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Revisão taxonômica e filogenia do gênero Loricariichthys Bleeker, 1862 (Ostariophysi: Siluriformes: Loricariidae) / Taxonomic revision and phylogeny of Loricariichthys Bleeker, 1862 (Ostariophysi: Siluriformes: Loricariidae)

Paixão, Andrea de Carvalho 11 December 2012 (has links)
Este estudo teve como objetivos principais revisar taxonomicamente as espécies do gênero Loricariichthys Bleeker, 1862 (Siluriformes, Loricariidae); atualizar a informação sobre a distribuição geográfica de todas as espécies do gênero; propor uma hipótese de relações filogenéticas entre essas espécies e testar as hipóteses de monofiletismo de Loricariichthys e das relações do gênero com os demais Loricariinae. São reconhecidas 17 espécies, das quais três são novas: Loricariichthys sp. n. 1 ocorre na bacia do rio Orinoco; Loricariichthys sp. n. 2 na bacia dos rios Tocantins-Araguaia; e Loricariichthys sp. n. 3 na bacia do rio Madeira. As espécies nominais L. chanjoo (Fowler, 1940) e L. ucayalensis Regan, 1913 são consideradas sinônimos júnior de L. stuebelii (Steindachner, 1882), ambas descritas para a bacia do rio Ucayali, no Peru. Dessa mesma bacia, L. cashybo (Eigenmann & Allen, 1942) é tentativamente considerada sinônimo júnior de L. hauxwelli Fowler, 1915. Loricariichthys brunneus (Hancock, 1828), descrita para o rio Orinoco, é considerada \"species inquirenda\". Uma análise filogenética baseada em 84 carateres morfológicos e 54 táxons resultou em 36 cladogramas mais parcimoniosos (IC = 43; IR = 87), que foi resumido em um cladograma de consenso estrito. Loricariichthys foi corroborado como um grupo monofilético com base em cinco sinapomorfias exclusivas, tendo Hemiodontichthys como grupo-irmão. Foram propostos oito agrupamentos monofiléticos para o gênero, em diferentes níveis de universalidade. As relações filogenéticas dentro de Loricariinae são discutidas / This main goals of this study were to taxonomically review the species of the genus Loricariichthys Bleeker, 1862 (Siluriformes, Loricariidae); to update the information on the geographical distribution of all species of the genus; to propose a hypothesis of phylogenetic relationships among these species and to test the hypotheses of the monophyly of Loricariichthys and its relationships with other Loricariinae. Seventeen species are recognized, of which three are new: Loricariichthys sp. n. 1 occurs in the rio Orinoco basin; Loricariichthys sp. n. 2 in the basin of the rio Tocantins-Araguaia, and Loricariichthys sp. n. 3 in the rio Madeira basin. The nominal species L. chanjoo (Fowler, 1940) and L. ucayalensis Regan, 1913 are considered junior synonyms of L. stuebelii (Steindachner, 1882), both described from the rio Ucayali basin, in Peru. From the same basin, L. cashibo (Eigenmann & Allen, 1942) is tentatively considered a junior synonym of L. hauxwelli Fowler, 1915. Loricariichthys brunneus (Hancock, 1828) described from the Orinoco River basin, is considered \"species inquirenda.\" A phylogenetic analysis based on 84 morphological characters and 54 taxa resulted in 36 most parsimonious cladograms (IC = 43, IR = 87), that were summarized in a strict consensus cladogram. Loricariichthys was corroborated as monophyletic based on five exclusive synapomorphies, and the genus is hypothesized as the sister group of Hemiodontichthys. Eight monophyletic taxa at different levels of universality were proposed within the genus. Phylogenetic relationships among members of the Loricariinae are also discussed
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Revisão taxonômica e filogenia do gênero Loricariichthys Bleeker, 1862 (Ostariophysi: Siluriformes: Loricariidae) / Taxonomic revision and phylogeny of Loricariichthys Bleeker, 1862 (Ostariophysi: Siluriformes: Loricariidae)

Andrea de Carvalho Paixão 11 December 2012 (has links)
Este estudo teve como objetivos principais revisar taxonomicamente as espécies do gênero Loricariichthys Bleeker, 1862 (Siluriformes, Loricariidae); atualizar a informação sobre a distribuição geográfica de todas as espécies do gênero; propor uma hipótese de relações filogenéticas entre essas espécies e testar as hipóteses de monofiletismo de Loricariichthys e das relações do gênero com os demais Loricariinae. São reconhecidas 17 espécies, das quais três são novas: Loricariichthys sp. n. 1 ocorre na bacia do rio Orinoco; Loricariichthys sp. n. 2 na bacia dos rios Tocantins-Araguaia; e Loricariichthys sp. n. 3 na bacia do rio Madeira. As espécies nominais L. chanjoo (Fowler, 1940) e L. ucayalensis Regan, 1913 são consideradas sinônimos júnior de L. stuebelii (Steindachner, 1882), ambas descritas para a bacia do rio Ucayali, no Peru. Dessa mesma bacia, L. cashybo (Eigenmann & Allen, 1942) é tentativamente considerada sinônimo júnior de L. hauxwelli Fowler, 1915. Loricariichthys brunneus (Hancock, 1828), descrita para o rio Orinoco, é considerada \"species inquirenda\". Uma análise filogenética baseada em 84 carateres morfológicos e 54 táxons resultou em 36 cladogramas mais parcimoniosos (IC = 43; IR = 87), que foi resumido em um cladograma de consenso estrito. Loricariichthys foi corroborado como um grupo monofilético com base em cinco sinapomorfias exclusivas, tendo Hemiodontichthys como grupo-irmão. Foram propostos oito agrupamentos monofiléticos para o gênero, em diferentes níveis de universalidade. As relações filogenéticas dentro de Loricariinae são discutidas / This main goals of this study were to taxonomically review the species of the genus Loricariichthys Bleeker, 1862 (Siluriformes, Loricariidae); to update the information on the geographical distribution of all species of the genus; to propose a hypothesis of phylogenetic relationships among these species and to test the hypotheses of the monophyly of Loricariichthys and its relationships with other Loricariinae. Seventeen species are recognized, of which three are new: Loricariichthys sp. n. 1 occurs in the rio Orinoco basin; Loricariichthys sp. n. 2 in the basin of the rio Tocantins-Araguaia, and Loricariichthys sp. n. 3 in the rio Madeira basin. The nominal species L. chanjoo (Fowler, 1940) and L. ucayalensis Regan, 1913 are considered junior synonyms of L. stuebelii (Steindachner, 1882), both described from the rio Ucayali basin, in Peru. From the same basin, L. cashibo (Eigenmann & Allen, 1942) is tentatively considered a junior synonym of L. hauxwelli Fowler, 1915. Loricariichthys brunneus (Hancock, 1828) described from the Orinoco River basin, is considered \"species inquirenda.\" A phylogenetic analysis based on 84 morphological characters and 54 taxa resulted in 36 most parsimonious cladograms (IC = 43, IR = 87), that were summarized in a strict consensus cladogram. Loricariichthys was corroborated as monophyletic based on five exclusive synapomorphies, and the genus is hypothesized as the sister group of Hemiodontichthys. Eight monophyletic taxa at different levels of universality were proposed within the genus. Phylogenetic relationships among members of the Loricariinae are also discussed
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Systematic revision of the South American armored catfish genus Loricaria (Siluriformes: Loricariidae)

Thomas, Matthew Randall 01 May 2011 (has links)
The genus Loricaria Linnaeus of the family Loricariidae is diagnosed as a monophyletic group based on two uniquely derived synapomorphies: lower lip surfaces covered with filiform papillae and absence of buccal papillae surrounding the dentary teeth. Loricaria are small to moderate-sized catfishes widely distributed throughout most of the major river drainages of cis-Andean South America, including the Amazon, Orinoco, Paraguay, Paraná, and smaller coastal rivers draining the Guyana and Brazilian Shields. Based on multivariate analyses of morphometric and meristic data in combination with qualitative assessment of external morphological characters, 15 nominal species are accepted as valid, with an additional nine described as new. Among the nominal species, L. lentiginosa is synonymized with L. prolixa. Loricaria carinata is resurrected from synonymy with L. cataphracta and L. simillima is treated as a junior synonym of L. carinata. Formal diagnoses, descriptions, and a key to all 24 species are provided. Phylogenetic analyses of Loricaria and related taxa (Spatuloricaria, Crossoloricaria, Planiloricaria, Brochiloricaria, Paraloricaria, and Ricola) based on a combined data set of 32 gap-coded quantitative (morphometric and meristic) characters and 24 qualitative characters derived from external morphology resulted in fully resolved, but poorly supported phylogenies under equal weights and implied weighting criteria. Implied weights analyses using a concavity constant (K) of 24-49 recovered Loricaria as a monophyletic group with L. piracicabae as basal and sister to six terminal clades containing all other species. Species originally described as Loricaria, but subsequently transferred to Brochiloricaria, Paraloricaria, and Ricola, were recovered as paraphyletic in each analysis and should be treated as congeneric with Loricaria. Distributions of Loricaria exhibit patterns of endemism similar to those documented for other groups of Neotropical fishes. Species diversity is highest in the Amazon basin (13 species, including 10 endemics), followed by the Paraguay region (5 species, including 4 endemics), Guianas region (5 species, including 2 endemics), Orinoco basin (3 species, including 2 endemics), and a single species occurring in both the São Francisco basin and drainages of Northeastern Brazil. Loricaria is apparently absent from coastal Atlantic drainages south of the São Francisco basin. Such shared patterns of endemism provide some insight into past geomorphological processes that have influenced diversification in Loricaria and serves as a foundation for further tests of biogeographic hypotheses based on phylogenetic and geological evidence.
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Relações filogenéticas das espécies do gênero Rineloricaria Bleeker, 1862 (Siluriformes, Loricariidae, Loricariinae) / Phylogenetic relationships of the species of the Rineloricaria Bleeker, 1862 (Siluriformes, Loricariidae, Loricariinae)

Fichberg, Ilana 17 December 2008 (has links)
As espécies do gênero Rineloricaria são representantes típicos da subfamília Loricariinae, família Loricariidae, tradicionalmente caracterizada pela presença de odontódios recobrindo o corpo, corpo fortemente deprimido e ausência de nadadeira adiposa. Rineloricaria compreende 65 espécies nominais, sendo o gênero mais rico em espécies na subfamília Loricariinae. Estudos filogenéticos prévios sobre Loricariidae não concordaram sobre a hipótese de monofiletismo e posicionamento filogenético de Rineloricaria entre outros Loricariinae. Os objetivos deste trabalho foram testar o monofiletismo do gênero e determinar seu posicionamento entre outros Loricariinae. Um estudo filogenético incluindo 36 espécies de Rineloricaria e 181 caracteres foi realizado utilizando parcimônia estrita. Os principais dados para análise foram derivados de morfologia esquelética e morfologia externa. O grupo externo incluiu uma quantidade representativa de gêneros considerados proximamente relacionados à Rineloricaria, sendo Neoplecostomus microps o táxon mais externo e ponto de enraizamento. Os resultados indicaram que Rineloricaria é monofilético e grupo-irmão dos outros Loricariinae. Doze sinapomorfias sustentam o monofiletismo de Rineloricaria. Dentre estas, uma sinapomorfia exclusiva é um processo dorso-mesial bem desenvolvido no quarto osso faringobranquial. Outras sinapomorfias não exclusivas para o gênero são: uma grande placa pré-anal trapezoidal circundada por três placas poligonais e caracteres específicos de dimorfismo sexual. / The species of Rineloricaria are typical members of Loricariinae subfamily, family Loricariidae, traditionally characterized by the presence of odontodes covering the body, strongly depressed body and absence of adipose fin. Rineloricaria comprises 65 nominal species and it is the most speciesrich genus in the subfamily Loricariinae. Previous phylogenetic studies on Loricariidae have not agreed on the putative monophyly and phylogenetic position of Rineloricaria among other Loricariinae. The objectives of this work were to test the monophyly of the genus and to determine its position among other Loricariinae. A phylogenetic study including 36 species of Rineloricaria and 181 characters was conducted using strict parsimony. The primary data for the analysis came from skeleton and external morphology. The outgroup included a number of representatives of genera previously considered as closely related to Rineloricaria, with Neoplecostomus microps as the most distant outgroup and rooting point. The results indicate that Rinolericaria is monophyletic and sister group to all other Loricariinae. Twelve sinapomorphies support the monophyly of Rineloricaria. Unique among them is the presence of a well-developed dorso-mesial process on the fourth pharyngobranchial bone. Other non-unique synapomorphies for the genus include: a great trapezoidal preanal plate surrounded by three polygonal plates and some specific dimorphic sexual features.
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Relações filogenéticas das espécies do gênero Rineloricaria Bleeker, 1862 (Siluriformes, Loricariidae, Loricariinae) / Phylogenetic relationships of the species of the Rineloricaria Bleeker, 1862 (Siluriformes, Loricariidae, Loricariinae)

Ilana Fichberg 17 December 2008 (has links)
As espécies do gênero Rineloricaria são representantes típicos da subfamília Loricariinae, família Loricariidae, tradicionalmente caracterizada pela presença de odontódios recobrindo o corpo, corpo fortemente deprimido e ausência de nadadeira adiposa. Rineloricaria compreende 65 espécies nominais, sendo o gênero mais rico em espécies na subfamília Loricariinae. Estudos filogenéticos prévios sobre Loricariidae não concordaram sobre a hipótese de monofiletismo e posicionamento filogenético de Rineloricaria entre outros Loricariinae. Os objetivos deste trabalho foram testar o monofiletismo do gênero e determinar seu posicionamento entre outros Loricariinae. Um estudo filogenético incluindo 36 espécies de Rineloricaria e 181 caracteres foi realizado utilizando parcimônia estrita. Os principais dados para análise foram derivados de morfologia esquelética e morfologia externa. O grupo externo incluiu uma quantidade representativa de gêneros considerados proximamente relacionados à Rineloricaria, sendo Neoplecostomus microps o táxon mais externo e ponto de enraizamento. Os resultados indicaram que Rineloricaria é monofilético e grupo-irmão dos outros Loricariinae. Doze sinapomorfias sustentam o monofiletismo de Rineloricaria. Dentre estas, uma sinapomorfia exclusiva é um processo dorso-mesial bem desenvolvido no quarto osso faringobranquial. Outras sinapomorfias não exclusivas para o gênero são: uma grande placa pré-anal trapezoidal circundada por três placas poligonais e caracteres específicos de dimorfismo sexual. / The species of Rineloricaria are typical members of Loricariinae subfamily, family Loricariidae, traditionally characterized by the presence of odontodes covering the body, strongly depressed body and absence of adipose fin. Rineloricaria comprises 65 nominal species and it is the most speciesrich genus in the subfamily Loricariinae. Previous phylogenetic studies on Loricariidae have not agreed on the putative monophyly and phylogenetic position of Rineloricaria among other Loricariinae. The objectives of this work were to test the monophyly of the genus and to determine its position among other Loricariinae. A phylogenetic study including 36 species of Rineloricaria and 181 characters was conducted using strict parsimony. The primary data for the analysis came from skeleton and external morphology. The outgroup included a number of representatives of genera previously considered as closely related to Rineloricaria, with Neoplecostomus microps as the most distant outgroup and rooting point. The results indicate that Rinolericaria is monophyletic and sister group to all other Loricariinae. Twelve sinapomorphies support the monophyly of Rineloricaria. Unique among them is the presence of a well-developed dorso-mesial process on the fourth pharyngobranchial bone. Other non-unique synapomorphies for the genus include: a great trapezoidal preanal plate surrounded by three polygonal plates and some specific dimorphic sexual features.
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Diversificação e evolução fenotípica em peixes cascudos (Siluriformes: Loricariidae: Loricariinae)

Souza, Laura Barreto de Paula 22 February 2018 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / One of the major causes of the phylogenetic, temporal and spatial variation of species richness is attributed to the processes of differential speciation and extinction of lineages, named diversification. There is also a great phenotypic diversity among species that may be related to diversification. The development of phylogenetic comparative methods allowed the study of the diversification and evolution of species traits. The aim of this study is to investigate the pattern of diversification and trait evolution of the suckermouth armored catfish, Loricariinae subfamily, and to investigate if these attributes are related to the diversification rates within the clade. We used a phylogeny containing 114 representatives of subfamily species and their attributes body size, climatic niche and microhabitat (substrate) - position and width for both - to evaluate the evolutionary rates and test the relationship between these different axes of the species niche and their evolutionary rates. We estimated diversification rates with BAMM and performed phylogenetic correlation analyzes (STRAPP) to address the question of whether the attributes are related to the diversification process in the subfamily. We also performed analyzes of disparity through time (DTT) to explore the temporal pattern of phenotypic evolution. The diversification analysis showed that the subfamily had high rates of diversification. Body size presented heterogeneous rates among clades, presenting a shift of diversification in which the specie Paraloricaria agastor had the smallest size of the clade. Climatic niche position presented a heterogeneous pattern of diversification rates, with a shift involving six species of Rineloricaria that retained their niche position. Diversification of the climatic niche width revealed the most heterogeneous pattern, presenting four shifts occurring in clades in which some species possessed greater climatic niche widths. However, the rates of diversification of both micro-habitat position and width did not show any shift. The STRAPP test revealed no correlation between any of the traits studied with diversification, showing that evolutionary process of Loricariinae seems to be independent of the phenotypic attributes investigated. The DTT revealed that in most of the Loricariinae’s evolutionary history, the averages of disparity of the studied attributes evolved under neutral evolution, although they presented peaks of phenotypic disparity within the clades in the most recent time. The results showed that Loricarinae evolved through a non-adaptive radiation where vicariant events would have promoted allopatric speciation and the high diversification rates. In fact, it is known that the radiation of Neotropical fishes was closely related to geological processes of basin formation (hydrogeological hypothesis). DTTs analyzes reinforces this claim, because in most of the evolutionary history the attributes evolved neutrally, without association with diversification, as expected in non-adaptive radiation. Although the subfamily evolved under non-adaptive radiation, divergent selection processes possibly occurred in species independently, promoting significant disparity of attributes within the clades at the present time. The results obtained highlights a peculiar evolutionary history for Loricariinae and a unique known example of nonadaptive radiation for the Neotropics, which can be enlighten the understanding of the yet little known processes that led to the extraordinary diversification of the Neotropical fishes. / Uma das causas da variação filogenética, temporal e espacial da riqueza das espécies são atribuídas aos processos de especiação e extinção diferencial das linhagens, chamado de diversificação. Existe também uma grande diversidade fenotípica entre as espécies que pode estar relacionada à diversificação. O desenvolvimento de métodos filogenéticos comparativos permitiu o estudo da diversificação e evolução de atributos das espécies. O objetivo do presente estudo é investigar os padrões de diversificação e evolução de atributos de peixes Cascudos da subfamília Loricariinae, e investigar se esses atributos estão correlacionados com as taxas de diversificação. Foi utilizada uma filogenia contendo 114 representantes de espécies da subfamília e os atributos tamanho corporal, posição e largura de nicho climático de microhábitat (substrato), para avaliar as taxas evolutivas e relação entre esses diferentes eixos do nicho das espécies e as taxas evolutivas da subfamília. As taxas de diversificação da subfamília e dos atributos foram estimadas através do BAMM e foram realizadas análises de correlação filogenética (STRAPP) a fim de detectar se os atributos estão moldando o processo de diversificação na subfamília. Foram realizadas também análises de disparidade ao longo do tempo (DTT) para explorar o padrão temporal de evolução fenotípica. A análise de diversificação mostrou que a subfamília possui altas taxas de diversificação. O tamanho corporal apresentou taxas heterogêneas entre os subclados, apresentando um shift de diversificação no clado em que a espécie Paraloricaria agastor apresentou o menor tamanho do clado. A posição de nicho climático apresentou um padrão heterogêneo de taxas de diversificação, apresentando um shift envolvendo seis espécies de Rineloricaria que conservaram sua posição de nicho. A diversificação da largura de nicho climático revelou o padrão mais heterogêneo, apresentando quatro shifts que ocorreram em clados que contém espécies com maiores larguras de nicho climático. Já as taxas de diversificação da posição e largura de micro-hábitat não apresentaram shifts. Os testes STRAPP revelaram não haver correlação entre nenhum dos atributos considerados no presente estudo e a diversificação, mostrando que o processo evolutivo de Loricariinae parece ser independente dos atributos fenotípicos investigados. O DTT revelou que na maior parte da história evolutiva da subfamília as médias de disparidade dos atributos estudados evoluíram de forma neutra, porém apresentaram picos de disparidade fenotípica dentro dos clados no tempo mais recente. Os resultados mostram que provavelmente os Loricaríneos evoluíram através de uma radiação não adaptativa onde eventos vicariantes teriam promovido especiação alopátrica e as altas taxas de diversificação. De fato, acredita-se que a radiação dos peixes Neotropicais esteve intimamente relacionada aos processos geológicos de formação de bacias (hipótese hidrogeológica). O DTT reforça essa conclusão, pois em boa parte da história evolutiva os atributos evoluíram neutramente, sem associação com a diversificação, como seria esperado em uma radiação não adaptativa. Entretanto, apesar de a subfamília ter evoluído sob radiação não adaptativa, processos de seleção divergente possivelmente ocorreram em espécies independentemente, promovendo disparidade significativa dos atributos dentro dos clados no tempo presente. Os resultados obtidos revelam uma história evolutiva peculiar para os Loricaríneos e um exemplo raro de radiação não adaptativa nos Neotrópicos, que pode elucidar o entendimento dos processos que levaram a extraordinária diversificação dos peixes Neotropicais, ainda pouco conhecidos. / São Cristóvão, SE

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