Resumo não disponível.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2017. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2017-03-31T20:04:12Z No. of bitstreams: 1 2017_BiancaSamayAngelinoBonfim.pdf: 1074842 bytes, checksum: 4d1edc3bbc2f110de3b7d9cb95124ed3 (MD5) / Rejected by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br), reason: Fernanda, Por favor, verificar os metadados (resumos e assunto). Obrigada! on 2017-04-20T12:51:44Z (GMT) / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2017-04-25T16:11:06Z No. of bitstreams: 1 2017_BiancaSamayAngelinoBonfim.pdf: 1074842 bytes, checksum: 4d1edc3bbc2f110de3b7d9cb95124ed3 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-04-27T23:19:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_BiancaSamayAngelinoBonfim.pdf: 1074842 bytes, checksum: 4d1edc3bbc2f110de3b7d9cb95124ed3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-27T23:19:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_BiancaSamayAngelinoBonfim.pdf: 1074842 bytes, checksum: 4d1edc3bbc2f110de3b7d9cb95124ed3 (MD5) / O cultivo comercial da macieira no Brasil iniciou-se na década de 70 e atualmente constitui uma atividade econômica de grande importância para a região Sul, cuja produção corresponde a 99% do total produzido no país. Apesar dos altos índices de produção, a produtividade da cultura é reduzida devido a ocorrência de pragas e doenças. Entre as principais doenças, as podridões pós-colheita destacam-se pelas perdas mais elevadas em relação as ocorridas no campo, pois além dos custos de produção, são adicionadas despesas de colheita, classificação, embalagem, transporte, armazenamento e comercialização. A podridão olho de boi é uma doença pós-colheita causada por um complexo de espécies do gênero Neofabraea, sendo que a ocorrência de cada táxon varia de acordo com a região geográfica. Por exemplo, N. alba é a única espécie relatada no Chile enquanto que N. alba, N. kienholzii e N. perennans já foram registradas na Polônia. O primeiro relato da podridão olho de boi no Brasil ocorreu em 1995 e até 2016, o agente etiológico da doença foi identificado como N. perennans. A identificação foi baseada principalmente nas características morfológicas, no entanto, estudos recentes demonstram a importância da inclusão de dados moleculares para a diferenciação das espécies. Portanto, esse trabalho tem o objetivo de identificar e caracterizar morfomolecularmente as espécies de Neofabraea associadas a podridão olho de boi e avaliar a agressividade e o crescimento micelial dos isolados em diferentes temperaturas. Os isolados foram obtidos de frutos sintomáticos coletados em Campo Belo do Sul-SC, Fraiburgo-RS, São Joaquim-SC e Vacaria-RS para extração do DNA genômico e amplificação parcial do gene da β-tubulina. Entre os 92 isolados identificados, 10 espécimes provenientes de Fraiburgo (4) e Vacaria (6) pertencem a N. actinidiae e 82 isolados obtidos em Campo Belo do Sul (15), Fraiburgo (36), São Joaquim (12) e Vacaria (19) pertencem a Neofabraea sp., indicando que a podridão olho de boi no Brasil é causada por duas espécies do gênero Neofabraea. Para a identificação precisa, isolados representativos de cada espécie e localidade foram selecionados para sequenciamento das regiões ITS, LSU, e RPB2 e para a caracterização morfológica. Após a abordagem morfomolecular, conclui-se que Neofabraea sp. e N. actinidiae ocorrem na proporção 8:1, sendo que Neofabraea sp. ocorre em Campo Belo do Sul-SC, Fraiburgo-SC, São Joaquim-SC e Vacaria-RS enquanto N. actinidiae foi encontrada somente em Fraiburgo e Vacaria. Adicionalmente, esse é o primeiro relato de N. actinidiae causando a podridão olho de boi da maçã. Isolados representativos de cada espécie e localidade foram utilizados para avaliação da agressividade e do crescimento micelial a 5°C, 17°C e 25 ºC. A agressividade foi determinada pelo tamanho das lesões em frutos de maçãs ‘Fuji’ ocasionadas pela inoculação de uma suspensão de conídios e o crescimento micelial pelo tamanho do diâmetro das colônias cultivadas em extrato de malte ágar. Após os testes, verifica-se que Neofabraea sp. é mais agressiva que N. actinidiae e que existe uma variação fisiológica intraespecífica para o crescimento micelial e a agressividade dos isolados sob diferentes temperaturas. / The commercial cultivation of apple trees in Brazil began in the 1970's and it is currently an economic activity of great importance in the country´s southern region, which accounts for 99% of the total domestic production. Despite the high fruit yields, crop productivity is limited by the occurrence of pests and diseases. Among the main diseases, postharvest rot losses are higher than field losses, due to the associated costs of harvesting, sorting, packaging, transportation, storage and commercialization. The bull’s eye rot is a post-harvest disease caused by a complex of species of the genus Neofabraea, and the occurrence of each taxon varies according to geographic region. For example N. alba is the only species reported in Chile whereas N. alba, N. kienholzii and N. perennans have already been recorded in Poland. The first report of bull’s eye rot in Brazil was made in 1995 and, until 2016, the etiological agent of the disease was identified as N. perennans. The identification was mainly based on the morphological characters, however, recent studies demonstrate the importance of the inclusion of molecular data for species differentiation. Therefore, this work aimed to identify and characterize morphologically and molecularly the Neofabraea species associated with bull’s eye rot and to evaluate the aggressiveness and mycelial growth of the isolates at different temperatures. The isolates were obtained from symptomatic fruits collected in Campo Belo do Sul-SC, Fraiburgo-RS, São Joaquim-SC and Vacaria-RS for extraction of genomic DNA and partial amplification of the β-tubulin gene. Among the 92 isolates identified, 10 specimens from Fraiburgo (4) and Vacaria (6) were shown to belong to N. actinidiae, while 82 isolates obtained from Campo Belo do Sul (15), Fraiburgo (36), São Joaquim (12) and Vacaria (19) were determined to belong to Neofabraea sp., indicating that bull’s eye rot in Brazil is caused by two species of the genus Neofabraea. For the precise identification, representative isolates of each species and locality were selected for sequencing of the ITS, LSU, and RPB2 regions and for the morphological characterization. After the morphomolecular approach, we concluded that Neofabraea sp. and N. actinidiae occur in the ratio 8:1, and Neofabraea sp. occurs in Campo Belo do Sul-SC, Fraiburgo-SC, São Joaquim-SC and Vacaria-RS whereas N. actinidiae was found only in Fraiburgo and Vacaria. Furthermore, this is the first report of N. actinidiae causing apple bull’s eye rot. Representative isolates of each species and locality were used to evaluate aggressiveness and mycelial growth at 5 ° C, 17 ° C and 25 ° C. Aggressiveness was determined by the size of lesions on 'Fuji' apple fruits following inoculation of a conidial suspension. Mycelial growth rates were determined by the size of the colonies grown in agar malt extract. Neofabraea sp. was consistently more aggressive than N. actinidiae. Additionally, an intraspecific physiological variation was found for the mycelial growth rate and isolate aggressiveness to fruits under different temperatures.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Botânica, Programa de Pós-Graduação em Botânica, 2014. / Submitted by Fernando de Jesus Pereira (fernandodejpereira@gmail.com) on 2015-05-22T16:04:39Z No. of bitstreams: 2 2014_JairEustaquioQuintinoFariaJunior.pdf: 13520427 bytes, checksum: 47c86f57be3d672f4a26a3f35adbd65f (MD5) 2014_JairEustaquioQuintinoFariaJunior.pdf: 13520427 bytes, checksum: 47c86f57be3d672f4a26a3f35adbd65f (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2015-05-25T12:07:05Z (GMT) No. of bitstreams: 2 2014_JairEustaquioQuintinoFariaJunior.pdf: 13520427 bytes, checksum: 47c86f57be3d672f4a26a3f35adbd65f (MD5) 2014_JairEustaquioQuintinoFariaJunior.pdf: 13520427 bytes, checksum: 47c86f57be3d672f4a26a3f35adbd65f (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-25T12:07:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 2014_JairEustaquioQuintinoFariaJunior.pdf: 13520427 bytes, checksum: 47c86f57be3d672f4a26a3f35adbd65f (MD5) 2014_JairEustaquioQuintinoFariaJunior.pdf: 13520427 bytes, checksum: 47c86f57be3d672f4a26a3f35adbd65f (MD5) / Myrtaceae é uma das maiores famílias de plantas neotropicais com ca. de 132 gêneros e 5671 espécies e também um componente importante nas formações florestais e savânicas dessa região. Entre os gêneros de Myrtaceae, Eugenia se destaca como segundo maior gênero com aproximadamente 1038 espécies. O gênero deve ser originário do oeste ou sudeste da América do Sul, migrando desde as regiões andinas para o norte ou nordeste da América do Sul e ocorrendo desde o México e Caribe até o norte da Argentina, África e Sudeste da Ásia. Baseado em estudo filogenético molecular, o gênero atualmente pode ser subdividido em oito grupos ou seções. O foco do estudo é Eugenia sect. Pilothecium, a qual ocorre, principalmente, na porção central a leste do Brasil, com uma espécie alcançando países vizinhos mais ao sul como Argentina, Bolívia, Paraguai e Uruguai e duas espécies Amazônicas que ocorrem no Brasil, Colômbia, Guianas, Peru, Suriname e Venezuela. O objetivo deste trabalho foi realizar um estudo filogenético preliminar para Eugenia sect. Pilothecium e Eugenia clado 2 (grupo informal), o qual é morfologicamente muito próximo ao primeiro grupo, e realizar a revisão taxonômica clássica para Eugenia sect. Pilothecium. Para tanto a tese se encontra subdividida em três capítulos. O primeiro capítulo faz um tratamento filogenético preliminar para os dois grupos acima citados. Neste capítulo, é comprovada através de técnicas de inferências filogenéticas com base em quatro marcadores plastidiais e um marcador nuclear, o monofiletismo dos dois grupos, e são feitos comentários sobre algumas relações dentro destes dois grupos. O segundo capítulo traz a revisão taxonômica clássica de Eugenia sect. Pilothecium. São feitas descrições para a seção e para todas as espécies, além de comentários sobre sua distribuição, ecologia e morfologia. O terceiro e último capítulo traz a descrição de duas novas espécies, uma de Eugenia sect. Pilothecium e a outra de Eugenia clado 2. Foi possível perceber que, apesar do grupo como um todo apresentar uma grande plasticidade na ocupação de habitats, a maioria de suas espécies apresenta distribuição muito restrita, o que as coloca em situação de risco de extinção. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Myrtaceae is one of the largest neotropical families with 132 genera and 5671 species and is also an important component of the forests and savannas of that region. Amongst the genera of Myrtaceae, Eugenia is noteworthy in being the second most species-rich with approximately 1038 species. The genus probably originated in Western or Southeastern South America, later migrating from the Andean regions into Northern or Northeastern South America; it now occurs from Mexico and the Caribbean to Northern Argentina, Africa and Southeast Asia. Based on a phylogenetic study the genus can be divided into eight groups or sections. The focus of this study is Eugenia sect. Pilothecium, that occurs mainly in Central and Eastern Brazil, with one species reaching southwards into the neighbouring countries of Argentina, Bolivia, Paraguay and Uruguay while two Amazonian species extend their ranges northwards into the Brazil, Colombia, Guianas, Peru, Surinam and Venezuela. The objective of this study, therefore, was a preliminary phylogenetic study of Eugenia sect. Pilothecium and of Eugenia clade 2 (informal group), that is morphologically very close to the former, and to produce a classic taxonomic revision of Eugenia sect. Pilothecium. For this purpose, the thesis is subdivided into three chapters. The first chapter is the preliminary phylogenetic study of the two groups cited above. In this chapter, we use phylogenetic inference techniques, applied to four plastidial markers and one nuclear marker, to prove that both groups are monophyletic, and some considerations are made about the relationships between them. The second chapter is the classic taxonomic revision of Eugenia sect. Pilothecium. The section and species are described, and comments on their distribution, ecology and morphology are made. The third and last chapter presents the description of two new species, one of which belongs to E. sect. Pilothecium and the other to E. clade 2. Although as groups these two clades are widely distributed and adapted to many different habitats, many of the species have very limited distributions that place them in danger of extinction.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2015. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2015-05-27T17:43:38Z No. of bitstreams: 1 2015_AlineBelmokdeAraujoDias.pdf: 3511355 bytes, checksum: 20e2b74a889a5764dd2f96f6be017da4 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2015-05-27T20:29:18Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_AlineBelmokdeAraujoDias.pdf: 3511355 bytes, checksum: 20e2b74a889a5764dd2f96f6be017da4 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-27T20:29:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_AlineBelmokdeAraujoDias.pdf: 3511355 bytes, checksum: 20e2b74a889a5764dd2f96f6be017da4 (MD5) / Há quase 25 anos foi proposto que os procariotos poderiam ser divididos em dois domínios distintos: Bacteria e Archaea. As archaeas foram inicialmente associadas apenas a ambientes extremos, mas com o aumento do uso de abordagens moleculares, membros deste domínio passaram a ser detectados em diversos habitats do nosso planeta, evidenciando sua ubiquidade. Além disso, posteriormente foram identificadas archaeas com metabolismos de importância ecológica que antes acreditavam-se estar restritos a bactérias, como a oxidação de amônia. Apesar dos avanços trazidos pelas técnicas moleculares, a obtenção de cultivos laboratoriais ainda é imprescindível para a compreensão de vários aspectos da biologia dos microrganismos. No Brasil, ainda são escassos os estudos sobre Archaea nos diferentes ambientes naturais. O Cerrado é um extenso e importante bioma de nosso país, mas pouco se sabe sobre a comunidade de archaeas nos solos de suas diferentes fitofisionomias. Além disso, queimadas são eventos ecológicos importantes no Cerrado e não existem estudos sobre o seu efeito na população de archaeas de solos deste ambiente. Assim, este trabalho teve como objetivo avaliar e comparar a comunidade de Archaea em solos de Cerrado sensu stricto que não sofrem queimadas há anos e solos de áreas queimadas bienalmente, além da detecção de archaeas com potencial para oxidação de amônia nestes solos. Outro objetivo do trabalho foi a obtenção de culturas de archaeas provenientes do solo deste bioma. Amostras de solo coletadas em triplicata foram submetidas à extração de DNA total, que foi utilizado em ensaios de PCR com os iniciadores específicos para os genes rRNA 16S e amoA de Archaea. Os resultados obtidos revelaram que a grande maioria das sequências obtidas pertence aos grupos I.1b e I.1c do filo Thaumarcheota. No entanto, apesar das semelhanças encontradas nas análises realizadas, as amostras de solo da área protegida do fogo apresentaram maior abundância de thaumarchaeotas do grupo I.1c, enquanto o solo da área queimada apresentou mais sequências do grupo I.1b. Análises do gene amoA, amplificado em todas as amostras, indicaram archaeas com o potencial para a oxidação de amônia possivelmente não descritas anteriormente ocorrendo nos solos de Cerrado. Para o estabelecimento do cultivo de archaeas do solo de Cerrado, meios de cultura foram confeccionados a partir de um coado de solo e suplementados com agentes antimicrobianos. Após vários repiques, o DNA das colônias observadas foi extraído e amplificado com iniciadores para os domínios Archaea e Bacteria. A análise das sequências obtidas indicou uma cocultura entre uma bactéria do gênero Novosphingobium e uma archaea do grupo I.1c de Thaumarchaeota, que ainda não apresenta qualquer representante cultivado descrito na literatura. / It has been almost 25 years since the proposal that divided prokaryotes in two different domains: Bacteria and Archaea. The archaea were initially associated exclusively with extreme environments, but the increasing utilization of molecular approaches revealed that members of this domain were ubiquitous and could be detected in different environments on Earth. Furthermore, metabolisms of ecologic importance that were thought to be restricted to bacteria were later detected in archaea, such as the ability to oxidize ammonia. This fact highlights that, despite the advances brought by molecular approaches, cultivation of microorganisms in laboratory is still essential for understanding many aspects of their biology. Currently, there are very few studies about Archaea in the natural environments of Brazil. The Brazilian savanna, known as Cerrado, is an extensive and important biome of our country, but little is known about the Archaea community in soils of its different phytophysiognomies. Furthermore, fires are important ecological events in Cerrado and there are no studies about its effects on the Archaea populations in soils. Therefore, this study aimed to evaluate and compare the archaea community of Cerrado sensu stricto soils of an area that has long been protected from fire and another that has been submitted to biennial prescribed fires. It also aimed to detect archaea with the potential for ammonia oxidation in these soils. Another objective of this study was the establishment of archaea from Cerrado soils in culture. Soil samples were submitted to DNA extraction, which was used for PCR essays with specific primers for Archaea rRNA 16s and amoA genes. Results showed that most of the sequences obtained were from I.1b e I.1c groups of Thaumarchaeota. Despite the similarities found in the analysis, samples from the protected site showed higher abundance of I.1c thaumarchaeotes, while in samples from the frequently burned site more sequences from group I.1b were detected. Analysis of the amoA gene, which was amplified from all samples, showed that there are possibly previously undescribed archaea with ammonia oxidation potential in Cerrado soils. For the establishment of archaea cultures, culture media were made from soil filtrates and supplemented with antimicrobial agents. After several transfers, DNA extracted from the obtained colonies was used for PCR essays with specific primers for Archaea and Bacteria domains. The sequences obtained revealed a coculture between a bacteria of Novosphingobium genus and an archaea from group I.1c of Thaumarchaeota, a group that so far does not have any cultured representative described in the literature.

A família Volutidae Rafinesque, 1815 possui cerca de 250 espécies de gastrópodes marinhos que se distribuem em praticamente todos os mares do mundo, desde a zona entremarés até a zona abissal. Historicamente a classificação da família é bastante conturbada, existindo na bibliografia várias propostas de classificação das subfamílias baseadas em diversos sistemas, sendo que poucos gêneros não são ainda alvo de discussões quanto à sua posição em relação às subfamílias. Estudos de sistemática de Volutidae com enfoque evolutivo esbarram na falta de dados para a elaboração de uma hipótese de filogenia dentro da família. Frente ao escasso conhecimento disponível quanto à morfologia de Volutidae, buscou-se através de estudos de morfologia comparada reconhecer padrões morfológicos para o gênero Adelomelon Dall, 1906 a partir da comparação com espécies de gêneros próximos e discriminar caracteres que fundamentem uma classificação que reflita as relações filogenéticas entre os táxons de Adelomelon.Inicialmente, através de uma revisão taxonômica, buscou-se reconhecer os táxons pertencentes ao gênero Adelomelon e avaliar a variabilidade intraespecífica. Neste sentido a revisão teve especial ênfase em localizar o material tipo dos táxons descritos para o gênero. A análise das descrições originais e do material tipo demonstrou que Scaphella arnheimi Rivers, 1891 e Voluta paradoxa Lahille, 1895 não devem ser considerados sinônimos de Adelomelon ancilla (Lightfoot, 1758) e que Adelomelon barattinii Klappenbach & Ureta, 1966 é uma forma muito rara de A. ancilla. O subgênero Weaveria Clench & Turner, 1964 não apresentou características exclusivas e portanto foi considerado um sinônimo de Adelomelon s.s.. As caracterizações morfológicas das cinco espécies de Adelomelon (A. ancilla, A. beckii, A. riosi, A. brasiliana e A. ferussacii) e de espécies de grupos próximos (Harpovoluta, Odontocymbiola, Provocator e Zidona) são embasadas em exemplares reunidos de lotes dediversas localidades provenientes de coleções particulares, coleções de museus, coletados junto a barcos de pesca comercial ou de cruzeiros científicos. Apesar dos táxons analisados tenham se apresentado muito semelhantes morfologicamente, é possível reconhecer características marcantes que distinguem as espécies atualmente pertencentes à subfamília Zidoninae daquelas pertencentes à subfamília Odontocymbiolinae. Em Zidoninae a próstata apresenta-se aberta lateralmente em toda sua extensão e pênis cilíndrico sem apresentar papila terminal, enquanto que em Odontocymbiolinae a próstata é aberta em um pequeno orifício lateral e o pênis é triangular achatado e apresenta uma papila.O exame do conteúdo do sistema digestório leva a supor que Mollusca e Echinoderma estariam entre os principais grupos taxonômicos predados pelas espécies de volutídeos estudados. Adelomelon riosi se mostrou especializado na predação de equinodemos enquanto A. brasiliana se alimenta tanto moluscos como equinodermos. Foi possível identificar espículas de poríferos entre o conteúdo do trato digestório de H. charcoti, um hábito alimentar até então não relatado para a família. Para a análise filogenética foram levantados 31 caracteres e 67 estados, a partir das caracterizações da morfologia de 11 espécies. A matriz de dados foi construída utilizando-se o programa Tree Gardener 2.2 e a análise foi realizada com o programa Hennig86, utilizando-se o comando “ie-”. A análise de parcimônia da matriz polarizada resultou em um único cladograma mais parcimonioso contendo 65 passos (IC=0,58; IR=0,62) com a seguinte topologia (O. magellanica; O. simulatrix (O. americana (Z. dufresnei (P. corderoi - H. charcoti)) ((A. brasiliana - A. ferussacii) (A. ancilla (A. beckii – A. riosi))))). Apesar da relativa distinção conquiliológica entre os clados Adelomelon s.s. e Pachycymbiola, a topologia da filogenia demonstra uma estreita proximidade entre os dois clados, o que torna a discussão em relação aos limites do gênero Adelomelon muito subjetiva. Uma visão mais abrangente do gênero aceita a inclusão de Pachycymbiola como um subgênero de Adelomelon, considerando as semelhançasmorfológicas presentes no gênero enquanto uma visão mais restritiva aceita a distinção dos dois clados em gêneros distintos, considerando as diferenças conquiliológicas. Na ausência de caracteres morfológicos claramente distintivos entre os dois táxons, optamos aqui pela visão mais ampla do gênero por considerarmos que as características conquiliológicas presentes em Volutidae são demasiadamente heterogêneas e freqüentemente sujeitas à convergência.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Economia, Administração e Contabilidade, Departamento de Economia, 2017. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-08-10T19:29:00Z No. of bitstreams: 1 2017_MariaLuizaAlmeidaLuz.pdf: 1474295 bytes, checksum: 3d5e093440eae5fd0a4e6c5380e7edf2 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-09-25T22:40:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_MariaLuizaAlmeidaLuz.pdf: 1474295 bytes, checksum: 3d5e093440eae5fd0a4e6c5380e7edf2 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-25T22:40:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_MariaLuizaAlmeidaLuz.pdf: 1474295 bytes, checksum: 3d5e093440eae5fd0a4e6c5380e7edf2 (MD5) Previous issue date: 2017-09-25 / Este trabalho propõe que a construção de indicadores de diversidade biológica incorpore os aspectos social e espacial. Para isso, a metodologia denominada Análise Social e Espacial - ASE foi, primeiramente, aplicada na análise de metas e indicadores brasileiros de biodiversidade apresentados nos relatórios nacionais para a Convenção sobre Diversidade Biológica referentes aos anos 2011 e 2015, além do conjunto nacional de indicadores do PainelBio apresentado em 2016. Em seguida, a ASE foi aplicada para investigar como o Brasil está em relação a países considerados avançados em suas políticas de conservação da biodiversidade, em termos de incorporação dos aspectos social e espacial em seus indicadores. Os resultados apontam que o Brasil avançou em seu processo metodológico, mas esse avanço ainda é frágil, principalmente em relação à rastreabilidade de informações apresentadas nos documentos oficiais. Os países, além de incorporar indicadores de biodiversidade em suas estratégias, devem assegurar que tais indicadores e metas sejam metodologicamente robustos, que as necessidades dos diferentes grupos sociais estejam representadas e que os indicadores sejam instrumentos adequados para avaliar a política à qual estão atrelados. / This work proposes that the construction of indicators of biological diversity incorporate the social and spatial aspects. For this, the methodology called Social and Spatial Analysis - ASE was first applied in the analysis of Brazilian biodiversity targets and indicators presented in the national reports for the Convention on Biological Diversity for the years 2011 and 2015, in addition to the national set of indicators of biodiversity of PainelBio presented in 2016. The ASE was then applied to investigate how Brazil is in relation to countries considered advanced in their biodiversity conservation policies, in terms of incorporating the social and spatial aspects into their indicators. The results indicate that Brazil has advanced in its methodological process, but this progress is still fragile, especially in relation to the traceability of information presented in official documents. Countries, in addition to incorporating biodiversity indicators into their strategies, should ensure that such indicators and targets are methodologically robust, that the needs of different social groups are represented, and that indicators are appropriate instruments for assessing the policy to which they relate to.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia, 2017. / Texto parcialmente liberado pelo autor. Conteúdo restrito: Capítulos 1, 2 e 3. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-12-07T15:59:55Z No. of bitstreams: 1 2017_WáldimaAlvesdaRocha _PARCIAL.pdf: 909938 bytes, checksum: bb8b75fa69d24df92140a745e10bdf80 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2018-02-08T21:38:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_WáldimaAlvesdaRocha _PARCIAL.pdf: 909938 bytes, checksum: bb8b75fa69d24df92140a745e10bdf80 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-08T21:38:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_WáldimaAlvesdaRocha _PARCIAL.pdf: 909938 bytes, checksum: bb8b75fa69d24df92140a745e10bdf80 (MD5) Previous issue date: 2018-01-08 / O bioma Caatinga foi durante anos uma das regiões de menor interesse científico no Brasil. A ideia de uma fauna depauperada e pobre em endemismos contribuiu com essa falta de interesse até o início da década de 90. Atualmente, sabemos que a Caatinga possui uma fauna relativamente rica e caracterizada por uma expressiva presença de elementos endêmicos. No entanto, muito de seu território, principalmente sua área central, continua apresentando uma amostragem deficiente para a herpetofauna em geral. A Caatinga apresenta um baixo número de reservas de proteção integral, com isso poucas espécies estão sob proteção e correm risco de perda hábitat por desmatamento, queimadas e avanço da monocultura. Diante da necessidade de avançar no conhecimento das serpentes deste bioma, este estudo teve como objetivos principais entender os padrões de distribuição das serpentes da Caatinga e que fatores explicam esses padrões, avaliar o estado atual de conservação deste grupo e identificar áreas prioritárias para a conservação. No Capítulo 1, observamos padrões de distribuição das serpentes da Caatinga e suas relações com as subdivisões de ecorregiões do bioma, e utilizando modelagem de distribuição potencial da ocorrência das espécies, nós identificamos áreas de expressiva diversidade dentro do bioma e identificamos as variáveis bioclimáticas mais relevantes para explicar essas áreas de alta diversidade. No Capítulo 2, usamos a distribuição das serpentes associadas a uma árvore filogenética para identificar áreas de endemismo filogenético. No Capítulo 3, utilizamos a distribuição das espécies endêmicas da Caatinga, para identificar áreas prioritárias para a conservação das espécies, através do planejamento sistemático para a conservação. / The Caatinga biome has been for years one of the least studied regions in Brazil. The idea that the region has a poor fauna and is poor in endemisms contributed to this lack of interest until the early 90's. Nowadays, we know that the Caatinga has a relatively rich fauna and is characterized by an expressive presence of endemic elements. However, much of its territory, mainly its central area, is still poorly sampled for the herpetofauna in general. The Caatinga presents a low number of integral protection reserves, and few species are under protection, which puts them under risk of loss habitat by deforestation, burnings and monocultures. Faced with the need to advance the knowledge on the snakes of this biome, this study had as main objectives to: 1) understand the distribution patterns of the Caatinga snakes and which factors explain the observed patterns; 2) evaluate the present conservation state of this group, and 3) identify priority areas for conservation. In Chapter 1, we identified distribution patterns of the Caatinga snakes and their relationships to the ecoregion subdivisions of the biome, using ecological niche modelling of potential distribution of species occurrence, we identified areas of expressive diversity within the biome and identified the most relevant bioclimatic variables for high diversity areas. In Chapter 2, we used the distribution of snakes associated with a phylogenetic tree to identify areas of phylogenetic endemism. In Chapter 3, we used the distribution of endemic Caatinga species to identify priority areas for species conservation through systematic planning for conservation.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia, 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-10-07T18:49:24Z No. of bitstreams: 1 2016_ThaizArmond.pdf: 1429793 bytes, checksum: 39242723ddd458169ce07c04023b59e8 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-11-21T15:21:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_ThaizArmond.pdf: 1429793 bytes, checksum: 39242723ddd458169ce07c04023b59e8 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-21T15:21:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_ThaizArmond.pdf: 1429793 bytes, checksum: 39242723ddd458169ce07c04023b59e8 (MD5) / O Cerrado é um bioma brasileiro com alta riqueza de espécies e endemismo, sendo considerado um hotspot de biodiversidade. Apesar da sua importância ecológica, este bioma é continuamente transformado pelas ações humanas, colocando em risco a conservação de muitas espécies que compõem a sua fauna e flora. Nesta situação se enquadram os roedores do gênero Clyomys, que apresentam hábitos coloniais e semi-fossoriais, e cuja distribuição no Cerrado, apesar de ampla, é descontínua. Não existe consenso entre os pesquisadores em relação ao número de espécies dentro do gênero. Para alguns autores ao menos duas espécies são encontradas, C. bishopi no estado de São Paulo e C. laticeps nas demais localidades, enquanto que para outros o gênero possui apenas uma única espécie (C. laticeps). Os marcadores moleculares mitocondriais e nucleares são importantes ferramentas para a análise da variação e estrutura genética existente dentro das espécies e em suas populações, e podem ser utilizados para a resolução de questões relacionadas à definição de status taxonômico. Para esclarecer dúvidas com relação a filogeografia do gênero Clyomys avaliamos, por análises genéticas, 33 indivíduos provenientes de várias localidades distribuídas por quase toda a sua área de ocorrência. A análise de sequências mitocondriais (Citocromo b – CytB; Citocromo c Oxidase Subunidade I - COI) e nucleares (Fator de von Willebrand – vWF, Receptor do Hormônio de Crescimento – GHR e, Beta Fibrinogênio – BFIB) utilizando métodos filogenéticos baseados em máxima verossimilhança e inferência bayesiana mostraram uma possível separação do gênero Clyomys em três espécies, uma ocorrendo em São Paulo, uma na região central do Brasil e a outra na região do Pantanal. Esses resultados foram corroborados com altas probabilidades encontradas nas análises do BP&P. A datação da divergência dessas potenciais espécies sugere que isto tenha ocorrido no Pleistoceno, sendo que a divergência da linhagem próxima ao pantanal ocorreu primeiro. ________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The Brazilian biome Cerrado is characterized by high species richness and endemism, and it’s considered a biodiversity hotspot. Despite its ecological importance, this biome is constantly changing due to human actions which strongly affects the conservation of many species. Clyomys, composed by colonial and semi-fossorial rodents, clearly fits in this situation. This genus has a large but discontinuous distributions over Cerrado area and there is no consensus among researchers regarding the number of species within the genus. Some authors consider two species, C. bishopi in São Paulo and C. laticeps in other locations, while for others Clyomys has only one species, C. laticeps. Molecular markers are important tools to access population genetic structure and it’s a powerful tool for species delimitation. Thus, we used mitochondrial an nuclear sequences from 33 individuals sampled in almost all known Clyomys range to evaluate the taxonomic status within the genus. The mitochondrial (Cytochrome b - CytB; Cytochrome c Oxidase Subunit I - COI) and nuclear (von Willebrand Factor - vWF, Growth Hormone Receptor - GHR and Beta Fibrinogen - BFIB) sequences were analyzed using phylogenetic methods based on maximum likelihood and Bayesian Inference. This analyses indicated a possible split into three species within Clyomys: one in São Paulo, one in central Brazil and another in the Pantanal. These results were corroborated by BAPS genetic clustering analysis and by a high probability for three distinct species in BP&P analyzes. Molecular dating based on *Beast species tree analysis indicated a recent speciation of these potential three species during Pleistocene in which the Pantanal lineage diverged first.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Biologia, Departamento de Botânica, Programa de Pós-graduação em Botânica,2015. / Submitted by Tania Milca Carvalho Malheiros (tania@bce.unb.br) on 2015-10-23T12:30:03Z No. of bitstreams: 1 2015_AbelEustáquioRochaSoares.pdf: 14740361 bytes, checksum: 1221c5819287f1d75984a042e1e49fe6 (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2015-10-23T14:04:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_AbelEustáquioRochaSoares.pdf: 14740361 bytes, checksum: 1221c5819287f1d75984a042e1e49fe6 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-23T14:04:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_AbelEustáquioRochaSoares.pdf: 14740361 bytes, checksum: 1221c5819287f1d75984a042e1e49fe6 (MD5) / A família Thuidiaceae pertence ao grupo dos musgos pleurocárpicos e a ordem das Hypnales. É uma família cosmopolita que coloniza substratos diversos e muitos de seus representantes exercem um papel ecológico importante. Estima-se que a família seja composta mundialmente por 72 espécies e 16 gêneros, distribuídas em regiões tropicais e temperadas do mundo. O objetivo deste trabalho é realizar uma revisão taxonômica da família Thuidiaceae para o Brasil; apresentar uma filogenia molecular e construir uma hipótese filogenética com uso de marcadores moleculares para Thuidiaceae a nível mundial e determinar quais caracteres morfológicos informativos para separar os gêneros e espécies de Thuidiaceae. Para tanto a tese está subdividida em quatro capítulos. O primeiro aborda a filogenia molecular da família Thuidiaceae baseada em marcadores de mitocôndria, cloroplasto e núcleo.Neste capítulo foram selecionadas 47 espécies para a extração de DNA. Foram utilizadas três regiões do genoma: rps4, nad5 e 26s. Em todas as análises foipossível observar a monofilia da família Thuidiaceae composta somente pelos gêneros Pelekium, Thuidiopsis e Thuidium e a polifilia de Leskeaceae e demais gêneros antes tradicionalmente agrupados em Thuidiaceae. O segundo capítulo refere-se ao novo arranjo taxonômico dos gêneros Pelekium e Thuidiopsis baseado em marcadores de mitocôndria, cloroplasto e núcleo e em evidências morfológicas.Foram selecionadas 26 espécies de Thuidiaceae para as análises filogenéticas e morfológicas. Marcadores de três regiões diferentes do genoma foram utilizados(rps4, 26S e nad5). Os gêneros Pelekium e Thuidiopsis formam um clado monofilético bem suportado, sugerindo a grande proximidade entre estes dois gêneros e a necessidade de uma nova circunscrição que está sendo apresentada neste estudo baseada em evidências filogenéticas e morfológicas. O terceiro capítulo traz a descrição de uma nova espécie de Thuidium endêmica do Brasil. O quatro é o último capítulo refere-se a revisão taxônomica da família Thuidiaceae no Brasil. Neste último capítulo foram estudadas exsicatas provenientes de diversos herbários nacionais e internacionais e o material-tipo de todas as espécies com registro de ocorrência no Brasil. Neste capítulo estão sendo tratadas 16 espécies e dois gêneros de Thuidiaceae para o Brasil. Duas novas ocorrências para o Brasil e uma nova espécie são apresentadas. / The Thuidiaceae family belongs to the pleurocarpous mosses and the Hypnales Order. It is a cosmopolitan family that colonizes a large tips of substrates, having an important ecological function in their enviroment. 72 species from 16 genus are worldwide estimated for the family distributed in tropical and temperate regions. This work objective is to realize a taxonomic revision of the Thuidiaceae family for Brazil; present a molecular phylogeny build a phylogenetic hypothesis by using molecular markers for the Thuidiaceae in a worldwide level and determine wich informative morphological characters to separate the genus and species of Thuidiaceae. The thesis is divide in four chapters. The first one is about a molecular phylogeny of Thuidiaceae family based on mitochondrial, nucleus and chloroplast markers. 47 species were selected for DNA extraction. Three genome regions were used: rps4, nad5 and 26s. In all the analyzes was possible to identify the monophyly of the Thuidiaceae family compose only by the Pelekium, Thuidiopsis and Thuidium genus and the polyphyly of the Leskeaceae and the traditional genus agrouped in Thuidiaceae. The second chapter refers to new taxonomical arrengement of the Pelekium and Thuidiopsis genus, based in mitochondrial, nucleus and chloroplast markers and in morphological evidences. 26 species from Thuidiaceae were selected for the phylogenetic and morphological analisys. Three regions markers were selected from the genome (rps4,26S and nad5). The Pelekium and Thuidiopsis genus forms a monophyletic clade well suported, sugesting a great proximity between these two genus making necessary a new circunscript that is beeing introduce in this study, using phylogenetical and morphological evidences. The third chapter presents the description of a new Thuidium specie endemic to Brazil. The last and the fourth one refers to a taxonomic review of the Thuidiaceae family in Brazil. In this last chapter, we studied exsiccatae from several national and international herbaria and the type material of all species with occurrence in Brazil. In this chapter we analyze 16 species and two genus of brazilian Thuidiaceae. Two new records of Thuidiceae were found to Brazil and a new specie were discovered and described.

Orientador : João Aristeu da Rosa / Banca: Maria Tercília Vilela de Azeredo Oliveira / Banca: José Clóvis do Prado Júnior / Banca: Marcos Takashi Obara / Banca: Carlos Eduardo de Almeida / Resumo: A subfamila Triatominae compreende 146 espécies, agrupadas em 18 gêneros e cinco tribos. O gênero Triatoma é o mais representativo da subfamília com 80 espécies descritas, as quais estão agrupadas em oito complexos e oito subcomplexos, sendo essa classificação baseada principalmente em características morfológicas. Triatoma rubravaria é considerado um importante vetor na transmissão da doença de Chagas no Estado do Rio Grande do Sul, uma vez que houve um aumento de sua captura e encontros de colônias intradomiciliares após o programa de combate ao T. infestans. Possui hábitos rupestres e é encontrado em buracos e fendas de locais pedregosos, juntamente com T. carcavalloi, T. circummaculata e T.klugi, os quais mostram semelhanças morfológicas. Marcadores moleculares pertencentes ao DNA nuclear, como os espaçadores internos transcritos (ITS) apresentam uma evolução mais rápida, permitindo estabelecer relações recentes ao passo que a grande subunidade ribossomal 28S (D2), por ser bem conservado, permite estabelecer relação entre organismos distantemente relacionados. Marcadores mitocondriais (Citocromo B - CytB e Citocromo Oxidase I - COI) apresentam taxa de mudança dez vezes mais rápida que aquelas apresentadas pelo DNA nuclear, sendo, portanto, úteis para estabelecer relações filogenéticas entre organismos que divergiram recentemente. A análise Bayesiana por meio de sequencias pertecentes ao mtDNA (CytB e COI) reafirmam o posicionamento de espécies no subcomplexo rubrovaria e indica T. carcavalloi como espécie irmã do grupo formado por T. klugi + T. rubrovaria + T. circummaculata. A análise bayesiana de seis populações de T. rubrovaria mostrou a população coletada em Canguçu isolada das demais, sugerindo que se trata de espécie críptica. / Abstract: The subfamily Triatominae comprises 146 species grouped in 18 genera and five tribes. The genus Triatoma is the most representative subfamily with 80 described species, which are grouped into eight complex and eight subcomplexes and this classification being based primarily on morphological characteristics. Triatoma rubravaria is considered an important vector in the transmission of Chagas disease in the state of Rio Grande do Sul since it was detected an increase of their capture and meetings colonies household after the program to combat of T. infestans. T. rubrovaria is found in groves and crevices of rocky areas within T. carcavalloi, T. circummaculata and T.klugi, which show morphological similarities. Molecular markers belonging to the nuclear DNA, as the internal transcribed spacers (ITS) have more rapid evolution, establishing recent relationships while the large ribosomal subunit 28S (D2), being well maintained, allows establishing the relationship between distantly related organisms. Mitochondrial markers (Cytochrome B - CytB and Cytochrome Oxidase I - COI) present a rate of change ten times faster than those presented by nuclear DNA, and are therefore useful for establishing phylogenetic relationships between organisms that diverged recently. A Bayesian analysis using mtDNA sequences belonging to (CytB and COI) reaffirmed the positioning of the species and indicates subcomplex rubrovaria and indicates T. carcavalloi as sister species from the group of T. klugi + T. rubrovaria + T. circummaculata. A Bayesian analysis of six populations of T. rubrovaria showed the population collected in Canguçu isolated from the others, suggesting that they are cryptic species. / Doutor