Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-20T13:36:44Z No. of bitstreams: 1 Andressa Carolina Mendes de Melo.pdf: 4203208 bytes, checksum: 432623f83a73f116a6b91b0c59dcf383 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-20T13:36:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Andressa Carolina Mendes de Melo.pdf: 4203208 bytes, checksum: 432623f83a73f116a6b91b0c59dcf383 (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / In the coast of Pernambuco, Brazil's northest, Dasyatis guttata is the most commun specie of ray caught by the artisanal fishery. This study makes a analisys of the reproductive biology and its fishery along cities Ponta de Pedra, Itapissuma, Paulista, Sirinhaém and Rio Formoso. The samples accurred between august 2013 and october 2015. An amount of 167 induviduals were analysed: 94 females and 73 males. The animals were caught using ray net (call “raieira”), shrimp troll, hand line, fish-weir, beach seine and gillnet. Exceptting the ray net in the others apparels rays are bycatch. Shrimp troll and curral are responsable to imature young of the year individuals captures. All life stages were observed however 83,73% of mature individuals composed the data. Mean size at maturity were 42,03 cm disc width (WD) in males (15,70-61,50 cm WD) and 50,67 cm WD in females (13,90-87,50 cm WD). Females showed bianual spawning cicle with fecundity taxa around 2,14/embryo/female ± 0,69. Gestation takes about 5 to 6 months with parturition occurring two times a year, in may to agust and november to march, and it's connected with low rain rate. The ray gets born with 13,9-15cm LD. Low fecundities associated with the fishing effort over D. guttata may affect population, thats suggested that conservation and management measures must be taken to minimize the antropic action on the habitat of this spcies. / A raia Dasyatis guttata é relatada como uma das espécies de raia mais comum capturada pela pesca artesanal do litoral de Pernambuco, nordeste do Brasil. Este estudo faz uma análise da biologia reprodutiva e pesca desta espécie através da análise de desembarques nos municípios de Ponta de Pedra, Itapissuma, Paulista, Sirinhaém e Rio Formoso. Um total de 167 indivíduos foram analisados, dos quais 94 eram fêmeas e 73 machos. Os espécimes foram capturados pela raieira, o arrasto de camarão, linha de mão, mangote e o emalhe, no período de agosto de 2013 a outubro de 2015. A rede raieira é o único aparelho de pesca dirigido à captura de raias em Pernambuco. Ela é responsável pela captura de 78,69% da amostra total, atuando em todos os estágios de desenvolvimento. Nos demais aparelhos de pesca, a espécie é capturada como fauna acompanhante. O arrasto de camarão e o mangote são responsáveis pela captura de indivíduos imaturos e em desenvolvimento. Todos os estágios de desenvolvimento foram registrados na amostra com indivíduos maduros representando 83,73%. O comprimento de primeira maturidade (WD50) para machos e fêmeas foi estimada em 42,03 e 50,67 cm WD, respectivamente. As fêmeas apresentaram ciclo reprodutivo bianual, com fecundidade de 2,14/embriões/útero ± 0,69. A gestação tem duração de cinco a seis meses, o período de parto tem início no mês de maio podendo se prolongar até agosto. O comprimento estimado de nascimento para a espécie foi de 13,9 a 15 cm LD. A baixa fecundidade da espécie associada com o esforço de pesca pode afetar a população de D. guttata em Pernambuco, desta forma, é sugerido que medidas de manejo e conservação devam ser estabelecidas no intuito de minimizar o impacto das ações antrópicas no habitat dessa espécie.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-20T14:19:41Z No. of bitstreams: 1 Ana Paula Felipe dos Santos.pdf: 781799 bytes, checksum: c9b604f7dd3deeeb5abbf59688ec9a86 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-20T14:19:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ana Paula Felipe dos Santos.pdf: 781799 bytes, checksum: c9b604f7dd3deeeb5abbf59688ec9a86 (MD5) Previous issue date: 2016-06-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Haematococcus pluvialis microalgae species is able to accumulate pigments (chlorophylls a and b, carotenoids –astaxanthin, β-carotene and lutein) with high value and commercial use when subjected to stress conditions, such as types of culture medium. The work aimed to study the growth of H. pluvialis and identify chlorophylls and carotenoids present in the cells, from the use of different culture medium. Six treatments were performed and different means were evaluated: Provasoli, Provasoli I modified, Provasoli II modified, KM1, MM2 and Guillard, all with three replications. The experimental units were conditioned in flasks with a volume of 2 liters, treated fresh water and enriched their culture medium. The microalgae were inoculated with an initial concentration of 1 x 105 cél.mL-1 and the treatments maintained at a temperature of 24 ± 1 ° C, photoperiod and light intensity integral 4000 lux. The assessment of growth, crop samples were taken and held daily counts by light microscopy. Growth curves were prepared for each treatment and the obtained values of the maximum cell density, culture time and the growth rate. For quantification of the pigments, samples of 2 ml were collected daily treatments, treated with 80% acetone in order to then be performed by reading the absorbance spectrophotometer. From the results of absorbances were calculated concentrations of chlorophyll a, chlorophyll b, total chlorophyll and total carotenoids. For data analysis was used Cochran, Shapiro-Wilk, ANOVA and Tukey test (P <0,05). The statistical results showed that there was significant difference (P <0,05) between treatments for maximum cell density, which was higher (21,42 ± 7,84 x 105 cél.mL-1) when using the medium Provasoli I modified, followed by Provasoli and Provasoli II modified means. Regarding pigments, significant differences (P <0,05) were observed for the concentration of chlorophyll b, total chlorophyll and total carotenoids, which were higher in the treatments used the Provasoli I modified, means Provasoli II modified and Provasoli. However, no significant differences were observed (P> 0,05) for chlorophyll a. For these experimental conditions suggest the use of the medium Provasoli I modified, so as to obtain a higher cell density and concentration of pigments of microalgae H. pluvialis. / A espécie Haematococcus pluvialis é uma microalga capaz de acumular pigmentos (clorofilas a e b, carotenoides –astaxantina, β-caroteno e luteína) com alto valor e uso comercial, quando submetida a condições de estresse, tal como, tipos de meios de cultura. O trabalho teve como objetivo estudar o crescimento de H. pluvialis e identificar clorofilas e carotenoides presentes nas células, a partir da utilização de diferentes meios de cultura. Seis tratamentos foram realizados e os diferentes meios foram avaliados: Provasoli, Provasoli modificado I, Provasoli modificado II, KM1, MM2 e Guillard, todos com três repetições. As unidades experimentais foram condicionadas em erlenmeyers com volume útil de 2 litros, água doce tratada e enriquecida com os respectivos meios de cultura. A microalga foi inoculada com a concentração inicial de 1 x 105 cél.mL-1 e os tratamentos mantidos a temperatura de 24 ± 1°C, fotoperíodo integral e intensidade luminosa de 4000 lux. Para avaliação do crescimento, foram retiradas amostras das culturas e realizadas contagens diárias em microscópio óptico. Foram elaboradas curvas de crescimento para cada tratamento e obtidos os valores da densidade celular máxima, tempo de cultivo e a velocidade de crescimento. Para quantificação dos pigmentos, amostras de 2mL foram coletadas dos tratamentos diariamente, tratadas com acetona a 80%, para em seguida ser realizada a leitura das absorvâncias através de espectrofotômetro. A partir dos resultados das absorvâncias foram calculadas as concentrações de clorofila a, clorofila b e carotenoides totais. Para análise dos dados utilizou-se Cochran, Shapiro-Wilk, ANOVA e teste de Tukey (P<0,05). Os resultados estatísticos mostraram que houve diferença significativa (P<0,05) entre os tratamentos para a densidade celular máxima, que foi mais alta (21,42 ± 7,84 x 105 cél.mL-1) quando utilizado o meio Provasoli modificado I, seguido dos meios Provasoli e Provasoli modificado II. Com relação aos pigmentos, diferenças significativas (P<0,05) foram observadas para a concentração de clorofilas b e total, carotenoides totais, que foram maiores nos tratamentos utilizado os meios Provasoli modificado I, Provasoli modificado II e Provasoli. Contudo, não foram observadas diferenças significativas (P>0,05) para concentração de clorofila a. Para estas condições experimentais sugere-se o uso do meio Provasoli modificado I, para assim obter uma maior densidade celular e concentração de pigmentos da microalga H. pluvialis.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-23T12:50:42Z No. of bitstreams: 1 Eduardo Cesar Rodrigues de Lima.pdf: 493122 bytes, checksum: eef0aacc9225107f4ed820dd3b64829c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-23T12:50:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Eduardo Cesar Rodrigues de Lima.pdf: 493122 bytes, checksum: eef0aacc9225107f4ed820dd3b64829c (MD5) Previous issue date: 2016-02-23 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Biofloc technology has brought advances in traditional aquaculture, mainly in shrimp and tilapia. The main advantages are low water use, recycling of nitrogen compounds and production of supplementary food rich in protein. Various carbon sources are employed in the biofloc culture, as sugars, starches, alcohols and fibers. So the aim of this study was to evaluate the effects of organic carbon sources on water quality, growth performance and acceptance of Nile tilapia fillets (Oreochromis niloticus) cultured in biofloc systems. Were adopted three treatments involving the sources of carbon, as sugar (AÇU), liquid molasses (MEL) and powder molasses (MEP), with five replicates each and a control treatment (CTL) without biofloc, with four replications. Fish (72.6 g) were stocked in 19 circular tanks (800L) at a density of 35 fish/m3 and grown by 145 days. They evaluated the water quality variables, growth performance and acceptability of tilapia fillets. The dissolved oxygen concentration was significantly higher (P≤0.05) in the tanks without bioflocs (CTL) in the absence of bacterial biomass. Total ammonia nitrogen (NAT) showed statistical significance (P≤0.05) between the AÇU treatment and the other with bioflocs, displaying the lowest concentration of 2.53 mg NAT/L. Already nitrite, showed no statistical difference (P>0.05) among treatments with mean values ranging from 0.74 to 2.3 mg of N-NO2/L. The final weight ranged from 339 to 409 g, with feed conversion ratio between 1.61 and 1.89, survival 80-99% and showed no statistical difference between treatments (P>0.05). Productivity ranged from 9.72 (AÇU) to 14.22 Kg/m3 (CTL) (P≤0.05). The tanks without bioflocs (CTL) consumed 9 m3 of water to produce 1 kg of fish, while the bioflocs used only 0.68 m3, which represents a 13 times lower consumption. The percentage of protein in fillets of tilapia and analyzed bioflocs ranged respectively 17-20% and 31-33%.Tilapia fillets coming from biofloc with sugar showed to have the preference of the evaluators, with note 7.77 (like moderately to like very much). With these results, it is concluded that the carbon sources (molasses and sugar) can be used in the tilapia culture with biofloc without damage to water culture and productivity. Moreover, one should consider the ease of obtaining sugar. / A tecnologia de bioflocos tem apresentado avanços na aquicultura tradicional, principalmente, em camarões e tilápias. As principais vantagens são pouca utilização de água, reciclagem dos compostos nitrogenados e produção de alimento suplementar rico em proteína. Diversas fontes de carbono são empregadas no cultivo em bioflocos, açúcares, amidos, álcoois e fibras, assim, o objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos das fontes de carbono orgânico na qualidade da água, desempenho de crescimento e aceitação de filés da tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) cultivada em sistema de bioflocos. Foram adotados três tratamentos envolvendo as fontes de carbono açúcar (AÇU), melaço líquido (MEL) e melaço em pó (MEP), com cinco repetições cada e um tratamento controle (CTL) sem bioflocos, com quatro repetições. Os peixes (72,6 g) foram estocados em 19 tanques circulares (800L) numa densidade de 35 peixes/m3 e cultivados por 145 dias. Foram avaliadas as variáveis de qualidade da água, desempenho de crescimento e aceitabilidade dos filés de tilápia. A concentração de oxigênio dissolvido foi significativamente maior (P≤0,05) nos tanques sem bioflocos (CTL) devido à ausência de biomassa bacteriana. O nitrogênio da amônia total (NAT) apresentou diferença estatística (P≤0,05) entre o tratamento AÇU e os demais com bioflocos, exibindo a menor concentração de 2,53 mg NAT/L. Já o nitrito, não apresentou diferença estatística (P>0,05) entre os tratamentos com valores médios variando de 0,74 a 2,3 mg de N-NO2/L. O peso final variou de 339 a 409 g, com fator de conversão alimentar entre 1,61 e 1,89, sobrevivência de 80 a 99% e não apresentou diferença estatística entre os tratamentos (P>0,05). A produtividade variou de 9,72 (AÇU) a 14,22 Kg/m3 (CTL) (P≤0,05). Os tanques sem bioflocos (CTL) consumiram 9 m3 de água para produzir 1 Kg de peixe, enquanto os de bioflocos utilizaram apenas 0,68 m3, o que representa um consumo 13 vezes menor. A porcentagem de proteína nos filés de tilápia e nos bioflocos analisados variaram, respectivamente, de 17 a 20% e 31 a 33%. Os filés de tilápia oriundos do biofloco com açúcar mostraram ter a preferência dos avaliadores, com nota 7,77 (gostei moderadamente a gostei muito). Com estes resultados, conclui-se que as fontes de carbono utilizadas (melaços e açúcar) podem ser utilizadas no cultivo da tilápia O. niloticus em bioflocos sem prejuízos à água de cultivo e à produtividade. Além disso, deve-se considerar a facilidade na obtenção do açúcar.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-23T13:23:40Z No. of bitstreams: 1 Rodrigo Risi Pereira Barreto.pdf: 4263357 bytes, checksum: 758f4258cdf8151b0f0baf5581f7b980 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-23T13:23:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rodrigo Risi Pereira Barreto.pdf: 4263357 bytes, checksum: 758f4258cdf8151b0f0baf5581f7b980 (MD5) Previous issue date: 2015-08-28 / A great diversity of sharks has been explored by modern fisheries, regularly caught as by-catch and after the decade of 1990’s as target species, mainly due to the high value of their fins in the international market. This species group is characterized by slow growth, late maturity, high longevity, low rates of fertility and productivity that implies in low potential of replacement for most species, resulting in serious implications for the sustainability of populations and also for fishing. Coastal nations of the South Atlantic (Brazil, Uruguay, South Africa and Namibia) have historically (since the 50s) given its ports to traditional longline fleets (mainly from Asia and the European Union) in order to exchange technology to develop their own fleets through a policy known as leasing. Declines of commercial species such as tuna and swordfish elsewhere, moreover divisions of fishing quotas established by the ICCAT, main RFMO in Atlantic, were responsible for the introduction of at least 20 different pelagic longline fleets. Pelagic longline fishing are demonstrably associated with declines in abundance of many species of oceanic sharks in various locations around the world. However information on the South Atlantic is incipient, with few studies focusing on more abundant species such as the blue shark. This thesis gathers information about catches and life history collected from the main monitoring fishing agencies from Brazil, in order to identify population trends and conservation status for main species caught in the South Atlantic. In the first chapter, we address the age and growth of the shortfin mako shark, because growth of this specie had not yet been studied in our study area. In Chapter 2, we discuss the history of fishing as well the different phases of exploitation focused in western and central South Atlantic, resulting in the identification of trends in exploitation and thus, abundances of key species. The third chapter addresses the vulnerability of this group of species through the use of different demographic methods. Overall our results show that most species analyzed are depleted and seriously threatened by pelagic longline fishing, which still lacks adequate monitoring and control in the South Atlantic. / Uma grande diversidade de tubarões vem sendo explorada pelas pescarias modernas, capturados regularmente como by-catch (ou captura incidental) e apos a década de 90 como espécies alvo, principalmente devido ao alto valor de suas nadadeiras no mercado internacional. Este grupo de espécies é caracterizado por crescimento lento, maturação tardia, alta longevidade, baixas taxas de fecundidade e produtividade, conjunto de características que implicam em baixo potencial de reposição para a maioria das espécies, resultando em sérias implicações para a sustentabilidade das populações e também da pesca. Nações costeiras do Atlantico Sul (Brasil, Uruguai, Africa do Sul e Namibia) têm desde a década de 50 cedido seus portos a frotas espinheleiras tradicionais (principalmente da Asia e Uniao Europeia) objetivando intercâmbio de tecnologia para desenvolver suas próprias frotas através de uma politica conhecida como arrendamento. Declinios de espécies comerciais como por exemplo os atuns e os espadartes em outras localidades, assim como as divisões de cotas de pesca estabelecidas pela principal RFMO do Atlantico, a ICCAT, foram responsáveis pela introducao pelo menos 20 diferentes frotas que utilizam espinheis pelágicos. Espinheis pelágicos estão comprovadamente associados a declínios em abundancia de inúmeras espécies de tubarões oceânicos, em diversas localidades do mundo. Entretanto informações sobre o Atlantico Sul sao incipientes, com poucos estudos concentrados em espécies mais abundantes como, por exemplo, o tubarão azul. A presente tese reúne informações sobre captura e historia de vida coletadas junto aos principais órgãos de monitoramento sediados no Brasil, com objetivo de identificar tendências populacionais para as principais espécies capturadas no Atlantico Sul. No primeiro capitulo, abordamos a idade e crescimento do tubarão mako, em virtude de ser a única espécie (em meio as principais) cujo crescimento ainda não tinha sido estudado na área do presente estudo. No capítulo 2, abordamos o histórico da pesca bem como as diferentes fases de exploração em nossa área de estudo, resultando na identificação de tendências na exploração e abundancia das principais espécies. O capitulo 3 aborda a vulnerabilidade deste grupo de espécies através do uso de diferentes métodos demográficos. Nossos resultados apontam que a maioria das espécies analisadas encontram-se depletadas e seriamente ameaçadas pela pesca de espinhel pelágico, que ainda nao dispõe de adequado monitoramento e controle no Atlantico Sul.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-24T12:55:35Z No. of bitstreams: 1 Marcelo Augusto Soares Rego.pdf: 833356 bytes, checksum: 1a5a4f1c36e44f371f7effe11bc5b82f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-24T12:55:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcelo Augusto Soares Rego.pdf: 833356 bytes, checksum: 1a5a4f1c36e44f371f7effe11bc5b82f (MD5) Previous issue date: 2016-02-25 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Biofloc Technology (BFT) is considered an alternative, sustainable culture system of the marine shrimp Litopenaeus vannamei. However, there are doubts about its financial return in the short and long period of time, as well as uncertainties regarding losses caused by variations in major economic items and shrimp performance. The Thesis evaluated the economic viability, risk and the efficiency of BFT in comparison to a conventional system of a shrimp farm located in the State of Pernambuco, Brazil. Data for the BFT and conventional farming systems were obtained from 9 production cycles in three 625 m2 ponds lined with HDPE and 12 production cycles in the farm’s conventional ponds, respectively. Viability indicators were favorable for both systems, with greater expressiveness of net present value (NPV) for the BFT (R$ 353,591.00) and internal rate of return (IRR) 4.5 times greater for the conventional (131.86%). When used the Monte Carlo Method (MMC) it was found to BFT system the failure probability of 7%, 10% and 15% when combined with a discount rate of 10%, 13% and 16% respectively. According the Data Envelopment Analysis (DEA) four productions cycles (7.0%) were classified as technically efficient on the farm over the years 2013 and 2014. There was significant difference in the average technical efficiency scores of production systems. There was greater influence of management on the conventional system efficiency, while the production scale was the factor to influence the reduction of the average technical efficiency score of BFT system. The works provide useful information to improve the L. vannamei culture and give greater security to the investment in the BFT system by producers in the Northeast region of Brazil. Both culture systems represent important investment alternatives for the rural sector of Brazil, confirmed by the favorable results of profitability and viability. / A tecnologia de bioflocos (BFT) é apontada como uma alternativa para o cultivo sustentável do camarão marinho Litopenaeus vannamei. Porém, existem dúvidas quanto ao seu retorno financeiro, no curto e no longo período de tempo, como também incertezas relacionadas à probabilidade de perdas diante de variações futuras nos principais índices econômicos e de desempenho zootécnico. Assim, objetivou-se com os estudos avaliar aspectos relacionados à viabilidade econômica, ao risco e a eficiência dos sistemas BFT e convencional em fazenda de criação de camarão do litoral sul do estado de Pernambuco. Para a obtenção das informações necessárias para as análises, utilizaram-se três viveiros (625 m2 cada) forrados com polietileno de alta densidade (PEAD) operando nos moldes do sistema BFT e informações do sistema convencional da mesma fazenda. Na análise de investimento, os indicadores foram favoráveis para ambos os sistemas, com maior expressividade do valor presente líquido (VPL) para o BFT (R$ 353.591,00) e taxa interna de retorno (TIR) 4,5 vezes maior para o convencional (131,86%). Porém, através de simulações pelo Método de Monte Carlo (MMC), verificou-se risco apenas no sistema BFT, com probabilidade de 7, 10 e 15% quando submetido à taxa de desconto de 10, 13 e 16%, respectivamente. Ao avaliar os ciclos produtivos da fazenda ao longo de 2013 e 2014, por meio da análise envoltória de dados (DEA), detectaram-se apenas quatro produções (7,0%) eficientes tecnicamente. Ao comparar os sistemas produtivos, verificou-se diferença significativa nos escores médios de eficiência técnica destes. Em relação às operações dos ciclos produtivos, foi constatada uma maior influência do manejo na ineficiência do sistema convencional, enquanto a escala produtiva foi o fator a influenciar na redução do escore médio de eficiência técnica do sistema BFT. Os resultados dos estudos permitirão o aperfeiçoamento do cultivo do camarão L. vannamei, além de dar maior segurança para o investimento no sistema BFT pelos produtores da região Nordeste do Brasil. Ambos os sistemas de produção de camarão representam importantes alternativas de investimento para o setor rural brasileiro, confirmado pelos resultados favoráveis de rentabilidade e viabilidade.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-24T13:09:10Z No. of bitstreams: 1 George do Nascimento Leao.pdf: 1841819 bytes, checksum: 8817ba2a46764f3fa488c0abe9b8ba3b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-24T13:09:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 George do Nascimento Leao.pdf: 1841819 bytes, checksum: 8817ba2a46764f3fa488c0abe9b8ba3b (MD5) Previous issue date: 2016-02-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / This study describes biological aspects of the species Eucinostomus argenteus collected in the Santa Cruz Channel, city of Itapissuma (Pernambuco), with regard to reproduction and feeding habit. Totally, 1910 individuals -16.4% females, 5% males and 78.6% with indeterminate sex- were sampled monthly from October 2013 to September 2014. There was a predominance of females over males (3,3:1) (p<0,05). The length-weight relationship for females, males and pooled sexes showed positive allometry. The length at first sexual maturity (in total length, cm) (L50) was 8,31 for pooled sexes; 6,02 for males and 8,03 for females. It was observed that approximately 73% of the individuals were in length classes lower than the L50, with an average size of 4.97 cm (SD= ±0.94). Juveniles predominated in almost all months, representing 67% of the total. In the months of October / November 2013, there was the highest percentage of mature individuals, as well as the highest values of gonadosomatic index and gonadal index, representing a peak breeding for the specie. To diet composition were used the indexes of frequency of occurrence (%FO), numeric (%N), percentage weight (%P), and the Alimentary Index (%AI). The feeding strategy was defined by the graphical method of Costello. We used the Restricted Analysis coordinates Main (CAP) and PERMANOVA analysis to compare the diet between climatic periods and ontogenetic stages. The diet was based mainly on Cefalocordados, Teleosts and polychaetes. The component 1 (CAP1) showed an explanation of 88%, indicating the formation of groups 3, despite the observed overlap. While CAP2 explained 6% of the variation, contributing very little to interpretation of the scene. There were significant differences in all combinations evaluated period (PERMANOVA; R Global = 0.03834, p <0.05), ontogeny: Period (PERMANOVA; R Global = 0.16515, p <0.05), however the " ontogeny "represented a further explanation of these variables (PERMANOVA; p <0.05). The species presented a feeding strategy of an opportunistic benthivorous fish. We may indicate that the estuary of the Santa Cruz Channel is being used as a feeding ground for species of the family Gerreidae. The high number of individuals, especially in the juvenile stage, highlights the importance of the waters of the estuary of the Santa Cruz Channel-PE, as natural habitat and shelter for this kind of Gerreidae family. It is important to the regulation by the relevant public bodies, preventing the use of nets with small mesh openings, to avoid catching very young species. / O presente estudo descreve os aspectos biológicos da espécie Eucinostomus argenteus capturada no Canal de Santa Cruz no município de Itapissuma (Pernambuco), no que se refere à alimentação e reprodução. Um total de 1910 indivíduos da espécie - 16,4% fêmeas, 5% machos e 78,6% com sexo indeterminado - foram capturados mensalmente de outubro de 2013 a setembro de 2014. Houve um predomínio de fêmeas sobre os machos (3,3:1) (p<0,05). Para fêmeas, machos e sexos agrupados, a relação peso-comprimento indicou alometria positiva. O tamanho de primeira maturação (em comprimento total, cm) (L50) para os sexos agrupados foi de 8,31cm, para os machos 6,02 e para as fêmeas 8,03. Observou-se que aproximadamente 73% dos indivíduos encontravam-se nas classes inferiores ao L50, com um tamanho médio de 4,97 cm (D.P. = ±0,94). Os indivíduos juvenis predominaram em quase todos os meses de estudo, correspondendo a 62,67% do total. No bimestre de outubro/novembro de 2013, registrou-se o maior percentual de indivíduos maduros, assim como os maiores valores de relação gonadossomática e do índice gonadal, caracterizando um pico de reprodução para a espécie. Para composição da dieta foram utilizados os índices de frequência de ocorrência (%FO), numérica (%N) e peso percentual (%P), além do índice de Importância Alimentar (%IAi). A estratégia alimentar foi definida através do método gráfico de Costello. Foram utilizados a Análise Restrita de Coordenadas Principais (CAP) e a análise de PERMANOVA para comparar a dieta entre os períodos climáticos e as fases ontogenéticas. A dieta da espécie foi baseada principalmente em Cephalochordata, Teleósteos e Poliquetas. A componente 1 (CAP1) apresentou uma explicação de 88%, indicando a formação de 3 grupos, apesar da sobreposição observada. Enquanto a CAP2 explicou 6% da variação, contribuindo muito pouco para interpretação do cenário. Houve diferença significativa em todas as combinações avaliadas, Período (PERMANOVA; R Global = 0,03834; p<0,05), Ontogenia:Período (PERMANOVA; R Global = 0,16515; p<0,05), no entanto a “Ontogenia” representou a maior explicação entre estas variáveis (PERMANOVA; p<0,05). A espécie apresentou estratégia alimentar zoobentívora oportunista. Podemos indicar que o estuário do Canal de Santa Cruz, é utilizado como área de alimentação pela espécie da família Gerreidae. O elevado número de indivíduos, principalmente na fase juvenil, evidencia a importância das águas do estuário do Canal de Santa Cruz-PE, como criadouro natural e abrigo para esta espécie da família Gerreidae. É importante realizar a regulamentação, por parte dos órgãos públicos competentes, do impedimento do uso de redes com aberturas de malha pequena, para evitar a captura de espécies muito jovens.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-26T13:40:10Z No. of bitstreams: 1 Raquel Ventura Lima.pdf: 907594 bytes, checksum: b1c95adf4722d8417b5de6105e98b747 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-26T13:40:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Raquel Ventura Lima.pdf: 907594 bytes, checksum: b1c95adf4722d8417b5de6105e98b747 (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The pacamã (Lophiosilurus alexandri) is a species of endemic catfish São Francisco river belonging to the order Siluriformes. It is a species very appreciated in the regions of the São Francisco River by the absence of intramuscular bones and quality of their steak, also highlighting the great potential for aquaculture. The pacamã among the most endangered species and restocking programs in the various regions of this basin have been developed. The aim of this study was to develop novel microsatellite markers for pacamã that can be used for genetic studies of this species and their populations. Tissue samples were collected from adult fish caught by artisanal fishing between the reservoirs of Sobradinho and Itaparica-BA-PE. First, a genomic DNA library was performed and a set of microsatellite was obtained. After genotyping, the number of alleles ranged from two to nine, and the average heterozygosity were 0659 (He) and 0.603 (Ho), respectively. Only one marker showed deviation from HWE and presence of null alleles. The overall coefficient of inbreeding (FIS) was 0.091, suggesting the presence of homozygous, which may be due to species characteristics. Polymorphic information content is, in most cases, greater than 0.5, confirming the efficiency of these markers for genetic studies / O pacamã (Lophiosilurus alexandri) é uma espécie de bagre endêmico do rio São Francisco pertencente a ordem dos Siluriformes. Trata-se de uma espécie muito apreciada nas regiões do rio São Francisco pela ausência de espinhos intramusculares e qualidade de seu filé, se destacando também pelo grande potencial para a aquicultura. O pacamã figura entre as espécies mais ameaçadas e programas de repovoamento nas diversas regiões desta bacia vêm sendo desenvolvidos. O objetivo deste trabalho foi desenvolver marcadores microssatélites inéditos para o pacamã que possam servir para estudos genéticos sobre essa espécie e suas populações. Amostras de tecido foram coletadas de peixes adultos capturados pela pesca artesanal entre os reservatórios de Sobradinho-BA e Itaparica-PE. Inicialmente, uma biblioteca genômica de DNA foi realizada e um conjunto de microssatélites foi obtido. Após a genotipagem, o número de alelos variou de dois a nove e as heterozigosidades médias foram de 0,659 (He) e de 0,603 (Ho), respectivamente. Apenas um marcador apresentou desvio do EHW e presença de alelos nulos. O coeficiente de endocruzamento total (FIS) foi de 0.091, sugerindo a presença de homozigotos, que pode ser em decorrência de características da espécie. O conteúdo de informação polimórfica foi, na maioria dos casos, superior a 0,5, atestando a eficiência desses marcadores para estudos genéticos futuros.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-26T13:52:15Z No. of bitstreams: 1 Sandra Cristina Soares da Luz.pdf: 1930040 bytes, checksum: 36344f947e80a6fe3f4734c7d7126fa1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-26T13:52:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sandra Cristina Soares da Luz.pdf: 1930040 bytes, checksum: 36344f947e80a6fe3f4734c7d7126fa1 (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Several species of Cichla were supposedly introduced in dams, lakes and reservoirs of Brazil causing serious damage to local wildlife. Cichlids captured in Paulo Afonso hydroelectric complex (BA) have uncertain classification due to the fact of not sharing the morphometric discriminant characters and patterns of colorations. This diversity in the form can be attributed to the introduction of more than one species or to the occurrence of hybrids or even may be associated with different stages of gonadal maturation. For the identification of individuals sampled in this study, we used moleculares tools (COI and microsatellites), in addition to morphometric measurements, meristic counts fish and geometric morphometry. Was also performed an evaluation of the reproduction of individuals. Morphometric measurements and meristic counts of fish confirmed the taxonomy of species, but genetic analyses revealed the occurrence of a single species, Cichla monoculus, in the complex. The haplotype analysis pointed to a population that suffered and bottleneck effect in the process of expansion. The different patterns and colors were evaluated with respect to reproductive parameters such as length of first maturity, gonadal gonadossomatic index, and condition factor, stages of gonadal development, fecundity and reproductive period. It was observed a predominance of females relative to males, a reduction in the size of first maturity relative to the natural habitat of the species and a long reproductive period, with peaks of RGS related to rainy season in the region. The morphometry was not allowed to associate the differences of form and colour to the maturational stages. However, a differentiation was observed between the staining patterns for the sample, with the morphotype "gray" with the more elongated body, and with the mouth a lower position compared to the morphotype "yellow". These changes can be attributed to phenotypic plasticity in the environment occupied by cichlids. These morphotypes might be splitting up, there is a crossing between types, through the choice of partner by color, and if the environmental pressure persist, it can lead to speciation of Cichla monoculus. / Várias espécies de Cichla foram supostamente introduzidas em açudes, lagos e reservatórios do Brasil, causando sérios prejuízos à fauna local. Os ciclídeos (Cichla) capturados no Complexo Hidrelétrico de Paulo Afonso (BA), na bacia do São Francisco, têm apresentado identificação incerta, devido ao fato de não compartilharem caracteres morfométricos discriminantes e padrões de colorações. Essa diversidade na forma pode ser atribuída tanto à introdução de mais de uma espécie, à ocorrência de híbridos ou mesmo associados a diferentes estágios de maturação gonadal. Para a identificação dos indivíduos amostrados neste trabalho, foram utilizadas ferramentas moleculares (COI e microssatélites), além de medições morfométricas, contagens merísticas dos peixes e morfometria geométrica. Também foi realizada uma avaliação da reprodução dos indivíduos, para verificar possíveis relações com os “tipos” encontrados. As medições morfométricas e contagens merísticas dos peixes não confirmaram a taxonomia da espécie, contudo as análises genéticas revelaram a ocorrência de uma única espécie, Cichla monoculus, em todo o Complexo. As análises haplotípicas apontaram para uma população que sofreu efeito gargalo e se apresenta em processo de expansão. Os diferentes padrões de fora e cores foi avaliado com relação a parâmetros reprodutivos como comprimento de primeira maturação gonadal, índice gonadossomático, fator de condição, estádios de desenvolvimento gonadal, período reprodutivo e fecundidade. Observou-se uma predominância de fêmeas com relação aos machos, uma redução do tamanho de primeira maturação em relação ao habitat natural da espécie e um longo período reprodutivo, com picos de RGS relacionados ao período chuvoso da região. A morfometria não permitiu associar as diferenças da forma e coloração aos estádios maturacionais. Contudo, foi observada uma diferenciação entre os padrões de coloração para a forma, com o morfotipo “cinza” com o corpo mais alongado, mais baixo e com a boca uma posição mais inferior em relação ao morfotipo “amarelo”. Estas mudanças podem ser atribuídas à plasticidade fenotípica da espécie em relação ao ambiente que ocupam. Se os cruzamentos forem preferenciais por morfotipo, através da escolha do parceiro por coloração; e se a pressão ambiental persistir, é provável que uma especiação do Cichla monoculus venha a ocorrer nesta bacia .

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-27T12:44:53Z No. of bitstreams: 1 Joana Angelica Lyra Vogeley de Carvalho.pdf: 1376015 bytes, checksum: 83c8b8a2eb0e7f8feefee9e03ebf6461 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-27T12:44:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Joana Angelica Lyra Vogeley de Carvalho.pdf: 1376015 bytes, checksum: 83c8b8a2eb0e7f8feefee9e03ebf6461 (MD5) Previous issue date: 2016-03-31 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / This study focused on selecting wild shrimp Bacillus for a probiotics use in shrimp farming. Bacillus circulans and Bacillus subtilis were isolated from the Farfantepenaeus subtilis intestine and have showed antagonism against Vibrio harveyi, Vibrio alginolyticus, Vibrio vulnificus and Vibrio mimicus in in vitro tests. Afterwards, these bacteria inhibited Vibrio parahaemolyticus ATCC 17802 (VP) in a wide pH and salinity range and produced lipase, amylase and protease in vitro showing that these Bacillus had the needed requirements for in vivo experiments. Thus, juveniles of Litopenaeus vannamei were grown according to the following diet: feed + B. subtilis (BS); feed + B. circulans (BC) and feed without bacteria (Control). Every 15 days samples were collected in order to quantify the bacteria and enzyme activity. After 45 days, the shrimp’s weight fed with BS and BC was significantly higher when compared to the control group. There was a significant increase in Bacillus spp. and a Vibrio spp. reduction in the intestine and hepatopancreas, especially after the 30th and 45th day mark. The trypsin, chymotrypsin, lipase and amylase also had significant increase in shrimp fed with BC and BS, especially after the 30th day mark. After 60 days, the immune system gene expression (proPO, LGBP and HEM) increased significantly in the shrimp fed with BS and BC. In addition to these experiments, the shrimp were infected (by injection) and challenged (water) against VP. The shrimp fed with BC diet had significantly higher survival rates after the injection and there were no differences after the challenge. The proPO expression did not differ between diets after infection or challenge. There was a Vibrio spp. reduction and a significant Bacillus spp. increase in the shrimps’ intestines which were fed with BC and BS diets after the challenge. The Bacillus spp. increase in shrimp fed with BC and BS diets suggest that there was colonization in the gastrointestinal tract during all the experimental period. This may have increased the enzyme activity improving digestion and weight gain, reduced the Vibrio spp. and increased the immune system gene expression, making the shrimp more resistant to infection (BC diet). Thus, B. circulans and B. subtilis have showed the potential for its application as probiotics in shrimp farming. / O objetivo desse estudo foi selecionar Bacillus de camarões selvagens para uso como probiótico na carcinicultura. Bacillus circulans e Bacillus subtilis foram isolados do intestino de Farfantepenaeus subtilis e demonstraram antagonismo contra Vibrio harveyi, Vibrio alginolyticus, Vibrio vulnificus e Vibrio mimicus em testes in vitro. Posteriormente, essas bactérias inibiram Vibrio parahaemolyticus ATCC 17802 (VP) em uma ampla faixa de pH e salinidade e produziram lipase, amilase e protease in vitro, demonstrando que esses Bacillus possuíam características requeridas para experimentos in vivo. Então, juvenis de Litopenaeus vannamei foram cultivados com as dietas: ração + B. subtilis (BS); ração + B. circulans (BC) e ração sem bactérias (Controle). A cada 15 dias, amostras foram coletados para quantificação bacteriana e de atividade enzimática. Ao final de 45 dias, o peso dos camarões alimentados com BS e BC foi significativamente maior comparados ao grupo controle. Houve um significativo aumento de Bacillus spp. e redução de Vibrio spp. no intestino e hepatopâncreas, sobretudo após 30 e 45 dias. As atividades da tripsina, quimotripsina, lipase e amilase aumentaram significativamente nos camarões alimentados com BC e BS, principalmente após 30 dias. Após 60 dias, a expressão de genes do sistema imunológico (proPO, LGBP e HEM) aumentou significativamente nos camarões alimentados com BS e BC. Adicionalmente, os camarões foram infectados (injeção) e desafiados (água) com VP. A sobrevivência dos camarões alimentados com BC foi significativamente maior após infecção e não houve diferenças após desafio. A expressão da proPO não diferiu entre as dietas após infecção e desafio. Houve uma redução de Vibrio spp. e significativo aumento de Bacillus spp. no intestino dos camarões alimentados com BC e BS após desafio. Durante todo o período experimental, o aumento de Bacillus nos camarões alimentados com BC e BS sugere que houve colonização no trato digetório de B. circulans e B. subtilis. Isso pode ter incrementado a atividade enzimática, melhorando a digestão e ganho de peso, reduzido Vibrio spp. e aumentado a expressão de genes do sitema imunológico, tornando os camarões mais resistentes ao VP (dieta BC). Assim, B. circulans e B. subtilis apresentam potencial para utilização como probiótico na carcinicultura.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-30T12:49:02Z No. of bitstreams: 1 Reginaldo Florencio da Silva Junior.pdf: 1573897 bytes, checksum: 6b4cdfaa9a70f1efb155726c3d8b7512 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-30T12:49:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Reginaldo Florencio da Silva Junior.pdf: 1573897 bytes, checksum: 6b4cdfaa9a70f1efb155726c3d8b7512 (MD5) Previous issue date: 2016-02-19 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The massive growth of aquaculture and limited supply of fish meal, means that alternative sources of food need to be studied to make more sustainable industry. In this context, the apparent digestibility coefficients (ADC) eight ingredients used in the aquafeeds were determined in terms of dry matter (DM), crude protein (CP), ether extract (EE), mineral contente (MM), phosphorus (P), gross energy (GE) and amino acids (AA) in juvenile common snook (Centropomus undecimalis) using chromium oxide as inert marked. The ingredients included fish meal (FM), shrimp meal (CM), poultry by-products (PBP), hydrolyzed feather meal (HFM), soybean meal (SM), corn gluten meal (CGM) wheat bran (WB) and maize (M). A reference diet (56.7%CP, 22.7 MJ/kg GE) was formulated in parallel experimental diets which included 30% of each ingredient and 70% of the reference diet. The results indicated that the ADC of nutrients and GE were affected (P <0.05) by the test composition ingredients. The CGM and HFM showed similar results (P> 0.05) in nutrients and GE. The digestibility DM ranges from 83% (SM) to 145% (CGM). The EE was well digested by fish with differences (P>0.05) among the ingredients. The smaller ADC MM were observed in the PBP (37%) and SM (28%) and difference (P<0.05) among the treatments. The ADC GE in the FM (118%) and SM (117%) were significantly higher (P<0.05) than the other ingredients for common snook. The ADC P were higher in all the ingredients. The ADC of AA reflected the digestibility of CP, and FM, SM, HFM and CGM greater than PBP, SM and M. The results of this study indicate high digestibility of protein and energy ingredients for juvenile C. undecimalis. However, the digestibility of mineral content to PBP, SM and M were significantly lower FM, CM, HFM, CGM, SM and WB, indicating the potential use of these ingredients in feed for this species. Thus, this study also investigated the effects of a commercial diet (I) and experimental on profile of digestive enzymes in C. undecimalis. The activities of peptidases, acid and alkaline, showed differences (P<0.05) between the fish fed the diets. The analysis differ (P<0.05) between treatments with greater intensity in the diets I, FM and HFM. In studies with trypsin, there is difference (P<0.05), with higher enzyme activity in fish fed diet I. Chymotrypsin showed higher proportion of enzymes in diets with protein ingredients, except for the PBP in relation to energy. Amylase, it was also high in protein ingredients except CGM. There was no difference (P>0.05) for specific activity of pepsin. The different ether extract concentrations in the diet REF and consequently in the other experimental diets, inhibited total alkaline proteolytic activities and trypsin in juveniles de common snook. The identification and characterization of acidic and alkaline proteases in fish digestibility studies is an important step in understanding the digestive mechanisms. The results of this thesis will allow the formulation of experimental and commercial diets based on digestible nutrients for juvenile common snook. / Os coeficientes de digestibilidade aparente (CDA) de oito ingredientes utilizados na indústria aquícola foram determinados em termos de matéria seca (MS), proteína bruta (PB), extrato etéreo (EE), matéria mineral (MM), fósforo (P), energia bruta (EB) e aminoácidos (AA) em juvenis de robalo-flecha (Centropomus undecimalis), utilizando óxido de cromo como marcado inerte. Os ingredientes incluíam a farinha de peixe (FP), farinha de camarão (FC), farinha de vísceras de aves (FVA), farinha de penas hidrolisada (FPH), farelo de soja (FS), farelo de glúten de milho (FGM), farelo de trigo (FT) e farinha de milho (FM). Uma dieta referência (REF) (56,7%PB, 22,7 MJ/kg ED) foi formulada em paralelo as dietas experimentais que incluiu 30% de cada ingrediente e 70% da dieta referência. Os resultados indicaram que o CDA dos nutrientes e EB foram afetados (P<0,05) pela composição dos ingredientes testes. O FGM e FPH apresentaram resultados semelhantes (P>0,05) nos nutrientes e EB. A digestibilidade da MS variou de 83% (FS) a 145% (FGM). O EE foi bem digerido pelos peixes com diferenças (P>0,05) entre os ingredientes. Os menores CDA de MM observados na FVA (37%), FS (28%) e FM (47,8%) com diferença (P<0,05) entre os tratamentos. Os CDA de EB na FP (118%) e FC (117%) foram significativamente maiores (P<0,05) do que os demais ingredientes utilizados para os robalo-flecha. Os CDA do P foram altos em todos os ingredientes. Os CDA dos AAs refletiram a digestibilidade da PB, sendo a FP, FC, FPH e FGM maior que FVA, FS e FM. Os resultados deste estudo indicam alta digestibilidade dos ingredientes proteicos e energéticos para juvenis de C. undecimalis. No entanto, a digestibilidade da matéria mineral para FVA, FS e FM, foram bastante inferiores a FP, FC, FPH, FGM e FT, indiciando potencial uso desses ingredientes em rações para essa espécies. Para melhorar a utilização das dietas em peixes, além da digestibilidade dos ingredientes é importante que se conheça o perfil de enzimas digestivas do animal cultivado. Assim, este trabalho também investigou os efeitos de uma dieta comercial (I) e experimentais sobre o perfil das enzimas digestivas em juvenis de C. undecimalis. As atividades das proteases ácidas e alcalinas, mostraram diferença (P<0,05) entre os peixes alimentados com as dietas. A análise diferiu (P<0,05) entre os tratamentos com maior intensidade nas dietas I, FP e FPH. Nos estudos com a tripsina, observa-se diferença (P<0,05), com maior atividade enzimática nos peixes alimentados com a dieta I. A quimotripsina, mostrou maior atividade de enzimas nas dietas com ingredientes proteicos, exceto para a FVA, em relação aos energéticos. A amilase, também se mostrou alta nos ingredientes proteicos, exceto FGM. Não houve diferença (P>0,05) para atividade específica da pepsina. As diferentes concentrações de extrato etéreo na dieta (REF) e consequentemente nas demais dietas experimentais, inibiram as atividades proteolítica alcalina total e de tripsina nos juvenis de robalo-flecha. A identificação e caracterização das proteases ácidas e alcalinas em estudos de digestibilidade de peixe é um passo importante para a compreensão dos mecanismos digestivos. Os resultados dessa tese permitirão a formulação de dietas experimentais e comerciais com base em nutrientes digestíveis para juvenis do robalo-flecha.