Orientadores: Brenda Paula Figueiredo de Almeida Gomes, Rogerio de Castilho Jacinto / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-15T18:25:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Montagner_Francisco_D.pdf: 4116912 bytes, checksum: 44ab64d774aeca67726f61c5f7590f94 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Os objetivos do presente estudo foram caracterizar as comunidades microbianas presentes em canais radiculares (CR) com necrose pulpar e abscessos periapicais agudos (APA) de amostras pareadas, e determinar in vitro a suscetibilidade antimicrobiana de bactérias anaeróbias estritas isoladas através do método de E-test. Coletas microbiológicas de 20 CR e 20 amostras de exsudatos de APA dos mesmos pacientes foram processadas e caracterizadas empregando-se métodos de análise do polimorfismo do fragmento terminal de restrição (APFTR), cultura microbiana e testes bioquímicos, PCR e Nested-PCR. Os dados foram analisados estatisticamente, de acordo com suas características. Amostras de CR e APA não diferiram no número de microrganismos ou diversidade de suas comunidades quando avaliadas através da técnica de APFTR. Poucas espécies foram detectadas simultaneamente nos ecossistemas correlacionados. Nenhuma espécie foi detectada em todas as amostras, e a maioria foi detectada em apenas uma amostra. A técnica da cultura microbiana demonstrou predomínio de anaeróbios estritos pertencentes ao gênero Prevotella spp. e às espécies Parvimonas micra, Gemella morbillorum e Bacteroides ureolyticus em ambos ecossistemas. As espécies Porphyromonas endodontalis, Prevotella nigrescens, Filifactor alocis, T. socranskii e T. denticola foram freqüentemente detectados nos CR e APA, através do PCR ou Nested-PCR. E. faecalis foi detectado em CR em uma única amostra. Em 45% dos casos, observou-se a presença de ao menos uma cepa resistente a um ou mais agentes antimicrobianos testados. Amoxicilina, amoxicilina + ácido clavulânico e penicilina G foram os antibióticos mais efetivos, enquanto que maiores níveis de resistência foram observados para eritromicina e azitromicina. As cepas isoladas dos APA demonstraram valores inferiores de CIM quando comparadas àquelas isoladas em CR, exceto para a penicilina G. Comunidades microbianas com perfis heterogêneos foram observadas em amostras de canais radiculares e abscessos periapicais, de um mesmo paciente. Os microrganismos isolados em ambos os ecossistemas revelaram padrões não similares de suscetibilidade aos agentes antimicrobianos mais prescritos em Endodontia. / Abstract: The aim of this study was to examine the profile of microbial communities in necrotic root canals (RC) and acute periradicular abscesses (AP) in paired samples. The antimicrobial susceptibility was determined with E-test for strict anaerobes. Paired samples of RC and PA exudates were collected from 20 subjects and analyzed by terminal restriction fragment length polymorphism (t-RFLP), microbial culture, PCR, and Nested-PCR. Statistical analysis was performed. RC and PA were not different in the number of species or in the community diversity, however very few species were shared between the two communities. No single t-RF fragment was detected in all samples, and the majority was detected in only one sample. Strict anaerobes were frequently isolated in RC and PA samples, comprising the genus Prevotella spp., and the species Parvimonas micra, Gemella morbillorum e Bacteroides ureolyticus species. Porphyromonas endodontalis, Prevotella nigrescens, Filifactor alocis, T. socranskii e T. denticola were frequently detected in the RC and PA. Only one RC sample harbored E. faecalis which was detected with molecular methods. The E-test showed that at least one resistant strain was isolated from 45% of the subjects. Amoxicilin, amoxicilin + clavulanic acid and penicilin-G were the most effective antimicrobial agents, and high resistance levels were observed for erythromicin and azithromicin. PA isolates had lower MIC than RC strains, except for pennicilin-G. In conclusion, the microbial profiles of the RC and PA communities are distinct and diverged between all subjects. The heterogeneous profiles RC and PA produced microbial interactions that affected the susceptibility to the most frequently prescribed antimicrobial agents in Endodontics. / Doutorado / Endodontia / Doutor em Clínica Odontológica

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-25T15:36:24Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Renata G. Cunha.pdf: 3040966 bytes, checksum: 03c4fbd180be9d322c4e34f188abad93 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-25T15:36:39Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Renata G. Cunha.pdf: 3040966 bytes, checksum: 03c4fbd180be9d322c4e34f188abad93 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-25T15:36:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Renata G. Cunha.pdf: 3040966 bytes, checksum: 03c4fbd180be9d322c4e34f188abad93 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / Acute Lymphoblastic Leukemia (ALL) is the most common malignancy in children, especially in males and chemotherapy is generally the treatment for these patients. Minor side effects of therapy have been reported, and mucositis is one of the most common. It has been suggested in the literature that HSV-1 plays an important role in the severity of oral mucositis in patients with onco-hematological diseases. This study quantified HSV-1 in the oral mucosa of pediatric ALL patients undergoing GBTLI ALL-2009 protocol, from the Foundation of Hematology of the Amazon (HEMOAM), correlating viral load to the different stages of treatment and also to the presence and grading of oral mucositis. We evaluated twenty patients by clinical examination of the oral mucosa to identify oral lesions and also collected cells from buccal mucosa in several times and phases of chemotherapy. These samples were submitted to DNA extraction followed by detection and quantification of HSV-1 using Real Time PCR. Data were analyzed using Mann-Whitney and Kruskal Wallis test with a significance level of p ≤ 0.05. Of all patients, half of them were male, between 1 and 6 years (80%) and with ALL Type B low risk (75%). Dry mouth (15%) and oral mucositis (35%) were the oral lesions found. It was detected HSV-1 presence in the oral mucosa of 80% of patients at some stage of chemotherapy with predominance of the virus in the intensification phase only in patients with ALL B high risk, with no differences in viral load of HSV -1 at different stages of treatment in LLA B group of low risk. Higher incidence of mucositis was observed in prefase/induction (75%) with higher levels of the virus in these patients compared to those free of mucositis, but without statistical significance. It is suggested that HSV-1 is frequent in the buccal mucosa of patients with B ALL, and its viral load may be different in subtypes of ALL B. However, the role of HSV-1 at the onset of oral mucositis not it is certain. / Leucemia Linfoblástica Aguda (LLA) é a neoplasia maligna mais comum em crianças, principalmente do sexo masculino, sendo a quimioterapia o tratamento indicado para esses pacientes. Efeitos colaterais secundários decorrentes da terapia têm sido relatados, sendo a mucosite um dos mais comuns. Tem sido sugerido na literatura que o HSV-1 desempenha papel importante na severidade da mucosite bucal em pacientes com doenças onco-hematológicas. Este trabalho quantificou o HSV-1 na mucosa bucal de pacientes pediátricos com LLA submetidos ao protocolo GBTLI LLA-2009, na Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas (HEMOAM), correlacionando sua carga viral com as diferentes fases do tratamento e em relação a presença e graduação da mucosite bucal. Foram avaliados vinte pacientes por meio de exame clínico da mucosa bucal para identificação de lesões bucais, bem como a coleta de células da mucosa jugal em vários momentos das diferentes fases da quimioterapia. Foi realizada extração de DNA dessas amostras para posterior detecção e quantificação da carga viral do HSV-1 por meio da técnica de PCR em Tempo Real. Os dados foram analisados por meio dos testes de Mann Whitney e Kruskal Wallis com nível de significância de p ≤ 0,05. Do total de pacientes, metade era do sexo masculino, a maioria com idade entre 1 e 6 anos (80%) e com LLA do tipo B de baixo risco (75%). Lábios ressecados (15%) e mucosite bucal (35%) foram as manifestações bucais encontradas. Detectou-se a presença do HSV-1 na mucosa bucal de 80% dos pacientes em algum momento do tratamento quimioterápico havendo predominância do vírus na fase de Intensificação somente no grupo de pacientes com LLA B alto risco, não havendo diferenças na carga viral do HSV-1 nas diferentes fases do tratamento no grupo de LLA B de baixo risco. Maior ocorrência de mucosite foi observada na prefase/indução (75%) ocorrendo valores mais altos de carga viral nesses pacientes em relação aos livres de mucosite, porém sem significância estatística. Sugere-se que a presença do HSV-1 na mucosa bucal de pacientes com LLA B é frequente, e sua carga viral pode estar diferenciada nos subtipos de LLA B. No entanto, o papel do HSV-1 no surgimento da mucosite bucal ainda não está claro.

Nosso grupo de pesquisa já vem há alguns anos estudando métodos para a síntese do núcleo estrutural dos furanoeliangolidos, mais especificamente do goiazensolido. A estrutura básica deste composto corresponde a um sistema 7-oxabiciclo [6.2.1] undecano, e ele possui atividades biológicas como esquistossomicida, citotóxica e antiinflamatória. Em nosso trabalho utilizamos como etapa chave a reação de Diels-Alder, que é geralmente eficiente e rápida para formação de sistemas policíclicos. Na ultima etapa da proposta sintética, propomos a clivagem da ligação interna do sistema policíclico para obtenção do macrociclo desejado. / Our research group has been studying, for some years, new methods for the synthesis of the core structure of the furanoheliangolides, more specifically of goyazensolide. The basic structure of this compound is a 7-oxabicyclo [6.2.1] undecane system, and it shows biological activities such as schistosomicidal, cytotoxic and anti-inflammatory. In this work, we have used the Diels-Alder reaction as a key step, since it is usually fast and efficient for the synthesis of polycyclic structures. As a last step, we proposed that the cleavage of the internal bond of the rings should furnish the desired macrocycle.

Neste trabalho estudamos um sistema de equações diferenciais parabólicas que modelam um processo de difusão-reação em duas dimensões da mistura molecular e reação química irreverssível de um só passo entre duas espécies químicas A e B para formar um produto P. Apresentamos resultados analíticos e computacionais relacionados à existência e unicidade da solução, assim como estimativas do erro local e global utilizando elementos finitos. Para os resultados analíticos usamos a teoria de semigrupos e o principio do m´aximo, e a simulação numérica é feita usando diferenças finitas centrais e o esquema simplificado de Ruge-Kutta. As estimativas do erro local para o problema semi-discretizado são estabelecidas usando normas de Sobolev, e para estimar o erro global usamos shadowing finito a posteriori. Os resultados computacionais obtidos mostram que o comportamento da solução está dentro do esperado e concorda com resultados da referências. Assim mesmo as estimativas do erro local e global são obtidas para pequenos intervalos de tempo e assumindo suficiente regularidade sobre a velocidade do fluído no qual realiza-se o processo. Destacamos que a estimativa do erro global usando shadowing finito é obtida sob hipóteses a posteriori sobre o operador do problema e o forte controle da velocidade numa vizinhança suficientemente pequena.

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-04-26T14:52:46Z No. of bitstreams: 1 juliadalmeidafrancisquini.pdf: 1735542 bytes, checksum: 4d7e2281f91e1b21487285704a0ccbe7 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2016-05-02T00:52:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 juliadalmeidafrancisquini.pdf: 1735542 bytes, checksum: 4d7e2281f91e1b21487285704a0ccbe7 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-02T00:52:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 juliadalmeidafrancisquini.pdf: 1735542 bytes, checksum: 4d7e2281f91e1b21487285704a0ccbe7 (MD5) Previous issue date: 2016-02-17 / O doce de leite (DL) é tradicionalmente obtido pela concentração por calor do leite acrescido de açúcar e tem expressiva produção e comercialização na América Latina. A padronização das características deste produto e a adequação ao preconizado pelo Regulamento Técnico de Identidade e Qualidade de Doce de Leite (RTIQDL) tornam-se dificultados pela diversidade cultural, mudanças tecnológicas e distintos ingredientes usados na fabricação. Este alimento tem aroma, sabor e cor característicos principalmente em decorrência da reação de Maillard (RM) desencadeada durante o aquecimento. O trabalho objetivou verificar a qualidade e uniformidade por meio da análise físico-química e composicional de produtos comercializados na cidade de Juiz de Fora – Minas Gerais (MG) e em doces de leite fabricados experimentalmente. O trabalho buscou determinar o índice de 5-hidroximetilfurfural (HMF) nos doces de leite comerciais e ao longo da fabricação dos doces de leite experimentais, com o intuito de entender como diferentes formulações influenciam na formação deste indicador. Nove diferentes marcas comerciais e doze formulações experimentais foram submetidas às determinações de umidade, lipídeos, proteínas, cinzas, carboidratos, atividade de água (Aw) e teor de sólidos solúveis. Foi realizada a determinação de HMF livre e HMF total por espectrofotometria a 443 nm usando ácido tiobarbitúrico. A estatística descritiva dos resultados obtidos para os atributos físico-químicos, composicionais e dos índices de HMF livre e HMF total dos doces comerciais demonstraram elevada variabilidade entre as amostras, com despadronização e não cumprimento integral da legislação vigente. Em relação às amostras experimentais, a estatística descritiva revelou baixa variabilidade para os atributos físico-químicos e composicionais indicando maior aderência aos limites estabelecidos pelo RTIQDL. A análise dos resultados de HMF para os doces experimentais mostrou elevação dos índices de HMF livre e HMF total ao longo da fabricação. Concluiu-se que a adição de glicose e o uso de maiores concentrações de bicarbonato de sódio foram fatores determinantes para o aumento do índice de HMF. Os resultados deste trabalho ampliam o conhecimento científico sobre doce de leite favorecendo as indústrias de laticínios e a comunidade científica, além de evidenciar a importância da padronização e do controle durante a fabricação do doce de leite. / The “dulce de leche” (DL) is traditionally obtained by concentrating heat milk plus sugar and has significant production and commercialization in Latin America. The standardization of the characteristics of this product and the adequacy recommended by the Technical Regulation Identity and Quality of “Dulce de Leche” become hampered by cultural diversity, technological changes, and different ingredients used in manufacturing. This food has characteristic flavor, aroma and color mainly due to the Maillard Reaction (MR) triggered during heating. This study aimed to verify the quality and uniformity through physical-chemical and compositional analysis of the products marketed in the city of Juiz de Fora - Minas Gerais (MG) and in DL manufactured experimentally. In addition, the study sought to determine the 5-hydroxymethylfurfural content (HMF) in commercial DL and along the manufacture of experimental DL in order to understand how different formulations influence the formation of this index. Nine different trademarks and twelve experimental formulations were submitted to determination of moisture, lipid, protein, ash, carbohydrates, water activity (Aw) and soluble solids. It was held the determination of free HMF and total HMF by spectrophotometry at 443 nm using thiobarbituric acid. The descriptive statistic of the results for the physico-chemical and compositional properties, and the free HMF and total HMF index of the comercial DL show high variability between samples with non standardization and not complete compliance with current legislation. Regarding the experimental samples, the descriptive statistic found low variability for the physical-chemical and compositional attributes indicating greater cohesion with the limits established by Technical Regulation Identity and Quality of “Dulce de Leche”. The analysis of the results of HMF for the experimental dulces showed elevated levels of free HMF and total HMF along the manufacturing. It is concluded that the addition of glucose and the use of higher concentrations of sodium bicarbonate were decisive factors for increasing the index of HMF. The results of this study expand scientific knowledge about dulce de leche favoring the dairy industry and the scientific community, as well as highlight the importance of standardization and control during the manufacture of “dulce de leche”.

Orientador: Carlos Roque Duarte Correia / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química / Made available in DSpace on 2018-08-25T19:36:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Angnes_RicardoAlmir_M.pdf: 5518498 bytes, checksum: 67fa707a73dd9c8251132ea7853f9fd7 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: O presente trabalho apresenta a viabilidade da síntese e aplicação de diversas bisoxazolinas quirais com ligantes para arilação de Heck-Matsuda enantiosseletiva. A simetria C2 mostra-se vantajosa para a transferência da informação quiral para o aduto das reações testadas. Além disso, observou-se que o aumento do volume estéreo na série: Me < Bn < i-Pr < i-Bu nos substituintes dos ligantes do tipo 2,2¿-bis(2-oxazolina) possui pouca influência na enantioseletividade, os substituintes t-Bu causaram brusca alteração na reatividade do sistema presumivelmente devido a efeitos estéreos não incluídos no modelo de Chartoon. O potencial da classe de ligantes bis(imidazolinas) quirais foi evidenciado através de um único exemplo, embora tais ligantes ainda encontram pouquíssimas aplicações na literatura. A estrutura absoluta dos adutos descritos previamente no trabalho de Correia foi obtida através de cristalografia de difração de raios-X. Uma metodologia para a formação de estruturas quirais do tipo cis-4-aril-2-ciclopenten-1-ol a partir da dessimetrização do 3-ciclopenten-1-ol por meio de uma reação de Heck-Matsuda enantioseletiva foi brevemente estudada / Abstract: This work shows the feasibility of synthesis and application of several chiral bisoxazoline ligands in enantioselective Heck-Matsuda arylation. The C2 symmetry has shown advantages in the transmission of chiral information to the product of the reaction. Besides, the increment of steric hindrance along the series: Me < Bn < i-Pr < i-Bu on the substituents of 2,2¿-bis(2-oxazoline) type ligands shown little effect to the overall enantioselectivity, however, the use of t-Bu substituints caused great change in the system reactivity presumable through steric effects not included in the Chartoon model. The potential use of chiral bis(imidazoline) ligands is shown through a singles example, those ligands have yet found only a few applications in the literature The absolute structure of the aducts described previously in the work of Correia is obtained by the use of X-ray diffraction experiment. A methodology for synthesis of chiral structures like cis-4-aryl-2-cyclopenten-1-ol through desymmetrization of 3-cyclopent-1-ol by enantioselective Heck-Matsuda reaction has been briefly studied / Mestrado / Quimica Organica / Mestre em Química

Orientador: Luiz Carlos Dias / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química / Made available in DSpace on 2018-08-20T16:20:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Perez_CarlaCristina_D.pdf: 5128114 bytes, checksum: d3cf5087b543e1096ea7da56cdaadc47 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: Os salinecetais A e B foram isolados em 2007 por Fenical e colaboradores a partir da actinobactéria marinha Salinispora arenicola, e mostraram ser importantes alvos na quimioprevenção do câncer como inibidores da ornitina descarboxilase. Concluímos a síntese do fragmento avançado C-4/C-17 (19) envolvendo 19 etapas em 5,5% de rendimento global a partir do éster de Roche (rota linear mais longa). No decorrer deste trabalho algumas mudanças de estratégia se fizeram necessárias, estando sempre voltadas à procura da rota sintética mais criativa e eficiente. Foram utilizadas como etapas chave na rota sintética principal, reações aldólicas do tipo syn seletivas para a preparação do aduto 139, bem como reação aldólica de dupla diastereodiferenciação na preparação de 134b. Uma reação de Grignard estereocontrolada pelo substrato foi determinante na preparação de 169, seguido de uma ciclização intramolecular do tipo Wacker para formação do biciclo espirocetal presente em 29. A reação de homologação de Seyferth-Gilbert foi usada na preparação do alcino 187 e uma syn-hidroestanilação converteu o mesmo na estanana vinílica 19. Esse resultado permitiu a determinação inequívoca da estereoquímica dos centros formados por comparação com os dados obtidos nesse trabalho com os da literatura, além dessa rota permitir, a princípio, a obtenção dos mesmos fragmentos em escalas maiores / Abstract: The saliniketals A (1) and B (2) were isolated in 2007 by Fenical and coworkers from Salinispora arenicola and showed to be important inhibitors of ornithine decarboxylase. We concluded the synthesis of C-4/C-17 fragment (19) after 19 steps in 5.5% overall yield from Roche ester (longest linear sequence). This work was always focused on the search for the more creative and efficient synthetic route. The key steps involved an efficient syn-aldol reaction for the preparation of adducts 139 and a double diastereo-differentiating aldol reaction for the preparation of 134b. Substrate controlled Grignard reaction provide 169, and an intramolecular Wacker-type cyclization established the bicyclic spiroketal in 29. The Seyferth-Gilbert homologation was used in the preparation of alkyne 187 and a syn-hydrostannation provided the vinyl stannane 19. This result allowed the unequivocal determination of the stereochemistry for all stereocenters formed by comparison with data obtained from the literature. We are able to conclude a formal total synthesis of saliniketals A and B and the synthetic route is, in principle, amenable to a large scale synthesis / Doutorado / Quimica Organica / Doutora em Ciências

Orientador : Sandra Cecilia Botelho Costa / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-01T03:10:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Menoni_SilviaMendoncaFerreira_M.pdf: 21358610 bytes, checksum: 91199fa109a7df3793cf28393427c6a8 (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: O Helicobacter pylori (H. pylori) causa infecção muito comum no mundo inteiro e atualmente é considerada a segunda infecção de maior prevalência no homem acometendo pessoas de todas as idades. Estudos epidemiológicos indicam que o H. pylori está relacionado com o nível sócio-econômico e com os hábitos alimentares e constitui um fator ambiental adquirido, importante na patogenia de várias afecções do aparelho digestivo. Em algumas destas patologias, a relação etiológica foi suficientemente comprovada, em outras, é duvidosa ou se baseia em estudos preliminares. Os fatores de patogenicidade do H. pylori estão relacionados: com suas características, e com o meio em que ele se encontra. A capacidade do H. pylori de "não se deixar envolver" com a resposta imunológica do hospedeiro, de resistir à fagocitose, de produzir enzimas (urease, catalase, superóxido dismutase entre outras), favorece a cronicidade da infecção (no estômago) durante longos períodos, eventualmente durante toda a vida. O diagnóstico da infecção pelo Helicobacter pylori pode ser estabelecido utilizando-se vários testes, que diferem entre si em relação à sua especificidade, sensibilidade,caráter invasivo e custo. A detecção do DNA do H. pylori pela PCR (Reação em Cadeia da polimerase) é específica e sensível e pode servir como uma poderosa ferramenta para o diagnóstico da infecção causada por essa bactéria. O diagnóstico de variações em regiões funcionalmente relevantes no genoma do H. pylori tem sido usado como marcador genético em numerosos estudos clínicos para diferenciar as linhagens e associá-Ias à patogênese bacteriana. O presente trabalho teve como objetivo a padronização da técnica "PCR", com a utilização de "primers" que flanqueiam a região conservada do Helicobacter pylori (ureaseC), para a detecção do H.pylori a partir de biópsias endoscópicas, e aplicação do método em 141 pacientes, em seguimento no Gastrocentro-FCM-Unicamp, com suspeita da infecção. Também padronizamos a genotipagem do H. pylori com o auxilio de duas enzimas de restrição aplicadas ao produto da "PCR" em 60 pacientes que apresentaram PCR + para o H. pylori. Os resultados obtidos pela "PCR" foram comparados com os resultados obtidos pela Histologia nas biópsias fixadas e pelo teste rápido da uréase, nas biópsias a fresco. Para a genotipagem 60 pacientes foram avaliados. Entre os 141 pacientes estudados, obtivemos os seguintes resultados: das 59 amostras de biópsias endoscópicas gástricas fixadas em parafina, 12 amplificaram pela PCR (20,3%). Das 82 amostras de biópsias gástricas a fresco todas amplificaram, sendo que 64 amostras foram positivas e 18 amostras foram negativas. Em relação a genotipagem, os padrões encontrados foram comparados com a utilização do programa computacional BioCap 1 D: foram encontrados 11 padrões com a enzima HhaI e 12 padrões com a enzima MboI. Pelo número pequeno de amostras estudadas, não foi possível uma correlação estatisticamente significante entre genótipos específicos e padrões de patologias digestivas / Abstract: The Helicobacter pylori (H. pylori) causes a very common infection all over the world and is currently considered the second infection of larger prevalence in man, attacking people of alI ages. Epidemic studies indicate that the fi. py/ori is related with the socioeconomic leveI and dietary habits, constituting an nnportant acquired environmental factor in the pathogenesis of several diseases of the digestive system. In some of these patients the etiologic relationship was sufficiently proven; in others, it is doubtful or based on prelllninarystudies. The pathogenicity factors of the H. pylori are related to its characteristics and to the environment where it is found. The capacity of the fi. py/ori of not becoming involved with the immunologic answer of the host, of resisting phagocytosis and of producing enzymes (urease, catalase and superoxide dismutase, among others) favors chronic infections (in the stomach) during long periods, eventually during a lifetnne. The diagnosis of infection by the Helicobacter pylori can be established by means of several tests that differ from each other in relation to specificity, sensitivity, invasive character and cost. Detection of the H. pylori DNA by PCR (Polymerase Chain Reaction) is specific and sensitive and can be a powerful tool for diagnosis of the infection caused by this bacterium. The diagnosis of variations in functionalIy important areas of the H. pylori genome has been used as a genetic marker in numerous clinical studies to differentiate lineages and to associate them to bacterial pathogenesis. The present work had as objective the standardization of the PCR technique, with primers flanking the conserved area of the Helicobacter pylori (urease C) for detection of H. pylori, beginning with endoscopic biopsies and application of the method to 141 patients who were being followed at Gastrocentro-FCM-Unicamp as potential infection hosts. We also standardized H. pylori genotyping, aided by two restriction enzymes applied to the product of PCR in 60 patients that presented PCR + for H. pylori. The results obtained by PCR were compared with the results obtained by histology from the fastened biopsies and for the fast urease test, in fresh biopsies. Sixty patients were appraised for genotyping purposes. Among the 141 studied patients we obtained the following results: of the 59 samples of gastric endoscopic biopsies fastened in paraffin, 12 were amplified by PCR (20.3%). Of the 82 samples of fresh gastric biopsies all were positive for PCR (100%). In relation to genotyping, patterns were compared by means of BioCap lD computer program: 11 patterns with the enzyme HhaI and 12 patterns with the enzyme MboI were found. On account of the small number of studied samples, it was not possible to find a significant statistic correlation among specific and standard genotypes of digestive pathologies / Mestrado / Mestre em Farmacologia

Orientador: Silvana Pereira Barros / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-03T17:59:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 BritoJunior_RuiBarbosade_D.pdf: 2338944 bytes, checksum: 1b6d13469e92f97498385faa9a200d6e (MD5) Previous issue date: 2003 / Doutorado

Orientadores: Clarice Weis Arns, Liana M. Cardoso Verinaud / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-04T00:24:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Almeida_RenataServande_D.pdf: 8139323 bytes, checksum: 5f1811651bc45b3676a6e65c545345ff (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: O Vírus Respiratório Sincicial Bovino (BRSV) é o agente etiológico de infecções respiratórias amplamente distribuídas e que produzem perdas importantes na criação comercial de bovinos. A infecção pelo BRSV produz alterações patológicas como bronquiolite e pneumonia intersticial e acomete, sobretudo, animais jovens. A limitada multiplicação do vírus em cultivos celulares e a sua instabilidade, representam dificuldades durante os procedimentos de isolamento do BRSV a partir de amostras clínicas. O presente trabalho teve como objetivo padronizar técnicas rápidas, sensíveis e específicas para a detecção do BRSV, utilizando um isolado brasileiro. Para tanto, foram utilizados camundongos Balb/c como modelo de infecção experimental pelo BRSV, a partir dos quais o vírus foi detectado pelas técnicas de RT-nested-PCR e imuno-histoquímica (IHQ) e os resultados foram comparados com aqueles obtidos em bovinos infectados experimentalmente. A técnica de RT-nested-PCR mostrou-se mais sensível para detecção do BRSV do que a técnica de IHQ, tanto para tecidos murinos quanto bovinos. As técnicas foram utilizadas em tecidos de bovinos suspeitos de infecção por BRSV. Uma destas amostras apresentou resultado positivo no RT-nested-PCR e na IHQ. O seqüenciamento dos produtos de PCR deste vírus detectado foi realizado. Esta nova estirpe, juntamente com a descrita previamente BRSV-25-BR (único isolado presente até então no Brasil), é representante do subgrupo B do BRSV e constitui importante ferramenta para a avaliação do perfil dos isolados brasileiros de BRSV, estimar a origem destes isolados e redefinir as necessidades locais com relação ao conteúdo das vacinas. As técnicas de RTnested- PCR e IHQ padronizadas serão úteis em estudos epidemiológicos bem como, no diagnóstico laboratorial do BRSV no Brasil / Abstract: Bovine respiratory syncytial virus (BRSV) is the etiologic agent of widely distributed respiratory infections and is responsible for significant economic losses in commercial cattle production. Infection by BRSV produces pathological changes such as bronchiolitis and interstitial pneumonia and affects mainly young animals. The poor growth of the virus in cell cultures and its instability represent difficulties in virus isolation from clinical samples. The aim of the present work was to standardise fast, sensitive and specific methods to detect BRSV, using a Brazilian strain. For this purpose, Balb/c mice were used as experimental model to the BRSV infection, from which the virus was detected by the RT-nested-PCR and immunohistochemistry (IHC) standardised, and the results were compared with experimentally infected calves. RT-nested-PCR was more sensitive in detecting BRSV than IHC, from both mouse and calf tissues. These techniques were also used to screen calves suspected of being infected with BRSV. One of the suspected samples was positive by RTnested- PCR and IHC. Sequencing of the PCR products of this sample was carried out. This new isolate and the previously described BRSV-25-BR strain (the only well-known isolate in Brazil) are belong to subgrupo B and provide an important tool to evaluate the profile and to esteem the origin of Brazilian BRSV isolates and to determine the local necessities about the vaccines content. The standardised RT-nested-PCR and IHC techniques could be useful in the epidemiological studies and laboratory diagnosis of BRSV in Brazil / Doutorado / Microbiologia / Doutor em Genetica e Biologia Molecular