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Associação entre genes candidatos e medidas neuropsicológicas em crianças e adolescentes com transtorno de déficit de atenção e hiperatividade

Kieling, Christian Costa January 2007 (has links)
Introdução: As heterogeneidades genotípica e fenotípica do transtorno de déficit de atenção e hiperatividade (TDAH) impõem barreiras à elucidação de suas bases biológicas. O uso do conceito de endofenótipo apresenta-se como estratégia através da qual uma redução na variabilidade fenomenológica pode proporcionar um aumento na sensibilidade a dimensões específicas do fenótipo, facilitando a identificação de substratos genéticos do transtorno. Métodos: Em uma amostra clínica de crianças e adolescentes com TDAH, buscou-se a identificação de diferenças no desempenho neuropsicológico de acordo com grupo genotípico. Os testes utilizados foram o Continuous Performance Test (CPT) e o Wisconsin Card Sorting Test (WCST). Investigaram-se polimorfismos funcionais dos genes para o receptor D4 de dopamina (DRD4) e para a enzima dopamina-betahidroxilase (DBH). Análises de associação e familiares foram realizadas, avaliando-se diferentes variáveis como potenciais confundidores. Resultados: A presença de pelo menos um alelo de 7 repetições do DRD4 esteve associada a um maior número de erros por comissão no CPT (p=0,036), enquanto que e homozigose 44 protegeu contra erros tanto por omissão (p=0,017) quanto por comissão (p=0,025), mesmo após ajuste para idade. Discussão: Já em relação ao gene DBH, a homozigose CC no polimorfismo -1021 C/T esteve associada a um menor desempenho cognitivo medido por um escore fatorial que explicou 83,8% do desempenho nos testes CPT e WCST (p=0,002). Este achado de associação foi corroborado por uma análise familiar confirmatória. A redução da variabilidade fenomenológica por meio do uso de testes neuropsicológicos de função executiva permitiu a identificação de subgrupos de pacientes com TDAH associados a polimorfismos funcionais de genes que codificam proteínas do sistema catecolaminérgico. Além disso, observou-se que o refinamento do fenótipo TDAH por meio de medidas compostas de funções executivas pode ajudar no entendimento das bases moleculares do transtorno. Tais achados fornecem evidência adicional acerca do papel de polimorfismos dos genes DRD4 e DBH no desempenho de crianças e adolescentes com o diagnóstico de TDAH em testes neuropsicológicos de funções executivas. / Introduction: The genotypic and phenotypic heterogeneities of attention-deficit and hiperactivity disorder (ADHD) hinder the elucidation of its biological bases. The use of the concept of endophenotype is a strategy through which a reduction in the phenomenological variability may enhance the sensitivity to specific dimensions of the phenotype, therefore contributing to the identification of the genetic underpinnings of the disorder. Methods: In a clinical sample of children and adolescents with ADHD, differences in neuropsychological performance were investigated according to genotypic group. The following tests were used: the Continuous Performance Test (CPT) and the Wisconsin Card Sorting Test (WCST). Functional polymorphisms of genes coding for the dopamine D4 receptor (DRD4) and the dopamine-beta-hydroxylase enzyme (DBH) were investigated. Association and family-based analyses were performed, assessing different variables as potential confounders. Results: For DRD4, the presence of at least one 7 repeat allele was associated with a higher number of commission errors in the CPT (p=0.036), while the 44 homozigosity protected against both errors of omission (p=0.017) and commission (p=0.025), even after adjusting for age. Regarding the DBH gene, the CC homozigosity for the -1021 C/T polymorphism was associated with a worse cognitive performance as measured by a factorial score that explained 83.8% of the performance in both CPT and WCST (p=0.002). This association was corroborated by a confirmatory family-based analysis. Discussion: The use of neuropsychological tests of executive function to reduce the phenomenological variability of ADHD allowed the identification of subgroups of 9 patients associated with functional polymorphisms of genes that code for proteins critical to catecholaminergic systems. In addition, the refinement of the ADHD phenotype by means of composite measures of executive function can contribute to a better understanding of the molecular bases of the disorder. These findings provide further evidence on the role of DRD4 and DBH polymorphisms in the performance of children and adolescents with ADHD in neuropsychological tests of executive function.
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Interação genótipos x ciclos de colheita em cana-de-açúcar no litoral sul de Pernambuco

MACHADO, Paulo Rocha 10 December 2015 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-09-19T14:32:15Z No. of bitstreams: 1 Paulo Rocha Machado.pdf: 594461 bytes, checksum: de29270fcaa988c035509da45aea89f3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-19T14:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Paulo Rocha Machado.pdf: 594461 bytes, checksum: de29270fcaa988c035509da45aea89f3 (MD5) Previous issue date: 2015-12-10 / Brazil is the world leader in sugarcane industry and to be reached this level was necessary investment in research, among them obtaining new varieties that tested in different environments can occur that are more effective in some and not in others. This behavior is due to the action of genotype x environment interaction (GE) analysis which constitutes a major problem for the breeding programs. The objective of this study was to evaluate the genotype x harvest cycles through its decomposition into simple and complex fraction and the agroindustrial performance RB genotypes of sugarcane (Saccharum spp.) on the south coast of Pernambuco. The experiment was conducted in harvests 2011/2012, 2012/2013 and 2013/2014, the plant Cucaú in Rio Formoso/PE municipality. We used a randomized block design with four replications, as treatments eleven clones RB 2004 series and three varieties as witnesses. They were evaluated thatched tons per hectare (TCH), tons of pol per hectare (TPH) and total recoverable sugar (ATR). The genetic-statistical analyzes were processed in the Genes software (Cruz, 2009). The means were grouped by the Scott and Knott test (1974), a 5 % error probability (p≤0.05). For the study of genotypes (G) x harvest cycles (C), and the joint analysis of variance, we proceeded to the split of GXC interaction variance component in simple and complex part, the method of Cruz and Castoldi (1991), and finally, the Pearson correlation coefficient between pairs of evaluated cycles of crops. It was found significant differences among genotypes for TCH and TPH, for GXC harvest and interaction cycles for all variables in the environmental conditions of the South Coast of Pernambuco Forest. On the decomposition of GXC interaction predominated simple fraction (FS> 60%) to TCH and TPH between pairs of harvest cycles (plant cane and first ratoon) and (first ratoon and second ratoon). A smaller percentage of the complex interaction indicates that in addition to genotypes respond in different proportion, they change performance as the environment. / O Brasil é líder mundial no setor sucoenergético e para que fosse alcançado este patamar se fez necessário investimento em pesquisas, dentre estas a obtenção de novas variedades, que testadas em ambientes distintos pode ocorrer que sejam mais efetivas em uns e não em outros. Esse comportamento é devido a ação da interação genótipo x ambiente (GxA) que se constitui num dos maiores problemas para os programas de melhoramento. Objetivou-se com este trabalho avaliar a interação genótipos x ciclos de colheitas através de sua decomposição em fração simples e complexa e o desempenho agroindustrial de genótipos RB de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) no Litoral Sul de Pernambuco. O experimento foi conduzido nas safras 2011/2012, 2012/2013 e 2013/2014, na Usina Cucaú, no município de Rio Formoso/PE. Utilizou-se delineamento em blocos casualizados, com quatro repetições, como tratamentos onze clones RB série 2004 e três variedades como testemunhas. Foram avaliadas toneladas de colmo por hectare (TCH), toneladas de pol por hectare (TPH) e açúcar total recuperável (ATR). As análises genético-estatísticas foram processadas no programa Genes (CRUZ, 2009). As médias foram agrupadas pelo teste de Scott e Knott (1974), a 5% de probabilidade de erro (P≤ 0,05). Para o estudo da interação genótipos (G) x ciclos de colheitas (C), além da análise de variância conjunta, procedeu-se o desdobramento do componente de variância da interação GxC em parte simples e complexa, pelo método de Cruz e Castoldi (1991), e por fim, a correlação de Pearson entre os pares de ciclos de colheitas avaliados. Verificou-se, diferenças significativas entre genótipos para TCH e TPH, para ciclos de colheita e interação GxC para todas as variáveis estudadas nas condições edafoclimáticas do Litoral do Sul da Mata de Pernambuco. Na decomposição da interação GxC predominou a fração simples (FS>60%) para TCH e TPH entre os pares de ciclos de colheita (cana-planta e cana-soca) e (cana-soca e ressoca). A porcentagem menor da interação complexa indica que além dos genótipos responderem em proporção diferente, eles mudam de desempenho conforme o ambiente.
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Avaliação de genótipos de aceroleira quanto a resistência a Meloidogyne enterolobii Yang & Eisenback

SILVA, Allan Deyws Francisco da 01 December 2014 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-09-20T14:58:27Z No. of bitstreams: 1 Allan Deyws Francisco da Silva.pdf: 1051578 bytes, checksum: a96eb23b9457ef89f0db5f7ae48844b2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-20T14:58:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Allan Deyws Francisco da Silva.pdf: 1051578 bytes, checksum: a96eb23b9457ef89f0db5f7ae48844b2 (MD5) Previous issue date: 2014-12-01 / The acerola (Malpighia emarginata D.C.) tropical species originating from the Antilles became a major plant economic importance to Brazil, mainly due to high content of vitamin C present in the fruit. Breeding programs have joined efforts to try to minimize the effects caused by the attack of Meloidogyne enterolobii (Sin.: M. mayaguensis), known as nematodes due to swellings (galls) formed in the attacked roots, which contributes to drastic decrease productivity. Obtaining resistant rootstocks constitutes the most efficient method of control. The objective of this research is to assess genotypes of acerola for resistance to M. enterolobii Yang & Eisenback, continuing the studies started in 2007 seeking rootstock resistant/tolerant adapted to Pernambuco Forest Zone. Twenty-one acerola accesses of the BAG UFRPE, as well as independent matrix were propagated by cuttings, which were planted in polyethylene bags. During 60 days were made inoculation of the plant parasitic nematode, the inoculum suspension consisting of 10,000 eggs and second stage juveniles (J2) of M. enterolobii. The evaluations were performed after 150 days. The reactions of the hosts were framed within the parameters setby the FR reproduction rate estimated by the ratio Pf / Pi, where Pf is the final population and Pi the initial population; gall index (GI) and egg mass index (IMO), using a scale of notes International Meloidogyne Project (IMP). Regarding the reproduction of the nematode was estimated the number of eggs per root system (ERS) and the number of eggs per gram of root (EGR). With values obtained by FR calculations, has become the highest value as a standard of susceptibility and calculated that the reduction percentage, framing the results of each genotype based on concept of Moura and Regis (1987). At the same time were estimated on fresh shoot biomass (FSB), fresh biomass relative to the root system (FBRRS) and dry matter (DM). The design was completely randomized with six replications. Among the different responses to the attack of the M. enterolobii we can highlight the resistant behavior of the genotypes 21 and 37. / A aceroleira (Malpighia emarginata D.C.) espécie tropical originária das Antilhas se tornou uma planta de grande importância econômica para o Brasil, principalmente pelo alto teor de vitamina C presente nos seus frutos. Os programas de melhoramento têm somado esforços para tentar minimizar os efeitos causados pelo o ataque do Meloidogyne enterolobii (Sin.: M. mayaguensis), conhecido como nematóides das galhas devido a intumescimentos (galhas) formados nas raízes atacadas, o que contribui para diminuição drástica da produtividade. A obtenção de porta-enxertos resistentes constitui-se no método mais eficiente de controle. O objetivo desta pesquisa consiste na avaliação de genótipos de aceroleira quanto à resistência a M. enterolobii Yang & Eisenback, continuando os estudos iniciados em 2007 buscando porta-enxerto resistente/tolerante adaptado a Zona da Mata de Pernambuco. Os vinte e um acessos de acerola do BAG da UFRPE, como também a matriz independente foram propagados por estaquia, que foram plantadas em sacos de polietileno. No decorrer de 60 dias foram feitas as inoculações com o fitonematóide, consistindo o inoculo da suspensão de 10.000 ovos e juvenis do segundo estádio (J2) de M. enterolobii. As avaliações foram realizadas após 150 dias. As reações dos hospedeiros foram enquadradas nos parâmetros estabelecidos pelo fator de reprodução FR, estimado pelo quociente Pf/Pi, onde Pf representa a população final e Pi a população inicial; pelo índice de galhas (IG) e índice de massa de ovos (IMO), através da escala de notas do Projeto International Meloidogyne (IMP). Com relação à reprodução do nematoide foi estimado o número de ovos por sistema radicular (OSR) e o numero de ovos por grama de raiz (OGR). Com os números obtidos pelos cálculos do FR, tomou-se o maior valor como padrão de susceptibilidade e calcularam-se os percentuais de redução, enquadrando-se os resultados de cada genótipo na conceituação de Moura e Regis (1987). Paralelamente foram estimadas a biomassa fresca relativa da parte aérea (BFRPA), biomassa fresca relativa do sistema radicular (BFRSR) e matéria seca (MS). O delineamento utilizado foi o inteiramente casualizado com seis repetições. Dentre as diferentes respostas ao ataque podemos destacar os genótipos 21 e 37 quais mostraram comportamento de resistência.
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Desempenho agronômico de genótipos de tomateiro e reação a geminivírus / Tomato genotypes agriculture perfformance and reaction the geminivirus

ARAUJO, Ana Luisa Rodrigues de 31 January 2014 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-10-07T12:38:23Z No. of bitstreams: 1 Ana Luisa Rodrigues de Araujo.pdf: 308379 bytes, checksum: 62f174eb7a80f9897623f44325f7ee3c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-07T12:38:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ana Luisa Rodrigues de Araujo.pdf: 308379 bytes, checksum: 62f174eb7a80f9897623f44325f7ee3c (MD5) Previous issue date: 2014-01-31 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The tomato plant is the second most economically important vegetable crop in the world. In Brazil cultivation occurs in different states and for most of the months of the year, thereby favoring the onset of many diseases of economic importance caused by viruses. Among the viruses considered to be limiting this culture stand out from those caused by geminivirus, responsible for considerable losses in production. The geminiviruses are transmitted very efficiently by the vector Bemisia tabaci, popularly known as whitefly. The high incidence of this disease in tomato plants is mainly due to the introduction and spread of the B biotype of the insect vector. One way to control geminivirus is the development of resistant cultivars, which features as one of the best strategies for spreading the infection. Thus, the present study aimed to evaluate the resistance to geminivirus in advanced lines and commercial hybrids of tomato plants in natural conditions in the field, in the area of Belem do Sao Francisco and agronomic development of these materials in Vitoria de Santo Antao. municipality. For this, there were two experiments, both under field conditions. The materials used in the experiments were derived from advanced lines of program improvement of UFRPE and IPA and commercial hybrids. The first experiment, under field conditions, was carried out in the IPA station of Vitória de Santo Antao. The experimental design was completely randomized with three replications and ten plants per plot. Factors research study were: total productivity, marketable productivity, non-commercial productivity and numbers of total fruits, numbers of commercial fruit and fruit numbers of discharges. The second experiment was conducted at the experimental station of the IPA in Belem do Sao Francisco. The materials used and the experimental design were also the same as described previously. Factors study were: to evaluate tomato lines and hybrids for resistance to begomoviruses, identify by molecular markers the Begomovirus species through PCR with specific primers and confirm the identity of amplified sequences by DNA sequencing. / O tomateiro é a segunda hortaliça com maior importância econômica no mundo. No Brasil seu cultivo ocorre em diferentes estados e durante grande parte dos meses do ano, favorecendo assim o surgimento de inúmeras doenças de importâncias econômicas causadas por vírus. Dentre as viroses consideradas como limitantes a esta cultura destacam-se as causadas pelo geminivírus, responsáveis por perdas consideráveis na produção. Os geminivírus são transmitidos com grande eficiência pelo vetor Bemisia tabaci, popularmente conhecida como mosca-branca. A alta incidência dessa doença em tomateiro deve-se principalmente à introdução e dispersão do biótipo B do inseto vetor. Uma forma de controle do geminivirus é o desenvolvimento de cultivares resistentes, que apresenta como uma das melhores estratégias para dispersão da doença. Desta forma, o presente trabalho teve como objetivo avaliar a resistência a geminivírus em linhagens avançadas e em híbridos comerciais de tomateiros, em condições de infecção natural de campo, no município de Belém do São Francisco e o desenvolvimento agronômico desses materiais no município de Vitória de Santo Antão. Para isto, realizaram-se dois experimentos, ambos em condições de campo. Os materiais utilizados nos experimentos foram linhagens avançadas oriundas do Programa de melhoramento da UFRPE e do IPA e híbridos comerciais. O primeiro experimento, de campo, foi realizado na Estação Experimental do IPA de Vitória de Santo Antão. O delineamento experimental foi blocos casualizados com três repetições e dez plantas por parcela. Os fatores de estudo da pesquisa foram: produtividade total, produtividade comercial, produtividade não comercial e número de frutos totais, número de frutos comercias e número de frutos de descartes. O segundo experimento foi realizado na Estação Experimental do IPA de Belém do São Francisco. Os materiais utilizados e o delineamento experimental também foram os mesmos descritos anteriormente. Os fatores de estudos foram: avaliar à resistência a begomovírus, identificar por marcadores moleculares a espécie de Begomovirus via PCR com primers específicos e confirmar a identidade das sequências amplificadas por meio de sequenciamento do DNA.
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Caracterização morfológica, agronômica e divergência genética para caracteres germinativos de diferentes genótipos de girassol

SANTOS, Helder Henrique Duarte 07 October 2014 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-03T12:09:24Z No. of bitstreams: 1 Helder Henrique Duarte Santos.pdf: 2691776 bytes, checksum: 672def976abe226c5288629aa2dbedd0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-03T12:09:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Helder Henrique Duarte Santos.pdf: 2691776 bytes, checksum: 672def976abe226c5288629aa2dbedd0 (MD5) Previous issue date: 2014-10-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The sunflower (Helianthus annuus L.) is an annual, robust and tolerant to drought that produces flowers in spring and summer, but can bloom all year plant. Currently, the sunflower is gaining prominence in the national and international scene because it is a plant that has multiple uses which almost everything is useful. Among the crops planted in the Brazilian Northeast sunflower is one of presenting economic viability for the region showing lower financial market risk. Given the above, this study aimed to characterize different sunflower genotypes derived from the germplasm bank of the Agricultural Research Enterprise (IPA), Northeast Brazil. The works were carried out between the months of september 2013 to june 2014, being developed in the field of experimental Experimental Station belonging to the IPA, in Vitória de Santo Antão (PE), and the Seed Laboratory of the Department of Agronomy, University Federal Rural de Pernambuco. In the laboratory, the characters were evaluated: characterization of the seed (achenes) and sunflower seedlings; Seed morphology (achenes); germination and seedling morphology; establishment of criteria for defining categories of normal and abnormal seedlings; genetic divergence for germination characters of sunflower. Genotypes were: Sunflower Black, Crioulo, BRS 323, BRS 324, Hélio 251, Embrapa 122 and Aguará 04. For the laboratory experiment, the design was completely randomized design with seven treatments (genotypes) and four replicates of 25 seeds each. As for the field experiment were used varieties: Criollo, BRS 323, Black Sunflower, Aguará 04, BRS 324, where the morphological characterization was performed; evaluation of agronomic and yield components of sunflower, with experimental design in randomized blocks with five treatments (genotypes) and six replications. The seeds of sunflower against the seven genotypes as the shape, size, weight and color can be different. Germination is epigeal and fanerocotiledonar starting on the first day and ending on the seventh day after sowing, for the seven genotypes. The intensity of staining for hypocotyl anthocyanins, green color of the cotyledons and the serrated margins of protophilus are descriptors that differentiate the genotypes studied. The descriptors allow the distinction of some morphological characters among the five sunflower genotypes evaluated in the field. The five sunflower genotypes have high productivity especially for genotype BRS 323 at the lower production cycle. Characters final stand, physiological maturity and plant height are the main determinants of variations in productivity. Germ characters that contribute most to divergence are: germination and emergence percentage. The most similar genotypes are Aguará 04 and Black Sunflower, whereas the genetically more distant are the BRS 323 and Embrapa 122 genotypes. / O girassol (Helianthus annuus L.) é uma planta anual, robusta e tolerante à seca que produz flores na primavera e no verão, mas podem florescer o ano todo. Atualmente, o girassol vem ganhando destaque no cenário nacional e internacional por se tratar de uma planta que apresenta múltiplos usos da qual quase tudo se aproveita. Dentre as culturas plantadas no Nordeste Brasileiro o girassol é uma das que apresentam viabilidade econômica para a Região apresentando menor risco financeiro de mercado. Diante do exposto, este trabalho teve como objetivo a caracterização de diferentes genótipos de girassol, oriundos do banco de germoplasma do Instituto Agronômico de Pernambuco (IPA), por meio de descritores morfológicos, agronômicos e divergência genética para caracteres germinativos de genótipos de girassol. Os trabalhos foram realizados entre os meses de setembro de 2013 a junho de 2014, sendo desenvolvidos em campo experimental da Estação Experimental pertencente ao IPA, no município de Vitória de Santo Antão (PE), e no Laboratório de Sementes do Departamento de Agronomia da Universidade Federal Rural de Pernambuco, Nordeste do Brasil. Em laboratório, os caracteres avaliados foram: caracterização da semente (aquênios) e plântulas de girassol; morfologia da semente (aquênio); morfologia da germinação e plântula; estabelecimento de critérios para definição de categorias de plântulas normais e anormais; divergência genética para caracteres germinativos de sementes de girassol. Os genótipos estudados foram: Girassol Preto, Crioulo, BRS 323, BRS 324, Hélio 251, Embrapa 122 e Aguará 04. Para o experimento de laboratório, o delineamento foi o inteiramente casualizado, com sete tratamentos (genótipos) e quatro repetições de 25 sementes cada. Já para o experimento de campo as variedades utilizadas foram: Crioulo, BRS 323, Girassol Preto, Aguará 04, BRS 324, onde foi feita a caracterização morfológica; caracterização agronômica e avaliação dos componentes da produção do girassol, com delineamento experimental em blocos ao acaso, com cinco tratamentos (genótipos) e seis repetições. Os aquênios de girassol, para os sete genótipos podem ser diferenciados quanto a forma, tamanho, peso e coloração. A germinação é epígea e fanerocotiledonar iniciando-se no primeiro dia e finalizando ao sétimo dia, após a semeadura, para os sete genótipos avaliados. A intensidade da coloração por antocianina do hipocótilo, coloração verde dos cotilédones e o serrilhado das margens dos protófilos são descritores que diferenciam os genótipos estudados. Os descritores possibilitam a distinção de alguns caracteres morfológicos entre os cinco genótipos de girassol avaliados em campo. Os cinco genótipos de girassol apresentam alta produtividade com destaque para o genótipo BRS 323 pelo menor ciclo de produção. Os caracteres estande final, maturação fisiológica e altura da planta são os principais determinantes das variações na produtividade. Os caracteres germinativos que mais contribuem para a divergência genética são: porcentagem de germinação e porcentagem de emergência. Os genótipos mais similares são Aguará 04 e Girassol Preto, ao passo que, os mais distantes geneticamente são os genótipos BRS 323 e Embrapa 122.
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Genotipagem do vírus da hepatite b em pacientes do Hospital Universitário da Universidade Federal de Sergipe

Sena, Ludmila Oliveira Carvalho 27 September 2010 (has links)
INTRODUCTION: The virus of hepatitis B was classified in eight genotypes that vary with geographic distribution, presenting different clinical manifestations and responses to anti-viral treatment. PURPOSES: This work intends to determine the prevalence of genotypes in Sergipe Brasil and evaluate them according to clinical and histopathological findings. METHODOLOGY: In a transversal search, were evaluated 97 patients, all of them AgHBs chronic porters, with traces of viral replication. From those patients, we got DNA s amplification in 43 samples, that formed the core to genotypical determination. Those were also evaluated on AgHBe positivity, viral load (CV) quantification, aminotransferases (ALT) and histological data. RESULTS: The genotypes A and F, were identified, with 35/43 (81.4%) of genotype A. Twenty Five from 43 patients (58.1%) presented abnormal ALT level, AgHBe negative (23/43 53.5%) and CV below 10.000 copies/ml (20/32 62.5%). In the patients presenting genotype A, 20/32 (62.5%) presented CV below 10,000 copies/ml, but in those with the genotype F, 5/7 (71.4%) presented CV above 10,000 copies/ml (p=0,101). There was no statistic difference between viral genotype and histological findings. CONCLUSION: In Sergipe, the genotypes A and F were found, but predominates the genotype A. Important differences were not found among the genotypes relatively to clinical and laboratorial findings. / INTRODUÇÃO: O vírus da hepatite B foi classificado em oito genótipos que variam de acordo com a distribuição geográfica, apresentando diferentes manifestações clínicas e resposta ao tratamento anti-viral. OBJETIVOS: O estudo visa determinar a prevalência dos genótipos em Sergipe-Brasil, e avaliá-los de acordo com achados clínicos e histopatológicos. METODOLOGIA: Em estudo transversal, foram avaliados 97 pacientes portadores crônicos do AgHBs com sinais de replicação viral. Destes, conseguiu-se amplificação do DNA em 43 amostras, as quais constituíram a casuística para realização de genotipagem. Foram, também, avaliados quanto à positividade do AgHBe, quantificação da carga viral (CV), aminotranferases (ALT) e avaliação histológica. RESULTADOS: Foram identificados os genótipos A e F, sendo 35/43 (81,4%) do genótipo A. Vinte e cinco/43 pacientes (58,1%) apresentaram ALT normais, AgHBe negativo (23/43, 53,5%) e CV inferior a 10.000 cópiasl/ml (20/32 (62,5%). Nos pacientes com genótipo A, 20/32 (62,5%) apresentaram CV inferior a 10.000 cópias/ml enquanto o genótipo F, 5/7 (71,4%) apresentaram CV superior a 10.000 cópias/ml (p=0,101). Não houve diferença estatística entre genótipo viral e características histológicas. CONCLUSÃO: Em Sergipe, foram descritos os genótipos A e F com predomínio do genótipo A. Não foram encontradas diferenças significantes entre os genótipos em relação às manifestações clínico-laboratoriais.
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Silagens de genótipos de Pennisetum sp na alimentação de ovinos

SOARES, Luciana Felizardo Pereira 03 February 2014 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-07-26T13:58:37Z No. of bitstreams: 1 Luciana Felizardo Pereira Soares.pdf: 732282 bytes, checksum: fad2df5050c579d56537a994643d1d0b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-26T13:58:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luciana Felizardo Pereira Soares.pdf: 732282 bytes, checksum: fad2df5050c579d56537a994643d1d0b (MD5) Previous issue date: 2014-02-03 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Two studies conducted to evaluate the silages of elephant grass genotypes in sheep feeding. In the first experiment eight sheep with permanent rumen fistula simultaneously divided into two 4 x 4 latin squares were used. The treatments consisted of the silages of elephant grass genotypes (Mott, Taiwan A- 146 2.37, IRI 381 and Elephant-B), which were ensiled after 60 days of regrowth. The animals had low dry matter intake of silage evaluated, however the consumption of nutrients not influenced by the experimental diets, except ether extract intake. The digestibility of dry matter (65,86 %), organic matter (73.02 %), crude protein (74.35 %), ether extract (75.99 %), neutral detergent fiber (63.34 %), carbohydrates total (67.54 %), non-fiber carbohydrate (76.73 %) and total digestible nutrients (64.13 %) were not influenced by the use of silages of elephant grass genotypes and feeding behavior and nitrogen balance. Silages made with Mott genotypes, Taiwan A- 146 2.37, IRI 381 and Elephant-B after 60 days of growth without the use of additives can be fed to sheep, however, to print low consumption cannot write as single ingredient feed. The second experiment aimed to evaluate the leg tissue composition and meat quality of sheep fed diets with roughage food silages Pennisetum sp. (IRI-381, Elephant-B and Mott) made without additives or practice of wilting. Twenty-four sheep without defined breed, with eight months of age with an average initial body weight of 20.29 ± 2.66kg, which distributed in a randomized block design with three treatments and eight replicates. The experimental diets formulated to meet the demands of animals and allow 20 kg average weight gain of 150 g/day, keeping focused 50:50 roughage. There was no significant difference in the dry matter intake (898.70 g/day) and total digestible nutrients (690.20 g/day) among diets. The animals subjected to different diets did not differ (P<0.05) for body weight at slaughter (24.8 kg) weight of the entire leg (1532.47g), muscle (1055.36g), bones (385.93g), weight of subcutaneous fat (43.04g), intermuscular (19.68g) and total (64.14g), other tissues (27.02 g) and the muscle: bone (2.73), muscle: fat (17.18) and muscularity of the leg (0.33). No difference in the chemical composition and qualitative aspects of meat from animals fed with the diets studied observed. Silages made with the IRI-381, Elephant-B and Mott genotypes, using no additive or premix may select withered sheep diets, they do not alter the tissue composition of the leg of the animal as well as the physicochemical parameters and chemical composition of meat. / Dois estudos foram conduzidos com o objetivo de avaliar as silagens dos genótipos de capim elefante na alimentação de ovinos. No primeiro experimento, foram utilizados oito ovinos com fistula permanente no rúmen distribuídos simultaneamente em dois quadrados latino 4 x 4. Os tratamentos experimentais consistiram nas silagens de genótipos de capim elefante (Mott, Taiwan A- 146 2.37, IRI 381 e Elefante-B), que foram ensilados após 60 dias do corte de uniformização. Os animais apresentaram baixo consumo de matéria seca das silagens avaliadas, entretanto o consumo de nutrientes não foi influenciado pelas dietas experimentais, exceto o consumo de extrato etéreo. As digestibilidades da matéria seca (65,86%), matéria orgânica (73,02%), proteína bruta (74,35%), extrato etéreo (75,99), fibra em detergente neutro (63,34%), carboidratos totais (67,54%), carboidratos não fibrosos (76,73%) e nutrientes digestíveis totais (64,13%) não foram influenciadas pelo uso das silagens dos genótipos de capim elefante, bem como o comportamento ingestivo e o balanço de nitrogênio. Silagens confeccionadas com os genótipos Mott, Taiwan A- 146 2.37, IRI 381 e Elefante-B aos 60 dias de crescimento sem uso de aditivos podem ser utilizadas na alimentação de ovinos. Entretanto, por proporcionar baixo consumo não podem compor como ingrediente único de rações. No segundo experimento, objetivou-se avaliar a composição tecidual da perna bem como a qualidade da carne de ovinos submetidos a dietas tendo como alimento volumoso silagens de genótipos de Pennisetum sp. (IRI-381, Elefante B e Mott) confeccionadas sem aditivos ou prática de emurchecimento. Foram utilizados 24 ovinos sem padrão racial definido, com oito meses de idade e peso corporal inicial médio de 20,29 ± 2,66 kg, que foram distribuídos em delineamento em blocos casualizados, com três tratamentos e oito repetições. As dietas experimentais foram formuladas para atender as exigências de animais com 20 kg e permitir ganho de peso médio de 150 g/dia, mantendo-se relação volumoso concentrado de 50:50. Não houve diferença significativa para o consumo de matéria seca (898,70 g/dia) e de nutrientes digestíveis totais (690,20 g/dia) entre as dietas experimentais. Os animais submetidos às diferentes dietas não apresentaram diferença (P<0,05) para o peso corporal ao abate (24,8 kg), peso da perna inteira (1532,47 g), músculo (1055,36 g), ossos (385,93 g), peso das gorduras subcutânea (43,04 g), intermuscular (19,68 g) e total (64,14 g), outros tecidos (27,02g), bem como nas relações músculo: osso (2,73), músculo: gordura (17,18) e índice de musculosidade da perna (0,33). Também não foi observada diferença para a composição química e aspectos qualitativos da carne dos animais submetidos às dietas estudadas. Silagens confeccionadas com os genótipos IRI-381, Elefante B e Mott, sem uso de aditivo ou pré-emurchecidos podem compor dietas de ovinos, pois não alteram a composição tecidual da perna dos animais, bem como os parâmetros físico-químicos e composição química da carne.
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Adaptabilidade e estabilidade fenotípica de clones de cana-de- açúcar

MAGALHÃES, Talyta Amaral 18 July 2017 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-03T13:17:39Z No. of bitstreams: 1 Talyta Amaral Magalhaes.pdf: 733612 bytes, checksum: 559c2153abbe20b46bfd22a480cc333e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-03T13:17:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Talyta Amaral Magalhaes.pdf: 733612 bytes, checksum: 559c2153abbe20b46bfd22a480cc333e (MD5) Previous issue date: 2017-07-18 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / For the recommendation of new cultivars the knowledge of the interaction genotype x environment (GxA) is essential, therefore, it allows to analyze the performance of the genotypes in different environment. The results of these tests are synthesized by studies of adaptability and phenotypic stability, which allows to know the productive capacity, the adaptation to the environmental variations and the production stability of the genotypes. The objective of this work was to evaluate the adaptability and phenotypic stability of RB genotypes of sugarcane by the AMMI (Additive Main Effects and Multiplicative Interaction Analysis) method. The experiments were conducted in five production units in the State of Pernambuco, in sugarcane plantations, soca and resoca, using 14 RB sugarcane genotypes, 11 RB clones from the 2004 series (G1 to G11) and three cultivars (G12 To G14) RB863129, RB867515 and BR92579 as controls. Each combination producing-cut unit was considered as an environment, totaling 13 environments. A randomized complete block design with four replications was used. The following variables were evaluated: tons of sugarcane per hectare (TCH) and tons of pol. Per hectare (TPH). The significant GxA interaction revealed changes in the classification of genotypes in response to environments. Genotype G12 showed general adaptability, phenotypic stability and high productivity for both variables. Genotypes G10, G13 and G14 showed higher yields, higher contribution to the interaction, indicating specific stability. / Para a recomendação de novas cultivares, o conhecimento da interação genótipo x ambiente (GxA) é essencial, pois, permite analisar o desempenho dos genótipos em diferentes ambiente. Os resultados destes ensaios são sintetizados por estudos de adaptabilidade e estabilidade fenotípica, que permite conhecer a capacidade produtiva, a adaptação frente as variações ambientais e a estabilidade de produção dos genótipos. O objetivo deste trabalho foi avaliar a adaptabilidade e estabilidade fenotípica de genótipos RB de cana-de-açúcar, pelo método AMMI (Additive Main Effects and Multiplicative Interaction Analysis). Os experimentos foram conduzidos em cinco unidades produtoras no estado de Pernambuco, em cultivos de cana planta, soca e ressoca, utilizando 14 genótipos RB de cana-de-açúcar sendo 11 clones RB da série 2004 (G1 ao G11) e três cultivares (G12 ao G14) RB863129, RB867515 e BR92579, como testemunhas. Cada combinação unidade produtora-corte foi considerado como um ambiente, totalizando 13 ambientes. Utilizou-se o delineamento experimental de blocos casualizados, com quatro repetições. Foram avaliadas as variáveis toneladas de cana por hectare (TCH) e toneladas de pol por hectare (TPH). A interação GxA significativa revelou alterações na classificação dos genótipos em resposta aos ambientes. O genótipo G12 apresentou adaptabilidade geral, estabilidade fenotípica e alta produtividade para as duas variáveis. Os genótipos G10, G13 e G14 apresentaram maiores produtividades, maior contribuição com a interação, indicando estabilidade específica.
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Divergência genética em genótipos de feijão-caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp.) por descritores morfoagronômicos e variáveis multicategóricas

SANTANA, Sérgio Rogério Alves de 28 July 2017 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-12-18T12:19:03Z No. of bitstreams: 1 Sergio Rogerio Alves de Santana.pdf: 954076 bytes, checksum: 05aad5d1f40ed4b56cef9f69314de6b3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-18T12:19:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sergio Rogerio Alves de Santana.pdf: 954076 bytes, checksum: 05aad5d1f40ed4b56cef9f69314de6b3 (MD5) Previous issue date: 2017-07-28 / Cowpea (Vigna unguiculata (L.) Walp.) Has great socioeconomic importance, mainly in the North / Northeast, constituting one of the main food components of its populations, being an important source of employment and income for small and medium producers . The genetic improvement of this species has become increasingly relevant in the countries producing this legume. Among the several methodologies used to perform the breeding, the genetic divergence has been highlighted. This analysis has helped to classify genotypes into groups and facilitated the choice of parents with characteristics desirable for the purpose of the program. Some researches have already been carried out to obtain new varieties that have desirable agronomic characteristics, however, the researches in the state of Pernambuco are being developed in an incipient way. The objective of this study was to characterize 30 cowpea genotypes of the Germplasm Bank of the Instituto Agronômico de Pernambuco (IPA), using morphoagronomic descriptors and to determine the genetic divergence between them. Qualitative and quantitative characteristics were evaluated according to the morphoagronomic descriptors proposed by Biodiversity Intenational (2007). The data were submitted to analysis of variance, obtaining the means, the variance matrix and residual covariance. The averages were purchased by the Scott-Knott test, at 5% probability, for all descriptors analyzed. With dissimilarity measures, the cluster analyzes were performed, using the multivariate technique. The coefficients of phenotypic and genotypic and environmental correlation between the pairs of characters were also estimated. There is genetic divergence among the studied genotypes, and can be used by breed improvement breeders. The quantitative characteristics contributed the most to the discrimination of the genetic divergence among the studied genotypes. The crosses between the genotypes Pitiúba x Cabeçudo, Pitiúba x Manteiga and Pitiúba x Costela de Vaca may originate new genetic combinations, because they present genetic divergence and because they have favorable agronomic characteristics. There is a high genetic component in the phenotypic expression of the evaluated traits, with a high probability of genetic gains through selection cycles for crop improvement. Among the characters evaluated, the number of pods per plant, the weight of ten pods and the weight of grains per pod are more suitable for selection of promising genotypes. / O feijão-caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp.) possui uma grande importância socioeconômica, principalmente nas regiões Norte/Nordeste, constituindo um dos principais componentes alimentares de suas populações, sendo uma importante fonte de emprego e renda para pequenos e médios produtores. O melhoramento genético dessa espécie vem se tornando cada vez mais relevante nos países produtores dessa leguminosa. Dentre as diversas metodologias empregadas para realizar o melhoramento, a divergência genética vem se destacando. Essa análise vem auxiliando a classificação de genótipos em grupos e facilitando a escolha de genitores com características desejáveis para o objetivo do programa. Algumas pesquisas já foram realizadas para a obtenção de novas variedades que possuam características agronômicas desejáveis, no entanto, as pesquisas no estado de Pernambuco estão sendo desenvolvidas de forma incipiente. Diante disso, o presente trabalho teve como objetivo caracterizar 30 genótipos de feijão-caupi do Banco de Germoplasma do Instituto Agronômico de Pernambuco (IPA), por meio de descritores morfoagronômicos e determinar a divergência genética entre eles. Foram avaliadas características qualitativas e quantitativas de acordo com os descritores morfoagronômicos propostos pela Biodiversity Intenational (2007). Os dados obtidos foram submetidos à análise de variância, obtendo-se as médias, a matriz de variância e covariâncias residuais. As médias foram compradas pelo teste de Scott-Knott, a 5% de probabilidade, para todos os descritores analisados. Com as medidas de dissimilaridade foram realizadas as análises de agrupamento, sendo empregada a técnica de multivariáveis. Também foram estimados os coeficientes de correlação fenotípica, genotípica e ambiental entre os pares de caracteres. Existe divergência genética entre os genótipos estudados, podendo ser utilizada pelos melhoristas no melhoramento da cultura. As características quantitativas foram as que mais contribuíram para a discriminação da divergência genética entre os genótipos estudados. Os cruzamentos entre os genótipos Pitiúba x Cabeçudo, Pitiúba x Manteiga e Pitiúba x Costela de Vaca podem originar novas combinações gênicas, por apresentarem divergência genética e por possuírem características agronômicas favoráveis. Existe um alto componente genético na expressão fenotípica dos caracteres avaliados, com grande probabilidade de ganhos genéticos através de ciclos de seleção para o melhoramento da cultura. Entre os caracteres avaliados o número de vagem por planta, o peso de dez vagens e o peso de grãos por vagem são mais indicados para seleção de genótipos promissores.
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Análises agronômicas e sensoriais de cultivares de milho para produção de minimilho nas condições de zona da mata do Estado de Pernambuco

GUERRA, Yrlânia de Lira 27 July 2017 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-12-18T13:09:16Z No. of bitstreams: 1 Yrlania de Lira Guerra.pdf: 1287810 bytes, checksum: ff1bba23c9df33221f5eed6f474a66c6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-18T13:09:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Yrlania de Lira Guerra.pdf: 1287810 bytes, checksum: ff1bba23c9df33221f5eed6f474a66c6 (MD5) Previous issue date: 2017-07-27 / In Brazil, corn is one of the main crops, about 80% of the national production is to supply the domestic market. The baby corn is the name given to the ear of corn before pollination occurs and its cultivation is approximately 70 days, so it is considered as a vegetable. There are no reports of specific commercial genetic material for use as a baby corn, theoretically, any type of corn can be used. The baby corn production is still under-explored, although domestic and external markets are promising. One factor that contributes a lot to this is the limited availability of information about production. To avoid this situation, to invest in the technological level of crop management and increase productivity, the objective is to evaluate maize genotypes that are more favorable to the production of baby corn, based on the agronomic and sensorial characteristics that are efficient in selection for planting in the Mata region of the state of Pernambuco, Brazil. The experiments were conducted at the experimental campus of Fitotecnia at UFRPE between 2014 and 2016 and the sensorial analysis was performed at the UFRPE Gastronomy laboratory. The agronomic parameters evaluated were plant height, panicle differentiation, ear length, ear diameter, ear weight, shoot weight, shoot weight after 12 days in the refrigerator, tassel height at day of harvest, height of first spike, number of ear and weight of the aerial part. Sensory evaluation was performed based on the acceptance of preserves, purchase intention and on the visual, olfactory and gustatory attributes. The agronomic variables that most influence in the production of the baby corn were number of ear, height of the plant at 30 and 60 days after the emergency, the weight of the spikes without spreading, height of the tassel on the day of harvest and weight of the aerial part. The genotypes CMS47 and the AL-25 were highlighted with higher number of ears and low shoot weight. All genotypes were super precocious. The CMS47 genotype was the one that had the high purchasing intentions. Therefore, this genotype should be used in breeding programs for baby corn production because it produces the highest number of cobs, low weight of the part aerial plant and a high potential for consumer acceptance. / No Brasil, o milho é uma das principais culturas e cerca de 80% da produção nacional é para abastecer o mercado interno. O minimilho, é o nome dado à espiga de milho antes que ocorra a polinização e seu cultivo dura aproximadamente 70 dias. Não há relatos de materiais genéticos comerciais específicos para a utilização como minimilho. Teoricamente, pode-se utilizar qualquer tipo de milho. Sua produção ainda é pouco explorada, embora os mercados interno e externo sejam promissores. Um fator que contribui bastante para isso é a limitada disponibilidade de informações a respeito de sua produção. Na busca de contornar essa situação, investir no nível tecnológico para condução da cultura e aumentar a produtividade foi o objetivo deste trabalho, no qual foram avaliadas e selecionados genótipos de milho mais promissores à produção do minimilho, desenvolvendo-se caracteres agronômicos e sensoriais, bem como sua eficiência para o plantio na Zona Mata em Pernambuco, Brasil. Os experimentos foram conduzidos no campus experimental da Fitotecnia na UFRPE, entre os anos de 2014 e 2016 e a análise sensorial foi realizada no laboratório de Gastronomia da UFRPE. As características agronômicas avaliadas foram: altura da planta; diferenciação da panícula; comprimento da espiga; diâmetro da espiga; peso da espiga; peso das espigas após 12 dias na geladeira; altura do pendão no dia da colheita; altura da primeira espiga; número de espigas e peso da parte aérea. A avaliação sensorial foi realizada com base na aceitação das conservas, intenção de compra e nos atributos visuais, olfativos e gustativos. As variáveis agronômicas que mais influenciam na produção do minimilho foram: número de espigas; altura de planta aos 30 e 60 dias após a emergência; peso de espigas sem espalha; altura do pendão no dia da colheita e peso da parte aérea. Os genótipos CMS47 e a variedade BR5039 (São Vicente) destacaram-se com maior número de espigas e baixa produção de peso da parte aérea, todos os genótipos se portaram como super precoces. Os genótipos CMS47 e o AL-25 foram os melhores descritos pelos atributos da análise sensorial. O genótipo CMS47 foi o que teve a maior intensão de compra, devendo ser utilizado em programas de melhoramento genético para a produção de minimilho por produzir o maior número de espigas, baixo peso da pare aérea e um potencial elevado de aceitação pelos consumidores.

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