Nos últimos anos, numerosas evidências da literatura científica têm atribuído ao hormônio nonapeptídico oxitocina (OXT) diversas ações sobre o comportamento animal. Para uma melhor compreensão desta associação, objetivou-se neste trabalho um estudo da evolução molecular da porção codificadora do gene do receptor da oxitocina (OXTR) em espécies da ordem Primates, assim como o desenho de uma rede gênica funcional da oxitocina, e sua análise ao longo de diversas linhagens de vertebrados. Obtivemos a sequência parcial de cDNA do gene OXTR para nove espécies de macacos do Novo Mundo, dado ausente na literatura até o momento. Associando estas informações à sequência de outras espécies de primatas que possuem o seu genoma descrito em banco de dados eletrônico, realizamos a comparação das porções codificantes do OXTR: entre 12 espécies de primatas para o éxon 3, e 17 espécies para o éxon 4. Descrevemos a ocorrência de 30 variações de códons não-sinônimas, distribuídas em 22 sítios diferentes. Evidenciamos o domínio intracelular 4 (IC4) como a região de menor conservação da proteína OXTR, respondendo por 46,6% (14/30) das variações observadas. De forma semelhante, este domínio apresentou o maior número de substituições moderadamente radicais, segundo critérios químicos (escore de Grantham). Identificamos três variações de sítios características, adjacentes a resíduos bastante conservados ao longo da filogenia por sua grande importância funcional. Uma análise de máxima verossimilhança códon-por-códon de sequências do gene OXTR em 38 espécies de vertebrados mostrou que a seleção negativa é a maior força agindo sobre o gene OXTR, embora 10% dos sítios apresentam um possível relaxamento. Metodologias da biologia de sistemas foram combinadas para o desenho de uma rede funcional da oxitocina, composta pelos genes AVP, AVPR1A, AVPR1B, ESR1, FOS, HCRT, OXT, OXTR, PRL, PRLH, PRLR e TRH. O nível de conservação destes 12 genes foi estudado em 36 espécies de vertebrados por meio da comparação das proteínas traduzidas com o seu homólogo humano. Identificaram-se dois grupos gênicos de padrão de conservação significativamente diferentes: um grupo mais conservado, associado à oxitocina (OXT), e um grupo mais diverso, relacionado à prolactina (PRL). / During the past years, many evidences from scientific literature have ascribed several actions over animal behaviour to the nonapeptidic hormone oxytocin (OXT). For a better understanding of this association, it was aimed on this research an assay on molecular evolution of the coding sequence of the oxytocin receptor gene (OXTR) on species from the order Primates, and also the design of an oxytocin gene network and its analysis through several vertebrate lineages. We obtained the partial sequence of cDNA from gene OXTR for nine species of New World monkeys, an unpublished data until present. Blending these informations to the sequence of other primates, available at genomic databases, we compared the coding regions of OXTR: among 12 primate species for exon 3, and 17 species for exon 4. We described 30 non-synonyms changes, distributed along 22 different sites. We found that intracellular domain 4 (IC4) has the lowest conservation rate of the OXTR protein, being responsible for 46,6% (14/30) of the observed variations. Likewise, this domain presented the highest number of moderately radical substitutions, according to chemical criteria (Grantham score). We identified three characteristic sites changes, located besides aminoacids highconserved for its great functional importance. A maximum-likelihood analysis by codon of the OXTR gene sequence on 38 vertebrate species showed that negative selection is the strongest power acting over the OXTR gene, although 10% of the sites are presented as possibly relaxed. Methodologies from systems biology were combined for design of an oxytocin functional network, composed by genes AVP, AVPR1A, AVPR1B, ESR1, FOS, HCRT, OXT, OXTR, PRL, PRLH, PRLR and TRH. Conservation levels from those 12 genes were studied on 36 vertebrate species by comparing the translated protein with its human homologous. Two assembling of genes showed conservation pattern significantly different: a more conserved group, associated to oxytocin (OXT), and a more diverse one, related to prolactin (PRL).

Um dos maiores objetivos na ciência atual é poder relacionar alterações nos genes a mudanças nas morfologias de organismos multicelulares. Além disso, é importante poder determinar se estas modificações foram obras do acaso ou se a seleção natural teve um papel central moldando a forma e o tamanho das criaturas vivas. A busca por nutrientes e sua utilização é uma das questões mais básicas para a sobrevivência de uma espécie. Em mamíferos a diversificação e especialização dos dentes para triturar, rasgar e mastigar diferentes tipos de comida possibilitou um incremento na geração de energia e representou uma inovação chave para a sobrevivência deste grupo. No presente estudo foi investigado o gene PAX9, que codifica um fator de transcrição chave no desenvolvimento da dentição de mamíferos. Para 125 indivíduos de origem ameríndia foi seqüenciado o exon 3 (138 pb), conjuntamente com as regiões intrônicas flanqueadoras 5´e 3´(232 pb e 220 pb, respectivamente) e os dados integrados com a informação disponível para a mesma região de 115 indivíduos de diferentes origens geográficas. Além disso, os exons 2, 3 e 4 (627 pb, 138 pb e 240 pb respectivamente) foram seqüenciados do DNA de 25 espécies de mamíferos e agrupados com os dados disponíveis de mais 29 espécies. Em humanos, o polimorfismo Ala240Pro possui uma distribuição variada entre os Ameríndios da América do Sul e está presente em Esquimós, Asiáticos e Europeus, mas não está presente entre os Afro-Americanos. O panorama que surge é que provavelmente a partir da saída da África a freqüência da mutação Ala240Pro aumenta, sendo possivelmente selecionada positivamente, o que pode estar relacionado à agenesia do terceiro molar, ou ainda, estar associado a genes conectados a adaptações ao frio. Com a chegada dos Ameríndios a regiões equatoriais, outro cenário parece dominar a evolução do exon 3, seja pela perda inicial da possível vantagem adaptativa, ou por causa da ação da deriva genética amplamente documentada nestas populações. Provavelmente em algum momento na história destas populações, fatores casuais poderiam ter sido preponderantes às restrições funcionais da proteína. Em geral, há uma maior variabilidade em nível de aminoácidos no exon 3 considerando todos os mamíferos estudados quando comparada com a do exon 2, ficando o exon 4 numa posição intermediária. O exon 3 seria um exemplo notável de uma situação que conferiria “evolvabilidade” ao PAX 9. / One of the main goals in science today is to establish the relation between gene changes and variations in the morphologies of multicellular organisms. In addition, it is important to determine if these changes were randomic or whether natural selection had a central role shaping the form and size of living beings. Searching for nutrients and its use is one of the most basic issues for a species survival. In mammals teeth diversification and specialization to grind, tear and chew different types of food were a key innovation that allowed an increase in the generation of energy and in the survival of this group. In this study an investigation was performed in the Paired box gene 9 (PAX9), which codes for a transcription factor that was a key factor in the development of mammal dentition. A total of 125 persons from Amerindian populations were studied by sequencing the PAX9 gene exon 3 (138 base pairs) as well as its 5´and 3´flanking intronic segments (232 bp and 220 bp, respectively) and the data integrated with the information available for the same genetic region from 115 individuals of different geographical origins. Moreover, exons 2, 3 and 4 (627 bp, 138 bp and 240 bp, respectively) were sequenced from DNA of 25 mammalian species and the results combined with the data available from other 29 additional species. In humans, the Ala240Pro polymorphism has a varied distribution among the South American Amerindians and is present in Eskimos, Asians and Europeans, but it is not present among Afro-Americans. The pattern that emerges is that probably starting with the out-Africa migration, and possibly as a result of positive selection, the Ala240Pro mutation frequency increased, that could be related to third molar agenesis or an associated gene connected to cold adaptation. With the Amerindian arrival again in equatorial regions, another pattern seems prevalent in exon 3 evolution, either due to the loss of a possible initial adaptive advantage, or to the action of genetic drift, widely documented in these populations. Probably at some point in the history of these populations, random factors could have been dominant despite the protein functional restrictions. In a general way, there is a greater variability at the amino acid level in exon 3 of all mammals considered when compared to exon 2, exon 4 occupying an intermediary position. Exon 3 would be a remarkable example of a condition that would confer PAX9 evolvability.

Nos últimos anos, numerosas evidências da literatura científica têm atribuído ao hormônio nonapeptídico oxitocina (OXT) diversas ações sobre o comportamento animal. Para uma melhor compreensão desta associação, objetivou-se neste trabalho um estudo da evolução molecular da porção codificadora do gene do receptor da oxitocina (OXTR) em espécies da ordem Primates, assim como o desenho de uma rede gênica funcional da oxitocina, e sua análise ao longo de diversas linhagens de vertebrados. Obtivemos a sequência parcial de cDNA do gene OXTR para nove espécies de macacos do Novo Mundo, dado ausente na literatura até o momento. Associando estas informações à sequência de outras espécies de primatas que possuem o seu genoma descrito em banco de dados eletrônico, realizamos a comparação das porções codificantes do OXTR: entre 12 espécies de primatas para o éxon 3, e 17 espécies para o éxon 4. Descrevemos a ocorrência de 30 variações de códons não-sinônimas, distribuídas em 22 sítios diferentes. Evidenciamos o domínio intracelular 4 (IC4) como a região de menor conservação da proteína OXTR, respondendo por 46,6% (14/30) das variações observadas. De forma semelhante, este domínio apresentou o maior número de substituições moderadamente radicais, segundo critérios químicos (escore de Grantham). Identificamos três variações de sítios características, adjacentes a resíduos bastante conservados ao longo da filogenia por sua grande importância funcional. Uma análise de máxima verossimilhança códon-por-códon de sequências do gene OXTR em 38 espécies de vertebrados mostrou que a seleção negativa é a maior força agindo sobre o gene OXTR, embora 10% dos sítios apresentam um possível relaxamento. Metodologias da biologia de sistemas foram combinadas para o desenho de uma rede funcional da oxitocina, composta pelos genes AVP, AVPR1A, AVPR1B, ESR1, FOS, HCRT, OXT, OXTR, PRL, PRLH, PRLR e TRH. O nível de conservação destes 12 genes foi estudado em 36 espécies de vertebrados por meio da comparação das proteínas traduzidas com o seu homólogo humano. Identificaram-se dois grupos gênicos de padrão de conservação significativamente diferentes: um grupo mais conservado, associado à oxitocina (OXT), e um grupo mais diverso, relacionado à prolactina (PRL). / During the past years, many evidences from scientific literature have ascribed several actions over animal behaviour to the nonapeptidic hormone oxytocin (OXT). For a better understanding of this association, it was aimed on this research an assay on molecular evolution of the coding sequence of the oxytocin receptor gene (OXTR) on species from the order Primates, and also the design of an oxytocin gene network and its analysis through several vertebrate lineages. We obtained the partial sequence of cDNA from gene OXTR for nine species of New World monkeys, an unpublished data until present. Blending these informations to the sequence of other primates, available at genomic databases, we compared the coding regions of OXTR: among 12 primate species for exon 3, and 17 species for exon 4. We described 30 non-synonyms changes, distributed along 22 different sites. We found that intracellular domain 4 (IC4) has the lowest conservation rate of the OXTR protein, being responsible for 46,6% (14/30) of the observed variations. Likewise, this domain presented the highest number of moderately radical substitutions, according to chemical criteria (Grantham score). We identified three characteristic sites changes, located besides aminoacids highconserved for its great functional importance. A maximum-likelihood analysis by codon of the OXTR gene sequence on 38 vertebrate species showed that negative selection is the strongest power acting over the OXTR gene, although 10% of the sites are presented as possibly relaxed. Methodologies from systems biology were combined for design of an oxytocin functional network, composed by genes AVP, AVPR1A, AVPR1B, ESR1, FOS, HCRT, OXT, OXTR, PRL, PRLH, PRLR and TRH. Conservation levels from those 12 genes were studied on 36 vertebrate species by comparing the translated protein with its human homologous. Two assembling of genes showed conservation pattern significantly different: a more conserved group, associated to oxytocin (OXT), and a more diverse one, related to prolactin (PRL).

Um dos maiores objetivos na ciência atual é poder relacionar alterações nos genes a mudanças nas morfologias de organismos multicelulares. Além disso, é importante poder determinar se estas modificações foram obras do acaso ou se a seleção natural teve um papel central moldando a forma e o tamanho das criaturas vivas. A busca por nutrientes e sua utilização é uma das questões mais básicas para a sobrevivência de uma espécie. Em mamíferos a diversificação e especialização dos dentes para triturar, rasgar e mastigar diferentes tipos de comida possibilitou um incremento na geração de energia e representou uma inovação chave para a sobrevivência deste grupo. No presente estudo foi investigado o gene PAX9, que codifica um fator de transcrição chave no desenvolvimento da dentição de mamíferos. Para 125 indivíduos de origem ameríndia foi seqüenciado o exon 3 (138 pb), conjuntamente com as regiões intrônicas flanqueadoras 5´e 3´(232 pb e 220 pb, respectivamente) e os dados integrados com a informação disponível para a mesma região de 115 indivíduos de diferentes origens geográficas. Além disso, os exons 2, 3 e 4 (627 pb, 138 pb e 240 pb respectivamente) foram seqüenciados do DNA de 25 espécies de mamíferos e agrupados com os dados disponíveis de mais 29 espécies. Em humanos, o polimorfismo Ala240Pro possui uma distribuição variada entre os Ameríndios da América do Sul e está presente em Esquimós, Asiáticos e Europeus, mas não está presente entre os Afro-Americanos. O panorama que surge é que provavelmente a partir da saída da África a freqüência da mutação Ala240Pro aumenta, sendo possivelmente selecionada positivamente, o que pode estar relacionado à agenesia do terceiro molar, ou ainda, estar associado a genes conectados a adaptações ao frio. Com a chegada dos Ameríndios a regiões equatoriais, outro cenário parece dominar a evolução do exon 3, seja pela perda inicial da possível vantagem adaptativa, ou por causa da ação da deriva genética amplamente documentada nestas populações. Provavelmente em algum momento na história destas populações, fatores casuais poderiam ter sido preponderantes às restrições funcionais da proteína. Em geral, há uma maior variabilidade em nível de aminoácidos no exon 3 considerando todos os mamíferos estudados quando comparada com a do exon 2, ficando o exon 4 numa posição intermediária. O exon 3 seria um exemplo notável de uma situação que conferiria “evolvabilidade” ao PAX 9. / One of the main goals in science today is to establish the relation between gene changes and variations in the morphologies of multicellular organisms. In addition, it is important to determine if these changes were randomic or whether natural selection had a central role shaping the form and size of living beings. Searching for nutrients and its use is one of the most basic issues for a species survival. In mammals teeth diversification and specialization to grind, tear and chew different types of food were a key innovation that allowed an increase in the generation of energy and in the survival of this group. In this study an investigation was performed in the Paired box gene 9 (PAX9), which codes for a transcription factor that was a key factor in the development of mammal dentition. A total of 125 persons from Amerindian populations were studied by sequencing the PAX9 gene exon 3 (138 base pairs) as well as its 5´and 3´flanking intronic segments (232 bp and 220 bp, respectively) and the data integrated with the information available for the same genetic region from 115 individuals of different geographical origins. Moreover, exons 2, 3 and 4 (627 bp, 138 bp and 240 bp, respectively) were sequenced from DNA of 25 mammalian species and the results combined with the data available from other 29 additional species. In humans, the Ala240Pro polymorphism has a varied distribution among the South American Amerindians and is present in Eskimos, Asians and Europeans, but it is not present among Afro-Americans. The pattern that emerges is that probably starting with the out-Africa migration, and possibly as a result of positive selection, the Ala240Pro mutation frequency increased, that could be related to third molar agenesis or an associated gene connected to cold adaptation. With the Amerindian arrival again in equatorial regions, another pattern seems prevalent in exon 3 evolution, either due to the loss of a possible initial adaptive advantage, or to the action of genetic drift, widely documented in these populations. Probably at some point in the history of these populations, random factors could have been dominant despite the protein functional restrictions. In a general way, there is a greater variability at the amino acid level in exon 3 of all mammals considered when compared to exon 2, exon 4 occupying an intermediary position. Exon 3 would be a remarkable example of a condition that would confer PAX9 evolvability.

Orientador: Eleonore Zulnara Freire Setz / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-23T04:30:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Martins_CristianaSaddy_M.pdf: 4579070 bytes, checksum: aa99f4f976668643642725f45056edf4 (MD5) Previous issue date: 1997 / Resumo: O uso de habitat por um grupo de três bugios (Alouatta fusca clamitans) foi estudado em um fragmento de 165 hectares de mata mesófila semidecídua na região de Lençóis Paulista, oeste de São Paulo. Aspectos da dieta dos animais, uso do tempo e uso do espaço foram investigados num período de 12 meses. Paralelamente foi realizada a descrição florística da área de estudo e o acompanhamento fenológico das espécies arbóreas. Através do método de parcelas foram amostradas 754 árvores (CAP = 32 cm), pertencentes a 38 famílias e 90 espécies. As observações da dieta e uso do tempo foram realizadas através do método "scan", a intervalos de dez minutos. Em trinta e quatro dias inteiros obteve-se 3.523 registros somando 408 horas de observação dos primatas. o uso do espaço foi estudado marcando o quadrado de 50x50 metros em que o grupo se localizava em mapas, a intervalos de 30 minutos. Os bugios consumiram partes de 34 espécies vegetais, sendo que os registros de dieta inc1uiram 66% de folhas maduras, 19% de frutos maduros, 10% de folhas jovens e 2% de frutos imaturos. As espécies mais utilizadas foram Ficus hirsuta e Pyrostegia venusta. O consumo de folhas maduras esteve presente durante todo o ano, mas foi significativamente maior nos meses de Junho a Agosto. Houve um consumo sazonal de folhas jovens (de Setembro a Novembro) e frutos maduros (de Dezembro a Fevereiro). A utilização de folhas maduras e jovens, assim como de frutos maduros apresentou correlação com a abundância destes itens na fenologia. Em relação ao uso do tempo, o descanso predominou, totalizando 77% do tempo amostrado, seguida da movimentação (12%) e alimentação (10%). Os bugios dispendem mais tempo se deslocando e se alimentando no verão. A área de uso total ('home range") calculada pelo método de somatório dos quadrados foi de 12,5 ha, com uma área central de utilização de 4 ha. Não houve diferenças entre a área utilizada e as distâncias diárias percorridas entre estações, embora na primavera e verão os bugios utilizem o espaço de forma mais restrita. Avaliando os resultados sob a ótica do forrageamento ótimo, pode-se perceber uma mudança de estratégia pelos bugios nas diferentes épocas do ano. Utilizam a estratégia de alto custo/alto retomo no uso do habitat, durante os períodos de maior oferta de recursos (época chuvosa). Há um maior dispêndio de energia em atividades como deslocamento e alimentação, porém o retomo também é maior devido ao consumo de itens alimentares mais energéticos. E na época de escassez de recursos (época seca), utilizam a estratégia de baixo-custo/baixo-retorno. Comparando-se os resultados deste estudo com outros estudos realizados com a mesma espécie, os bugios em Lençóis Paulista utilizam menos espécies vegetais na dieta, mais folhas maduras e uma área de vida maior, o que pode ser explicado pelo formato estreito do fragmento utilizado, pelo grau de perturbação do habitat e pela baixa densidade de bugios no local / Abstract: The habitat use of a group of three brown howler monkeys (Alouatta fusca clamitans) was studied in a fragment with 165 ha of semideciduous forest in Lençóis Paulista, west of São Paulo State. Aspects of diet, time budgets and space use of the animals were investigated during 12 months. It was carried out also the fIoristic study of the area and the phenology of the trees. Through the "quadrat method" 754 trees with CBH = 32 cm were sampled, belonging to 38 families and 90 species. The diet and space use observations were carried out through the "scan sampling" method using ten minutes intervalo Thirty-four whole days were sampled and 3.523 records were obtained in 408 hours of field observations. The space use was studied ploting the primate group locations in a map with quadrats of 50x50 meters each 30 minute. The howlers consumed parts of 34 plant species, and the diet records included 66% of mature leaves, 19% ofripe fruits, 10% ofyoung leaves and 2% ofunripe fruits. The most consumed species were Ficus hirsuta and Pyrostegia venusta. Mature leaves were used during the whole year, but consumption was significant higher from June to August. There was a seasonal consumption of young leaves (from September to November) and ripe fruits (from December to January). The mature, young leaves and ripe fruits use showed correlation with the abundance found in the phenology. Regarding time budgets, resting is predominant, with 77% of the records, followed by moving (12%), and feeding (10%). The howlers spent more time moving and feeding during summer (December to February). The home range calculated using the "summed quadrats" method was 12,5 ha, with a core area of 4 ha. There was no difference between the area used and the daily distances among the seasons, although during spring and summer the howlers had used the area in a restrict way. Analysing the results according to the optimal foraging theory, the animals changed the strategy of habitat use according to the seasons. They have a high cost/high benefit strategy of habitat use during periods of great abundance of resources. They spent more energy, but they have also a greater return, because of the use of more energetical food itens. And during the season with scarce resouces, they have a strategy of low-cost/Iowreturn. Comparing the results of this study with other studies carried out with the same species, the howlers in Lençóis Paulista used less plant species in the diet, more mature leaves and they have a larger home range. The format of the fragment (thin and long), the disturbance degree of the habitat and the low density of howlers in the study site are probably the reasons for these findings / Mestrado / Mestre em Ecologia

Orientador : Carlos Roberto H. Fortinguerra / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-07-28T03:58:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Barbosa_Leandro_M.pdf: 1987736 bytes, checksum: 3bc2ab136b6c9848b47002284ccf338a (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: o estudo da Anatomia Comparada, tem sido um tema relevante para inúmeros trabalhos científicos que procuram estabelecer prováveis correlações filogênicas entre os animais e o Homem. No intuito de estimar correlações anatõmicas entre o Cebus aoella e a espécie humana, este trabalho descreve o padrão vascular das artérias encontradas na coxa desse animal, seguindo uma linha de pesquisa já existente nos laboratórios de Anatomia Humana da Universidade Federal de Uberlândia (UFU). Foram utilizados para a execução deste trabalho, 10(dez) espécimes, sendo 5(cinco) machos e 5(cinco) fêmeas. Os animais foram anestesiados com inalação de clorofórmio e em seguida, sacrificados por perfusão intravenosa (veia femoral) de Ketalar, em seguida, foram tricotomizados e injetados com Látex corado em vermelho, logo após os animais foram fixados com solução aquosa de formol a 10 %,a seguir, efetuou-se a dissecação da região a ser estudada. Seguindo este procedimento constatou-se que na coxa do macaco Cebus aoella encontra-se os seguintes ramos; artérias ilíaca externa, femoral, epigástrica inferior, obturatória, circunflexa medial da coxa, circunflexa lateral da coxa com seus ramos ascendentes, descendentes e transversais, epigástrica superficial, pudenda externa, pudenda interna, profunda da coxa, ramos musculares, ramos articulares, artérias perfurantes, poplítea, colaterais do joelho, safenas magna e parva, seguindo uma descrição sintética, analisando os aspectos de freqüência, número, origem, trajeto e distribuição / Abstract: The Comparative Anatomy study has been used as an important issue for various scientific researches that want to stablish a probable evolutionary correlation between animais and the human being. With the purpose of stablishing evolutionary anatomical correlations between the Cebus apella and the human being, this paper describes the artery vessel patern found on this animal, 08 (eight) specimens, 04 (four) male and 04 (four) female ones. The animais were pre­ anesthetized by inhaling chloroform and afterwards sacrificed by intravenous perfusion (femoral vein) of Ketalar. Then they were divided into three parts to facilitate the handling and to better spot the veins and arteries. The next step was to inject the arteries with latex died in red and immediately afterwards the animais were fixed with an aqueous solution of formaldehyde at 10% and kept on this solution for a undetermined period. Then the dissection of the anterolateral side of the thigh took place, followed by cleaning of the femoral artery and its branches. With this procedure, it was possible to notice the following arteries on the thigh of the Cebus aDella monkey; external iliac artery, femoral artery, epigastric inferior artery, obturator artery, medial femoral circunflex, lateral femoral circunflex: branchs ascendent, descending and transverse, superficial epigastric, external pudendal, internal pudendal, deep femoral artery, muscular branches, articular branches, perforating arteries, popliteal artery, geniculares, saphenous great and short arteries, tibial artery followed by a summarized description trying to analyse the aspects of frequency, quantity, origin, track and distribution. The femoral artery pattern of the Cebus does not differ much from the one found on the human being and other monkeys. The biggest difference may be the presence of two saphenous great and short arteries / Mestrado / Mestre em Biologia e Patologia Buco-Dental

Orientador: Cory Teixeira de Carvalho / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-15T23:51:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Chiarello_AdrianoGarcia_M.pdf: 3006133 bytes, checksum: 260712f02c4ed6c6393d2e344058b0ce (MD5) Previous issue date: 1992 / Resumo: O comportamento e a ecologia de um grupo de seis bugios, Alouatta fusca, foram estudados semanalmente durante 12 meses na reserva municipal de Santa Genebra, de 250 ha de área, no município de Campinas. Simultaneamente, foi amostrada a fenologia de 186 árvores e arvoretas da reserva, pertencentes a 72 espécies e 29 famílias. O padrão de atividades e a dieta do grupo foram registrados através de amostragem instantânea ("scan samplins"), empregando-se sessões de três minutos de duração a cada intervalo de 10 minutos. Sessenta dias inteiros de observação (das 6:00 as 18:00 h, aproximadamente) foram utilizados, totalizando 718 horas de observação direta dos animais e 2.943 registros de alimentação. A área de vida do grupo foi quantificada através da plotagem de seus deslocamentos diários em mapa. Em média, os bugios repousaram por ó4% do período diário e a alimentação e o deslocamento ocuparam 18% e 13% deste período, respectivamente. Na estação seca o tempo gasto em alimentação (24%) foi significativamente maior do que na estação chuvosa (15%), observando-se o inverso deste padrão para o tempo alocado em repouso (59% e 69% do tempo diário nas estações seca e chuvosa, respectivamente). A área anual utilizada pelo grupo (4,13 ha) foi parcialmente compartilhada por cinco grupos vizinhos e foi ligeiramente maior na estação chuvosa (3,63 ha) do que na estação seca (3,13 ha). A dieta foi constituída basicamente por folhas (73%), flores (12%) e frutos (5%) de 67 espécies vegetais. Celtis iguanae, Cassia ferruginea e lnga spp. foram as espécies mais consumidas, constituindo cerca de 50% da dieta total. As folhas predominaram na dieta em todas as estações, porém no inverno o consumo de flores foi significativamente maior. Folhas jovens (59%) foram preferidas às folhas maduras (31%), sendo 56% das folhas ingeridas provenientes de árvores a 41% de lianas. A dieta do grupo esteve correlacionada positivamente às disponibilidades de folhas jovens, flores e frutos na reserva, porém as correlações não atingiram nível de significância para flores e frutos. Em comparação com outros trabalhos, o grupo estudado apresentou uma dieta mais rica em folhas, notadamente folhas jovens de lianas, e uma restrita área de vida, consequências prováveis da natureza perturbada da reserva e de sua alta densidade de bugios / Abstract: The behavior and ecology of a group of six brown howlers were studied weekly during 12 months in the Santa Genebra Reserve (22º49'45"S and 47º06'33"W), near the city of Campinas. The reserve has 250 ha of secondary, mesophitic, semi-deciduous forest. Simultaneously, the phenology of 186 trees of 72 species and 29 families was monitored. The "scan sampling method" was used to sample the activity pattern and the diet from dawn until dusk on each sample day with scans of three minutes of duration and 10-minutes intervals. Sixty complete days of observation were utilized, yielding 718 hours of animal-observer contact, and 2,943 feeding records. The group's home range was studied by plotting its daily range on a map. On average, the group rested for 64% of the daiIy period, and feeding and traveI1ing occupied 18% and 13% of this period, respectively. A significantly greater proportion of time was spent feeding during the dry season (24%) than in the wet season (15%), and the reverse of this pattern was observed for the time spent resting (59% and 69% of the daily time in the dry and wet seasons, respectively). The group's home range (4.13 ha) was partially shared by five neighbour groups, and it was slightly greater during the wet season (3.63 ha> than in the dry season (3.13 ha). The diet was composed of leaves (73%), flowers (12%) and fruits (5%), from 67 identified plant species. Celtis iguanae, Cassia ferruginea and lnga spp. were the most important plant species for the howlers, accounting for approximately 50 % of its diet. Young leaves (59%) were prefered to mature leaves (31%). Tree species contributed to 56% of the ingested leaves, and liana species to 41% of the leaf diet. The ingestion of young leaves, flowers and fruits was positively correlated to the availability of these items in the forest; however, the correlations were not significant for flowers and fruits. In comparison to other works, the diet of the study group was poorer in fruits and richer in young leaves of lianas, and its home range was rather small. These results are probable consequences of the proliferation of lianas and the high number of howlers existing in the reserve / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ciências Biológicas

Made available in DSpace on 2015-12-06T23:47:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O Torque Teno Vírus (TTV) foi primeiramente identificado em 1997, no Japão, em urn paciente com hepatite aguda pós-transfusão, de etiologia desconhecida, sendo após, caracterizado como urn pequeno vírus DNA circular de fita simples e não envelopado. Recentemente, o Torque Teno Vírus foi classificado em urn novo gênero chamado Anellovírus, que compreende também, o Torque Teno Mini Vírus (TTMV), Torque Teno Midi Vírus (TTMDV) e pequenos anelovírus (SAV). 0 TTV tern sido detectado em uma ampla gama de primatas nao humanos, bem como em animais domésticos. Este trabalho teve por objetivo pesquisar o TTV no soro e sangue total de primatas nao humanos e em plasma de frangos domésticos de corte (Gallus g. domesticus), pela aplicação da Nested-PCR da região não codificadora (UTR) e pel a Semi­Nested-PCR da região codificadora N22, seguido de seqüenciamento genômico e de análise filogenética. Através da Nested-PCR da região não codificadora (UTR) o DNA do TTV foi detectado no soro de 4 (5,3%) de 75 Cebus apella, 2 (40%) de 5 Alouata fusca, 1 (20%) de 5 Alouata caraya, 1 (5.2%) de 19 Callithrix penicilata, 1 (4%) de 25 Callithrix jacchus, 1 (20%) de 5 Saimiri sciureus e 1 (25%) de 4 Leontopithecus chrysomelas. Nao se obteve amplificação por PCR-UTR em nenhuma amostra de sangue total. A análise filogenética revelou que as seqüências detectadas em 8 amostras apresentaram maior identidade com as seqüências de TTV isoladas de macacos japoneses do novo mundo: So-TTV2 (Saüíinus oedipus) e At-TTV3 (Aotes Trivirgatus). Trt!!s seqüências (uma de Callithrix penicilata, uma de Leontopithecus crysomelas e uma de Cebus apella) mostraram similaridade com uma seqüência de Torque Teno Mini Vírus (TTMV) de humanos. Não se obteve amplificação por PCR-UTR em nenhuma amostra de plasma de frangos domésticos de corte (Gallus g. domesticus). Três amostras foram positivas pela amplificação da região ORF2. 0 DNA do TTV da região ORF2 foi detectado em uma amostra de soro de Cebus apella e em uma amostra de sangue total de Callithrix jacchus, e em uma de plasma de frango doméstico de corte (Gallus g. domesticus). As seqüências amplificadas pela região ORF2 nao mostraram diferenças entre as de humano, primatas nao humanos e de frango doméstico Pela Semi-Nested-PCR da região codificadora (N22), o DNA do TTV foi detectado no sangue total de 3 (4%) de 75 Cebus apella e de 1 (25%) de 4 Leontopithecus chrysomelas. Não se obteve amplificação por PCR em nenhuma amostra de soro. A análise filogenética revelou que uma amostra de Cebus apella agrupou-se com seqüências de macacos japoneses do novo mundo: Saguinus oedipus (So-TTV2) e Aotes trivirgatus (At-TTV3); duas amostras de Cebus apella mostraram similaridade com uma seqüência de Torque Teno Mini Vírus (TTMV) de humanos e uma (Cebus apella) mostrando similaridade com uma seqüência de chimpanzé (Pt-TTV6) e com uma seqüência de TTV de humano, cepa protótipo denominada TA278. Não se obteve amplificação por PCR-N22 em nenhuma amostra de plasma de frangos domésticos de corte (Gallus g. domesticus). Os resultados apresentados mostraram que este é o primeiro relato da ocorrência de Torque Teno Vírus e Torque Teno Mini Vírus em primatas não humanos do novo mundo e em frangos de corte (Gallus g. domesticus) no Brasil. / Torque Teno Virus (TTV) was first identified in the serum of a patient with acute post-transfusion hepatitis of unknown etiology in 1997 and was characterized as a small nonenveloped virus with a circular, single-stranded DNA. Recently, Torque Teno Virus has been classified to the newly genus called Anellovirus, which also comprises Torque Teno Mini Virus (TTMV), Torque Teno Midi Virus (TTMDV) and small Anellovirus. TTV has been detected in a range of non-human primates as well as domestic animals. The purpose of this study was to search TTV in the serum and total blood of nonhuman primates and in plasma of domestic chickens of cut (Gallus g. domesticus) by application the nested-PCR of the non-coding region (UTR) and by semi-nested-PCR of the coding region (N22), followed by a genomic sequence and phylogenetic analysis. By nested-PCR of non-coding region (UTR), the TTV DNA was detected in sera from 4 (5.3%) of 75 Cebus apella, 2 (40%) of 5 Alouata fusca, 1 (20%) of 5 Alouata caraya, 1 (5.2%) of 19 Callithrix penicilata, 1 (4%) of 25 Callithrix jacchus, 1 (20%) of 5 Saimiri sciureus e 1 (25%) of 4 Leontopithecus chrysomelas. No PCR-UTR amplification in any total blood sample was obtained. Phylogenetic analysis revealed that sequences detected in 8 samples had presented greater identity with TTV sequences isolated of Japanese new world non-human primates (So-TTV2 - Sagüínus oedipus and At-TTV3 - Aotes Trivirgatus). Three sequences (1 of Callithrix penicilata, 1 of Leontopithecus crysomelas and 1 of Cebus apella) showed similarity with a human Torque Teno Mini Virus (TTMV) sequence. No PCRUTR amplification in any domestic chicken plasma sample was obtained. Three additional samples were positive by the amplification of the ORF-2 region. TTV ORF2 DNA was detected in one sera sample of Cebus apella and one whole blood sample of Callithrix jacchus and in one plasma sample of domestic chicken of cut (Gallus g. domesticus). The sequences amplified by the ORF2 region showed no differences between human, non-human primates and domestic chicken. By semi-nested-PCR of coding region (N22), the TTV DNA was detected in total blood from 3 (4%) out of 75 Cebus apella and from 1 (25%) out of 4 Leontopithecus chrysomelas. No PCR amplification in any serum sample was obtained. Phylogenetic analysis revealed that one sample of Cebus apella clustered with sequences isolated of Japanese new world non-human primates (Saguinus oedipus - So-TTV2 and Aotes trivirgatus - At-TTV3); two samples of Cebus apella showed similarity with a human Torque Teno Mini Virus (TLMV) sequence. The other sample of Cebus apella showed similarity with one sequence of the chimpanzee (Pt-TTV6) and with the human TTV strain called TA278. No PCR amplification any domestic chicken plasma sample was obtained. The presented results showed that this is the first occurrence of Torque Teno Virus and Torque Teno Mini Virus in new world non-human primates and domestic chicken of cut (Gallus g. domesticus) in Brazil. / BV UNIFESP: Teses e dissertações

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000434730-Texto+Completo-0.pdf: 855325 bytes, checksum: c32de7fd4729e20d9bcd4832226480d4 (MD5) Previous issue date: 2011 / The species Brachyteles arachnoides, popularly known as southern muriqui, is considered the largest neotropical primate and currently listed as endangered, nevertheless no molecular population genetics study has been done so far in the southern muriqui. Here we analyze the phylogeography pattern, genetic diversity and demographic history of this species using sequences from part of the mtDNA Control Region and 14 microsatellites. The mtDNA showed a high genetic diversity and no clear evidence of geographical structuring. Moreover we showed that there was a population expansion around 15 thousand years ago and there is no concrete evidence of population decline. As well as in analysis with mtDNA, the microsatellites also showed no geographical structure, groups were not clearly defined and recent population decline was not evident. The lack of geographical structure was expected, mainly for mtDNA data, since females are known to disperse from their natal group, moreover the social groups are formed by male and females without an apparent hierarchy. For the other hand, as the microsatellites usually respond more rapidly to more recent fragmentation it would be expected they showed some evidence of structure caused by the recent fragmentation of Atlantic Forest, which was not observed. Similar results were also observed with the northern muriqui (Brachyteles hypoxanthus) that is critically endangered and occurs in more fragmented areas. / A espécie Brachyteles arachnoides, popularmente conhecido como muriqui do sul, é considerado o maior primata da América Latina e listado atualmente como estando ameaçado de extinção, apesar disso, até o momento, não existem estudos moleculares de genética de população a seu respeito. Aqui nós analisamos o padrão filogeográfico, diversidade genética e história demográfica da espécie utilizando sequências de parte da Região Controle do mtDNA e 14 loci de microssatélites. O mtDNA mostrou uma alta diversidade genética e nenhum indício claro de estruturação geográfica. Além disso, mostrou-se que houve uma expansão populacional há cerca de 15 mil anos atrás e não há nenhuma evidência concreta de declínio populacional. Assim como nas análises com mtDNA, os microssatélites também mostraram falta de estruturação geográfica, ausência de grupos definidos e nenhuma evidência de declínio populacional recente. A ausência de estruturação geográfica era esperada, principalmente para os dados de mtDNA, visto que as fêmeas são conhecidas por migrarem do seu grupo natal, além disso os grupos sociais de muriqui são formados por machos e fêmeas sem uma hierarquia aparente. Por outro lado, como os loci de microssatélite usualmente respondem rapidamente à fragmentação recente, seria esperado que eles mostrassem alguma evidência de estruturação causada pela recente fragmentação na Mata Atlântica, o que não foi observado. Resultados semelhantes também foram encontrados com o muriqui do norte (Brachyteles hypoxanthus) que está criticamente ameaçado e ocorre em áreas mais fragmentadas.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:06:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1947_1.pdf: 1104506 bytes, checksum: 575658f343fa190cbe1b4a98fb943787 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2003 / O sagüi do nordeste (Callithrix jacchus) é um primata endêmico do Nordeste Brasileiro, habitando diversos ecossistemas, inclusive ambientes urbanos, que vive em pequenos grupos familiares. Esse trabalho foi realizado no campus da UFRPE, Brasil, e teve como objetivo calcular a área de uso e descrever o padrão de dispersão de um grupo de sagüis urbanizados. Um grupo foi estudado de fevereiro a setembro de 2002 e capturado regularmente para coleta de dados morfométricos. No início das observações o grupo era composto de sete animais: 2 fêmeas adultas, 1 macho adulto, 1 macho jovem e 3 infantes. No final das observações, a composição era: 2 machos adultos, 2 fêmeas adultas, 1 fêmea sub-adulta e 1 jovem. Durante o estudo 2 animais adultos se dispersaram para outros grupos, e um jovem foi predado. Para a análise da área de uso a fêmea dominante Adriana (A) foi observada e sua localização anotada a cada 20 minutos por um período de 8 meses. Localizações foram transferidas para o programa CALHOME (Califórnia Home Range) e através do método do Mínimo Polígono Convexo com 100% dos pontos se determinou a área de uso total, que foi 0,67 hectares. Exploram em média 36 árvores, destas, 3 servindo como locais de dormida. O grupo estudado apresentou uma área de uso comparativamente pequena, explicada pela composição florística da área, composta de árvores frutíferas e gomíferas, de fácil acesso, dentro de uma área restrita