Orientador: Edison Barbieri / Resumo: As praias arenosas e os estuários são ambientes importantes para as aves por serem utilizados como locais de repouso e alimentação, porém ainda há poucas informações sobre a interação das aves com estes ecossistemas. As informações sobre abundância, distribuição e biologia das populações animais são importantes para a preservação dos ambientes estuarinos e das espécies ali presentes. Portanto, este trabalho estudou a assembleia e a dinâmica de populações das aves no Baixio do Arrozal, localizado na Baía de Trapandé, seguindo o pressuposto de que as variações de abundância, dominância e diversidade apresentariam diferenças em relação aos meses e estações do ano. Os dados utilizados foram coletados em censos quinzenais durante o período de abril de 2013 a dezembro de 2016, pelo método do ponto fixo. A partir das amostras obtidas, foram calculadas a frequência de ocorrência, constância abundância, dominância e diversidade. Para o estudo da assembleia foi feito análise de similaridade e teste de correlação com as estações e com os anos de coleta de dados, juntamente com gráfico de barras com erro padrão da abundância total em função da mensalidade e gráfico boxplot deste mesmo índice em função das estações do ano, quanto ao estudo das populações, as variações das abundâncias de cada espécie registrada foram avaliadas através de gráfico boxplot e gráfico de barras com erro padrão em função das estações e da mensalidade. Através da análise de similaridade foram identificados três g... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The sandy beaches and estuaries are important environments to the birds, because they use these places as resting and foraging areas, but there is not a lot of information about the interaction of birds with these ecosystems. Information about abundance, distribution and biology of animal populations are important for preservation of the estuaries and species. Thus, this work studied the assembly and the dynamic population of birds at the Baixio do Arrozal, in Trapandé Bay, supposing the variations of abundance, dominance and diversity would exhibit differences regarding the months and seasons. The data were collected in fortnightly censuses between April 2013 and December 2016, by the point count method. From the collected samples, we calculated the abundance, constance, dominance and diversity index. For the assembly study were made the similarity analysis and correlation test of dominance, abundance and diversity with seasonality and monthly, together with bar chart with standard error to total abundance in function of monthly and a boxplot chart of abundance in function of seasons. For the population study the variations of abundance were evaluated by boxplot chart and bar chart with standard error in function of months and seasons for each registered specie. The similarity analysis resulted in three different groups, which were determined according to abundance and constance, the group I constituted by Thalasseus acuflavidus, Nannopterum brasilianus e Rynchops niger, the... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

O gênero Aburria pertence à família Cracidae e tem como grupo irmão os gêneros Penelope e Penelopina. É composto por cerca de sete táxons, distribuídos por todos os países do continente sul-americano (exceto Chile e Uruguai) e na Ilha de Trinidad. Em geral, habitam florestas tropicais úmidas, matas de altitude e matas de galeria do cerrado, e utilizam as copas das árvores como habitat preferencial. Os representantes do gênero Aburria são caracterizados por possuir a face nua e um topete bem desenvolvido (exceto Aburria aburri), uma barbela na região do pescoço, e a plumagem negra com brilho iridescente. A taxonomia e a sistemática do gênero Aburria Reichenbach (1853) são controversas e até hoje não há um consenso acerca do número de táxons válidos. Poucos foram os estudos que contemplaram adequadamente a variação individual e geográfica dos táxons, além da dificuldade encontrada em descrever as cores das ceras e dos apêndices, desde as primeiras descrições. O presente trabalho teve como objetivo revisar a taxonomia alfa das espécies, redefinindo os táxons terminais e suas respectivas distribuições geográficas. Foram analisados 302 exemplares do gênero Aburria, conservados em via seca e depositados nas principais coleções ornitológicas do Brasil e do exterior. Foram tomados caracteres qualitativos e quantitativos, da morfologia externa. De acordo com os resultados obtidos e segundo o Conceito Filogenético de Espécie, os táxons do gênero Aburria foram diagnosticados em sete espécies plenas: Aburria aburri (Lesson, 1828), Aburria cujubi (Pelzeln, 1858), Aburria cumanensis (Jacquin, 1784), Aburria grayi (Pelzeln, 1868), Aburria jacutinga (Spix, 1825), Aburria nattereri (Reichenbach, 1862) e Aburria pipile (Jacquin, 1784). As diagnoses foram estabelecidas principalmente, pelo conjunto de caracteres qualitativos. Os caracteres mais informativos estão relacionados ao formato e coloração das penas do topete, formato e coloração da barbela e o padrão do espelho branco nas asas. A partir desses resultados, foram redefinidas as suas distribuições geográficas, importantes para detectar lacunas de amostragem, bem como subsidiar os correntes e futuros trabalhos de conservação. / The genus Aburria Reichenbach, 1853, belongs to the family Cracidae, representing the sister-taxon of the genera Penelope and Penelopina. It includes about seven taxa occurring in all South American countries (except for Chile and Uruguay), as well as in the Trinidad island. These birds are associated to forest habitats (humid Tropical forests, forests at high elevations and gallery forests in the Cerrado), showing habitat preference for the canopy in such formations. The taxa of the genus Aburria are characterized by the nude face and a well developed crest (except for Aburria aburri), a wattle on the neck and the black, shiny and iridescent plumage. The taxonomy and systematics of the genus Aburria are controversial, and there is not a consensus regarding how many valid taxa it includes. Only a few studies provided insights to individual and geographic variation, and properly describing the coloration of the ornaments and nude areas of the face has been a difficult task already observed in the first historical descriptions. The present study brings a taxonomic revision of the genus Aburria, aiming to redefine its taxa and their geographic distribution. A sample of 302 stuffed specimens of Brazilian and international institutions was examined considering qualitative and quantitative characters of external morphology. On the basis of the Phylogenetic Species Concept, the present analysis allowed the recognition of seven full species: Aburria aburri (Lesson, 1828), Aburria cujubi (Pelzeln, 1858), Aburria cumanensis (Jacquin, 1784), Aburria grayi (Pelzeln, 1868), Aburria jacutinga (Spix, 1825), Aburria nattereri (Reichenbach, 1862) e Aburria pipile (Jacquin, 1784). The most informative characters to the diagnosis of these taxa are related to color and shape of the crest feathers, color and shape of the wattle, and the white pattern of the wings. Based on these data, the range of the Aburria species were redefined, representing important information to the detection of sampling gaps, as well as to the delineation of conservation programs.

As comunidades ecológicas formam-se a partir de pools regionais de espécies, mas contendo apenas um subconjunto da diversidade total da região envolvente. Quando comparadas com simulações aleatórias, as comunidades ecológicas reais mostram frequentemente evidências de estrutura não-aleatória. Esta estrutura pode incluir interações ambientais e/ou interespecíficas determinando os conjuntos de espécies e atributos que co-ocorrem, sendo a importância relativa dos efeitos ambientais vs. interespecíficos mediada pela qualidade de habitat. Além disso, as comunidades podem também revelar estrutura filogenética se, por exemplo, determinados atributos forem conservados dentro das linhagens, ou se espécies próximas se diversificarem rapidamente. Neste estudo, comparámos comunidades de aves aquáticas amostradas ao longo de 10 anos em lagoas costeiras e praias do Rio Grande do Sul, Brasil, oriundas de dois pools distintos de espécies contendo migradores estivais ou invernais – já que as espécies de aves que ocorrem sazonalmente, em particular as limícolas migradoras, constituem uma grande porção (c.25%) do total das espécies e indivíduos presentes. As comunidades foram comparadas em termos da sua composição taxonômica e ecologia funcional com base em dados existentes na literatura relativa a comportamento de forrageamento, dieta e morfologia de cada uma das espécies. Enquanto a composição taxonômica parece depender do pool de espécies a partir da qual a comunidade se formou, a composição funcional não diferiu entre estações. As comunidades dos lagos mostraram ser funcionalmente mais ricas e mais equitativas que as comunidades no ambiente mais homogêneo de praia, sugerindo que as comunidades são estruturadas pelo ambiente que limita as funções por si suportadas. Os resultados da comparação da diversidade funcional das comunidades com modelos nulos sugerem que a ocorrência das espécies é mediada pela competição interespecífica, ao passo que a abundância de indivíduos de cada uma das espécies está relacionada com as condições abióticas. Os atributos funcionais apresentaram sinal filogenético ao nível do pool de espécies, mas não foi encontrada evidência de influência da filogenia sobre a montagem de comunidades. Apesar de as comunidades variarem na sua composição filogenética relativamente ao ambiente, esta relação foi mediada pelos atributos. Tal como ocorreu com os atributos funcionais, também a variação filogenética foi maior em ambiente de lago do que em ambiente de praia, sendo que as praias mostraram agrupamento filogenético significativo. No seu conjunto, estes resultados evidenciam um forte papel do ambiente sobre a composição funcional das comunidades de aves aquáticas, o que por sua vez determina as composições taxonômica e filogenética. A composição taxonômica está associada ao pool de espécies, mas as comunidades são funcionalmente similares nas duas estações consideradas e as linhagens migratórias não são suficientemente distintas evolutivamente para revelar sinal filogenético associado à estação. Estes resultados contribuem para o nosso entendimento teórico sobre as regras de montagem de assembleias, um tema controverso em ecologia há décadas. Por último, a compreensão do modo como as comunidades de aves limícolas se constituem e tem aplicações na restauração ecológica e no delineamento de áreas protegidas, o que é de extrema importância dada a perda continuada de áreas húmidas e o subsequente declínio populacional de muitas espécies de aves aquáticas e migradoras. / Ecological communities are assembled from regional species pools, but contain only a subset of the total diversity from the surrounding region. Compared with random simulations, real ecological communities often show evidence of non-random structure. This structure may include environmental and/or interspecific interactions determining the sets of species and traits that co-occur, with the relative importance of environmental vs. interspecific effects mediated by habitat quality. Furthermore, communities may also show evidence of phylogenetic structure, for example if certain traits are conserved within lineages, or closely-related species diversify rapidly. In this study we compared waterbird communities sampled over 10 years at coastal lakes and beaches in Rio Grande do Sul, Brazil, from two distinct species pools containing summer and winter migrants – as seasonally occurring bird species, mainly migratory waders, form a large portion (c.25%) of the total species and individuals present. Communities were compared in terms of their taxonomic composition and functional ecology by collecting data on each species’ foraging behaviour, diet and morphology from literature. While taxonomic composition depended on the species pool from which the community was drawn, functional composition did not differ between seasons. Communities in lakes were functionally richer and more even than communities in the more homogeneous beach environment, suggesting that communities are structured by their environment through limiting the functions they can support. Comparing communities’ functional diversity with null models suggests that while species occurrence is mediated by interspecific competition, the abundance of individuals of each species is related to abiotic conditions. While functional traits had a phylogenetic signal at the species-pool level, there was no evidence of phylogenetic influence on community assembly. Although communities varied in their phylogenetic composition with respect to the environment, this relationship was mediated by traits. As occurred with functional traits there was considerably greater phylogenetic variation in lake habitats, with beach sites showing significant phylogenetic clustering. Together, these results are evidence of a strong environmental role in driving the functional composition of waterbird communities, which in turn determines the taxonomic and phylogenetic compositions. Taxonomic composition is sensitive to species pool, but communities were functionally similar in both seasons and migratory lineages were not evolutionarily distinct enough to cause a phylogenetic signal with respect to season. These results contribute to our theoretical understanding of community assembly, which has been a controversial issue in ecology for decades. Also, understanding how waterbird communities are assembled has applications to ecological restoration and reserve design, which is valuable given ongoing loss of wetlands and consequent population declines of many wetland and migratory species.

As bactérias do gênero Salmonella, especialmente S. Enteritidis e S. Typhimurium, são responsáveis por imensos prejuízos econômicos ao setor avícola, uma vez que produtos como carne de frango e ovos são apontados como a principal fonte desse patógeno em surtos de salmonelose humana. Perdas econômicas na avicultura também estão relacionadas à infecção em aves jovens devido ao desenvolvimento de doença clínica e ao aumento da mortalidade. A patogenicidade de Salmonella é considerada complexa e multifatorial necessitando de estudos que possam esclarecer a interação entre patógeno e hospedeiro. O presente trabalho teve por objetivo avaliar a virulência de 130 isolados de S. Enteritidis e 70 de S. Typhimurium, inoculadas em pintos de um dia de idade através do estabelecimento de um índice de patogenicidade. Para cada cepa, foram utilizados 10 pintos comerciais da linhagem Cobb provenientes de matrizes de corte com idade superior a 58 semanas. As aves foram inoculadas com 0,2 mL de uma solução contendo aproximadamente 2x108 UFC de S. Enteritidis ou S. Typhimurium, através da via intraperitoneal. A mortalidade e a presença de lesões associadas à septicemia foram observadas diariamente durante sete dias. As aves encontradas mortas durante esse período foram necropsiadas e observadas quanto à presença de aerossaculite (A), perihepatite (Ph), pericardite (Pc), peritonite (Pt), onfalite (O) e celulite (C). Para cada lesão foi atribuído o valor de “0,833” se presente e o valor “0” quando ausente. Animais mortos nas primeiras 24 horas pósdesafio receberam a pontuação 10, o que representa o índice máximo. Do segundo ao sétimo dia, houve uma diminuição proporcional da pontuação no tempo de morte (TM) a cada dia em que o animal sobrevivia. O cálculo do índice de patogenicidade de cada pintinho inoculado (IP) obedeceu a seguinte fórmula: IP = (TMx5) + A + Ph + Pc + Pt + O + C. Para obtenção do IP de cada amostra foi realizada a média do IP obtido com as 10 aves inoculadas. A partir dos resultados do trabalho, foi possível atribuir um valor de patogenicidade a cada uma das cepas permitindo classificá-las em grupos de baixa, intermediária e de alta patogenicidade. Os sorotipos analisados neste estudo não diferiram na capacidade de induzir a formação de lesões septicêmicas e elevada mortalidade. Desta forma conclui-se que, tanto S. Enteritidis quanto S. Typhimurium, são potencialmente capazes de causar doença clínica e mortalidade de forma semelhante aos sorovares adaptados às aves. / Bacterials of the Salmonella genus, particularly Salmonella (S.) Enteritidis and S. Typhimurium, are responsible for serious economic loss on the poultry industry, once eggs and meat chicken are the principle sources of the pathogens on outbreak of salmonellosis in human. Economic loss on the poultry industry, also is related infection in young chicks due to development clinical disease and increased mortality. The pathogenicity of Salmonella is complex and multifactorial which requires studies that elucidate the interaction between pathogen and host. The present study, was conducted to evaluate the virulence of 130 isolate of S. Enteritidis and 70 of S. Typhimurium, inoculated in 01 day old chicks, through establishment of one index of pathogenicity. For each strain was used 10 commercial lineage Cobb chicks older than 58 weeks old. Chickens were inoculated with 0,2 mL containing approximately 2 x 108 CFU of S. Enteritidis or S. Typhimurium by route intraperitoneal. Mortality and lesions associated septicemia were observed daily for seven days. Dead chicks during this period were necropsied and observed as the presence of airsaculitis (A), perihepatitis (Ph), pericarditis (Pc), peritonitis (Pt), omphalitis (O) and cellulitis. For each lesion was attributed the value “0,833” when present and “0”when absent. Dead animals on first 24 hours post-challenge received the punctuation 10. The second to seventh day, there was a proporcional decrease of punctuation on time of death (TM) each day that the chickens survived. The calculation of the index of pathogenicity obeyed the following formula: IP = (TMx5) + A + Ph + Pc + Pt + O + C. For obtainment IP of each strain was realized the average IP obtained with 10 inculated chickens. Based on results this study, was possible to assign a value of pathogenicity for each isolated allowing to classify them on groups of low, intermediate and high pathogenicity. The sorovars analyzed did not differ on ability to induce septicemic lesions and high mortality. Therefore it is concluded that, such S. Enteritidis as S. Typhimurium, are potencially capable to cause clinical disease and mortality similar to serotypes poultry adapted.

Tesis para optar al Grado de Magíster en Ciencias Animales y Veterinarias. / Los virus de Influenza tipo A representa una amenaza latente para la salud pública y para la salud animal. Debido a esto, y a raíz de la creciente preocupación por los focos de influenza aviar de alta patogenicidad que se registran en diferentes regiones del mundo, actualmente se lleva a cabo una vigilancia epidemiológica constante de estos virus por parte de diversas organizaciones de salud, monitoreando desde planteles comerciales hasta poblaciones de aves silvestres, especialmente de aquellas catalogadas como migratorias. Sin embargo, la información existente sobre estos virus en poblaciones silvestres en América del Sur aún es muy limitada. Las aves silvestres, especialmente aquellas relacionadas con ambientes acuáticos, son consideradas como reservorios de la gran mayoría de los subtipos de virus de influenza A conocidos y tienen el potencial de diseminarlos entre países e incluso continentes por medio de las rutas migratorias, debido a esto, resulta fundamental generar esta información epidemiológica. Este estudio, realizó un muestreo en los sectores Humedal Laguna Cartagena (HLC) y la Reserva Nacional Lago Peñuelas (RNLP), entre Septiembre de 2015 y Agosto de 2016. El objetivo de este estudio, fue la detección de virus de influenza A en muestras de heces de aves silvestres mediante rRT-PCR, determinando una relación entre la prevalencia del virus detectada y la estacionalidad de las comunidades de aves silvestres presentes durante el muestreo. Se recolectaron un total de 2.579 muestras ambientales (1.148 de HLC y 1.431 de la RNLP) y paralelamente, mediante la realización de censos se identificaron un total de 5.091 aves (3.815 en HLC y 1.276 en RNLP) pertenecientes a 46 especies, de las cuales 39 fueron clasificadas como residentes, 5 como visitantes de primavera-verano y 2 como visitantes de otoño-invierno. El análisis de las muestras indicó una prevalencia a VIA de un 0,4% (5/1.148) para el HLC y de un 1,04% (15/1.431) para la RNLP. Casi la totalidad de las muestras positivas fueron detectadas durante los meses de verano, siendo Diciembre y Enero los meses que presentaron los valores de prevalencia más altos, lo cual coincidió con una mayor presencia y abundancia de aves migratorias de origen boreal. Los factores de riesgo que presentaron asociación estadísticamente significativa fueron una abundancia de individuos baja (<200) (OR = 9,71; p = 0,0424) en el HLC y la estación del año, correspondiente a primavera-verano (OR 5,47 y p = 0,0288) en la RNLP. Los resultados de este estudio demuestran la presencia de virus de influenza A en los ecosistemas de ambos sitios y la asociación con la estacionalidad de las poblaciones de aves silvestres presentes en ellos / Influenza type A viruses represent a constant threat to both public and animal health. Therefore, and because of growing concern on high pathogenic avian influenza outbreaks around the world, health organizations maintain a strong epidemiological surveillance of this virus, monitoring from avian production systems till wild birds populations, especially the ones are catalogued as migratory birds. However, there is short information at moment about these types of viruses in wilds populations on South America. Wild birds, especially the ones are related with aquatic environment, are considered as reservoir of the most known influenza A virus and his subtypes, also they has the potential to disseminate the virus across countries or continents by migratory routes. Due to this, is extremely important generate this epidemiologic information. This Study, performed a sampling in Cartagena Lagoon Wetland y Peñuelas Lake National Reserve, between September 2015 and August 2016. The aim of this study was detect influenza A virus on samples feces of wild birds using rRT-PCR, determining a relationship between the prevalence of the virus and the seasonality of wild birds population. Were collected a number of 2.579 environmental samples (1.148 from HLC and 1.431 from RNLP), also it was possible by a census, identified 5.091 birds (3.815 in HLC and 1.276 in RNLP) belonging to 46 species, which one 39 were classified as residents birds, 5 as spring/summer visitors and 2 as an autumn/winter visitors. The analysis of the samples showed a prevalence to avian influenza virus of 0,4% (5/1.148) for HLC and a 1,04% (15/1.431) for RNLP. Almost all positive samples were detected in summer months, December and January showed the highest prevalence values, which coincided with a greater presence and abundance of boreal migratory birds. The risk factors that showed significant statistics association were low individuals abundance (<200) (OR = 9,71; p = 0,0424) in HLC and autumn/winter season (OR 5,47 y p = 0,0288) in RNLP / Financiamiento: Proyecto NIAID HHSN272201400006C.

O vírus da anemia das galinhas (CAV) pode causar imunodepressão em galinhas de todas as idades e doença nos frangos jovens, a qual é caracterizada por severa anemia, atrofia da medula óssea e hemorragias. A doença clínica é rara hoje, porém a forma subclínica é freqüentemente encontrada em criações comerciais e resulta num considerável decréscimo do desempenho. O CAV apresenta variabilidade genética, entretanto, em relação às amostras brasileiras do CAV, pouco ou quase nada desta variabilidade é conhecida. O presente trabalho descreve um protocolo de Nested-PCR para a detecção do CAV diretamente de amostras clínicas e analisa filogeneticamente as seqüências nucleotídicas das amostras positivas buscando verificar se a patologia apresentada por estas está relacionada com a variabilidade genética. Para a extração de DNA, o método baseado em tiocianato de guanidina mostrou-se mais eficiente e prático de executar que os demais testados. Foi selecionado um par de primers que amplifica uma região de 664 pb do gene vp1 e outro par que amplifica uma região interna de 539 pb para a realização da Nested-PCR. A especificidade dos primers foi avaliada utilizando amostras de lotes controlados para CAV e 30 diferentes isolados de vírus e bactérias causadoras de doenças em galinhas, as quais não geraram produto de amplificação. A sensibilidade foi determinada a partir de diluições seriadas da vacina comercial para o CAV. A Nested-PCR mostrou ser mais sensível do que a PCR e foi capaz de detectar 0,16 DICC50% da cepa vacinal. Além disso, a Nested-PCR detectou DNA viral em tecidos, soro e cama aviária de lotes com e sem sintomas clínicos.O produto de amplificação de 539 pb do gene vp1 de 44 amostras, provenientes de diferentes Estados produtores de frangos do Brasil, foi seqüenciado e foram encontradas 10 novas seqüências nucleotídicas do CAV. Estas 10 seqüências nucleotídicas foram analisadas filogeneticamente pelo método de distância neighbour joining com 1000 replicações o qual, mostrou que não houve correlação entre a patogenia apresentada nos animais e os grupos genéticos. Estas seqüências nucleotídicas também foram comparadas com 30 cepas de CAV isoladas em outros países e não foi observada correlação entre a distribuição geográfica e a variabilidade genética. Substituições de amino ácidos foram observadas em 9 posições sendo que, 65R substituindo o resíduo Q e 98F substituindo o resíduo Y ainda não haviam sido observadas. Conclui-se que, como técnica de detecção do CAV, o protocolo de Nested-PCR aqui descrito é mais sensível e menos trabalhoso do que o isolamento viral. As amostras Brasileiras de CAV possuem características filogenéticas similares às isoladas em outros países.

La presente tesis tiene por objetivo visualizar y dar cuenta de la distribución potencial actual y futura de veinte especies de aves de la vertiente del Pacífico del Perú. Asimismo, pretende visualizar los potenciales efectos del cambio climático al año 2050 sobre los centros de diversidad para tal comunidad de aves en estudio a modo de contribución para la elaboración de planes de conservación de la biodiversidad en el marco de iniciativas de desarrollo del ecoturismo en la vertiente del Pacífico del Perú. En tal sentido, haciendo uso del método de modelamiento espacial de especies (MDE) a través del software Maxent, y en base a registros de aves y variables bioclimáticas del área de estudio es posible localizar la distribución potencial actual de la avifauna objetivo, y los centros de diversidad de la avifauna objetivo. Se aplicó tal método para estimar los efectos del cambio climático sobre la distribución potencial actual para visualizar las proyecciones al año 2050 a través de los modelos climáticos: CCSM4, INMCM4, y MIROC5. Los resultados mostraron, en primer lugar, centros de diversidad a través de la superposición de los resultados del modelamiento espacial, tanto para la distribución presente y la distribución potencial futura para cada especie. En segundo lugar, se observó el grado de influencia del cambio climático sobre la distribución potencial futura de la avifauna. En tercer lugar, se determinaron las áreas con potencial para el avistamiento de aves, y más específicamente, si los centros de diversidad estarían afectados a futuro por el efecto del cambio climático. Por último, se culmina esta investigación con propuestas y recomendaciones que contribuyen a la conservación de la diversidad de aves de acuerdo a su distribución espacial en la vertiente occidental del Perú relacionado directamente al desarrollo del aviturismo o birdwatching como herramienta bisagra entre el desarrollo económico de poblaciones locales y la conservación y protección de especies, tomando como referencia las políticas recomendadas por el quinto reporte del IPCC del 2014, las que finalmente guían hacia el desarrollo sostenible. / The present thesis aims to visualize and determine the potential present and future potential distributions of twenty bird species of the Pacific slope of Peru; moreover, aims to visualize the potential effects of climate change by the year 2050 on the diversity centers of this bird community on study. In this way, this research contributes to biodiversity conservation plans in the context of sustainable development initiatives and ecotourism development in the Pacific slope of Peru. Thanks and through Maxent software, based on bird registers and bioclimatic variables of the study area, it was possible to estimate the present and future potential distributions and some resulting diversity centers of the birds on study. This method applied also estimates the effects of climate change. Thus, the projections were visualized up to the year 2050 according to the climatic models: CCSM4, INMCM4 and MIROC5. The results showed, first, diversity centers through the overlapping of each result of the spatial modelling, resulting on present and potential future geographic distributions for each species. Second, it was possible to observe the degree of influence of climate change on the potential future distribution of the fauna on study. Third, priority areas were identified, and more specifically, whether diversity centers were affected by the climate change. At the end, this research was complemented with proposals and recommendations that contribute to the conservation of species diversity according to its spatial distribution, the diversity centers and the ecosystems contained on study area, all of them related directly to the development of ecotourism regarding birdwatching on the Pacific slope of Peru. In this way, this research final products can be an example of the recent multiple tool hinges that could contribute to economic development of local populations, species conservation plans which, at the end, are policies recommendations by the fifth report of the IPCC of 2014 that ensure a sustainable development. / Tesis

Orientador: Carlos Roberto Teixeira / Resumo: O objetivo do trabalho constituiu no levantamento qualitativo e quantitativo da comunidade de aves presentes em três diferentes áreas, com fitofisionomias distintas localizadas no município de Botucatu, com a intenção de proporcionar em primeiro ponto, o melhor conhecimento sobre a avifauna do município de Botucatu – SP e os padrões populacionais e comportamentais de cada ave e áreas a que cada espécie melhor se adapta, contribuindo para que em um próximo passo, sejam realizados programas de adequação e solturas de aves capturadas pelo tráfico, assim como pesquisas e projetos de conservação proporcionando condições ideais para as aves viverem e se reproduzirem. O projeto contou com a identificação de 211 espécies e permitiu o comparativo entre as diferentes comunidades de aves, em áreas de cerrado e mata atlântica como florestas estacionais semideciduais e regiões com corpos d’água, assim como endemismo, guilda alimentar e sazonalidade dos quais ao ter a liberação para a soltura de aves, podem favorecer o enriquecimento ambiental através da reprodução das espécies e da dispersão de sementes. Desde que sejam respeitados os aspectos genéticos, comportamentais e ambientais de cada espécie de ave. / Mestre

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Ecologia, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2008. / Submitted by Diogo Trindade Fóis (diogo_fois@hotmail.com) on 2009-09-10T15:15:15Z No. of bitstreams: 1 2008_DanielTouremGressler.pdf: 1567322 bytes, checksum: a35579beb920fbf00005178d79a5b4ae (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Maia(luanna@bce.unb.br) on 2010-01-22T17:03:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_DanielTouremGressler.pdf: 1567322 bytes, checksum: a35579beb920fbf00005178d79a5b4ae (MD5) / Made available in DSpace on 2010-01-22T17:03:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_DanielTouremGressler.pdf: 1567322 bytes, checksum: a35579beb920fbf00005178d79a5b4ae (MD5) Previous issue date: 2008 / O canário-rasteiro, Sicalis citrina (Emberizidae) é uma espécie com ampla distribuição na América do Sul cuja biologia é fracamente conhecida. O primeiro capítulo deste trabalho descreve detalhadamente diversos aspectos da biologia reprodutiva de S. citrina. No segundo capítulo são testadas hipóteses ecológicas relacionadas à sobrevivência dos ninhos e são estimadas as taxas de sobrevivência diária dos ninhos e o sucesso reprodutivo da espécie através da modelagem da sobrevivência de ninhos. Entre os meses de janeiro e maio de 2007 foram realizados a procura e o monitoramento de ninhos em antigas áreas de mineração de cascalho do Parque Nacional de Brasília, locais onde ocorre a nidificação da espécie. A reprodução de S. citrina ocorre de dezembro a maio, bem após o início das chuvas, concentrando-se nos meses de janeiro a março. A biologia reprodutiva de S. citrina é bastante semelhante à dos demais emberizídeos neotropicais. O ninho é em forma de cesto aberto, construído principalmente em arbustos de pteridófitas (Dicranopteris flexuosa), onde é realizada a postura de dois ou três ovos. O período de incubação dura, em média, 12 dias e os ninhegos permanecem no ninho, em média, por 13 dias. O sucesso reprodutivo aparente da espécie e o sucesso estimado pelo método de Mayfield foram de 26 e 21%, respectivamente. A taxa de sobrevivência diária estimada pelo método de Mayfield foi de 0,94. A probabilidade de sucesso dos ninhos de S. citrina pode variar grandemente de acordo com a planta suporte e com o período da estação reprodutiva. Ninhos construídos em pteridófitas no final da estação reprodutiva possuem maior probabilidade de sucesso. A probabilidade de sobrevivência dos ninhos diminui conforme o aumento da idade dos mesmos. A distância dos sítios de nidificação em relação à borda do ambiente não afetou a sobrevivência dos ninhos. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The Stripe-tailed Yellow-Finch Sicalis citrina (Emberizidae) is a poorly known species with a wide range in South America. The first chapter of this study details its breeding biology. In the second chapter ecological hypothesis on the factors that possibly affect nest survival are tested. Estimates of daily survival rates and reproductive success are given as well in the last chapter. Nest search and monitoring were conducted between January and May 2007 and started after the beginning of raining season. Stripe-tailed Yellow-finches breed in abandoned mining pits in the Brasília National Park from December to May, most frequently from January to March. Its life history traits are quite similar to most Neotropical Emberizidae passerines. Eggs, from two-three, are laid in an open cup nest built mainly in Pteridophytae shrubs (Dicranopteris flexuosa). Incubation lasts 12 days and nestlings take 13 days to fledge. Nest apparent success was 26%. Daily survival rates and overall success using Mayfield’s method were 0.94 and 21%, respectively. Overall nest survival probabilities varied greatly as a function of substrate (plant species) and time of breeding season, being greater in nests built in Pteridophytae late in the breeding season. Daily survival rates also decreases as the nests get older. Edge effects did not influence nest survival. Key-words: Stripe-tailed Yellow-finch, Sicalis citrina, life history traits, nest survival, Brazilian savanna.

A Salmonella permanece um importante problema na avicultura mundial e considerando os patógenos transmitidos por alimentos, a Salmonella aparece como um dos agentes principais em surtos de toxinfecções alimentares. Existem vários relatos de isolamento de Salmonella em frangos vivos e surtos alimentares, porém em carcaças de frangos e cortes a disponibilidade de dados é menor, assim como estudos de determinação do número de Salmonella presentes nas amostras, também são poucos. No presente estudo, foram analisadas 180 carcaças de frangos resfriadas, adquiridas em varejos, para determinação da ocorrência de contaminação por Salmonella pelo método de microbiologia convencional, ensaio imunoenzimático (ELISA) e determinação do número de células da bactéria pelo método do número mais provável (NMP) nos ágares para isolamento verde brilhante com novobiocina (BGN) e xilose-lisina tergitol 4 (XLT4). Neste mesmo estudo, foi determinado o perfil de resistência a antimicrobianos de 13 amostras de Salmonella isoladas das carcaças de frangos, e analisados 101 suabes de arrasto de camas aviárias, pelo método microbiológico convencional, para a presença do agente. Os resultados mostraram 15,8% de ocorrência de Salmonella nos suabes de arrasto e 12,2% de ocorrência nas carcaças de frangos resfriadas, pelo método de microbiologia convencional. O teste de ELISA detectou 11,3% de positividade para Salmonella nas carcaças de frangos resfriadas. A média de NMP de Salmonella por mL, na leitura pelo ágar XLT4 foi de 2,674 células e BGN foi de 1,282 células. As cepas de Salmonella apresentaram resistência aos antimicrobianos lincomicina, penicilina e estreptomicina (100%), josamicina e enrofloxacina (69,23%), amoxicilina (30,76%), clortetraciclina (23,07%), estreptomicina e estreptomicina + penicilina (15,83%) e 7,69% de resistência a doxiciclina e polimixina B. Os sorovares de Salmonella isolados no estudo foram Enteritidis, Agona, Risssen, Heidelberg e Livingstone, nas carcaças de frangos, e, Enteritidis, Agona, Ohio, Rissen, Tennessee, entérica O: 3,10 e entérica O: 6,71 nos suabes de arrasto. A análise dos resultados apresentou contaminação por Salmonella nas camas aviárias e presença de cepas de Salmonella, isoladas das carcaças, multiresistentes a antimicrobianos. Também demonstrou existir um número variável de células de Salmonella contaminando as carcaças de frango resfriadas que estão à venda ao consumidor.