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Rastreamento de mutações no gene ASB10 (GLC1F) em pacientes portadores de glaucoma primário de ângulo aberto / Screening of mutations in ASB10 gene in primary open angle glaucoma patients

Souza, Bruno Batista, 1983- 27 May 2013 (has links)
Orientadores: Mônica Barbosa de Melo, José Paulo Cabral de Vasconcellos / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-22T22:28:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Souza_BrunoBatistade_M.pdf: 2093816 bytes, checksum: a5a2fcec7f8efe9155d60f7a43e91e51 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: O glaucoma é uma das principais causas de cegueira irreversível no mundo, acometendo cerca de 70 milhões de indivíduos, com pelo menos 6,8 milhões de pessoas apresentando cegueira bilateral. Fisiopatologicamente, o glaucoma é uma doença degenerativa do nervo óptico, frequentemente associada a uma elevada pressão intra-ocular (PIO) e caracterizada pela escavação do disco óptico e alterações no campo visual. Diferentes genes associados ao glaucoma têm sido identificados por meio de estudos de ligação, mas alterações nesses genes representam uma pequena proporção dos genes envolvidos no desenvolvimento da doença. Os genes identificados até o momento são TIGR/MYOC, OPTN, WDR36, NTF4 e ASB10, sendo que o último, identificado no ano de 2012, foi inicialmente mapeado em 1999 (lócus GLC1F) a partir do estudo de famílias com glaucoma primário de ângulo aberto (GPAA). O gene ASB10 está localizado na região 7q36.1 (lócus GLC1F) e possui 6 éxons, sendo que sua região de leitura compreende os éxons 1 a 5. Pertencente à família de proteínas ASB, a proteína ASB10 possui uma região central com sete repetições de anquirinas codificada pelos éxons 2 e 3 e uma região C-terminal SOCS Box codificada pelo éxon 5. Pasutto et al. 2012 observaram que a variante Thr255Thr segregava com o glaucoma em uma família, tornando-o candidato a gene causador do GPAA no lócus GLC1F. O objetivo deste estudo do tipo caso-controle, foi avaliar a presença de mutações no gene ASB10 em 100 pacientes afetados por GPAA, e 100 indivíduos controle, por meio das técnicas de PCR e sequenciamento. A análise dos sequenciamentos permitiu a identificação de 13 mutações, sendo 8 do tipo "missense" e 5 sinônimas. Dentre as 13 variantes, quatro não haviam sido previamente reportadas ou encontram-se descritas em bases de dados. A análise estatística pelo teste qui-quadrado não mostrou associação entre alterações no gene ASB10 e o desenvolvimento de GPAA (p = 0.3377). Alterações foram encontradas na mesma proporção entre indivíduos do grupo com GPAA e do grupo controle. As variantes do tipo "missense" foram submetidas a duas análises in silico, que sugerem que tais alterações não causam danos relacionados à estrutura ou à função protéica ou possuem relação com o desenvolvimento da doença. Não foi possível observar relação entre alterações no gene ASB10 e níveis elevados de PIO. Em conclusão, sugere-se que alterações no gene ASB10 possam não estar associadas à etiologia do GPAA na amostra da população estudada / Abstract: Glaucoma is an optic nerve degenerative disease, often associated with high intraocular pressure (IOP) and characterized by excavation of the optic disc and visual field loss. Some genes associated with glaucoma have been identified, but there is a small contribution of variants in these genes in disease development. The ASB10 gene, identified in 2012, was first mapped in 1999 through the study of families with primary open angle glaucoma (POAG). ASB10 is located at chromosome 7q36.1 (GLC1F locus) and has 6 exons, with an open reading frame region that comprises exons 1-5. Belonging to the family of ASB proteins, the ASB10 protein has a central region with seven ankyrin repeats encoded by exons 2 and 3 and a C-terminal SOCS Box region encoded by exon 5. The aim of this case-control study was to evaluate the presence of variations in the ASB10 gene in 100 patients with POAG and 100 controls. Coding sequence and intron-exon boundaries were evaluated through PCR and direct sequencing. Sequencing analysis allowed the identification of 13 variants, 8 missense and 5 synonymous. Among the 13 variants, four had not been previously reported or are not described in databases. Variants were observed in the same proportion among individuals from the POAG group and the control group. The missense variants that were described for the first time were subjected to in silico analysis, which suggest that such changes might not cause damages related to protein structure or function. It is important to note that four missense variants were present only in the POAG group including, A75E, R222G, P387T, and R438C. No association was observed between alterations in the ASB10 gene and high levels of IOP. Changes in the ASB10 gene may not be associated with the etiology of POAG in this sample of the Brazilian population. Functional analysis and an extended cohort may help in the evaluation of the role of ASB10 in relation to the etiology of POAG / Mestrado / Clinica Medica / Mestre em Clinica Medica
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Perfil clínico, laboratorial e epidemiológico de pacientes chagásicos idosos seguidos em um serviço de referência = Clinical, laboratory and epidemiological profile of elderly chagasic patients followed in a reference service / Clinical, laboratory and epidemiological profile of elderly chagasic patients followed in a reference service

Pereira, Mariane Barroso, 1984- 21 August 2018 (has links)
Orientadores: Eros Antonio de Almeida, Sandra Cecília Botelho Costa / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-21T06:18:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pereira_MarianeBarroso_M.pdf: 1684202 bytes, checksum: 4d409617c2303278099fd5ac351f8186 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: A doença de Chagas, descoberta por Carlos Chagas em 1909, é uma enfermidade causada pelo protozoário Trypanosoma cruzi, que já teve a via vetorial como sua principal forma de transmissão. Com o controle da transmissão vetorial, a incidência de novos casos diminuiu, propiciando uma mudança nas características da população infectada. Atualmente, a população chagásica no Brasil é constituída, sobretudo, por portadores da forma crônica da doença. Estes indivíduos estão envelhecendo e necessitam de acompanhamento clínico adequado. Os objetivos foram avaliar o perfil clínico, epidemiológico e laboratorial de pacientes idosos portadores da doença de Chagas atendidos pelo Grupo de Estudos em Doença de Chagas do Hospital de Clínicas da Universidade Estadual de Campinas. Na primeira etapa foi realizada entrevista e coleta de amostra de sangue para testes moleculares e sorológicos. Posteriormente, verificaram-se os dados clínicos e os resultados sorológicos nos prontuários médicos. A amostra de sangue foi submetida a uma extração de DNA e amplificação gênica da região nuclear do parasito. Os dados foram tratados estatisticamente pelo programa BioEstat 5.0. Verificou-se que não houve prevalência de um gênero. Houve prevalência de idosos na faixa etária entre 60 e 69 anos e a forma cardíaca como a forma clínica mais comum. A hipertensão arterial foi a comorbidade prevalente, principalmente no gênero feminino. Os fármacos mais utilizados foram os anti-hipertensivos e os diuréticos. A polifarmácia foi detectada em 34% dos idosos. O teste sorológico foi reagente em 95% das amostras. Em 36%das amostras houve amplificação gênica. Conclui-se que os idosos atendidos pelo GEDoCh são idosos jovens, cardiopatas, hipertensos,fazem uso de medicamentos, possuem antecedentes para a doença de Chagas e os testes sorológicos são reagentes em sua maioria / Abstract: Chagas disease, discovered by Carlos Chagas in 1909, is a disease caused by the protozoan Trypanosoma cruzi, which already had the track vector as their main mode of transmission. With the control of vector transmission, the incidence of new cases decreased, providing a change in the characteristics of the infected population. Currently, the chagasic population in Brazil is constituted mainly by patients with the chronic form of the disease. These individuals are aging and require appropriate clinical follow-up. The objectives were to evaluate the clinical, epidemiological and laboratory elderly patients with Chagas disease seen by the Study Group on Chagas Disease, Clinical Hospital of University of Campinas. The first step was carried out with an interview and collect blood sample for molecular and serological tests. Later, there were the clinical and serologic findings in medical records. The blood sample was subjected to DNA extraction and amplification of the nuclear region gene of the parasite. The data were treated statistically by BioEstat 5.0. There was no prevalence of gender. There was prevalence of elderly people aged between 60 and 69 years and cardiac form as the most common clinical presentation. Hypertension comorbidity was prevalent, especially in females. The drugs used were antihypertensive and diuretics. Polypharmacy was detected in 34% of the elderly Serologic testing was positive in 95% of the samples. In 36% of the samples was gene amplification. We conclude that the elderly assisted by GEDoCh are younger elderly, cardiac patients, hypertensive use drugs, have antecedents for Chagas disease and serological tests are mostly reactive / Mestrado / Gerontologia / Mestra em Gerontologia
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Detecção microbiológica e molecular da bacteremia por Bartonella spp. em gatos / Molecular and microbiological detection of Bartonella spp. bacteremia in cats

Drummond, Marina Rovani, 1985- 21 August 2018 (has links)
Orientador: Paulo Eduardo Neves Ferreira Velho / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-21T05:58:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Drummond_MarinaRovani_M.pdf: 544765 bytes, checksum: b62366bd6e7873354e418dfef366c14d (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: Atualmente o genero Bartonella compreende pelo menos 31 especies e subespecies, sendo 15 delas conhecidamente patogenicas ao homem. Tres especies de Bartonella estao associadas ao maior numero de manifestacoes clinicas em seres humanos. Sao elas: Bartonella bacilliformis, Bartonella quintana e Bartonella henselae. A B. henselae e a bacteria mais associada a doencas humanas e sua transmissao e muitas vezes relacionada ao trauma cutaneo causado pelo arranhao de gatos infectados. Em recente estudo, documentou-se que mais de dois por cento dos doadores de sangue da regiao de Campinas testados estavam bacteremicos por Bartonella spp. e o contato com animais foi um fator de risco para a aquisicao da infeccao. Com o objetivo de avaliar a prevalencia de bacteremia por Bartonella spp. e isolar uma cepa regional de B. henselae, e foram analisadas 112 amostras de sangue de gatos, sendo que destes, 84 (75%) eram nao domiciliados. A partir do sangue total coletado durante o procedimento cirurgico para castracao, foi realizada extracao de DNA, seguida de PCR nested que amplifica a regiao FtsZ e e especifica para B. henselae. Este sangue tambem foi inoculado em meio liquido BAPGM (Bartonella Alpha-Proteobacteria Growth liquid Medium). Apos dez dias de incubacao, parte desta cultura liquida de enriquecimento foi semeada em meio solido enriquecido com 30% de sangue de carneiro e parte analisada pela mesma PCR nested e por PCR simples especifica para o genero Bartonella e que amplifica a regiao ITS. As culturas solidas foram incubadas por ate 45 dias e as que apresentaram crescimento foram encaminhadas as duas diferentes reacoes de PCR ja descritas. O DNA de B. henselae foi detectado em 86 (77%) das 112 amostras de sangue e em 56 (50%) das amostras da cultura de liquida de enriquecimento. No total, a bacteremia foi detectada em 90% (101/112) dos gatos deste estudo. Constatou-se maior prevalencia entre gatos nao domiciliados (95%, 80/84) quando comparada com a dos gatos de proprietarios (75%, 21/28). A deteccao da bacteremia por meio de PCR simples, especifica para o genero Bartonella, foi possivel em 31 das 112 (28%) culturas liquidas de enriquecimento. Dezesseis isolados foram obtidos da cultura solida, sendo que 11 foram PCR positivos. As amostras foram sequenciadas e tres destas colonias, que demonstraram 100% de homologia com a cepa de B. henselae Brazil- 1 na regiao ITS analisada, foram depositadas na Colecao de Culturas do Instituto Adolfo Lutz, sendo as primeiras do Brasil. A PCR nested especie especifica foi positiva em, pelo menos, uma amostra de todos os gatos em que a bacteremia foi detectada. Estes resultados mostram que a bacteremia causada por Bartonella spp. e muito frequente nos gatos de Campinas e sugerem que a prevalencia da infeccao por Bartonella spp. nos gatos e suas consequencias para a saude publica tem sido subestimadas. Metodos diagnosticos mais sensiveis precisam ser utilizados na investigação desta infecção / Abstract: Currently, Bartonella genus comprises at least 31 species and subspecies, 15 pathogenic to humans. Three species are associated with the largest number of clinical symptoms in human beings: Bartonella bacilliformis, Bartonella quintana and Bartonella henselae. B. henselae is the one most frequently associated with human diseases. This specie is considered zoonotic and its transmission is usually related with infected cat scratches. In a recent study, bacteremia was detected in more than two percent of blood donors from Campinas area and contact with animals was documented as a risk factor for Bartonella spp. infection. In order to evaluate Bartonella spp. bacteremia prevalence in cats from Campinas and to isolate a B. henselae regional strain, we analyzed blood samples from 112 cats (75% stray cats). The whole blood that was collected during spay surgery was submitted to DNA extraction and tested with specie-specific FtsZ nested PCR for B. henselae. A pre-enrichment culture in liquid medium BAPGM (Bartonella Alpha- Proteobacteria Growth Liquid Medium) was also performed. After ten-day culture, an aliquot was seeded and incubated up to 45 days in a solid medium supplemented with 30% sheep blood and another aliquot was tested for two PCRs: specie-specific FtsZ nested PCR for B. henselae and Bartonella genus-specific ITS single tube PCR. Sample isolates obtained from solid cultures were also tested by the two different PCR reactions described above. B. henselae DNA was detected in 86 (77%) of 112 blood samples and 56 (50%) of pre-enrichment culture samples. In total, bacteremia was detected in 90% (101/112) cats. Higher bacteremia prevalence was detected in stray cats (95%, 80/84 cats) when compared to client-owned subjects (75%, 21/28 cats). When the genus-specific ITS single tube PCR was used, Bartonella spp. bacteremia was detected just in 31/112 (28%) of preenrichment culture. Sixteen Gram-negative isolates were obtained from solid medium culture and eleven of them were PCR positive. Some samples were sequenced and three of these isolates demonstrated a 100% homology with B. henselae Brazil-1 strain at analyzed ITS region. These isolates were the first samples of this strain to be deposited in Brazil, at Adolfo Lutz Institute Culture Collection. The specie-specific FtsZ nested PCR was positive at least at one sample of bacteremic cats. Our results show that Bartonella sp. bacteremia prevalence among cats is very frequent in Campinas and suggest that the prevalence of Bartonella spp. infection among cats and its consequences for public health remains underestimated. More sensitive diagnostic methods must be used in the study of this infection / Mestrado / Clinica Medica / Mestra em Clínica Médica
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Avaliação de métodos e ocorrência de Clostridium difficile em carnes / Evaluation of methods and occurrence of Clostridium difficile in meats

Tsuchiya, Ana Claudia, 1987- 04 September 2012 (has links)
Orientador: Arnaldo Yoshiteru Kuaye / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campionas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-20T10:25:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tsuchiya_AnaClaudia_M.pdf: 449310 bytes, checksum: 3afe68453ac7a3b16148cef90be5c03f (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: Clostridium difficile é um bacilo anaeróbio responsável por doença intestinal associada ao tratamento prévio com antibióticos, manifestando desde uma diarreia leve até casos graves de colite pseudomembranosa causada principalmente pelas toxinas A (TcdA) e B (TcdB). Os casos de infecção estão relacionados à contaminação em hospitais, porém pesquisas recentes sugerem possível associação ao consumo de alimentos contaminados, pois C. difficile já foi isolado de bovinos, suínos e aves e suas carnes sugerindo os animais como reservatórios. Desta forma, os estudos são de suma importância para o entendimento da transmissão da doença causada por C. difficile. Diante de poucas pesquisas de C. difficile e da inexistência de método padronizado para seu isolamento a partir dos alimentos, o trabalho consistiu em três etapas: 1) avaliação de metodologia [utilizando dois procedimentos (tratamento com álcool e plaqueamento direto) e dois meios seletivos (ágar Clostridium difficile moxalactan norfloxacina ¿ CDMNA e ágar cicloserina cefoxitina frutose ¿ CCFA)] de detecção de C. difficile em carnes (bovina moída e peito de frango [Peitoralis profundus e superficialis]); 2) avaliação da ocorrência de C. difficile em amostras de carnes resfriadas (bovina moída, bovina peça [Semimembranosus], suína [Longuisimus dorsi] e frango [Peitoralis profundus e superficialis]), compreendendo detecção, isolamento e identificação dos isolados; 3) avaliação do perfil toxigênico dos isolados através da detecção de genes tcdA e tcdB codificadores de TcdA e TcdB e respectivamente avaliação de produção do toxinas pelos isolados. A partir da comparação de dois procedimentos, observou-se que o plaqueamento direto foi mais eficaz e recuperou uma maior quantidade de C. difficile se comparado com o tratamento com álcool e o ágar Clostridium difficile moxalactan norfloxacina (CDMNA) apresentou maior taxa de recuperação em relação ao ágar cicloserina cefoxitina frutose (CCFA). A ocorrência de C. difficile foi observada em 11,5% (17/147) das amostras analisadas, totalizando 80 isolados, destes 41,2% (33/83) apresentaram positivo para pelo menos um gene de virulência (A-B+), ou para ambos os genes (A+B+). Houve concordância de 70,5% entre os testes fenotípicos e genotípicos utilizados para detecção de toxinas. Desta forma, sugere-se que alimentos de origem animal são uma potencial fonte de transmissão de C. difficile para humanos / Abstract: Clostridium difficile is an anaerobic bacillus responsible for intestinal deseases in individuals previouslly treated with antibiocs, who can manifest from a mild diarrhea to severe cases of pseudomembranous colitis, mainly caused by toxins A (TcdA) and B (TcdB). The infections are related to contamination in hospitals, but recent researches sugests a possible association with the consumiption of contaminated foods as C. difficile has been isolated from bovines, suines and poultries and their meat, sugesting animals as reservatories. Thus, studies are extremelly important to elucidate the transmition of the desease caused by C. difficile. Faced with few researches about this bacteria and the lack of a standard method for its isolation from food, this work is divided in three steps: 1) Evaluation of the methodology for C. difficile detection in meet (commercial bovine mince and chicken breast ¿ [Peitoralis superficialis and Peitoralis profundus] [using two procedures (treatment with alcohol and direct plating) and two selective mediums (agar Clostridium difficile moxalactan norfloxacin ¿ CDMNA and cycloserine cefoxitin fructose agar¿ CCFA)]; 2) Assessing of the occurrence of C. difficile in samples of chilled meat (bovine: commercial mince and the whole Semimembranosus; suine: whole Longuisimus dorsi; chicken: Peitoralis profundus and Peitoralis superficialis) by detection, isolation and identification of the isolated; 3) Evaluation of the toxicogenic profile of the isolated by the detection of the genes tcdA and tcdB, which are encoding of TcdA and TcdB respectivelly, and the capacity of toxine production by the isolated bacterias. From the comparison of the two proceeding above it was observed that the direct plating was more efficient and recovered a larger aumont of C. difficile than the treatment with alcohol. Furthermore, the CDMNA agar presented a higher recovery rate compared to CCFA agar. It was observed the occurrence of C. difficile in 11,5% (17/147) of the analyzed samples, comprising 80 isolates, of which 41,2% (33/83) showed a positive response for at least one virulence gene (A-B+), or for both genes (A+B-). In addition, there was a 70,5% concordance between the phenotypic and genotypic tests used to detect toxins. In this way, it is suggested that foods of animal origin are a potential source of transmission of C. difficile for humans / Mestrado / Tecnologia de Alimentos / Mestre em Tecnologia de Alimentos
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Analise de polimorfismo no promotor do gene da metaloprotease da matriz-1, -2, -9 e do fator transformador do crescimento-'beta'1 : correlação com a severidade da doença periodontal cronica

de Souza, Ana Paula, 1975- 24 October 2002 (has links)
Orientador: Sergio Roberto Peres Line / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-02T13:57:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pardo_AnaPauladeSouza_D.pdf: 2282434 bytes, checksum: 60a7f5fcc525c89a842f6c39d512f897 (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: Metaloproteases da matriz (MMPs) degradam muitas das proteínas que compõe a matriz extracelular, estando sua atividade implicada com a destruição do tecido conjuntivo durante a invasão do câncer, destruição da cartilagem na artrite, ruptura da placa aterosclerótica e destruição dos tecidos periodontais na periodontite. Recentemente, variações genéticas foram detectadas na região do promotor do gene de várias MMPs. Esses polimorfismos genéticos têm apresentado alelos-específicos que afetam a atividade de transcrição do promotor do gene das MMPs, podendo estar associados com susceptibilidade e/ou severidade a doenças comuns e complexas. Similarmente, polimorfismos genéticos foram encontrados no promotor do gene do Fator Transformador do Crescimento (TGF-'beta¿1), um importante fator responsável pelo aumento na síntese de colágeno. Estas alterações poderiam contribuir com o descontrole entre síntese e destruição dos componentes da matriz extracelular. Atualmente, a doença periodontal representa o principal fator responsável pela perda de dentes em adultos. O papel das bactérias na iniciação da doença está bem documentado, mas a ativação das células de defesa requeridas para produção e liberação de mediadores que estimulam os mecanismos de destruição do tecido conjuntivo não é claro. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi detectar polimorfismos genéticos no promotor do gene da MMP-1, MMP-2, MMP-9 e TGF-'beta¿1 e associar à susceptibilidade e/ou severidade da doença periodontal crônica em uma população Brasileira / Abstract: Matrix metalloproteinases (MMPs) degrade a range of extracellular matrix proteins and have been implicated in connective tissue destruction during cancer invasion, cartilage destruction in arthritis, atherosclerotic plaque rupture, and periodontal tissues destruction. Recently, genetic variances have been detected in the promoter of a number of MMPs genes.These genetic polymorphisms have been shown to have allele-specific effects on the transcription activities of MMPgene promoters, and to be associated with susceptibility and/or severity to several diseases. Similarly, genetic polymorphisms have been found in the gene promoter of the transforming growth factor-f31 (TGF-'beta¿1), an important growth factor reponsible to increase the collagen production. These alterations could contribute to the imbalance between the synthesis and degradation of the extracellular matrix components. Presently, periodontal disease represents the main factor responsible for loss of teeth in adults. The role of bacterial in the initiation of periodontitis is very well documented, but the activation of the host defense cells requeired to release mediators that stimulate the pathway connective tissue breakdown is unclear. Likewise, the aim of our study was to detect genetic polymorphisms in the gene promoterof MMP-1, MMP-2, MMP-9, and TGF-'beta¿1 and to associate with susceptibility and/or severity of the chronic periodontal disease in a Brazilian population / Doutorado / Histologia e Embriologia / Doutor em Biologia Buco-Dental
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Suscetibilidade genetica a severidade da doença periodontal

Trevilatto, Paula Cristina 10 October 2002 (has links)
Orientador: Sergio Roberto Peres Line / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-02T16:15:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Trevilatto_PaulaCristina_D.pdf: 4223894 bytes, checksum: 69a41e7959d3f73c8d6c56c7a87c992d (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: Citocinas constituem importantes mediadores inflamatórios que influenciam o início e a progressão de diversas doenças inflamatórias crônicas, incluindo a doença periodontal. Polimorfismos gênicos têm sido relacionados ao aumento da expressão das citocinas correspondentes. O objetivo do presente estudo foi investigar a correlação entre os polimorfismos nos genes da IL-1¿alfa¿, IL-1¿beta¿, IL-1ra, IL-6 e TNF-'alfa¿ e a severidade da periodontite crônica. Cento e treze indivíduos não-aparentados, não-fumantes, acima dos 25 anos (média: 41,6 anos), foram divididos de acordo com o nível de severidade da doença periodontal crônica: 44 indivíduos saudáveis, 31 com periodontite moderada e 38 com periodontite severa. O DNA genômico foi obtido de células epiteliais da mucosa bucal através de um bochecho com 5 mL de solução de glicose a 3 % e leve raspagem da mucosa jugal. ... Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Inflammatory cytokines represent important pathological mediators in chronic inflammatory diseases, including periodontitis. Polymorphisms in cytokine genes have been associated with enhanced expression of cytokines, which mediate the development of inflammatory diseases. The aim of this study was to investigate the association between polymorphisms in the IL-1¿alfa¿, IL-1¿beta¿, IL-1ra, IL-6 and TNF¿-alfa¿ genes and severity of chronic periodontitis in Brazilians. One hundred and thirteen unrelated non-smoking subjects, over 25 years (mean age 41.6), were divided according to the severity levei of periodontal disease: 44 healthy individuals, 31 subjects with moderate and 38 with severe periodontitis. DNA was obtained from epithelial cells through a mouthwash with 5 mL 3% glucose and scraping of oral mucosa. ... Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Doutorado / Doutor em Biologia e Patologia Buco-Dental
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Determinação genotipica dos fatores de virulencia em amostras de Escherichia coli isoladas de cistite

Tiba, Monique Ribeiro 03 August 2018 (has links)
Orientadores: Domingos da Silva Leite, Tomomasa Yano / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-03T19:07:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tiba_MoniqueRibeiro_M.pdf: 4062695 bytes, checksum: e115238559926b3180bd900e913cd00b (MD5) Previous issue date: 2003 / Mestrado
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Diagnostico e monitorização da infecção ativa por citomegalovirus em transplantados alogenicos de celulas progenitoras hematopoeticas

Bonon, Sandra Helena Alves 27 May 2004 (has links)
Orientador: Sandra Cecilia Botelho Costa / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-03T23:30:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bonon_SandraHelenaAlves_D.pdf: 4001153 bytes, checksum: 258cc9da316f7eedd9edf3f5b45ddc9b (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: Neste estudo, monitorizamos 69 pacientes receptores de medula óssea e de células progenitoras periféricas, alogênicos, HLA idênticos, desde o pré-transplante até 150 dias após o transplante, semanalmente com as técnicas de PCR dupla e antigenemia e mensalmente com sorologia tipo ELISA (IgM e IgG) contra o HCMV, incluindo os doadores no pré-transplante. Quarenta e cinco pacientes do Grupo A, sendo 38 adultos e 7 crianças, que possuíam doenças hematológicas malignas e status sorológico de risco, receberam profilaxia universal com ganciclovir; e vinte e quatro pacientes do Grupo B, sendo 14 adultos com anemia aplástica e 10 crianças (7 com doenças hematológicas malignas e 3 com anemia aplástica) não receberam profilaxia com ganciclovir. Se a vigilância laboratorial era positiva (2 ou mais amostras de PCR positivas consecutivas ou 1 ou mais células antígeno-positivas por antigenemia), terapia precoce com ganciclovir era administrada, seguida de doses de manutenção nos pacientes de ambos os grupos. Como resultados obtidos após a monitorização, nos pacientes do Grupo A, 36/45 pacientes tiveram infecção ativa pelo HCMV detectada por AGM e/ou PCR. A probabilidade de antigenemia positiva até o dia +150 foi de 53% e por PCR foi de 71,3% (P=0,04). O teste de PCR não se mostrou mais precoce na detecção da infecção ativa pelo HCMV do que a antigenemia nos pacientes deste grupo (54 e 62 dias, respectivamente, P=NS). A sensibilidade e a especificidade da antigenemia foi de 58% e 64,3%, respectivamente, usando a PCR como padrão-ouro. Nos pacientes do Grupo B, 19/24 pacientes tiveram infecção ativa pelo HCMV detectada por AGM e/ou PCR. A probabilidade de positivação da antigenemia foi de 66,7% e da PCR dupla foi de 67,2% (P=NS). O teste de PCR mostrou-se mais precoce do que a antigenemia na detecção da Infecção Ativa por HCMV nos pacientes do Grupo B (24 e 34 dias, respectivamente, P=0,03). A sensibilidade e a especificidade da antigenemia foi de 81,2% e 62,5%, respectivamente, usando a PCR dupla como padrão-ouro. Doença por HCMV ocorreu em 2/45 pacientes (4,44%) do Grupo A (casos de gastrite), e foram tratados com sucesso pelo ganciclovir. No Grupo B, 4/24 pacientes (16,7%) tiveram doença por HCMV. Um desses pacientes teve coriorretinite, dois tiveram gastrite e um teve pneumonia intersticial. Dois óbitos por HCMV ocorreram neste grupo (50%), sendo que um por gastrite inicial e outro por pneumonia intersticial, ambos com disseminação sistêmica posterior. Neste trabalho, o uso da profilaxia universal com ganciclovir pareceu retardar o aparecimento da infecção ativa, pois atrasou a positividade dos testes, quando comparado ao grupo que não recebeu profilaxia. Contudo, nenhum impacto favorável foi observado no grupo de pacientes que recebeu profilaxia universal com ganciclovir, em relação à infecção ativa pelo HCMV, doença e sobrevida. Outra observação foi em relação ao comportamento dos testes diagnósticos nos pacientes tratados com ganciclovir, onde a PCR dupla demonstrou-se mais precoce, porém, na maioria dos casos, a antigenemia confirmou o diagnóstico. Nossos resultados sugerem que tanto a antigenemia quanto a PCR podem ser utilizadas como marcadores precoces para a introdução da terapia antiviral específica / Abstract: Human cytomegalovirus (HCMV) remains a cause of significant morbidity and mortality after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation (HSCT). Different prophylactic approaches have been adopted, but these strategies remain controversial. Early detection of active HCMV infection is imperative to control and to detain HCMV disease. Ganciclovir universal prophylaxis or pre-emptive treatment based on detection of antigenemia (AGM) or a nested polymerase chain reaction (N-PCR) effectively prevents HCMV disease during the first 100 days after transplant. The aim of this study was to describe our experience in the control of active HCMV infection using ganciclovir universal prophylaxis at low doses and pre-emptive therapy with ganciclovir following hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) based on the monitoring of antigenemia (AGM) and on a nested polymerase chain reaction (N-PCR). We prospectively monitored 69 HLA identical sibling donor HSCT patients for evidence of HCMV infection and disease starting in the day of transplant until day 150 after transplant. Two groups of patients were studied: Group A: 45 recipients with malignances diseases and with risk factor for HCMV disease (D+/R+; D-/R+ and D+/R-) received ganciclovir universal prophylaxis in a dose of 5 mg/kg per day, 3 days per week and continued until day 75 after transplant; Group B: 14 adults patients, most of them with non-malignance disease and ten pediatrics patients who did not receive ganciclovir universal prophylaxis. In Group A, the incidence of positive antigenemia at day 150 was 51% in a median of 62 days after transplantation, with a positive PCR of 68.9% in a median of 54 days. In Group B, the antigenemia positivity was 66.6% and that of N-PCR was 66.7% in a median of 34 and 24 days, respectively. HCMV disease occurred in 6/55 patients (10.9%), with 2/36 (5.5%) from Group A (gastritis) and was successfully treated with ganciclovir. In Group B, 4/24 patients (16.7%) had HCMV disease (one chorioretinitis; two gastritis and one with interstitial pneumonia (IP)). Two of these patients (50%) died of HCMV disease. Our results suggest that antigenemia and N-PCR can be used as markers for assessing the introduction pre-emptive therapy. This approach could prove to be more cost-effective than ganciclovir universal prophylaxis for treating HCMV infection / Doutorado / Ciencias Basicas / Doutor em Clínica Médica
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Avaliação da presença do Propionibacterium acnes em pele lesional e não lesional de pacientes com hipomelanose macular progressiva por cultura e PCR em tempo real

CAVALCANTI, Silvana Maria de Morais 31 January 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T18:28:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3535_1.pdf: 4497210 bytes, checksum: aa2e672b4d17f24b8c8446cc122032b6 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / A hipomelanose macular progressiva é uma dermatose caracterizada por máculas hipocrômicas localizadas principalmente em tronco, que tendem a confluir na linha média. Em pacientes melanodérmicos, as lesões contrastam com a pele normal prejudicando a auto-estima dos pacientes. Sua etiologia permanece especulativa, sendo sugerida a participação do Propionibacterium acnes, um membro da flora cutânea normal. Objetivo: Avaliar a presença do Propionibacterium acnes na pele lesional e não lesional de pacientes com hipomelanose macular progressiva, por meio da reação em cadeia da polimerase em tempo real quantitativa e cultura bacteriológica de fragmento de pele e, determinar o ponto de corte para o número de cópias de genoma de Propionibacterium acnes, como marcador de sua positividade na pele lesional de pacientes com hipomelanose macular progressiva, utilizando a reação em cadeia da polimerase em tempo real quantitativa e considerando a cultura como padrão-ouro. Pacientes e Métodos: Estudo exploratório, observacional com grupo de comparação foi realizado envolvendo 36 pacientes, atendidos nos ambulatórios de dermatologia do Hospital Universitário Oswaldo Cruz, Recife, Pernambuco, Brasil, entre março e maio de 2008. Todos os pacientes foram submetidos a exame sob luz de Wood, pesquisa micológica e biópsias de pele lesional e não lesional do dorso. Os fragmentos de biópsia de pele foram submetidos a exame histopatológico, cultura bacteriológica e reação em cadeia da polimerase em tempo real quantitativa, utilizando oligoiniciadores específicos para a região 16S do RNA ribossomal do Propionibacterium acnes. A pele lesional foi comparada a não lesional quanto à positividade da reação em cadeia da polimerase em tempo real quantitativa e da cultura, considerada padrão-ouro. Com o programa Statistical Package for Social Sciences, versão 12.0, procedeu-se à determinação de associação com os testes de Wilcoxon e de McNemar, em nível de significância de 0,05, e do ponto de corte com a curva ROC para valores máximos. Resultados: Houve predomínio significante do Propionibacterium acnes na pele lesional, comparada com a pele não lesional (p<0,001), demonstrado por cultura bacteriológica e reação em cadeia da polimerase em tempo real quantitativa. O ponto de corte para o número de cópias de genoma de Propionibacterium acnes como marcador de sua positividade na pele lesional de pacientes com hipomelanose macular progressiva igualou-se a 1.333, com sensibilidade de 87,9% e especificidade de 100,0%. Conclusão: Apesar do Propionibacterium acnes ser um saprófita do folículo pilossebáceo, ele esta mais presente em pele lesional dos pacientes com hipomelanose macular progressiva, sugerindo sua participação no desenvolvimento dessa dermatose
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Avaliação da transmissão e concordância genotípica entre os parceiros sexuais da cidade do Recife

RIBEIRO, Camila Maria Beder 31 January 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T22:57:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4010_1.pdf: 1042636 bytes, checksum: dd90fd89cd91f71c437dc0e9f827f6fd (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / Introdução: O papilomavírus humano (HPV) é o principal agente etiológico de lesões malignas de colo uterino, pênis e possivelmente um dos co-fatores implicados na etiopatogênese do carcinoma oral de células escamosas (OSCC). Objetivos: O presente estudo teve o objetivo de avaliar a transmissão e concordância genotípica do papilomavírus humano (HPV) entre parceiros sexuais da Cidade do Recife em diferentes sítios de coleta (pênis, vagina/colo uterino e boca). Métodos: A amostra foi composta por trinta e um casais heterossexuais residentes na Cidade do Recife e Região Metropolitana. Os indivíduos do sexo masculino da pesquisa foram submetidos a um questionário para avaliar as condições sócioeconômicas, hábitos gerais e sexuais, e história prévia de doenças sexualmente transmissíveis (DSTs), seguido da coleta de esfregaço peniano de lesões malignas e/ou potencialmente malignas possivelmente associadas ao HPV. As respectivas parceiras foram convidadas e também submetidas ao mesmo questionário, seguido da coleta de esfregaço de vagina/colo uterino, exame de colposcopia e citologia cervical, exame clínico e coleta de esfregaço de mucosa oral. A pesquisa do HPVDNA foi realizada através da reação da cadeia de polimerase (PCR) com a utilização dos primers MY09 e MY11 e a identificação da concordância genotípica entre os HPVs foi realizada através da análise do polimorfismo dos fragmentos de DNA (RFLP) obtido pelas enzimas de restrição DdeI e RsaI. Resultados: Foi amplificado HPV-DNA a partir de esfregaço de pênis (P) de 22/31 indivíduos (71%); 18/31 (58,1%) das amostras de vagina/colo (V) e 17/31 (54,8%) de mucosa oral (B). 16/31 (51,6%) casais apresentaram HPV-DNA pelo menos dois sítios anatômicos. Após a análise do padrão de polimorfismo do HPV-DNA obtida através da RFLP foi possível avaliar observar HPV-DNA concordância em 14/31 (45,2%) casais. 5/6 casais (83,3%) que praticam intercurso vaginal sem preservativo apresentaram concordância genotípica entre HPV peniano e vagina/colo uterino; 7/8 (87,5%) casais que relataram uso do preservativo foram PV HPV discordantes (OR=11,67 p=0,039). Similarmente, 8/11 (72,7%) casais que negaram o uso do preservativo durante a prática da felação foram HPV concordantes, enquanto 4/4 casais (100%) que relataram o uso do preservativo durante sexo oral, apresentaram diferentes tipos de HPV peniano e HPV oral (p= 0,025). Conclusão: Baseado nos achados clínicos e laboratoriais foi possível concluir que houve transmissão e concordância genotípica entre parceiros infectados, quando da não utilização de preservativos. A prática da não utilização de barreiras físicas pode contribuir para a etiopatogênese de lesões malignas e/ou potencialmente malignas

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