L'objectif que nous visions dans notre recherche était l'étude de la structure anatomique du Gmelina arborea, ainsi que la nature et la périodicité des cernes en première instance, et ensuite l'étude de l'influence de l'âge, des conditions climatiques et des traitements sur la largeur des cernes au Mali. Pour cela, nous avons pris un total de 37 arbres venant de sites différents (Monts Mandingues, Faya, Farako) et nous avons prélevé des rondelles sur ces arbres. Ensuite, par des examens macroscopiques et microscopiques, nous avons essayé un repérage et un comptage des cernes. Nous avons trouvé que le Gmelina arborea forme des cernes annuels, entre autre des particularités présentant des difficultés d'interprétation. Parmi celles-ci, les cernes des premières années que nous avons appelés "pseudo-cernes", les faux-cernes, les cernes accidentels ou traumatiques, les cernes incomplets, les cernes étroits, et rarement, les veines colorées. Les cernes annuels ne présentent pas la structure de bois initial et bois final à une observation macroscopique, bien qu'au point de vue microscopique, on puisse observer parfois des différences d'épaisseur des parois des fibres. Les cernes annuels sont beaucoup mieux visibles dans les Gemlina des Monts Mandingues et de la Faya que ceux de Farako qui présentent des cernes beaucoup plus onduleux dans les dernières années qui ont précédé l'abattage des arbres. En général, les cernes ont une largeur très variable en suivant la circonférence de l'arbre. Nous avons trouvé que c'est la courbe polynomiale de la forme: y = A₀ + A₁/ x +A₂ x (où x est l'âge de l'arbre, y la largeur de cerne correspondante, A₀, A₁ et A₂ des coefficients) qui convient le mieux comme courbe de fonction de croissance biologique du Gmelina au Mali. Le site a une influence sur la largeur des cernes, et nous avons constaté que la croissance était meilleure aux Monts Mandingues et à la Faya qu'à Farako; alors que la pluviométrie de la région de Sikasso (où se trouve la plantation de Farako) est nettement supérieure à celle de la région de Bamako. On a essayé d'interpréter ce phénomène par la dégradation des sols, la concurrence de la végétation arbustive, la vigueur de la strate graminéenne et le moindre entretien des plantations à Farako. Nous avons essayé d'étudier l'influence des différents facteurs climatiques sur la largeur des cernes; ceci nous a donné 36% de coïncidence avec la pluviométrie et 18% avec l'humidité relative aux Monts Mandingues, 55% avec la pluviométrie de la Faya, alors qu'à Farako, nous avons eu 57% pour la pluviométrie et 29% pour l'humidité relative. Il convient cependant de souligner ici l'éloignement des stations de relevés météorologiques qui doit avoir son influence. Nous pensions trouver des largeurs plus faibles pour les années correspondantes de la période de sécheresse du Sahel; tel n'a pas été le cas, ce qui pourrait agréer davantage l'hypothèse qui veut que le rythme de croissance soit commandé plus par des causes génétiques. Le traitement par éclaircie a également une influence sur la largeur des cernes annuels. Dans le cas des Monts Mandingues, il apparaît que le taux optimum est de 50% puisqu'il donne des largeurs de cernes supérieures à celles du taux de 75%. De plus, il semble que l'effet de l'éclaircie sur la largeur des cernes ne dura pas plus de 7 années. Compte tenu des valeurs que nous avons obtenues et de l'importance de l'estimation de la largeur moyenne des cernes, nous pensons qu'il serait d'un grand intérêt de tenir compte de l'orientation dans la mesure des cernes. Ainsi, on pourrait mesurer des largeurs sur une orientation donnée et les utiliser pour les analyses.

Les graines de l'Anogeissus leiocarpus ayant un très faible taux de germination, des essais ont été effectués au Mali afin de vérifier le potentiel d'enracinement des boutures de cette espèce. Vingt plants mères situés à Sho et à Katibougou ont été choisis et 20 boutures par plant ont été prélevées à quatre reprises au cours de l'année. Il s'agissait de boutures semi-herbacées et semi-ligneuses pour les deux premiers prélèvements et de boutures ligneuses pour les deux autres. La base des boutures a été trempée dans une solution auxinique contenant 0, 1 000, 2 500 et 5 000 ppm d'AIB (acide indole butyrique) pour les deux premiers prélèvements, et dans une solution contenant 0, 2 500, 5 000 et 10 000 ppm d'AIB pour les deux autres. Elles ont ensuite été piquées dans un terreau et placées à l'extérieur dans une enceinte rudimentaire humide, protégée des radiations solaires et du vent. L'enracinement des boutures a été observé et mesuré après quatre mois. Un petit nombre de boutures prélevées en novembre et en mars se sont enracinées. Ces données montrent tout de même que les boutures de l'Anogeissus leiocarpus possèdent un certain potentiel à s'enraciner. Il faudra, toutefois, mettre en place d'autres essais pour préciser avec soin les conditions les plus favorables au processus d'enracinement.

Cette thèse étudie l’état des victimations et du climat dans les collèges maliens et l’articulation de ces victimations au climat scolaire, cela dans la perspective d’une comparaison internationale avec des collèges français de zones d’éducation prioritaires. La comparaison internationale est ici convoquée pour un approfondissement de la mise en critique des collèges maliens au prisme des collèges français. Par une association des approches quantitative et qualitative cette recherche procède à l’étude des victimations et du climat scolaires en mesurant à la fois les expériences victimaires des acteurs de l’école, leur regard de l’institution scolaire et de leurs interactions sociales à l’école. La réalité sociale des victimations et du climat scolaires est ainsi décryptée à travers une affirmation du rôle déterminant des sens et significations produits par les acteurs de l’école. Notre recherche montre une articulation particulière des victimations au climat scolaire dans les écoles maliennes, une réalité qui s’oppose à celle des collèges français étudiés et qui contredit la constance révélée par les études européennes, à savoir la dégradation du climat scolaire proportionnellement à l’importance de la prévalence de violences scolaires. L’articulation paradoxale du climat et des victimations caractérisant les collèges maliens montre à la fois le poids du contexte dans l’étude des dynamiques sociales à l’école et la relativité du phénomène de la violence en milieu scolaire. / This thesis studies the state of victimations and climate in Malian colleges and the articulation of these victimations to the school climate with regard to international comparison with French colleges of priority education areas.The international comparison is hereby invoked in order to further the criticism of Malian colleges in light of French colleges.Through an association of quantitative and qualitative approaches, this research procedes with the study of school victimations and climate by measuring both the victimation experience of school actors, their opinion of the school institution and their social interactions at school. The social reality of the school victimations and climate is thus decripted through an affirmation of the key role of senses and significations produced by the school actors.Our research shows a particular articulation of victimations to school climate in Malian schools , a fact that is contrary to the surveyed French schools and which contradicts the constancy revealed by European studies, that is to say the deterioration of the school climate with respect to the importance of the prevalence of school violences.The paradoxical articulation of the climate and victimations which characterizes Malian colleges shows both the burden of the contexte in the study of social dynamics at school and the relativity of the phenomenon of violence in school environment.

La mortalité maternelle et périnatale est un problème majeur de santé publique dans les pays en développement. Elle illustre l’écart important entre les pays développés et les pays en développement. Les interventions techniques pour améliorer la santé maternelle et périnatale sont connues dans les pays en développement, mais ce sont la faiblesse des systèmes de santé et les défis liés aux ressources qui freinent leur généralisation. L’objectif principal de ce travail était de mieux comprendre le rôle des ressources humaines en particulier ceux de la première ligne dans la performance d’un système de référence maternelle. Au Mali, la mise en place d’un système de référence maternelle, système de référence-évacuation « SRE », fait partie des mesures nationales de lutte contre la mortalité maternelle et périnatale. Les trois composantes du SRE, soit les caisses de solidarité, le transport et la communication et la mise à niveau des soins obstétricaux, permettent une action simultanée du côté de la demande et de l’offre de soins maternels et périnatals. Néanmoins, la pénurie de personnel qualifié a conduit à des compromis sur la qualification du personnel dans l’implantation de ce système. La région de Kayes, première région administrative du Mali, est une région de forte émigration. Elle dispose d’une offre de soins plus diversifiée qu’ailleurs au Mali, grâce à l’appui des Maliens de l’extérieur. Son SRE offre ainsi un terrain d’études adéquat pour l’analyse du rôle des professionnels de première ligne. De façon plus spécifique, ce travail avait pour objectifs 1) d’identifier les caractéristiques des équipes de soins de première ligne qui sont associées à une meilleure performance du SRE en termes de survie simultanée de la mère et du nouveau-né et 2) d’approfondir la compréhension des pratiques de gestion des ressources humaines, susceptibles d’expliquer les variations de la performance du SRE de Kayes. Pour atteindre ces objectifs, nous avons, à partir du cadre de référence de Michie et West modélisé les facteurs liés aux ressources humaines qui ont une influence potentielle sur la performance du SRE de Kayes. L’exploration des variations du processus motivationnel a été faite à partir de la théorie de l’attente de Vroom. Nous avons ensuite combiné une revue de la littérature et un devis de recherche mixte (quantitative et qualitative). Les données pour les analyses quantitatives proviennent d’un système d’enregistrement continu de toutes les urgences obstétricales (GESYRE : Gestion du Système de Référence Évacuation mis en place depuis 2004 dans le cadre du suivi et de l’évaluation du SRE de Kayes) et des enquêtes à passages répétés sur les données administratives et du personnel des centres de santé. Un modèle de régression biprobit a permis d’évaluer les effets du niveau d’entrée dans le SRE et des équipes de soins sur la survie jointe de la mère et du nouveau-né. A l’aide d’entrevues semi-structurées et d’observations, nous avons exploré les pratiques de gestion des personnes dans des centres de santé communautaires « CScom » sélectionnés par un échantillonnage raisonné. Les résultats de ce travail ont confirmé que la main d’œuvre humaine demeure cruciale pour la performance du SRE. Les professionnels de première ligne ont influencé la survie des femmes et des nouveau-nés, à morbidités égales, et lorsque la distance parcourue est prise en compte. La meilleure survie de la mère et du nouveau-né est retrouvée dans les cas d’accès direct à l’hôpital régional. Les femmes qui sont évacuées des centres de première ligne où il y a plus de professionnels ou un personnel plus qualifié avaient un meilleur pronostic materno-fœtal que celles qui ont consulté dans des centres qui disposent de personnel peu qualifié. Dans les centres de première ligne dirigés par un médecin, des variations favorables à la performance comme une implication directe des médecins dans les soins, un environnement de soins concurrentiel ont été retrouvés. Concernant les pratiques de gestion dans les centres de première ligne, les chefs de poste ont mis en place des incitatifs pour motiver le personnel à plus de performance. Le processus motivationnel demeure toutefois très complexe et variable. La désirabilité de bons résultats des soins (valence) est élevée pour tous les professionnels ; cependant les motifs étaient différents entre les catégories de personnel. Par ailleurs, le faible niveau d’équipements et la multiplicité des acteurs ont empêché l’établissement d’un lien entre l’effort fourni par les professionnels et les résultats de soins. Cette compréhension du rôle des professionnels de première ligne pourra aider le personnel administratif à mieux cibler le monitorage de la performance du SRE. Le personnel de soins pourra s’en servir pour reconnaitre et appliquer les pratiques associées à une bonne performance. Dans le domaine de la recherche, les défis de recherche ultérieurs sur les facteurs humains de la performance du SRE seront mieux identifiés. / Although proven effective interventions have been transferred from the developed world, developing countries still face high maternal and perinatal deaths. Weak health systems and human resources crisis hinder the scaling up of those interventions. This study is aimed at improving the understanding of the role of human resources, especially the first line staff in a maternal referral system, the evacuation and referral system (ERS) of Kayes (Mali). The implantation of the ERS as part of major strategies for fighting maternal and perinatal deaths has been generalised in Mali’s eight administrative regions. The ERS main components are: upgrading of emergency obstetric care (EmOC); funding by a solidarity fund; and improving transport and communication by ambulance. These components allows for joint action regarding the supply and the use of maternal and perinatal services. Yet, due to the shortages in skilled birth attendants, the extension of the coverage in emergency obstetric services has been made with less qualified staff. Kayes is Mali’s first administrative region and a cradle of emigration. It therefore offers, with the support of its immigrants, a more diversified primary care provision than elsewhere in Mali. This gives an opportunity of studying the role of primary care staff in the ERS performance. More precisely, the objectives of this research were to: 1 identify characteristics of primary care teams that influenced the ERS performance assessed by the joint mother-child survival and 2) improve the understanding of human resources practices associated with ERS performance. We combined a systematic literature review with a mixed quantitative and qualitative research design. Kayes ERS performance was modelised using Michie and West conceptual framework and the motivational process was explored with Vroom’s expectancy theory. Data for the quantitative analyses derived from an ongoing system of registering all obstetric emergencies implemented since 2004 (GESYRE: Gestion du Système de Référence Évacuation / Management of the Evacuation Referral System) and periodic surveys. A biprobit regression model has been fitted to estimate the effects of the point of entry in the ERS and the primary care team composition on the joint mother-newborn survival. We also conducted semi structured interviews and non participant observations in order to explore human resources practices in purposely selected community health centers. This research confirmed the importance of human resources in ERS performance. When women’ individual risk factors are controlled for, there is a combined effect of distance traveled and the point of entry in the ERS on one side and the community health centers staff on the other hand, on the mother-child joint survival. The best prognosis of care was found in women who directly accessed care at the regional hospital. Having been transferred from a community health center where there is a physician or more than three professionals increased the mother-child survival probability. Physicians in community health centers develop strategies for a better performance of the health centers they managed: direct implication in care and a competitive care environment. Primary care managers set up incentives to motivate staff. The motivation process remains however a variable and complex one. The desirability of good results was common for all staff though its motivations varied according to the type of staff. Besides, due to insufficiency of material and multiples intermediate factors, perception of a linkage between effort and result was low. This increased understanding of the role of primary care human resources in the ERS performance would focus the management of ERS performance on targeted but effective interventions. The workforce could benefit from the study conclusions in identifying and applying best practices. Further research challenges would also be more precisely identified.

On ne peut combattre sérieusement les difficultés économiques que connaît le Mali sans une prise en compte des paramètres socioculturels des bénéficiaires des différents projets de développement car ceux-ci ont en eux des acquis qui peuvent être des facteurs déclencheurs ou des freins à tout processus de développement local. L’humanitaire est à la croisée de la générosité de ses membres et de l’insuffisance de l’action politique dans un pays. Le Mali ne saurait être à la marge et se trouver dans une situation socioéconomique et politique qui requiert des appuis extérieurs pour résoudre ses différents problèmes existentiels et conjoncturels. Dans ce contexte, les ONG sont devenues les opérateurs du développement, quasiment à la place de l’Etat au Mali. Les résultats de cette situation paraissent mitigés ; d’où le sentiment d’une grande dépense d'énergie pour des maigres résultats ? Pourquoi, nous Maliens avons du mal à nous approprier la notion de développement (économique et social) ?Dans la situation actuelle, nous sommes face à des difficultés pour comprendre les questions de développement, pendant que les ONG et leurs partenaires étrangers agissent, et définissent leurs actions à partir de points de vue stéréotypés. Le Mali a subi des influences extérieures depuis la colonisation (colonialisme sous influence française, socialisme sous influence chinoise, libéralisme sous influence de la Banque mondiale et des institutions internationales comme le FMI) qui l’ont empêché de concevoir un modèle de développement propre à lui, adapté à son cadre de références culturelles. Ces facteurs évoqués ci-dessus ajoutés à ceux environnemental et climatique entretiennent les populations dans un état de pauvreté et classe le Mali selon l’indice de développement humain des nations unies 2012 au 175ème rang sur 182, au niveau mondial, malgré les ressources dont il dispose. Les données de la banque mondiale indiquent que le revenu brut national par habitant est de 649 us $ soit 616 euros. La pauvreté se mesure par deux dimensions : pauvreté matérielle et pauvreté en termes de relations sociales. Autrefois comme aujourd’hui (cf. rapport du PNUD du 3 au 4 juin 1999) tous les observateurs extérieurs sont frappés par la richesse des relations sociales entre personnes au Mali. Cette situation favorise l’intervention des ONG et leur permet de réaliser des actions concrètes (infrastructures, appui conseil) qui manquent cruellement aux populations. Cependant, dans leur intervention, elles ne prennent pas assez en compte la complexité des schémas socioculturels, leur incidence et surtout la question de l’appropriation des réalisations par les habitants et de leur cadre social ; elles finissent souvent par être rejetées car étant en contradiction avec ce cadre. Ainsi, le processus de développement au Mali peut être freiné par le poids important de la culture. Au Mali, la socialisation des enfants se déroule en 3 étapes de 0 à 16 ans. Son contenu réfère à une vision de l’homme dans la culture malienne qui diffère en partie selon les spécificités des différents groupes d’appartenance. Elle tend à produire in fine un individu en partie libre, en partie inscrit dans un corps social où il doit jouer le rôle qui lui a été assigné. Devenir adulte, c’est prendre sa place dans la famille rapprochée, dans sa famille élargie, dans son village, son peuple d’appartenance, selon des critères culturels complexes et précis. Ces paramètres constituent des cadres qui s’imposent à l’individu malien lorsqu’il participe à des initiatives de développement. S’il tente d’élever son niveau scolaire, d’améliorer sa situation économique, c’est pour mieux jouer son rôle dans un cadre « traditionnel », entre contrainte et liberté. Or souvent, quand les ONG interviennent dans le champ de l’éducation ou du développement local, elles n’ont pas en tête les subtilités de la socialisation des enfants et ses interactions possibles avec le parcours scolaire.... / The economic difficulties faced by Mali can't be seriously combatted without taking into account socio-cultural parameters of beneficiaries of development projects because they have achievements that can be triggering factors or obstacles to any process of local development.Humanitarian aid is at the crossroads of the generosity of its members and the lack of political action in a country. Mali can't be at the margin and find itself in a socio-economic and political situation that requires outside support to resolve its various existential and economic issues.In this context, NGOs have become the operators of development, almost instead of the State in Mali.The results of this situation seem mixed; hence the feeling of a great deal of energy for poor results? Why do Malians have difficulties in taking over the concept of development (economic and social)?In the current situation, we are facing difficulties to understand development issues, while NGOs and their foreign partners act and define their actions from stereotyped views.Mali has been influenced externally since colonialism (colonialism under French influence, socialism under Chinese influence, liberalism under the influence of the World Bank and international institutions such as the IMF), which prevented it from conceiving a specific development model according to its cultural references.These factors, combined with environmental and climatic factors, keep populations in a state of poverty and classify Mali according to the United Nations Human Development Index 2012 to 175th out of 182 world levels, despite the available resources. According to the same source, data from the World Bank indicate that the national gross income per capita is US $ 649 or 616 euros. Poverty is defined by two dimensions: material poverty and poverty in terms of social relations. Formerly as today (see UNDP report from 3 to 4 June 1999), all external observers are struck by the rich social relationships between people in Mali.This fertile ground encourages the intervention of NGOs and allows them to carry out concrete actions (infrastructures, advisory support) badly needed by the populations. However, in their intervention, they do not often take into account the complexity of socio-cultural models, their impact and, above all, the appropriation of achievements by the inhabitants which are often rejected because they don't stick with their social context.Thus, the development process in Mali may be hampered by the heavy weight of the culture.The socialization of children takes place in 3 steps from 0 to 16 years. Its content refers to the vision of a human in the Malian culture, but differs in part according to the specificities of the group of belonging. It ultimately produces an individual who is partly free, partly enrolled in a social body in which he must play the role assigned to him. Becoming an adult means taking his place in the close family, in his extended family, in his village, his people of belonging, according to complex and precise cultural criteria.These are the parameters that make up the models imposed on the Malian individual while participating in development initiatives. If he tries to improve his educational level, to improve his economic situation, the goal is to play a better role in a "traditional" setting, between determinism and freedom.But often, when NGOs intervene in education or local development, they do not have in mind the subtleties of socialization of children and the possible interactions with the school course.In other words, when they promote economic projects, they remain unrelated to the questions regarding who is locally in charge of these projects (depending on the place of each other in the social and family order).The Malian individual himself is not in a position to overcome this context, to stand back to analyze it and modify it.

Cette recherche analyse la dimension sociale de la mobilité pour études des Maliens en France et au Maroc. Face à un système d'enseignement supérieur à l'offre pédagogique et aux capacités d'accueil limitées, nombre d'étudiants maliens voient en la mobilité une échappatoire. En outre, ceux qui partent perpétuent une pratique de formation à l'étranger consubstantielle à la formation des élites maliennes au XXe siècle. Des acteurs institutionnels facilitent la mobilité étudiante. L'État, d'une part, à travers les bourses de mérite qu'il met en place, et par les nouveaux établissements privés, au Maroc notamment, qui adaptent leur offre de formation à la demande provenant des pays d'Afrique subsaharienne. Nous questionnons la manière dont la mobilité géographique participe d'une stratégie de mobilité sociale, puis démontrons comment les inégalités du champ scolaire malien, fondées sur les disparités de capitaux économique, culturel et social, façonnent les inégalités d'accès à la mobilité. Toutefois, ces dernières sont contournées par la mobilisation des « liens faibles », dont la parenté élargie, par les étudiants socialement défavorisés. Le rôle de ces réseaux apparaît crucial dans la mobilité pour études, comme l'attestent les parcours des étudiants défavorisés dont la réussite professionnelle et sociale est souvent comparable à celle des étudiants issus des élites politiques, économiques et religieuses. Les trajectoires d'insertion professionnelle des diplômés maliens de France et du Maroc mettent enfin en évidence le rôle clé de la mobilité internationale pour études supérieures, en complément de la scolarité au Mali : gage d'un accès au statut d'élite, au Mali, pour le plus grand nombre, une telle mobilité internationale apparaît comme un facteur de transformation des hiérarchies sociales. / This PhD research analyzes the social dimension of Malian students' mobility in French and Moroccan higher education. Confronted with a higher education system with limited capacity, many Malian students perceive mobility as a loophole. These students going abroad perpetuate a tradition of mobility consubstantial with the training of Malian elites in the twentieth century. This mobility is encouraged by the state through cooperation exchanges, as well as private educational institutions particularly in Morocco, that adapt their educational options and services to the demands of sub-Saharan countries. We interrogate how geographical mobility is part of a social mobility strategy and then demonstrate how inequalities in the Malian school system, based on disparities in economic, cultural and social capital, shape inequalities in access to mobility. However, these inequalities are overcome by the mobilization of "weak ties", including extended kinship, by socially disadvantaged students. Social capital plays a crucial role in achieving success through mobility, where students from disadvantaged families succeed as much as those from elite families with politico-economic and religious clout. The career paths of Malian graduates from France and Morocco finally highlight the key role of international mobility for higher education, in addition to schooling in Mali: a guarantee of access to elite status in Mali, for the greater number. Consequently, international mobility appears as a factor in the transformation of social hierarchies.

La bactériose vasculaire du riz (BLB) et à stries foliaires (BLS) causées respectivement par Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) et X. oryzae pv. oryzicola (Xoc) sont deux maladies émergentes en Afrique de l'Ouest, suite à l'expansion de la culture du riz et à l'introduction de variétés à haut rendement au cours de ces dernières décennies. Trois nouvelles races de Xoo ont été caractérisées en Afrique dont on a montré, sur la base d'une analyse génétique, leur spécificité africaine. En revanche, une étude réalisée sur une dizaine de souches de Xoc isolées au Mali en 2003, démontre qu'elles sont apparentées à des souches de Xoc asiatiques. En Asie, plusieurs gènes de résistance à Xoo ont été identifiés et déployés dans les programmes de lutte contre BLB. Cependant aucun gène de résistance à Xoc n'a été encore identifié chez le riz. Les objectifs de notre étude étaient (i): d'implémenter les collections de souches de Xoo et Xoc Africaines disponibles mais incomplètes, à l'aide de nouvelles campagnes d'échantillonage réalisées de 2009 à 2012 dans différentes zones agroécologiques du Burkina Faso et du Mali, (ii) de déterminer la diversité génétique de ces souches, (iii) d'identifier et caractériser de nouvelles sources de résistance contre BLB et BLS au sein d'accessions de riz cultivées au Burkina Faso. Nos résultats ont montré que les souches africaines de Xoc sont hautement variables tant d'un point de vue génétique que du pouvoir pathogène. L'analyse par PCR de deux effecteurs de types III conservés (xopAJ et xopW) permet de différencier les souches de Xoc en deux groupes, xopAJ étant absent dans la majorité des souches et une insertion de 1050 bp étant détectée dans la séquence codante de xopW de certaines souches. Néanmoins, il apparait que la forte diversité génétique des Xoc n'est pas corrélée à leur origine géographique, ni à la période de collecte, ou à la nature de l'hôte. Les souches de Xoo caractérisées appartiennent toutes à la race A1 qui n'avait pas encore été signalée au Mali. Au regard de la diversité des souches et de leur évolution, il est important d'envisager un plan de surveillance épidémiologique à plus large échelle des populations de Xo dans les régions concernées en Afrique de l'Ouest. Enfin, nous avons montré que certaines variétés de riz cultivées au Burkina Faso présentent un phénotype de résistance spécifique des souches africaines de Xoo et ce, à tous les stades de développement de la plante. Ces données originales contrastent par rapport au phénotype des lignées de riz résistantes de référence (Xa4, xa5 et Xa7 efficaces uniquement au stade de tallage maximum). Eu égard à l'absence de gènes de résistance dans le riz efficaces contre Xoc, ces variétés qui constituent également une source de résistance efficaces contre la diversité des souches de Xoc africaines, offrent potentiellement un nouveau moyen pour assurer le contrôle du BLS au Burkina Faso et éventuellement dans d'autres pays Africains. / Bacterial Leaf Blight (BLB) and Bacterial Leaf Streak (BLS) diseases respectively caused by Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) and X. oryzae. pv oryzicola (Xoc) are two emerging diseases of rice in West Africa, due to the recent expansion of rice cultivation and introduction of improved rice varieties over the last decade. Three news Xoo races were characterized based on genetic analysis, demonstrating their african specificity. In contrast, a study achevied on about ten Xoc strains isolated in Mali in 2003, show that they are related to asian Xoc strains. In Asia, several R genes against Xoo have been identified and deployed in breeding program to control BLB. In contrast, no R gene against Xoc has been identified in rice. The objectives of this PhD thesis are to (i) complete the Xo collections of African isolates upon annual sampling operated from 2009 to 2012 in various agroecological areas of Burkina Faso and Mali, (ii) determine the genetic diversity of these strains , (iii) identify and characterize news sources of resistance genes to BLB and BLS within rice accessions cultivated in Burkina Faso.Our results showed that african Xoc are highly diverse genetically and phenotypically. PCR-based analyse of two conserved type III effector gene (xopAJ and xopW) differentiated two groups of Xoc strains, with xopAJ not detected in a majority of African Xoc strains and 1050 bp insertion detected in xopW gene for few strains. However, the high genetic diversity observed among the Xoc strains is not correlated to geographical origin, sampling data or host plant species. Xoo strains characterized belong all to race A1 previously reported by Gonzalez et al. (2007) in Burkina Faso. Given the diversity of X. oryzae strains and their evolution, it is essential to establish a large scale epidemiological monitoring of Xo populations in concerned regions in west Africa.At last, some accessions cultivated in Burkina Faso showed specific resistance to african Xoo strains at all plant development stages. These original data contrast with rice lines carring Xa4, xa5 and Xa7 resistance genes against BLB, which are only effective at maximun tillering stage.Given no sources of effective resistance genes against BLS is available in rice, these accessions which were also efficient against a set of Xoc strains representative of the diversity in Africa, represent a huge potential source for the control of BLS in Burkina Faso, and eventually in others african countries.

Le paludisme est l’une des maladies infectieuses la plus fréquente au monde avec 40% de la population mondiale exposée. En dépit des stratégies actuelles de lutte notamment la prise en charge rapide des cas, l’utilisation de matériaux imprégnés et la pulvérisation intra domiciliaire d’insecticide, le paludisme reste une des premières causes de morbidité et de mortalité notamment en Afrique subsaharienne. Cette partie du monde totalise à elle seule plus de 90% des cas de décès par paludisme dont 88% chez les enfants de moins de moins de 5 ans. En absence de vaccin utilisable en santé publique, il y a donc un besoin urgent de trouver une stratégie efficiente et simple de contrôle du paludisme. Le traitement préventif intermittent (TPI) définie comme l’administration d’un antipaludique à dose curative à des intervalles de temps prédéfinis réduit l’incidence du paludisme et apparaît aujourd’hui comme une des stratégies les plus prometteuses. Cette stratégie couplée au Programme Elargi de Vaccination (PEV) chez les enfants de moins de 1 an réduit l’incidence du paludisme de 30%. Des résultats plus importants sont obtenus chez les enfants de 0 à 5 ans voire de 0 à 10 ans lorsque la stratégie est appliquée en ciblant la saison de transmission. Nos travaux de recherche au Mali ont porté sur :- l’impact de la mise en œuvre du TPI couplé à la vaccination du PEV (TPin) sur i) la résistance P. falciparum à la Sulfadoxine pyrimethamine (SP), ii) la couverture des vaccins du PEV, iii) le taux de mortalité des enfants âgés de 4 à 18 mois.- l’efficacité du TPI chez les enfants ciblant la saison de transmission (TPIe) dans un contexte de faible et de forte couverture en des Moustiquaires Imprégnés d’Insecticides (MII). Nos résultats ont montré qu’après une année de mise en œuvre à l’échelle du district sanitaire, le TPIn a entrainé une augmentation de la couverture des vaccins du PEV. Cette couverture était de 53% en zone de non-intervention contre 69.5% en zone d’intervention (p<0.01). Il y a eu une réduction de la mortalité globale de 27% (RR= 0,73, IC95% : 0,55-0,97, p=0,029) chez les enfants âgés de 4 à 18 mois. Les fréquences des marqueurs moléculaires de la résistance de P. falciparum à SP en début et en fin la mise en œuvre et entre la zone d’intervention et la zone de non –intervention après une année de mise en œuvre étaient similaires. Deux doses de SP données en TPI à 8 semaines d’ intervalle durant la saison de transmission réduit le taux d’incidence du paludisme pendant la saison de transmission de 69,4% chez les enfants de moins de 5 ans et de 63,4% chez les enfants de 5-10 ans dans un contexte de très faible utilisation de MII (<5%). Dans une autre étude que nous avons menée, le TPI avec SP + Amodiaquine (AQ) donné en 3 occasions à un mois d’ intervalle pendant la saison de transmission a réduit le taux d’ incidence du paludisme clinique non compliqué de 82% (IC à 95%: 78%– 85%; P<0.001) et les formes graves de paludisme de 87% (IC à 95% 42% – 99%, P=0.001) chez les enfants âgés de 3 à 59 mois en dépit un taux d’utilisation des MII de plus de 99%. Nous n’avons pas documenté d’événement indésirable grave lié à l’utilisation de la SP ou de la SP + AQ en TPI durant ces deux études. Nos résultats étayent la recommandation du TPI, ciblant la saison de transmission ou couplée au PEV, pour la lutte antipaludique chez les enfants. / Malaria is one of the most common infectious diseases in the world and 40% of the world population is exposed to malaria. Despite the current control strategies such as rapid diagnosis and treatment of disease cases, use of insecticide impregnated materials and indoor residuals spraying with insecticides, malaria remained a main cause of morbidity and mortality particularly in sub Saharan Africa. More than 90% of the deaths due to malaria occurred in this region and 88% of these deaths occurred in children aged less than 5 years of age. In absence of vaccine that can be used in public health, there is an urgent need for a simple and efficient control strategy. Malaria intermittent preventive treatment (IPT) defined as the administration of curative dose of anti-malarial drug at predefined time intervals, appears as one of the most promising strategies. Given through the Expanded Program of Immunization (EPI), the strategy reduced the incidence of malaria by 30%. More drastic reductions were obtained in children aged 0-5 years and even 0-10 years when the malaria transmission season was targeted for the administration of the strategy. Our research work in Mali has assessed the following:- The impact of implementation of IPT administrated through EPI (IPTi) on: i) the resistance of P. falciparum to Sulfadoxine pyrimethamine (SP); ii) EPI vaccine coverage, and iii) mortality of children of 4-18 months of age. - The efficacy of IPT in children targeting the malaria transmission season (IPTe) in a context of low and high coverage of insecticide impregnated nets (ITN).We have found that the implementation of IPTi at the district level has resulted in an augmentation of the EPI vaccine coverage. The EPI vaccine coverage was 53% in the non-intervention zone compared to 69.5% in the intervention zone (p<0,01). There was a reduction in all cause mortality of 27% (RR= 0.73, 95% CI : 0.55-0.97, p=0.029) in children aged 4-18 months. The frequencies of molecular markers of the resistance of P. falciparum to SP were similar at the beginning and the end of the one year implementation period and between the intervention and non-intervention zones.Two doses of SP given at 8 weeks interval during the transmission season, reduced the incidence of malaria episodes during the transmission season by 69.4% in children aged less than 5 years and by 63.4% in children aged 5-10 years in a context of very low ITN use (<5%). In another study that we have conducted, IPT with SP + Amodiaquine (AQ) given at three occasions at one month interval during the transmission season reduced the incidence rate of clinical malaria by 82% (95% CI: 78%– 85%; P<0.001), and the incidence of severe and complicated malaria by 87% (95% IC 42% – 99%, P=0.001) in children aged 3 to 59 months of age despite an ITN use of greater than 99%.There was no serious adverse event related to the use of SP or SP+AQ in IPT during the two studies. Our results support the recommendation of IPT targeting the transmission season and IPT given through the EPI for malaria control in children.

I följande essä, Konstens olika horisonter – ett möte med bildkonst från Senegal, Mali och Mocambique, diskuterar jag rollen som gallerist och curator i mötet med det som är okänt och främmande i konsten. I essän refereras till möten med konst och konstnärer från Senegal, Mali och Mocambique. Texten utgår dels från mina upplevelser på konstbiennalen i Dakar, dels från arbetet med två olika utställningar på Galleri Flach i Stockholm. Med utgångspunkt i min roll som kurator reflekterar jag över situationer när konstens sammanhang framstår som främmande och okända. Hur bemöter jag situationen? Vad ser jag i den och vad bidrar den med i mitt kuratoriska arbete i gallerirummet? Med stöd bland annat i hermeneutiken och filosofer som Hans-Georg Gadamer och Marcia Sa Cavalcante Schuback, beskrivs en bildningsprocess i vilken jag reflekterar över det geografiska och kulturella avståndet. I texten diskuteras också ett så kallat hermeneutiska mellanrum som uppstår i skarven mellan det välkända och det främmande. Diskussionen införlivar även tankar om hur normer i den västerländska konsthistorien påverkar mitt möte med konsten och vad jag uppfattar som konstnärlig kvalitet. I essän konstateras att mina möten och konfrontationer med det som är okänt i konsten, är betydelsefullt. Det påbörjar en process mot ny kunskap i vilken jag tydligare får syn på mig själv och mina medvetna och omedvetna föreställningar. I texten beskrivs hur jag i gallerirummet prövar mina reflektioner i praktiken i en dialog med mig själv och de konstnärer med vilka jag samarbetar. Jag betonar dialogens och den inre reflektionens betydelse för utställningens tillblivelse. Utställningen blir ett mellanrum, ett begränsat sammanhang, där dialogen och reflektionen tar form. / The following essay, Different horizons - Encounters in visual arts from Senegal, Mali and Mozambique, discusses how to encounter what is unknown and unfamiliar within art in my role as a gallerist and curator. The essay refers to encounters with art and artists from Senegal, Mali and Mozambique. The text is partly based on my experiences at the biennial in Dakar, partly from working experiences with two exhibitions at Galleri Flach in Stockholm. On the basis of my role as curator, I am reflecting on the situation when art appears unfamiliar. How do I act? What do I learn in these situations and what do they bring to my curatorial work in the gallery space? With support from hermeneutics and philosophers such as Hans-Georg Gadamer and Marcia Sa Cavalcante Schuback, I describe a learning process that takes the geographical and cultural distance into consideration. The text reflects also on the so-called hermeneutical gap (a room in between) that occurs in the joint between the familiar and the unfamiliar. The discussion incorporates thoughts on how standards in the Western art history affect my encounters with the art object and what I perceive as artistic quality. I note in the essay how these meetings and confrontations with the unknown in the art are important. It sets in motion a process towards greater knowledge in which I see myself more clearly, not the least my conscious and unconscious beliefs. The text describes how I use the gallery space to put my reflections into practice, in a dialogue between myself and the artists with whom I work. I emphasize the dialogue and the importance of an internal reflection in creating an exhibition. The exhibition offers a room within a room, a limited context, where dialogues and reflections take shape.

La mortalité maternelle et périnatale est un problème majeur de santé publique dans les pays en développement. Elle illustre l’écart important entre les pays développés et les pays en développement. Les interventions techniques pour améliorer la santé maternelle et périnatale sont connues dans les pays en développement, mais ce sont la faiblesse des systèmes de santé et les défis liés aux ressources qui freinent leur généralisation. L’objectif principal de ce travail était de mieux comprendre le rôle des ressources humaines en particulier ceux de la première ligne dans la performance d’un système de référence maternelle. Au Mali, la mise en place d’un système de référence maternelle, système de référence-évacuation « SRE », fait partie des mesures nationales de lutte contre la mortalité maternelle et périnatale. Les trois composantes du SRE, soit les caisses de solidarité, le transport et la communication et la mise à niveau des soins obstétricaux, permettent une action simultanée du côté de la demande et de l’offre de soins maternels et périnatals. Néanmoins, la pénurie de personnel qualifié a conduit à des compromis sur la qualification du personnel dans l’implantation de ce système. La région de Kayes, première région administrative du Mali, est une région de forte émigration. Elle dispose d’une offre de soins plus diversifiée qu’ailleurs au Mali, grâce à l’appui des Maliens de l’extérieur. Son SRE offre ainsi un terrain d’études adéquat pour l’analyse du rôle des professionnels de première ligne. De façon plus spécifique, ce travail avait pour objectifs 1) d’identifier les caractéristiques des équipes de soins de première ligne qui sont associées à une meilleure performance du SRE en termes de survie simultanée de la mère et du nouveau-né et 2) d’approfondir la compréhension des pratiques de gestion des ressources humaines, susceptibles d’expliquer les variations de la performance du SRE de Kayes. Pour atteindre ces objectifs, nous avons, à partir du cadre de référence de Michie et West modélisé les facteurs liés aux ressources humaines qui ont une influence potentielle sur la performance du SRE de Kayes. L’exploration des variations du processus motivationnel a été faite à partir de la théorie de l’attente de Vroom. Nous avons ensuite combiné une revue de la littérature et un devis de recherche mixte (quantitative et qualitative). Les données pour les analyses quantitatives proviennent d’un système d’enregistrement continu de toutes les urgences obstétricales (GESYRE : Gestion du Système de Référence Évacuation mis en place depuis 2004 dans le cadre du suivi et de l’évaluation du SRE de Kayes) et des enquêtes à passages répétés sur les données administratives et du personnel des centres de santé. Un modèle de régression biprobit a permis d’évaluer les effets du niveau d’entrée dans le SRE et des équipes de soins sur la survie jointe de la mère et du nouveau-né. A l’aide d’entrevues semi-structurées et d’observations, nous avons exploré les pratiques de gestion des personnes dans des centres de santé communautaires « CScom » sélectionnés par un échantillonnage raisonné. Les résultats de ce travail ont confirmé que la main d’œuvre humaine demeure cruciale pour la performance du SRE. Les professionnels de première ligne ont influencé la survie des femmes et des nouveau-nés, à morbidités égales, et lorsque la distance parcourue est prise en compte. La meilleure survie de la mère et du nouveau-né est retrouvée dans les cas d’accès direct à l’hôpital régional. Les femmes qui sont évacuées des centres de première ligne où il y a plus de professionnels ou un personnel plus qualifié avaient un meilleur pronostic materno-fœtal que celles qui ont consulté dans des centres qui disposent de personnel peu qualifié. Dans les centres de première ligne dirigés par un médecin, des variations favorables à la performance comme une implication directe des médecins dans les soins, un environnement de soins concurrentiel ont été retrouvés. Concernant les pratiques de gestion dans les centres de première ligne, les chefs de poste ont mis en place des incitatifs pour motiver le personnel à plus de performance. Le processus motivationnel demeure toutefois très complexe et variable. La désirabilité de bons résultats des soins (valence) est élevée pour tous les professionnels ; cependant les motifs étaient différents entre les catégories de personnel. Par ailleurs, le faible niveau d’équipements et la multiplicité des acteurs ont empêché l’établissement d’un lien entre l’effort fourni par les professionnels et les résultats de soins. Cette compréhension du rôle des professionnels de première ligne pourra aider le personnel administratif à mieux cibler le monitorage de la performance du SRE. Le personnel de soins pourra s’en servir pour reconnaitre et appliquer les pratiques associées à une bonne performance. Dans le domaine de la recherche, les défis de recherche ultérieurs sur les facteurs humains de la performance du SRE seront mieux identifiés. / Although proven effective interventions have been transferred from the developed world, developing countries still face high maternal and perinatal deaths. Weak health systems and human resources crisis hinder the scaling up of those interventions. This study is aimed at improving the understanding of the role of human resources, especially the first line staff in a maternal referral system, the evacuation and referral system (ERS) of Kayes (Mali). The implantation of the ERS as part of major strategies for fighting maternal and perinatal deaths has been generalised in Mali’s eight administrative regions. The ERS main components are: upgrading of emergency obstetric care (EmOC); funding by a solidarity fund; and improving transport and communication by ambulance. These components allows for joint action regarding the supply and the use of maternal and perinatal services. Yet, due to the shortages in skilled birth attendants, the extension of the coverage in emergency obstetric services has been made with less qualified staff. Kayes is Mali’s first administrative region and a cradle of emigration. It therefore offers, with the support of its immigrants, a more diversified primary care provision than elsewhere in Mali. This gives an opportunity of studying the role of primary care staff in the ERS performance. More precisely, the objectives of this research were to: 1 identify characteristics of primary care teams that influenced the ERS performance assessed by the joint mother-child survival and 2) improve the understanding of human resources practices associated with ERS performance. We combined a systematic literature review with a mixed quantitative and qualitative research design. Kayes ERS performance was modelised using Michie and West conceptual framework and the motivational process was explored with Vroom’s expectancy theory. Data for the quantitative analyses derived from an ongoing system of registering all obstetric emergencies implemented since 2004 (GESYRE: Gestion du Système de Référence Évacuation / Management of the Evacuation Referral System) and periodic surveys. A biprobit regression model has been fitted to estimate the effects of the point of entry in the ERS and the primary care team composition on the joint mother-newborn survival. We also conducted semi structured interviews and non participant observations in order to explore human resources practices in purposely selected community health centers. This research confirmed the importance of human resources in ERS performance. When women’ individual risk factors are controlled for, there is a combined effect of distance traveled and the point of entry in the ERS on one side and the community health centers staff on the other hand, on the mother-child joint survival. The best prognosis of care was found in women who directly accessed care at the regional hospital. Having been transferred from a community health center where there is a physician or more than three professionals increased the mother-child survival probability. Physicians in community health centers develop strategies for a better performance of the health centers they managed: direct implication in care and a competitive care environment. Primary care managers set up incentives to motivate staff. The motivation process remains however a variable and complex one. The desirability of good results was common for all staff though its motivations varied according to the type of staff. Besides, due to insufficiency of material and multiples intermediate factors, perception of a linkage between effort and result was low. This increased understanding of the role of primary care human resources in the ERS performance would focus the management of ERS performance on targeted but effective interventions. The workforce could benefit from the study conclusions in identifying and applying best practices. Further research challenges would also be more precisely identified.