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Hipersensibilidade e resistencia sistemica adquirida em feijoeiro moruna NC, induzidas pelo virus do mosaico do feijoeiro do sul dos EUA

Rocha, Andrea Brondani da 19 June 2000 (has links)
Orientador: Jorge Vega / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-26T04:18:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rocha_AndreaBrondanida_D.pdf: 12961975 bytes, checksum: e6c9f9fee433398c749a5c14f022d096 (MD5) Previous issue date: 2000 / Resumo: As plantas podem ficar sistemicamente protegidas contra diversas moléstias através de uma inoculação prévia com patógenos causadores de necrose. Este fenômeno é conhecido como resistência sistêmica adquirida. O envolvimento de vários mecanismos na indução da resistência adquirida tem sido sugerido. Entre eles estão a resposta de hipersensibilidade, aumento na atividade da peroxidase, e o aumento no conteúdo de ácido salicílico nas folhas resistentes. Esta tese teve como objetivos caracterizar o fenômeno da resistência adquirida em plantas de feijoeiro Moruna nc inoculadas com o vírus VMFS-EUA, quanto à ocorrência da reação de hipersensibilidad e; efeito do número de lesões necróticas necessárias para a indução da resistência; efeito de condições ambientais (radiação e temperatura), duração do fenômeno e efeito da nodulação por Rhizobium tropici; avaliar os processos bioquímicos envolvidos na resistência adquirida, tais como peroxidação de lipídeos, atividade enzimáticas (catalase, peroxidase e fenilalanina amônia-liase) e o envolvimento do ácido salicílico; e estudar o efeito da aplicação de citocininas, ácido salicílico e benzotiadiazole sobre a resposta de hipersensibilidade e a expressão da resistência sistêmica adquirida. Para tanto, na maioria dos experimentos (exceção aos experimentos em que foi estudada a influência do número de lesões ocorridas na indução na expressão da resistência), o feijoeiro Moruna nc foi inoculado na folha primária com o vírus VMFS-EUA purificado, na concentração de 10 ~glmL. Geralmente a reação de hipersensibilidade ocorreu 72 horas após esta inoculação (inoculação de indução). A planta inoculada recebeu outra inoculação ( de desafio) com a mesma concentração de VMFS-EUA, na 23 folha trifoliolada. Quatro dias após esta última inoculação, foram realizados os ensaios enzimáticos e as outras determinações bioquímicas em ambas as folhas, induzi da e desafiada. Nos experimentos em que foi estudada a influência do número de lesões ocorridas na indução na expressão da resistência adquirida, verificou-se que o aumento na concentração viral de 1,7 para 20 JlglrnL durante a inoculação de indução resultou em menos lesões ocorridas no desafio, tanto nos experimentos realizados em casa de vegetação como em câmara de crescimento. As mudanças realizadas experimentalmente na radiação luminosa incidente não resultaram em alterações na expressão da resistência adquirida. No entanto, a aumento na temperatura de 20°C para 30°C causou uma redução no número e tamanho de lesões ocorridas no desafio. De um modo geral, a resistência adquirida teve duração de 13 a 22 dias após a indução da mesma. Não foi observado efeito da nodulação na expressão da resistência adquirida. Malondialdeído, um produto da peroxidação de lipídeos, esteve relacionado com a resposta de hipersensibilidade. Não foi observado aumento na atividade da enzima catalase em relação à ocorrência de resistência adquirida. A atividade da peroxidase aumentou de aproximadamente 3 para 15 unidades (expressas em Mbs4701min.g massa fresca) durante a expressão da resistência sistêmica adquirida. A enzima fenilalanina amônia-liase (P AL) também apresentou aumento de atividade nas plantas que estavam expressando resistência (uma média de 7 UA.2901h. g massa fresca x100. nas folhas não induzi das e 27 U.A.290/h.g massa fresca x 100 nas folhas com resistência adquirida). O conteúdo de ácido salicílico nasfolhas com resistência induzida aumentou mais de 30 vezes durante a ocorrência da resistência no feijoeiro Moruna nc. O tratamento de aplicação de citocinina permitiu maior replicação viral, monitorada pelo teste PT A-ELISA, tanto nas plantas de uma variedade que permite a invasão sistêmica (cultivar Jalo), como na variedade Moruna nc. Já as folhas tratadas com ácido salicílico apresentaram redução na replicação viral. A aplicação do ácido salicílico induziu resistência sistêmica a partir de doze horas após sua aplicação, evidenciada pela redução de 15lesõeslcm2 de folha, no controle, para 2 lesõeslcm2 de folha nas folhas tratadas. O benzotiadiazole (sob a forma do produto comercial BION), produto indutor de resistência análogo ao ácido salicílico, induziu resistência nos feijoeiros quando aplicado nas doses de 2,5 e 5 g/100L. Doses maiores do produto causaram sintomas de toxidez nas plantas. Peroxidase teve sua atividade aumentada nas plantas tratadas com o produto, mas a enzima P AL não apresentou tal comportamento. O produto conferiu resistência às plantas durante o período de nove dias. O trabalho permite concluir que o número e tamanho das lesões causadas pelo VMFS EUA na indução foram afetados pela temperatura, e foram fatores determinantes para a ocorrência da resistência adquirida. As enzimas peroxidase e P AL foram associadas aos processos bioquímicos que possibilitaram a ocorrência da resistência sistêmica. O ácido salicílico também esteve envolvido na expressão de resistência sistêmica adquirida em plantas de feijoeiro Moruna nc inoculadas com VMFS-EUA / Abstract: Plants can be systemically protected against diseases by prior inoculation with necrotizing pathogens or physiologicallbiochemical stresses. This phenomenon has been tenned systemic acquired resistance (SAR). Several mechanisms have been suggested to contribute to plant induced resistance. They inc1ude the hypersensitive response (HR), enhanced systemic extracellular peroxidase activity, and the involvement of salicylic acid. The purposes of this work were to characterize SAR in Moruna bean inoculated with Southern Bean Mosaic Vírus (SBMV) in relation to the HR occurrence; study the effect of lesion number necessary to induce SAR; study the effects of light radiation and temperature; evaluate time extension and effect of Rhizobium tropici nodulation; study biochemical processes involved with SAR, such as lipid peroxidation, enzymatic activities (catalase, peroxidase, and P AL) and the involvement of salicylic acid; and finally study the effects of cytokinin, salicily acid and benzothiadiazole application in the HR and SAR expression. In most of the experiments (except for those where the effect of lesion number necessary to induce SAR was studied) Moruna bean was inoculated on the primary leaves with purified SBMV at the concentration of 1 O ~g/rnL. lt usually showed HR 72 hours after this inoculation. Inoculated plants were challenged with the same concentration of SBMV on the second trifoliate leaf. Four days after challenge, enzymatic assays and other biochemical assays were performed on both induced and challenged leaves. In the experiments where the effect of lesion number necessary to induce SAR was studied, increasing SBMV concentration ftom 1.7 to 20 ~glmL as the inducing inoculum resulted in the development of fewer lesions at cha1lenge in both greenhouse and growth chamber experiments. Changes in incident light radiation did not modify the pattem of SAR expression, but increase of temperature ftom 20°C to 30°C caused a reduction in both number and lesion size at challenge. In general, SAR was expressed during 13 to 22 days. No nodulation etfects were observed on the expression of SAR. Malondialdehyde, a product oflipid peroxidation, was associated with HR. No changes in catalase activity were observed in relation to SAR. Peroxidase activity increased ftom approximately 3 to 15 units (expressed in ~AbS4701min.g ftesh weight) during SAR expression. Phenylalanine ammonia-Iyase (P AL) also showed enhanced activity in the induced leaves (an average of7 U.A.2901 h. g ftesh weight xl00 in non-induced leaves, and 27 U.A.2901 h. g ftesh weight x 100 in SAR expressing leaves). Salicylic acid content on the induced leaves increased up to 30 fold during SAR expression in Moruna bean. Leaves treated with cytokinin showed increased virus replication, measured by PT A ELISA, both for plants that permit systemic spread (Jalo) as for Moruna nc. On the other hand, leaves sprayed with salicylic acid presented less virus replication. Treatment with salicylic acid induced systemic resistance after 12 hours, showing a reduction ftom 15 lesions/cm2 (control) to 2lesionslcm2 (treated leaves). Benzothiadiazole (which commercial product is called BION), an analog of salicylic acid, induced resistance in bean when it was applied at 2.5 and 5 g/100 L. Higher amounts of this product were toxic to the plants. Peroxidase activity was higher in plants treated with BTH than in the control, but PAL did not show this increase in activity. Plants treated with BTH remained resistant to SBMV during 9 days. We conclude that number and lesion size caused by SBMV at induction were atfected by temperature, and were important for SAR occurrence. Extracellular peroxidase and P AL were associated with the biochemica1 processes leading to resistance. Salicylic acid was also related to induced resistance ofMoruna bean plants inoculated with SBMV / Doutorado / Doutor em Biologia Vegetal
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Análise de crescimento e tolerância a geadas de Eucalyptus dunnii Maiden e Eucalyptus benthamii Maiden et Cambage em função do porte das mudas e adubação /

Zimermann, Antônio Fernando, 1983-, Fenilli, Tatiele Anete Bergamo, 1976-, Universidade Regional de Blumenau. Programa de Pós-Graduação em Engenharia Florestal. January 2014 (has links) (PDF)
Orientador: Tatiele Anete Bergamo Fenilli. / Dissertação (mestrado) - Universidade Regional de Blumenau, Centro de Ciências Tecnológicas, Programa de Pós-Graduação de Engenharia Florestal.
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Resistência de genótipos de feijoeiro (Phaseolus vulgaris) a Bemisia tabaci (Gennadius, 1889) biotipo B (Hemiptera: Aleyrodidae) /

Barcelos, Paulo Henrique Soares January 2018 (has links)
Orientador: Arlindo Leal Boiça Júnior / Banca: Marina Robles Angelini / Banca: Ricardo Antonio Polanczyk / Resumo: O feijão é importante fonte de proteína é usado na alimentação humana em diversos países incluindo o Brasil, que é o terceiro maior produtor mundial desse grão. Fatores limitantes da produção são sérios problemas para os agricultores, nessa cultura dentre os principais destaca-se a incidência de Bemisia tabaci (Genn.) biótipo B. Este inseto suga a seiva das plantas e, além disso, transmite virus para a cultura, sendo o mais devastador o Bean golden mosaic virus (BGMV) no qual as perdas podem chegar até 100%. O presente trabalho teve por objetivo identificar genótipos de feijoeiro resistentes à B. tabaci biótipo B nas categorias por antibiose e antixenose para oviposição. Para isso, foram realizados três experimentos, desenvolvidos em laboratório e em casa-de-vegetação, avaliando-se 26 genótipos de feijoeiro. Inicialmente foi realizado o teste antibiose para seleção de 8 genótipos mais resistentes e alguns mais suscetíveis. Após a seleção, foi realizado o teste de antixenose para oviposição com e sem chance de escolha, em delineamento de blocos casualizados com 4 repetições. No primeiro teste as variáveis avaliadas foram: período de incubação dos ovos; viabilidade dos ovos; período ninfal; viabilidade ninfal; período da eclosão das ninfas a morte dos adultos; longevidade dos adultos. Nos outros dois testes foram avaliados o número de ovos por cm² em cada genótipo. Os dados foram submetidos aos testes de normalidade (Kolmogorov-Smirnov) e homocedasticidade (Bartlett), para veri... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Bean is an important protein source used in human food in several countries including Brazil, which is the third world's largest producer of this grain. Factors limiting production are serious problems for farmers. Among the main crops, the incidence of Bemisia tabaci (Genn.) b iotype B is highlighted. This insect sucks the sap from plants and, in addition, transmits viruses to the crop. the most devastating Bean golden mosaic virus (BGMV) in which losses can reach up to 100%. The present work had as objective to identify bean genotypes resistant to B. tabaci biotype B in the categories by antibiosis and antixenosis for oviposition. For this, three experiments were carried out, developed in the laboratory and in greenhouse, evaluating 26 bean genotypes. Initially the antibiosis test was performed to select 8 more resistant and some more susceptible genotypes. Aft er the selection, the antixenos is test for oviposition with and without chance of choice was carried out in a randomized complete block design with 4 replicates. In the first test the variables evaluated were: egg incubation period; egg viability; nymphal period; nymphal viability; peri od of the hatching of nymphs to death of adults; longevity of adults. In the other two tests the number of eggs per cm² in each genotype was evaluated. Data were submitted to normality tests (Kolmogorov - Smirnov) and homocedasticity (Bartlett), to verify th e need to transform the data, and, when necessary, the most appropriate one ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Comportamento alimentar de Bemisia tabaci biótipo B (Hemiptera : Aleyrodidae) em genótipos de soja na presença e ausência de silício /

Godoy, Ana Flávia, 1991. January 2017 (has links)
Orientador: Edson Luiz Lopes Baldin / Banca: João Roberto Spotti Lopes / Banca: André Luiz Lourenção / Resumo: A soja, [Glycine max (L.) Merrill], é um dos cultivos mais importantes para o Brasil, com alta produtividade e intensa participação no mercado externo. Seus grãos representam importante fonte nutricional para o homem e seus derivados são usados para alimentação animal ou mesmo na fabricação de energia renovável, na forma de biodiesel. No entanto, a produção desta leguminosa pode ser comprometida pelo ataque de insetos-praga, como a mosca-branca, Bemisia tabaci (Gennadius) biótipo B (Hemiptera: Aleyrodidae). Atualmente, este inseto é apontado como importante praga para a cultura da soja, devido às crescentes infestações e dificuldade no controle. Seu manejo é feito principalmente através de aplicações sucessivas de inseticidas sintéticos, as quais favorecem à rápida seleção de indivíduos resistentes. Desta forma, torna-se importante avaliar alternativas menos agressivas, alinhadas ao manejo integrado de pragas (MIP), com destaque para o uso de cultivares resistentes e indutores de resistência, como o silício. O monitoramento da alimentação de insetos sugadores por meio da técnica de EPG (Electrical Penetration Graph) tem auxiliado na caracterização de categorias e fatores de resistência de plantas frente ao ataque de insetos. Assim, neste trabalho, avaliou-se o comportamento alimentar de B. tabaci biótipo B em genótipos resistentes e suscetíveis de soja na presença e ausência de silício, utilizando-se EPG. Na primeira etapa, foram avaliados quatro genótipos de soja portadores ... / Abstract: Soybean, [Glycine max (L.) Merrill], is one of the most important crops for Brazil, with high productivity and strong participation in the foreign market. Soybeans represent important nutritional source for humans and their derivatives are used in animal nutrition or even renewable energy production, as biofuel. However, production of this crop may be affected negatively by the attack of insect pests, such as the whitefly, Bemisia tabaci (Gennadius) biotype B (Hemiptera: Aleyrodidae). This insect is currently indicated as an important pest for the soybean crop, due to the increasing infestations and difficulty in control. Its management is mostly done with successive spraying of synthetic insecticides that promote rapid selection of resistant individuals. Thus, it is important to evaluate less aggressive alternatives, aligned with the integrated pest management (IPM), with emphasis on the use of resistant cultivars and resistance inducers, as silicon. Monitoring sucking insects feeding using the EPG technique (Electrical Penetration Graph) has been helping in the characterization of categories and resistance factors of plants against insect attacks. In this study, the feeding behavior of B. tabaci biotype B was assessed in resistant and susceptible genotypes of soybean in the presence and absence of silicon using EPG. In the first stage, four genotypes of soybean bearers of different categories of resistance against the whitefly were assessed (KS-4202, tolerance; IAC-19, antixenosis; UX-2569-159, antibiosis e PI-227687, susceptible). At the same time, the types of trichomes present on the abaxial surface of the leaflets were characterized, in order to establish possible correlations with the feeding behavior of the whitefly. The results confirm the presence of antixenotic factors in the genotype IAC-19 (low duration of feeding in the phloem phase). ... / Mestre
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Metodologias de pesquisa e avaliação da resistência de genótipos de amendoim a Spodoptera albula (walker, 1857) (Lepidoptera: Noctuidae) /

Di Bello, Mirella Marconato. January 2015 (has links)
Orientador: Arlindo Leal Boiça Júnior / Banca: Raphael De Campos Castilho / Banca: José Roberto Scarpellini / Resumo: Tendo-se em vista a importância da espécie Spodoptera albula (Walker,1857) (Lepidoptera: Noctuidae) nos últimos anos devido aos prejuízos econômicos, causando desfolha na cultura do amendoim bem como a falta de informações a respeito de metodologias de criação e pesquisa em resistência de plantas a insetos, o objetivo do presente trabalho foi avaliar diferentes métodos e materiais visando os estudos de não preferência para alimentação e antibiose dessa espécie, utilizando-se de dietas artificiais e genótipos de amendoim. Os ensaios foram realizados em condições controladas (25 ± 2 ° C, 70 ± 10% umidade relativa e 12 horas de fotofase). Os experimentos iniciais foram para a adequação de uma metodologia de criação para S. albula. Foram avaliados os seguintes parâmetros biológicos: duração, sobrevivência e mortalidade das fases larval, pupal e larva a adulto; peso de lagartas aos 12 dias de idade; peso de pupa com 24 horas de idade; razão sexual; e longevidade dos adultos, em três dietas artificiais, diferentes densidades larvais, densidades de casais e tamanho de gaiolas para oviposição (para o teste de oviposição avaliou-se o número de posturas e de ovos). Observou-se que S. albula conseguiu completar seu ciclo biológico nas três dietas, entretanto, a dieta de Anticarsia gemmatalis Hübner foi a mais adequada para sua criação em laboratório, proporcionando desenvolvimento mais rápido e com maior sobrevivência em relação às demais. A individualização das lagartas de S. albula favoreceu seu desenvolvimento, permitindo maior ganho de peso e menor mortalidade. O tamanho da gaiola não influencia no número de ovos colocados pelas fêmeas, e o maior número de casais por gaiola não favoreceu um aumento da oviposição. Possíveis adequações a dieta escolhida são recomendadas para que a criação alcance maiores índices de sobrevivência. Quanto à metodologia de pesquisa em resistência... / Abstract: Taking into consideration the importance of Spodoptera albula (Walker, 1857) (Lepidoptera: Noctuidae) species in recent years due to the economic losses, caused defoliation in the peanut crop and the lack of rearing methodologies and research on host plant resistance information, the aim of this study was to evaluate different materials and methods aiming non-preference feeding and antibiosis of this species, using artificial diets and peanut genotypes. The assays were performed under controlled conditions (25 ± 2 ° C, 70 ± 10% relative humidity and 12 hours photophase). Initial experiments were to adjust a design methodology for S. albula. The following biological parameters were evaluated: larval, pupal and larval to adult phase duration, survival and mortality; 12 days old caterpillars weight; 24 hours old pupal weight; sex ratio; and longevity of adults, in three artificial diets, different larval densities, couples densities and cages size for oviposition (for the oviposition assay were evaluated the number of egg masses and eggs). S. albula managed to complete its life cycle in all three diets; however, the Anticarsia gemmatalis Hübner diet was the most suitable for laboratory rearing, providing faster development and higher survival rate in compare to the others. S. albula caterpillar's individualization favored its development, allowing greater weight gain and lower mortality. Cage size does not influence the number of eggs laid by the females, and the largest number of couples per cage did not favor an increase in oviposition. Possible adjustments in the chosen diet are recommended so the rearing can reach higher survival rates. As for research methodology in plant resistance the experiments evaluated the influence of these factors on the expression of non-feeding preference in runner growth habit genotypes IAC Runner 886 and straight growth habit IAC Tatu to S. albula in assays free-choice and no-choice feeding ... / Mestre
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Panorama transcricional sob controle da proteína LIMYB, um componente da via de defesa antiviral mediada por NIK1 / Transcriptional landscape under control of LIMYB protein, a component of the antiviral defense pathway mediated by NIK1

Teixeira, Ruan Maloni 20 July 2017 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-04-19T18:21:29Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 5916812 bytes, checksum: 639d6c03f1d6b4f272d2a161b0ecbfc4 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-19T18:21:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 5916812 bytes, checksum: 639d6c03f1d6b4f272d2a161b0ecbfc4 (MD5) Previous issue date: 2017-07-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A proteína LIMYB (L10-interacting MYB domain-containing protein) foi recentemente identificada como um componente downstrean da via de sinalização antiviral mediada pelo receptor NIK1 (Nuclear shuttle protein- interacring kinase 1). Diante da ativação de NIK1, LIMYB interage com RPL10 para reprimir a expressão de genes de proteínas ribossomais, levando a supressão global de tradução. Exceto pelos genes de proteínas ribossomais que são regulados por LIMYB, os demais alvos diretos de LIMYB em escala genômica não foram ainda determinados. Para determinar possíveis genes controlados por LIMYB e compreender sua função no desenvolvimento e nos processos coordenados pela regulação da tradução, foi avaliado o perfil transcricional de plantas overexpressando LIMYB, por RNA-seq e ChIP-seq. Nas análises por RNA-seq, foram identificados 2351 genes diferencialmente expressos, sendo que 1246 genes down regulados e 1105 genes up regulados, em plantas expressando ectopicamente LIMYB. Os estudos de ontologia gênica demonstraram que a categoria funcional mais enriquecida entre genes down regulados, de fato pertence aos constituintes ribossomais, enquanto que para genes up regulados foi notada uma categoria associada a resposta de níveis de nutrientes. Nas análises de ChIP-seq, o DNA associado à proteína foi fragmentado, imunoprecipitado e sequenciado, permitindo uma avaliação dos locais de ligação de LIMYB ao DNA nos respectivos genes sob controle da proteína. A análise integrativa de ChIP-seq e RNA-seq identificou 156 genes down regulados e destes, os constituintes ribossomais foram o grupo mais afetado, seguido por categorias relacionadas a metabolismo celular de aldeídos, fotossíntese e tradução. Nestas diversas categorias, foi possível identificar genes reprimidos por LIMYB e que também participam de processos de infecção viral, expandindo a atividade antiviral de LIMYB. Entre os genes reprimidos por LIMYB, foram identificados componentes chaves do aparato fotossintético sugerindo que LIMYB pode funcionar como um molecular link que sincroniza supressão de tradução e inibição de fotossíntese. Já no conjunto de genes up regulados, a categoria relacionada a transporte de ânions foi a mais enriquecida, seguida por categorias relacionadas a escassez de determinados compostos como fosfato e na resposta a estímulos internos e externos. A partir dos genes diferencialmente expressos para compreender sua função no desenvolvimento e nos processos coordenados a regulação da tradução na intercessão dos experimentos de ChIP-seq e RNA-seq, foram encontrados em maior significância 3 sequencias consensos, CAAAC, AAGAAA e ATATATA. A interação de LIMYB com promotores, reprimindo e ativando genes alvo, foi elucidada neste trabalho, através de análise de cobertura (co-localização RNA- seq/ChIP-seq), representando a proximidade dos picos com os respectivos genes, e pelo mapeamento das sequencias consensos nos promotores escolhidos. Estes resultados permitem uma melhor compreensão da função de LIMYB como um regulador capaz de gerenciar processos celulares em função da inibição da tradução global, durante o desenvolvimento e na defesa antiviral. / LIMYB (L10-interacting MYB domain-containing protein) was recently identified as a downstream component of the NIK1 (Nuclear shuttle protein-interacting kinase 1)-mediated antiviral signaling. Upon NIK1 activation, LIMYB interacts with RPL10 to repress the expression of ribosomal protein genes, leading to the global translation suppression. Apart from the LIMYB-mediated regulation of RP genes, the genome-wide direct target genes of LIMYB are unknown. To identify genes controlled by LIMYB towards understanding LIMYB function in development and in processes coordinated by translation regulation, we carried out a transcriptional profiling of LIMYB-overexpressing plants by RNA-seq and ChIP-seq. RNA-seq analyses revealed 1246 down-regulated genes and 1105 up- regulated genes in LIMYB-overexpressing plants. Gene enrichment analysis, based on gene ontology, demonstrated that the ribosomal constituent category was the most-enriched down-regulated functional term, whereas the most- enriched up-regulated term was associated with response to nutrient levels. For the chip-seq analysis, the DNA associated with the protein was fragmented, immunoprecipitated and sequencing, allowing the location of LYMIB association with DNA on the respective genes under control of LIMYB. The integrative analysis between ChIP-seq and RNA-seq identified 156 down-regulated genes, from which the ribosomal constituents were the group more affected, followed by categories related to aldehyde metabolism, photosynthesis and translation. Within these categories, we identified LIMYB-repressed genes unrelated to translation that also participate in viral infections, expanding the antiviral activity of LIMYB. Among the LIMYB-repressed genes, we also identified key components of the photosynthetic apparatus, suggesting that LIMYB may function as a molecular link, which synchronizes translation suppression and photosynthesis inhibition. Within the up-regulated genes, the anion transport term was the most enriched category, followed by phoshate deprivation-related category and response to internal and external stimuli. By analyzing the set of differentially expressed genes also found in ChIP-seq, the three consensus sequences CAAAC, AAGAAA and ATATATA were identified as the top-scoring motifs. The interaction of LIMYB with promoters, repressing and activating target genes, was elucidated by the coverage analysis (co-localization RNA-seq/ChIP- seq), mapping peaks from ChIP-seq and heats from RNA-seq within the gene locus. These results allowed a better understanding of the LIMYB function as a regulator of cell processes related to suppression of global translation, during development and antiviral defense.
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Impacto das mudanças climáticas na resistência de clones de eucalipto a Ceratocystis fimbriata

Favalessa, Marcilene 17 September 2014 (has links)
Submitted by Maykon Nascimento (maykon.albani@hotmail.com) on 2016-04-20T20:01:21Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertacao Marcilene Favalessa.pdf: 937770 bytes, checksum: 219a1b2d9eafc1c50ff427a4e769ec00 (MD5) / Approved for entry into archive by Patricia Barros (patricia.barros@ufes.br) on 2016-05-11T16:43:22Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertacao Marcilene Favalessa.pdf: 937770 bytes, checksum: 219a1b2d9eafc1c50ff427a4e769ec00 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-11T16:43:22Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertacao Marcilene Favalessa.pdf: 937770 bytes, checksum: 219a1b2d9eafc1c50ff427a4e769ec00 (MD5) / O eucalipto é uma das espécies florestais de importância comercial cultivada em vários países do mundo, possuindo ampla adaptabilidade ambiental, representando grande fonte de recursos financeiros para a economia do Brasil. A murcha de Ceratocystis fimbriata no eucalipto é uma das doenças que limitam o crescimento e a produtividade da cultura. O patossistema, bem como suas interações pode ser afetado pelas mudanças climáticas globais, principalmente com relação às alterações de temperatura e de dióxido de carbono (CO2). Diante desse contexto, o objetivo deste trabalho foi analisar o efeito do aumento da concentração de CO2 e da temperatura sobre o comportamento de dois clones de eucalipto com diferentes níveis de resistência a Ceratocystis fimbriata. O estudo foi desenvolvido em câmara de crescimento (“fitotron”) do Laboratório de Meteorologia e Ecofisiologia Florestal no Departamento de Ciências Florestais e da Madeira do Centro de Ciências Agrárias da Universidade Federal do Espírito Santo, localizada no município de Jerônimo Monteiro, ES. Foram utilizadas mudas de eucalipto com diferentes graus de resistência ao patógeno, em fase inicial transplantadas para vasos de 12L e permanecendo em casa de vegetação por 45 dias, sendo em seguida inoculadas com o patógeno e mantidas no “fitotron” por 30 dias. O experimento foi desenvolvido em dois cenários com condições ambientais diferentes, onde se simulou o aumento da temperatura conforme dados de trabalhos científicos, para a região norte do estado do Espirito Santo. O cenário atual foi desenvolvido com temperatura variando de 18 a 30ºC e concentração de CO2 de 400 μmol.mol-1 e o cenário futuro com temperatura variando de 22 a 34ºC e concentração de CO2 de 800 μmol.mol-1. Foram quantificadas as características de crescimento através da mensuração de altura, diâmetro, área foliar e massa seca das plantas. Para caracterizar as respostas ecofisiológicas, foram realizadas medidas das trocas gasosas. O delineamento experimental utilizado foi Inteiramente Casualizado (DIC) em esquema fatorial 3x2, sendo três clones e dois cenários, as médias quando significativas foram submetidas ao teste de Tukey para comparação a nível de 5% de probabilidade. Para os dois materiais genéticos de eucalipto avaliados, a elevada concentração de CO2 e da temperatura no cenário futuro, atuou como um fator estressante para as mudas de eucalipto, onde foi possível notar que as mudas submetidas a esse cenário apresentaram menores valores de massa seca total, área foliar, altura da parte aérea e fotossíntese liquida. Quanto à severidade da doença, o clone suscetível inoculado apresentou a doença nos dois cenários em estudo, já o clone resistente apresentou comportamento distinto quando comparados os dois cenários estudados, observando-se a doença apenas nas mudas do cenário futuro. Com base nos resultados dessa pesquisa, acredita-se que as mudanças climáticas devem alterar as condições de resistência de plantas de eucalipto, aumentando a intensidade das doenças. / Eucalyptus is one of the commercially important tree species grown in several countries in the world with wide environmental adaptability, representing major source of financial resources for the economy of Brazil. The wilting of Ceratocystis fimbriata in Eucalyptus is one of the diseases that limit the growth and crop productivity. The pathosystem, as well as their interactions can be affected by global climate change, particularly with respect to changes in temperature and carbon dioxide (CO2). In this context, the aim of this study was to analyze the effect of increased CO2 concentration and temperature on the behavior of two eucalyptus clones with different levels of resistance to Ceratocystis fimbriata. The study was conducted in growth ("phytotron") of the Laboratory of Ecophysiology and Forest Meteorology in the Department of Forest Science and Wood Center for Agricultural Sciences, Federal University of Espírito Santo chamber, located in the town of Jeromino Monteiro, ES. Eucalyptus seedlings with different degrees of resistance to the pathogen were used in the initial phase transplanted to pots 12L and staying in a greenhouse for 45 days and then inoculated with the pathogen and maintained in "phytotron" for 30 days. The experiment was conducted in two scenarios with different environmental conditions, where the simulated temperature increase according to data from scientific paper, for the northern region of the state of Espirito Santo. The current scenario was developed with temperature ranging from 18 to 30 ° C and CO2 concentration of 400 μmol.mol-1 and the future scenario with temperatures ranging from 22 to 34°C and CO2 concentration of 800 μmol.mol1. Growth characteristics were quantified by measuring height, diameter, leaf area and plant dry matter. To characterize the ecophysiological responses of gas exchange measurements were performed. The experimental design was completely randomized (DIC) in a 3x2 factorial design, with three clones and two scenarios, the averages were significant when subjected to Tukey's test to compare the level of 5% probability. For those genetic materials eucalyptus evaluated, the high concentration of CO2 and temperature on the future scenario, acted as a stressor for eucalyptus seedlings, where it was possible to notice that the seedlings subjected to this scenario had significantly lower total dry mass, leaf area, shoot height and net photosynthesis. As the severity of the disease, the clone susceptible inoculated had the disease in the two scenarios under study, since the clone resistant showed different behavior when comparing the two scenarios studied, observing the disease only in the seedling of the future scenario. Based on the results of this research, it is believed that climate change should alter the conditions of resistance of Eucalyptus plants by increasing the intensity of the disease.
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Metodologias de pesquisa e avaliação da resistência de genótipos de amendoim a Spodoptera albula (walker, 1857) (Lepidoptera: Noctuidae)

Di Bello, Mirella Marconato [UNESP] 03 June 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-10-06T13:03:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-06-03. Added 1 bitstream(s) on 2015-10-06T13:19:06Z : No. of bitstreams: 1 000849193.pdf: 949581 bytes, checksum: d7c1dfc05961fe7a3b897b7ee2924801 (MD5) / Tendo-se em vista a importância da espécie Spodoptera albula (Walker,1857) (Lepidoptera: Noctuidae) nos últimos anos devido aos prejuízos econômicos, causando desfolha na cultura do amendoim bem como a falta de informações a respeito de metodologias de criação e pesquisa em resistência de plantas a insetos, o objetivo do presente trabalho foi avaliar diferentes métodos e materiais visando os estudos de não preferência para alimentação e antibiose dessa espécie, utilizando-se de dietas artificiais e genótipos de amendoim. Os ensaios foram realizados em condições controladas (25 ± 2 ° C, 70 ± 10% umidade relativa e 12 horas de fotofase). Os experimentos iniciais foram para a adequação de uma metodologia de criação para S. albula. Foram avaliados os seguintes parâmetros biológicos: duração, sobrevivência e mortalidade das fases larval, pupal e larva a adulto; peso de lagartas aos 12 dias de idade; peso de pupa com 24 horas de idade; razão sexual; e longevidade dos adultos, em três dietas artificiais, diferentes densidades larvais, densidades de casais e tamanho de gaiolas para oviposição (para o teste de oviposição avaliou-se o número de posturas e de ovos). Observou-se que S. albula conseguiu completar seu ciclo biológico nas três dietas, entretanto, a dieta de Anticarsia gemmatalis Hübner foi a mais adequada para sua criação em laboratório, proporcionando desenvolvimento mais rápido e com maior sobrevivência em relação às demais. A individualização das lagartas de S. albula favoreceu seu desenvolvimento, permitindo maior ganho de peso e menor mortalidade. O tamanho da gaiola não influencia no número de ovos colocados pelas fêmeas, e o maior número de casais por gaiola não favoreceu um aumento da oviposição. Possíveis adequações a dieta escolhida são recomendadas para que a criação alcance maiores índices de sobrevivência. Quanto à metodologia de pesquisa em resistência... / Taking into consideration the importance of Spodoptera albula (Walker, 1857) (Lepidoptera: Noctuidae) species in recent years due to the economic losses, caused defoliation in the peanut crop and the lack of rearing methodologies and research on host plant resistance information, the aim of this study was to evaluate different materials and methods aiming non-preference feeding and antibiosis of this species, using artificial diets and peanut genotypes. The assays were performed under controlled conditions (25 ± 2 ° C, 70 ± 10% relative humidity and 12 hours photophase). Initial experiments were to adjust a design methodology for S. albula. The following biological parameters were evaluated: larval, pupal and larval to adult phase duration, survival and mortality; 12 days old caterpillars weight; 24 hours old pupal weight; sex ratio; and longevity of adults, in three artificial diets, different larval densities, couples densities and cages size for oviposition (for the oviposition assay were evaluated the number of egg masses and eggs). S. albula managed to complete its life cycle in all three diets; however, the Anticarsia gemmatalis Hübner diet was the most suitable for laboratory rearing, providing faster development and higher survival rate in compare to the others. S. albula caterpillar's individualization favored its development, allowing greater weight gain and lower mortality. Cage size does not influence the number of eggs laid by the females, and the largest number of couples per cage did not favor an increase in oviposition. Possible adjustments in the chosen diet are recommended so the rearing can reach higher survival rates. As for research methodology in plant resistance the experiments evaluated the influence of these factors on the expression of non-feeding preference in runner growth habit genotypes IAC Runner 886 and straight growth habit IAC Tatu to S. albula in assays free-choice and no-choice feeding ...
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Metodologias de pesquisa e tipos de resistência em genótipos de soja a Diabrotica speciosa (Germar, 1824) (Coleoptera: Chrysomelidae)

Costa, Eduardo Neves [UNESP] 22 February 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-22Bitstream added on 2014-06-13T20:52:59Z : No. of bitstreams: 1 costa_en_me_jabo.pdf: 541101 bytes, checksum: 6673256645e9bf2d2bad7da0920bd80a (MD5) / Este trabalho teve por objetivo avaliar a não preferência para alimentação e tolerância, em genótipos de soja, ao ataque de Diabrotica speciosa (Germar, 1824) (Coleoptera: Chrysomelidae), assim como avaliar metodologias de pesquisa, em teste de preferência para oviposição, e avaliar graus de resistência do tipo antibiose. Os experimentos foram conduzidos em laboratório, sob condições controladas de temperatura (25 ± 2 ºC), umidade relativa (70 ± 10%) e fotofase (12 horas), exceto o experimento de não preferência para alimentação de larvas, o qual foi conduzido em condições de casa de vegetação. Foram utilizados 10 genótipos de soja para os testes de não preferência para alimentação de adultos (discos foliares e plantas jovens), quais sejam: IAC 100, BRSGO 8360, IGRA RA 626 RR, DM 339, BRS Valiosa RR, Dowling, IGRA RA 516 RR, PI 227687, PI 274454 e BR 16, dos quais seis foram selecionados para os testes subsequentes. Os experimentos de não preferência para alimentação de adultos, com e sem chance de escolha, foram realizados adotando-se dois modelos experimentais, utilizando-se discos foliares e folhas de plantas jovens de soja (não destacando-as da planta), avaliando a atratividade de adultos pelos genótipos de soja em diferentes períodos de tempo, e a área foliar consumida. Paralelamente à realização destes experimentos, foi quantificado o número de tricomas nas folhas dos genótipos de soja, com a finalidade de... / This work aimed to evaluate the non-preference for feeding and tolerance, on soybean genotypes, to the attack of Diabrotica speciosa (Germar, 1824) (Coleoptera: Chrysomelidae), as well as to assess research methodologies, in oviposition preference test, and evaluate the antibiosis type resistance degrees. The experiments were conducted in laboratory, under controlled conditions of temperature (25 ± 2 ºC), relative humidity (70 ± 10%), and photophase (12 hours), except the experiment of non-preference for larvae feeding, which was performed in greenhouse conditions. Ten soybean genotypes were used for non-preference for adults feeding tests (leaf discs and young plants), which were IAC 100, BRSGO 8360, IGRA RA 626 RR, DM 339, BRS Valiosa RR, Dowling, IGRA RA 516 RR, PI 227687, PI 274454 and BR 16, being six selected for the posterior tests. The non-preference for adults feeding experiments, carried out in free and no-choice tests, were fulfilled adopting two experiment models, using leaf discs and leaves of soybean young plants (not detaching them), assessing the adults attractiveness for soybean genotypes at different periods of time, and the leaf intake, being the value express in square centimeter for the test with leaf discs, and injury grade and leaf intake percentage for the test with young plants. Concomitantly to the performing of these experiments, the trichomes number on soybean genotypes leaves was assessed, for the purpose of observing the influence... (Complete abstract click electronic access below)
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Não preferência para oviposição e antibiose em genótipos de eucalipto a Glycaspis brimblecombei Moore, 1964 (Hemiptera: Psyllidae)

Ribeiro, Zulene Antônio [UNESP] 22 February 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-22Bitstream added on 2014-06-13T20:52:59Z : No. of bitstreams: 1 ribeiro_za_me_jabo.pdf: 1737628 bytes, checksum: 8196f0ebf4b2b4d6e00e39a5a577facc (MD5) / Plantios florestais com eucalipto representam um papel estratégico como fonte de matéria-prima e, o Brasil optou pela sua utilização, diminuindo assim a pressão aos remanescentes florestais nativos do país. Nos últimos anos, houve um acréscimo de pragas nativas e exóticas na cultura do eucalipto, tendo como consequência o aumento da utilização de agrotóxicos. Glycaspis brimblecombei Moore (Hemiptera: Psyllidae) é um inseto que, após sua introdução no país, promoveu sérios danos à cultura. Na busca de alternativas para a convivência com o inseto abaixo do nível de dano econômico e visando uma sustentabilidade ecológica, a utilização de plantas resistentes ao psilídeo é uma opção economicamente e ambientalmente viável. Com base em tais considerações, objetivou-se com este estudo avaliar a resistência de genótipos de eucalipto a G. brimblecombei, avaliando-se os tipos de resistência em testes de oviposição e antibiose e identificação das possíveis causas de resistência envolvidas por meio de análise química das folhas. Adicionalmente, testou-se a hipótese de que a angulação formada entre o contato da gota de água e a superfície foliar esteja relacionada à quantidade de cera epicuticular, que pode ser um indicativo de resistência a G. brimblecombei. Foram avaliados 22 genótipos, divididos em dois grupos, sendo o primeiro formado por 10 genótipos, mais as espécies Eucalyptus camaldulensis Dehnh e Corymbia citriodora (Hook.), utilizadas como padrões de suscetibilidade e resistência, respectivamente; e o segundo grupo formado por 11 genótipos, dentre estes, o... / Forest plantations with eucalyptus play a strategic role as afeedstock source and Brazil opted by its utilization,thus reducing the pressure onthe remaining native forests of the country. In the lastyears, there was an increase of native and exotic pests in eucalyptus, and hence the increment of pesticides use. Glycaspis brimblecombei Moore (Hemiptera: Psyllidae) is an insect that, after its introduction into the country, has caused serious damages to eucalyptus plantations. Inorderto search for alternatives on the acquaintanceship with the insect belowthe economical injury level and aiming an ecological sustainability, the use of resistantplants to the psyllidisan economically and environmentally viable option. Basing on these considerations, this study aimedto evaluate the resistance of eucalyptus genotypes to G. brimblecombei, by assessing it in oviposition andantibiosis assays and by identifying thepossible resistance mechanisms involvedthrough leaveschemical analysis. Additionally, we testedthe hypothesis that the angle formed between the contact of thewater droplet and foliar surface isrelated to the epicuticular wax amount, which may be a resistance indicativeto G. brimblecombei. Twenty-two genotypes were assessed, which were divided into two groups,being the firstformed by 10 genotypes inaddition to the speciesEucalyptus camldulensis Dehnh and Corymbia citriodora (Hook.), set as the susceptibility and resistance patterns, respectively; and thesecond group was formed by 11genotypes, among them,the genotype which has...(Complete abstract click electronic access below)

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