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Caractérisation de la principale cible thérapeutique du cytomégalovirus humain l'ADN polymérase UL54

Picard-Jean, Frédéric January 2008 (has links)
Le cytomégalovirus humain (CMV) est un Herpèsvirus causant une infection latente chez 60% à 70% des nords-américains. Sa primo-infection chez les nouveaux-nés et sa réactivation chez les individus immunodéprimés sont associées à de nombreux cas de morbidité et de mortalité. Le traitement des infections au CMV est compliqué par l'absence de vaccin et le nombre restreint de drogues homologuées. Ces dernières sont malheureusement issues de vieilles générations de composés, et sont associées à une activité modérée, à une importante toxicité, et à l'apparition fréquente de résistance au traitement. Ces composés ciblent tous l'ADN polymérase virale, et inhibent ainsi la réplication du virus. Cependant, comparativement aux autres polymérases virales, cette enzyme est bien peu caractérisée, ce qui limite le développement de composés thérapeutiques de seconde génération plus efficaces, moins toxiques et moins sujets à l'apparition de résistance virale. Ayant entendu ce signal d'alarme, nous avons entrepris de caractériser la principale cible thérapeutique du cytomégalovirus humain, son ADN polymérase. Le gène UL54 du CMV code une protéine de 1242 acides aminés et qui est connue pour être la sous-unité catalytique de l'ADN polymérase virale. Malheureusement, sa grande taille a longtemps limité son expression et sa caractérisation. En nous concentrant sur les régions importantes pour son activité, nous avons généré une protéine un peu plus courte, mais toujours catalytiquement active. Nous avons ainsi pu exprimer, pour la première fois, une grande quantité de protéines UL54, ce qui nous a permis de caractériser en détails sa liaison avec ses deux substrats principaux, soit l'ADN et les dNTP. L'emploi de la spectroscopie à fluorescence nous a permis de suivre la liaison de UL54 à ses substrats, en quantifiant l'impact de la liaison de ces derniers sur la fluorescence intrinsèque du tryptophane de UL54. Nous avons ainsi pu établir que les constantes de dissociation de UL54 pour l'ADN et pour les dNTP étaient respectivement de 48[micro]M et de 15[micro]M. Notre étude révèle qu'un substrat d'ADN aussi petit que 6nt peut lier la protéine. Nous avons aussi démontré que UL54 lie aussi bien l'ADNsb que l'ADNdb, et que cette liaison semble séquence indépendante. De plus, la protéine est incapable de discriminer entre un substrat d'ADN et un d'ARN. Le profil thermodynamique de la liaison à l'ADN et aux dNTP a été établi et révèle deux modes de liaison distincts. La liaison de l'ADN est propulsée par l'enthalpie et est fort probablement associée à la relâche de molécules d'eau au solvant. Les interactions hydrophobes et d'empilement représentent les forces majeures stabilisant la liaison, alors que les interactions électrostatiques sont presque négligeables. À l'inverse, la liaison de UL54 au dNTP est propulsée par l'enthalpie, et la stabilisation de la liaison est associée davantage aux interactions électrostatiques, à des ponts hydrogènes et aux forces de van der Waal's. Des essais de dichroïsme circulaire, une seconde technique optique qui peut générer une représentation des structures secondaires et tertiaires d'une protéine, indique que, suite à la liaison de l'ADN, la protéine UL54 opère un changement de conformation, et qu'elle en subit un second suite à la liaison d'un dNTP, ce qui est cohérent avec les changements de conformation observés chez d'autres polymérases mieux caractérisées. Quelques expériences complémentaires sont aussi présentées. Enfin, comme les résistances aux traitements sont un enjeu majeur, et qu'elles sont créées par des erreurs de UL54, l'élaboration d'une démarche expérimentale visant à établir la fidélité de cette protéine est décrite en détail. Nous sommes confiants qu'une telle étude sur la caractérisation biochimique de la principale cible pharmacologique du CMV contribuera au développement rationnel de nouvelles générations de drogues anticytomégaloviriques efficaces.
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Modélisation de la sécurité des tâches coopératives humain-robot

Tarbouriech, Sonny January 2016 (has links)
L’interaction physique humain-robot est un domaine d’étude qui s’est vu porter beaucoup d’intérêt ces dernières années. Une optique de coopération entre les deux entités entrevoit le potentiel d’associer les forces de l’humain (comme son intelligence et son adaptabilité) à celle du robot (comme sa puissance et sa précision). Toutefois, la mise en service des applications développées reste une opération délicate tant les problèmes liés à la sécurité demeurent importants. Les robots constituent généralement de lourdes machines capables de déplacements très rapides qui peuvent blesser gravement un individu situé à proximité. Ce projet de recherche aborde le problème de sécurité en amont avec le développement d’une stratégie dite "pré-collision". Celle-ci se caractérise par la conception d’un système de planification de mouvements visant à optimiser la sécurité de l’individu lors de tâches d’interaction humain-robot dans un contexte industriel. Pour ce faire, un algorithme basé sur l’échantillonnage a été employé et adapté aux contraintes de l’application visée. Dans un premier temps, l’intégration d’une méthode exacte de détection de collision certifie que le chemin trouvé ne présente, a priori, aucun contact indésirable. Ensuite, l’évaluation de paramètres pertinents introduit notre notion de sécurité et définit un ensemble d’objectifs à optimiser. Ces critères prennent en compte la proximité par rapport aux obstacles, l’état de conscience des êtres humains inclus dans l’espace de travail ainsi que le potentiel de réaction du robot en cas d'évènement imprévu. Un système inédit de combinaison d’objectifs guide la recherche et mène à l’obtention du chemin jugé comme étant le plus sûr, pour une connaissance donnée de l’environnement. Le processus de contrôle se base sur une acquisition minimale de données environnementales (dispositif de surveillance visuelle) dans le but de nécessiter une installation matérielle qui se veut la plus simple possible. Le fonctionnement du système a été validé sur le robot industriel Baxter.
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Interaction humain-robot par la voix avec traitement des émotions du locuteur

Brodeur, David January 2016 (has links)
Un robot social doit être capable d'interagir avec des humains. Pour cela, il est essentiel de savoir communiquer de façon naturelle. L'audition artificielle appliquée en robotique est une approche intéressante puisque la voix est le principal mécanisme de communication des humains entre eux. Au-delà des mots prononcés, il est aussi important de savoir y décoder le contenu paralinguistique qui donne beaucoup de renseignements sur le locuteur. Entre autres, les émotions véhiculées dans la voix du locuteur peuvent aider un robot à comprendre une situation, à savoir si une personne est satisfaite ou non de son travail, si une personne a peur, etc. Pour qu'une interaction par la voix avec un robot soit fonctionnelle et intéressante pour le locuteur, plusieurs éléments matériels et logiciels sont nécessaires. L'interaction doit aussi tenir compte de certaines règles de conduite qui facilitent les échanges d'information et la compréhension lors d'un dialogue. Ce mémoire présente donc un système d'interaction humain-robot par la voix qui intègre ces éléments dans une même plateforme. Il utilise 8SoundsUSB et le système ManyEars pour faire l'acquisition et le prétraitement du signal audio. Un détecteur d'activité vocale vient ensuite distinguer le bruit stationnaire ambiant des sources sonores représentant la voix. Une fois le signal de la voix récupéré, il est analysé pour en décoder les mots prononcés et l'émotion. La reconnaissance de la parole est effectuée à partir de l'outil Google Speech API. La reconnaissance des émotions par la voix est basée sur l'algorithme de [Attabi et Dumouchel, 2013] qui utilise les Anchor Models, et caractérise les émotions perçues en trois catégories : neutre, négatif ou positif. Une nouvelle implémentation de cet algorithme a été validée en simulation, puis dans des essais en temps-réel. Le logiciel Palaver [McClain, 2013] permet ensuite d'interpréter les mots et les émotions en les associant à une réponse que le robot peut prononcer à l'aide d'un module de synthèse vocale. Enfin, le gestionnaire de dialogues Disco [Rich et Sidner, 2012] est utilisé afin de réaliser des interactions plus soutenues sur un même sujet. L'objectif final du projet est de vérifier si l'ajout de la capacité à percevoir les émotions dans la voix améliore l'interaction humain-robot. Pour cela, une interface graphique utilisant des concepts de la bande-dessinée a été développée afin d'illustrer de manière intégrée le contenu linguistique et le contenu paralinguistique détecté. Les résultats d'une étude réalisée auprès de 30 participants suggèrent que l'interaction humain-robot est plus appréciée lorsque le système reconnaît les émotions que lorsqu'il ne les reconnaît pas. Le projet a aussi permis d'identifier des éléments qui permettraient une meilleure intégration des différents éléments du système. Entre autres, l'amélioration du modèle des émotions doit passer par une base de données de voix locales plus grande et annotée par un plus grand nombre de personnes.
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Rôle du polymorphisme du papillomavirus humain de type 33 (VPH-33) dans le cancer du col de l'utérus

Soraya, Khouadri January 2006 (has links)
Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.
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Accès à un emploi correspondant aux attentes : le cas des nouveaux immigrants du Québec

Chérifi, Rachida January 2007 (has links)
Mémoire numérisé par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal.
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Caractérisation génétique et étude de l'antibiorésistance d'isolats de Campylobacter retrouvés chez le porc, la volaille et l'humain

Guévremont, Èvelyne January 2004 (has links)
Thèse numérisée par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.
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L'épreuve du vivant : nature et écriture au XXe siècle

Laberge-Bélair, Isabelle January 2007 (has links)
Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.
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Évolution de la charge virale et de l'intégration de HPV-16 dans les maladies précancéreuses du col utérin

Fontaine, Julie January 2004 (has links)
Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.
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Interaction entre capital humain et émigration : le cas du Liban / Interaction between human capital and migration : the case of Lebanon

Taghlobi, Mohamad 25 September 2012 (has links)
Cette thèse travail s'articule autour des deux phénomènes : le capital humain et la migrationdes qualifiés. Les arguments consolidant le choix de cette interaction tiennent d'une part au constat selonlequel le capital humain constitue pour le Liban la seule matière première parce qu'il nedispose pas de ressources naturelles ni d'autres matières premières pouvant favoriser sondéveloppement; et d'autre part à la fatalité d'émigrer en l'absence de débouchés.La thèse est composée de trois parties. Dans la première partie, sont extraits de l'abondantelittérature les principaux traits liés au capital humain tels que son apport à l'accroissement ducapital et de la production de long terme et donc à la croissance du pays considéré; sont étayéspar la suite les motivations de la fuite des cerveaux et leurs effets sur les pays de départ(développé) et d'accueil (sous développé).La deuxième partie est destinée à décrire dans l'économie libanaise, les facteurs de générationdu capital, les niveaux d'emploi des qualifiés et l'émigration des qualifiés.La troisième partie est consacrée au modèle qui combine ces deux phénomènes en vue demettre en relief leur interaction. Ce modèle s'inscrit dans le cadre des travaux traitant dudrainage des cerveaux à l'aide d'une économie à générations imbriquées où sont représentésles choix des consommateurs et ceux du producteur, il met l'accent sur la divergence d'intérêt,vis à vis des migrants qualifiés, entre les pays source d'émigration et les pays d'accueil.Ce modèle a le mérite de relier les effets micro-économiques caractérisés par un choixindividuel de se former et/ou de migrer aux conséquences macro-économiques du mouvementmigratoire qui en résultent en analysant les revenus des agents, leur niveau d'emploi, le stockde capital et la production de long terme, et le bien être collectif.La résolution du modèle donne la quantité optimale de cette migration sélective. Cettequantité est explicitée pour les pays de départ et d'accueil dans une optique de long termeselon des situations de concurrence pure et parfaite et de syndicalisation des qualifiés. Les résultats numériques obtenus confirment clairement le constat suivant : les pays d'accueilreceveur d'immigrants qualifiés en bénéficie nettement, tandis que le pays source convoyeurd'émigrants se soumet à une ponction de l'un de ses facteurs les plus productifs. Ces résultatspermettent en outre de dresser pour les deux pays un tableau comparatif des salaires, desniveaux d'emploi, des biens être individuels et collectifs, du capital et du produit.Les différentes comparaisons établies des valeurs numériques laissent présager un moyend'action par le décideur politique du pays source d'émigration, en vue d'atténuer les effetsnéfastes de cette fuite des cerveaux. Ce moyen peut se réaliser, d'une part, grâce à despolitiques favorables à l'organisation des qualifiés au sein d'un groupe de pression ; et d'autrepart, en orientant l'émigration des qualifiés vers les pays dont l'économie est la plus libérale. / This thesis focuses on two phenomena: human capital and skilled migration.Such a choice is consolidated by the observation that on the one hand, humancapital is for Lebanon the only raw material given that it has no other resourcesof any kind that can promote its development, and on the other hand theinevitability of migration in the absence of opportunities.This thesis consists of three parts. In the first one, we extract from the abundantliterature the main features related to human capital, such as its contribution tothe growth of long-term capital and long-term production and therefore thegrowth of the considered country. Then, we study in detail the motivations ofbrain drain and its impact on source countries (underdeveloped) and hostcountries (developed).The second part is intended to describe in the Lebanese economy, factors ofgeneration of human capital, skilled employment levels, and skilled workersemigration.The third part is devoted to a model that combines these two phenomena inorder to highlight their interaction. This model is part of the work dealing withbrain drain using an overlapping generation economy in which are representedthe choices of consumers and producers. This model emphasizes the divergenceof interest towards skilled migrants, between source of emigration and hostcountries.This model has the merit of linking microeconomic effects characterized by anindividual choice of training to become skilled and of migrating, to themacroeconomic consequences of migratory movements, through an analysis ofagents' income and their employment level, long-term capital stock, long-termproduction, and welfare.Resolving the model gives the optimal quantity of this selective migration. Thisquantity is made explicit for source and host countries in a long-term perspectivefollowing pure and perfect competition situation and unionization of skilledworkers.The numerical results clearly confirm the following observation: the hostcountry clearly benefits from these skilled immigrants while the source countryis subject to the drain of one of its most production factors. These results alsoallow us to make for both countries a comparison of wages, employment levels,individual and collective welfare, capital and product.Comparisons of different numerical values suggest a means of action by thepolicymaker in the source country to mitigate the negative effects of the braindrain. This method can be achieved, on the one hand, through policiesfavourable to the qualified organization within a pressure group, and on theother hand, by directing skilled emigration to countries whose economy is mostliberal.
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Mise au point et validation de protocoles de cryoconservation du tissu ovarien humain / Development and validation of cryopreservation protocols of human ovarian tissue

Sanfilippo, Sandra 12 October 2012 (has links)
La cryoconservation du tissu ovarien (CTO) permet aujourd'hui de préserver la fertilité des femmes et jeunes filles devant subir un traitement potentiellement gonadotoxique ou souffrant de pathologie à l'origine d'une insuffisance ovarienne prématurée. En vue d'optimiser les procédures de CTO, l'objectif de notre travail a porté d'une part sur la validation d'un protocole original de congélation lente du tissu ovarien applicable en thérapeutique et d'autre part, sur le développement d'un protocole de vitrification. L'analyse statique du tissu ovarien congelé selon notre protocole de congélation lente montre des résultats similaires en comparaison à ceux obtenus avec le tissu frais en termes de qualité des follicules et de l'endothélium vasculaire ovarien. Néanmoins, le stroma semble plus sensible aux effets délétères de la congélation. L'analyse fonctionnelle montre que le tissu ovarien congelé/décongelé présente une folliculogenèse active après 12 jours de culture in vitro. Les mesures des concentrations en oestradiol dans les milieux de culture et l'étude immunohistochimique du facteur de prolifération PCNA (proliferating cell nuclear antigen) témoignent en effet de l'activité fonctionnelle des follicules décongelés en culture. Dans un second temps, nous avons développé un protocole de vitrification du tissu ovarien. Pour évaluer son efficacité, nous avons réalisé une analyse statique du tissu ovarien vitrifié selon ce protocole versus notre protocole de congélation lente validé. Les résultats obtenus ne montrent aucune différence significative entre les deux méthodes, en termes de préservation de la morphologie et de l'intégrité nucléaire des follicules et du stroma ovarien. En conclusion, notre protocole de congélation lente préserve la qualité des différents compartiments constituant le tissu ovarien et la fonctionnalité de ce tissu. Ces données viennent compléter des travaux préliminaires de l'équipe et permettent de valider ce protocole envisageable maintenant en thérapeutique. La procédure de vitrification développée présente une efficacité similaire à la procédure de congélation lente en termes de préservation de la qualité des follicules et du stroma ovarien. Néanmoins, il serait nécessaire de poursuivre l'étude de l'efficacité de ce protocole par une analyse fonctionnelle. / No abstract available

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