Submitted by GEORGE DEROCO MARTINS null (deroco87@hotmail.com) on 2017-02-08T14:17:06Z No. of bitstreams: 1 martins_gd_dr_prud.pdf: 4750620 bytes, checksum: 2b77564f0f8c206ce23e6d7ca4bac5d6 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-02-13T18:01:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 martins_gd_dr_prud.pdf: 4750620 bytes, checksum: 2b77564f0f8c206ce23e6d7ca4bac5d6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-13T18:01:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 martins_gd_dr_prud.pdf: 4750620 bytes, checksum: 2b77564f0f8c206ce23e6d7ca4bac5d6 (MD5) Previous issue date: 2016-12-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os nematoides são importantes fitoparasitas que se constituem em um problema sério para o cultivo do café no Brasil. Como a ocorrência de nematoides no sistema radicular do cafeeiro causa desequilíbrios nutricionais na planta que provocam variações na resposta espectral da folha e define uma configuração espacial característica às áreas infectadas, o objetivo desta pesquisa avaliar o potencial de dados de sensoriamento remoto adquiridos em multiescala para discriminar e mapear o café sadio, em estágio inicial de infecção e severamente infectado. A pesquisa foi desenvolvida em três áreas experimentais, localizadas no sul do estado de Minas Gerais, nas quais foi certificada a ocorrência de nematoides e realizadas medições de variáveis biofísicas e dados hiperespectrais na folha e sobre o dossel da planta. Os dados hiperespectrais também foram utilizados em simulação de bandas dos sensores do RapidEye e OLI/Landsat 8 para identificar as faixas espectrais mais sensíveis para a discriminação de patógenos em plantas de café. Nenhum dos parâmetros biofísicos avaliados discriminou eficientemente as folhas de plantas sadias e infectadas, mas a simulação de bandas indicou que os intervalos espectrais do vermelho, vermelho limítrofe e infravermelho próximos do RapidEye foram complementares para a discriminação de plantas de café sadio e dos dois níveis de infecção. Essas bandas, mais uma imagem NDVI, foram utilizadas na classificação das áreas infectadas por nematoides, a qual definiu a distribuição espacial de café sadio e dos dois níveis de infecção, com uma acurácia global de 78% e coeficiente kappa de 0,71. A classificação não supervisionada da imagem multiespectral OLI/Landsat 8 também definiu as três condições, porém com baixa confiabilidade (coeficiente kappa igual a 0,41). Por outro lado, uma inferência espacial quantitativa da concentração de nematoides/cm³ no solo, a partir de um modelo empírico baseado na imagem RapidEye, apresentou um erro consideravelmente alto (21,89%). / Nematodes are important phytoparasites that constitute a serious issue for coffee cultivation in Brazil. Because root infection by nematodes induces spectral variation in leaves and defines a unique spatial configuration in the cultivation field, the aim of this study is to evaluate the potential of remote sensing data acquired in multiscale to discriminate and map healthy, early infected and severely infected coffee plants. This study was carried out in three experimental areas, located in the in southern Minas Gerais State, in which the occurrence of nematodes was certified and biophysical and hyperspectral measurements of the leaves and on the canopy were made. Hyperspectral data were also used to simulate the bands of the RapidEye and OLI/Landsat 8 sensors to identify the most sensitive spectral ranges for pathogen discrimination in coffee plants. None of the biophysical parameters efficiently discriminated the leaves of healthy and infected plants, but the band simulations indicated that red, red edge and near infrared spectral ranges were complementary to the discrimination of healthy coffee plants and the two levels of infection. These bands, plus an (NDVI) image, were used for a multispectral classification of healthy and nematode-infected areas. The multispectral classification defined the spatial distribution of healthy, early infected and two levels of infection, with an overall accuracy of 78% and kappa coefficient of 0.71. The unsupervised classification of the multispectral image OLI/Landsat 8 also defined the three conditions, but with low reliability (kappa coefficient equal to 0.41). In contrast, a quantitative spatial inference of the soil nematode concentration/cm³, from an empirical model based on the RapidEye image, presented a considerably high error (21.89%).

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This study evaluated the spatial distribution of nematodes, clay content and soil chemical properties with the aid of geostatistics in an area mostly cultivated with soybeans. For this, georeferenced samples of soil and roots, from a rural property in Paracatu MG, were collected and subjected to chemical, physical and nematode analyses. Sampling was conducted in the form of a mesh, collecting approximately one sample per hectare, in nine areas with central pivot in a property with 831.01 ha. Subsequently, the semivariograms and spatial distribution maps were made, using kriging technique, for each factor evaluated. There was a predominance of spherical and exponential models in semivariograms adjusted for soil chemical properties, of exponential models for nematodes, and clay could not be identified by any of the models. There was spatial independence for various soil chemical properties, which can be associated to the application of precision agriculture to the area, both in correction and fertilization in previous years, which provided adequate or near adequate fertilization levels for soybean cultivation and the main crops used in rotation on the property. The data for total clay were biased, thus modeling of the semivariograms was done with the residues. Similarly, some of the soil chemical attributes were modeled from the residues, and in these cases, the semivariograms showed pure nugget effect, indicating that trend surface is the best spatial representation for them. Due to the low number of samples with nematodes, it was not possible to fit semivariograms adjusted for most trophic groups of nematodes of primary importance for the cultures used in the area. However, the most abundant nematode groups in the trophic structure were the parasites of plants (PP) and the Bacteriophage (B). The nematodes of primary importance found were Pratylenchus brachyurus in greater numbers, followed by Rotylenchulus reniformis and Meloidogyne sp. In soybean and Pratylenchus zeae and Pratylenchus brachyurus in maize and millet. The analyses of chemical soil properties, indicated a tendency for P-rem at pivot 07, V (%), SB, P-rem, Mg2 +, CTC (T) and CTC (t) in the area of pivot 05, P-rem in the area of pivot 04, H+Al and pH in water in the area of pivot 03 and CTC (T), CTC (t) and P-rem in the area of pivot 02. Also, pure nugget effect was observed for H+Al, Al3+ , P, SB and V (%) in pivot area 02; K+, m (%) and P and V (%) in pivot area 03; Al3+, K+, m (%) P and the area of pivot 04; phosphorus in pivot area 06; Al3+ and m ( %) in pivot area 07; Al3+, Ca2+, CTC (T) CTC (t), K+, m (%), Mg2+, SB and V (%) in the area of pivot 08 and phosphorus (P) in the area of pivot 09. In pivot 05, Al3+, Ca2+, H+Al, K+, m (%) and P had spatial independence and the data did not adjust to any of the models. / O presente trabalho foi desenvolvido com o intuito de avaliar a distribuição espacial de nematoides, teor de argila e atributos químicos do solo com auxílio da geoestatística em área onde predomina cultivo de soja. Para isso, foram coletadas amostras de solo e raízes georeferenciadas de uma propriedade rural em Paracatu-MG e feitas análises químicas, físicas e nematológicas. A amostragem foi realizada na forma de malhas, coletando-se aproximadamente uma amostra por hectare em nove áreas de pivô central da propriedade de 831,01 ha. Em seguida montou-se semivariogramas e mapas de distribuição espacial por krigagem para os fatores avaliados. Observou-se a predominância dos modelos esférico e exponencial nos ajustes de semivariogramas de atributos químicos do solo, do exponencial para nematoides e para argila não foi possível identificar predominância de nenhum dos modelos. Houve independência espacial para vários atributos químicos do solo, o que pode estar associado com a aplicação de agricultura de precisão à área tanto na correção quando na adubação em anos anteriores, o que proporcionou teores adequados e próximos para o cultivo de soja e das principais culturas utilizadas em rotação na propriedade. Quanto à argila total, ocorreu tendência nos dados, sendo feita modelagem dos semivariogramas a partir dos resíduos encontrados para retirá-la. Fato similar foi constado para parte dos atributos químicos sendo que, nesses casos, os semivariogramas gerados a partir dos resíduos apresentaram efeito pepita puro, indicando que a superfície de tendência é a melhor representação espacial dessas variáveis. Devido ao baixo número de amostras com nematoides, não foi possível montar semivariogramas ajustados para a maioria dos grupos tróficos ou de fitonematoides de importância primária para as culturas utilizadas na área. No entanto, os grupos mais abundantes na estrutura trófica de nematoides foram o de Parasitos de Plantas (PP) e o de Bacteriófagos (B). Os fitonematoides de importância primária encontrados foram Pratylenchus brachyurus em maior número e Rotylenchulus reniformis e Meloidogyne sp., em menor número, para cultura da soja e Pratylenchus zeae e Pratylenchus brachyurus para as culturas do milho e do milheto. Quanto aos atributos químicos do solo, houve tendência para P-rem no pivô 07, V (%), SB, P-rem, Mg2+, CTC (T) e CTC (t) na área de pivô 05, P-rem na área de pivô 04, H + Al e pH em água na área de pivô 03 e CTC (T), CTC (t) e P-rem na área de pivô 02. Constatou-se ainda efeito pepita puro para H + Al, Al3+, P, SB e V (%) na área de pivô 02; K+, m (%), P e V (%) na área de pivô 03; Al3+, K+, m (%) e P na área de pivô 04; fósforo na área de pivô 06; Al3+ e m (%) na área de pivô 07; Al3+, Ca2+, CTC (T), CTC (t), K+, m (%), Mg2+, SB e V (%) na área de pivô 08 e fósforo (P) na área de pivô 09. Na área de pivô 05, para Al3+, Ca2+, H + Al, K+, m (%) e P observaram-se independência espacial e inadequação dos dados ao ajuste a qualquer modelo. / Mestre em Agronomia

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:34:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RenataMAC_DISSERT.pdf: 1125273 bytes, checksum: 6bd33833f33ca21674933995a1ccf14a (MD5) Previous issue date: 2012-02-28 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The aim of this study was to evaluate and characterize phenotypically goats with different levels of resistance to gastrointestinal nematodes. For a period of 93 days, 60 F2 goats originated from ? Saanen and ? Anglo- nubian animals were kept in the same area of pasture. Every seven days, feces and blood were collected for eggs per gram counts of feces (EPG) and cultures of feces and to determinate the number of eosinophils, packed cell volume and total plasma protein, respectively. On the same day, the animals were weighed and submitted to body score condition and FAMACHA method to worm control. Based on the average of EPG, the twelve animals with the highest average (susceptible group) and the twelve animals with the lowest average of EPG (resistant group) were selected, slaughtered and necropsied to recovery, counting andparasites identification. The resistant animals present lower EPG mean (P <0.0001) and 4.7 folder less parasites than susceptible animals. The resistant group presented higher mean packed cell volume (26.48%) and total plasma protein (6.24 g / dl) than susceptible one (24,04% e 5,82g/dl, respectively). The average number of eosinophils was similar in both groups The Haemonchus sp. was the most prevalent in the culture of feces, followed by Trischostrongylus sp. and Oesophagostomum sp.. The counting of nematodes in the abomasum of susceptible group was higher than in resistant one. The species identified were H. contortus in abomasums and T. colubriformis in small intestine. It can be concluded that EPG, packed cell volume and total plasma protein were useful phenotypic markers to identify animals as resistant and susceptible to gastrointestinal nematodes infections / O presente trabalho teve como objetivo de avaliar e caracterizar fenotipicamente caprinos com diferentes n?veis de resist?ncia a nematoides gastrintestinais. Em um per?odo de 93 dias, 60 caprinos F2 oriundos do cruzamento de animais ? Saanen e ? Anglo-nubiano foram mantidos em uma mesma ?rea de pastagem cultivada irrigada de capim Tanz?nia (Panicum maximum Jacq. Cv Tanz?nia). A cada sete dias, fezes e sangue foram coletados para contagem de ovos por grama de fezes (OPG), coproculturas, contagem de eosin?filos, determina??o de volume globular e prote?na plasm?tica total, respectivamente. No mesmo dia das coletas, os animais foram pesados e avaliados quanto ao escore da condi??o corporal e grau de anemia com aux?lio no cart?o FAMACHA. Com base na m?dia de OPG, os doze animais com as maiores m?dias de OPG (grupo suscept?vel) e os doze animais com as menores m?dias de OPG (grupo resistente) foram identificados e selecionados para serem abatidos e necropsiados para a recupera??o, contagem e identifica??o dos parasitos presentes. Os animais pertencentes ao grupo resistente apresentaram menor m?dia de OPG (P<0,0001) e 4,7 vezes menos parasitos adultos do que os animais do grupo suscept?vel. O grupo resistente obteve maior m?dia de volume globular (26,48%) e prote?na plasm?tica total (6,24 g/dl) do que os animais suscept?veis (24,04% e 5,82g/dl, respectivamente). A m?dia de eosin?filos foi semelhante nos dois grupos .O g?nero Haemonchus foi o mais prevalente a nas coproculturas, seguido por Trischostrongylus e Oesophagostomum. A contagem de nematoides foi maior no abomaso do grupo suscept?vel do que no grupo resistente. As esp?cies identificadas foram H. contortus no abomaso e T. colubriformis no intestino delgado. Conclui-se que OPG, volume globular e prote?na plasm?tica total foram marcadores fenot?picos eficientes para identificar animais resistentes e suscept?veis ?s infec??es causadas por nematoides gastrintestinais

Os nematoides que atualmente tem sido classificados como P. coffeae, demonstram ampla variabilidade morfológica, molecular e quanto à reação à diferentes hospedeiros. Por conseguinte, é essencial que se identifique corretamente as espécies e que se conheça a capacidade de parasitismo em alguns hospedeiros, para que se possa estabelecer medidas de controle e estimar eventuais riscos da entrada de um patógeno em uma área com hospedeiro suscetível. Neste sentido, a presente pesquisa propõe, numa primeira parte, uma medida de controle de P. jaehni (K5), que é muito agressivo à cafeeiro arábico, baseada no uso de plantas má hospedeiras. Na segunda parte deste trabalho é realizada uma caracterização da reação de diferentes espécies vegetais à quatro populações de Pratylenchus spp. Em virtude do exposto, este estudo objetivou avaliar a reação de diferentes cultivares de feijoeiro comum frente à P. jaehni (K5), visando seu possível uso no manejo de áreas cafeeiras infestadas e caracterizar a reação de diferentes espécies vegetais de importância econômica (café, porta-enxertos cítricos, banana e sorgo) frente à quatro populações de Pratylenchus spp. As populações inciais utilizadas nos experimentos variaram entre 180 e 200 nematóides. Em todos os experimentos, os nematóides foram extraídos das raízes pelo método de Coolen e D´Herde (1972) e, eventualmente, do substrato pelo método de Jenkins (1964). Foram realizados três ensaios: i) o primeiro com feijoeiro comum, onde todas as cultivares utilizadas foram resistentes à P. jaehni (K5), inclusive na réplica; ii) o segundo com porta-enxertos cítricos, no qual somente o limão-cravo foi hospedeiro de P. jaehni (K5); iii) o terceiro, no qual foi utilizado café, limão-cravo, banana e sorgo para o conhecimento das respectivas reações frente à 4 populações de Pratylenchus spp. Neste último experimento ocorreu uma reação hospedeira diferenciada para cada população. De acordo com os resultados, concluise que as cultivares de feijoeiro comum utilizadas apresentam potencial de uso em áreas cafeeiras infestadas por P. jaehni (K5), em consórcio ou em áreas de renovação de cafezal, e que as populações de Pratylenchus spp. são capazes de se reproduzir de forma diferenciada frente às espécies vegetais testadas. / Nematode populations that have been classified as P. coffeae show wide morphological, molecular and host range variability. Therefore, is essential the correct identification of the species and the knowledge about its parasitism capacity on some hosts, to ensure appropriate control measures and to estimate the entry risks of a pathogen in an area with susceptible host. In this sense, the present research report, firstly, propose a control measure of P. jaehni (K5), which is very aggressive to the arabic coffee, based on the use of poor host plants. In the second part, was carried out a host status evaluation of different plant species to four populations of Pratylenchus spp. In this context, were evaluated the reaction of different common bean cultivars to P. jaehni (K5), for its possible use in management of coffee areas infested with this nematode, and characterized the response of different economic important plant species (coffee, citrus rootstocks, banana and sorghum) to four populations of Pratylenchus spp (IB01P, IB02P, K5 e C1). The initial population used in experiments ranged between 180 and 200 nematodes. In all experiments, nematodes were extracted from roots by Coolen e D\'Herde´s method (1972) and eventually from the substrate by Jenkins´ method (1964). Three assays were conducted and results was as following: i) in the first one, with common bean, all tested cultivars were resistant to P. jaehni (K5), including the replica; ii) in the second one, with rootstocks, only rangpur lime was a good host of P. jaehni (K5); iii) in the third one, in which was used coffee, rangpur lime, banana and grain sorghum, was observed a differential host reaction for each nematode population evaluated. According to the present results, we suggest that common bean cultivars tested have great potential for use, or in intercropping or in crop rotation, in coffee areas infested by P. jaehni (K5) and populations of Pratylenchus spp. have different reproductive fitness in the plants species tested.

Os nematoides que atualmente tem sido classificados como P. coffeae, demonstram ampla variabilidade morfológica, molecular e quanto à reação à diferentes hospedeiros. Por conseguinte, é essencial que se identifique corretamente as espécies e que se conheça a capacidade de parasitismo em alguns hospedeiros, para que se possa estabelecer medidas de controle e estimar eventuais riscos da entrada de um patógeno em uma área com hospedeiro suscetível. Neste sentido, a presente pesquisa propõe, numa primeira parte, uma medida de controle de P. jaehni (K5), que é muito agressivo à cafeeiro arábico, baseada no uso de plantas má hospedeiras. Na segunda parte deste trabalho é realizada uma caracterização da reação de diferentes espécies vegetais à quatro populações de Pratylenchus spp. Em virtude do exposto, este estudo objetivou avaliar a reação de diferentes cultivares de feijoeiro comum frente à P. jaehni (K5), visando seu possível uso no manejo de áreas cafeeiras infestadas e caracterizar a reação de diferentes espécies vegetais de importância econômica (café, porta-enxertos cítricos, banana e sorgo) frente à quatro populações de Pratylenchus spp. As populações inciais utilizadas nos experimentos variaram entre 180 e 200 nematóides. Em todos os experimentos, os nematóides foram extraídos das raízes pelo método de Coolen e D´Herde (1972) e, eventualmente, do substrato pelo método de Jenkins (1964). Foram realizados três ensaios: i) o primeiro com feijoeiro comum, onde todas as cultivares utilizadas foram resistentes à P. jaehni (K5), inclusive na réplica; ii) o segundo com porta-enxertos cítricos, no qual somente o limão-cravo foi hospedeiro de P. jaehni (K5); iii) o terceiro, no qual foi utilizado café, limão-cravo, banana e sorgo para o conhecimento das respectivas reações frente à 4 populações de Pratylenchus spp. Neste último experimento ocorreu uma reação hospedeira diferenciada para cada população. De acordo com os resultados, concluise que as cultivares de feijoeiro comum utilizadas apresentam potencial de uso em áreas cafeeiras infestadas por P. jaehni (K5), em consórcio ou em áreas de renovação de cafezal, e que as populações de Pratylenchus spp. são capazes de se reproduzir de forma diferenciada frente às espécies vegetais testadas. / Nematode populations that have been classified as P. coffeae show wide morphological, molecular and host range variability. Therefore, is essential the correct identification of the species and the knowledge about its parasitism capacity on some hosts, to ensure appropriate control measures and to estimate the entry risks of a pathogen in an area with susceptible host. In this sense, the present research report, firstly, propose a control measure of P. jaehni (K5), which is very aggressive to the arabic coffee, based on the use of poor host plants. In the second part, was carried out a host status evaluation of different plant species to four populations of Pratylenchus spp. In this context, were evaluated the reaction of different common bean cultivars to P. jaehni (K5), for its possible use in management of coffee areas infested with this nematode, and characterized the response of different economic important plant species (coffee, citrus rootstocks, banana and sorghum) to four populations of Pratylenchus spp (IB01P, IB02P, K5 e C1). The initial population used in experiments ranged between 180 and 200 nematodes. In all experiments, nematodes were extracted from roots by Coolen e D\'Herde´s method (1972) and eventually from the substrate by Jenkins´ method (1964). Three assays were conducted and results was as following: i) in the first one, with common bean, all tested cultivars were resistant to P. jaehni (K5), including the replica; ii) in the second one, with rootstocks, only rangpur lime was a good host of P. jaehni (K5); iii) in the third one, in which was used coffee, rangpur lime, banana and grain sorghum, was observed a differential host reaction for each nematode population evaluated. According to the present results, we suggest that common bean cultivars tested have great potential for use, or in intercropping or in crop rotation, in coffee areas infested by P. jaehni (K5) and populations of Pratylenchus spp. have different reproductive fitness in the plants species tested.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The production expansion areas of soybean monoculture system result in increased fertilizers and pesticides application, and the intensification of some phytosanitary problems such as the damage caused by plant-parasitic nematodes. The arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) increase plant growth and reduce the problems caused by nematodes in soybean. The objective of this work was to study the effect of arbuscular mycorrhizal fungi Rhizophagus clarus in the growth of soybean plants and the nematode Pratylenchus brachyurus suppression. Two trials were conducted in a greenhouse. In the first experiment evaluated the growth of soybeans in the presence and absence of the mycorrhizal fungus R. clarus. In the second trial was carry out the damage caused by the P. brachyurus in soybean grown in the presence and absence of R. clarus. In soybean flowering period evaluated the height, stem diameter, the dry matter of root and shoot, nodulation, the relative chlorophyll index, the nutrient content of the plant tissue, the number of the nematode in soil and penetrated to the root system, the reproduction factor of the nematode, the number of fungal spores in the soil and mycorrhizal colonization of roots. The results showed that mycorrhiza increased the growth, nodulation and nutrient uptake of soybean plants grown in soil with or without nematode. The mycorrhizal colonization reduced the penetration of the nematode in soybean roots, despite the greater number of nematodes in the soil. The presence of the nematode influenced mycorrhizal colonization of soybean plants. The use of sustainable management practices that favor the populations of AMF in the soil, can be a strategy for increasing and/or maintaining crop yields and reducing the affect caused by the P. brachyurus. / A expansão das áreas de produção e o sistema de monocultivo da soja resultam no aumento da aplicação de fertilizantes e agrotóxicos, e na intensificação de alguns problemas fitossanitários, como os danos causados pelos fitonematoides. Os fungos micorrízicos arbusculares podem contribuir para aumentar o crescimento das plantas e reduzir os problemas causados pelos nematoides na cultura da soja. O objetivo do presente trabalho foi estudar o efeito do fungo micorrízico arbuscular Rhizophagus clarus no crescimento das plantas de soja e na supressão do nematoide Pratylenchus brachyurus. Dois ensaios foram conduzidos em casa de vegetação. No primeiro ensaio foi avaliado o crescimento da soja na presença e na ausência do fungo micorrízico R. clarus. No segundo ensaio foi avaliado os danos causados pelo nematoide P. brachyurus na cultura da soja cultivada na presença e na ausência do R. clarus. No período de florescimento da soja avaliou-se a altura, o diâmetro de colmo, a fitomassa da parte aérea e radicular, a nodulação, o índice relativo de clorofila, o teor de nutrientes do tecido vegetal, o número de P. brachyurus no solo e penetrados no sistema radicular, o fator de reprodução dos nematoides, o número de esporos fúngicos no solo e a colonização micorrízica das raízes. Os resultados demonstraram que a micorrização aumentou o crescimento, a nodulação e a absorção de nutrientes das plantas de soja, cultivadas em solo com ou sem o nematoide. A colonização micorrízica reduziu a penetração do P. brachyurus nas raízes da soja, apesar do maior número de nematoides no solo. A presença do nematoide influenciou a colonização micorrízica das plantas de soja. A adoção de práticas de manejo sustentáveis que favoreçam as populações de FMAs no solo, pode ser uma estratégia para o aumento e/ou manutenção da produtividade das lavouras e redução dos danos causado pelo P. brachyurus.