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Estudo da variação populacional dos metabólitos secundários do arnicão (Lychnophora salicifolia Mart., Vernonieae, Asteraceae) / Interpopulational variation of secondary metabolites of arnicão (Lychnophora salicifolia Mart., Vernonieae, Asteraceae).Gouvea, Dayana Rubio 02 September 2010 (has links)
Cerca de 10% da flora mundial é representada pela família Asteraceae, uma das maiores famílias de Angiospermae, caracterizada não só pela diversidade morfológica e taxonômica, como também pela riqueza de metabólitos secundários apresentada pelas espécies estudadas dessa família. Lychnophora salicifolia Mart. é a espécie de maior distribuição geográfica do gênero (ocorrendo na Serra do Espinhaço na Bahia, em Minas Gerais e no sudeste de Goiás) e a mais polimórfica também. Entre seus usos etnobotânicos, destaca-se a ação anti-inflamatória e analgésica. Neste trabalho, realizamos o estudo da variação dos metabólitos polares dessa espécie, sendo que para isso foi utilizada a desreplicação do extrato bruto (metanol/água obtido a partir da folhas) através da análise por CLAE-DAD-EM, a qual permitiu a caracterização dos constituintes dessa mistura através da análise dos espectros de UV e dados de EM. Assim foi possível identificar 20 substâncias: ácido protecatecuico; ácido 3-O-E-cafeoilquínico; ácido 3-O-p-cumaroilquínico; ácido 4-O-E-cafeoilquínico; ácido 5-O-E-cafeoilquínico; ácido 4-O-p-cumaroilquínico; ácido 5-O-p-cumaroilquinico; ácido 5-O-feruloilquínico; vicenina-2 (6,8-di-C--glcosilapigenina); ácido 3,4-di-O-E-cafeoilquínico; ácido 3,5-di-O-E-cafeoilquínico; ácido 3-O-cumaroil 5-O-p-cafeoilquínico; ácido 3-O-cafeoil, 5-O-p-cumaroilquínico; ácido 4,5-di-O-E-cafeoilquínico; ácido 4-feruloil-5-O-E-cafeoilquínico; ácido 3,4 di-O-p-cumaroilquínico; ácido 3,5 di-O-p-cumaroilquínico; ácido 4,5 di-O-p-cumaroilquínico; ácido lychnofólico e o ácido 2-O-acetil lychnofólico. Para a validação da metodologia analítica foi utilizada uma substância pertencente a cada classe de compostos: ácido 5-O-E-cafeoilquínico, vicenina-2 e o ácido 2-O-acetil lychnofólico. Quanto à validação da metodologia analítica, esta garantiu a confiabilidade dos resultados e a credibilidade do método para os propósitos deste estudo, abrangendo a faixa de concentração necessária para as análises de variação populacional, além apresentar valores de limites de detecção e limites de quantificação, precisão e recuperação adequados. Na análise intrapopulacional, verificou-se uma variabilidade quantitativa entre indivíduos da mesma população, porém, em média os indivíduos pertencentes à mesma população são parecidos quimicamente. Já em relação ao estudo da variação populacional, pudemos verificar diferenças tanto quanti como qualitativas entre populações coletadas em regiões distintas do Brasil, sendo que a partir da análise estatística, verificamos que há uma correlação entre isolamento geográfico e diminuição da semelhança do perfil de metabólitos polares entre as plantas de populações diferentes indicando que o padrão encontrado para concentração dos metabólitos é influenciado pela distribuição geográfica das amostras. Todavia, não é possível determinar a localização das amostras unicamente pelas variáveis metabólicas estudadas. Assim, a concentração e presença dos metabólitos são influenciadas pela distribuição geográfica das amostras. / About 10% of the world flora is represented by the Asteraceae family, which has been extensively studied since it is one of the largest families of Angiospermae, characterized not only by morphological and taxonomic diversity but also the wealth of secondary metabolites produced by the species studied of this family. Lychnophora salicifolia Mart. is the most widely distributed species of the genus (occurring in the Serra do Espinhaço in Bahia, Minas Gerais and in the southeast of Goiás) and also is the most polymorphic. Its popular use is due to the anti-inflammatory and analgesic activity. In this work, we studied the variation of polar metabolites of this species using the dereplication of the crude extract (methanol/water obtained from the leaves) by the HPLC-DAD-MS analysis, which led us to identify the constituents of this mixture by analyzing the UV spectra and MS data. Thus it was possible to identify 20 substances: protocatechuic acid; 3-O-E-caffeoylquinic acid; 3-O-p-coumaroylquinic acid; 4-O-E-caffeoylquinic acid; 5-O-E-caffeoylquinic acid; 4-O-p-coumaroylquinic acid; 5-O-p-coumaroylquinic acid; 5-O-feruloylquinic acid; vicenin-2 (6,8-di-C--glucosylapigenin); 3,4-di-O-E-caffeoylquinic acid, 3,5-di-O-E-caffeoylquinic acid; 3-O-coumaroyl-5-O-p-caffeoylquinic acid; 3-O-caffeoyl acid, 5-O-p-coumaroylquinic acid; 4,5-di-O-E-caffeoylquinic acid, 4-feruloyl-5-O-E-caffeoylquinic acid; 3,4-di-O-p-coumaroylquinic acid; 3,5-di-O-p-coumaroylquinic acid; 4,5-di-O-p-coumaroylquinic acid; lychnofolic acid and 2-O-acetyl lychnofolic acid. To the validation of analytical methodology were used one substance belonging to each class of compounds: 5-O-E-caffeoylquinic acid, vicenin-2 and 2-O-acetyl lychnofolic acid. So, the validation of analytical method ensured the reliability and credibility of the results of the method for purposes of this study, covering the concentration range required for analysis of population variation and presents appropriates values of detection and quantification limits, precision and recovery. For intrapopulation analysis, there was a quantitative variability between individuals of the same population, but on average the individuals of the same population are similar chemically. In relation to the study of interpopulation variation, we could see quantitative and qualitative differences between populations collected from different regions of Brazil, and from the statistical analysis, we found that there is a correlation between geographic isolation and decrease of the similarity of the polar metabolites profile between plants of different populations. This indicated that the pattern found for the concentration of metabolites is influenced by the geographical distribution of samples. However, it is not possible to determine the location of the samples only by the metabolic variables studied. Thus, the presence and concentration of metabolites are influenced by the geographical distribution of samples.
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Padrão de sobreposição e co-ocorrência interespecífica de moscas-das-frutas (Diptera, Tephritidae, Anastrepha) em áreas antropizadas / Overlap pattern and interespecific co-ocurrence of fruit flies (Diptera, Tephritidae, Anastrepha) in anthropic areasAmaral, Tayron Sousa 11 March 2014 (has links)
O padrão de sobreposição de nicho e a co-ocorrência, bem como as interações positivas e negativas entre espécies de Anastrepha, com base em matrizes com dados de abundância e presença-ausência, foi avaliado. As populações de Anastrepha foram estudadas também quantativamente para avaliar sua distribuição e a flutuação populacional das espécies predominantes. O estudo foi realizado em duas áreas antropizadas, denominadas Fazenda Areão e Monte Olimpo, do campus \"Luiz de Queiroz\", Universidade de São Paulo, Piracicaba, SP. O estudo foi baseado em 52 coletas por meio de 14 armadilhas tipo McPhail distribuídas nas duas áreas. Foram coletadas 1.583 fêmeas pertencentes a 14 espécies: A. amita Zucchi, A. barbiellinii Lima, A. bistrigata Bezzi, A. daciformis Bezzi, A. distincta Greene, A. fraterculus (Wiedemann), A. grandis (Macquart), A. manihoti Lima, A. montei Lima, A. obliqua (Macquart), A. pickeli Lima, A. pseudoparallela (Loew), A. serpentina (Wiedemann) e A. sororcula Zucchi. Na Fazenda Areão, foram coletadas mais espécimes (1.041), em comparação ao Monte Olimpo (542), que, entretanto, apresentou o maior índice de diversidade de espécies. Anastrepha fraterculus, A. obliqua e A. pseudoparallela foram predominantes na Fazenda Areão; no Monte Olimpo, apenas A. fraterculus e A. pseudoparallela foram predominantes. A média de sobreposição de nicho foi maior que o esperado ao acaso para as duas áreas, portanto, os nichos ecológicos das espécies, em grande parte, se sobrepõem. O padrão de co-ocorrência indicou a ocorrência de dois pares de espécies não aleatórios que segregaram: A. pseudoparallela x A. obliqua na Fazenda Areão e A. fraterculus x A. pseudoparallela no Monte Olimpo. A segregação indica que pode haver competição por algum recurso dentro do nicho. A análise também apresentou três pares agregados: A. bistrigata x A. montei e A. fraterculus x A. barbiellinii para a Fazenda Areão e A. fraterculus x A. bistrigata para o Monte Olimpo, indicando que cada par coexiste pacificamente, sem que haja interferência na permanência das populações de moscas-das-frutas nas áreas. O nível populacional mais elevado ocorreu de agosto a dezembro, nas duas áreas, quando as temperaturas oscilaram entre 18 e 24°C, com pico populacional em setembro. / The niche overlap pattern and co-ocurrence, as well as positive and negative interactions among Anastrepha species, based on abundance matrix data and presence-absence data was evaluated. The populations of species of Anastrepha was analyzed quantitatively to evaluate its distribution and the populational fluctuation of predominant species. The study was carried out in two anthropic areas, Fazenda Areão and Monte Olimpo, at \"Luiz de Queiroz\" campus, Universidade de São Paulo, Piracicaba, SP. The research was based on 52 samplings obtained over 14 McPhail traps distributed in these two areas. It was captured 1,583 females belong 14 species: A. amita Zucchi, A. barbiellinii Lima, A. bistrigata Bezzi, A. daciformis Bezzi, A. distincta Greene, A. fraterculus (Wiedemann), A. grandis (Macquart), A. manihoti Lima, A. montei Lima, A. obliqua (Macquart), A. pickeli Lima, A. pseudoparallela (Loew), A. serpentina (Wiedemann) and A. sororcula Zucchi. It was collected more specimens (1,041) at Fazenda Areão, comparing with the ones at Monte Olimpo (542), that showed the highest species diversity index. Anastrepha fraterculus, A. obliqua and A. pseudoparallela were the predominant species at Fazenda Areão; at Monte Olimpo, only A. fraterculus and A. pseudoparallela were predominant. The niche overlap mean was higher than randomly expected for these two areas. Therefore, the species ecological niches mostly overlap. The coocurrence pattern indicated the ocurrence of two non-randomized pair of species that segregated: A. pseudoparallela x A. obliqua at Fazenda Areão, and A. fraterculus x A. pseudoparallela at Monte Olimpo. The segregation indicates that can exist three aggregated pairs: A. bistrigata x A. montei and A. fraterculus x A. barbiellinii at Fazenda Areão; and A. fraterculus x A. bistrigata at Monte Olimpo, indicating that each pair coexists pacifically, with no interference in the permanence of the fruit fly populations in the areas. The highest populational level occurred from August to December, when temperatures oscillated between 18 and 24°C, with the population peak in September.
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Dinâmica de infestação em Acacia mearnsii e ecologia de Oncideres impluviata (Coleoptera: Cerambycidae) / Dynamics of infestation in Acacia mearnsii and ecology of Oncideres impluviata (Coleoptera: Cerambycidae)Ono, Maria Angélica 30 October 2015 (has links)
Neste estudo a dinâmica de quebra de galhos de acácia negra foi investigada com análise de séries temporais e modelagem ecológica, em conjunto de dados obtidos durante oito anos, visando compreender como se dá o comportamento de Oncideres impluviata (Colepotera, Cerambycidae) em diferentes áreas de plantios florestais, em fazendas localizadas em diferentes municípios do Rio Grande do Sul. A diversidade de cerambicídeos também foi analisada em duas fazendas localizadas no município de maior abundancia de O. impluviata. Os resultados sugerem que a maior abundância de galhos quebrados se dá em Cristal e Encruzilhada do Sul. O município de Piratini exibiu menor densidade de galhos quebrados, entretanto, a projeção dos valores médios de galhos seguiu um padrão aparentemente exponencial para Cristal e Encruzilhada do Sul e sigmóide para Piratini. As funções de autocorrelação e autocorrelação parcial não evidenciaram claras tendências de ciclos nas séries para os três municípios, mas as tendências de ocorrência de picos similares aos surtos diferiram nos três municípios quando a análise espectral foi aplicada. A dinâmica analisada pela equação de Ricker indicou a ocorrência de equilíbrio estável, ciclo limite e comportamento caótico nos três municípios, porém, com menor prevalência de caos em Piratini. A migração espacial mostrou maior poder de estabilização populacional em Cristal e Encruzilhada do Sul em razão das maiores taxas de crescimento presentes nestes municípios. Quinze espécies de cerambicídeos foram encontradas em duas fazendas pertencentes ao município de Encruzilhada do Sul e Oncideres impluviata, Nesozineus alphoides e Ygapema delicata foram as espécies de cerambicídeos mais abundante nas áreas analisadas. As curvas de rarefação atingiram assíntotas de forma satisfatória, comprovando a suficiência do esforço amostral. / In this study, the dynamics of black wattle broken branches was investigated with time series analysis and ecological modeling in dataset obtained during eight years, in order to understand how O. impluviata (Coleoptera, Cerambycidae) behaves in different forests placed in farms of different municipalities of the Rio Grande do Sul, Brazil. The diversity of cerambycids wal also analysed in two farms placed in the municipality with the highest abundance of O. impluviata. The results suggest that higher abundance of broken branches occurs in Cristal and Encruzilhada do Sul. Piratini exhibited the lowest density of broken branches, however, the projection of mean values of branches followed an apparently exponential pattern in Cristal and Encruzilhada do Sul and sigmoid in Piratini. The autocorrelation and partial autocorrelation functions did not show clear trends of cycles in the series of the three municipalities, but the peak occurrence trends similar to the outbreaks differed in the three municipalities when the spectral analysis was applied. The dynamics analysed with the Ricker equation indicated stable equilibrium, limit cycle and chaos in the three municipalities, but, with lower prevalence in Piratini. The spatial migration showed higher power to stabilize population in Cristal and Encruzilhada do Sul in response to high growth rates in these municipalities. Fifteen species of cerambycids were found in the two farms in Encruzilhada do Sul and O. impluviata, Nesozineus alphoides and Ygapema delicate were the most abundant species in the areas. The rarefaction curves showed satisfactory asymptotes, confirming the adequacy of the sampling effort.
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A contribuição de estudos populacionais em idosos saudáveis: base de dados genômicos, compreensão do envelhecimento e lateralidade cerebral / The contribution of population studies in healthy elders: genomic database, understanding aging and brain lateralityNaslavsky, Michel Satya 22 September 2015 (has links)
Com a redução progressiva dos custos de sequenciamento completo do genoma humano, os estudos populacionais tornam-se viáveis. A interpretação dos dados e integração com informações clínicas, entretanto, apresentam-se como desafios crescentes. O conhecimento sobre a variabilidade genética e sua interação com fenótipos complexos podem ser ampliados com estudos de grande porte em populações miscigenadas, em particular de sociedades com heterogeneidades sociais, culturais e históricas, ainda pouco representadas globalmente na área da genômica. Este trabalho apresenta um conjunto de estudos colaborativos que se basearam em uma amostra de natureza representativa de idosos da cidade de São Paulo (amostra SABE, aproximadamente 1400 indivíduos) e em de octogenários cognitivamente saudáveis (amostra 80+, aproximadamente 130 indivíduos). Além de questionários e testes, DNA dos participantes foi obtido e exomas sequenciados para cerca de 600 indivíduos. Esta base permitiu a construção de grupos controles para diversos estudos de associação de variantes causais ou de suscetibilidade a doenças raras como distrofia muscular de cinturas, tumores do sistema endócrino e síndrome de Noonan, entre outras, além de integrar, como referência populacional local, o sistema de análise de variantes do serviço de diagnóstico molecular do Centro de Pesquisas sobre o Genoma Humano e Células-tronco da Universidade de São Paulo. Por ser uma amostra de idosos, além de permitir a construção de uma base eficiente para controles comparativos de doenças raras ou de início precoce, tornou-se possível a execução de projetos sobre envelhecimento cerebral através do recrutamento cerca de 580 indivíduos para ressonância magnética. Estudos com marcadores de demências, como polimorfismos do gene APOE (associado à doença de Alzheimer) indicaram que a população brasileira apresenta riscos diferenciais em relação a populações de outros países, provavelmente devido à estrutura populacional única do ponto de vista de ancestralidade genética e composição socio-econômica. Por fim, os estudos com ressonância magnética e genômica permitiram a investigação do fenótipo de lateralidade cerebral, que engloba dominâncias manual e de linguagem, que está presente de forma variável em seres humanos e está envolvida com distúrbios neuropsiquiátricos como dislexia e esquizofrenia. Foi possível detectar associação entre variantes do gene FOXP2, implicado no neurodesenvolvimento da linguagem, e endofenótipos assimétricos de tratos de substância branca envolvidos na produção da fala. O presente trabalho abre caminho para diversos novos projetos dada a escala de dados sociodemográficas, clínicos, funcionais e genômicos / Due to the progressive reduction of genome sequencing costs, population studies become feasible. Interpretation of subsequent data and integration with clinical information, however, impose a growing challenge. The knowledge about genetic variability and its interaction with complex phenotypes could be expanded with large scale admixed population studies, particularly in those samples that live in socially, culturally and historically heterogeneous communities, so far globally underrepresented in the genomics field. This thesis presents a collection of collaborative studies that were based on a population-representative sample of elderly from the city of São Paulo (SABE sample, approximately 1400 subjects) and a cognitively healthy octogenarians sample (80+ group, approximately 130 subjects). Comprehensive questionnaires and functional tests were obtained, along with DNA from all subjects and exome sequences from about 600 of them. This database allowed the assembly of control groups to several association studies with causal and susceptibility variants to rare disorders such as limb-girdle muscular dystrophy, endocrine system tumors and Noonan syndrome, among others, and, in addition, composed as a local population reference the analyses\' protocols in the molecular diagnosis service of the Human Genome and Stem-cell Research Center at the University of São Paulo. As this is an elderly sample, it was possible not only to build an efficient control group to compare with patients affected by rare or early onset disorders, but to promote projects on brain aging through recruitment of about 580 subjects to magnetic resonance imaging (MRI). Studies with markers of dementia, such as APOE gene polymorphisms (involved in Alzheimer\'s disease), suggested that the Brazilian population might present different risks compared to other countries, probably due to its unique population structure from the genetic ancestry standpoint and socioeconomic composition. As a final project, MRI and genomics studies were performed to investigate the phenotype of brain laterality, which comprises handedness and language dominance and it is variable among humans, with involvement with neuropsychiatric disorders such as dyslexia and schizophrenia. It was possible to detect an association between variants of FOXP2 gene, which is involved in neurodevelopmental processes of language, and asymmetry endophenotypes of white matter tracts that form the speech production circuitry. This effort opens several pathways to develop new projects due to the scale of sociodemographic, clinical, functional and genomic data
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Análise da estrutura genética populacional do curimbatá (Prochilodus lineatus, Characiformes: Prochilodontidae) na região da bacia do Rio Grande, SP. / Analysis of population genetic structure of Prochilodus lineatus (Teleostei, Characiformes, Prochilodontidae) in the Rio Grande basin, São Paulo, BrazilSilva, Riviane Garcez da 19 October 2006 (has links)
O curimbatá (Prochilodus lineatus) é uma espécie de importância comercial na pesca continental brasileira, especialmente na região da bacia do Rio Grande. Diversos estudos foram realizados com o curimbatá nesta região, incluindo os de delimitação populacional. Desde então, a região passou por alterações ambientais causadas pela construção de diversas barragens, impossibilitando migrações a montante, essenciais para a reprodução de P. lineatus. O presente estudo teve como objetivo verificar o impacto das barragens, sob o ponto de vista genético, na população de curimbatá da bacia do Rio Grande. Para tanto, foi utilizada a técnica de PCR-RFLP do fragmento entre os genes ND2 e CO1 e também da região controle, ambos do mtDNA, com 10 e 15 enzimas de restrição, respectivamente. Foram realizadas coletas em nove localidades entre barragens que não possuíam escadas para a migração de peixes. As localidades são: no Rio Grande - Cardoso, Colômbia, Conceição das Alagoas, Igarapava, Pedregulho e São João Batista do Glória; no Rio Mogi-Guaçu - Pirassununga e Espírito Santo do Pinhal; e no Rio Pardo - Jaborandi. Os resultados obtidos na análise do fragmento ND2-CO1 com três amostras, sendo uma de cada rio, não evidenciaram divergência significativa. Os índices de diversidade genética (haplotípica e nucleotídica) observados foram baixos, quando comparados com outras espécies de peixes. Estes resultados são condizentes com o esperado para seqüências conservadas, por isso, optou-se pela análise de uma região mais variável, como a região controle do mtDNA. Os resultados obtidos para a região controle (Fst, distribuição de Monte Carlo, teste exato e AMOVA) evidenciaram divergência significativa entre a amostra de Jaborandi e as demais, este fato pode ser devido a uma sub-estruturação populacional, ou a um erro de identificação da localidade de coleta. As outras amostras evidenciaram que, em geral, fazem parte de uma única população sob o ponto de vista genético. Não foi observada estruturação por distância, já que não houve correlação entre a distância genética e a distância geográfica. Os índices de diversidade (nucleotídica e haplotípica) são considerados de altos a moderados, sendo que os maiores foram obtidos para as amostras localizadas em trechos onde ainda há características naturais da bacia. A presença de poucos haplótipos amplamente distribuídos e internos na rede de haplótipos e de diversos haplótipos raros localizados perifericamente na rede, são um indício de expansão populacional recente. A expansão foi averiguada, também, com testes de neutralidade e gráficos de distribuição mismatch. O tempo de expansão foi calculado em 238 mil anos, que corresponde ao Pleistoceno Médio, época de grandes mudanças climáticas na América do Sul. Em conclusão, as alterações ambientais provocadas pelas barragens não geraram, a curto prazo, diferenças significativas entre as amostras estudadas, assim como parecem não estar diminuindo a variabilidade genética do curimbatá, quando comparada com a de populações naturais de outros rios. A divergência obtida para Jaborandi deve ser melhor estudada, mas parece refletir ausência de fluxo anterior à construção das barragens. O objetivo pretendido é o de apresentar um parâmetro de comparação para estudos futuros, especialmente aqueles que enfoquem o monitoramento da variabilidade genética do curimbatá. Estudos de longo prazo devem ser realizados no intuito de auxiliar o manejo pesqueiro do curimbatá, inclusive em programas de repovoamento. / Prochilodus lineatus has a commercial importance in the Brazilian freshwater fishing, especially in the Rio Grande basin. Several studies have been done with P. lineatus in this area, including those delimiting populations. Since then, the Rio Grande basin has been changed due to environmental impacts caused by construction of several dams. The most expressive impact for this population of P. lineatus was the impossibility of upstream migration, essential for its reproduction. The present study aimed at genetically verifying the impact of dams in the population of P. lineatus from Rio Grande basin. The PCR-RFLP method was used in mitochondrial DNA fragments ND2-CO1 and control region, with 10 and 15 restriction enzymes, respectively. Nine samples colected between dams with no fish ladders were analyzed: in Rio Grande - Cardoso, Colômbia, Conceição das Alagoas, Igarapava, Pedregulho e São João Batista do Glória; in Rio Mogi-Guaçu - Pirassununga e Espírito Santo do Pinhal; and in Rio Pardo Jaborandi. Analysis results of the ND2-CO1 fragment with three samples, one from each river, did not show significant divergence. Values of haplotype and nucleotide diversity were low when compared to other fish species. These results are expected for conserved sequences, so analysis of a more variable region, such as the control region, was chosen. Results of the control region (Fst, Monte Carlo distribution, exact test and AMOVA) showed a significant divergence between Jaborandi sample and the others. This could be due to a population structure, or to an error in the locality identification. The other samples seem to be part of a single population. Isolation by distance was not verified since there is no correlation between genetic and geographic distances. Values of haplotype and nucleotide diversity ranged from high to moderate, with the highest values found in samples from localities where natural features of the basin still exist. Presence of few and widely distributed haplotypes internally in the haplotype net, and the occurrence of several other rare haplotypes distributed peripherically in the haplotype net, are typical of a recent population expansion. The expansion was also verified in neutrality tests and mismatch distribution. The calculated expansion time is 238 thousands of years that correspond to the Median Pleistocene, a period of great climatic changes in South America. In conclusion, the environmental changes caused by dams did not generate significant differences among the analyzed samples, in a short-term, and did not seem to be decreasing the genetic variability of P. lineatus, when compared to other natural populations. Divergence obtained for Jaborandi should be better studied, but seems to reflect the absence of gene flow prior to the construction of dams. These work intents to present a comparative parameter for future studies, especially those monitoring the genetic variability of P. lineatus. Longterm studies must be conducted to help fisheries management of P. lineatus, including restock programs.
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Estrutura Genética e Desequilíbrio de Ligação em Africanos, Ameríndios e Remanescentes de Quilombos Brasileiros Estimados por Novos STRs-X / Genetic Structure and Linkage Disequilibrium in African, Amerindian and Quilombo Remnants of Brazilian Estimated by new X-STRsAndrade, Claudia Caixeta Franco 06 February 2014 (has links)
O cromossomo X possui características que o tornam um bom marcador em estudos de genética populacional. A formação da população brasileira é resultado de cinco séculos de mistura étnica entre populações de três diferentes populações: europeus, africanos e ameríndios. Sendo assim, a população brasileira atual é considerada tri-híbrida embora as proporções dos três grandes componentes étnicos variem consideravelmente conforme a região geográfica. O objetivo deste trabalho é obter informações sobre a estrutura genética de populações urbanas brasileiras, indígena, remanescentes de quilombos e uma amostra da população africana (Congo). Foram utilizados 20 STRs localizados em três regiões do cromossomo X: Xp21, Xp-q11.1, Xq28. O total de alelos obtidos foi 169. Todas as três regiões apresentaram alelos privados, totalizando 26. A população ameríndia, Tikúna, foi a que apresentou a menor diversidade genética. Além disso, quando comparada com as outras populações, Tikúna foi a que mais se diferenciou. Era esperado que Tikúna fosse a população mais divergente e com menor diversidade, pois esta é uma população pequena e isolada que sofre as consequências da ocorrência de deriva genética. Nas mulheres, as populações mais semelhantes foram Sítio Velho-Teresina, Sítio Velho-Ribeirão Preto e Ribeirão Preto-Teresina, pois tiveram valores de FST não significativos. Nos homens, apenas Mimbó-Sítio Velho são as populações mais semelhantes (FST não significativo). Mimbó e Sítio Velho são os dois remanescentes de quilombos utilizados neste estudo e o histórico de formação destas populações é semelhante, o que justifica a proximidade genética entre elas. Todas as populações foram agrupadas em três clusters, tanto no grupo dos homens quanto no das mulheres. O primeiro cluster é formado, em sua grande maioria, por indivíduos da população Africana, Mimbó e Sítio Velho, representando o componente africano na população brasileira. O segundo cluster foi formado por mais de 90% da população Tikúna, sendo assim indicativo do componente ameríndio. O terceiro cluster agrupou as populações urbanas, Ribeirão Preto e Tikúna, que possuem um maior componente europeu na sua formação. DL ocorreu entre os marcadores de todos os haploblocos (DMD, PC e HEMA). HEMA foi o haplobloco com maior DL. Semelhanças e diferenças entre as populações foram encontradas de acordo com o esperado pelo histórico de formação de cada uma delas. Os três componentes genéticos (africano, ameríndio e europeu) da população brasileira foram claramente identificados nas amostras analisadas. / The X chromosome has characteristics that make it a good marker for studies of population genetics. Brazilian population results from five centuries of admixture of European, Africans and Amerindians. Thus, the current Brazilian population is considered trihybrid although the proportions of the three main ethnic components vary considerably according to the geographical region. The aim of this work was to obtain information about the genetic structure of Brazilian urban populations, Amerindians, quilombo remnants and a sample of African (Congo). We used 20 STRs located in three regions of the X chromosome: Xp21, Xpq11.1 andXq28. The total of alleles obtained was 169. All three chromosomal regions have private alleles, totaling 26. The Amerindian population (Tikúna) had lower genetic diversity and higher FST values, when compared to other populations. This is expected given the genetic isolation and small population size, which make them most sensitive to the effects of genetic drift. In women, by pairs of populations Sítio Velho-Teresina, Sítio Velho-Ribeirão Preto and Ribeirão Preto-Teresina, were similar (FST values not significantly different). In men, only the pair Mimbó-Sítio Velho rendered no significantly different the individuals analyzed were grouped into three clusters, even when considered separately for men and women. One cluster was termed \'African\' to be formed largely by individuals from Congo, quilombo remnants and Sítio Velho. Another cluster termed \'Amerind\' was formed by >90% of Tikúna population. In the third one, were grouped urban populations of Ribeirão Preto and Teresina. In this cluster are observed components African, Amerindian, and European with predominance of the latter. DL occurred between markers of all blocks (DMD, PC e HEMA). HEMA had the highest DL. There were differences between DL in men and women, which may have been caused by sampling problems. The observed similarities and differences between clusters and populations subsets match expectation from the population histories. The results presented bring new elements of analysis to the structure of the Brazilian population.
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Padrões espaciais de abundância e dinâmica populacional em longo prazo do camarão sete-barbas Xiphopenaeus kroyeri (Heller, 1862) na Enseada de Ubatuba, SP / Long-term pattern of spatial abundance and population dynamics of the seabob shrimp Xiphopenaeus kroyeri (Heller, 1862) in Ubatuba Bay, São Paulo State, BrazilHeckler, Gisele Salgado 29 August 2014 (has links)
A análise de uma população em longo prazo permite a identificação da ausência ou presença de variações nos padrões de ciclo de vida, de distribuição espaço-temporal e dinâmica populacional. O ciclo de vida do camarão sete-barbas Xiphopenaeus kroyeri foi investigado na Enseada de Ubatuba, litoral norte do Estado de São Paulo (23º25\' - 23º27\'S / 45º00\' - 45º03\' W) ao longo de um intervalo de treze anos. Amostras de material biológico, de água de fundo e de sedimento foram coletadas em quatro pontos de amostragem em três períodos de 12 meses cada: janeiro a dezembro de 1998, julho de 2006 a junho de 2007 e setembro de 2010 a agosto de 2011. Dados obtidos em 1999 foram incluídos para as análises de crescimento individual, de longevidade e de idade de maturação. Altas abundâncias de fêmeas maduras e de jovens foram respectivamente associadas a valores de temperatura da água de fundo acima e abaixo da média da região. Indivíduos adultos predominaram em pontos com variação temporal da composição granulométrica do sedimento enquanto que os jovens se estabeleceram naqueles em que o sedimento permaneceu fino entre os períodos. Em 1998, a abundância de jovens, o peso individual de machos e fêmeas de todas as categorias demográficas, a idade de maturação morfológica e fisiológica e a longevidade foram maiores do que nos outros períodos. Os parâmetros da função de crescimento de machos e fêmeas variaram entre os períodos, sem apresentarem uma tendência temporal clara. Os padrões anuais de reprodução e recrutamento foram bastante semelhantes entre os períodos. As alterações nos fatores ambientais provocadas por variações na dinâmica de massas de água, pela ocorrência de El Niño e alterações na intensidade de pesca foram consideradas como possíveis agentes relacionadas às variações nos padrões do ciclo de vida da espécie na região / Long-term studies on a population provide detection of the presence or absence of interannual variation in patterns of its life cycle, spatio-temporal distribution, and dynamics. This study investigate the population of the seabob shrimp Xiphopenaeus kroyeri within a period of 13 years in Ubatuba Bay, northern coast of São Paulo state, Brazil (23º25\' - 23º27\'S / 45º00\' - 45º03\' W). Shrimp, bottom water and sediment samples were collected from four sampling sites during three 12-month periods: January-December 1998, July 2006-June 2007, and September 2010-August 2011. Monthly data collected in 1999 were included in growth, longevity and maturation age analyses. High abundance of mature females and juveniles were associated to the occurrence of temperature values below and above the region average, respectively. Adults predominated in sites that showed temporal variation of sediment texture while juveniles occurred in sites where sediment remained fine between the study periods. In the 1998 period values of juveniles were more abundant, individual weight of all demographic categories was higher, both morphological and physiological maturity was attained later and lifespan was longer than on the following periods. Growth function parameters of males and females varied between periods with no clear temporal trend. Monthly patterns of reproduction and recruitment were similar between the study periods. Changes in the environmental conditions caused by variations in the dynamics of the local water masses, occurrence of El Niño and fishery intensity were considered as possible factors related to the interannual variations in the life cycle pattern of X. kroyeri in the study region
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Dinâmica populacional e distribuição de insetos em plantios florestais na Estação Experimental de Anhembi (Anhembi, SP) / Population dynamics and insect distribution in forest plantations at Anhembi Experimental Station (Anhembi, SP)Litholdo, Murilo Gaspar 27 September 2018 (has links)
O setor florestal brasileiro é referência mundial devido a sua alta produtividade, sustentabilidade e inovação, porém ainda há muitos entraves para a continuidade do crescimento. Com a introdução de novas pragas nos plantios de eucalipto, o conhecimento sobre as relações ecológicas tornou-se fundamental para estabelecer medidas efetivas de controle e monitoramento. Os objetivos do presente estudo foram conhecer as dinâmicas populacionais de insetos florestais com predomínio em eucalipto, com ênfase no padrão de distribuição de psilídeo-de-concha. Foram instaladas 5 armadilhas adesivas amarelas, em 26 pontos na Estação Experimental de Anhembi, SP. As coletas foram realizadas durante 12 meses, com início em dezembro de 2016 e término em novembro de 2017. As armadilhas permaneceram instaladas durante 15 dias de cada mês. Foram quantificadas as pragas exóticas Glycaspis brimblecombei, Thaumastocoris peregrinus, Leptocybe invasa, predadores (coccinelídeos e crisopídeos) e os parasitoides Selitrichodes neseri, Psyllaephagus bliteus e Cleruchoides noackae. Analisou-se o total de insetos de cada grupo (variável resposta), afetados por fatores abióticos como temperatura, mês, pluviosidade, tipo do eucalipto e tamanho do talhão (variáveis explicativas), utilizando modelos lineares generalizados com distribuição binomial negativa. Variáveis não significantes (P > 0.15) foram removidas dos modelos. A seleção de modelos baseou-se no critério de informação de Akaike. Todas as análises estatísticas foram realizadas utilizando o software R® (R Development Core Team, 2015). Dados meteorológicos (temperatura e pluviosidade) foram obtidos da estação climática da Estação Experimental em Anhembi. Um mapa vetorial foi construído usando a interface ArcMap do software ArcGis 10.3 (ESRI 2014), representando pontos de amostragem por um shapefile combinado com uma tabela de atributos, com o número de insetos em cada ponto. A técnica de Inverse Distance Weighted (IDW) foi utilizada com o número de insetos encontrados em cada ponto de coleta. Métodos de interpolação foram usados para estimar o valor de cada ponto não amostrado a partir dos valores nos pontos amostrados, e um mapa de distribuição de abundância foi construído para as espécies. Os insetos observados com as maiores abundâncias foram o psilídeo-de-concha com 5904 indivíduos, coccinelídeos com 1068 indivíduos, P. bliteus com 271 indivíduos, vespa-da-galha com 45 indivíduos, percevejo-bronzeado com 10 indivíduos, crisopídeos com 44 indivíduos. Temperatura, tamanho da área, diferentes espécies de eucalipto e mês influenciaram significativamente nas populações de coccinelídeos, P. bliteus e G. brimblecombei. Não há correlação nos picos populacionais de G. brimblecombei com os fatores ambientais temperatura e pluviosidade, mesmo quando esses fatores são considerados simultaneamente. Os picos populacionais de G. brimblecombei ocorreram na primavera, com temperaturas altas e início do período chuvoso. As populações de G. brimblecombei tendeu a concentrar-se mais proximamente ao curso do rio e afastar-se de áreas com maior atividade agrícola. / The Brazilian forestry sector is a world reference due to its high productivity, sustainability and innovation, but there are still many obstacles to the continuity of growth. With the introduction of new pests in eucalyptus plantations, the knowledge about ecological relationships has become essential to establish effective control and monitoring measures. The aim of the present study was to know the population dynamics of forest insects, mainly in eucalyptus and emphasizing the distribution pattern of Glycaspis brimblecombei. Five yellow adhesive traps were installed in 26 points at the Experimental Station in Anhembi, SP. The collections were carried on during 12 months, from the beginning of December 2016 until the end of November 2017. Traps remained installed for 15 days of each month. It was quantified the following exotic pests: Glycaspis brimblecombei, Thaumastocoris peregrinus, Leptocybe invasa, predators such as (Coccinellidae and Chrysopidae) and the parasitoids Selitrichodes neseri, Psyllaephagus bliteus and Cleruchoides noackae. It was analyzed the total number of insects of each group (response variable), affected by abiotic factors such as temperature, month, rainfall, eucalyptus type and size of the field (explanatory variables), using generalized linear models with negative binomial distribution. Non-significant variables (P> 0.15) were removed from the models. The selection of models was based on Akaike\'s information standard. All statistical analyzes were performed using R® software (R Development Core Team, 2015). Meteorological data (temperature and rainfall) were obtained from the climatic station of the Anhembi Experimental Station. A vector map was constructed using the ArcMap interface of ArcGis 10.3 software (ESRI 2014), representing sampling points by a shapefile combined with an attribute table, with the number of insects at each point. The Inverse Distance Weighted (IDW) technique was used with the number of insects found at each collection point. Interpolation methods were used to estimate the value of each point not sampled from the values at the points sampled, and an abundance distribution map was made for the species. The greatest abundances of insects were observed for G. brimblecombei with 5904 individuals, Coccinellidae with 1068 individuals, P. bliteus with 271 individuals, L. invasa with 45 individuals, T. peregrinus with 10 individuals, Chrysopidae with 44 individuals. Temperature, area size, different species of eucalyptus and month influenced significantly in the populations of Coccinellidae, P. bliteus and G. brimblecombei. There is no correlation in the population peaks of G. brimblecombei with the environmental factors for temperature and rainfall, even when these factors are considered simultaneously. The population peaks of G. brimblecombei occurred in the spring, with high temperatures and the early rainy season. The populations of G. brimblecombei tended to concentrate more closely to the course of the river and to move away from areas with greater agricultural activity.
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Espaçamentos ultra-adensado, adensado e convencional com densidade populacional variável em algodoeiro. / Ultra-narrow row, narrow row and conventional row with cotton variable density plant population.Silva, Ariana Vieira 17 January 2003 (has links)
No presente estudo foi avaliado a densidade populacional, por espaçamentos ultra-adensado, adensado e convencional entre fileiras e número de plantas por metro linear, através do crescimento, desenvolvimento e produtividade da cultivar de algodão IAC 23. O experimento foi conduzido na área experimental da ESALQ/USP, município de Piracicaba, Estado de São Paulo, no ano agrícola de 2001/02. O delineamento experimental foi o de blocos ao acaso em esquema fatorial, com 4 repetições, sendo três espaçamentos entre linhas (0,38, 0,76 e 0,95 m) e quatro densidades de plantas por metro linear (5, 8, 11 e 14). O controle da altura das plantas foi realizado através de regulador de crescimento. Em cada parcela experimental foram marcadas seis plantas ao acaso e analisados os seguintes parâmetros: estádios fenológicos, altura média das plantas, altura de inserção do 1º ramo frutífero, diâmetro do caule, número de ramos vegetativos e frutíferos, número de internódios e o número de capulhos por planta. Em duas plantas foram avaliados o índice de área foliar e a massa seca da parte aérea. Na área útil de cada parcela foi determinada a produção de algodão em caroço, a precocidade de colheita e em amostras de 20 capulhos por parcela foram realizadas as análises dos caracteres agronômicos de laboratório (massa média de uma capulho, massa de 100 sementes e porcentagem de fibra) e das características tecnológicas da fibra (comprimento da fibra, uniformidade de comprimento, tenacidade, micronaire e maturidade). Pelos resultados obtidos concluí-se que as condições ambientais foram favoráveis para o crescimento e desenvolvimento da cultivar IAC 23, completando o ciclo em 161 dias; quanto menor o espaçamento e maior a densidade de plantas na linha, maior o IAF durante o ciclo, menor o diâmetro do caule pelo estiolamento das plantas e menor o número de capuhos por planta; quanto maior o espaçamento e menor a densidade de plantas na linha, maior a massa seca da parte aérea e a altura média das plantas durante o ciclo; o índice de colheita é maior conforme o aumento do espaçamento enquanto que não altera com a densidade de plantas; maior densidade de plantas na linha eleva a altura de inserção do 1º ramo frutífero; independente do espaçamento e da densidade, o número de ramos vegetativos não é alterado enquanto que o número de ramos frutíferos e o número de internódios diminui com o aumento da população de plantas por área; a produção de algodão em caroço foi 12% e 8,4% superior nos espaçamentos ultra-adensado e adensado, respectivamente, comparado ao convencional; no espaçamento ultra-adensado na menor densidade de plantas na linha, a produção de algodão em caroço foi 29,2% e 22,3% superior, respectivamente, às produções dos espaçamentos adensado e convencional na mesma densidade de plantas na linha; a precocidade de colheita praticamente não é alterada na cultivar IAC 23, sobretudo com o aumento da população de plantas por área; os caracteres agronômicos de laboratório e as características tecnológicas da fibra não foram alteradas nas populações de plantas estudadas. / The purpose of this work was to study plant population density, by spacing between rows and plants per linear meter for the IAC 23 cotton cultivar under ultra-narrow row, narrow row or conventional row by analyzing plant growth, development and yield. The experiment was established in the experimental field of ESALQ/USP, Piracicaba, São Paulo, during the 2001/2002 season, in a randomized block design with four replications. Three rows (0,38, 0,76 and 0,95 m between lines) and four plant densities (5, 8, 11 and 14 plants per linear meter) were used. Plant height was controlled by growth regulator. Six plants per plot were labeled and analyzed for the phenological phase, average plant height, insertion height of the first fruit branch, stem diameter, number of vegetative and fruit branches, number of internodes and open bolls per plant. Two plants were analyzed per plot for the leaf area index (LAI) and plant top dry mass. Cotton yield and harvest early were determined considering the effective plot area. Samples of 20 open bolls randomized chosen per plot were analyzed for agronomical lab characteristics (average open boll mass, mass of 100 seeds and fiber percentage) and fiber technological characteristics (length, length uniformity, strength, micronaire and maturity). Results showed that the environmental conditions favored growth and development of the IAC 23 cultivar, which completed its lifecycle in 161 days; smaller row and higher plant density resulted in greater LAI, smaller stem diameter due to estiolation and fewer open bolls per plant; larger row and lower plant density promoted greater plant top dry mass and average plant height; the harvest index increased with row, although it was not altered by plant density; higher plant density in rows increased the insertion height of the first fruit branch; the number of vegetative branches was not influenced by plant row and density, while the number of fruit branches and internodes decreased with level of plant population per area; cotton yield was 12% and 8,4% higher for the ultra-narrow row and narrow row, respectively, when compared with the conventional row; cotton yield for the ultra-narrow row with the lowest plant density in rows was 29,2% and 22,3% higher than the yields for the narrow row and conventional row, respectively, considering the same plant density; harvest early of the IAC 23 cultivar varied with the increase in plant population per area; agronomical lab characteristics and fiber technological characteristics did not vary in the plant populations studied.
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Tr?s ensaios sobre o envelhecimento populacional e seus efeitos econ?micosZuanazzi, Pedro Tonon 15 December 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-12-15 / SESCON-RS / This dissertation is comprised of three essays that relate the demographic transition and the
population aging to its economic impacts. The relevance of this topic in literature has
increased since the second half of the last century, when studies starts to use, in addition to
population growth, changes in the age structures of the population. In the case of Brazil,
population will face important challenges in the coming years, such as the population decline
and a continuous increase in the elderly population, thus resulting in the end of the
demographic dividend - a period when there is an increase in the participation of the
population aged 15-64 years in the total population. Thus, in the first essay, the main
objective is to evaluate the impact of the demographic dividend on per capita GDP growth
using a panel database of countries. The results show that, although the demographic dividend
is directly related to the per capita GDP, its effects are partially alleviated due to its inverse
relation with the proportion of workers among the population aged 15-64 years. In the second
essay, we analyze the evolution of the relationship between the Brazilian's age and their
probability to be a saver, measuring the effect of aging on private savings through the
Household Budget Surveys (POFs) of 1995-1996, 2002-2003 and 2008-2009. The results,
obtained through a multinomial logit model, indicate that demography should contribute
slightly to increase the number of savers in the coming years, which indicates that the country
lives a smooth second demographic bonus. Finally, considering that several social security
reforms have been applied in Brazil since the Federal Constitution of 1988, necessary in part
by the process of population aging, the third essay aims at estimating the impact of the
modifications of one of these reforms on the Brazilians probability to save. In this case, we
investigated the reform originated by Constitutional Amendments 41 and 47, which occurred
between the 2002-2003 and 2008-2009 POFs and substantially affected only the civilian
public employees, which allowed the use of a difference-in-differences using the other
workers as a control group. The results are that the reform has impacted on an increase in the
percentage of savers, in accordance with the life cycle hypothesis. / Esta tese ? formada por tr?s ensaios que relacionam a transi??o demogr?fica e o
envelhecimento populacional com seus impactos na economia. A relev?ncia desse tema na
literatura aumentou a partir da segunda metade do s?culo passado, quando os estudos
passaram a empregar, al?m do crescimento populacional, as modifica??es nas estruturas
et?rias da popula??o. No cen?rio brasileiro, a popula??o enfrentar? desafios importantes nos
pr?ximos anos, como o decl?nio populacional e um cont?nuo aumento da parcela da popula??o
idosa, acarretando, portanto, o fim do seu b?nus demogr?fico ? janela em que aumenta a
participa??o da popula??o de 15 a 64 anos na popula??o total. Dessa forma, no primeiro
ensaio, o objetivo principal foi avaliar os impactos do b?nus demogr?fico no crescimento do
PIB per capita utilizando uma base de dados em painel formada por pa?ses. Os resultados
obtidos apontam que, embora o b?nus atinja, por identidade, o PIB per capita diretamente,
seus efeitos s?o parcialmente amenizados devido ? sua rela??o inversa com a propor??o de
trabalhadores entre a popula??o de 15 a 64 anos. No segundo ensaio, atrav?s das Pesquisas de
Or?amento Familiares (POFs) de 1995-1996, 2002-2003 e 2008-2009, estudou-se a evolu??o
da rela??o entre a idade do brasileiro e a sua probabilidade de ser poupador, avaliando, assim,
o efeito do envelhecimento na poupan?a privada. Os resultados, obtidos atrav?s de um modelo
logit multinomial, sinalizam que a demografia deve contribuir ligeiramente para o
crescimento no n?mero de poupadores nos pr?ximos anos, dando ind?cios de que o pa?s vive,
de forma suave, um segundo b?nus demogr?fico. Por fim, tendo em vista que diversas
reformas previdenci?rias t?m sido aplicadas no Brasil desde a Constitui??o Federal de 1988,
necess?rias, em parte, pelo processo de envelhecimento da popula??o, o terceiro ensaio visa
estimar o impacto das modifica??es de uma dessas reformas na probabilidade de poupar dos
brasileiros. No caso, investigou-se a reforma originada pelas Emendas Constitucionais 41 e
47, que ocorreu entre as POFs 2002-2003 e 2008-2009 e atingiu substancialmente apenas os
servidores p?blicos civis, o que permitiu a utiliza??o de um modelo de diferen?as-emdiferen?as
utilizando os demais trabalhadores como grupo controle. Os resultados encontrados
s?o de que a reforma impactou em um incremento no percentual de poupadores, indo ao
encontro da hip?tese do ciclo de vida.
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