Esta dissertação fez parte do projeto temático “Conservação da Biodiversidade em Paisagens Fragmentadas no Planalto Atlântico de São Paulo", que teve como objetivo geral estudar os efeitos da fragmentação da Mata Atlântica sobre diversas comunidades e processos ecológicos na região de Caucaia do Alto, SP. A dissertação está dividida em três capítulos centrais e duas abordagens principais. A primeira delas utilizou dados coletados por mim e outros pesquisadores com o objetivo de testar o uso de uma metodologia de captura de pequenos mamíferos relativamente nova e pouco utilizada nos trópicos, comparando a sua eficiência com a da metodologia mais tradicional de coleta de dados sobre estes animais (capítulo 2). Estudos recentes demonstram que a matriz, conjunto de ambientes alterados que circundam os remanescentes em paisagens fragmentadas, considerada inicialmente inóspita e homogênea, funciona como um mosaico de unidades com diferentes permeabilidades ao deslocamento ou à ocorrência das espécies. Dentro deste contexto, a segunda abordagem desta dissertação corresponde à descrição e comparação do uso, pelos pequenos mamíferos, dos ambientes alterados que envolvem os remanescentes de floresta (capítulo 3) e à utilização deste tipo de informação para o estudo da influência da estrutura da paisagem sobre a distribuição de espécies (capítulo 4). No capítulo 2, para avaliar a eficiência e a congruência entre tipos de armadilhas, amostramos a comunidade de pequenos mamíferos de forma padronizada usando armadilhas Sherman e de queda em 26 sítios, 20 localizados em fragmentos florestais e seis em floresta contínua. Os resultados sugerem que armadilhas de queda, quando constituídas por baldes grandes e profundos e utilizadas nas épocas chuvosas e quentes, não só complementam a diversidade encontrada com o uso de armadilhas tradicionais, como podem triplicar a riqueza por sítio de amostragem, incluindo espécies raras, de hábitos semi-fossoriais e espécies escansoriais/arborícolas geralmente não atraídas pela isca das armadilhas tradicionais. Apesar das diferenças de eficiência, os resultados sugerem que os dados obtidos com os dois tipos de armadilhas são congruentes e que variações de diversidade e abundância entre sítios são semelhantes entre os métodos. As armadilhas de queda também parecem ser essenciais em estudos demográficos, já que capturam indivíduos em uma amplitude maior de peso, incluindo os jovens, raramente capturados nas armadilhas tradicionais. No capítulo 3, para avaliar a qualidade da matriz para os pequenos mamíferos na região de Caucaia do Alto, utilizamos os dados de amostragens padronizadas realizadas em 23 sítios, sete localizados em remanescentes florestais (floresta contínua e fragmentos) e 16 distribuídos nos quatro tipos predominantes de habitats da matriz (vegetação nativa em estádios iniciais de regeneração, plantações de eucalipto, áreas de agricultura e áreas rurais com construções). Houve forte segregação na comunidade de pequenos mamíferos entre a vegetação nativa e demais habitats, indicando a capacidade extremamente reduzida das espécies florestais de ocupar habitats antropogênicos. A vegetação nativa em estádios iniciais apresentou uma razoável permeabilidade para as espécies florestais, sugerindo o potencial da regeneração natural para a restauração de paisagens fragmentadas de Mata Atlântica. Os habitats antropogênicos foram dominados por espécies generalistas, exóticas ou típicas de biomas abertos, sugerindo que paisagens muito alteradas possam ser dominadas por estas espécies, com conseqüências para a regeneração das florestas e para a saúde humana. No capítulo 4, a partir dos resultados da distribuição das espécies de pequenos mamíferos nos habitats do mosaico, informações sobre a qualidade destes habitats foram utilizadas na avaliação da influência da estrutura da paisagem sobre a ocorrência das espécies em 20 fragmentos florestais, com o objetivo de comparar o poder explanatório de métricas que consideram ou não a qualidade da matriz e investigar a importância da escala espacial. Os resultados indicam que a influência da estrutura da paisagem é maior para as espécies que não ocorrem na matriz, ou entre as que ocorrem, para aquelas que não ocupam todos os ambientes da paisagem. Em geral, os modelos com as métricas que consideram a qualidade da matriz apresentaram maior poder explanatório sobre a distribuição das espécies nos fragmentos. Dentre as métricas que consideram a qualidade da matriz, aquelas que incorporam a distância entre as diferentes manchas de habitat mostraram vantagens em relação às que consideram apenas a área das manchas, pois apresentaram maior poder explanatório sobre a ocorrência de um maior número de espécies e menor variação do poder explanatório em relação a mudanças na escala espacial considerada. Esta ultima característica é importante dada a falta de uniformidade observada na resposta das espécies à variação da escala espacial e a escassez de informações que embasem a escolha de escalas espaciais adequadas para espécies tropicais. / This dissertation was developed as part of the thematic project “Biodiversity Conservation in Fragmented Landscapes at the Atlantic Plateau of São Paulo", which aimed at studying the effects of the fragmentation of the Atlantic forest on several communities and ecological processes in Caucaia do Alto, SP. This dissertation is divided in two main approaches that comprise three chapters. In the first approach, I used data collected by myself and by other researchers with the objective of testing the use of a relatively new and little explored methodology to capture small mammals in the tropics, comparing its efficiency to the methodology that is tradicionally ised to collect data about these animals (chapter 2). Recent studies have shown that the matrix of altered habitats surrounding remnants in fragmented landscapes, considered initially as inhospitable and homogeneous, act as a mosaic of units presenting different degrees of permeability to the movement or to the occurrence of species. Within this context, the second approach of this dissertation concerns the description and comparison of use of the altered habitats surrounding forest remnants by small mammals (chapter 3) and to the use of this type of information for the study of the influence of landscape structure on species distribution (chapter 4). In chapter 2, aiming at the evaluation of the efficiency and congruence of different types of traps, we sampled the small mammal community using a standardized procedure, with Sherman and pitfall traps in 26 study sites, 20 located in forest fragments and six in the continuous forest. Results suggest that large and deep enough pitfall traps used during wet and warm periods, not only complement the diversity found using traditional traps, but also leads to an considerable increase in the number of species found at each study site, including rare species, semi-fossorial species and scansorial/arboreal species that are usually not attracted to the bait used in traditional traps. Despite differences in efficiency, results suggest that data gathered with the two types of traps are congruent and that the variation in diversity and abundance among study sites is similar between the two methods. Pitfall traps also seem to be essential in demographic studies because they are able to capture individuals within a larger range of weights, including young individuals, which are rarely captured using traditional traps. In the chapter 3, to evaluate matrix quality for the small mammals in Caucaia do Alto, we used data from standardized sampling in 23 study sites, seven of which were located in forest remnants (continuous and fragmented forest) and 16 were distributed in the four main types of matrix habitats (native vegetation in initial stages of regeneration, eucalyptus plantation, areas of agriculture and rural areas with buildings). There was a strong segregation in the small mammal community between native vegetation and the other habitats, indicating the extremely low capacity of forest species to occupy anthropogenic habitats. Native vegetation in initial stages presented a reasonable permeability to forest species, suggesting the potential of natural regeneration to restore fragmented Atlantic forest landscapes. Anthropogenic habitats were dominated by generalist species, exotic species or species that are typical from open biomes, suggesting that highly altered landscapes may be dominated by these species, with consequences to forest regeneration and to human health. In chapter 4, using the results of the distribution of the small mammal species in the habitats of the mosaic, information on the quality of these habitats was applied in the evaluation of the influence of landscape structure on the occurrence of species in 20 forest fragments, aiming to compare the explanatory power of metrics that consider or not matrix quality and to investigate the importance of spatial scale. Results indicate that the influence of landscape structure is stronger for species that do not occur in the matrix, or for species that do not occur in all habitats in the mosaic. In general, the models using metrics that consider matrix quality presented higher explanatory power on the distribution of species. Among the metrics that consider matrix quality, those that incorporate distance among different habitat patches presented advantages in relation to those that consider only patch area, because they presented a higher explanatory power to the occurrence of a larger number of species and lower variation in the explanatory power in relation to changes in spatial scale. The later characteristic is important given the lack of uniformity observed in species response to variations in spatial scale, and the scarcity of information that could support the choice of adequate spatial scales for tropical species.

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-18T18:06:27Z No. of bitstreams: 2 Francisca Helena Aguiar da Silva.pdf: 2730642 bytes, checksum: dfeba4b2314368c6fa0b055e953849c9 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-18T18:06:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Francisca Helena Aguiar da Silva.pdf: 2730642 bytes, checksum: dfeba4b2314368c6fa0b055e953849c9 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2007-05-08 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / This study analyzed the diet of the Harpy Eagle (Harpia harpyja), including the influences of seasonality and land cover (forest vs. deforested) in a 3 km buffer around nests, and the frequency of occurrence and biomass of prey delivered to nestlings and fledglings. The nests were located in areas of lowland forest in settlements of Villa Amazônia (INCRA). Skulls, jaws and bones of prey consumed by Harpy Eagles were collected on the ground beneath the nest trees and from the nests at five sites between 2003 and 2005. Prey species were identified by comparison to reference collections in the Paraense Museum (MPEG) and the National Institute for Amazonian Research (INPA). Biomass of prey were estimated using regression equations. Harpia harpyja consumed: Bradypus variegatus (39 %), Choloepus didactylus (40 %), Callicebus hoffmannsi (4 %), Cebus apella (1 %), Chiropotes albinasus (1 %), Pithecia irrorata (0.4 %), Coendou koopmani (2.4 %), Didelphis marsupialis (0.8 %), Potos flavus (0.8 %) e Ara chloroptera (Aves) (0.4 %). About 99 % of prey were arboreal, the rest arboreal/terrestrial, also most were of habits solitary (84 %) and folivore (81 %). Sloths contributed with 86 % of the total biomass estimated. The monthly biomass consumed was on average 6.5 kg, 3.6 kg, 3.5 kg, 3.2 kg e 3.2 kg, but when material collected from nests was considered, the monthly biomass increased to 7.9 kg, 5.4 kg, 4.3 kg, 5.6 kg e 3.2 kg respectively, for the nests of Nova Esperança, Quebra-Curuá, Murituba, Laguinho and Alternativo do Ney. The number of individuals of sloths eaten was greater in the dry season. Harpy eagle revealed to be a specialist Levin ́s trophic level index for Parintins region, that is 0.105 for individuals and 0.069 for biomassa. Forest cover in the 3-km zone around four of the nests averaged just over 50% and 92% around the fifth. The amount of forest was reduced only about 1% during the course of the study, and there was no relationship between the amount of available forest in the 3-km zone around the nest and what was consumed by this eagle species in the different nests. / O presente estudo analisou a dieta do gavião-real (Harpia harpyja), incluindo influências da estacionalidade e da área de cobertura florestal sobre a composição, a freqüência e a biomassa de indivíduos por espécie de presas trazidas pelo casal para o filhote no ninho. Crânios, madíbulas e fragmentos de ossos de presas consumidas pelo gavião-real que permanecem no solo sob a árvore do ninho e no interior do ninho foram coletados entre 2003 e 2005. Os cinco ninhos estavam localizados em florestas de terra-firme no Assentamento do INCRA – Vila Amazônia, município de Parintins, Amazonas. As presas foram identificadas em comparações com espécimes de coleções de referência no Museu Paraense Emilio Goeldi e no Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, para quantificar o número de indivíduos por espécie de presa e a biomassa de cada indivíduo predado. A biomassa das espécies predadas foi estimada por meio de equações de regressão. As espécies de presas consumidas, em termos de proporção de indivíduos foram: Bradypus variegatus (39 %), Choloepus didactylus (40 %), Callicebus hoffmannsi (4 %), Cebus apella (1 %), Chiropotes albinasus (1 %), Pithecia irrorata (0,4 %), Coendou koopmani (2,4 %), Didelphis marsupialis (0,8 %), Potos flavus (0,8 %) e Ara chloroptera (Aves) (0,4 %). Primatas não identificados pertencentes ao taxon Cebidae/Pitheciidae perfazem um total de 5,2 %, enquanto Aves não identificadas, 4,6 %. Considerando os hábitos ecológicos das espécies predadas nos cinco ninhos, 99 % eram indivíduos arborícolas, 1 % terrestres/arborícolas, 81 % folívoros e 84 % solitários. Em termos de biomassa, as preguiças foram as presas mais importantes na dieta do gavião-real, contribuindo com 86 % da biomassa total estimada de presas consumidas. A biomassa mensal consumida nos cinco ninhos foi em média 6,5 Kg, 3,6 Kg, 3,5 Kg, 3,2 Kg e 3,2 Kg, respectivamente para os ninhos Nova Esperança, Quebra-Curuá, Murituba, Laguinho e Alternativo do Ney. Incluindo a biomassa estimada das presas coletadas na limpeza dos ninhos, a biomassa mensal aumentou para 7,9 Kg, 5,4 Kg, 4,3 Kg, 5,6 e 3,2 Kg. A dieta do gavião-real para a região de Parintins, revelou que o uso de presas foi especializado, cujos valores de amplitude de nicho trófico de Levins resultaram em 0,105 para número de indivíduos e 0,069 para a biomassa das presas consumidas. As preguiças foram consumidas com maior freqüência na estação seca. A cobertura florestal reduziu cerca de 1 % na área de floresta no entorno dos ninhos durante o período de monitoramento, mas não houve relação entre o tamanho de floresta disponível no raio de 3 Km e o que é trazido para o filhote nos ninhos.

Orientador: Nivar Gobbi / Banca: Katia Cury Roselli / Banca: Eliana Ferraz Santos / Banca: Ricardo Tadeu Santori / Banca: Sônia Aparecida Talamoni / Resumo: O estudo das características microscópicas dos pêlos de mamíferos tem sido desenvolvido com o propósito de utilizá-las como critério taxonômico, especialmente para a identificação de restos presentes em fezes, conteúdos estomacais e bolotas de regurgitação de predadores. Os pêlos são menos danificados no processo digestivo, e são freqüentemente a única prova para identificação da presa em estudos de hábito alimentar, já que ossos e dentes sofrem intensa fragmentação durante a mastigação apresentando baixo valor diagnóstico, portanto um conhecimento maior da estrutura do pêlo facilita esses estudos e oferece uma base para estudos mais completos de predação e seus efeitos sobre as espécies de presa. Assim, os objetivos do presente projeto foram o desenvolvimento de técnicas de preparação de lâminas de pêlos para coleções e observações diretas; o desenvolvimento de uma chave de identificação de alguns roedores de mata atlântica baseada em pêlos; e a análise morfométrica dos pêlos de algumas espécies de roedores para a comparação com dados biométricos. Foram desenvolvidas 3 novas técnicas para a preparação de lâminas para a observação da medula de pêlos e outras 3 para a observação do padrão cuticular. Essas técnicas proporcionam um maior índice de sucesso na preparação de lâminas, aumentando também a visibilidade dos padrões e consequentemente as possibilidades de pesquisas na área. / Abstract: The mammal hair identification has been used across the world for studies in forensics, in the field of public health, in textile fibers research, and in mammals feeding ecology, being useful on the identification of leftovers on feces and stomach contents. Hairs are the less damaged structures by digestive processes and nonetheless are the only clue for the identification of the prey in studies of feeding ecology of predators, since bones and tooth suffer heavy damage during the chewing process, being of a low diagnostic value. These factors show the importance of a better knowledge of the hair structure for prey or predator ecology studies. Also the hair trapping and identification has a important value in animal research bioethics, since the mammal surveys can be developed with hair-traps or scats/pellets without any harm or interference for the animals which have no risk to get addicted to the bait, which usually bias surveys, and minimizing the stress for being caught. The aim of the present thesis were the development of better techniques for the preparation of hair plates for collections and direct observations; the development of a identification key for Rain Forest rodents; and the morphometrical analysis of those mammals hairs for further comparison and analysis with biometrical data. There were developed 6 new techniques, being 3 for medulla pattern observation, and another 3 for cuticular impressions. Those techniques showed a higher success index on plate preparation, enabling the development of high level research on this field. / Doutor

Estudos sobre seleção de presas podem apresentar resultados bastante diferentes dependendo do predador analisado. Predadores com diferentes técnicas de caça, como as aves de rapina e os mamíferos carnívoros, podem selecionar diferentes tipos de presas. Estudos sistemáticos sobre esse tema ainda são escassos no Brasil. Por esse motivo, o objetivo deste trabalho foi a análise da seletividade na dieta de três predadores quanto ao consumo de pequenos mamíferos na Estação Ecológica de Itirapina, SP. Para a suindara (Tyto alba), a seletividade de presas foi avaliada nos níveis de: espécie, tamanho, idade e sexo. A coruja-buraqueira (Athene cunicularia) foi estudada quanto ao consumo diferenciado nos níveis de espécie, tamanho e idade das presas. Para o lobo guará (Chrysocyon brachyurus), apenas a seleção de espécies foi possível. Foram utilizados restos de ossos (mandíbulas e cinturas pélvicas) das presas encontradas nas pelotas e fezes desses predadores para identificação da espécie e do sexo dos indivíduos, e para a quantificação do número de indivíduos consumidos. A análise de seleção de espécie foi feita por meio de comparações entre a proporção das mesmas encontradas nas dietas e no ambiente. Para isto, foram utilizados o teste G e o intervalo de confiança de Bonferroni. O consumo preferencial por um determinado sexo foi avaliado pelo teste G ou pelo teste exato de Fisher. O tamanho dos pequenos mamíferos na dieta foi calculado por meio de equações de regressão desenvolvidas para cada espécie dessas presas. O Teste de Mann-Whitney foi utilizado para comparações entre o tamanho das presas nas dietas e no ambiente. As idades dos roedores encontrados nas dietas e nos ambientes foram comparadas utilizando-se o teste G. A suindara foi mais seletiva do que a buraqueira no consumo de espécies de pequenos mamíferos, embora ambas incluam as mesmas espécies nas suas dietas. Calomys tener e Oligoryzomys nigripes foram os roedores mais predados pelas corujas. A seleção de indivíduos menores e de juvenis de C. tener pela suindara e de sub-adultos dessa presa pela buraqueira poderia ser entendido pelo modo de forrageamento de cada coruja e características biológicas da presa. Por outro lado, por ser um animal de maior porte, era esperado por parte do lobo-guará o consumo de presas maiores, como Clyomys bishopi. A seleção por indivíduos menores de C. tener pelas duas corujas indica predação de indivíduos mais vulneráveis. Assim a predação diferencial por roedores pequenos pode não ser devido a predação seletiva por parte das corujas, mas sim devido à alta vulnerabilidade dos mesmos, devido a sua inexperiência e por serem errantes. Pode-se perceber por meio deste estudo que, dependendo da localidade e das diferentes composições/abundancia de presas, os predadores parecem adotar diferentes estratégias. Dentro de uma mesma localidade esse recurso é utilizado de forma diferenciada pelos três predadores, pelo menos em termos de proporções, tamanho e idade. Estudos mais amplos e detalhados com utilização de metodologia padronizada, englobando todos os componentes de uma guilda trófica, além de se levar em conta as muitas variáveis ambientais, torne possível entender o papel de cada espécie na comunidade. / Prey selection studies may result in different conclusions depending on the analysed forager. Predators with different foraging modes, such as raptors and carnivorous mammals, may select different prey types. This kind of study is still scarce in Brazil. So, the goal of this research is the analysis of small mammal selection in the diet of three predators at Itirapina Ecological Station, SP. Analysis of prey selection by the Barn Owl (Tyto alba) was conducted in relation to species, size, age and sex. The Burrowing Owl (Athene cunicularia) was studied in relation to the consumption of small mammal species, size and age. The Maned Wolf (Chrysocyon brachyurus) was only evaluated concerning prey species selection. Remains of bones (mandibles and pelvic girdles) found in pellets and faeces of predators were utilized to identify prey species, sex and to quantify number of consumed individuals. Analysis of prey species selection was conducted by comparisons between proportion of prey found in the diet and in environment, applying G test and Bonferroni confidence intervals. Differential sex consumption was evaluated by G test and Fisher exact test. Mann-Whitney test was employed to compare prey size in the diet and in the environment. Rodent ages found in pellets/ faeces and in the field were compared by G test. The Barn Owl was more selective than the Burrowing Owl in relation to prey species consumption, though both of them include the same small mammal species in their diets. Calomys tener and Oligoryzomys nigripes were the most preyed on rodents by the two owls. Small-sized and juvenile individuals of C. tener were more consumed by the Barn Owl, whereas sub-adults were more preyed on by the Burrowing Owl. Differences may be due to foraging mode of each owl and biological characteristics of prey. The consumption of larger prey, such as Clyomys bishopi, by the larger predator, the Maned Wolf, was expected. Selection of smaller individuals within species may suggest predation of more vulnerable prey. So small-sized rodent selection may not result from active predation by the owls, but from higher vulnerability of these prey. Based on this study, depending on locality and differences in prey composition/abundance, predators may adopt different strategies. In the same area, resource was utilized in different manner by these predators, at least, in terms of prey proportion in the diet, size and age. Further studies using the same methodology, involving all components of trophic guilds, besides environmental variables, may better illustrate the role of each species in community.

O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é um sistema genético reconhecidamente polimórfico em populações humanas. Em porções específicas dos genes que compõem o MHC de populações humanas também foi evidenciada a ação da seleção natural em nível molecular. Em várias espécies de vertebrados onde estes genes foram estudados diferentes níveis de variação, composição gênica e organização foram detectados, mantendo, entretanto, as características que os tornam tão interessante de ser estudados. Para mamíferos marinhos, as questões sobre a variação no MHC servem de pano de fundo para o entendimento sobre o sistema imunológico destas espécies e suas particularidades em relação ao ambiente marinho e a evolução destes genes em organismos não-modelos. No presente trabalho, duas espécies de cetáceos, a toninha ou franciscana (Pontoporia blainvillei) e a baleia-franca-austral (Eubalaena australis), foram investigadas quanto aos níveis de variação no gene DQB1 do MHC. O segundo exon da cadeia beta do gene DQ foi amplificado em 25 amostras de toninha e 18 amostras de baleia franca. Os fragmentos de 212pb (pares de base) resultantes do processo de amplificação foram clonados e, tiveram analisados por seqüenciamento 171pb correspondentes ao sítio de ligação ao peptídeo antigênico (PBR). Uma amostra de toninha e um par mãe-filhote de baleia-franca-austral foram analisadas quanto à expressão do gene DQB a partir de amostras de pele. A evidência de seleção natural a nível molecular nesta porção do gene é confirmada por um excesso de substituições não sinônimas em relação às substituições sinônimas (em um contexto de neutralidade as substituições sinônimas acumulam-se na mesma taxa de mutações) através da razão dN (não sinônimas) e dS (sinônimas). Para confirmar os desvios da neutralidade (Ho= dN/dS=1), foi usada a estatística z. Os valores de dN/dS para toninha e baleia-franca-austral foram, respectivamente, dN/dS = 2,32 (p=0,014) e dN/dS =3,75 (p= 0,001). Estes valores, as características das seqüências e a evidência de expressão desses genes na pele de cetáceos estão de acordo com os pressupostos de seleção positiva para esta região do gene e sugerem funcionalidade para estes genes nestas duas espécies. Há evidências de mais de uma cópia do gene para baleia-franca-austral. Foram descritos 6 alelos para toninha e 17 alelos para baleia-franca-austral sendo que um dos alelos é compartilhado entre as duas espécies, sugerindo que essa linhagem alélica é anterior à divergência entre odontocetos e misticetos. Paralelamente a este trabalho, o cariótipo de toninha foi descrito através de um processo de cultivo celular a partir da córnea de dois exemplares recém-mortos. Seu número cromossômico 2n=44 corrobora a estabilidade cariotípica descrita para cetáceos. / The Major Histocompatibility Complex is a highly polimorphic genetic system described to human populations. It is clear that a particular region from these genes is under natural selection which results in different patterns of variation from those expected under neutrality. In other vertebrates these genes were studied, these special characteristics seems to be preserved despite specific genomic organization and variation levels. In marine mammals, questions adressed to MHC molecular variation are focused in questions concerned on environmental restrictions and molecular evolution in non-model organisms. In the present study, two marine mammal species were surveyed concerning genetic variability using the gene DQB exon 2. Samples from 25 franciscana dolphins (Pontoporia blainvillei) and 18 southern right whales (Eubalaena australis) were used to amplify a 212bp (base pair) fragment from DQB exon 2. The 171bp resulting fragment was sequenced and analized in relation to the molecular level evidence of selection. Rates of nonsynonymous (dN) and synonymous (dS) base pair substitution and departures from neutrality for dN/dS (z statistics) were calculated. For both species examined, molecular evidence of selection was confirmed. The dN/dS ratios to franciscana and southern right whale were 2.32 (p=0.014) and 3.75 (p=0.001), respectively. These values, combined to data on DQB gene expression in franciscana and southern right whale skin and less restrictive aminoacid usage in both species, suggest a functional signature to sequences cetacean derived. Additionally, 6 alleles were described to franciscana dolphins and 17 to southern right whales. One more evidence of selection acting in this particular genomic region is provided from the fact that both species share one allele, suggesting that this allelic lineage was present before the splitting between mysticeti and odontoceti. To provide addtional information on franciscana dolphins the karyotype of P. blainvillei is presented. The karyotype was obtained from corneal culture of two dead animals. The diploid number 44 confirms the clear prevalence of this pattern among cetaceans.

Entre janeiro de 2005 e dezembro de 2006 foram realizados estudos sobre a abundância relativa de mamíferos de médio e grande porte no Parque Estadual do Turvo (PET), Rio Grande do Sul, Brasil. O PET localiza-se no extremo noroeste do Estado, junto às divisas da Argentina e do Estado de Santa Catarina. O Parque possui 17.491 ha e é o último remanescente representativo da Mata Pluvial do Alto Uruguai. Sua localização, contígua a região de Misiones pode ser considerada como um dos extremos do Corredor Verde, uma ampla região florestal que estende-se pela Argentina até o Parque Nacional do Iguaçu. Esta região abriga uma grande diversidade de fauna e as populações mais austrais de diversas espécies, tendo portanto grande importância conservacionista. No total foram registradas 29 espécies de mamíferos de médio e grande porte no PET. As espécies de mamíferos cujos registros mostraram-se mais abundantes foram Dasyprocta azarae e Sylvilagus braslienisis.Entre os Carnivora, Nasua nasua e Leopardus pardalis foram as espécies mais comumente registradas. Os indivíduos de Leopardus pardalis, foram individualizados por foto-identificação. No total, obteve-se o registro de ao menos 26 indivíduos em toda área do Parque. Através de análises de capturara e recaptura estimou-se a densidade local de L. pardalis em 0,20 indivíduos por km². Entre os ungulados a espécie com maior número de registros foi Pecari tajacu, embora Tapirus terrestris seja uma espécie facilmente registrada na área. Constatou-se a extinção local de Tayassu pecari, não registrada na área mesmo após dois anos de estudos. Os resultados obtidos fornecem uma base de dados para o aprofundamento dos estudos populacionais, o monitoramento da população de mamíferos do PET, além de servirem como alerta da fragilidade deste ecossistema.

Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario. / Los armadillos, junto a los perezosos y osos hormigueros, pertenecen al Megaorden Xenarthra. Actualmente se conocen 20 especies de armadillos en el mundo, de las cuales sólo tres se distribuyen en Chile. Habitan, principalmente, la cuesta occidental de la cordillera de los Andes. Por el norte se distribuye el quirquincho de la puna (Chaetophractus vellerosus), en la zona centro-sur el piche (Zaedyus pichiy) y en el extremo sur el peludo (Chaetophractus villosus). A pesar de las interesantes e inusuales características que tienen estas especies a nivel anatómico, fisiológico y evolutivo, en Chile no se les ha dado la atención necesaria. Esta memoria tiene por finalidad profundizar en el conocimiento de la historia natural de estas tres especies a través de una revisión bibliográfica y evaluar su distribución real y amenazas dentro del Sistema Nacional de Áreas Silvestres Protegidas del Estado (SNASPE) de la Corporación Nacional Forestal. Para ello se recopiló la literatura existente sobre los armadillos de Chile, y se enviaron encuestas a todas las unidades del SNASPE, obteniendo un 70,5% de respuestas. La búsqueda bibliográfica mostró que se ha generado muy poca información en el país y que se han realizado pocos estudios en terreno. La distribución del piche resultó ser mucho más restringida de lo que se pensaba. Las principales amenazas en el país son el atropellamiento, el ataque por perros asilvestrados y la presencia de minerías y termoeléctricas. Esta memoria servirá como base para futuros estudios sobre estas especies en Chile / Armadillos, as well as sloths and anteaters, belong to the Superorder Xenarthra. Twenty species of armadillos are currently recognized in the world, of which only three are distributed in Chile. They inhabit mainly the western slope of the Andes. The screaming hairy armadillo (Chaetophractus vellerosus) is distributed in the north, the pichi (Zaedyus pichiy) in the south-central area of Chile, and the large hairy armadillo (Chaetophractus villosus) inhabits the far south. Despite the interesting and unusual characteristics of these species at the anatomical, physiological, and evolutionary level, Chile has not given these species the necessary attention. This report aims to deepen the knowledge about the natural history of these three species through a bibliographical review, and to evaluate their real distribution and threats within the Sistema Nacional de Áreas Silvestres Protegidas del Estado (SNASPE) of the Corporación Nacional Forestal. To accomplish this, the existing literature on the armadillos of Chile was compiled and surveys were sent to all SNASPE units, obtaining 70.5% of responses. The literature search showed that very little information has been generated in the country and that few field studies have been done. The pichi’s distribution turned out to be much more restricted than previously thought. The main threats in the country include automobiles, attacks by feral dogs, and the presence of mining and thermoelectric plants. This report will serve as a basis for future studies on these species in Chile

Los telómeros son complejos nucleoproteicos localizados en los extremos de los cromosomas eucarióticos. Están involucrados en la preservación de la integridad de los mismos, protegiéndolos de la degradación por nucleasas y de la recombinación y fusión con otros cromosomas. Por lo tanto, el mantenimiento de la función telomérica resulta fundamental para la estabilidad genómica y la viabilidad celular. Dado que una cantidad importante de mutágenos químicos son utilizados como agentes antitumorales, el estudio del daño inducido a nivel genético por estos compuestos reviste gran interés. El objetivo general de este trabajo de Tesis Doctoral consistió en obtener nuevos conocimientos para lograr una mejor comprensión de los efectos de los mutágenos químicos sobre los telómeros de los cromosomas eucarióticos y estudiar la inestabilidad telomérica en un modelo murino de inducción tumoral. De este modo, se pretende establecer si los mutágenos químicos inducen inestabilidad telomérica retardada o persistente y si el desarrollo tumoral se relaciona o asocia con alteraciones específicas en el patrón de expresión de los genes ligados al mantenimiento telomérico. Para tal fin, en primer término se abordó el estudio de la inestabilidad telomérica (IT). Este comprende el análisis del daño cromosómico a nivel telomérico, los eventuales cambios en la longitud telomérica y en la actividad de la enzima telomerasa en la progenie de las células de rata ADIPO-P2, que fueron expuestas inicialmente a los mutágenos químicos bleomicina (BLM), estreptonigrina (EN) y estreptozotocina (EZ). Si bien se conocen parcialmente los efectos inmediatos o a corto plazo de algunos mutágenos químicos sobre los telómeros, se desconoce qué es lo que ocurre a largo plazo con los telómeros de las células que sobreviven al tratamiento con un mutágeno dado y si los mutágenos químicos inducen inestabilidad telomérica retardada tal como ocurre con las radiaciones ionizantes. El análisis de las aberraciones cromosómicas se llevó a cabo aplicando la técnica de PNA-FISH con sonda telomérica. Asimismo, se estudió la actividad de la enzima telomerasa, utilizando un kit comercial específico y la longitud telomérica se determinó mediante la técnica de Flow-FISH por citometría de flujo. Nuestros resultados demuestran que los mutágenos químicos BLM, EN y EZ pueden inducir inestabilidad telomérica hasta al menos 15 días después del tratamiento con los mismos. Asimismo, se evidenció que los llamados cromosomas incompletos (CI), a pesar de carecer de un extremo cromosómico, pueden ser transmitidos a la progenie de las células que fueron originalmente expuestas a dichos mutágenos. Además, se 5 determinó que las células expuestas a los mutágenos químicos mencionados son cromosómicamente inestables desde la primera división mitótica luego del tratamiento. Por otro lado, se observó que en las células ADIPO-P2 expuestas a los mutágenos, BLM, EN y EZ, la actividad de la enzima telomerasa depende de la presencia de telómeros cortos y no se correlaciona directamente con la inestabilidad telomérica registrada citogenéticamente. De esta manera, los resultados de la presente investigación permitieron obtener un mejor conocimiento de los efectos de los mutágenos químicos antitumorales sobre el genoma a largo plazo y por lo tanto, contribuirán a una mejor comprensión de su modo de acción sobre las células, lo cual resulta de fundamental importancia al momento de evaluar la eficacia y uso terapéutico de dichos compuestos. En segundo término, para determinar si el desarrollo tumoral in vivo se relaciona con alteraciones en el perfil de expresión de genes teloméricos (complejo shelterina), se estudió la actividad transcripcional de los genes responsables del mantenimiento telomérico. Para ello, se empleó la técnica de PCR en tiempo real en un modelo murino de inducción tumoral. Nuestros datos indican una disminución significativa de la actividad transcripcional en 2 de los 6 genes integrantes del complejo telomérico en mamíferos (trf1 y rap1). Esta alteración en la expresión de los mismos, podría considerarse como un posible marcador de inestabilidad genómica en melanoma murino. De este modo, mediante el desarrollo de la presente Tesis Doctoral, se lograron aportes significativos en relación a la inestabilidad telomérica existente a largo plazo a nivel telomérico, en células de mamífero (rata) expuestas in vitro a antibióticos antitumorales y la inestabilidad telomérica presente en un modelo in vivo de inducción tumoral (melanoma murino).

Durante el período comprendido entre noviembre de 1981 y mayo de 1984 (31 meses), se realizaron 1987 necropsias de visones mayores de un mes de edad, provenientes de 4 criaderos de la Provincia de Buenos Aires. Las enfermedades se determinaron mediante el estudio de las lesiones anatomopatológicas macro y microscópicas, los análisis complementarios e historias clínicas de cada caso. De los 1987 casos estudiados, 672 (33,8 por ciento) correspondieron a animales con lesiones de Plasmacitosis viral, 273 (13,7 por ciento) a pleuritis purulenta, 261 (13,1 por ciento) a procesos patológicos de localización hepática, 199 (10 por ciento) a urolitiasis, 160 (8 por ciento) a neumonía hemorrágica, 94 (4,7 por ciento) a tuberculosis y 327 (16,4 por ciento) a otras enfermedades.

Made available in DSpace on 2013-08-07T18:41:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000426061-Texto+Completo-0.pdf: 815660 bytes, checksum: a63907607c66f42025ef148afc7c6471 (MD5) Previous issue date: 2010 / The neurotrophic factor known as BDNF has attracted considerable attention in the scientific literature, due to its involvment in critical processes related to the development and regulation of the nervous system. However, many aspects of this molecule are still unknown, while others have only been investigated in humans and model organisms. In this context, bioinformatic tools can be very useful to perform comparative analyses focusing on evolutionary, structural and functional aspects of this protein. This study aimed to characterize the patterns of conservation and variability in this molecule through the comparison of coding sequences in different mammalian lineages, as well as to investigate structural aspects by constructing a novel 3D model of a BDNF homodimer that is consistent with experimentally validated data. Our results revealed very interesting patterns of conservation and variability in different lineages, including strong evidence for the occurrence of negative natural selection (indicating constraints to evolutionary change implying functional relevance) in both the mature and the pro domains. In addition, we observed evidence of positive selection (induction of changes that are likely adaptive) in different lineages, in every case directly affecting the pro domain. These results indicate that the pro domain presents great functional relevance, and highlight the importance of focusing research efforts on this portion of BDNF. / O fator neurotrófico conhecido como BDNF tem atraído considerável atenção na literatura científica, pelo seu envolvimento em processos cruciais de desenvolvimento e regulação do sistema nervoso. Entretanto, muitos aspectos desta molécula são ainda desconhecidos, enquanto outros foram investigados apenas em humanos e organismos-modelo. Neste contexto, ferramentas de bioinformática podem ser muito úteis para realizar análises comparativas enfocando aspectos evolutivos, estruturais e funcionais. Este projeto objetivou uma caracterização de padrões de conservação e variação desta molécula através da comparação das seqüências codificantes deste gene em diferentes linhagens de mamíferos, assim como uma investigação de aspectos estruturais através da construção de um modelo 3D do BDNF consistente com dados experimentais. Os resultados revelam padrões bastante interessantes de conservação e variação de sequência em diferentes linhagens, incluindo fortes evidências da ocorrência de seleção natural negativa (indicando restrição à mudança devido à relevância funcional) tanto no domínio maduro como no domínio pro. Além disso, observou-se evidência de seleção positiva (indução de mudanças possivelmente adaptativas) em diferentes linhagens, em todos os casos afetando diretamente o domínio pro. Estes resultados indicam que o domínio pro apresenta grande relevância funcional, e salientam a importância de focar esforços de investigação experimental nesta porção do BDNF.