Made available in DSpace on 2018-08-01T22:57:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_11218_Tese final Clemilton Alves da Silva.pdf: 3597717 bytes, checksum: e4e51d592c83fee4b0e5a4c7deb3cf1f (MD5) Previous issue date: 2017-06-30 / A goiabeira é uma espécie que apresenta destaque na fruticultura brasileira pela sua importância econômica, social e alimentar. Pesquisas agronômicas referentes ao melhoramento genético da espécie possibilitam o conhecimento sobre a adaptação da cultura a diferentes ambientes. Objetivou-se com esse trabalho avaliar a interação genótipo ambiente e estimar coeficientes de repetibilidade usando variáveis de produção em 22 genótipos de goiabeira em dois experimentos instalados no Estado do Espírito Santo: um no Sul no município de Mimoso do Sul e o outro no Norte no município de Linhares. O delineamento experimental adotado foi em blocos casualizados, com quatro repetições, cada repetição com uma parcela composta de duas plantas. Foram avaliados os seguintes caracteres: produção de frutos por plantas; massa, comprimento e diâmetro de fruto, espessura do endocarpo e do mesocarpo, massa e rendimento de polpa, razão comprimento diâmetro de fruto. A avaliação dos parâmetros de adaptabilidade e estabilidade dos genótipos foram obtidos por diferentes métodos: Eberhart & Russell, Lin & Binns, Annicchiarico, Método centroide modificado, análise REML/BLUP e AMMI. As estimativas do coeficiente de repetibilidade (r), foram obtidas por quatro metodologias distintas: análise de variância; máxima verossimilhança restrita, aplicando o modelo básico de repetibilidade; componentes principais com base na matriz de correlações; e análise estrutural com base na matriz de correlações entre as medidas repetidas. Os métodos analisados foram concordantes quanto aos parâmetros de adaptabilidade e estabilidade. Os genótipos Cortibel LM e Cortibel RM são os mais recomendados para o cultivo por apresentarem desempenho sastisfatório frente as variações de ambientes. Os genótipos Cortibel LG, Cortibel LM, Cortibel BRM, Cortibel V Cortibel III, Cortibel RG apresentaram adaptabilidade geral. Os genótipos Cortibel SLG, Cortibel BLG, Paluma, Século XXI, Sassaoka apresentaram melhor desempenho em ambientes favoráveis. Os vi genótipos Cortibel V, Cortibel VII, Cortibel XII tiveram desempenhos satisfatório, merecendo atenção especial em trabalhos de melhoramento genético. Houve concordância nas magnitudes dos coeficientes de repetibilidade para as nove variáveis analisadas, obtidas pelos diferentes métodos. O número de oito colheitas utilizada no trabalho foi satisfatório para avaliar o valor real dos genótipos com base nas variáveis massa de fruto, comprimento de fruto, massa de polpa, rendimento de polpa, razão comprimento/diâmetro de fruto e produção de frutos por plantas. Houve diferença na magnitude dos valores de repetibilidade das variáveis analisadas. O número de medições necessárias para a predição do valor real do indivíduo obtidos pelo método dos componentes principais foram menores que aqueles obtidos pelos demais métodos analisados

The study of the physical and physico-chemical characteristics in the post-harvest of banana fruit contributes for the selection of the highlighted and adapted cultivars in the germoplasm implementation site. Therefore, this dissertation aims was to evaluate the quality of the cultivars and tree hybrids of banana post-harvest fruits, in two production cycles in Tabuleiros Costeiros, Sergipe, edaphoclimatic conditions, intending the material with superior characteristics selection for future recommendation. The experiment was conducted in Ecophysiology Laboratory at Embrapa Tabuleiros Costeiros, located in Aracaju-SE. The experimental design was made in randomized blocks with three repetitions, located in the Experimental Field Jorge do Prado Sobral at Embrapa Tabuleiros Costeiros in the city of Nossa Senhora das Dores, Sergipe, Tabuleiros Costeiros area. It were evaluated 12 agronomic characters in 13 banana tree genotypes coming from Rede Nacional de Avaliação de Genótipos de bananeira do Programa de Melhoramento da Embrapa (Nacional network for banana tree genotypes evaluation improvement program at Embrapa): Prata type (FHIA-18; PA42-44; PV94- 01; Garantida; YB42-47; Pacovan; Prata-Anã), Maçã type (Princesa; Tropical; Maçã), Caipira type (Caipira), Gros Michel type (Bucaneiro) Mysore type (Thap Maeo). The characters size, diameter and average weight of the fruits, pulp/skin relation, pH, total acidity titration, reducing sugars, total soluble solids, ratio, total sugars and amid were taken into consideration. The data underwent into variance analysis and the linear correlation between the characters evaluated took place. Using Gower algorithm, a dendrogram was elaborated with distance matrix obtained from agronomic, physic and physico-chemical fruit analysis in each cycle. Significant differences were noted for the fruit size variable, fruit diameter, fruit skin weight, fruit without skin weight, relation pulp/ skin, soluble-solids total content, total acidity titration and reducing sugars. With the genetic divergence used as a cut-off it was identified four groups in the second cycle: G1 group, formed by the genotypes FHIA-18, PA94-01, Caipira, YB42-47, Thap Maeo, Princesa, Tropical, Maçã and Pacovan; G2, by the genotypes PA42-44 and Prata Anã; G3, by the genotype Garantida and G4, by the genotype Bucaneiro. Four groups in the third cycle were also identified: G1, by the genotypes FHIA-18, PA42-44, PA94-01, Garantida, YB42-47, Thap Maeo, Prata Anã, Princesa, Maçã and Pacovan; G2, by the genotype Caipira; G3, by the genotype Tropical and G4, by the genotype Bucaneiro. The Bucaneiro genotype was qualified as promising to be incorporated by the production system of the banana producer in Sergipe. Total sugars, skin fruit weight, amid and fruit without skin weight characters contribute with a big part of the genetic variability between the 13 banana trees genotypes evaluated. / O estudo das características físico-químicas em pós-colheita dos frutos da bananeira contribui com indicativos de qualidade dos frutos, servindo como parâmetro para escolha de cultivares para cultivo em determinada região. O objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade pós-colheita dos frutos das cultivares e híbridos de bananeira, em dois ciclos de produção nas condições edafoclimáticas dos Tabuleiros Costeiros, Sergipe, visando à caracterização e seleção de materiais. O experimento foi implantado no Campo Experimental Jorge do Prado Sobral da Embrapa Tabuleiros Costeiros, no município de Nossa Senhora das Dores, Sergipe, área de Tabuleiros Costeiros. As análises pós-colheita foram realizadas no Laboratório de Ecofisiologia da Embrapa Tabuleiros Costeiros, em Aracaju-SE. Foram avaliados 12 caracteres agronômicos: comprimento do fruto, diâmetro do fruto, peso do fruto com casca, peso do fruto sem casca, relação polpa/casca, sólidos solúveis totais, acidez total titulável, ratio, açúcar redutor, açúcares totais, amido e pH de 13 genótipos de bananeira, provenientes da Rede Nacional de Avaliação de Genótipos de bananeira do Programa de Melhoramento da Embrapa: do tipo Prata (FHIA-18; PA42-44; PV94-01; Garantida; YB42-47; Pacovan; Prata-Anã), do tipo Maçã (Princesa; Tropical; Maçã), do tipo Caipira (Caipira), do tipo Gros Michel (Bucaneiro) e do tipo Mysore (Thap Maeo), no segundo e terceiro ciclo de produção. O delineamento experimental foi em blocos casualizados com três repetições Os dados foram submetidos à análise de variância e procedeu-se a correlação linear entre os caracteres avaliados. Foram observadas diferenças significativas para as variáveis comprimento do fruto, diâmetro do fruto, peso do fruto com casa, peso do fruto sem casca, relação polpa/casca, teor de sólidos solúveis totais, acidez total titulável e açúcares redutores. Com a divergência genética média usada como ponto de corte, foram identificados quatro agrupamentos no segundo ciclo: grupo G1, formado pelos genótipos FHIA-18, PA94-01, Caipira, YB42-47, Thap Maeo, Princesa, Tropical, Maçã e Pacovan; G2, pelos genótipos PA42-44 e Prata Anã; G3, pelo genótipo Garantida e G4, pelo genótipo Bucaneiro. Também foram identificados quatro agrupamentos no terceiro ciclo: G1, pelos genótipos FHIA-18, PA42-44, PA94-01, Garantida, YB42-47, Thap Maeo, Prata Anã, Princesa, Maçã e Pacovan; G2, pelo genótipo Caipira; G3, pelo genótipo Tropical e G4, pelo genótipo Bucaneiro. O genótipo Bucaneiro demonstrou-se promissor para ser incorporado ao sistema de produção do bananicultor em Sergipe. Os caracteres açúcares totais, peso do fruto com casca, amido e peso do fruto sem casca contribuem com grande parte da variabilidade genética entre os 13 genótipos de bananeira avaliados.

O trabalho foi realizado na sede do Centro Nacional de Pesquisas de Arroz e Feijão da EMBRAPA com o objetivo de avaliar a resistência à seca de 5 grupos de genitores utilizados nos programas de melhoramento de arroz de sequeiro e classificados como sequeiro favorecido, sequeiro tradicional, sequeiro melhorado africano, sequeiro melhorado brasileiro e irrigado. Dois experimentos de campo idênticos foram implantados tardiamente para coincidir o período reprodutivo dos genótipos com o início da estação seca da região. Um dos experimentos não recebeu irrigação suplementar por 25 dias para induzir déficit hídrico enquanto o outro foi mantido sob boa disponibilidade de água. Os grupos de sequeiro melhorado africano e brasileiro apresentaram um menor enrolamento foliar, maior exposição da panícula e fertilidade de espiguetas e consequentemente uma melhor classificação na escala de avaliação de resistência à seca. O grupo de sequeiro melhorado brasileiro teve o maior rendimento de grãos, seguido do africano. Possivelmente parte do sucesso do grupo de sequeiro melhorado resida no uso de genitores elite do grupo japonica na sua composição. O pior desempenho dos materiais de sequeiro favorecido frente aos demais grupos de sequeiro, demonstra o risco de cruzar japonica com indica de forma aleatória / not available

Esta pesquisa teve como principais objetivos o desenvolvimento de um protocolo de regeneração de plantas de soja in vitro e a obtenção de tecidos transformados, utilizando-se o Agrobacterium tumefasciens como vetor de transformação. Inicialmente, os objetivos foram direcionados para obter um protocolo de regeneração in vitro para três genótipoes de soja. Utilizando-se nós-cotiledonares como explantes, inoculados em meio de cultura MS/2 suplementado com 2,5 μM de BA + 30 g/l de sacarose + 0,7% (p/v) de ágar, obteve-se altas taxas de regeneração e múltipla brotação. Vencida a etapa da cultura in vitro, dois métodos de infecção foram avaliados, usando-se a linhagem GV2260 de Agrobacterium. Após ferir os explantes com bisturi, foram feitos dois cocultivos: em meio líquido por 16 h e em meio sólido por 48 h. Este procedimento interferiu drasticamente no processo de regeneração, sendo que apenas 8% dos explantes apresentaram brotos, a maioria, com vitrificação. No segundo método, os explantes foram infectados, na região onde ocorre a regeneração, com uma seringa contendo uma cultura líquida do Agrobacterium. Em seguida, procedeu-se o cocultivo em meio sólido por 48 h. Este ensaio mostrou 96% de regeneração com brotação abundante. Nos dois processos, foi observada a expressão transitória do gene da β-glucuronidase (GUS), usado como reporter na construção do plasmídio. Fica demonstrado neste trabalho que a utilização do Agrobacterium como vetor de transformação de soja independe do método de infecção. Porém, a regeneração de brotos está condicionada à não exposição dos explantes ao cocultivo em meio líquido. / not available

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2016-09-14T14:36:56Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese Rerinton3.pdf: 605463 bytes, checksum: 7acdf1b006c271664034ab05db95c851 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-14T14:36:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese Rerinton3.pdf: 605463 bytes, checksum: 7acdf1b006c271664034ab05db95c851 (MD5) Previous issue date: 2015-04-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / O pinhão-manso surge como uma alternativa, para a produção de combustíveis renováveis, pois possui alto teor de óleo nas sementes facilmente conversível em biodiesel. No entanto, o conhecimento acumulado sobre a espécie é limitado, tornando todas as recomendações de plantio, longevidade da planta, produtividade, rendimento, entre outras apenas especulações. Nesse sentido, o objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho agronômico de plantas de pinhãomanso, através da resposta da planta a diferentes intensidades de poda e espaçamento, fenologia e avaliação de genótipos elite. Para tanto, foram realizados três experimentos na Embrapa Clima Temperado, como segue: Experimento 1 - Fenologia do pinhão-manso na Região de Pelotas/RS; Experimento 2 - Efeitos do espaçamento e da poda de formação na produtividade de pinhão-manso; Experimento 3 - Desempenho agronômico dos genótipos de pinhão-manso. Ao final dos experimentos verificou-se que: A dinâmica fenológica sazonal, com a paralisação do crescimento durante o período de inverno, permite colher toda à produção de pinhão-manso em três ou quatro colheitas. Sendo que para o início do período vegetativo a temperatura mínima e o número de horas de frio acumulado no mês de agosto são fundamentais. O desempenho agronômico dos genótipos de pinhão-manso avaliados permitiu a identificação de materiais com melhor produtividade, bem como identificar os melhores espaçamentos para o cultivo pinhão-manso nos seis primeiro anos de cultivo. / The jatropha is a viable alternative for production of renewable fuels, as it has high oil content in the seeds easily convertible into biodiesel. However, there is limited knowledge about this plant species which reduces the possibility of making recommendations on longevity of the plant, production and yield. In this sense, the objective of this study was to evaluate the agronomic performance of jatropha plants through plant response to different intensities of pruning and spacing, phenology and evaluation of elite genotypes. For this, three experiments were carried out at Embrapa Clima Temperado, as follows: Experiment 1 - Phenology of jatropha in Pelotas-RS; Experiment 2 - Effects of spacing and pruning training in jatropha productivity; Experiment 3 - Agronomic performance of Jatropha genotypes. At the end of the experiments it was found that: The seasonal phenological dynamics, with the stoppage of growth during the winter period, allows reap all the production of jatropha in three or four crops. At the end of the experiments, it was found that the seasonal phenological dynamics, with the stoppage of growth during the winter period, spoon allows all production of jatropha in three or four crops. And to start the plant growing season, the minimum temperature and the number of chilling hours in August are very important. The agronomic performance of the jatropha genotypes evaluated allowed the identification of materials with improved productivity and identify the best spacing for jatropha cultivation in the first six years of cultivation.

Orientador: Luis Guilherme de Oliveira / Resumo: Mycoplasma suis e Mycoplasma parvum se ligam fortemente aos eritrócitos e causam hemoplasmose em suínos. Os animais infectados podem ser portadores assintomáticos ou apresentar sinais inespecíficos, acometendo todas as faixas etárias. No Brasil, os estudos sobre a ocorrência e a diversidade genética associada aos hemoplasmas suínos (HS) são escassos. Portanto, este trabalho teve como objetivo detectar, quantificar e caracterizar a diversidade genética da HS em animais terminados de granjas tecnificadas no estado de Goiás, Brasil. Amostras de sangue total de 450 de 30 granjas diferentes localizadas no estado de Goiás, foram coletadas em tubos contendo ácido etilenodiaminotetracético (EDTA) e armazenadas a -80 °C. A extração de DNA seguiu o método “in house” descrito previamente. A PCR convencional (cPCR) direcionada ao gene endógeno gapdh foi realizada para evitar resultados falso-negativos nos testes seguintes. Os ensaios de PCR em tempo real quantitativa (qPCR) foram realizados a fim de detectar e quantificar DNA de Mycoplasma baseado no gene 16S rRNA para HS. Para avaliar a diversidade genética da HS, realizou-se a clonagem e sequenciamento dos genes 16S rRNA e 23S rRNA para hemoplasmas. Os resultados da qPCR mostraram uma ocorrência de HS de 68,89%, onde todas as fazendas tinham pelo menos dois animais positivos. A quantificação na qPCR variou de 8.43x10-1 a 4.69x106 µL, e 52.71% das amostras apresentaram 1x103 copies/µL. Além disso, o teste do coeficiente de Spearman reve... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Mycoplasma suis and Mycoplasma parvum are strongly bound to erythrocytes and cause hemoplasmosis in pigs. Infected animals can be asymptomatic carriers or have nonspecific signs, affecting all age groups. In Brazil, studies on the occurrence and genetic diversity associated with porcine hemoplasmas (PH) are scarce. Therefore, this work aimed to detect, quantify and characterize the genetic diversity of PH in finished animals from technified farms in the state of Goiás, Brazil. Whole blood samples from 450 animals from 30 different farms located in the state of Goiás, were collected in tubes containing ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) and stored at -80°C. DNA extraction followed the "in house" method previously described. Conventional PCR (cPCR) targeting the gapdh endogenous gene was performed to avoid false negative results in the following tests. Quantitative real-time PCR (qPCR) assays were performed in order to detect and quantify Mycoplasma DNA based on the 16S rRNA gene for PH. To assess the genetic diversity of PH, cloning and sequencing of the 16S rRNA and 23S rRNA genes for hemoplasmas was performed. The results of the qPCR showed a PH occurrence of 68.89%, where all farms had at least two positive animals. The quantification in the qPCR varied from 8.43x10-1 to 4.69x106 µL, and 52.71% of the samples presented 1x103 copies / µL. Furthermore, the Spearman coefficient test revealed that the occurrence of PH is inversely associated with the number of births per we... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Giardia duodenalis é um protozoário entérico de distribuição mundial responsável por causar a giardíase em uma grande variedade de mamíferos, incluindo os humanos. É considerada uma espécie complexa, no qual os isolados podem ser classificados em sete agrupamentos genéticos distintos apesar de serem morfologicamente indistinguíveis. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade genotípica de isolados de G. duodenalis provenientes de humanos naturalmente infectados, residentes em cidades do litoral de São Paulo, na Baixada Santista. A caracterização molecular de 43 isolados pelo seqüenciamento parcial de genes codificadores da enzima glutamato-desidrogenase (gdh) e da proteína beta-giardina (bg) mostrou que o assemblage B da G. duodenalis é o mais freqüente na região litorânea, ocorrendo em 53,5% (n=23) das amostras, sendo o assemblage A identificado em 34,8% (n=15). A maioria das seqüências obtidas pelo gene gdh se mostrou polimórfica, caracterizada por picos duplos de nucleotídeos em algumas posições em cromatograma e quando a análise dos dois genes foi combinada cinco isolados apresentaram identidades diferentes. A esses fenômenos duas explicações são atribuídas, infecção mista ou heterozigose de seqüência alélica. As análises filogenéticas mostraram que o gene bg é mais conservado que o gene gdh, não sendo capaz de discriminar os sub-agrupamentos que constituem os Assemblages do parasita. Com base nos resultados apresentados podemos concluir que a participação de genótipos zoonóticos é relevante na epidemiologia das giardíases nos indivíduos residentes das cidades litorâneas do estado de São Paulo e que estudos de caracterização molecular da G. duodenalis são indispensáveis para melhor conhecimento da epidemiologia desta infecção. / Giardia duodenalis is an enteric protozoa of global distribution responsible for causing giardiasis in a wide range of mammals including humans. Is considered complex specie in which the isolates can be classified in different genetic groups despite to be morphologically indistinguishable. The purpose of this study was evaluating the genetic variability of G. duodenalis isolates from humans naturally infected residents in the coast cities of Sao Paulo, in Baixada Santista. The molecular characterization of 43 isolates using the gene encoding glutamate-desidrogenasi enzyme (gdh) and beta-giardin protein (bg) showed that the assemblage B is the most common in the coast region, occurring in 53.5% (n=23) samples, the assemblage A was identified in 34.8% (n=15). Most sequences obtained by the gdh gene showed polymorphism, characterized for double peaks of nucleotides in some chromatogram positions and when the analysis of two genes was combined five isolates were differently identified. For this phenomena can be attributed two explanations, mixed infections or heterozygosis allelic sequence. The phylogenetic analysis showed that bg gene is more conserved than gdh gene, not being able to discriminate the sub-groups of parasite assemblages. Based on the presented results we can conclude the participation of zoonotic genotypes is important in the epidemiology of giardiasis in residents of the coast cities of Sao Paulo state and molecular characterization studies of G. duodenalis are essential for better understanding the epidemiology of this infection.

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:04:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao-marcos-andre-matos.pdf: 725697 bytes, checksum: e2fcb1b4531591c5a4eeebc3b47ca54f (MD5) Previous issue date: 2008-12-20 / The aim of this study was to investigate the seroepidemiological and molecular profile of the hepatitis B virus (HBV) infection in long distance truck drivers in Brazil. From October 2005 to 2006, 641 individuals were interviewed on sociodemographic and risk factors, and blood samples were collected to test for HBV markers (HBsAg, anti- HBs and anti-HBc) by the enzyme linked immunosorbent assay (ELISA). HBsAg positive samples were submitted to HBV DNA detection by polymerase chain reaction (PCR) and genotyping by restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. A global prevalence of HBV was 18.9% (95% CI: 15.9-22.2): 16 were HBsAg positive, 117 anti-HBc total and 69 anti-HBs. Thirty truck drivers were anti- HBs only, suggesting vaccination against hepatitis B. Length of profession above 20 years, time away from home more than 15 days and history of sexually transmitted diseases (STD) were independently associated to HBV positivity by multivariate analysis. Among HBsAg-positive truck drivers, one (6.2%) were HBeAg reactive, nine (56.25%) anti-HBe positive and the rest negative for both markers. HBV DNA was detected in nine samples of the HBsAg-positive individuals, being identified the genotype A (22.2%), D (55.6%) and F (22.2%). These findings ratify the high risk of hepatitis B infection in truck drivers, and highlight the importance of public health politics addressed to this group whom presents characteristics which may favour HBV acquiring and it dissemination. / O objetivo deste estudo foi investigar o perfil soroepidemiológico e molecular da infecção pelo vírus da hepatite B em caminhoneiros de rota longa no Brasil. De outubro de 2005 a outubro de 2006, 641 indivíduos foram entrevistados sobre dados sócio-demográficos e fatores de risco, e coletadas amostras sanguíneas para detecção dos marcadores sorológicos do HBV (HBsAg, anti-HBs e anti-HBc) pelo ensaio imunoenzimático (ELISA). As amostras HBsAg reagentes foram submetidas a detecção do DNA viral pela reação da polimerase em cadeia (PCR) e genotipadas pela análise do polimorfismo de comprimento dos fragmentos de restrição (RFLP). A prevalência global para os marcadores da infecção pelo HBV foi de 18,9% (IC 95%: 15,9-22,2): 16 eram HBsAg positivos, 117 anti-HBc total e 69 anti-HBs. Trinta caminhoneiros apresentaram positividade isolada ao anti-HBs, evidenciando imunidade contra hepatite B. Tempo de profissão acima de 20 anos, tempo de permanência fora do lar superior a 15 dias e história de doença sexualmente transmissível (DST) foram fatores independentemente associados à positividade ao HBV pela análise multivariada. Dentre os caminhoneiros HBsAg reagentes, um (6,2%) apresentou reatividade ao HBeAg, nove (56,2%) ao anti-HBe e o restante negativo para ambos os marcadores. HBV DNA foi detectado em nove amostras de indivíduos HBsAg reagentes, sendo identificados os genótipos A (22,2%), D (55,6%) e F (22,2%). Os resultados deste estudo ratificam o risco elevado da população caminhoneira para infecção pelo HBV, e apontam para a necessidade de políticas públicas de saúde voltadas para este grupo, que apresenta características que favorecem a aquisição e disseminação do vírus da hepatite B.

Giardia duodenalis é um protozoário entérico de distribuição mundial responsável por causar a giardíase em uma grande variedade de mamíferos, incluindo os humanos. É considerada uma espécie complexa, no qual os isolados podem ser classificados em sete agrupamentos genéticos distintos apesar de serem morfologicamente indistinguíveis. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade genotípica de isolados de G. duodenalis provenientes de humanos naturalmente infectados, residentes em cidades do litoral de São Paulo, na Baixada Santista. A caracterização molecular de 43 isolados pelo seqüenciamento parcial de genes codificadores da enzima glutamato-desidrogenase (gdh) e da proteína beta-giardina (bg) mostrou que o assemblage B da G. duodenalis é o mais freqüente na região litorânea, ocorrendo em 53,5% (n=23) das amostras, sendo o assemblage A identificado em 34,8% (n=15). A maioria das seqüências obtidas pelo gene gdh se mostrou polimórfica, caracterizada por picos duplos de nucleotídeos em algumas posições em cromatograma e quando a análise dos dois genes foi combinada cinco isolados apresentaram identidades diferentes. A esses fenômenos duas explicações são atribuídas, infecção mista ou heterozigose de seqüência alélica. As análises filogenéticas mostraram que o gene bg é mais conservado que o gene gdh, não sendo capaz de discriminar os sub-agrupamentos que constituem os Assemblages do parasita. Com base nos resultados apresentados podemos concluir que a participação de genótipos zoonóticos é relevante na epidemiologia das giardíases nos indivíduos residentes das cidades litorâneas do estado de São Paulo e que estudos de caracterização molecular da G. duodenalis são indispensáveis para melhor conhecimento da epidemiologia desta infecção. / Giardia duodenalis is an enteric protozoa of global distribution responsible for causing giardiasis in a wide range of mammals including humans. Is considered complex specie in which the isolates can be classified in different genetic groups despite to be morphologically indistinguishable. The purpose of this study was evaluating the genetic variability of G. duodenalis isolates from humans naturally infected residents in the coast cities of Sao Paulo, in Baixada Santista. The molecular characterization of 43 isolates using the gene encoding glutamate-desidrogenasi enzyme (gdh) and beta-giardin protein (bg) showed that the assemblage B is the most common in the coast region, occurring in 53.5% (n=23) samples, the assemblage A was identified in 34.8% (n=15). Most sequences obtained by the gdh gene showed polymorphism, characterized for double peaks of nucleotides in some chromatogram positions and when the analysis of two genes was combined five isolates were differently identified. For this phenomena can be attributed two explanations, mixed infections or heterozygosis allelic sequence. The phylogenetic analysis showed that bg gene is more conserved than gdh gene, not being able to discriminate the sub-groups of parasite assemblages. Based on the presented results we can conclude the participation of zoonotic genotypes is important in the epidemiology of giardiasis in residents of the coast cities of Sao Paulo state and molecular characterization studies of G. duodenalis are essential for better understanding the epidemiology of this infection.

Submitted by Johnny Rodrigues (johnnyrodrigues@ufcg.edu.br) on 2018-06-14T16:11:05Z No. of bitstreams: 1 JANIVAN FERNANDES SUASSUNA - DISSERTAÇÃO PPGEA 2011..pdf: 18061504 bytes, checksum: fd08a63472b542945b135446d04567f6 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-14T16:11:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JANIVAN FERNANDES SUASSUNA - DISSERTAÇÃO PPGEA 2011..pdf: 18061504 bytes, checksum: fd08a63472b542945b135446d04567f6 (MD5) Previous issue date: 2011-02 / CNPq / No Nordeste brasileiro ocorrem períodos longos e variados de seca, constituindo-se de grande relevância a identificação de materiais genéticos promissores para cultivo em tais condições. Conhecendo-se as funções do porta-enxerto e sua importância para o sucesso da citricultura, inclusive sobre sua influência na tolerância a fatores de estresse, realizou-se este trabalho objetivando-se avaliar a tolerância de genótipos de citros (variedades e híbridos) ao estresse hídrico na fase de formação de porta-enxerto. Para tanto, um experimento em viveiro telado da UFCG, foi realizado, em duas etapas (A e B), no qual os tratamentos foram compostos pela combinação dos fatores, manejo hídrico (MH) e genótipos (GEN). Na etapa A, de 60 a 135 dias após a semeadura (DAS), os tratamentos foram: MHj - umidatfc no substrato dos tubetes. correspondente ao nível de 100% do conteúdo hídrico próximo à capacidade de campo (CC) e MHj - umidade no substrato dos tubetes correspondente ao nível de 50% da CC Na etapa B, de 136 a 210 DAS, manteve-se o tratamento MHj, com o substrato próximo à CC em MHj, intensificou-se o nível de estresse, passando as plantas a receber irrigação no nível 25% da CC. O fator GEN foi constituído de 10 genótipos de porta-enxertos de citros, 'variedades e híbridos' provenientes do Programa de Melhoramento Genético de Citros da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical. O delineamento experimental foi em blocos casualizados, com um fatorial 2 x 10 e 3 repetições, a parcela foi constituída de 15 plantas, cultivadas individualmente em tubetes de 288 mL de capacidade volumétrica. As intensidades de estresse foram monitoradas diariamente por pesagem dos tubetes, para se avaliar a perda de água. A avaliação do estresse foi concluída individualmente por genótipo, quando começaram a secar e/ou a cairem 50% das folhas das plantas, em mais da metade dos tubetes. Durante o experimento foram avaliadas variáveis de crescimento e fisiológicas. Na coleta final foram realizadas, ainda, avaliações de fitomassa e, mediante análise da fitomassa total, os genótipos foram classificados em moderadamente tolerantes, moderadamente sensíveis e sensíveis ao estresse hídrico. Os dados obtidos foram avaliados por análise de variância e teste 'F' até 5% de probabilidade e analise de comparação das médias pelo teste de Scott-Knott (p<0,05) para o fator genótipos O estresse hídrico promoveu alterações nas trocas gasosas, no crescimento e na produção de fitomassa dos porta-enxertos de cirros. Os porta-enxertos 'TSKC x TRENG256', 'TSKC x (TR x LCRH>59', 'TSKFL x CTTR-017', 'TSKC x TRENG-264' e 'TSKFL x LRM-007' são mais promissores para cultivo em condições de baixa disponibilidade hídrica e os genótipos 'LCRSC, 'TSKFL x CTC25-0T0', 'CTSW, 'LCRC e 'LVK' não resistiram ao estresse hídrico de 25% da capacidade de campo. / In Northeast Brazil. long and varied drought periods occur, and it is of great importance to identify promising genetic materiais for farming in these conditions. Knowing the rootstock functions and its importance to the success of citrus crops, including its influence on the tolerance of stress factors, a research was carried out aiming to evaluate the tolerance of citrus genotypes (varieties and hybrids) to water stress on rootstock formation. For this, an experiment was conducted in the nursery at UFCG, on two stages (A and B), in which the treatments consisted of combinations factor, water management (MH) and genotypes (GEN). On stage A, from 60 to 135 days after sowing (DAS), the treatments were: MHi - substrate moisture in the tubes, corresponding to a levei of 100% of the water content at field capacity (CC), and MH2 - substrate moisture in the tubes, corresponding to a levei of 50% water content CC. In the stage B, from 136 to 210 DAS, the MH] factor with the remained plants in the CC moisture, and in the MH2 the stress levei was intensified, and the plants remained in a moisture of 25% water content CC. The GEN factor consisted of 10 citrus rootstock genotypes, 'varieties and hybrids'. of the Citrus Genetic Improvement Program. The experimental design was randomized blocks with a 2 x 10 factorial, and three replications; the plot consisted of 15 plants, cultivated individually in plastic tubes of 288 mL of volume capacity. The stress intensity was monitored daily by weighing the tubes, to measure the water loss. When 50% of the plant leaves began to dry and/or fali in more than half of the tubes, the stress evaluation was completed individually by genotype. During the experiment, growth and physiological variables were evaluated. In the final collection, biomass evaluations were performed, and according to the total biomass analysis the genotypes were classified into moderately tolerant, moderately sensitive, and sensitive to water stress. The data were evaluated by variance analysis and test 'F' (p<0.05) and analysis by comparison of averages by Scott-Knott test for genotype factor, to 5 % probability. Water stress provided changes on leaf gas exchange, on growth and biomass production of rootstocks citrus genotypes. The genotypes 'LCRSC, 'TSKFL x CTC25-010', 'CTSW 'LCRC and 'LVK' did not survive to water stress of 25% moisture corresponding to field capacity; and rootstocks 'TSKC x TRENG-256', 'TSKC x (TR x LCR)-059', 'TSKFL x CTTR-017', 'TSKC x TRENG-264' and 'TSKFL x LRM-007', are most promising for farming in scarce water availability.