente descritas, distribuídas entre quatro principais agrupamentos: Notosuchia, Baurusuchidae, Peirosauridae e Trematochampsidae. À luz dos novos morfótipos descritos se faz necessária uma análise filogenética, a fim de testar possíveis relações com os táxons estabelecidos. Adicionalmente nenhum trabalho traz uma abordagem metodológica a respeito da paleobiogeografia destes grupos. Deste modo, os objetivos desse trabalho foram realizar uma análise filogenética e utilizar seus resultados pela primeira vez em uma análise de Parcimônia de Brooks. O resultado da análise levou a 3 árvores de 2259 passos cada uma, gerando uma árvore de consenso também com 2270 passos. Mesoeucrocodylia foi recuperado, sendo composto por dois clados mais inclusivos: Neosuchia e Gondwanasuchia. Este último formado Sebecia e Notosuchia. Sebecia inclui um grupo monofilético formado por Trematochampsidae, Peirosauridae e Itasuchidae, um clado que inclui Caririsuchus, Itasuchus, Barreirosuchus, Pepesuchus e MCT-1723-R. Este último táxon apresenta semelhanças morfológicas profundas com Pepesuchus e foi classificado como Pepesuchus sp. As relações dentro desse clado sempre formam politomias, foram resgatadas todas resolvidas. Notosuchia inclui um grupo de formas mais avançadas composto por dois clados. Um deles é Baurusuchia, que resgatas as subfamílias Pissarrachampsinae e Baurusuchinae, mas não encontra Baurusuchus pachecoi e Baurusuchus salgadoensis como táxons irmãos. O outro clado dentro de Notosuchia é formado por Notosuchidae como grupo irmão de um clado formado por Morrinhosuchus e Sphagesauridae, com Labidiosuchus e Adamantinasuchus no âmbito desta família. Mariliasuchus robustus compartilha diversas similaridades morfológicas com Mariliasuchus amarali, enquanto que as diferenças entre ambos os táxons... / Crocodylomorphs are the most expressive group of vertebrate fossils from the Bauru Group, counting 25 formally described species, distributed among four main groups: Notosuchia, Baurusuchidae, Peirosauridae, Trematochampsidae. Facing the new morphotypes described it is necessary a phylogenetic analysis to test possible relationships with established taxa. Besides, none work brings a methodology regarding a biogeographic approach to these goups, thus the objectives of this study were to perform a phylogenetic analysis and use the results to a Brooks Parsimony analysis. The result of the analysis took to 3 trees of 2259 steps each, generating a consensus tree of 2270 steps. Mesoeucrocodylia was recovered, consisting of two more inclusive clades: Neosuchia and Gondwanasuchia. The latter is composed by Sebecia and Notosuchia, Sebecia includes a monophyletic group composed by Trematochampsidae, Peirosauridae, and Itasuchidae, a clade comprising Caririsuchus, Itasuchus, Barreirosuchus, Pepesuchus, and MCT-1723-R. This last taxon showing large morphologic similarities with Pepesuchus and was classified like Pepesuchus sp. The relationships inside this clade always return polytomies, and they were recovered all solved. Notosuchia included a group of advanced forms comprising two clades, one of this is Baurusuchia, recovering the subfamilies Pissarrachampsinae and Baurusuchinae, but not finding Baurusuchus pachecoi and Baurusuchus salgadoensis like sister-taxa. The other clade inside Notosuchia is formed by Notosuchidae with a sister-group of a clade comprising by Morrinhosuchus and Sphagesauridae, with Labidiosuchus and Adamantinasuchus inside that family. Mariliasuchus robustus sharing several morphological similarities with Marliasuchus amarali,while the differences between both the taxa are resultants of sexual dimorphism. Therefore, M. robustus is a junior synonym of M. amarali. The results of Brooks Parsimony analysis is a General Area ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-10-29Bitstream added on 2014-06-13T18:54:07Z : No. of bitstreams: 1 toledo_bfb_me_jabo.pdf: 494396 bytes, checksum: 73007bbe5afed3d92412924b6ebe8b81 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A crescente demanda de alimentos causada pelo aumento populacional, aliado a alto custo de fertilizantes industrializados e impacto ambiental causado por eles leva, mundialmente, à utilização em grande escala de inoculantes de bactérias fixadoras de nitrogênio. Os inoculantes utilizados no Brasil (coleção SEMIA- IPAGRO) ainda não estão suficientemente caracterizados geneticamente. O objetivo deste trabalho foi avaliar e confrontar as seqüências parciais dos genes 16S rDNA e nifH de 26 estirpes padrões já classificadas, com 70 estirpes de rizóbios recomendadas e autorizadas para a produção de inoculantes no Brasil. Para esta finalidade, a partir das amostras de DNA extraídos destas bactérias foram realizadas reações de PCR com oligonucleotídeos iniciadores relativos à região codificadora do gene 16S rDNA e do nifH, sendo então seqüenciadas com o objetivo de detectar diferenças nucleotídicas entre as diferentes bactérias estudadas. Para a comparação dos resultados do seqüenciamento com a consulta de similaridade de nucleotídeos no BLASTn, foram geradas árvores filogenéticas através de ferramentas de bioinformática. Foi observado que a classificação taxonômica das estirpes SEMIA recomendadas para inoculação de leguminosas previamente disponível na FEPAGRO, com base em propriedades morfológicas e especificidade hospedeira, não foi confirmada em todas as estirpes pelos sequenciamentos parciais dos genes estudados. Sugerimos revisão da classificação destas estirpes. Concluímos também que a consulta de similaridade ao BLASTn pelo seqüenciamento parcial dos genes 16S rDNA e nifH é, na maioria dos casos, consistente com a classificação proposta pela construção de árvores filogenéticas destas sequências. Estas ferramentas apresentaram-se muito confiáveis para obtenção de classificação em nível de gênero das estirpes estudadas. / The growing demand for food caused by population growth, combined with high cost of fertilizers and industrial environmental impacts caused by them leading, worldwide, the large scale use of inoculants different nitrogen-fixing bacteria. The inoculants used in Brazil (SEMIA-IPAGRO collection) are not yet sufficiently characterized genetically. The purpose of this study was to evaluate and compare the sequences of partial 16S rDNA and nifH of 26 strains already classified, with 70 strains of rhizobia recommended and authorized for the production of inoculants in Brazil. For this purpose, from DNA samples taken from these bacteria were performed with PCR reactions with primers on the coding region of the gene 16S rDNA and nifH, and sequencing with the aim of detecting nucleotide differences between different bacteria studied. To compare the results of the consultation of similarity of sequences of nucleotides in BLASTn, phylogenetic trees were generated through bioinformatics tools. It was observed that the taxonomic classification of strains SEMIA recommended for inoculation of legumes previously available in FEPAGRO, based on morphological properties and host specificity, it wasn’t confirmed in all strains by partial sequencing of the genes studied. We suggest reviewing the classification of these strains. We concluded that the similarity of the consultation BLASTn by partial sequencing of 16S rDNA and nifH is, in most cases, consistent with the classification proposed by the construction of phylogenetic trees of these sequences. These tools were very reliable for obtaining classified in the genus level of strains studied.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-22Bitstream added on 2014-06-13T19:42:36Z : No. of bitstreams: 1 souza_hv_dr_sjrp.pdf: 2893095 bytes, checksum: 3fbfb29a644c0168eb94cfc13b38ae77 (MD5) / Os Heteroptera apresentam particularidades, como a variação entre as espécies no número de lobos testiculares e colorações diferentes da bainha peritoneal. Além destas características, algumas espécies da família Pentatomidae possuem um dos lobos testiculares com características morfológicas e celulares diferentes dos demais lobos, levando à formação de espermatozoides com funções diversificadas. Embora apresentem inúmeras características peculiares, como as tratadas anteriormente, o modo como evoluem necessita de análises aprofundadas. Assim, o presente trabalho objetivou analisar a evolução dos caracteres números de lobos, pigmentação da bainha peritoneal, espermatozoides não fertilizantes e cariótipo, baseando-se nas reconstruções filogenéticas. Foram utilizados, como marcadores, moleculares os genes mitocondriais COI, 16S e o nuclear 18S. Foi feito o sequenciamento de parte desses genes de 25 espécies de Heteroptera, sendo 12 da Família Coreidae e 13 da família Pentatomidae. Verificou-se que sozinhos estes genes não forneceram uma inferência segura nas análises evolutivas. Com tais genes concatenados, as informações puderam se somar, porém devido à baixa consistência nos ramos, as inferências evolutivas devem ser vistas com cautela. Desse modo, esta pesquisa evidenciou a complexidade das distribuições das características testiculares e citogenéticas relatadas através da filogenia molecular. Tornando-se necessário ampliar estes estudos com novas abordagens, como a utilização de caracteres morfológicos ou outros marcadores moleculares para elucidar sua evolução / Heteroptera have peculiarities, including varying numbers of testicular lobes and different coloration of the peritoneal sheath between species. In addition to these features, some species in the Pentatomidae family have testicular lobes with morphologies and cells that are differentiated from the others, leading to the formation of spermatozoa with diversified functions. Although Heteroptera have many peculiar features, such as those previously reported, the study of their evolution requires detailed analysis. Thus, this study aimed to analyze the evolution of the characteristic number of lobes, peritoneal sheath pigmentation, production of non-fertilizing sperm and karyotype based on phylogenetic reconstructions using molecular markers, such as the COI, 16S and nuclear 18S mitochondrial genes. Thus, portions of genes from 25 Heteroptera species, including 12 from the Coreidae family and 13 from the Pentatomidae family, were sequenced. These genes alone did not provide reliable inference for evolutionary analyzes. With such concatenated genes, information could be added, but due to low consistency in the branches, the resulting evolutionary inferences must be viewed with caution. Thus, this research demonstrated the complexity of the distributions of the testicular and cytogenetic characteristics inferred by molecular phylogeny, and it is necessary to extend these studies with new approaches, such as the use of morphological or other molecular markers to elucidate evolution

Resumo: Histerinae está dividida em cinco tribos: Exosternini Bickhardt, 1914; Hololeptini Hope, 1840; Platysomatini Bickhardt, 1914; Omalodini Kryzhanovskij, 1972 e Histerini Gyllenhal, 1808. Estudos de abordagem filogenética para Histeroidea e Histeridae têm questionado a monofilia da subfamília e da maioria de suas tribos. Segundo a classificação corrente de Histeridae, Omalodini é composta por 94 espécies descritas em 12 gêneros distribuídos pelas regiões Neotropical, Afrotropical, Afrotemperada e Oriental: Notolister Lewis, 1894; Sphyracus Marseul, 1853; Ebonius Lewis, 1885; Scapomegas Lacordaire, 1854; Lewisister Bickhardt, 1824; Asolenus Lewis, 1906; Blypotehus Vienna, 2000; Perfidolenus Vienna, 2000; Atribalus Bickhardt, 1921, Rhypochares Marseul, 1854; Theropatina Mazur, 1984; e Omalodes Erichson, 1844, este último dividido em Omalodes (Omalodes), O. (Diplogrammicus) Lewis, 1907 e O. (Cornillus) Lewis, 1907. Os objetivos da presente pesquisa foram testar a monofilia de Omalodini, com base na análise cladística, e propor uma hipótese de relacionamento filogenético para os grupos que compõem a tribo. A matriz foi formada por 50 táxons terminais (35 do grupo interno e 15 do grupo externo) e por 135 caracteres da morfologia dos adultos. Foram realizadas análises com pesos iguais e implícitos aos caracteres. Em ambas as análises, Omalodini apresentou-se um grupo polifilético e as árvores resultantes da análise com pesos iguais (quatro árvores igualmente parcimoniosas) foram escolhidas para restabelecer a monofilia da tribo. Omalodini foi aqui reconhecida com linhagens de Ebonius, Omalodini sp. (novo gênero a ser descrito) e Omalodes, sendo apoiada por seis transformações (Ebonius + (Omalodini sp. + Omalodes)). O grupo irmão de Omalodini foi definido como um clado composto pelas linhagens de Histerini, Platysomatini e Hololeptini. Hipóteses conflitantes foram geradas sobre o posicionamento dos subgêneros de Omalodes perante a análise com pesos implícitos. Salienta-se que Omalodes (Omalodes) compõe o maior grupo de Omalodini sendo necessária uma análise com maior amostragem para considerações mais precisas acerca das relações internas do gênero. Os grupos excluídos a posteriori de Omalodini, Theropatina, Asolenus, Atribalus, Blypotehus, Lewisister, Notolister, Perfidolenus, Rhypochares, Sphyracus, e Scapomegas não puderam ser alocados em nenhuma das tribos existentes de Histerinae.

Orientadora : Profª. Drª. Lúcia Massutti de Almeida / Co-orientador : Prof. Dr. Miguel Ángel Morón / Co-orientador : Prof. Dr. Fernando Zagury Vaz-de-Mello / Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Entomologia). Defesa: Curitiba, 24/02/2015 / Inclui referências / Área de concentração : Entomologia / Resumo: Diplotaxini Kirby é uma das 29 tribos de Melolonthinae, composta por 709 espécies descritas em 21 gêneros distribuídas nas regiões Neotropical, Neártica, Afrotropical e Oriental. Até o momento não foram realizados estudos de filogenia da tribo. Liogenys Guérin-Méneville é o maior gênero dos Diplotaxini neotropicais, composto por 78 espécies distribuídas do Panamá até o sul da América do Sul. Este trabalho teve por objetivos avaliar a monofilia de Diplotaxini e propor uma hipótese de relacionamento filogenético para os gêneros que a compõem, com foco em Liogenys; revisar taxonomicamente este gênero e redescrever as espécies brasileiras. Para a reconstrução filogenética da tribo e conhecimento da posição sistemática dos gêneros, em especial de Liogenys, foram utilizados 167 caracteres morfológicos e 83 taxa terminais (12 do grupo externo e 71 do grupo interno). Em ambas as análises de pesagem igual e implícita dos caracteres, Diplotaxini se mostrou polifilético. A monofilia da tribo pode ser recuperada retirando-se: Empecta Erichson, Clypeasta Fairmaire (próximos de Melolontha melolontha (Linnaeus)) e Pseudoliogenys Moser (agrupado em Tanyproctini Erichson). As análises suportam a polifilia de Liogenys, que pode ser recuperada mediante a retirada de L. ferrugata Mannerheim (próxima de Melolonthini Samouelle) e L. micropyga Burmeister (Diplotaxis) e a inclusão de Homoliogenys tarsalis (Moser) e Hilarianus anguliceps Blanchard (Syn. Nov. de Liogenys punctaticollis Blanchard). As quatro espécies de Hilarianus restantes agruparam-se em Sericoidini. São apresentadas chaves de identificação de adultos para alguns gêneros de Diplotaxini, incluindo todos os gêneros neotropicais e alguns não neotropicais (Diplotaxis Kirby e Apogonia Kirby) e para as espécies brasileiras de Liogenys. Liogenys foi revisado taxonomicamente, redefinido e redescrito. Homoliogenys Gutiérrez e Hilarianus Blanchard são propostos como novos sinônimos de Liogenys. Foram designados 19 lectótipos e propostas seis novas sinonímias, uma revalidação e uma recombinação. Todas as espécies brasileiras (23) foram redescritas e ilustradas: L. tarsalis Moser Comb. Nov., L sinuaticeps Moser, L. unicolor Evans, L. diodon Burmeister, L. bilobata Frey, L santaecrucis Blanchard, L. bidenticeps Moser, L. acutidens Moser, L. tibialis Moser Stat. Rest., L. punctaticollis (Blanchard), L. testaceipennis Moser, L. spiniventris Moser, L. elegans Nonfried, L. suturalis (Blanchard), L. moseri Frey, L. pilosipennis Moser, L. hirtipennis Frey, L. laminiceps Moser, L. corumbana Moser, L. fusca Blanchard, L. pallidicornis Blanchard, L. bidentata Burmeister e L. concolor Blanchard. Dezenove espécies de Liogenys brasileiras tiveram seus registros de ocorrência expandidos. Palavras-chave: Cladística, descrição, morfologia, Neotropical, Scarabaeoidea, sistemática. / Diplotaxini Kirby, 1837 is one of the 29 Melolonthinae tribes, with 708 described species belonging to 21 genera distributed on Neotropical, Neartic, Afrotropical and Oriental regions. Until now no phylogeny studies of the tribe were made. Liogenys Guérin-Méneville, 1831 is the largest genus of Neotropical Diplotaxini, composed by 78 species distributed from Panama to southern South America. This study aimed to evaluate the monophyly of Diplotaxini and to generate phylogenetic relationship hypothesis among the genera, focusing on Liogenys; to review this genus and to redescribe Brazilian species. To reconstruct the tribe phylogeny and to test the systematic position of Diplotaxini genera, in special of Liogenys, 167 morphological characters and 83 terminal taxa (12 outgroups and 71 ingroups) were used. Diplotaxini is poliphyletic in both equal and implicit weighting character analysis. The monophyly of the tribe can be recovered removing: Empecta Erichson, Clypeasta Fairmaire (close to Melolontha melolontha (Linnaeus)) and Pseudoliogenys Moser (close to Tanyproctini Erichson). The results support the poliphyly of Liogenys, monophyly is recovered removing L. ferrugata Mannerheim (close to Melolonthini) and L. micropyga Burmeister (Diplotaxis) and including Homoliogenys tarsalis Moser and Hilarianus anguliceps Blanchard (Syn Nov. of Liogenys punctaticollis Blanchard). The remaining four Hilarianus were related to Sericoidini. Adult identification keys to some Diplotaxini are presented, including all Neotropical genera and some non-Neotropical (Diplotaxis Kirby and Apogonia Kirby) and to the Brazilian Liogenys. Liogenys was reviewed, redefined and redescribed. Homoliogenys Gutiérrez and Hilarianus Blanchard were proposed as new synonyms. Nineteen lectotypes were designate; six new synonyms, one revalidation and one recombination were proposed. All Brazilian species (23) were redescribed and illustrated: L. tarsalis Moser Comb. Nov., L sinuaticeps Moser, L. unicolor Evans, L. diodon Burmeister, L. bilobata Frey, L santaecrucis Blanchard, L. bidenticeps Moser, L. acutidens Moser, L. tibialis Moser Stat. Rest., L. punctaticollis (Blanchard), L. testaceipennis Moser, L. spiniventris Moser, L. elegans Nonfried, L. suturalis (Blanchard), L. moseri Frey, L. pilosipennis Moser, L. hirtipennis Frey, L. laminiceps Moser, L. corumbana Moser, L. fusca Blanchard, L. pallidicornis Blanchard, L. bidentata Burmeister and L. concolor. Nineteen species of Liogenys for Brazil had their distribution records expanded. Key-words: Cladistics, description, morphology, Neotropical, Scarabaeoidea, systematics.

Made available in DSpace on 2015-09-17T15:24:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-11-22. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:48:29Z : No. of bitstreams: 1 000842326.pdf: 1568778 bytes, checksum: 44ee70fd5854d8be4d8c71d1f4d50503 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A subfamila Triatominae compreende 146 espécies, agrupadas em 18 gêneros e cinco tribos. O gênero Triatoma é o mais representativo da subfamília com 80 espécies descritas, as quais estão agrupadas em oito complexos e oito subcomplexos, sendo essa classificação baseada principalmente em características morfológicas. Triatoma rubravaria é considerado um importante vetor na transmissão da doença de Chagas no Estado do Rio Grande do Sul, uma vez que houve um aumento de sua captura e encontros de colônias intradomiciliares após o programa de combate ao T. infestans. Possui hábitos rupestres e é encontrado em buracos e fendas de locais pedregosos, juntamente com T. carcavalloi, T. circummaculata e T.klugi, os quais mostram semelhanças morfológicas. Marcadores moleculares pertencentes ao DNA nuclear, como os espaçadores internos transcritos (ITS) apresentam uma evolução mais rápida, permitindo estabelecer relações recentes ao passo que a grande subunidade ribossomal 28S (D2), por ser bem conservado, permite estabelecer relação entre organismos distantemente relacionados. Marcadores mitocondriais (Citocromo B - CytB e Citocromo Oxidase I - COI) apresentam taxa de mudança dez vezes mais rápida que aquelas apresentadas pelo DNA nuclear, sendo, portanto, úteis para estabelecer relações filogenéticas entre organismos que divergiram recentemente. A análise Bayesiana por meio de sequencias pertecentes ao mtDNA (CytB e COI) reafirmam o posicionamento de espécies no subcomplexo rubrovaria e indica T. carcavalloi como espécie irmã do grupo formado por T. klugi + T. rubrovaria + T. circummaculata. A análise bayesiana de seis populações de T. rubrovaria mostrou a população coletada em Canguçu isolada das demais, sugerindo que se trata de espécie críptica. / The subfamily Triatominae comprises 146 species grouped in 18 genera and five tribes. The genus Triatoma is the most representative subfamily with 80 described species, which are grouped into eight complex and eight subcomplexes and this classification being based primarily on morphological characteristics. Triatoma rubravaria is considered an important vector in the transmission of Chagas disease in the state of Rio Grande do Sul since it was detected an increase of their capture and meetings colonies household after the program to combat of T. infestans. T. rubrovaria is found in groves and crevices of rocky areas within T. carcavalloi, T. circummaculata and T.klugi, which show morphological similarities. Molecular markers belonging to the nuclear DNA, as the internal transcribed spacers (ITS) have more rapid evolution, establishing recent relationships while the large ribosomal subunit 28S (D2), being well maintained, allows establishing the relationship between distantly related organisms. Mitochondrial markers (Cytochrome B - CytB and Cytochrome Oxidase I - COI) present a rate of change ten times faster than those presented by nuclear DNA, and are therefore useful for establishing phylogenetic relationships between organisms that diverged recently. A Bayesian analysis using mtDNA sequences belonging to (CytB and COI) reaffirmed the positioning of the species and indicates subcomplex rubrovaria and indicates T. carcavalloi as sister species from the group of T. klugi + T. rubrovaria + T. circummaculata. A Bayesian analysis of six populations of T. rubrovaria showed the population collected in Canguçu isolated from the others, suggesting that they are cryptic species. / FAPESP: 09/52236-2

Made available in DSpace on 2014-08-27T14:36:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-28Bitstream added on 2014-08-27T15:57:09Z : No. of bitstreams: 1 000777987_20150228.pdf: 1117439 bytes, checksum: 9fd2decbcc0447eb7e0130a6f2ef7968 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-03-03T12:45:19Z: 000777987_20150228.pdf,Bitstream added on 2015-03-03T12:45:56Z : No. of bitstreams: 1 000777987.pdf: 4639540 bytes, checksum: a9e91d54b20b0c16443a02f210845531 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Opilioacaridae é um pequeno e raro grupo de ácaros de vida livre, com seus aspectos biológicos e ecológicos pouco conhecidos. Das 37 espécies conhecidas no mundo, 15 são encontradas no Novo Mundo, sendo 12 pertencentes ao gênero Neocarus e as outras três pertencentes ao gênero Caribeacarus, podendo ser diagnosticados pelas setas modificadas no tarso do palpo e no telotarso da perna I. Apesar das descrições recentes, não existe uma proposta de parentesco entre suas espécies. Com intuito de preencher esta lacuna, apresenta-se a primeira hipótese de relacionamento filogenético entre as espécies de Neocarus. Do material analisado, 20 táxons terminais e 37 caracteres foram incluídos na análise. Utilizou-se o NONA com 1000 replicações e 100 árvores armazenadas por replicação, com pesagens iguais de caracteres, através da busca heurística TBR, utilizando a otimização ACCTRAN e o WinClada como interface. A análise filogenética produziu 20 árvores igualmente parcimoniosas com 73 passos, com índice de consistência 68 e índice de retenção 74. A árvore de consenso estrito encontrada apresentou 83 passos, índice de consistência 60 e índice de retenção 63. Para verificar o suporte dos ramos, foi utilizado o índice de Bremer, com 1000 replicações e considerando árvores com 5 passos adicionais. O monofiletismo de Neocarus não foi observado, sendo parafilético em relação à Caribeacarus, com as relações entre suas espécies não totalmente estabelecidas, apresentando politomias. O material tipo de algumas espécies não pôde ser obtido para análise taxonômica, assim como algumas estruturas não puderam ser observadas. A espécie Neocarus ojastii se enquadra na diagnose de Caribeacarus, sugerindo-se uma nova combinação, bem como a espécie N. calakmulensis que pode se tratar de uma sinonímia de N. nicaraguensis / Opilioacaridae is a small and rare group of free-living mites, their biological and ecological aspects unfamiliar. Of the 37 known worldwide species, 15 are found in the New World, which 12 belong to the genus Neocarus and the other three belong to the genus Caribeacarus and can be diagnosed by the setae in the modified tarsus of palp and telotarsus I. Despite recent descriptions, there is no proposed relationship between their species. In order to fill this gap, we present the first hypothesis of phylogenetic relationships among species of Neocarus. Of the material analyzed, 20 characters and 37 terminal taxa were included in the analysis. We used NONA with 1000 replicates and 100 trees stored for replication, with equal weights of characters through the TBR heuristic search using the ACCTRAN optimization and WinClada as interface. Phylogenetic analysis produced 20 equally parsimonious trees with 73 steps, with a consistency index of 68 and a retention index of 74. The strict consensus tree had found 83 steps, consistency index 60 and 63 retention rate. To check the support of branches was used Bremer index, with 1000 replications and considering trees with 5 additional steps. The monophyly of Neocarus was not observed, being paraphyletic with respect to Caribeacarus, and the relationships between their species is not fully established, presenting polytomies. The type material of some species could not be obtained for taxonomic analysis, as well as some structures could not be observed. The Neocarus ojastii fits the diagnosis of Caribeacarus, suggesting a new combination, as well N. calakmulensis that can treat a synonymy of N. nicaraguensis / FAPESP: 10/13269-0

Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:27Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-23Bitstream added on 2015-03-03T12:07:39Z : No. of bitstreams: 1 000811094.pdf: 620444 bytes, checksum: 656aa996de25000536a3d6e5e8b7e218 (MD5) / O gênero Mazama (Mammalia: Cervidae) engloba as espécies de cervídeos neotropicais de pequeno porte e chifres simples. A alta taxa de convergência morfológica e diversificação rápida e recente dificultam a resolução das lacunas na sua história evolutiva. Estudos envolvendo análises moleculares indicaram que Mazama é um gênero polifilético, com uma subdivisão das suas espécies em dois clados (veados vermelhos e cinza). No presente estudo foram inferidas as relações filogenéticas e o tempo de divergência das espécies de veados cinza M. gouazoubira e M. nemorivaga, utilizando dois genes mitocondriais (Cytb e COI) e dois genes nucleares (IL16 e MGF). A análise de coalescência corroborou com os resultados anteriores, separando essas duas espécies do restante das espécies de Mazama. Além disso, as duas espécies são alocadas em clados separados e monofi léticos, representando diferentes gêneros. Os resultados obtidos indicaram que as duas espécies representam complexos de linhagens crípticas, com ambas as diversificações tendo iniciado no final do Pleistoceno (1,62-1,65 Myr). A espécie M. gouazoubira foi subdividida em cinco clados de distribuição simpátrica em grande parte da sua ocorrência. A espécie M. nemorivaga foi separada em três clados, com distribuições biogeográficas distintas e correspondentes às áreas de endemismo da Amazônia. O grande número de linhagens identificadas no presente estudo indica o caráter emergencial de uma delimitação e revisão sistemática acurada para as espécies desse gênero. Essas linhagens detectadas representam hipóteses taxonômicas a serem testadas utilizando outras metodologias de análise complementares como, citogenética, morfometria, ecologia, comportamento e reprodução / The genus Mazama includes neotropical deer species of small sizes and simple antlers. Morphological convergences, in addiction to rapid and recent diversification, make the resolution of gaps in their evolutionary history difficult. Initial molecular analyses indicated that Mazama is a polyphyletic genus with species subdivided into two clades (gray and red deer). In this study we inferred the phylogenetic relationships and divergence time of the gray brocket deer species M. gouazoubira and M. nemorivaga using two mitochondrial genes (Cytb and COI) and two nuclear genes (IL16 and MGF). The coalescence analysis corroborated the previous results, separating these two species from the remaining Mazama species. Moreover, the two species were allocated into separate monophyletic clades, representing different genera. These results indicate that the two species represent complexes of cryptic lineages, whose diversifications started in the Late Pleistocene (1.62 to 1.65 Myr). The M. gouazoubira species was subdivided into five clades with sympatric distribution. The M. nemorivaga species was separated into three distinct clades, corresponding to areas of Amazon biogeographical endemism. The large number of lineages identified in this study indicates need for an accurate delimitation and systematic review for the Mazama species. These findings may represent hypotheses of taxonomic lineages to be tested using other analysis methods, such as cytogenetics, morphology, ecology, behavior and reproduction strategies