O conhecimento de aspectos epidemiológicos do patossistema Phakopsora pachyrhizi - soja pode auxiliar no controle da doença. Para isso, foram realizados quatro experimentos. (1) Urediniósporos foram avaliados quanto à germinação e formação de apressórios em placas de poliestireno, nas temperaturas de 8, 12, 15, 20, 25 e 30ºC e períodos de molhamento de 1, 2, 4, 8 e 12h de incubação. As avaliações foram realizadas contando-se os urediniósporos não germinados, germinados e os que formaram apressório. (2) Plantas de soja da variedade BRS 154, no estádio V2, foram inoculadas e mantidas nas temperaturas de 10, 15, 20, 22,5, 25, 27,5 e 30ºC e nos períodos de molhamento foliar de 0, 4, 6, 8, 12, 16 e 24h. Em cada tratamento foi determinado o período latente e após 14 dias da inoculação, por meio de fotografia das folhas, foram quantificadas a freqüência de infecção, tamanho médio de lesão e severidade. (3) Plantas da mesma variedade e estádio, foram inoculadas e mantidas na temperatura de 23°C por período de 24h de molhamento foliar. Após esse período, elas foram transferidas para temperaturas de 23, 30, 35 e 40°C. Foram determinados o período de incubação e latente. Após 14 dias da inoculação foram quantificadas a freqüência de infecção, tamanho médio de lesão e severidade. (4) Plantas de soja dos genótipos BRS 154, BRS 258, PI 459025 (Bing Nan), PI 200487 (Kinoshita), PI 471096 (Orba) e PI 274453 (Shiranui) no estádio V2, foram inoculadas e mantidas em câmaras de crescimento nas temperaturas de 15 e 25°C e duração do período de molhamento foliar inicial de 24h. Foram determinados o período de incubação e latente. As avaliações da intensidade da doença foram realizadas aos 13 e 20 dias após a inoculação para as plantas mantidas a 25 e 15°C, respectivamente. Os dados de germinação e formação de apressórios apresentaram bom ajuste ao modelo Beta generalizado em relação à temperatura e o modelo Monomolecular em relação ao período de molhamento. Houve infecção nos períodos de molhamento a partir de 6 horas e em todas as temperaturas testadas, exceto na de 30 °C. O período latente foi influenciado pela temperatura e os dados foram ajustados a equação do segundo grau. O menor período latente foi de nove dias na temperatura de 22,5 °C. A função Beta generalizada ajustou-se ao comportamento da severidade e da freqüência de infecção em relação à temperatura e o modelo Monomolecular ajustou-se em relação ao período de molhamento. O tamanho médio de lesão não foi influenciado pelos tratamentos testados. A temperatura interferiu no processo de colonização e o patógeno conseguiu se desenvolver apenas nas temperaturas de 23 e 30 °C. A temperatura de 30°C não influenciou nas variáveis: freqüência de infecção, tamanho médio de lesão e severidade, mas aumentou o período de incubação e o período latente. Os genótipos que desenvolveram sintomas RB apresentaram maior período latente e menor número de urédias por lesão quando comparadas com BRS 154. / The knowledge of epidemiological aspects of Phakopsora pachyrhizi - soybean pathosystem can help in controlling this disease. For this four experiments were performed. (1) Urediniospores were evaluated regarding germination and appressorium formation in polystyrene plates, in the temperatures of 8, 12, 15, 20, 25 and 30ºC and wetness duration of 1, 2, 4, 8 and 12h of incubation. The evaluations were carried out by counting ungerminated, germinated without appressorium and germinated with appressorium urediniospores. (2) Plants of BRS 154 soybean cultivar, in the V2 stage, were inoculated and kept in temperatures of 10, 15, 20, 22.5, 25, 27.5 and 30°C and in leaf wetness duration of 0, 4, 6, 8, 12, 16 and 24h. In each treatment the latent period was determined. 14 days after inoculation, the frequency of infection, lesion size and severity were evaluated by digital images of the leaves. (3) Plants of the same cultivar and stage were inoculated and kept in the temperature of 23°C for a period of 24h of leaf wetness. After this period, the plants were transferred to temperatures of 23, 30, 35 and 40°C. The incubation and latent period were determined. After 14 days of inoculation the frequency of infection, lesion size and severity were quantified. (4) Plants of soybean genotypes BRS 154, BRS 258, PI 459025 (Bing Nan), PI 200487 (Kinoshita), PI 471096 (Orba) and PI 274453 (Shiranui) in the V2 stage, were inoculated and kept in growth chambers in temperatures of 15 and 25°C and 24h of initial leaf wetness duration. The incubation and latent period were determined. The evaluations of disease intensity were carried out at 13 and 20 days after inoculation for the plants kept at 25 and 15°C respectively. The data of germination and appressorium formation had a good fit to the Beta generalized model in relation to the temperature and the Monomolecular model in relation to the wetness duration. Infection occurred in wetness duration of 6 hours or more and in all of temperatures, except 30°C. The latent period was influenced by the temperature and the data were fitted to a second degree equation. The shortest latent period was nine days in the temperature of 22.5°C. The Beta generalized model fitted the behavior of severity and frequency of infection in relation to the temperature, and the wetness duration fitted the Monomolecular model. The lesion size was not influenced by the treatments. The temperature interfered the pathogen colonization and it developed only in the temperatures of 23 and 30°C. The temperature of 30°C did not influence frequency of infection, lesion size and severity, but it increased the incubation and latent periods. The genotypes with RB symptoms showed greater latent period and smaller number of uredia per lesion when compared with BRS 154.

O oídio do pimentão e pimenteiras, causado pelo fungo Leveillula taurica, tem sido considerado atualmente a doença mais séria do cultivo protegido, causando perdas de até 75%. O uso de fungicidas é ineficaz sendo a melhor maneira de controle através da resistência genética. As fontes de resistência ao oídio encontradas em Capsicum annuum L., não tem sido satisfatórias por apresentarem resistência parcial e as melhores fontes ocorrem nas espécies C. baccatum e C. chinense. Existem poucos estudos sobre a herança da resistência nessas espécies. O objetivo deste trabalho foi de triar os acessos da coleção de Capsicum da ESALQ/USP, identificando possíveis fontes de resistência nas espécies C. annuum, C. baccatum e C. chinense e obter informações sobre a herança da reação de pimentão e pimentas ao oídio. Para isso 156 acessos de Capsicum foram triados e posteriormente cruzamentos entre progenitores resistentes versus suscetíveis e resistentes versus resistentes foram obtidos. As gerações F2 e alguns retrocruzamentos foram obtidos. As avaliações das reações ao oídio foram feitas na fase de frutificação, através de uma escala de notas de acordo com a severidade da doença de 1 (resistente) a 5 (altamente suscetível). Foram estimados: o número de locos segregantes, os coeficientes de herdabilidade, os progressos esperados na seleção e o tipo de ação gênica envolvida. Foram avaliadas também as reações dos híbridos entre progenitores resistentes. Dentre os materiais triados em C. annuum apenas 5% foram considerados resistentes, em C. baccatum 84% e em C. chinense 85%. A herança da resistência aooídio em Capsicum mostrou ser poligênica. As herdabilidades e ganhos de seleção estimados foram altos, indicando boas perspectivas de progresso seletivo. Os progenitores resistentes em Capsicum annuum possuem diferentes mecanismos genéticos e expressões de resistência. Enquanto em C. baccatum e C. chinense os mecanismos de resistência mostraram ser os mesmos, havendo alelismo entre as fontes. A fonte de resistência do pimentão HV-12 foi a melhor para o uso no melhoramento. / Powdery mildew caused by the fungus Leveillula taurica, is considered the most serious greenhouse sweet pepper disease, causing losses up to 75%. Its control by fungicide is ineffective, and the best way to control would be by genetic resistance. Powdery mildew resistance sources identified in Capsicum annuum L. have been unsatisfactory because they have partial resistance. The best resistant sources seem to be found in the species C. baccatum and C. chinense. However, the resistance inheritance has not been studied in these hot pepper species, except for C. annuum, with few published pappers. The present study aimed to screen the Capsicum ESALQ/USP collection accesses, to identify potential resistance sources in C. annuum, C. baccatum and C. chinense and elucidate the reaction inheritance to powdery mildew in sweet pepper and hot pepper. A total 156 Capsicum access were tested. Crosses among resistant and susceptible progenitors and among resistant ones were carried out. F2 and backcrosses generations were obtained. Reactions evaluations to powdery mildew were carried out during the fruit production using rating system based on score disease severity using scale varying from 1 (resistant) to 5 (highly susceptible). Estimation of segregating loci number, heritability and expected selection gains was made, to investigate the gene action and to evaluate the reaction to powdery mildew from resistant versus resistant single hybrids. Only 5% of the C. annuum accesses evaluated were considered to be resistant, in contrast with 84% and 85% obtained for C. baccatum and C. chinense, respectively. Resistance inheritance to powdery mildew in Capsicum spp. was found to be polygenic. In view of the high heritability and selection gains estimates, good selection progresses are expected. The genetic systems controlling resistance in the Capsicum annuum progenitors have different genetic mechanisms and expressions of resistance, while in C. baccatum and C. chinense showed to be the same in each ones with allelism between the sources. The sweet pepper HV-12 was the best source to use in breeding.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T12:51:13Z No. of bitstreams: 1 Jeferson Araujo Silva.pdf: 166823 bytes, checksum: 6c389068c6abcff8459db563807d3eb8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T12:51:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jeferson Araujo Silva.pdf: 166823 bytes, checksum: 6c389068c6abcff8459db563807d3eb8 (MD5) Previous issue date: 2011-02-22 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The collar rot caused by Sclerotium rolfsii, is an important disease that causes an incidence in lima bean (Phaseolus lunatus L.) at the Northeastern of Brazil. Aiming to select genotypes with potential to be used in a disease management, there were 50 genotypes of lima bean evaluated in relation to an isolate of S. rolfsii. Plants with 10 days old were inoculated by an injury into their base and deposited the sclerotia of the pathogen. The evaluation occurred at the 10th day after the inoculating, by calculating the percentage of the number of plants with symptoms in relation to the total of plants per pot. Most part of the genotypes (58%) behaved as highly susceptible to the pathogen while 28% were classified as susceptible, 10% as moderately resistant. Only two genotypes (F-2 and F-25) behaved as extremely resistant, corresponding to 4% of the total. The stability of resistance of these two genotypes was evaluated in relation to 10 isolates of S. rolfsii. Both genotypes showed a good level of resistance, thus demonstrating the potential of its use as a strategy for management of collar rot of the lima bean crop. / A podridão do colo, causada por Sclerotium rolfsii, é uma importante doença que pode incidir em fava (Phaseolus lunatus L.) no Nordeste brasileiro. Visando selecionar genótipos com potencial de utilização no manejo da doença, foram avaliados 50 genótipos de fava, em relação a um isolado de S. rolfsii. Plantas com 10 dias de idade foram inoculadas pelo método de ferimento do colo e deposição do escleródio do patógeno. A avaliação ocorreu aos 10 dias após a inoculação pela mensuração da incidência da doença, considerando a porcentagem de plantas com sintomas em relação ao total de plantas por vaso. A maioria dos genótipos (58%) se comportou como altamente suscetível ao patógeno, enquanto que 28% foram classificadas como suscetíveis e 10% como medianamente resistentes. Somente dois genótipos (F-2 e F-25) se comportaram como altamente resistentes, correspondendo a 4% do total. A estabilidade da resistência destes dois genótipos foi avaliada em relação a 10 isolados de S. rolfsii. Ambos os genótipos apresentaram um bom nível de resistência, demonstrando potencial de utilização como estratégia de manejo da podridão do colo na cultura da fava.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T16:51:26Z No. of bitstreams: 1 Leonardo Tavares de Souza (1).pdf: 547012 bytes, checksum: 3ce24d8a338d375481b7eaa6393560c4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T16:51:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Leonardo Tavares de Souza (1).pdf: 547012 bytes, checksum: 3ce24d8a338d375481b7eaa6393560c4 (MD5) Previous issue date: 2009-02-18 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, is an important disease of tomato (Solanum lycopersicon L.) in Northeastern Brazil. Order to select genotypes with potential for use in the disease management, 60 strains were evaluated (F7 generation) from the crossing of access BHRS-2, 3 and Viradoro cultivar in relation to isolates from the physiologic races 2 and 3 of F. oxysporum f. sp. lycopersici. Seedlings 21 days old were inoculated using the method of cutting the roots and soak in the suspension of conidia of the pathogen. The evaluation was performed after 21 days, with the scale of grades ranging from 1 to 5. The genotypes were grouped into five classes of reaction. Most genotypes (73.3%) behaved as highly resistant to the race 2 isolate, while 45.0% were classified as susceptible and 28.3% as highly susceptible to the race 3 isolate. Only the L-1 strain showed high resistance reaction to both isolates. The stability of this line of resistance was evaluated on five isolates ofeach race (2 and 3). The line L-1 showed high levels of resistance to all race 2 isolates, therefore indicating high stability of resistance. However, for race 3 isolates, this strain showed three distinct classes of reaction, ranging from highly resistant to susceptible, indicating instability of resistance to this race. / A murcha-de-fusário, causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, é uma importante doença do tomateiro (Solanum lycopersicon L.) no Nordeste brasileiro. Visando selecionar genótipos com potencial de utilização no manejo da doença, foram avaliadas 60 linhagens (geração F7) oriundas do cruzamento entre o acesso BHRS-2,3 e a cultivar Viradoro, em relação a isolados das raças fisiológicas 2 e 3 de F. oxysporum f. sp. lycopersici. Mudas com 21 dias de idade foram inoculadas pelo método do corte de raízes e imersão na suspensão de conídios do patógeno. A avaliação foi realizada após 21 dias, com o auxílio de escala de notas de 1 a 5, para agrupamento dos genótipos em cinco classes de reação. A maioria dos genótipos (73,3%) se comportou como altamente resistente ao isolado da raça 2, enquanto 45,0% foram classificados como suscetíveis e 28,3% como altamente suscetíveis ao isolado da raça 3. Somente a linhagem L-1 apresentou reação de alta resistência aos dois isolados de ambas as raças. A estabilidade da resistência dessa linhagem foi avaliada em relação a cinco isolados de cada raça (2 e 3) do patógeno. A linhagem L-1 apresentou reação de alta resistência a todos os isolados da raça 2, evidenciado estabilidade da resistência. No entanto, em relação aosisolados da raça 3, essa linhagem apresentou três classes de reação distintas, variando de altamente resistente a suscetível, indicando instabilidade da resistência à essa raça.

O oídio do pimentão e pimenteiras, causado pelo fungo Leveillula taurica, tem sido considerado atualmente a doença mais séria do cultivo protegido, causando perdas de até 75%. O uso de fungicidas é ineficaz sendo a melhor maneira de controle através da resistência genética. As fontes de resistência ao oídio encontradas em Capsicum annuum L., não tem sido satisfatórias por apresentarem resistência parcial e as melhores fontes ocorrem nas espécies C. baccatum e C. chinense. Existem poucos estudos sobre a herança da resistência nessas espécies. O objetivo deste trabalho foi de triar os acessos da coleção de Capsicum da ESALQ/USP, identificando possíveis fontes de resistência nas espécies C. annuum, C. baccatum e C. chinense e obter informações sobre a herança da reação de pimentão e pimentas ao oídio. Para isso 156 acessos de Capsicum foram triados e posteriormente cruzamentos entre progenitores resistentes versus suscetíveis e resistentes versus resistentes foram obtidos. As gerações F2 e alguns retrocruzamentos foram obtidos. As avaliações das reações ao oídio foram feitas na fase de frutificação, através de uma escala de notas de acordo com a severidade da doença de 1 (resistente) a 5 (altamente suscetível). Foram estimados: o número de locos segregantes, os coeficientes de herdabilidade, os progressos esperados na seleção e o tipo de ação gênica envolvida. Foram avaliadas também as reações dos híbridos entre progenitores resistentes. Dentre os materiais triados em C. annuum apenas 5% foram considerados resistentes, em C. baccatum 84% e em C. chinense 85%. A herança da resistência aooídio em Capsicum mostrou ser poligênica. As herdabilidades e ganhos de seleção estimados foram altos, indicando boas perspectivas de progresso seletivo. Os progenitores resistentes em Capsicum annuum possuem diferentes mecanismos genéticos e expressões de resistência. Enquanto em C. baccatum e C. chinense os mecanismos de resistência mostraram ser os mesmos, havendo alelismo entre as fontes. A fonte de resistência do pimentão HV-12 foi a melhor para o uso no melhoramento. / Powdery mildew caused by the fungus Leveillula taurica, is considered the most serious greenhouse sweet pepper disease, causing losses up to 75%. Its control by fungicide is ineffective, and the best way to control would be by genetic resistance. Powdery mildew resistance sources identified in Capsicum annuum L. have been unsatisfactory because they have partial resistance. The best resistant sources seem to be found in the species C. baccatum and C. chinense. However, the resistance inheritance has not been studied in these hot pepper species, except for C. annuum, with few published pappers. The present study aimed to screen the Capsicum ESALQ/USP collection accesses, to identify potential resistance sources in C. annuum, C. baccatum and C. chinense and elucidate the reaction inheritance to powdery mildew in sweet pepper and hot pepper. A total 156 Capsicum access were tested. Crosses among resistant and susceptible progenitors and among resistant ones were carried out. F2 and backcrosses generations were obtained. Reactions evaluations to powdery mildew were carried out during the fruit production using rating system based on score disease severity using scale varying from 1 (resistant) to 5 (highly susceptible). Estimation of segregating loci number, heritability and expected selection gains was made, to investigate the gene action and to evaluate the reaction to powdery mildew from resistant versus resistant single hybrids. Only 5% of the C. annuum accesses evaluated were considered to be resistant, in contrast with 84% and 85% obtained for C. baccatum and C. chinense, respectively. Resistance inheritance to powdery mildew in Capsicum spp. was found to be polygenic. In view of the high heritability and selection gains estimates, good selection progresses are expected. The genetic systems controlling resistance in the Capsicum annuum progenitors have different genetic mechanisms and expressions of resistance, while in C. baccatum and C. chinense showed to be the same in each ones with allelism between the sources. The sweet pepper HV-12 was the best source to use in breeding.

Thesis (MSc)--Stellenbosch University, 2012. / ENGLISH ABSTRACT: Plant diseases are among the major causes of food insecurity. In South Africa the wheat fungal diseases including stem rust caused by Puccinia graminis f. sp. tritici, leaf rust caused by P. triticina and stripe rust caused by P. striiformis f. sp. tritici are the most important. Genetic resistance is a viable way of protecting wheat crops against the wheat rusts, especially cultivars carrying multiple genes that confer durable resistance. In order to breed for multi-gene resistance an effective breeding strategy that allows for selecting multiple resistance genes and other desirable traits needs to be devised. The aim of this study was to identify a number of genotypes with combinations of different rust resistance genes, good grain yield and end-use quality out of an existing pre-breeding population and thereby identify superior parents. In order to achieve the stated aim the following objectives have been identified: identify wheat lines through marker-assisted selection (MAS) carrying the gene complexes, Sr31/Lr26/Yr9, Lr24/Sr24, Lr37/Sr38/Yr17, Lr34/Yr18 and Sr2; to develop inbred lines to evaluate selected lines under field trials. From the initial subset of 64 lines, 60 were chosen and advanced to the doubled haploid (DH) phase and seed multiplication. The 60 lines either carried one or more of the three rust resistance gene complexes. The genes that were the most prominent were Sr31/Lr26/Yr9 and Lr24/Sr24. The selected lines were incorporated into a DH seed multiplication phase. After 4 cycles of seed increases and preliminary field evaluation during multiplication, 15 lines were chosen and subjected to multi-location field trails. The extensive multi-location field trails carried out in this study aided in identifying genotypes from the 15 MS-MARS lines with good adaptability and stability in regards to yield and baking quality. An important observation was that the molecular markers employed to indentify quality loci correlated well with the genes encoding the HMW-GS 5, 10 and 12 as observed with the Agilent© 2100 Bioanalyzer. In future studies the lines which performed the best could be re-introduced into the existing MSMARS pre-breeding programme of the Stellenbosch University’s Plant Breeding Laboratory (SUPBL). The frequencies of desired alleles could be increased in this manner. Since the majority of these characteristics are influenced by quantitatively inherited alleles, using these lines as recurrent parents will increase the frequencies of these alleles in the existing SU-PBL pre-breeding population. / AFRIKAANSE OPSOMMING: Plantsiektes is van die belangrikste oorsake van voedselonsekerheid ter wêreld. In Suid-Afrika is die roesswamme van die belangrikste plantsiektes wat koring produksie beïnvloed. Hierdie siektes sluit in, stamroes wat veroorsaak word deur Puccinia graminis f. sp. tritici, blaarroes wat veroorsaak word deur P. triticina en streeproes wat veroorsaak word deur P. striiformis f. sp. tritici. Genetiese weerstand is ‘n uitstekende manier om koring te beskerm teen hierdie swamsiektes. Weerstand wat gebasseer is op veelvuldige weerstandsgene is veral ‘n goeie middel om genetieseweerstand op ‘n volhoubare basis in koringteling toe te pas. Om veelvuldige weerstandsgene in koringkultivars in te teel word ‘n effektiewe telingstrategie benodig. Die doel van die studie was om genotipes te identifiseer met kombinasies van veelvuldige weerstandsgene vir roes, sowel as goeie eienskappe belangrik vir graanopbrengs en bakkwaliteit. Lyne is geïdentifiseer uit ‘n bestaande voortelingspopulasie van Stellenbosch Universiteit se Planteteelt Laboratorium (SU-PTL) wat geteel was met spesifiek weerstand en opbrengs potensiaal in gedagte. Om die doel van die studie te bereik is sekere doelwitte daar gestel. Hierdie doelwitte sluit in om lyne uit die populasie te selekteer deur middel van merker bemiddelde seleksie (MBS) vir gene naamlik Sr31/Lr26/Yr9, Lr24/Sr24, Lr37/Sr38/Yr17, Lr34/Yr18 en Sr2; om die geselekteerde lyne suiwertelend te maak; sowel as om die suiwertelende lyne in veld proewe in te sluit. Van die oorspronklike stel van 64 lyne, is 60 gekies vir verdere studie. Deur middel van die verdubbelde haploïed (VH) tegniek is die lyne suiwertelend gemaak. Die 60 lyne het een of meer van die geselekteerde gene bevat. Die mees prominente gene was die twee geen komplekse Sr31/Lr26/Yr9 en Lr24/Sr24. Na vier siklusse van saadvermeerdering en voorloppige seleksies is 15 lyne ingesluit by ‘n multi-omgewing veldproef. Hierdie uitgebreide multi-omgewing veldproewe het gehelp om individue uit die 15 lyne te identifiseer wat oor goeie aanpasbaarheid en stabiliteit beskik met betrekking tot opbrengs en bak kwaliteit. Die molekulêre merkers gebruik om die gene verantwoordelik vir die kodering van HMGGS 5, 10 en 12 op te spoor het goed gekorreleer met die HMG-GS bande bepaal met behulp van die Agilent© 2100 Bioanalyzer. Toekomstige studies kan moontlik insluit die gebruik van die lyne wat geïdentifiseer was met goeie kenmerke in die bestaande MS-MARS teelprogram van die SU-PTL. Die frekwensies van die verlangde allele kan op hierdie manier in die populasie verhoog word.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2004-11-30Bitstream added on 2014-06-13T20:25:41Z : No. of bitstreams: 1 souza_vl_dr_botfca.pdf: 2271657 bytes, checksum: 47639580599fdb90506aaf118467c1e8 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff), agente causal da murcha-de-curtobacterium em feijoeiro, é um patógeno de colonização vascular de difícil controle. A doença foi detectada pela primeira vez no Brasil na safra das águas de 1995, no Estado de São Paulo. Além da região Sudeste, atualmente a doença encontra-se distribuída nas regiões Sul e Centro-Oeste. Sintomas típicos da doença incluem a murcha, amarelecimento das folhas e morte de plantas, sintoma variável em resposta aos diferentes níveis de resistência em genótipos de feijoeiro. Por tratar-se de uma doença de difícil controle, o uso de material comercial com resistência genética ao patógeno tem sido a melhor opção. O presente trabalho teve como objetivos avaliar a reação de genótipos de feijoeiro a murcha-de-curtobacterium, frente a 333 acessos pertencentes ao banco de germoplasma de feijoeiro do Instituto Agronômico de Campinas (IAC), comparar por meio da microscopia eletrônica de varredura a colonização de Cff em vasos de xilemas de feijoeiros altamente resistentes e suscetíveis, avaliar através de técnica molecular a especificidade dos iniciadores CffFOR2-CffREV4 e CF4-CF5 em reação de PCR, como ferramenta de identificação de vinte e quatro isolados de Cff de diferentes regiões geográficas e dois isolados de Curtobacterium flaccumfaciens endofíticos de citros, como também a variabilidade genética destes isolados pela técnica de rep-PCR, e por fim a análise da agressividade de Cff, através de inoculação em genótipos de feijoeiro suscetíveis e altamente resistentes. Os resultados mostraram a existência de variabilidade genética nas amostras dos 333 genótipos de feijoeiro avaliados, ao isolado de Cff Feij 2634. Os materiais foram classificados em quatro grupos de resistência:... . / Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff), causer agent of the bacterial wilt of common bean. It is a vascular colonization pathogen of difficult control. The disease was first detected in Brazil in the 1995 waters harvest time in São Paulo State. Besides the Southeast region, the disease is currently also distributed in the South and Middle West regions. Typical symptoms of the disease include: wilt yellow leaves and plant death. However, the symptoms are variable according to the different levels of resistance in the plant genotypes. Due to the difficult disease control, genetic resistance has been the better option. The aim of this study was to evaluate the reaction of bean genotypes to the bacterial wilt in common bean in 333 access of the bean plant germoplasm database of the Instituto Agronômico de Campinas (IAC), and to compare the Cff colonization in xylem vessels of highly resistant and susceptible bean plants by scanning electronic microscopy. It also aimed the molecular evaluation of the CffFOR2-CffREV4 and CF4-CF5 primers specificity using PCR reaction in the identification of 24 Cff isolateds from geographically separated regions and 2 citrus endophytic Curtobacterium flaccumfaciens isolated, as well as the genetic variability of these isolates by rep-PCR, and the Cff aggressiveness analysis by the inoculation of susceptible and highly resistant bean plant genotypes. The observed results indicated genetic variability in all 333 genotypes evaluated in relation to the Cff isolate Feij 2634. The materials were classified into four resistance levels: 29 highly resistance genotypes (8.7%), 13 resistant genotypes (3.9%), 18 moderately resistant genotypes (5.0%) and 273 susceptible genotypes (81.0%). Using the scanning electronic microscopy, several bacteria agglutinations involved by filaments and the appearance of tangled structures under the punctuations... (Complete abstract, click electronic address below).

CoordenaÃÃo de AperfeÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / O objetivo deste estudo foi avaliar ferramentas fenotÃpicas, histolÃgicas, imunolÃgicas e moleculares para caracterizar caprinos mestiÃos quanto à resistÃncia e susceptibilidade aos nematoides gastrintestinais. Para isso, foram utilizados 231 animais F2, de ambos os sexos, com idade variando de cinco a dez meses, provenientes de quatro lotes experimentais. Semanalmente, foram coletadas amostras de fezes e sangue para realizaÃÃo dos exames: contagem de ovos por grama de fezes (OPG), coprocultura, volume globular (VG), proteÃna plasmÃtica total (PPT), eosinÃfilos sanguÃneos (EOS) e determinaÃÃo dos nÃveis de imunoglobulinas. Nos mesmos dias das coletas, tambÃm foi realizado o mÃtodo Famacha. Os animais foram ordenados de acordo com os valores de OPG, os 12 animais que apresentaram as menores mÃdias foram caracterizados como resistentes e os 12 animais que apresentaram as maiores mÃdias foram caracterizados como susceptÃveis. Os animais do lote experimental 4, como apresentaram a melhor caracterizaÃÃo fenotÃpica, foram necropsiados para a recuperaÃÃo dos nematoides gastrintestinais e amostras de tecidos para anÃlises histolÃgicas e de expressÃo gÃnica. O OPG foi eficaz, nos quatro lotes, para a caracterizaÃÃo de caprinos resistentes e susceptÃveis as parasitoses gastrintestinais nos dois desafios de infecÃÃo (P<0,05). No quarto lote, as variÃveis: OPG, VG e PPT foram eficazes na identificaÃÃo dos animais quanto a diferentes nÃveis de resistÃncia. Nos demais lotes, o VG, a PPT, a contagem de eosinÃfilos e o Famacha nÃo foram tÃo eficazes como o OPG, para diferenciar caprinos resistentes e susceptÃveis Ãs parasitoses gastrintestinais. Os nÃveis de IgA e IgG, em especial para Haemonchus contortus, nos dois desafios de infecÃÃo, e a contagem de eosinÃfilos no abomaso foram parÃmetros eficazes na resposta imune, indicando que essas cÃlulas de defesa apresentam um papel efetor no controle das infecÃÃes gastrintestinais. Na expressÃo gÃnica, a IL-5 e IL-10 apresentaram nÃveis superiores significativos no grupo susceptÃvel, mostrando que a expressÃo destas citocinas na quinta semana de infecÃÃo pode ter papel em mecanismos de susceptibilidade a nematoides gastrintestinais. / The aim of this study was to evaluate phenotypic, histologic, immunologic and molecular tools to characterize goat crossbred in resistant and susceptibily to gastrointestinal nematodes. For this purpose, we used 231 F2 animals of both genders, of ages between five and ten months, from four different kidding seasons. Stool and blood samples were collected weekly for eggs per gram of feces (EPG) determinations, fecal culture, packed cell volume (PCV), total plasma protein (TPP), blood eosinophils (EOS) and immunological tests. Famacha scores were obtained on the same sample collection days. The animals were ranked according to EPG values and the 12 animals with lowest means were considered resistant while the 12 animals with the highest means were considered susceptible. The animals in the experimental lot 4, presented the best phenotypic characterization and were chosen for, recovery of gastrointestinal nematodes and tissue samples for histological and gene expression determinations. EPG, PCV and TPP were effective in the identification of resistant and susceptible. In the other lots, the PCV, TPP, eosinophil count and Famacha were not as effective as EPG. IgG and IgA levels, particularly for Haemonchus contortus infection in both challenges, showed significant differences in some of the studied timepoints. Resistant animals presented higher eosinophil counts in the abomasum, indicating that these cells participate in the control of gastrointestinal infections. IL-5 and IL-10 gene expression levels were significantly higher in the susceptible group, showing that the expression of these cytokines in the fifth week of infection may have a role in mechanisms of susceptibility to gastrointestinal nematodes.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-09-20T14:58:27Z No. of bitstreams: 1 Allan Deyws Francisco da Silva.pdf: 1051578 bytes, checksum: a96eb23b9457ef89f0db5f7ae48844b2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-20T14:58:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Allan Deyws Francisco da Silva.pdf: 1051578 bytes, checksum: a96eb23b9457ef89f0db5f7ae48844b2 (MD5) Previous issue date: 2014-12-01 / The acerola (Malpighia emarginata D.C.) tropical species originating from the Antilles became a major plant economic importance to Brazil, mainly due to high content of vitamin C present in the fruit. Breeding programs have joined efforts to try to minimize the effects caused by the attack of Meloidogyne enterolobii (Sin.: M. mayaguensis), known as nematodes due to swellings (galls) formed in the attacked roots, which contributes to drastic decrease productivity. Obtaining resistant rootstocks constitutes the most efficient method of control. The objective of this research is to assess genotypes of acerola for resistance to M. enterolobii Yang & Eisenback, continuing the studies started in 2007 seeking rootstock resistant/tolerant adapted to Pernambuco Forest Zone. Twenty-one acerola accesses of the BAG UFRPE, as well as independent matrix were propagated by cuttings, which were planted in polyethylene bags. During 60 days were made inoculation of the plant parasitic nematode, the inoculum suspension consisting of 10,000 eggs and second stage juveniles (J2) of M. enterolobii. The evaluations were performed after 150 days. The reactions of the hosts were framed within the parameters setby the FR reproduction rate estimated by the ratio Pf / Pi, where Pf is the final population and Pi the initial population; gall index (GI) and egg mass index (IMO), using a scale of notes International Meloidogyne Project (IMP). Regarding the reproduction of the nematode was estimated the number of eggs per root system (ERS) and the number of eggs per gram of root (EGR). With values obtained by FR calculations, has become the highest value as a standard of susceptibility and calculated that the reduction percentage, framing the results of each genotype based on concept of Moura and Regis (1987). At the same time were estimated on fresh shoot biomass (FSB), fresh biomass relative to the root system (FBRRS) and dry matter (DM). The design was completely randomized with six replications. Among the different responses to the attack of the M. enterolobii we can highlight the resistant behavior of the genotypes 21 and 37. / A aceroleira (Malpighia emarginata D.C.) espécie tropical originária das Antilhas se tornou uma planta de grande importância econômica para o Brasil, principalmente pelo alto teor de vitamina C presente nos seus frutos. Os programas de melhoramento têm somado esforços para tentar minimizar os efeitos causados pelo o ataque do Meloidogyne enterolobii (Sin.: M. mayaguensis), conhecido como nematóides das galhas devido a intumescimentos (galhas) formados nas raízes atacadas, o que contribui para diminuição drástica da produtividade. A obtenção de porta-enxertos resistentes constitui-se no método mais eficiente de controle. O objetivo desta pesquisa consiste na avaliação de genótipos de aceroleira quanto à resistência a M. enterolobii Yang & Eisenback, continuando os estudos iniciados em 2007 buscando porta-enxerto resistente/tolerante adaptado a Zona da Mata de Pernambuco. Os vinte e um acessos de acerola do BAG da UFRPE, como também a matriz independente foram propagados por estaquia, que foram plantadas em sacos de polietileno. No decorrer de 60 dias foram feitas as inoculações com o fitonematóide, consistindo o inoculo da suspensão de 10.000 ovos e juvenis do segundo estádio (J2) de M. enterolobii. As avaliações foram realizadas após 150 dias. As reações dos hospedeiros foram enquadradas nos parâmetros estabelecidos pelo fator de reprodução FR, estimado pelo quociente Pf/Pi, onde Pf representa a população final e Pi a população inicial; pelo índice de galhas (IG) e índice de massa de ovos (IMO), através da escala de notas do Projeto International Meloidogyne (IMP). Com relação à reprodução do nematoide foi estimado o número de ovos por sistema radicular (OSR) e o numero de ovos por grama de raiz (OGR). Com os números obtidos pelos cálculos do FR, tomou-se o maior valor como padrão de susceptibilidade e calcularam-se os percentuais de redução, enquadrando-se os resultados de cada genótipo na conceituação de Moura e Regis (1987). Paralelamente foram estimadas a biomassa fresca relativa da parte aérea (BFRPA), biomassa fresca relativa do sistema radicular (BFRSR) e matéria seca (MS). O delineamento utilizado foi o inteiramente casualizado com seis repetições. Dentre as diferentes respostas ao ataque podemos destacar os genótipos 21 e 37 quais mostraram comportamento de resistência.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-10-07T12:38:23Z No. of bitstreams: 1 Ana Luisa Rodrigues de Araujo.pdf: 308379 bytes, checksum: 62f174eb7a80f9897623f44325f7ee3c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-07T12:38:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ana Luisa Rodrigues de Araujo.pdf: 308379 bytes, checksum: 62f174eb7a80f9897623f44325f7ee3c (MD5) Previous issue date: 2014-01-31 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The tomato plant is the second most economically important vegetable crop in the world. In Brazil cultivation occurs in different states and for most of the months of the year, thereby favoring the onset of many diseases of economic importance caused by viruses. Among the viruses considered to be limiting this culture stand out from those caused by geminivirus, responsible for considerable losses in production. The geminiviruses are transmitted very efficiently by the vector Bemisia tabaci, popularly known as whitefly. The high incidence of this disease in tomato plants is mainly due to the introduction and spread of the B biotype of the insect vector. One way to control geminivirus is the development of resistant cultivars, which features as one of the best strategies for spreading the infection. Thus, the present study aimed to evaluate the resistance to geminivirus in advanced lines and commercial hybrids of tomato plants in natural conditions in the field, in the area of Belem do Sao Francisco and agronomic development of these materials in Vitoria de Santo Antao. municipality. For this, there were two experiments, both under field conditions. The materials used in the experiments were derived from advanced lines of program improvement of UFRPE and IPA and commercial hybrids. The first experiment, under field conditions, was carried out in the IPA station of Vitória de Santo Antao. The experimental design was completely randomized with three replications and ten plants per plot. Factors research study were: total productivity, marketable productivity, non-commercial productivity and numbers of total fruits, numbers of commercial fruit and fruit numbers of discharges. The second experiment was conducted at the experimental station of the IPA in Belem do Sao Francisco. The materials used and the experimental design were also the same as described previously. Factors study were: to evaluate tomato lines and hybrids for resistance to begomoviruses, identify by molecular markers the Begomovirus species through PCR with specific primers and confirm the identity of amplified sequences by DNA sequencing. / O tomateiro é a segunda hortaliça com maior importância econômica no mundo. No Brasil seu cultivo ocorre em diferentes estados e durante grande parte dos meses do ano, favorecendo assim o surgimento de inúmeras doenças de importâncias econômicas causadas por vírus. Dentre as viroses consideradas como limitantes a esta cultura destacam-se as causadas pelo geminivírus, responsáveis por perdas consideráveis na produção. Os geminivírus são transmitidos com grande eficiência pelo vetor Bemisia tabaci, popularmente conhecida como mosca-branca. A alta incidência dessa doença em tomateiro deve-se principalmente à introdução e dispersão do biótipo B do inseto vetor. Uma forma de controle do geminivirus é o desenvolvimento de cultivares resistentes, que apresenta como uma das melhores estratégias para dispersão da doença. Desta forma, o presente trabalho teve como objetivo avaliar a resistência a geminivírus em linhagens avançadas e em híbridos comerciais de tomateiros, em condições de infecção natural de campo, no município de Belém do São Francisco e o desenvolvimento agronômico desses materiais no município de Vitória de Santo Antão. Para isto, realizaram-se dois experimentos, ambos em condições de campo. Os materiais utilizados nos experimentos foram linhagens avançadas oriundas do Programa de melhoramento da UFRPE e do IPA e híbridos comerciais. O primeiro experimento, de campo, foi realizado na Estação Experimental do IPA de Vitória de Santo Antão. O delineamento experimental foi blocos casualizados com três repetições e dez plantas por parcela. Os fatores de estudo da pesquisa foram: produtividade total, produtividade comercial, produtividade não comercial e número de frutos totais, número de frutos comercias e número de frutos de descartes. O segundo experimento foi realizado na Estação Experimental do IPA de Belém do São Francisco. Os materiais utilizados e o delineamento experimental também foram os mesmos descritos anteriormente. Os fatores de estudos foram: avaliar à resistência a begomovírus, identificar por marcadores moleculares a espécie de Begomovirus via PCR com primers específicos e confirmar a identidade das sequências amplificadas por meio de sequenciamento do DNA.