Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-26T13:20:05Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 338125 bytes, checksum: a3bc0e9074279b843fd7569a7cd7da39 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-26T13:20:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 338125 bytes, checksum: a3bc0e9074279b843fd7569a7cd7da39 (MD5) Previous issue date: 2017-02-24 / Os nematoides-de-galhas causam sérios danos em cultivos de hortaliças no Brasil. As espécies Meloidogyne incognita e Meloidogyne javanica são comumente as mais encontradas em áreas infestadas. A aplicação de extratos aquosos e de óleos essenciais de plantas pode ser opção adicional ao manejo do nematoide-de-galhas. Desta forma, objetivou-se com este trabalho avaliar o potencial nematicida de óleos essenciais e de extratos aquosos de plantas do Cerrado. No Capítulo 1, óleos essenciais de folhas de Ageratum fastigiatum e Callistemon viminalis e de frutos maduros e verdes de Schinus terebinthifolius foram avaliados quanto à sua eficácia na inibição de eclosão e em controlar juvenis de segundo estádio (J 2) de M. javanica em laboratório e no manejo desse nematoide na cultura da alface em campo. No Capítulo 2, extratos aquosos de frutos de Enterelobium gummiferum, folhas e frutos de Stryphnodendron adstringens, folhas de Hancornia speciosa, folhas e ramos de Tapirira guianensis, folhas e ramos de Copaifera langsdroff, folhas de Eremanthus erythropappus, folhas de Hymenaea stigonocarpa e folhas de Dimorphandra mollis foram avaliados quanto à sua ação nematicida em laboratório e em casa de vegetação, usando alface como hospedeiro suscetível. Conclui- se que o óleo de frutos verdes de S. terebinthifolius reduz a eclosão e controla J 2 de M. javanica em laboratório e a aplicação dos óleos essenciais de frutos verdes e maduros de S. terebinthifolius e de folhas de C. viminalis e A. fastigiatum não controla M. javanica em alface em campo infestado com alta densidade do patógeno (média de 554 J 2 /100 cm³ de solo). Em laboratório, extratos de folhas e ramos de C. langsdroff, folhas de T. guianensis e frutos de S. adstringens e E. gummiferum reduzem a eclosão de juvenis de segundo estádio (J 2) de M. javanica, enquanto que extratos de folhas de E. erythropappus e H. stigonocarpa possuem substâncias que controlam J 2. Em casa de vegetação, a aplicação ao solo de extratos de frutos de E. gummiferum, folhas de C. langsdroff, folhas de E. erythropappus e da mistura de extratos de folhas de C. langsdroff e H. stigonocarpa reduz o número de galhas, enquanto que a mistura de extratos de frutos de S. adstringens e folhas de E. erythropappus reduz o número de ovos de M. javanica em raízes de alface. / Root-knot nematodes cause serious damage to vegetable crops in Brazil. Meloidogyne incognita and Meloidogyne javanica are the commonest species found in infested areas. The application of aqueous extracts and essential oils of plants may be an additional option for the management of root-knot nematodes. Thus, we aimed with this research to assess the nematicidal potential of essential oils and aqueous extracts of plants Cerrado. In the Chapter 1, essential oils of leaves of Ageratum fastigiatum and Callistemon viminalis and of green and mature fruits of Schinus terebinthifolius were evaluated in laboratory for their efficacy in inhibiting hatching and control second-stage juevniles (J 2) of M. javanica, and in field for the management of this nematode in lettuce. In the Chapter 2, aqueous extracts of fruits of Enterelobium gummiferum, leaves and fruits of Stryphnodendron adstringens, Hancornia speciosa, Dimorphandra mollis Eremanthus erythropappus, Hymenaea stigonocarpa, leaves and branches of Tapirira guianensis and Copaifera langsdroff were evaluated for their nematicidal action in laboratory and greenhouse, using lettuce as susceptible host. As a conclusion, essential oil of S. terebinthifolius green fruits reduces hatching and control M. javanica J 2 in laboratory and the application of essential oils of green and mature fruits of S. terebinthifolius and leaves of C. viminalis and A. fastigiatum does not control M. javanica in lettuce grown in field with high density of the pathogen (average of 554 J 2 /100 cm³ of soil). In laboratory, extracts of leaves and branches of C. langsdroff, leaves of T. guianensis and fruits of S. adstringens and E. gummiferum reduce J 2 hatching, while leaf extracts of E. erythropappus and H. stigonocarpa contain substances that control M. javanica J 2. In greenhouse, soil application of fruit extracts of E. gummiferum, leaves of C. langsdroff and E. erythropappus and the mixture of leaf extracts of C. langsdroff and H. stigonocarpa reduces the number of galls, while the mixture of extracts of S. adstringens fruits and E. erythropappus leaves reduce the number of M. javanica eggs in lettuce roots.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-20T18:42:52Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 502635 bytes, checksum: 3d459feebbf0f27372e1bb496c77054c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-20T18:42:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 502635 bytes, checksum: 3d459feebbf0f27372e1bb496c77054c (MD5) Previous issue date: 2009-02-17 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / O biocontrole do mofo cinzento em condições de campo é viável, este fato é comprovado pelo acúmulo de informações quanto ao antagonismo de C. rosea a B. cinerea. Porém, demanda-se otimizar a produção massal do antagonista, bem como obter formulação de baixo custo e estável no tempo. Nesse trabalho, objetivou-se desenvolver metodologia para produzir C. rosea. Avaliaram-se diferentes substratos, a otimização da produção, o tempo ótimo de produção, a suplementação do substrato, a concentração do inóculo inicial, a produção de esporos na ausência de luz e a produção de esporos em diferentes recipientes. Milheto, palha de soja e palha de feijão foram substratos eficientes na produção, que foi afetada pelo nível de umidade em cada substrato. A adição de suco de vegetal (V8 ® ) aumentou a esporulação em substrato arroz. Abrindo-se o recipiente após 6 dias de colonização, antecipou-se o tempo do início da coleta e maior produção de esporos. A faixa de concentração inicial testada (10 3 a 10 8 ) não afetou a produção final de esporos. Não houve diferença significativa entre a produção de esporos na ausência de luz e com fotoperíodo de 12 h, aos 30 dias de colonização. Avaliou-se, ainda, a sobrevivência de esporos de C. rosea, armazenados a 4°C ou temperatura ambiente após diferentes tempos de secagem (12, 24, 36 e 48 h) com dois diluentes (água e sacarose 35%). Também se avaliou a sobrevivência dos esporos em substrato moído, com ou sem Caolin, armazenados a 4°C ou temperatura ambiente. Após 4 meses, avaliou-se a capacidade destes esporos em colonizar folhas de eucalipto. A germinação dos esporos submetidos a diferentes tempo de secagem reduziu-se a zero após dois meses de avaliação, independente do tratamento. Em substrato moído, ocorreu aumento significativo da germinação na presença de caolim, armazenamento a 4°C no primeiro mês de avaliação, mas a germinação reduziu-se a zero após dois meses de avaliação. Realizou-se teste de colonização em folhas de eucalipto com esporos em que a porcentagem de germinação foi zero, e os esporos colonizaram-nas. Portanto, é possível ocorrer a dormência dos esporos, o que será estudado posteriormente. / It is believed that the biocontrol of gray mold with C. rosea under field conditions is viable. However mass production of the antagonist must be optimized and a formulation of low cost and stable over time must be developed. Therefore this research aimed to develop methods to produce and commercialize C. rosea in a commercial scale. We evaluated different substrates, the optimization to production, the optimum time to production, the supplementation of substrate, the initial inoculum concentration, the production of spores on absence of light, and the production of spores in different containers. Millet, soybean straw, and bean straw were efficient as substrates to produce spores, which was affected by the level of moisture on each substrate. The addition of V8 ® vegetable juice increased the sporulation on rice. The opening of the container after 6 days of colonization reduced the time to start to collect spores and increased spores production. The range of initial concentration tested (10 3 to 10 8 ) did not affect the final spores production. After 30 days, it was found no significant difference between the production of spores on absence of light and photoperiod of 12h. We also evaluated the survival of spores of C. rosea in a formulation stored at 4°C or laboratory temperature (24±2°C) after different drying times (12, 24, 36 and 48 h) with two solvents (water and sucrose 35%). The survival of spores in ground substrate, with or without Kaulin, stored at 4°C or environment temperature was evaluated. The ability of these spores to colonize leaves of eucalyptus was also evaluated after 4 months storage. The germination of formulated spores of all treatments reduced to zero after 2 months of evaluation. In the ground substrate, germination significantly increased in the presence of Kaulin, storage at 4°C, at the second month of evaluation, but it was zero after 2 months of evaluation. However the fungus colonized eucalyptus leaves even after the formulated spores being stored for 4 months storage. Therefore, it is possible that the spores become dormant, which will be studied later. / Dissertação liberada do sigilo pelo Orientador em 29 de novembro de 2016. Documento anexado ao Termo de Autorização.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-06-03T09:02:33Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1143803 bytes, checksum: 0c14d3843edd0185ace5121513e595e2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-03T09:02:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1143803 bytes, checksum: 0c14d3843edd0185ace5121513e595e2 (MD5) Previous issue date: 2015-09-18 / A podridão branca, causada pelo fungo Sclerotium cepivorum, é uma das principais doenças, que ocorre em todo o mundo, que pode causar graves perdas nos cultivos de alho (Allium sativum L.) e cebola (Allium cepa L.). Escleródios de S. cepivorum são capazes de sobreviver por até 30 anos no campo. A gama de hospedeiros do fungo compreende plantas do gênero Allium e a germinação dos escleródios é induzida pela presença de exsudatos Allium, especialmente em solos úmidos e sob condições de temperatura entre 13 – 18 ° C. A erradicação do patógeno de áreas infestadas é muito difícil e a densidade de escleródios viáveis deve ser reduzida por meio de estratégias diferentes, tais como indutores de germinação e fungicidas. A aplicação de extratos de alho em campos de pousio pode induzir escleródios a germinarem e diminuir o número de estruturas de sobrevivência viáveis. Fungicidas podem inibir a germinação de escleródios e crescimento micelial. Assim, o efeito do extrato de alho e dialil dissulfeto (DADS) sobre a germinação de esclerócios de S. cepivorum e o potencial de fungicida sobre a inibição do crescimento micelial foi avaliado neste trabalho. Extrato aquoso e etanólico de alho preparados em laboratório (20 % m:v), as águas residuais de agroindústria de alho e extrato aquoso produzido por Shimada Agronegócios (20 %, m:m) foram utilizados como indutores de germinação aos 17 e 27 °C em laboratório. Além disso, o efeito de DADS em estimular a germinação de escleródios foi avaliada usando tubos plásticos com solo e contendo escleródios enterrados a 10, 20 e 30 cm de profundidade. Todos os extratos de alho induziram a germinação dos escleródios, independentemente da temperatura avaliada. DADS induziu a germinação de escleródios de 10 a 30 cm de profundidade, embora o efeito tenha sido maior sobre escleródios localizados a 10 cm. Em outro experimento, o fungicidas tebuconazol + trifloxystrobina, trifloxistrobina + protioconazol, tebuconazol, triadimenol, tiofanato metílico e fluazinam foram adicionados a meio batata dextrose agar (BDA) + extrato aquoso de alho (20 % m:m) em volumes equivalentes a 200 e 20.000 L/ha. Discos de micélio de 5 mm de diâmetro de S. cepivorum foram removidos da borda de culturas do fungo com 15 dias de idade em BDA e colocadas no centro de placas de Petri contendo BDA + extrato de alho, com ou sem fungicidas. O fungo foi incubado a 17 ± 2 oC por 30 dias, quando o crescimento mycelial foi avaliado. Todos fungicidas reduziram o crescimento do fungo em mais de 90 %. Os fungicidas triadimenol e fluazinam inibiram completamente o crescimento de S. cepivorum, independemente do volume da solução fungicida. A eficácia de tebuconazol e tebuconazol + trifloxistrobina foi reduzida quando o volume da solução foi aumentada de 200 para 20.000 L. Extratos de alho, residuo de agroindústria de alho e DADS induzem a germinação de escleródios de S. cepivorum. Triadimenol, fluazinam, tebuconazol e tebuconazol + trifloxistrobina suprimem o crescimento de S. cepivorum in vitro, especialmente em volume de soluçãofungicida equivalente a 200 L.ha -1 . Estudos adicionais em campo são necessários para avaliar o uso integrado de extratos de alho, DADS e os fungicidas triadimenol, fluazinam, tebuconazol e tebuconazol + trifloxistrobina no manejo da podridão branca. / White rot, caused by the fungus Sclerotium cepivorum, is a major disease worldwide that can cause severe losses in garlic (Allium sativum L.) and onion (Allium cepa L.). Sclerotia of S. cepivorum are able to survive for up to 30 years in the field. The host range of the fungus comprises plants from the genera Allium and the sclerotia germination is induced by the presence of Allium exsudates, especially in moist soils and at 13 – 18 °C. Since eradication of the pathogen from infested areas is very difficult, the density of viable sclerotia must to be reduced by using different strategies, such as germination inducers and fungicides. The application of garlic extracts at fallow fields may induce sclerotia germination and decrease the number of viable resting propagules. Fungicides may inhibit sclerotia germination and mycelial growth. Thus, the effect of garlic extract and diallyl disulfide (DADS) on the germination of sclerotia of S. cepivorum and the potential of fungicides on the inhibition of mycelial growth were evaluated in this work. Aqueous and ethanolic extracts of garlic prepared in laboratory (20 % m:v), wastewater of garlic agroindustry and aqueous extract produced by Shimada Agronegócios (20 % m:m) were used as germination inducers at 17 and 27 °C in laboratory. In addition, the effect of DADS in stimulating germination of sclerotia was assessed using plastic tubes filled with soil and containing sclerotia buried at 10, 20 and 30 cm depth. All extracts stimulated sclerotia germination, regardless the temperature. DADS induced germination of sclerotia at 10 to 30 cm depth, although the effect was higher at 10 cm. In other experiment, the fungicides tebuconazole + trifloxystrobin, trifloxystrobin + protioconazole, tebuconazole, triadimenol, thiophanate methyl and fluazinam were added into potato dextrose agar (PDA) + garlic aqueous extract (20 % m:m) broth at dosages equivalent to 200 and 20.000 L.ha -1 . Mycelial discs (5 mm in diameter) of S. cepivorum were removed from the border of 15 day cultures in PDA cultures and placed on the center of Petri dishes with PDA+garlic aqueous extract, amended or not with fungicides. The fungus was incubated at 17 ± 2 oC for 30 days, when the mycelial growth was assessed. All fungicides reduced the growth of the fungus by more than 90 %. The fungicides triadimenol and fluazinam inhibited completely the growth of S. cepivorum, regardless the volume of the solution. The efficacy of tebuconazole and tebuconazole + trifloxystrobin was reduced when the volume of the soultion was increased from 200 to 20.000 L. Garlic extracts, wastewater of garlic agroindustry and DADS induce germination of sclerotia of S. cepivorum. Triadimenol, fluazinam, tebuconazole and tebuconazole+trifloxystrobin suppress the growth of S. cepivorum in vitro, especially at the volume of fungicide solution equivalent to 200 L.ha -1 . Further studies under field conditions are needed to evaluate the integrated use of garlic extracts, DADS and the fungicides triadimenole, fluazinam, tebuconazole and tebuconazole + trifloxystrobin on the management of the white rot. / Ficha catalográfica com ano de aprovação diferente.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-06-14T16:52:05Z No. of bitstreams: 1 resumo.pdf: 816628 bytes, checksum: 982ed6172c49e36cd012121025ce45a2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-14T16:52:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 resumo.pdf: 816628 bytes, checksum: 982ed6172c49e36cd012121025ce45a2 (MD5) Previous issue date: 2006-05-30 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Efetuaram-se levantamentos da microbiota fitopatogênica associada às seguintes plantas daninhas nativas do Brasil: Mitracarpus hirtus (Rubiaceae), Palicourea marcgravii (Rubiaceae). Pereskia aculeata, (Cactaceae), Psidium catleianum (Myrtaceae) e Tradescantia fluminensis (Commelinaceae). Tais levantamentos foram conduzidos em todos os estados do sudeste e sul do país, visando a busca por potenciais agentes de controle biológico destas importantes invasoras. A seleção dos locais a serem visitados para coleta foi feita com base nos registros de ocorrência das plantas-alvo nos principais herbários nacionais e nos dados de clima de cada região. Quando possível, as coletas foram feitas nos diversos tipos climáticos onde a planta-alvo ocorria. Trinta espécies fúngicas, associadas às essas quatro plantas-alvo, foram identificadas. Dentre essas as seguintes novidades taxonômicas: um novo gênero, 15 novas espécies e uma nova variedade. Além disto. dentre os demais fungos coletados, 11representaram novos registros geográfico para o Brasil ou registros de novo hospedeiro para o taxon. Em M. Hirtus, duas novas espécies fúngicas, Cercospora mitracarpi-hirti e Puccinia mitracarpii , destacaram-se como possíveis agentes de biocontrole desta espécie invasora em ambiente exóticos. Somente uma nova espécie de pseudocercospora e uma espécie de ferrugem foram encontradas atacando P. Marcgravii. Nenhum destes parece ter potencial para utilização no controle biológico. Para P. Aculeata, a ferrugem Uromyces pereskiae e uma nova espécie de Pseudocercospora, destacaram-se como potenciais agentes de biocontrole. No entanto, o ciclo de vida de U. Pereskiae necessita de mais estudos para a sua utilização como agente de controle biológico clássico. Para P. Cattleianum, dentre as 9 espécies encontradas, as duas Mycosphaerellaceae, Stenella sp. e Mycosphaerella sp., destacaram-se para o controle biológico dessa planta, reconhecida como responsável por alguns dos piores problemas de invasões biológicas no mundo, particularmente em ilhas oceânicas. / A survey of the pathogenic mycobiota of the following weed species native to Brazil was performed: Mitracarpus hirtus (Rubiaceae), Palicourea marcgravii (Rubiaceae). Pereskia aculeata, (Cactaceae), Psidium catleianum (Myrtaceae) e Tradescantia fluminensis (Commelinaceae). This survey was conducted in all states in South and Southeastern Brazil and the principal aim was the discovery of potential biocontrol agents to be used against these weeds. Selection of localities to be visited was made after a compilation of records of occurrences of the target-plants in the main Brazilian herbaria and a study of climatic maps of Brazil. Based on this iinformation it was then attempted to select areas representing the various kinds of climate where the target-plants occur in nature. Thirty fungal species were collected in association with the four target-plant species. Among these the following taxonomic novelties were found: One new genus, 15 new species and one new variety. Moreover, among the other fungi that were collected 11 represented new geographic records for Brazil or new host-pathogen associations. Two new fungal species werw found on M hirtus: Cercospora mitracarpi-hirti and Puccinia mitracarpii. Both are recognized as having potential interest as classical biocontrol agents. Only two fungal species were found attacking P. Marcgravii: a new species of Pseudocercospora and an already known rust species. None seem to have biocontrol potential. Pereskia aculeata, had two fungal pathogens associated whith it that appeared to have potential as biocontrol agents: Uromyces pereskiae and a new species of Pseudocercospora. Nevertheless, before U. Pereskiae ais further considered as a potential biocontrol agent, its life-cycle needs further clarification as only the uredinial and telial stages of this rust seem to be known, contrary to what has been published by other authors. Nine new fungal species were found to have P. Cattleianum as a host. Among these two members of the Mycosphaerellaceae – Stenella sp. and Mycosphaerella sp. - appeared to have good potential as biocontrol agents for this very important weed, which causes some of the worst known biological invasions in the world, particularly in oceanic islands / Tese antiga, sem PDF completo. Somente resumo.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-08-22T11:11:06Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 7208096 bytes, checksum: b47fc09fb64969fdb3686851115041b9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-22T11:11:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 7208096 bytes, checksum: b47fc09fb64969fdb3686851115041b9 (MD5) Previous issue date: 2016-02-18 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os fungos conhecidos pela denominação informal de cercosporóides são um dos maiores grupos de microfungos, compreendendo mais de 2000 espécies e englobando diversos gêneros de formas assexuais tendo como correspondente fase assexuada formas ascosporogênicas que eram tradicionalmente classificadas no gênero Mycosphaerella e equivalentes. Possuem distribuição cosmopolita e são altamente diversos especialmente nos países tropicais e subtropicais. Fungos cercosporóides podem ser encontrados como saprófitas, hiperparasitas sendo muito comuns como patógenos de plantas – causando, sobretudo manchas foliares. Diversas doenças importantes de plantas cultivadas são causadas por fungos cercosporóides. Nos últimos anos, a aplicação de técnicas moleculares ao estudo dos cercosporóides gerou novas informações que estão auxiliando o melhor entendimento das relações filogenéticas dentro desse grupo levando a uma re-estruturação do sistema de classificação deste grupo de fungos com rearranjos, fusão de gêneros e reconhecimento de novos gêneros. O presente estudo pretendeu contribuir para estender essa abordagem para cercosporóides já conhecidos no Brasil e novos taxa coletados em trabalhos de campo. Um total de 27 Pseudocercospora spp., 7 Passalora spp., 4 Zasmidium spp. e 1 Sirosporium foram coletados, isolados em cultura pura, sequenciados e submetidos a análises filogenéticas multigênicas. Quatro regiões genômicas (LSU, ITS, tef1 e actA) foram utilizadas para realização de uma análise Bayesiana com o alinhamento das regiões combinadas ITS, actA e tef1. Os resultados obtidos associando filogenia, morfologia e características da cultura revelaram uma rica diversidade incluindo dezoito novas espécies a serem propostas, a saber: Pseudocercospora aeschynomenicola, Ps. diplusodonii, Ps. emmotunicola, Ps. manihotii, Ps. perae, Ps. planaltinensis, Ps. pothomorphes, Ps. sennae-multijugae, Ps. solani-pseudocapsicicola, Ps. vassobiae, Ps. wulffiae, Ps. xylopiae, Passalora dasyphyllii, Sirosporium tocoyenae, Zasmidium aspidospermae, Z. brosimii, Z. peixotoana e Z. roupalina. Onze epitipos foram designados, para as espécies: Pseudocercospora bixae, P. chamaecristae, P.exilis, P. luzardii, P. plumeriifolii, P. richardsoniicola, P. rigidae, P. struthanthi, Passalora schefflerae, Pa. rubida e Pa. vicosae. Três dentre os taxa encontrados representam novos relatos para o Brasil, respectivamente: Ps. euphorbiacearum, Ps. tecomicola, Ps. trinidadensis e vários hospedeiros foram relatados como representando novas associações com cercosporóides de ocorrência já conhecida anteriormente no Brasil. Adicionalmente, o posicionamento filogenético de Camptomeris leucaenae foi investigado pela primeira vez baseado em sequências da região LSU. Confirmou-se que C. leucaenae pertence à família Mycospaerellaceae (Capnodiales, Dothideomycetes), situando-se próximo de Cymadothea trifolii, patógeno de uma leguminosa nativa da Europa. O presente estudo é uma contribuição para uma abordagem moderna para a compreensão com base em dados moleculares da sistemática de cercosporóides do Brasil. Foram geradas informações morfológicas e moleculares para 40 taxa, representando apenas uma pequena fração da diversidade de espécies de cercosporóides conhecida no país. Muitas espécies de cercosporóides descritas ou relatadas por micologistas no Brasil no passado precisam ser recoletadas para se consolidar um entendimento mais preciso desse importante grupo de fungos. / Fungi cercosporoid are one of the largest groups of microfungi, with over than 2000 associated names, including several genera of Mycosphaerella and Mycosphaerella-like sexual morph. The cercosporoids are cosmopolitan fungi and are highly diverse especially in tropical and subtropical countries. Cercoporoid fungi vary from being saprobic, hyperparasitic and plant pathogenic, in the last case they are known to causes several important diseases in several crops. In the last years, the taxonomy of cercosporoid fungi has undergone significant changes. The application of molecular techniques have generated new informations that are helping the understanding of the phylogenetic relationships leading to a re-structuration of the classification system of this group of fungi with rearrangements, fusion of genera and recognition of new genera as distinct. In this study, a total of 27 Pseudocercospora spp., 7 Passalora spp., 4 Zasmidium spp. and one Sirosporium were collected, cultivated and subjected to a multigene analysis. Four genomic regions (LSU, ITS, tef1 and actA) were used to performed a Bayesian analysis with combined ITS, actA and tef1 sequence alignment. Our results based on DNA phylogeny integrated with morphology, revealed a rich diversity with eighteen new species to be described, namely: Pseudocercospora aeschynomenicola, Ps. diplusodonii, Ps. emmotunicola, Ps. manihotii, Ps. perae, Ps. planaltinensis, Ps. pothomorphes, Ps. sennae-multijugae, Ps. solani-pseudocapsicicola, Ps. vassobiae, Ps. wulffiae, Ps. xylopiae, Passalora dasyphyllii, Sirosporium tocoyenae, Zasmidium aspidospermae, Z. brosimii, Z. peixotoana and Z. roupalina. Eleven epitype specimens were designated, Pseudocercospora bixae, P. chamaecristae, P.exilis, P. luzardii, P. plumeriifolii, P. richardsoniicola, P. rigidae, P. struthanthi, Passalora schefflerae, Pa. rubida and Pa. vicosae, three species newly reported, Ps. euphorbiacearum, Ps. tecomicola, Ps. trinidadensis and several new host records linked to known cercosporoid in Brazil. Additionally, the phylogenetic position of Camptomeris leucaenae was investigated for the first time based in sequences of the large subunit ribosomal (LSU). This study confirmed that C. leucaenae belongs to Mycosphaerellaceae s. str. (Capnodiales, Dothideomycetes) and is closely related to Cymadothea trifolii a pathogen a native leguminous plant from Europe. The present study represents the first organized effort towards generating molecular data to support the taxonomy of cercosporoid from Brazil. It yielded information for 40 taxa, representing only a small fraction of yet unknown species diversity in the country. Many additional species still need to be collected and recollected to enable a better understanding of systematic of cercosporoid fungi in Brazil.

ALVES, E. S. Ocorrência da resinose do cajueiro afetada pelas condições edafoclimáticas. 2012. 65 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia/Fitotecnia) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2012. / Submitted by Francisco Lacerda (lacerda@ufc.br) on 2014-07-01T19:43:03Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_esalves.pdf: 1722269 bytes, checksum: f8703350e7bbf5d5e5ef8f6370a27058 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2014-07-02T18:53:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_esalves.pdf: 1722269 bytes, checksum: f8703350e7bbf5d5e5ef8f6370a27058 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-07-02T18:53:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_esalves.pdf: 1722269 bytes, checksum: f8703350e7bbf5d5e5ef8f6370a27058 (MD5) Previous issue date: 2012 / The cashew plant is an anacardeaceae commonly found all over tropical regions of the world. The cashew crop is a highly important source of income and social development in northeast Brazil. Cashew nut production have been oscillating in recent years mainly due to heterogeneity of population, climatic variations and the lack of inadequate cropping practices. Disease epidemics also play a very important role in this scenery. The cashew gummosis, caused by Lasiodiplodia theobromae, is recognized as the most important disease of cashew plant in northeast Brazil, which may bring about the complete decline of orchards within few years. The knowledge of environmental conditions associated with gummosis occurrence will surely contribute to the understanding of host-pathogen interaction. Based on that, this work aimed to establish the relationship among the environmental factors in regions characterized by different levels of gummosis with disease incidence. Data of rainfall, maximum and minimum temperature, temperature range, soil, and altitude of 13 regions characterized by four different levels of gummosis incidence (0 = no report, 1 = rare, 2 = frequent, 3 = always present) were used in this study. The Mann-Whitney test was used in addition to correlation analyses, admitting 5% significance level. Maximum, minimum, temperature range, altitude, and deep and well-drained soils were associated with high incidence of gummosis. / O cajueiro é uma anacardiácea encontrado em praticamente todo o mundo tropical. A cajucultura é de enorme relevância social para o Nordeste brasileiro já que é responsável pela geração de renda para a população. A produção vem oscilando muito nos últimos anos devido à heterogeneidade dos pomares antigos e a ausência de manejo adequado para a cultura. As doenças acabam por desempenharem importante papel nesse cenário. A resinose do cajueiro causada pelo fungo Lasiodiplodia theobromae é tida como a principal doença no semiárido nordestino e caracteriza-se pela inviabilização do pomar em poucos anos. O conhecimento das condições de ambiente que possam ser associados a processos infecciosos poderá contribuir para elucidação da interação patógeno-hospedeiro. Nesse sentido, este trabalho tem como objetivo estabelecer associações de fatores edafoclimáticos a diferentes zonas de severidade para o patossistema da resinose do cajueiro. Foram comparados dados climáticos, tais como, precipitação pluviométrica, temperatura máxima, mínima, amplitude térmica, como também características de solo, clima e altitude, de 13 municípios nordestinos classificadas em quatro zonas de severidade para a resinose: 0 (sem observação), 1 (observação rara), 2 (observação frequente) e 3 (ocorrência generaliza). Para tanto, utilizou-se do teste de Mann-Whitney além de correlações sendo admitidos 5% de nível de significância. A temperatura máxima, mínima, amplitude térmica, a altitude, além de solos profundos e bem drenados foram associadas às diferentes áreas de ocorrência da resinose.

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:29:50Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-05-06. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:33:55Z : No. of bitstreams: 1 000856518_20170619.pdf: 389927 bytes, checksum: 4be3b8327beb9325c295271ea9eaffa2 (MD5) Bitstreams deleted on 2017-06-19T16:12:33Z: 000856518_20170619.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-06-19T16:13:18Z : No. of bitstreams: 1 000856518.pdf: 1255973 bytes, checksum: 911854ad6a713ea1a328b649f79c9d4d (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Xanthomonas. citri subsp. citri (Xac) é o agente causal do cancro cítrico, uma das doenças mais graves que afetam plantas cítricas de importância comercial em todo o mundo. O controle eficaz para o cancro cítrico constitui na eliminação de plantas infectadas em programas rigorosos para conter a propagação da bactéria. No entanto, o relaxamento recente nas políticas para combater cancro cítrico em áreas como o estado de São Paulo - Brasil, está a contribuir para a propagação da doença. O conhecimento da biologia deste patógeno de plantas e também dos mecanismos envolvidos na interação planta-patógeno são de grande importância para apoiar o desenvolvimento de estratégias para lidar com o cancro cítrico. Um trabalho recente de nosso grupo demonstrou que os mutantes X. citri com disrupção do gene parB são comprometidos na segregação cromossômica e na capacidade de produzir os sintomas da doença na planta. No presente trabalho, nós estendemos nossas caracterizações, avaliando os efeitos da falta de parB em mutantes X. citri através de uma deleção limpa. ParB é uma proteína de ligação ao DNA e está envolvida no processo de segregação cromossômica através de interação com outras proteínas. Devido à dificuldade de deleção de genes envolvidos neste processo em X. citri, o nocaute de parB foi realizado numa variante abrigando um plasmídeo replicativo capaz de expressar cópias extras de ParB (ParB-TAP) sob o controle de para (promotor de arabinose). A viabilidade de X. citri parB nocaute (XacΔparB-pLAC2) foi avaliada em experimentos de curva de crescimento e em comparação com a estirpe do tipo selvagem, em condições de repressão ou de indução de parB-tap ligado a este promotor; O objetivo foi explorar as condições de depleção e superexpressão de ParB e seus efeitos através da caracterização do referido promotor. Em seguida, X. citri parB nocaute foi visualizado por microscopia de... / Xanthomonas citri ssp. citri (Xac) is the causal agent of citrus canker, one of the most severe diseases that affect citrus plants of commercial importance around the world. An effective control for citrus canker constitutes the elimination of infected plants in rigorous programs to contain the spread of the bacteria. However, recent relaxation in the policies to combat citrus canker in areas such as the state of São Paulo, Brazil, the major orange juice producer in the world, are contributing to the spread of the disease. Therefore, knowledge of the biology of this plant pathogen and also of the mechanisms involved in plant-pathogen interaction are of great importance to support the development of strategies to deal with citrus canker. Recent work from our group demonstrated that X. citri mutants disrupted for parB are compromised in chromosome segregation and are unable to produce disease symptoms in plant. In the present work, we extended our characterizations by evaluating the effects of a lack of ParB in X. citri mutants carrying a clean deletion of its coding DNA. ParB is a DNA binding protein and is involved in chromosome segregation process through interaction with other proteins. Because of difficult in genes deletion involved this process in X. citri, the parB gene was deleted in a X. citri variant harboring a replicative plasmid able to express extra copies of ParB (ParB-TAP) under the control of the para (arabinose promoter). The viability of the X. citri parB knockout was assessed in growth curve experiments and compared with the wild type strain under different conditions of parB-tap repression or induction. The aim was to explore the conditions depletion and overexpression of ParB and its effects through the characterization of para in X. citri Thus, the X. citri parB knockout was visualized under differential interference contrast (DIC) microscopy in order to detect morphological alterations normally expected from ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-02-16Bitstream added on 2014-06-13T18:29:23Z : No. of bitstreams: 1 ozatojunior_t_me_sjrp.pdf: 797973 bytes, checksum: 60aec21696ccdd3f5f3f798127a445e0 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O presente trabalho consistiu no seqüenciamento e caracterização molecular das Cadeias Abertas de Leitura (Open Reading Frames - ORFs) 2 e 3 do genoma do isolado São Paulo do Southern bean mosaic virus (SBMV-SP), completando-se o seqüenciamento de todo o genoma desse isolado. A ORF 2 codifica uma poliproteína (serino protease – VPg – RNA polimerase RNA-dependente) e a ORF 3 um produto com função desconhecida. O seqüenciamento da ORF 2 apresentou 2889 nucleotídeos, incluindo-se o códon de terminação UGA, com 962 aminoácidos deduzidos e massa molecular estimada de aproximadamente 105 kDa. Dentro da ORF 2, localiza-se a ORF 3 contendo 398 nucleotídeos, incluindo-se o códon de terminação UAA, com 132 aminoácidos e massa molecular estimada de aproximadamente 15 KDa. A análise feita a partir das seqüências das ORFS 2 e 3 do genoma do SBMV-SP, quando comparadas com outras espécies do mesmo gênero e isolados do SBMV, depositadas no GenBank, mostrou que a ORF 2 apresenta maior identidade (91,4% na seqüência de nucleotídeos e 95,0% na seqüência de aminoácidos deduzidos) com o isolado de Arkansas. Resultado similar foi obtido em relação à ORF 3 com valores de identidade de 97,0% tanto para as seqüências de nucleotídeos e aminoácidos deduzidos. Dados de filogenia corroboram os dados de identidade. Regiões conservadas do gênero Sobemovirus também foram identificadas, tais como Sítio de Ligação à Capa Protéica (CBPS), a tríade catalítica da serino protease (H-D-S) e a seqüência de heptanucleotídeos (TTTAAAC). A expressão em Escherichia coli da porção C-terminal da RNA Polimerase RNA Dependente (RpRd) produziu uma proteína de fusão de aproximadamente 67 kDa no sistema pMAL c2-x e de 30 kDa no sistema pET 28a. Quando a proteína de fusão foi injetada em coelhos houve a produção de anti-soro específico para a proteína recombinante. / The present work consisted of the sequencing and molecular characterization of the Open Reading Frames (ORFs) 2 and 3 from the São Paulo isolate genome of Southern bean mosaic virus (SBMV-SP), completing the sequencing of all the genome of this isolate. The ORF 2 encodes a polyprotein (serine protease - VPg - RNA dependent RNA polimarase) and the ORF 3 one product with unknown function. The sequencing of the ORF 2 reveals 2889 nucleotides, including the stop codon (UGA), with 962 deduced amino acids e and estimated molecular weight of approximately 105 kDa. Nested in the ORF 2 were found the ORF 3 with 398 nucleotides, including the stop codon (UAA), with 132 deduced amino acids and estimated molecular weight of approximately 15 kDa. The analysis made from the sequences of the ORFs 2 and 3 from the SBMV-SP genome, when compared with other species of the same gender and isolates of SBMV, deposited in the GenBank, showed that the ORF 2 presents higher identity (91,4% in the nucleotide sequence and 95,0% in the deduced amino acids sequence) with Arkansas isolate. Similar result was obtained in relation to the ORF 3 with identity values of 97,0% for the nucleotides and deduced amino acids sequences. Phylogeny data corroborate the identity data. Conserved regions of the Sobemovirus gender had also been identified such as Coat Protein Binding Site (CPBS), serine protease catalytic triad (H-D-S) and heptanucleotide sequence (TTTAAAC). The Expression in Escherichia coli of the C-terminal region of the RNA dependent RNA polimerase produced a fusion protein of approximately 67 kDa in pMAL c2-x system and a 30 kDa protein in pET 28a system. When the fusion protein ...(Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2015-08-20T17:09:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-20T17:27:23Z : No. of bitstreams: 1 000199389.pdf: 584941 bytes, checksum: 5a9337c1a6d76389fabc4039dfce878f (MD5) / A bactéria Xanthomonas axonopodis pv. citri é um fitopatógeno causador do cancro cítrico que compromete parte da produção de laranjas do Estado de São Paulo, com reflexos negativos para a economia do Estado e do País. Para que haja um controle futuro do cancro cítrico, vários pesquisadores se empenharam no Projeto Genoma-Xanthomonas visando desvendar o conjunto gênico desta bactéria e fornecer subsídios para a identificação dos genes envolvidos com a sua patogenicidade. Neste sentido, o atual trabalho visa o monitoramento da expressão gênica do patógeno quando submetido a diferentes condições ambientais, tais como variações no pH extracelular e antibacterianos utilizando o Differential Display RT - PCR. Deste modo, obtivemos a expressão de genes importantes quando o microrganismo foi submetido ao pH 8.0 tais como: um gene relacionado a um transportador MFS, valina - piruvato aminotransferase, glucano 1,4--glucosidase e uma proteína hipotética conservada. Quando submetida à agentes inibidores como a ampicilina, a Xanthomonas expressou proteínas como a integrase, proteína de virulência e uma fosforibosilformilglicinamida ciclo ligase. Quando em meio de cultura contendo penicilina, a bactéria expressou o gene da tirosil t-RNA sintetase. Há um grande interesse em desvendar os mecanismos de ataque da Xanthomonas axonopodis pv. citri, na sua interação com o vegetal e também suas estratégias para inibir o sistema de defesa do hospedeiro, promovendo o surgimento da doença. Neste sentido, espera-se que estes resultados, adicionados a outros projetos funcionais, possam fornecer informações quanto ao mecanismo de defesa da Xanthomonas, bem como da interação planta-bactéria e conseqüentemente auxiliar no controle do cancro cítrico. / The bacterium Xanthomonas axonopodis pv. citri is a pathogen causing citric canker that compromises part of the orange production in the State of São Paulo, with negative consequences for the economy of the State and the Country. For the future control of citric canker, several investigators participated in the Xanthomonas Genome Project in order to determine the gene set of this bacterium and to contribute to the identification of the genes involved in its pathogenicity. In this respect, the objective of the current study was to monitor the gene expression of the pathogen when submitted to different environmental conditions such as variation in extracellular pH, and to different antibacterial agents using Differential Display RT-PCR. Using this method we obtained the expression of important genes when the bacteria were submitted to pH 8.0, such as a gene related to an MFS transporter, valine-pyruvate aminotransferase, glucan 1,4--glucosidase and a conserved hypothetical protein. When submitted to the action of inhibitory agents such as ampicillin, Xanthomonas expressed various proteins, i.e., integrase, virulence protein and a phosphoribosylformylglycinamide cycloligase. In a culture containing penicillin, the bacteria expressed the gene of tyrosyl t-RNA synthetase. There is great interest in determining the mechanisms of attack of Xanthomonas axonopodis pv. citri, its interaction with plants and also the strategies it uses to inhibit the defense system of the host, promoting the onset of the disease. In this respect, the present results, added to those obtained in other functional projects, are expected to provide information about the defense mechanism of Xanthomonas and about the plant-bacterium interaction in order to contribute to the control of citric canker

Made available in DSpace on 2015-09-17T15:24:45Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-12-11. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:47:21Z : No. of bitstreams: 1 000846547.pdf: 2363942 bytes, checksum: 9e3e3a053eea57e0c35038173c728430 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A videira é a frutífera economicamente mais importante no mundo e é cultivada para que seus frutos produzam uvas de mesa, suco, e uvas passas. As bagas da videira são também a base para o alto valor agregado dos vinhos e outras bebidas alcoólicas. O Rupestris stem pitting associated virus - RSPaV foi identificado como o agente causador da doença do lenho estriado ou cascudo (Rupestris stem pitting - RSP), um dos componentes do complexo do lenho rugoso da videira (Rugose wood - RW). Esta doença é transmitida por enxertia e constitui uma das viroses de videira mais disseminadas no mundo, sendo descrita no Brasil no final dos anos 60. Devido à dificuldade de purificação das partículas virais a partir da videira infectada, a expressão em larga escala da proteína capisidial do RSPaV em bactérias é uma estratégia promissora para o entendimento de suas propriedades. A cultura do feijão também tem produtividade grandemente afetada pela ocorrência de doenças que diminuem a produção e, conseqüentemente, reduzem a sua oferta, provocando um aumento nos preços de mercado. No Brasil, foram descritas mais de dez viroses em feijoeiro, citando-se aquela causada pelo Southern bean mosaic virus (SBMV) do gênero Sobemovirus. Este vírus tem uma restrita gama de hospedeiras, confinada quase exclusivamente a espécies da família das leguminosas, sendo algumas de interesse econômico como o feijoeiro comum e a soja. As proteínas do movimento (MP), serino protease e VPg, são produzidas em baixas concentrações, impossibilitando a purificação em larga escala a partir de plantas infectadas. A expressão e purificação em larga escala das proteínas VPg, serino protease e proteína do movimento do SBMV e proteína capisidial do RSPaV, foram realizadas utlizando os vetores pET28a e pMAL. Análises das proteínas, através de espalhamento dinâmico de luz mostraram que foi possível obter soluções proteicas monomodais... / The grapevine culture is the most economically important fruit plant in the world. The grapevine is the basic source of high valued wines and other alcoholic beverages. The Rupestris stem pitting associated virus-RSPaV was identified as the causative agent of the rupestris stem pitting (RSP) disease, a component ofthe the rugose wood (RW) complex, one of the major disease complexes affecting grapevines. This disease is transmitted by grafting and is one of the most widespread viruses of grapevine in the world. In brazil this disease was reported for the first time in late 1960s. As it is difficult to seperate the viral particles from the infected plant, the expression of large-scale of coat protein of RSPaV in bacteria is a promising strategy for understanding their properties. The bean crop productivity has also greatly affected by the occurrence of diseases that reduce the production and consequently reduce their supply, causing an increasein the prices. This virus has a narrow host range, confined almost exclusively to species of leguminous species, some of the species has a very high economical value such as the common bean and soybean. The movement protein (MP), serine protease and VPg, are produced in low concentrations, making impossible the large-scale purification from infected plants. In Brazil, more than ten virus were reported in beans, among them, Southern bean mosaic virus (SBMV) from the genus Sobemovirus. The large scale expression and purification of proteins VPg, serine protease and movement protein of SBMV and capisidial protein of RSPaV were performed using pMAL pET28a vectors. Analysis of the proteins by dynamic light scattering showed that was possible to obtain monomodal protein solutions. By circular dichroism was observed that the proteins were structured and the investigation of protein-ligand interactions was performed using nuclear magnetic resonance. These results contributed to increase the knowledge...