Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-09-03Bitstream added on 2014-06-13T19:12:57Z : No. of bitstreams: 1 zuin_rg_me_jabo.pdf: 216391 bytes, checksum: a0e1c4fd33e27c06f5e9cb650e3c402f (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Características de carcaça preditas por ultrassonografia foram incluídas nos programas de avaliação genética, uma vez que estas estão associadas à qualidade e rendimento de carcaça. Neste trabalho, os objetivos foram estimar os parâmetros genéticos e as tendências genéticas para área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EG) e espessura de gordura subcutânea de garupa (EGP8), peso corporal aos 210 (P210) e aos 365 (P365) dias de idade em bovinos da raça Nelore. Foram analisados dados de animais nascidos entre 1998 e 2008, oriundos de fazendas participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (Nelore Brasil). As estimativas dos componentes de (co) variância, dos parâmetros genéticos e valores genéticos para as características estudadas foram obtidas pelo método da máxima verossimilhança restrita, sob modelo animal multi-característica. Para as características de peso as estimativas de herdabilidade genética direta e materna foram: 0,26 ± 0,003 e 0,18 ± 0,01, para P210 e 0,39 ± 0,02 e 0,05 ± 0,01, para P365. As estimativas de herdabilidade para AOL, EG e EGP8 foram iguais a 0,28 ± 0,03; 0,21 ± 0,02; 0,25 ± 0,03, respectivamente. Mudanças significativas nos valores genéticos médios anuais das características de carcaça indicaram que estas estão sendo indiretamente influenciadas pelo índice de seleção aplicado para estes rebanhos / Carcass traits by ultrasound measurements were included in genetic evaluation programs because they are associated with carcass yield and quality. This study aimed to estimate genetic parameters and genetic trends for back fat thickness (BF), rump fat thickness (RF), rib-eye area (REA) and body weight at 210 (BW210) and 365 (BW365) days of age. It data from animals whose herds participating in the Nelore breeding program (Nelore Brasil) born between 1998 and 2008, were used. Genetic parameters, (co)variance components and breeding values were estimated for each trait, in multi traits analysis, using maximum restricted likelihood method. Heritability estimates were equal to 0.28 ± 0.03 (REA); 0.21 ± 0.02 (BF) and 0.05 ± 0.01 (RF). In the growth traits the direct and maternal heritability estimates were respectively 0.26 ± 0.003; 0.18 ± 0.01 for BW210 and 0.39 ± 0.021; 0.05 ± 0.010 for BW365. Significant changes in the annual breeding values indicated that the carcass traits are being indirectly influenced by the selection index

Este trabalho foi desenvolvido visando a estimativa de parâmetros genéticos para características de carcaça obtidas por ultrassonografia em bovinos da raça Nelore. Foram analisadas as informações de 13.256 animais, machos e fêmeas, com idade entre 10 e 25 meses, provenientes de cinco propriedades distintas, pertencentes ao programa de melhoramento genético da Associação Nacional de Criadores e Produtores (ANCP). As características de carcaça avaliadas por ultrassonografia foram área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), espessura de gordura na garupa (EGG), percentagem de gordura intramuscular (PGIM), além do peso na data da avaliação e das estimativas do peso e da percentagem da porção comestível (PESPC e PERPC, respectivamente). Foram estimadas a herdabilidade, correlações genéticas e fenotípicas, além da tendência genética observada no período avaliado. As herdabilidades observadas foram de moderada magnitude (0,18 a 0,37), suportando a recomendação de seleção para as características de carcaça. As correlações da gordura intramuscular com as demais variáveis foram, em sua maioria, próximas de zero, com exceção para as correlações com a área de olho de lombo e com o peso da porção comestível, cujos valores negativos devem ser considerados nos critérios de seleção. O efeito da idade sob as características permite afirmar que as avaliações por ultrassonografia podem ser obtidas em idade precoce. Os resultados indicaram ainda que a inclusão das DEPs de carcaça tem proporcionado melhorias na área de olho de lombo e nas espessuras de gordura, no entanto a percentagem da gordura intramuscular e o rendimento dos cortes cárneos não apresentaram progresso uniforme na população e período avaliados. / This work was developed aiming to estimate genetic parameters for carcass traits obtained by ultrasound in Nelore cattle. The information of 13,256 animals were analyzed, male and female, with ages between 10 and 25 months, from five distinct properties, belonging to the genetic improvement program of the Associação Nacional de Criadores e Produtores (ANCP). The carcass characteristics evaluated by ultrasonography were: rib eye area (REA), subcutaneous back fat thickness (BF), rump fat thickness (RF), percentage of intramuscular fat (IMF), also the weight on the valuation date, estimates of weight and percentage of retail product. Heritability, genetic and phenotypic correlations were estimated, in addition to the genetic tendency observed during the study period. Observed heritability had moderate magnitude (0,18 to 0,37), corroborating the selection recommendation for carcass traits. The percentage of intramuscular fat correlations with other features were mostly close to zero, except for correlations with the loin eye area and the weight of retail product, whose negative values should be considered in the selection criteria. The effect of age on the observed features suggest that the ultrasound evaluation can be held at an early age. The results also indicated that the inclusion of expected progeny differences (EPDs) has provided improvements in REA and BF, however the intramuscular fat and yield of meat cuts showed no uniform progress in the population and the evaluated period.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:29Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-02-22Bitstream added on 2014-06-13T19:56:22Z : No. of bitstreams: 1 silva_tm_me_jabo.pdf: 650702 bytes, checksum: e82149c4828707a461cba592b74bade2 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Dentre os fatores que interferem no processo produtivo, o peso à desmama constitui-se um dos mais importantes. Para tal, a técnica de creep feeding pode assumir grande importância para encurtar o tempo necessário para o acabamento e abate dos animais destinados ao corte. Com o objetivo de avaliar o desempenho de bezerros lactentes em resposta a diferentes suplementos no sistema de creep feeding e a viabilidade econômico-financeira da implantação da cria, 32 bezerros da raça Canchim com 120 dias de idade e suas respectivas mães, foram distribuídos em quatro lotes experimentais com oito bezerros cada. O experimento foi dividido em 4 períodos de 28 dias totalizando 112 dias. Os tratamentos foram: SG = concentrado com milho moído e soja grão; TA = concentrado com milho moído e torta de amendoim; FS = concentrado com milho moído e farelo de soja e o SS = sem suplementação (controle). Os tratamentos com suplemento receberam a inclusão de 10% de NaCl nos dois últimos períodos (56 o -112o dia) para controle do consumo de concentrado. Os animais foram avaliados através de pesagens e monitoração ultrassonográfica. Na análise econômica foi utilizado o fluxo de caixa e os indicadores de viabilidade econômicofinanceiros. Para flexibilização dos resultados da situação determinista foram realizadas simulações, nas quais foi modificado o número de matrizes e a aquisição dos ativos fixos. O horizonte de planejamento considerado foi de 10 anos. Observou-se que os tratamentos SG, TA, FS não se diferenciaram entre si estatisticamente (0,943; 0,986 e 0,913 kg), mas diferenciaram (P<0,01) em relação ao tratamento SS (0,669 kg) no primeiro período. No 2o período notou-se um aumento significativo (P<0,01) no ganho de peso dos tratamentos com suplementação, em relação ao tratamento sem suplementação, sendo 1,019; 1,120 e 1,041 kg para os tratamentos SG, TA, FS e 0,598 kg... / Weaning weight is the most important factor on the productive process. For this, creep feeding can assume great importance to reduce the necessary time for the finishing and slaughter of cattle. With the objective to evaluate the performance of suckling calves in reply the different supplements in the creep feeding system and the economic-financier viability of the implantation for this system, 32 Canchim calves with 120 days of age and their mothers, which were distributed in four experimental lots with eight calves which one. The experimental period lasted 112 days, divided in four sub-periods of the 28 days. The experimental treatments were: SG = concentrate with corn ground and soybean; TA = concentrate with corn ground and peanut cake; FS = concentrate with corn ground and soybean meal and SS = without supplementation (control). All treatments received the inclusion of 10% of NaCl on two last periods (56 -112o day) for control of consumption of concentrated. The animals were evaluated through weighing and ultrasound measures. In the economic analysis were used the cash flow and the viability economic-financial gauge. The simulations were used for flexibilitation the results of the determinist situation. In which was modified the number of matrices and acquisition of the infrastructure. The planning horizon was considered 10 years. There were no significative differences among the treatments SG, TA, FS however there were observed differences (P<0.01) between supplemented treatments and the control in the first period. On second period occurred a significant increase (P<0.01) in the weight gain of the animals in the treatments with supplementation, in relation to the treatment without supplementation, with value of 1.019; 1.120 and 1.041 kg for treatments SG, TA, FS and 0.598 kg for treatment SS...(Complete abstract, click electronic access below)

Submitted by Ana Paula Reiff Janini null (anapaulajanini@hotmail.com) on 2017-07-05T18:37:29Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_APRJ.pdf: 1729959 bytes, checksum: ac65d4b7d77c1ab8a468de7f2909d978 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-07-12T19:34:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 janini_apr_me_jabo.pdf: 1729959 bytes, checksum: ac65d4b7d77c1ab8a468de7f2909d978 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-12T19:34:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 janini_apr_me_jabo.pdf: 1729959 bytes, checksum: ac65d4b7d77c1ab8a468de7f2909d978 (MD5) Previous issue date: 2017-06-01 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Objetivou-se, com o presente estudo, avaliar o efeito do tempo (dias – 0, 21, 42, 63) de suplementação de alto consumo (2% do peso corporal), so-bre o desempenho e características da carcaça e qualidade da carne de vacas de descarte da raça Nelore mantidas em pastejo contínuo em Brachiaria bri-zantha cv. Marandu, durante a estação seca. O delineamento foi em blocos casualizados (DBC), sendo os animais blocados de acordo com o peso inicial, com quatro tratamentos (dias de suplementação) e cinco repetições (piquetes), sendo três animais por piquete (unidade experimental). Não houve efeito do tempo no consumo de suplemento. O ganho médio diário (GMD) e ganho mé-dio diário em carcaça (GMDCar) se adequaram ao modelo quadrático, tendo o seu ponto máximo aos 42 dias de suplementação com 1,61 e 0,96 kg/dia, res-pectivamente. O peso corporal sem jejum (PSJ) e com jejum (PCJ) apresenta-ram efeito linear com o aumento nos dias de suplementação (P<0.01). Da mesma forma, peso de carcaça quente (PCQ) e fria (PCF) e rendimento de carcaça quente (RCQ) e fria (RCF). As variáveis de comprimento de carcaça (CCar), profundidade de carcaça (PCar) e tamanho de coxão (TCoxão) não foram verificados efeitos da suplementação. Perímetro de coxão (PCoxão), área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS) res-ponderam linearmente ao incremento nos dias de suplementação. Os órgãos (fígado, coração, rins, baço, intestinos delgado e grosso), denominados de componentes não carcaça (CnC), bem como gordura renal pélvica inguinal (GRPI), somatório de CnC e ganho médio diário desses (GMDCnC) aumenta-ram linearmente ao longo dos dias de suplementação. O aumento no peso cor-poral e de carcaça dos animais resultou em maiores pesos de cortes primários, traseiro especial, dianteiro e ponta de agulha (PA) expressaram comportamen-to linear. O incremento nos dias de suplementação também resultou em cortes cárneos mais pesados, com exceção do filé mignon, que não houve efeito, os demais cortes comerciais do traseiro especial, não aparados e aparados, au-mentaram linearmente (P<0,01), da mesma forma os cortes de dianteiro e PA, não aparados e aparados, sofreram influência do aumento de peso corporal devido ao incremento dos dias de suplementação. Maiores porcentagens de aparas foram verificadas em todos os cortes com o aumento do tempo de su-plementação. As médias de temperatura se adequaram ao modelo quadrático de regressão com maior média (5,91°C) aos 63 dias de suplementação. Não houve diferença entre os tratamentos para os valores de pH, sendo a média de 5,8. Para as variáveis relacionadas à coloração da carne foi verificado efeito dos dias de suplementação, sendo quadrático (P<0.01) para L* e b* e linear (P<0.01) para a*. Não houve diferença significativa na composição química pa-ra os teores de lipídeos, carboidratos e matéria mineral. Umidade e proteína bruta se ajustarem ao modelo quadrático de regressão. Perdas por cocção (PPC) e força de cisalhamento (FC) se comportaram de forma linear crescente (P=0.04). A suplementação das vacas de descarte não influenciou os teores de colágeno muscular (P>0,10). Para colágeno insolúvel, solúvel, total e termosso-lúvel as médias foram de 0,18%, 0,018%, 0,20% e 9,6%, respectivamente. Desta forma, fêmeas mais pesadas apresentaram carcaças mais bem acaba-das e cortes cárneos mais pesados. Aos 42 dias suplementação, as vacas ob-tiveram a máxima produção de carcaça por dia e aos serem abatidas produzi-ram carcaças com acabamento adequado ao mercado consumidor. / This study aimed to evaluate the effect of time (days – 0, 21, 42, 63) on high intake supplementation (2% of body weight) on the performance and carcass traits and meat quality of Nellore cull cows in continuous grazing of Brachiaria brizantha cv. Marandu, during the dry season. The experimental de-sign was performed in randomized blocks (DBC), with the animals blocked ac-cording to the initial weight, with four treatments (days of supplementation) and five repetitions (paddocks), using three animals per paddock (experimental unit). There was no time effect in supplement intake. The average daily gain (ADG) and the average daily gain in carcass (ADGC) were adjusted to the quadratic model, with the maximum peak at 42 days of supplementation at 1.61 and 0.96 kg/day, respectively. Body weight without fasting (BWW) and fasting (BWF) presented a linear effect with the increase in days of supplementation (P <0.01), as well the warm carcass weight (WCW) and cold (CCW) and the warm carcass yield (WCY) and cold (CCY). For the variables of carcass length (CL), carcass depth (CD) and size of round (SR), no effects of supplementation were observed. Round perimeter (PRound), longissimus muscle area (LMA) and subcutaneous fat thickness (SFT) responded linearly to the increase of days of supplementation. The organs (liver, heart, kidneys, spleen, small and large in-testines), denominated non-carcass components (NCC), as well the inguinal pelvic renal fat (IPRF), NCC summation and average daily gain of non-carcass components (ADGNCC) increased linearly over the days of supplementation. The increase in animals’ body weight and carcass resulted in higher weights of primary cuts, special rear, front and needle tip (PA), also expressing a linear behavior. The increase in the days of supplementation also resulted in heavier meat cuts, except for filet mignon, which had no effect; others commercial cuts, such as the special rear, trimmed and not trimmed, increased linearly (P <0.01). In the same way, the front and AP cuts, trimmed and not trimmed, were influ-enced by the increase in body weight, due to the increment of days of supple-mentation. Higher percentages of shavings were observed in all cuts with the increase of the supplementation time. The temperature averages were adjusted to the quadratic regression model with the highest mean (5.91°C) at 63 days of supplementation. There was no difference between the treatments for pH val-ues, resulting in an average of 5.8. For the variables related to the meat color, the effect of supplementation days was observed, showing quadratic (P<0.01) for L* and b* and linear (P<0.01) for a*. There was no significant difference in the chemical composition for lipid, carbohydrate, and mineral matter contents. Humidity and crude protein fit the quadratic regression model. Cooking losses (CL) and shear force (SF) indicated an increasing linear shape (P = 0.04). The supplementation of cull cows did not influence the levels of muscle collagen (P>0.10). For insoluble, soluble, total and thermosoluble collagen, the averages reached were 0.18%, 0.018%, 0.20% and 9.6%, respectively. Therefore, heavi-er females had heavier carcasses and heavier meat cuts. At 42 days of sup-plementation, cows obtained the maximum carcass production per day and, when slaughtered, they produced carcasses with adequate finishing to the con-sumer market.

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:13:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 alineteseca.pdf: 944325 bytes, checksum: 5f0b947649cbf727f1cd020b11cdb011 (MD5) Previous issue date: 2008-12-15 / Sheep rearing is becoming an important economic activity, where it is necessary to establish the ideal slaughter weight per genetic group and sex to acheive standardized carcasses which meet customer needs in terms of product quality.This experiment evaluated the effect of genetic group and slaughter weight on carcass traits and meat quality in lambs. Twenty four Santa Ines (SI), 24 ½ Ile de France x ½ Santa Inês (ILE x SI) and 8 ½ Texel x ½ Santa Inês (TE x SI), slaughtered at different weights (30, 35, 40 and 45 kg ) were used.Eye rib area and fat thickness were measured in vivo and on the carcass. After a 16 hour food and water fast the animals were slaughtered conventionally and the carcasses placed in a cold chamber at 4ºC/24h. pH was measured at slaughter and after 24h as were subjective measurements on the Longissimus dorsi. A section of the rib region from the 11th to 13th ribs of the left side of the carcass was used for tissue and fractional composition, physic-chemical parameters and fatty acid composition. The experiment was in a 3 x 2 x 4 factorial design. For physic-chemical and fatty acids a 3 x 4 factorial and analysed using CORR (Correlation), REG (Regression) and Duncan (5%) means test in SAS ®. Genetic group did not influence (P>0.05) means for rib eye area or fat thickness measured by ultrasound or paquimeter. These measurements increased with slaughter weight. Tissue composition was influenced by genetic group and slaughter weight (P<0.05). The Texel x Santa Inês had most muscle (63.75 g), fat (53.75 g), bone (29.37 g) and edible portion (78.75%) at 35 and 45 kg . Slaughter weight centesimal composition, with an increase in total lipids as weight increased. No significant differences were found for final pH between genetic groups and slaughter weights. Genetic group did not influence colour (3.32), shear force (3.57 kgf) or loss in cooking (24.05%) of the Longissimus dorsi, but slaughter weight affected these, causing stronger colour, tougher meat and greater loss in cooking as slaughter weight increased. Significant differences were found in the sensorial traits of the meat with different genetic groups and slaughter weights. The fatty acids found included oleic (43%); palmitic (22%) and estearico (18%). Higher quantities of desirable fatty acids were found in the Texel x Santa Inês (66.78%) group. Slaughter weight caused a significant difference (P<0.05) in the fatty acid profile of saturated and polyunsaturated fats. / A criação de ovinos surge como atividade de importância econômica, na qual busca-se estabelecer o peso ideal para abate por grupo genético e sexo, proporcionando carcaças padronizadas que satisfaçam as perspectivas dos consumidores em termos de qualidade do produto. Objetivou-se com este experimento avaliar os grupos genéticos e peso de abate nas características da carcaça e qualidade da carne de cordeiros. Foram utilizados 24 cordeiros Santa Inês (SI), 24 cordeiros mestiços ½ Ile de France x ½ Santa Inês (ILE x SI) e 8 cordeiros mestiços ½ Texel x ½ Santa Inês (TE x SI), abatidos em diferentes pesos (30, 35, 40 e 45 kg). As análises de área de olho de lombo e espessura de gordura foram realizadas in vivo e na carcaça dos animais. Após jejum e dieta hídrica de 16 h, os animais foram submetidos ao abate convencional e as carcaças permaneceram em câmara fria a 4ºC/24h. Durante esse período foi realizada a leitura de pH inicial e final (24 h) e avaliações subjetivas no músculo Longissimus dorsi. Posteriormente foram retiradas as frações correspondentes à região da 11ª a 13ª costelas da carcaça esquerda para as análises de composição tecidual e centesimal, avaliação dos parâmetros físico-químicos e composição de ácidos graxos. O delineamento utilizado foi inteiramente casualizado em esquema de fatorial 3 (grupo genético) x 2 (sexo) x 4 (peso de abate). Para as análises físico-químicas e perfil de ácidos graxos foi utilizado fatorial 3 x 4 com aplicação de procedimentos CORR (Correlação), REG (Regressão) e teste de médias (Duncan 5%) do programa estatístico SAS. Os grupos genéticos não influenciaram (P>0,05) os valores médios da área de olho de lombo e espessura de gordura pelo ultra-som e paquímetro. Observou-se maior a área de olho de lombo e espessura de gordura na 12a costela com o aumento dos pesos ao abate. A composição tecidual foi influenciada pelos grupos genéticos e peso ao abate (P<0,05). Os animais Texel x Santa Inês apresentaram maior quantidade de músculo (63,75 g), gordura (53,75 g), osso (29,37 g) e porção comestível (78,75%) aos 35 e 45 kg. Houve efeito dos pesos de abate para a composição centesimal, apresentando aumento do teor de lipídeos à medida que os pesos eram elevados. Não houve diferença para pH final entre os grupos genéticos e pesos ao abate avaliados. Os grupos genéticos não influenciaram a cor (3,32), força de cisalhamento (3,57 kgf) e perda por cozimento (24,05%) do músculo Longissimus dorsi, no entanto, houve diferença significativa para os grupos de peso ao abate, atribuindo-se a coloração mais acentuada, carne menos macia e maior perda de líquido por cozimento com a elevação do peso ao abate. Foram detectadas diferenças nos atributos sensoriais avaliados nas carnes de cordeiros de diferentes genótipos e pesos ao abate. Os ácidos graxos encontrados em maior concentração foram o oléico (43%); palmítico (22%); esteárico (18%). Verificou-se maiores quantidades de ácidos graxos desejáveis em animais Texel x Santa Inês (66,78%). O peso de abate dos cordeiros determinou diferença significativa (P<0,05) no perfil dos ácidos graxos saturados e poliinsaturados.

O objetivo deste trabalho foi estudar o transcriptoma do músculo Longissimus dorsi (LD) de bovinos da raça Nelore associado as características de área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS), a fim de encontrar genes diferencialmente expressos (GDE), conjuntos de genes co-expressos, vias metabólicas e processos biológicos que regulam essas características. Foram utilizados dados de 385 bovinos Nelore castrados para obtenção das medidas fenotípicas de AOL e EGS, mensuradas entre a 12ª e 13ª costelas do músculo LD. Estes animais foram separados em dois grupos extremos, alto e baixo, contendo seis animais cada, baseados nos valores genômicos estimados (GEBV), para AOL e para EGS. Estes conjuntos de 12 animais foram submetidos à análise de expressão diferencial afim de encontrar GDE entre os grupos. Em seguida, a análise de enriquecimento funcional a partir da lista de GDE foi executada por meio do DAVID (Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery) e da combinação do BiNGO (Biological Networks Gene Ontology) e REVIGO (Reduce + Visualise Gene Ontology). Para AOL, foram identificados 101 GDE entre os grupos de alto e baixo GEBV. Desses, 72 genes apresentaram-se down-regulated e 29 up-regulated no grupo baixo. Para EGS, foram encontrados 18 GDE, dos quais treze apresentaram-se up-regulated e cinco down-regulated no grupo baixo. Dentre as vias metabólicas e processos biológicos encontrados para essas características, destacam-se a via de sinalização MAPK (bta04010) e a via da endocitose (bta04144) - AOL - e, os processos de biossíntese de andrógenos (GO:0006702) e via de sinalização canônica Wnt (GO:0060070) - EGS. Para encontrar conjuntos de genes co-expressos associados aos tratamentos (AOL e EGS), foi utilizado o pacote WGCNA (Weighted Correlation Network Analysis) do R, com dados de contagens de transcritos de 43 animais. Foram identificados 37 módulos, dentre eles, os módulos Azul, Verde-escuro e Salmon apresentaram correlação significativa de 0,3 com a EGS (P&lt;0,10). Os genes destes módulos foram selecionados para análise de enriquecimento funcional quando seus valores de filiação ao módulo foram superiores a 0,7. O módulo azul apresentou o maior número de genes co-expressos, com 953 genes submetidos à análise de enriquecimento funcional. Foram encontradas seis vias metabólicas e 101 termos do Gene Ontology para este módulo, conforme análise do DAVID, além de 108 processos biológicos identificados pelo BiNGO/REVIGO. Os resultados do presente estudo enfatizam a complexidade da regulação gênica do músculo LD de bovinos Nelore associado às características de AOL e EGS. Estes resultados nos auxiliam a compreender melhor os diversos processos moleculares envolvidos na deposição muscular e de gordura de cobertura, características de carcaça economicamente importantes para a produção da carne bovina. / The aim of this work was to study the Longissimus dorsi (LD) muscle transcriptome of Nellore cattle associated with ribeye area (REA) and backfat thickness (BFT) to find differentially expressed genes (DEG), coexpressed gene modules, metabolic pathways, and biological processes that regulate these traits. Data from 385 Nellore steers were used to obtain the phenotypic measures of REA and BFT, measured between the 12th and 13th ribs of the LD muscle. These animals were divided into two extreme groups, high and low, with six animals each, based on the estimated genomic breeding values (GEBV) for REA and for BFT. These sets of 12 animals were submitted to differentially expressed gene analysis to find DEG between the groups. Then, the functional enrichment analysis from the list of DEG was performed by DAVID (Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery) and the combination of BiNGO (Biological Networks Gene Ontology) and REVIGO (Reduce + Visualize Gene Ontology). For REA, 101 DEG were identified between the high and low GEBV groups. Of those, 72 genes were down-regulated and 29 up-regulated in the low group. For BFT, 18 DEG were found, of which thirteen were up-regulated and five were down-regulated in the low group. Among the metabolic pathways and biological processes found for these traits, the MAPK signaling pathway (bta04010) and the endocytosis pathway (bta04144) - for REA -, the androgen biosynthetic processes (GO: 0006702) and the canonical Wnt signaling pathway (GO: 0060070) - for EGS - can be highlighted. To find coexpressed gene modules associated with the traits (REA and BFT), we used the WGCNA (Weighted Correlation Network Analysis) package from R, with data from transcript counts of 43 animals. A total of 37 modules were founded. Among them, the Blue, Dark Green and Salmon modules had a significant correlation of 0.3 with BFT (P&lt;0.10). The genes of these modules were selected for functional enrichment analysis when their module membership values were higher than 0.7. The blue module had the highest number of co-expressed genes, with 953 genes submitted to functional enrichment analysis. Six metabolic pathways and 101 Gene Oontology terms were founded for this module by DAVID analysis, in addition, 108 biological processes were identified by BiNGO/REVIGO. The results of the present study emphasize the complexity of gene regulation in the LD muscle of Nellore cattle associated with REA and BFT. These results can help us to better understand the different molecular processes involved in muscle and fat deposition, which are economically important carcass traits for beef production.

Le facteur pronostic majeur des cancers du col localement avancés (LACC) est le statut ganglionnaire lombo-aortique. Notre travail de thèse a été d'évaluer la lymphadénectomie lombo-aortique (qui représente la technique de référence pour obtenir cette information) à l'ère de la tomographie par émission de positron (TEP) et de la chirurgie par une seule incision (LESS). Les résultats publiés de cette thèse sont: la lymphadénectomie lombo-aortique extrapéritonéale par LESS est faisable. Nous en avons décrit et codifié la technique pour la première fois par une incision iliaque gauche unique ; cette technique que nous avons mise au point est sure, reproductible et équivalente sur le plan carcinologique et ergonomique à la laparoscopie conventionnelle ; la lymphadénectomie lombo-aortique de staging est indispensable dans les LACC compte tenu du taux de faux négatif du TEP-TDM retrouvé dans ce travail de thèse (12% s'élevant à 22 % en cas de fixations ganglionnaires pelviennes suspectes). Nous avons également démontré sur la plus large de la série de littérature que la lymphadénectomie lombo-aortique associée à l'extension des champs d'irradiation en lombo-aortique lors de la radio-chimiothérapie apporte aux patientes présentant des micrométastases une survie identique à celle des patientes négatives histologiquement au niveau lombo-aortique. En revanche, en cas d'atteinte macrométastatique le pronostic demeure péjoratif et nécessite de proposer d'autres options thérapeutiques / In locally advanced cervical cancer (LACC) the most important predictor of disease recurrence is para-aortic nodal status. The aim of our thesis was to evaluate the role of para-aortic lymphadenectomy (the current gold standard to assess para-aortic nodal status) in the era of positron emission tomography (PET) and single incision surgery (LESS). The published results of this thesis are: extraperitoneal para-aortic lymphadenectomy by LESS is feasible and we have described and codified the technique for the first time by a single left iliac incision; the technique we have developed is safe, reproducible and oncologically and ergonomically equivalent to conventional laparoscopy; para-aortic LAD staging is essential in LACC given the false negative rate of PET-CT found in this work (12% increasing to 22% if PET-CT reveals suspicious pelvic lymph nodes). We have also demonstrated, in the largest case series published to date, that para-aortic lymphadenectomy followed by chemoradiation including the pelvis and para-aortic lymph nodes for patients with micrometastatic para-aortic nodal involvement provides an overall survival that is identical to the overall survival of LACC with histologically negative para-aortic lymph nodes. However, in case of macrometastatic disease prognosis remains pejorative and requires other treatment options

Este trabalho teve como objetivo avaliar Características de carcaça por ultra-sonografia de 48 animais confinados (24 Brangus e 24 Nelore), com sistema de controle de consumo individual através de portões eletrônicos(Calan Gates), recebendo diferentes níveis de energia na ração (20, 40, 60 e 80%). Foi utilizado um equipamento de ultra-som Piemedical Scanner 200 Vet, com transdutor linear de 18 cm e 3,5 MHz, a cada intervalo de aproximadamente 28 dias, para obter a área de olho de lombo (AOLU), espessura de gordura subcutânea (EGSU) entre a 12ª e a 13ª costelas e a espessura de gordura na picanha (EGPU), sob o terço superior do músculo Bíceps femuris. Após 142 dias de confinamento os animais foram abatidos e obteve-se o peso de carcaça quente (PCQ) e o rendimento de carcaça (RC). Após 24 horas de resfriamento, as carcaças foram cortadas entre a 12ª e a 13ª costelas e obtidas a área de olho de lombo (AOLC) e a espessura de gordura (EGSC) na carcaça. As correlações entre as medidas por ultra-som e na carcaça foram de 0,83 entre AOLU e AOLC e 0,86 entre EGSU e EGSC. Os animais Brangus apresentaram melhores respostas ao tratamento com 60% de concentrado, enquanto que os animais Nelore responderam melhor ao tratamento 40%. Equações de regressão utilizando o peso vivo (PV), AOLU, EGSU e EGPU explicaram 71% da variação do PCQ quando a medida foi realizada no início do experimento e cerca de 97% quando realizada imediatamente antes do abate, nos animais Brangus. Nos animais Nelore as equações explicaram cerca de 50% na medida realizada no início do trabalho e 96% na medida antes do abate. As equações para estimar o RC utilizando as mesmas características explicaram cerca de 28% da variação quando a medida foi realizada 142 dias antes do abate e 25%imediatamente antes do abate, nos animais Brangus. Nos animais Nelore, as equações explicaram cerca de 15% e 21% quando realizadas no início do experimento ou 142 dias depois, respectivamente. A estimativa da espessura de gordura subcutânea ao abate através do PV, AOLU, EGSU e EGPU explicaram cerca de 20% quando utilizados os dados obtidos no início do trabalho até 73% quando os dados utilizados foram os obtidos imediatamente antes do abate. As medidas de ultra-som apresentaram boa acurácia e podem ser utilizadas para estimar diferenças entre grupos de animais, mas as equações para estimar RC e ponto ideal de abate necessitam maiores estudos. / The objective of this experiment was to evaluate trough ultrasonography the carcass characteristics of 48 young bulls (24 Brangus and 24 Nellore), fed diets with four energy levels(20, 40, 60 and 80% of concentrate) in pens with Calan gates. The Piemedical Scanner 200 ultrasound with a linear transductor of 18 cm and 3,5 MHz was utilized, and the measurements taken at 28 days intervals of the rib eye area (AOLU) and subcutaneous fat thickness (EGSU) between the 12 th and 13 th ribs and also over the Biceps femoris muscle (EGPU). After 142 days on feed all the animals were slaughtered and the hot carcass weight (PCQ) was taken and the carcass dressing percentage (RC) calculated. After 24 hours of chilling the carcasses were separated between the 12 th and 13 th ribs and the rib eye area (AOLC) and fat thickness (EGSC) measured directly. The correlations between ultra-sound and carcass measurements were 0,83 for AOLU and AOLC and 0.86 for EGSU and EGSC. The Brangus bulls showed better performance with 60% concentrate diets and the Nellore with 40% concentrate diets. Regression equations using live weight (PV), AOLU, EGSU and EGPU explained 71% of the variation in the PCQ when measured 142 days before slaughter and 97% immediately before slaughter for the Brangus bulls. For the Nellore bulls the equations explained 50% in the first measurement and 96% the day before slaughter. The equations to estimate RC using the same ultrasound measurements explained 50 and 96% and 15 and 21% of the variation when taken 142 days before or in the day before slaughter for the Brangus and Nellore, respectively. To estimate a determined endpoint the PV, AOLU, EGSU and EGPU explained 20% of the variation when the data was taken in the beginning of the feeding period and increased up to 73 when the data were taken just before slaughter. The ultrasound measurements showed good accuracy and could be used to estimate differences among cattle groups, but equations to estimate RC and determined endpoint need further studies.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-13T12:40:28Z No. of bitstreams: 1 Fernanda de Oliveira Lana.pdf: 2191655 bytes, checksum: 1c0fe338043dce8d998d515ebec30b36 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-13T12:40:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Fernanda de Oliveira Lana.pdf: 2191655 bytes, checksum: 1c0fe338043dce8d998d515ebec30b36 (MD5) Previous issue date: 2012-02-13 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The silky shark, Carcharhinus falciformis, is an abundant species in tropical and equatorial waters of the pelagic zone. The present work aimed at studying the ecology of the silky shark, including aspects of its reproduction, relative abundance, distribution, habitat use and migration on the Equatorial Atlantic Ocean. From November 1992 to December 2011, 153 specimens were examined, 72 males and 81 females, resulting in a sex ratio close to 1:1 (0.89:1.00). All specimens were caught by commercial tuna longline boats, in the area located between 08°N to 53°S latitude and 08°E to 48°W longitude. The results suggest a size at first maturity for females around 205- 210 cm and for males between 180- 200 cm TL. Females were found in 5 maturational stages: juvenile (n = 29/ 35.8% from 74 to 204 cm, TL), maturing (n = 10 / 12.3%, from 215 to 295 cm TL), pre- ovulatory (n = 14 / 17.3%, 177 to 280 cm TL), pregnant (n = 24 / 29.6%, 203 to 270 cm TL) and resting (n = 4 / 4.9%, from 223 to 285 cm TL). Males were classified into 4 stages: juvenile (n = 38/ 52.8% from 81 to 220 cm TL and clasper length - CL <12 cm), maturing (n = 16/ 22.2%, from 166 to 208 TL cm, 9.5 to 24.5 cm CL;), adult (n = 17/ 23.6%, from 141 to 272 cm TL, CL> 24.5 cm) and neonate (n = 1/ 1.4%, 82 cm TL, CL 4 cm). Catch and effort data from 16.016 sets made by Brazilian tuna longliners, from 2004 to 2011, were analyzed. The CPUE was calculated and the catch and effort data were grouped in squares of 5° x 5° latitude and longitude. Two silky sharks were tagged with satellite transmitters PSAT (Pop-up Satellite Archival Tag), in the vicinity of Archipelago of Saint Peter and Saint Paul – ASPSP, but from only one it was possible to recover the data. The preferred temperature range of the tagged animal was between 27 and 28°C with a preferred depth between 1 and 10m. / O tubarão lombo-preto, Carcharhinus falciformis, é uma espécie abundante na zona pelágica, com distribuição em águas tropicais e equatoriais de todos os oceanos do mundo. O presente trabalho teve por objetivo estudar a ecologia do tubarão lombo-preto, incluindo aspectos da sua reprodução, abundância relativa, distribuição, uso do habitat e padrões de migração, na margem ocidental do Oceano Atlântico Equatorial. No período de novembro de 1992 a dezembro de 2011, foram examinados 153 exemplares, 72 machos e 81 fêmeas, resultando uma proporção sexual próxima de 1:1 (0,89:1,00). Todos os espécimens foram capturados por barcos da frota comercial atuneira, que realizaram pescarias com espinhel pelágico, na área localizada entre as latitudes de 08°N e 53°S e longitudes de 08°E e 48°W. Os resultados obtidos sugerem um tamanho de primeira maturação sexual para as fêmeas em torno de 205- 210 cm, e para os machos entre 180- 200 cm de comprimento total (CT). As fêmeas se encontravam em 5 estágios maturacionais: juvenil (n= 29; 35,8%; 74 a 204 cm de CT), em maturação (n= 10; 12,3%; 220 a 295 cm CT), pré-ovulatória (n= 14; 17,3%; 177 a 280cm CT), grávida (n= 24; 29,6%; 203 a 270cm CT); e em repouso (n= 4; 4,9%; 223 a 285 cm CT). Os machos foram classificados em 4 estágios: juvenil (n= 38; 52,8%; 81 a 220 cm CT e Comprimento do Clásper CC < 12 cm), em maturação (n= 16; 22,2%; 166 a 208 cm CT, 9,5 a 24,5 cm CC), Adulto (n= 17; 23,6%; 141 a 272 cm CT; CC > 24,5 cm) e neonato (n= 1; 1,4%; 82 cm CT; 4 cm CC). Foram analisados dados de captura e esforço de pesca de 16.016 lançamentos com espinhel pelágico de deriva, realizados pela frota brasileira atuneira, de 2004 a 2011. A CPUE foi calculada e os dados de captura e esforço foram agrupados em quadrados de 5° x 5° de latitude e longitude. Dois tubarões lombo-preto foram marcados com transmissores via satélite do tipo PSAT (Pop-up Satellite Archival Tag), nas imediações do Arquipélago de São Pedro e São Paulo- ASPSP, mas apenas em um deles foi possível a recuperação dos dados. A faixa de temperatura preferencial do animal marcado se situou entre 27 e 28°C, com uma profundidade preferencial entre 1 e 10m.

Orientador: André Mendes Jorge / Resumo: Os sistemas integrados de produção agropecuária (SIPAs), surgem como estratégia para aumentar a produtividade e renda para o produtor ao mesmo tempo que alcançam a sustentabilidade. No entanto, seus efeitos na qualidade da carcaça e carne dos animais nele produzidos carecem de elucidação. Assim, objetivou-se com este estudo avaliar o desempenho e as características da carcaça e carne de bovinos da raça Nelore terminados em SIPAs, sem disponibilidade de sombra (integração lavoura-pecuária: ILP) e com duas densidades de árvores (integração lavoura-pecuária-floresta: ILPF, com 196 árvores/ha e 448 árvores/ha). O delineamento experimental foi em blocos completos, com três tratamentos (ILP, ILPF-1L e ILPF-3L) e quatro repetições por tratamento, totalizando 12 parcelas experimentais. Foram utilizados 60 animais da raça Nelore castrados de aproximadamente 28±2,81 meses de idade e peso médio inicial de 385,71±27,17 kg para a avaliação do desempenho. Após o abate dos animais, foram coletadas 48 amostras do músculo longissimus thoracis para as análises de qualidade da carcaça e carne. Não foram encontradas diferenças (P>0,05) entre os tratamentos para o ganho médio diário e peso vivo final, contribuindo para ausência de diferença no peso e rendimento da carcaça quente, dianteiro, traseiro especial e ponta de agulha (P>0,05). Do mesmo modo, não foi encontrada diferença (P>0,05) entre os tratamentos para área de olho de lombo inicial e final, espessura de gordura subcutânea inicial e fin... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor