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VARIABILIDADE DA ATIVIDADE DO ELEMENTO DE TRANSPOSIÇÃO mariner EM POPULAÇÕES NATURAIS DE Drosophila simulans / VARIABILITY OF THE ACTIVITY OF THE mariner TRANSPOSABLE ELEMENT IN NATURAL POPULATIONS OF Drosophila simulansJardim, Sinara Santos 24 February 2012 (has links)
Fundação de Amparo a Pesquisa no Estado do Rio Grande do Sul / Transposition elements (TEs) are DNA sequences with the ability to move from one
chromosome region to another. These elements have different mechanisms of transposition
and diversity in their sequences, giving them wide distribution among most organisms. The
DNA transposon mariner is found in a range of bodies, being ubiquitous in eukaryotes and is
excellent for studying the behavior of TE within natural populations of Drosophila. Among
the natural populations of D. simulans there are variations in the number of copies of mariner
and, hence, in its activity. But within a same population such variations are scarcely
assessed. To estimate the activity in natural populations of D. simulans, crosses were made
between these and the mutant strain, D. simulans white-peach. The F1 males have spots in the
eyes that indicate reversion to the wild condition in a white-peach context, which are used to
estimate the activity. In this work, isofemale strains were prepared from recently collected
natural populations and from strains maintained in the laboratory. The variables assessed the
activity within and between isofemale strains. The number of spots in F1 revealed how many
transposition events occurred, and there was no difference in variances between the isofemale
strains of the same collection site. The area of the spots showed in what phase of development
transposition occurred more frequently. In the test experiment, the embryo stage showed the
large patches. Blotches indicated that mobilization occurred in the early stages of cellular
determination. In crosses between the evaluated isofemale strains and the white-peach strains,
mobilization occurred at all stages of development. Molecular analysis of the copies by qPCR
showed variation. But there was no correspondence between the high number of copies and
patches most isofemale strains. These differences may be due to a single highly active
element or of many elements with low activity. Some already described mariner regulation
mechanisms may be acting in isofemale strains evaluated by inhibiting or decreasing the
activity of some copies. Additional analyses are also needed to investigate how many copies
are actually active in the genome of natural and recently collected strains. / Os elementos de transposição (TEs) são seqüências de DNA com a capacidade de moveremse
de uma região cromossômica para outra. Estes elementos apresentam mecanismos de
transposição diferenciados e diversidade em suas sequências conferindo-lhes ampla
distribuição entre a maioria dos organismos. O transposon de DNA mariner é encontrado
numa gama de organismos, sendo ubíquo nos eucariotos e é excelente para estudar o
comportamento dos TE dentro de populações naturais de Drosophila. Entre as populações
naturais de D. simulans há variações no número de cópias de mariner e, consequentemente,
na sua atividade. Porém, dentro de uma mesma população tais variações são pouco avaliadas.
Para estimar a atividade em populações naturais de D. simulans, cruzamentos foram
realizados entre estas e a linhagem mutante, D. simulans white-peach. Os machos da F1
apresentam nos olhos manchas de reversão à condição selvagem num contexto white-peach,
que são utilizadas para estimar a atividade. Nesse trabalho, foram estabelecidas isolinhagens
de populações naturais, recentemente coletadas e utilizadas linhagens mantidas no laboratório.
As variáveis avaliaram a atividade dentro e entre as isolinhagens. O número de manchas da
F1 revelou quantos eventos de transposição ocorreram e através da análise não apresentou
diferenças nas variâncias entre as isolinhagens de um mesmo local de coleta. A área das
manchas representa em qual fase do desenvolvimento mais ocorreu transposição. No
experimento teste, a fase de embrião foi a que apresentou manchas grandes. Manchas grandes
indicam que a mobilização ocorreu nos estágios iniciais de determinação celular. Nos
cruzamentos entre as isolinhagens avaliadas e a linhagem white-peach, a mobilização ocorreu
em todas as fases do desenvolvimento. A análise molecular do número de cópias de mariner
por qPCR mostrou variação no número de cópias, porém não houve correspondência entre a
alta quantidade de cópias e de manchas na maioria das isolinhagens. Essas diferenças podem
ser devidas a um único elemento altamente ativo ou de vários com baixa atividade.
Mecanismos de regulação de mariner já descritos podem estar atuando nas isolinhagens
avaliadas, inibindo ou diminuindo a atividade de algumas cópias. Também são necessárias
análises adicionais que investiguem quantas cópias realmente estão ativas no genoma das
linhagens naturais e recentemente coletadas.
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