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Morphogenèse et développement pulmonaireClement, Raphaël 30 March 2011 (has links) (PDF)
La forme emerge a toutes les echelles et dans tous les syst emes physiques, vivants ou non, comme le r esultat de l'interaction suivant certaines r egles des di erents el ements constituant le syst eme. L'enjeu de l' etude de la morphogen ese est donc d' etablir quels el ements et quelles interactions sont responsables de l' emergence des traits frappants de la forme dont on souhaite expliquer la naissance. En biologie du d eveloppement, le contexte bio-mol eculaire et l'importance du g ene font souvent perdre de vue que comme dans tout syst eme, la forme g eom etrique emerge suite a des interactions inscrites dans l'espace et dans le temps, interactions dont les g enes et les prot eines pour lesquelles ils codent sont certainement acteurs. Dans ce manuscrit, nous traiterons de la morphogen ese de deux syst emes di erents. Le premier se situe dans la lign ee des exp eriences de croissance osmotique r ealis ee au XIX eme si ecle par le Dr. St ephane Leduc. Il consiste en la formation spontan ee de tubes de silice poussant sym etriquement autour d'une fracture se situant en leur milieu lors de l'injection d'une solution dans une seconde, un pr ecipit e se formant a l'interface. Le reste du manuscrit est d edi e a l' etude de la morphogen ese pulmonaire chez les mammif eres. Nous construirons d'abord le cadre th eorique d'un mod ele de croissance tr es g en eral bas e sur les observations de la biologie mol eculaire et la g eom etrie de l'organe. Par la suite nous verrons comment de simples consid erations de g eom etrie et de di usion permettent d'expliquer le patterning des g enes impliqu es, et comment ces m^emes consid erations rendent compte de l' emergence des traits frappants de la morphologie du poumon embryonnaire : l'arborescence, l' evitement des bronches entre elles, et l' etablissement d'une distance caract eristique entre l' epith elium distal et le m esenchyme distal. Nous introduirons aussi les outils th eoriques permettant de comprendre en profondeur les m ecanismes impliqu es. En n nous pr esenterons une exp erience physique simple bas ee sur les conclusions du mod ele, et r ev elant des similitudes frappantes avec la croissance pulmonaire.
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La morphogenèse gastrovasculaire de la méduse Aurelia auritaGambini, Camille 28 June 2012 (has links) (PDF)
La morphogenèse dans le vivant est contrôlée par un ensemble complexe de processus, parmi lesquels la physique joue un rôle essentiel. Dans le cadre de cette thèse, nous nous sommes intéressé aux processus mécaniques d'auto-organisation qui guident la morphogenèse gastrovasculaire de la méduse Aurelia aurita. Le système gastrovasculaire de cette méduse est constitué d'un réseau branché de canaux, dont le rôle est de distribuer les nutriments et l'oxygène dans son ombrelle, et dont l'organisation est relativement simple. Nous avons observé la croissance de ce réseau de canaux et étudié la structure et les propriétés mécaniques des tissus qui les entourent. Les canaux grandissent dans un mince feuillet cellulaire plat, l'endoderme, et sont entourés par de la matrice extracellulaire. Ces différents tissus sont comprimés périodiquement par des contractions musculaires. Des expériences de macro- et microrhéologie ont montré que la matrice apparaît comme un gel viscoélastique mou, dont la structure et les propriétés mécaniques évoluent au cours du développement de la méduse. Cette évolution peut être mise en rapport avec les contraintes physiques particulières subies par la matrice lors des contractions musculaires. Par ailleurs, nous avons montré par microscopie optique et électronique que les canaux croissent localement par accumulation, empilement et différenciation des cellules de l'endoderme en cellules de canal. Des simulations numériques et des résultats expérimentaux suggèrent que ce processus est induit par une accumulation locale des contraintes de compression dans l'endoderme, à l'extrémité des canaux en croissance, à chaque contraction musculaire de la méduse.
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Etude morphologique et phylogénie des Ciliés Astomes endocommensaux d'Oligochètes terricoles de la région de Yaoundé et ses environsFokam, Zéphyrin 01 August 2012 (has links) (PDF)
L‟étude porte sur la systématique de l‟endofaune microbienne des Oligochètes terricoles Megascolecidae et Glossoscolecidae de la région de Yaoundé et ses environs, avec un accent particulier sur l‟analyse morphologique et génétique des Ciliés Astomes présents dans leur tractus digestif. Une révision taxonomique de la famille des Radiophryidae de Puytorac 1972 est menée, avec la description de cinq espèces nouvelles de la sous-famille des Metaracoelophryinae de Puytorac, 1972. Elle permet de confirmer d‟une part, la présence des genres Paracoelophrya et Dicoelophrya dans le tube digestif des Oligochètes du genre Alma du Cameroun et de confirmer l‟homogénéité de ce groupe d‟autre part. La question de la parenté phylogénétique des Hoplitophryida est exposée. La diversité d‟organisation de l‟appareil nucléaire dans le genre Almophrya a été étudiée à travers des observations sur ses variations morphologiques après coloration des spécimens au Diamidino Phényl Indol (Johnson et al., 1982), au Feulgen ou au carbonate d‟argent ammoniacal (Fernandez Galiano, 1994). Une nouvelle espèce d‟Almophrya à vacuoles axiales est décrite, Almophrya nkoldaensis n. sp., imposant une révision des clés d‟identification des espèces au sein de ce genre. Bien plus, le processus de morphogenèse de bipartition chez trois espèces d‟Astomes a été étudié, montrant diverses variantes de cette division : à côté de la fission binaire classique chez Eudrilophrya complanata, la palintomie radiaire et distale chez Buchneriella eupolytoreuti n. sp. a été précisée. De plus, le processus de la conjugaison a été exploré chez Eudrilophrya simplex n.sp. L‟analyse des séquences de gènes RNA de la petite sous unité ribosomale (SSrRNA) chez Anoplophrya marylandensis Conklin, 1930 montre l‟appartenance de cette espèce d‟Astome à la Classe des Oligohymenophora (Affa‟a et al., 2004). Cependant, la séquence de gènes d‟une seule espèce est insuffisante pour établir avec certitude, les relations phylétiques dans un grand groupe. Par conséquent, nous avons obtenu les séquences de gènes SSrRNA de neuf espèces additionnelles distribuées dans six genres appartenant aux trois ordres de la sous-classe des Astomatia : Hoplitophryida Cheissin, 1930 em., de Puytorac, 1972 ; Anoplophryida Cépède, 1910 et Haptophryida Cépède, 1923. Dans le cadre de l‟analyse moléculaire, un nouveau genre de Clausilocolidae de Puytorac in Corliss, 1979 est proposé : Paraclausilocola nov. gen., avec deux espèces nouvelles : P. elongata n. sp. et P. constricta n. sp. Ce nouveau genre est représentatif de l‟ordre des Haptophryida. Le cladogramme obtenu montre une forte affinité des séquences des nouveaux Astomes étudiés avec celle d‟A. marylandensis Conklin, 1930. La branche de l‟arbre contenant les Astomes est précise et montre une distance génétique considérable avec les autres sous-classes des Oligohymenophorea. Cet arbre établit les Astomes comme un clade frère des Scuticociliés, confirmant l‟hypothèse selon laquelle les Astomes forment une sous-classe monophylétique appartenant à la classe des Oligohymenophora (de Puytorac, 1954 ; Affa‟a et al., 2004). Dans la sous-classe des Astomatia, nous observons deux branches bien distinctes : l‟une avec les genres Anoplophrya, Almophrya et Metaracoelophrya, la seconde avec les genres restants : Eudrilophrya, Metaradiophrya, Paraclausilocola et Njinella. Au regard de ce regroupement, les attributions ordinales et les assignations des genres aux familles dans les deux classifications actuelles, celle de de Puytorac (1994) et de Lynn (2008), ne semblent plus respectées.
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Contribution à l' étude de la morphogénèse des mitochondries chez la drosophile / Contribution to the study of the mitochondrial morphogenesis in Drosophila MelanogasterMacchi, Marc 05 October 2012 (has links)
Les mitochondries sont des organelles de quelques micromètres qui proviendraient de l'incorporation d'une alpha-protéobactérie dans le cytoplasme des cellules eucaryotes par endosymbiose. Dans les cellules eucaryotes, la mitochondrie joue un rôle central dans la production d'ATP, mais aussi dans la mort cellulaire programmée par apoptose ainsi que dans la biosynthèse de nombreuses molécules. Les mitochondries sont très polymorphes, leurs taille, forme et organisation varient considérablement selon le type cellulaire ou l'état physiologique ou pathologique de la cellule. Depuis une vingtaine d'année, l'étude des mécanismes qui contrôlent la morphogenèse, la dynamique de fission et de fusion mitochondriale et leurs rôles physiologiques est devenue un domaine majeur dans la recherche sur la mitochondrie. De plus, avec les progrès de la vidéo-microscopie, il est devenu possible de filmer des mitochondries dans le cytoplasme de cellules vivantes. Durant ma thèse, j'ai participé à la caractérisation de la fonction du gène Pantagruelian Mitochondria I (PMI), un nouveau déterminant de la morphologie des mitochondries que nous avons découvert chez la drosophile. PMI est une protéine de la membrane interne qui, en intervenant dans l'organisation de cette membrane, est indispensable à la formation de mitochondries de forme tubulaire. J'ai également contribué au développement d'outils et de méthodologies permettant la visualisation et l'étude de la dynamique mitochondriale dans des embryons de drosophiles vivants. / Mitochondria are organelles which are a few micrometers long and are originated from the incorporation of an alpha-proteobacteria in the cytoplasm of eukaryotic cells through endosymbiosis. In eukaryotic cells, mitochondria play a central role in ATP production as well as in programmed cell death and in the biosynthesis of many molecules. Mitochondria are highly polymorphic in size and form. Their organization also varies considerably according to the cell type or physiological or pathological state of the cell. In the last two decades, the study of the mechanisms controlling morphogenesis, dynamic of mitochondrial fission and fusion and their physiological roles has become a major research field of mitochondria. In addition, the progress in video-microscopy enable to record mitochondrial dynamics in the cytoplasm of living cells. I participated in the research on the characterization of gene function called Pantagruelian Mitochondria I (PMI), a novel determinant of the mitochondrial morphology that we discovered in Drosophila. PMI, a protein of the inner membrane, is involved in its membrane organization and essential to form tubular mitochondria. I also contributed to the development of experimental tools and protocols to visualize and study the mitochondrial dynamics in living Drosophila embryos. Interestingly, a stereotyped process of mitochondrial remodeling during Drosophila embryogenesis has been found and it raised a question about its role in developmental processes through my work.
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Régulation du trafic des protéines de la membrane apicale dans les cellules épithéliales polarisées humaines Caco-2/TC7 : Rôle du complexe Crumbs3A et de la Drebrine E2.Vacca, Barbara 19 November 2012 (has links)
Des pathologies lourdes, telles que les dystrophies de la rétine et certains cancers, impliquent une désorganisation de l'épithélium et la famille Crb, dont la protéine apicale Crumbs3 (isoformes Crb3A et Crb3B) fait partie. Les protéines transmembranaires Crb possèdent un domaine intracellulaire fortement conservé et des partenaires communs. Il est donc essentiel de comprendre comment ces protéines Crb sont régulées afin de mieux appréhender ces pathologies. Pour cela, j'ai étudié le complexe de polarité apical Crb3A (Crb3A, Pals1, PATJ) impliqué dans l'établissement et le maintien de la polarité apico-basale. Je me suis, tout d'abord, intéressée à la régulation des isoformes de Crb3 par leurs partenaires (Pals1 et PATJ), puis, à la régulation des protéines de la membrane apicale, dont Crb3A, par la Drebrine E2, un nouveau partenaire de Crb3A impliqué dans l'organisation du cytosquelette d'actine et la morphogenèse apicale. Mon travail a permis de mettre en évidence: 1) la régulation de la dynamique membranaire des isoformes de Crb3 par PATJ dans les cellules Caco-2/TC7, une lignée épithéliale intestinale humaine, mais aussi, 2) d'identifier une nouvelle fonction de la Drebrine E2 dans la régulation du trafic de plusieurs protéines de la membrane apicale dans ces cellules, dont, par exemple, la DPPIV (DiPeptidyl Peptidase IV). Dans les cellules déplétées en Drebrine E2, l'expression des protéines apicales est diminuée et leur endocytose est augmentée, puis, elles sont relocalisées dans le compartiment majeur de dégradation, le lysosome. / Some serious diseases like retinal dystrophies and some cancers involve epithelial cells disorganization and the Crumbs (Crb) proteins family. The apical Crb3 (Crb3A and Cr3B isoforms) protein belongs to Crb family. The transmembrane proteins Crb have a conserved intracellular domain with common partners. It is unclear how Crb proteins are regulated by their partners and this information is required to better understand these pathologies. Here, we decided to study the apical polarity Crb3A complex (Crb3A, Pals1, PATJ) which is involved in apico-basal polarity establishment and maintenance. First, I investigated Crb3 isoforms regulation by their partners (Pals1 and PATJ). Then, I studied the regulation of apical membrane proteins, such as Crb3A, by Drebrin E2, a new partner of Crb3A which is involved in actin cytoskeleton remodeling and apical morphogenesis. During my thesis, I demonstrated: 1) the regulation of Crb3 isoforms dynamics by PATJ in Caco-2/TC7 human intestinal epithelial cells, but also, 2) a new function for Drebrin E2 in regulating the trafficking of apical membrane proteins, like DPPIV (DiPeptidyl Peptidase IV). In Drebrin E2 KD cells, apical membrane proteins expression is decreased and we observe an increased endocytosis. This leads to relocalization of the apical membrane proteins to the main degradative compartment, the lysosome. These new datas suggest a role for Drebrin E2 in the regulation of apical membrane proteins recycling pathway. The Drebrin E2 KD cells phenotype is reminiscent of the microvillar inclusions disease (MVID). Now, I am trying to investigate the link between theses pathways.
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Caractérisation du gène Spatial et identification de sa fonction dans les cellules hautement polariséesYammine, Miriam 12 December 2011 (has links)
Le gène Spatial est exprimé par des cellules hautement polarisées : les cellules épithéliales du thymus, neuronales du système nerveux central et germinales du testicule. La différenciation de ces cellules est accompagnée d'une polarisation de la distribution de Spatial, dans des structures microtubulaires hautement organisées telles que la manchette, le flagelle et la dendrite.Mon projet a porté sur l’identification de la fonction du gène Spatial au niveau du thymus et du cerveau murins. De plus, j’ai été impliquée dans la caractérisation du gène Spatial chez l’homme et l’évaluation de son impact sur la spermatogenèse et l’infertilité humaine.Nos résultats montrent qu’au niveau du thymus, Spatial est détecté tout au long de l’organogenèse thymique jusqu’aux stades adultes. Son profil d’expression correspond à un « promiscuous gene » impliqué dans l’acquisition de la tolérance des lymphocytes T. Au niveau du système nerveux central, Spatial présente une distribution somatodendritique dans les cultures de neurones hippocampiques et son expression est fortement détectée lors de la poussée dendritique. Nous avons montré que le transport de Spatial du corps cellulaire vers les dendrites est dépendant de la kinésine Kif17. De plus, Spatial semble être impliqué dans la formation des dendrites via la voie de signalisation stimulée par le Nerve Growth Factor.Chez l’homme, le gène H-Spatial est fortement exprimé au niveau du testicule et son expression est spécifique de la spermiogenèse, étape de différenciation des spermatides rondes en spermatozoïdes. Chez les patients infertiles asthéno- et/ou tératozoospermiques, présentant des anomalies de mobilité et de forme des spermatozoïdes, le niveau d’ARNm d’H-Spatial est fortement réduit. Ces résultats suggèrent qu’H-Spatial est un marqueur potentiel de l’infertilité masculine.J’ai également participé à la validation des dendrimères PAMAM (poly-amidoamine) comme vecteurs efficaces pour le transfert de siRNA et d’ADN in vitro sur différents lignées cellulaires et in vivo sur des thymus murins. Ce système pourrait être un moyen thérapeutique pour traiter des immunodéficiences liées aux lymphocytes T. / Spatial gene is expressed in highly polarized cells such as, thymic epithelial cells, testicular germ cells and neuronal cells of the central nervous system. The differentiation of these cells is accompanied by the polarized distribution of Spatial in highly organized microtubule structures such as the manchette, the flagellum and dendrites. This project aims to identify the function of Spatial gene in the thymus and in the brain. Moreover, we characterize Spatial gene in humans and evaluate its impact on spermatogenesis and human infertility.Our results showed that, in the thymus, Spatial is detected throughout the thymic development, until adulthood. Its expression profile corresponds to a ‘promiscuous gene’, implicated in the acquisition of T lymphocyte tolerance.At the level of the central nervous system, Spatial showed a somatodendritic distribution in hippocampal neuron cultures. Moreover, its expression was highly detected during dendritic growth. We have also shown that the transport of Spatial from the cell body to the dendrites is dependent on the kinesin Kif17. In addition, our results suggest that Spatial seems to be implemented in dendrite formation by the Nerve Growth Factor mediated signaling pathway.In the humans, H-Spatial is highly expressed in the testis and its expression is specific to spermiogenesis: the phase of differentiation of round spermatids to spermatozoids. In infertile astheno and/or teratozoospermic patients with sperm shape and mobility anomalies, H-Spatial levels were drastically reduced. These results propose H-Spatial as a potential marker for human male infertility.Finally, we have equally participated in the validation of PAMAM (poly-amidoamine) dendrimers as efficient vectors for the transfer of DNA and siRNA in vitro, in different cell lines; and in vivo, in murine thymi. This system could serve as a new therapeutic model for treating diseases linked to T lymphocytes.
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Intercellular coupling and mechanical feedback during tissue morphogenesis / Couplages intercellulaires et rétrocontrôles mécaniques au cours de la morphogenèseBailles, Anaïs 20 December 2018 (has links)
Un des mécanismes principaux de la morphogenèse des organismes est la contraction des réseaux d’actine sous l’effet du moteur moléculaire Myosine II. L’invagination de l’endoderme postérieur de Drosophila est causée par la contraction apicale des cellules par MyoII, mais la cause de sa déformation polarisée est inconnue. Nous avons découvert une vague de Rho1, MyoII et de déformation qui se propage à l’échelle du tissu et sous-tend la déformation de l’endoderme. MyoII est d’abord activée dans le primordium de l’endoderme par un ligand de GPCR, Fog. L’activation apicale de MyoII se propage ensuite à travers l’épithélium dorsal à 2.2 ± 0.2 µm/min. La dynamique de la vague n’est définie ni par les niveaux de Fog ni par leur motif d’expression. A la place, l’activité de MyoII est nécessaire pour l’activation intracellulaire de Rho1 et sa propagation à travers le tissu, indiquant une boucle de rétroaction. Des simulations d’un matériau viscoélastique contractile montrent qu’une boucle de rétroaction basée sur la tension peut générer une vague. Des perturbations de l’environnement mécanique du tissu avec des moyens génétiques ou mécaniques résultent en une augmentation de l’activité de MyoII et une diminution de la vitesse de la vague. Les déformations ou les forces du tissu procurent donc un rétrocontrôle sur l’activation de Rho1/MyoII lors de la vague, contrôlant sa dynamique. A l’échelle cellulaire, la vague de déformation implique la compression basale des cellules et l’étalement et l’adhésion du cortex apical sur la membrane vitelline, suivi d’un détachement. Ainsi la morphogenèse observée émerge de la propagation stimulée mécaniquement d’une vague de déformation 3D. / One of the main mechanisms of organism morphogenesis is the contraction of actin filament networks powered by non-muscle Myosin II motor proteins (MyoII). Drosophila presumptive posterior endoderm invagination is caused by MyoII-dependent apical constriction, but the cause of its polarized deformation is unknown. We unravelled a tissue scale wave of high Rho1 and MyoII activation and deformation which underlies the polarized deformation of the endoderm. MyoII is first activated medio-apically in cells within the endoderm primordium by the GPCR ligand Fog. Subsequently, apical MyoII activation propagates across the dorsal epithelium at a constant speed of 2.2 ± 0.2 µm/min. MyoII wave dynamics are set neither by Fog levels nor expression pattern. Instead, both intracellular Rho1 activation and its propagation across the tissue require sustained MyoII activity, indicating a positive feedback from contractility into Rho1 activity. Through simulations of a contractile viscoelastic material we found that a stress-based feedback loop could generate a wave. Perturbations of the tissue mechanical environment with both genetic and physical means result in an increase in MyoII activity and a strong reduction of the wave speed. Tissue deformation or stress thus provides a feedback onto Rho1/MyoII activity during the wave, controlling its dynamics. At the cell scale, the deformation wave involves cells basal compression and apical cortex spreading and adhering onto the vitelline membrane, followed by de-adhesion, that correlates with MyoII activation and propagation within cells. Thus the observed morphogenesis emerges from a mechanically driven wave of 3D deformation.
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Identification and characterization of the mechanical role of germline growth in Drosophila melanogaster epithelial morphogenesis / Identification et caractérisation du rôle mécanique de la croissance de la lignée germinale sur la morphogenèse épithéliale chez Drosophila melanogasterLamiré, Laurie-Anne 28 January 2019 (has links)
La morphogenèse épithéliale est essentielle à la formation des organes. J'utilise le follicule ovarien de Drosophila comme modèle d'étude de l’aplatissement des cellules. Un follicule est composé de cellules germinales en croissance entourées d'une monocouche de cellules épithéliales cuboïdes. À un stade de développement spécifique, une part de ces cellules s'aplatit en suivant une vague régulée. Cet aplatissement est en partie contrôlé par un gradient de pression provenant d’un groupe de cellules germinales (les cellules nourricières). Toutes les cellules germinales sont connectées via des ponts cytoplasmiques. Cette thèse étudie les mécanismes conduisant à la génération du gradient de pression, et à la modulation moléculaire induite par cette force mécanique pour permettre l'aplatissement. J'ai montré que le nombre et le diamètre des ponts cytoplasmiques influaient sur la pression. En utilisant des reconstructions tridimensionnelles de follicules, j’ai étudié le rôle de la croissance différentielle des cellules nourricières en mesurant le changement de volume des cellules germinales lors de l'aplatissement des cellules. Enfin, j’ai cherché le mécanisme moléculaire conduisant à l’aplatissement des cellules et influencé par un stimulus mécanique à partir de la pression germinale, en proposant un rôle de la voie Hippo dans ce processus. En conclusion, nous proposons que la croissance des cellules germinales influe de manière mécanique et génétique sur les cellules épithéliales pour permettre l’élongation, et donc l'acquisition de la forme finale du follicule. / Epithelial morphogenesis is essential for organ formation. I use the Drosophila ovarian follicle as a model for studying cell flattening. A follicle is composed of growing germ cells surrounded by a monolayer of cuboidal epithelial cells. At a specific stage of development, some of these cells flatten out following a regulated wave. This flattening is partly controlled by a pressure gradient from part of the germ cells (the nurse cells). All germ cells are connected via cytoplasmic bridges. This thesis studies the mechanisms leading to the generation of the gradient of pressure, and to the molecular modulation induced by this mechanical force to allow flattening. I have shown that the number and diameter of cytoplasmic bridges affect the pressure. Using three-dimensional reconstructions of follicles, I studied the role of differential growth of nurse cells by measuring the change in germ cell volume during epithelial cell flattening. Finally, I looked for the molecular mechanism leading to the flattening and influenced by a mechanical stimulus from the germinal pressure, supporting a role of the Hippo pathway in this process. In conclusion, we propose that germ cell growth mechanically and genetically influences epithelial cells to allow elongation, and thus the acquisition of the final form of the follicle.
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Caractérisation de l'évolution géomorphologique de la basse vallée de la Romanche en relation avec les instabilités gravitaires de ses versants rocheuxLe Roux, Olivier 16 January 2009 (has links) (PDF)
L'objectif de ce travail de thèse est de comprendre le rôle de la déglaciation et l'influence de l'évolution géomorphologique de la basse vallée glaciaire de la Romanche sur l'initiation et la localisation des instabilités gravitaires de ses versants rocheux.<br />Une étude multidisciplinaire combinant des données géologiques, morphologiques, géophysiques, et chronologiques a ainsi été menée à deux échelles spatiales différentes : celle de la basse vallée de la Romanche et celle du mouvement de terrain de Séchilienne.<br />La détermination de la fracturation du massif, obtenues par morphologie de surface, indiquent que les caractéristiques lithologiques et structurales sont des facteurs importants dans la localisation et l'initiation des instabilités gravitaires. De plus, le surcreusement glaciaire très important de la vallée, mis en évidence par prospection géophysique, a probablement engendré une modification importante de l'état des contraintes dans le massif rocheux. Cependant, ce processus érosif, associé à la décompression élastique générée par la fonte des glaciers et aux facteurs litho-structuraux, ne semble pas avoir été suffisant pour déclencher des instabilités gravitaires de manière immédiate après le retrait glaciaire. Les données chronologiques obtenues sur l'escarpement sommital de Séchilienne suggèrent en effet que ce mouvement a été déclenché avec un délai d'au moins 5400 ans par rapport au retrait glaciaire, et probablement suite à une modification brusque du climat correspondant à l'optimum climatique de l'Holocène. En particulier, le régime pluviométrique apparaît être un facteur majeur dans l'initiation et dans la dynamique du mouvement de terrain de Séchilienne.
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Modélisation dynamique des interactions plante-environnement. Application à l'étude des interactions entre les relations sources-puits et les processus de développement chez la vignePallas, Benoît 22 September 2009 (has links) (PDF)
La modélisation dynamique du développement de la vigne offre de nombreuses possibilités pour évaluer la pertinence des pratiques culturales pour répondre à des objectifs de production. Le développement de la vigne résulte de l'effet de différents facteurs, environnementaux, génotypiques et techniques lorsqu'elle est cultivée. Une des principales variables endogènes, résultant des effets combinés de ces trois facteurs et qui détermine en grande partie la plasticité phénotypique est la compétition trophique entre les organes. Le développement des organes peut-être décomposé en trois processus, l'initiation (organogenèse), l'expansion (morphogenèse), et la croissance en biomasse. Pour la vigne, l'organogenèse des axes est le processus de développement présentant la plus grande plasticité. Ce travail établit les bases pour la construction d'un modèle prédictif, permettant de simuler le développement de plantes de vignes soumises à une gamme de pratiques culturales et dans des environnements contrastés. Notre travail combine deux approches de modélisation, écophysiologique et mathématique. L'originalité de ce travail a été d'utiliser les deux approches de façon conjointe pour tirer parti des outils et des concepts de chacune et pour combler leurs lacunes respectives dans un objectif de modélisation des interactions plante-environnement. Le modèle GreenLab et les outils d'optimisation qui lui sont associés ont permis de quantifier précisément les relations sources-puits entre les organes et le niveau de compétition trophique qui en résulte à l'échelle de la plante. L'approche écophysiologique a permis d'établir de nouveaux formalismes de la réponse des processus d'organogénèse aux contraintes environnementales, et de les implémenter dans le modèle GreenLab. Un simulateur stochastique du développement de la vigne dans des environnements variés (thermiques, hydriques, lumineux) a ainsi pu être développé.
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