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Estimativas de (co)variâncias e predições de valores genéticos do consumo alimentar residual e características associadas em touros da raça nelore / Variance and genetic parameters for residual feed intake and associated characteristicsMorais, Lorraine Cristina Oliveira de 24 May 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-05-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Among various measures for assessing feed efficiency, consumption
residual feed (CAR) has highlighted as lacking correlation with
growth characteristics. Animals that exhibit negative CARs are
more efficient when compared to animals with positive CAR due to
consume less than the predicted amount for the same weight gain.
Selecting more efficient animals, have been not only reducing costs
production as well as reduced environmental impact because of the dimiuição
emission of greenhouse gases, manure production and pasture area.
The aim of this study was to estimate (co) variances, parameters and values
Genetic CAR and associated features, aiming at their inclusion in
breeding programs. Data from 238 bulls were analyzed
Nellore, from the breeding program Nellore
Qualitas. The MTDFREML application was used to estimate the components of
(co) variances, heritability and genetic and phenotypic correlations of
characteristics analyzed. The heritability values found for the
characteristics were generally moderate to low, probably by
small sample size of animals evaluated (n = 238). The inclusion of the
contemporary group of animals allowed to obtain results more
consistent estimates of parameters and predictions of genetic values
for the measures assessed. Comparison of phenotypic values and
predictions of genetic value for CAR showed that the phenotype of own
animal is a poor indicator of their genetic value, especially in cases
like this that the heritability of the trait analyzed was low (h² = 0.10). / Dentre várias medidas de avaliação da eficiência alimentar, o consumo
alimentar residual (CAR) tem destaque por não possuir correlação com
características de crescimento. Animais que apresentam CAR negativo são
mais eficientes quando comparados a animais com CAR positivo em razão de
consumirem menos que a quantidade predita para o mesmo ganho em peso.
Selecionando animais mais eficientes, têm-se não só a redução dos custos de
produção como também menor impacto ambiental por conta da dimiuição de
emissão de gases efeito estufa, produção de esterco e área de pastagens.
Objetivou-se neste trabalho estimar (co)variâncias, parâmetros e valores
genéticos do CAR e de características associadas, visando a sua inclusão em
programas de melhoramento genético. Foram analisados dados de 238 touros
da raça Nelore, provenientes do programa de melhoramento genético Nelore
Qualitas. O aplicativo MTDFREML foi utilizado para estimar os componentes de
(co)variâncias, herdabilidades e correlações genéticas e fenotípicas das
características analisadas. Os valores de herdabilidade encontrados para as
características foram, em geral, de moderados a baixos, provavelmente pelo
pequeno tamanho amostral dos animais avaliados (n=238). A inclusão do efeito
do grupo contemporâneo dos animais permitiu a obtenção de resultados mais
consistentes das estimativas de parâmetros e predições de valores genéticos
para as medidas analisadas. A comparação dos valores fenotípicos e das
predições de valor genético para o CAR mostrou que o fenótipo próprio do
animal é um fraco indicador do seu valor genético, principalmente em casos
como este que a herdabilidade da característica analisada foi baixa (h²= 0,10).
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Seleção recorrente para rendimento de grãos em aveia (Avena sativa L.) : identificação do tipo de unidade experimental para a avaliação, da geração de seleção e da variabilidade dos genitoresLange, Claudia Erna January 2003 (has links)
Seleção recorrente é um método indicado para o melhoramento de características quantitativas, como rendimento de grãos em aveia. Consiste em selecionar e recombinar de forma cíclica genótipos superiores de uma população geneticamente variável. Sua implantação depende do estabelecimento de uma estratégia que permita a condução das atividades inerentes ao método de forma compatível com a estrutura física e de mão-de-obra do programa. Este trabalho teve como objetivos investigar a possibilidade do uso de uma unidade experimental de tamanho reduzido para a condução das avaliações e seleção, indicar a geração de autofecundação a ser submetida à seleção e caracterizar a variabilidade dos genitores de uma população sintetizada pelo cruzamento dialélico de dez genótipos de aveia . Dados de três anos de ensaios mostram que unidades experimentais constituídas de uma única linha de três metros de comprimento reproduzem as classificações dos genótipos obtidas em parcelas de tamanho padrão para ciclo, estatura e rendimento de grãos. No entanto, o uso posterior de linhas como unidade experimental em ensaios que ocuparam uma área muito extensa, demonstrou que a variação de ambiente reduziu muito a eficiência da seleção. A avaliação da base genética para rendimento de grãos de aveia indica uma forte determinação de efeitos não aditivos. Nesta situação, a seleção em gerações mais avançadas de homozigose são mais adequadas. Porém, a seleção em geração F4 não apresentou vantagens sobre a realizada em F2 devido a grande variação de ambiente relacionada ao tamanho da área necessária para a condução dos ensaios. A estrutura da variabilidade fenotípica dos genitores confirma o caráter complementar dos genótipos em relação às características agronômicas e de adaptação pretendidas na população..
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Genética de caracteres agronômicos e de qualidade em milho doce / Genetic of agronomic and quality traits in sweet cornCardoso, Elbio Treicha January 2001 (has links)
A cultura do milho doce poderá ser uma excelente opção para os agricultores, especialmente nas pequenas propriedades, devido o seu manejo não ser distinto da cultura do milho comum e pelo maior valor do produto. No entanto, as variedades disponíveis atualmente apresentam inúmeros problemas, tanto em caracteres agronômicos, como de qualidade de grão, o que dificulta a viabilização desta cultura. Deste modo, as populações BR 400, BR 401 e BR 402 foram avaliadas para estimar a capacidade combinatória, bem como os efeitos diretos e indiretos da seleção recorrente sobre caracteres adaptativos. Também foram estimados parâmetros genéticos importantes para realização eficiente da seleção em caracteres relacionados à qualidade de grão e espiga. Os experimentos foram conduzidos durante três anos agrícolas (1998/1999 a 2000/2001) na Estação Experimental Agronômica da UFRGS (Eldorado do Sul). Os resultados obtidos indicaram a existência de variabilidade genética para os caracteres avaliados, com predominância de efeitos gênicos aditivos sobre os não aditivos. A seleção para estatura, altura de inserção de espiga, florescimento masculino e feminino foi eficiente e não provocou alteração expressiva nos caracteres de qualidade de grão e espiga. As estimativas de variância aditiva e herdabilidade para os caracteres espessura de pericarpo, teor de sólidos solúveis e percentagem de espigas descobertas indicaram que a possibilidade da obtenção de ganhos genéticos através de seleção para estes caracteres. Por outro lado, as correlações genotípicas observadas entre caracteres importantes da cultura foram baixas, requerendo a seleção simultânea para estes caracteres; sendo que para este fim o emprego do índice de seleção de Williams apresentou resultados superiores às demais metodologias avaliadas. / Sweet corn can be an excellent option, particularly for small farmers. Its product is valuable on the international market and its cultural practices are similar to those used in field corn. However, available varieties in southern Brazil present problems, especially in agronomic and quality traits. This way, the populations BR 400, BR 401, and BR 402 were tested for combining ability and selected for adaptative traits, using direct and selection indexes approaches. Genetic parameters were also estimated for grain and ear quality. The experiments were conducted in three seasons (1998/1999 to 2000/2001) in Estação Experimental AgronômicalUFRGS (Eldorado do Sul, RS). The obtained results indicated the existence of genetic variability for all the evaluated traits, with predominance of additive effects. The selection for plant height, ear height, pollen shedding and silking was efficient and it did not provoke significant alteration in quality traits. The estimates of additive variance and heritability for pericarp thickness, total soluble solids, and ear tip indicated the possibility to obtain significant genetic gains through selection. On the other hand, genotypic correlations among traits were low, requiring simultaneous selection. As a result, Williams selection index was suggested as a superior alternative for sweet corn breeding in southern Brazil.
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Gestão por competência: perfil e visão do administrador das Unidades de conservação do Estado do Amazonas. / Recognição do perfil “conhecimentos, habilidades e atitudes” dos gerentes de unidades de conservação do estado do Amazonas.Sahdo, Rosana Martiniano. 23 May 2018 (has links)
Submitted by Inácio de Oliveira Lima Neto (inacio.neto@inpa.gov.br) on 2018-09-26T17:38:46Z
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Previous issue date: 2018-05-23 / The study proposed to recognize the appropriate profile for the position of manager of Conservation Units. Competences of Knowledge, Skills and Attitudes were mapped and the design of the manager's post was suggested to the selective processes of the Environment Secretariat in the state of Amazonas, Brazil. The research was descriptive of a qualitativequantitative case study by personal interviews and questionnaires. The result showed a team of young managers, aged between 20 and 40 years. Most of them have a 47.1% multidisciplinary degree and 2 to 10 years in the function. It is essential to know about: administration / finances, operational strategic planning and interpersonal relationship. Above all, leadership, integrity and commitment must be achieved to make good management. / O estudo propôs reconhecer o perfil adequado ao cargo de gerente de Unidades de Conservação. Foram mapeadas as competências dos Conhecimentos, Habilidades e Atitudes e sugerido o desenho do cargo do gerente aos processos seletivos da Secretaria de Meio Ambiente no estado do Amazonas, Brasil. A pesquisa foi descritiva de estudo de caso qualiquantitativo através de entrevistas presencial e questionários. O resultado mostrou uma equipe de gerentes jovens, idade entre 20 a 40 anos. A maioria possui nível de graduação multidisciplinar 47,1% e com 2 a 10 anos atuando na função. É essencial conhecer sobre: administração/finanças, planejamento estratégico operacional e relação interpessoal. Sobretudo, para fazer boa gestão deve-se ter liderança, integridade e comprometimento.
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Padrão de ocupação e seleção de conchas pelo ermitão Paguristes tortugae SCHMITT, 1933 (Crustacea, Anomura) na Ilha Anchieta, Ubatuba, São Paulo. / Patterns of shell utilization and selection by the hermit crab Paguristes tortugae SCHMITT, 1933 (Crustacea, Anomura) from Anchieta Island, Ubatuba, São Paulo.Dominciano, Laura Cristina da Cruz 29 October 2001 (has links)
No presente trabalho caracterizou-se o padrão de utilização de conchas pelo ermitão Paguristes tortugae, habitante do infralitoral da Ilha Anchieta (Ubatuba), analisando-se comparativamente o padrão de seleção e de ocupação de conchas no ambiente natural e em laboratório. Para o estudo de ocupação de conchas no ambiente, os indivíduos foram coletados mensalmente (janeiro a dezembro/1998) na região infralitorânea de quatro áreas da Ilha, por mergulho autônomo. Os ermitões foram medidos quanto ao comprimento e largura do escudo cefalotorácico, altura e comprimento do própodo quelar, contados, determinado seu sexo e pesados. Para os experimentos de seleção de conchas, os animais foram mantidos vivos em aquário de vidro. Nestes experimentos laboratoriais, os animais foram retirados de suas conchas e colocados com um número suficiente de conchas com tamanhos apropriados. Após 72h os animais e as conchas escolhidas foram analisados quanto ao peso dos ermitões e das conchas e as respectivas medidas. A escolha quanto ao tipo de concha foi analisada de acordo com a porcentagem de ocupação de uma espécie em relação à outra. Para a escolha quanto ao tamanho da concha, avaliou-se as análises de regressão entre as dimensões dos ermitões e das conchas. Um total de 2429 exemplares de P. tortugae foram analisados (1092 machos, 495 fêmeas não-ovígeras e 842 fêmeas ovígeras), ocupando 21 espécies de conchas de gastrópodos. Este perfil, indicativo de ampla diversidade no padrão de ocupação, apresentou Pisania auritula (35.49%), Cerithium atratum (27.83%) e Morula nodulosa (12.70%) como as mais ocupadas. Os machos (38.46%) e as fêmeas ovígeras (38.00%) ocuparam, em maior porcentagem, as conchas de P. auritula, enquanto que as fêmeas não-ovígeras (39.40%) ocuparam C. atratum. Houve dimorfismo sexual quanto ao tamanho em favor dos machos e, a razão sexual foi de 1:1.2, em favor das fêmeas. Verificou-se que as conchas mais ocupadas foram as menos adequadas. Leucozonia nassa foi a mais adequada tanto no ambiente quanto no laboratório, corroborando a hipótese de que a ocupação das conchas está associada ao ambiente em que vivem e à sua disponibilidade. A maior correlação ocorreu entre as dimensões dos ermitões e o peso da concha, sendo esta a relação que melhor caracterizou a escolha e a ocupação das conchas por P. tortugae. Quanto ao sexo, as fêmeas ovígeras apresentaram as melhores correlações, estando melhor adequadas ao peso e ao volume interno da concha, favorecendo a fecundidade e o processo reprodutivo anual. Tal condição foi corroborada com os experimentos de laboratório, onde constatou-se que as fêmeas ovígeras apresentaram preferência por conchas com maior volume interno (L. nassa e C. atratum). Em laboratório, dentre as seis espécies de conchas com maior ocorrência de ocupação no ambiente, o padrão de preferência foi L. nassa > P. auritula > S. haemastoma > T. viridula para os indivíduos maiores e C. atratum > M. nodulosa para os indivíduos menores. Estes resultados, comparados aos da natureza, demonstraram que P. tortugae apresentou um padrão de preferência pelas conchas mais disponíveis na natureza, mesmo não sendo as mais adequadas quanto às dimensões. Neste sentido podemos inferir que o padrão de utilização de conchas de P. tortugae pode estar fortemente associado à disponibilidade de conchas, ao tamanho e à condição reprodutiva dos indivíduos. / This study characterized the pattern of shell utilization by the hermit crab Paguristes tortugae, inhabiting infralittoral areas of Anchieta Island (Ubatuba), analyzing comparatively the pattern of the shell occupation in the field and in the laboratory. For the shell occupation study in the field, the individuals were collected monthly (January to December/1998), by scuba methods in four infralittoral areas of the Island. The hermit crabs were measured on the basis of shield width and length, propodus height and length, sexed and weighed. In the shells selection experiments, the animals were maintained alive in the laboratory. All experiments were conducted in a glass aquarium where the hermit crabs were placed naked with a large number of shells of appropriate sizes. After 72h the hermit crabs and chosen shells were analyzed by preference and measured. The shell type preference was estimated by the percentage of occupation of the chosen species. The preferred shell type and size were determined by regression analysis. A total of 2429 individuals of P. tortugae were analyzed (1092 males, 495 non-ovigerous females and 842 ovigerous females), occupying 21 species of gastropod shells characterizing a considerable diversity in the shell occupation pattern. The most occupied shells were Pisania auritula (35.49%), Cerithium atratum (27.83%) and Morula nodulosa (12.70%). The males (38.46%) and the ovigerous females (38.00%) occupied in higher percentage P. auritula shells, while the non-ovigerous females (39.40%) occupied C. atratum. It was verified sexual size dimorphism, being the males larger than females. The sex ratio was 1:1.2 in favor of females. It was verified that the most occupied shells least adequate and that L. nassa was the most adequate in the field and in the laboratory, corroborating the hypothesis that the shell utilization is associated to the habitat and to the availability in the field. The highest correlation coefficients were obtained for the relations between the crab dimensions and shell dry weight. In relation to sex, the ovigerous females showed the best correlation coefficients being more adequate to the shell weight and internal volume, that may favor the fecundity and the annual reproductive process. This condition was corroborated by the laboratory experiments when the ovigerous females preferred shells with higher internal volume (L. nassa e C. atratum). In laboratory, among the six most occupied shell species in the field, the preference pattern was L. nassa > P. auritula > S. haemastoma > T. viridula to larger individuals and C. atratum > M. nodulosa to the small ones. These results, compared to the field study, showed that P. tortugae exhibited a pattern of preference for the most available shells in the field, even if theyre not the most adequate to the crab dimensions. In this sense we may infer that the shell utilization pattern of P. tortugae may be associated to the shell availability and to the size and reproductive conditions of the individuals.
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Application of artificial neural networks to genome-enabled prediction in Nellore cattle /Ribeiro, André Mauric Frossard January 2019 (has links)
Orientador: Henrique Nunes de [UNESP] Oliveira / Resumo: Nos últimos anos, o rápido desenvolvimento de tecnologias de sequenciamento de alto rendimento permitiu a genotipagem em larga escala de milhares de marcadores genéticos. Diversos modelos estatísticos foram desenvolvidos para predizer os valores genéticos para traços complexos usando as informações de marcadores moleculares em alta densidade, pedigrees ou ambos. Esses modelos incluem, entre outros, as redes neurais artificiais (RNA) que têm sido amplamente utilizadas em problemas de previsão em outros campos de aplicação e, mais recentemente, para predição genômica. O objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho de redes neurais artificiais na predição genômica de bovinos Nelore. Para isso foram testadas diferentes arquiteturas de rede (1 a 4 neurônios em camada oculta), 5 estratégias para seleção de animais com base na acurácia do EBV a serem declaradas para a rede de treinamento como entrada e avaliação de matrizes de relacionamento (NN_G (G como entrada); NN_GD (combinados G com D); e N_Guar (Guar como entrada)) a serem utilizados como entrada para predição genômica em características de peso corporal de bovinos Nelore em relação a modelos de regressão lineares bayesianos hierárquicos (BayesB). . Para isso, utilizou-se o dEBV de 8652 animais genotipados para peso corporal aos 120 dias, 240 dias, 365 dias e 455 dias. Esses animais foram divididos pela acurácia do EBV em população de treinamento e na validação. Todas as estratégias foram repetidas 5 vezes e a correlação ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In recent years, the fast development of high-throughput sequencing technologies has enabled large-scale genotyping of thousands of genetic markers. Several statistical models have been developed for predicting breeding genetic values for complex traits using the information on dense molecular markers, pedigrees, or both. These models include, among others, the artificial neural networks (ANN) that have been widely used in prediction problems in other fields of application and, more recently, for genome-enabled prediction. The objective of this work was to evaluate the performance of artificial neural networks in the genomic prediction of complex trait in Nellore cattle. For this, we has been tested different network architectures (1 to 4 neurons on hidden layer), 5 strategies to select animals based on their EBV accuracy to be declared for the training network as input and evaluation of relationship matrices [ NN_G (G as input); NN_GD(combined G with D), and N_Guar (Guar as input)] to be used as input for genomic prediction in body weight traits in Nellore cattle relative to hierarchical linear Bayesian regression models (BayesB) . The dEBV of 8652 animals genotyped for body weight at 120 days, 240 days, 365 days, and 455 days was used. Animals were divided into training population and validation by the predicted EBV accuracy. All strategies were repeated five times, and the correlation between dEBV and predicted dEBV was used as the accuracy measure of the models tested. Th... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Evolução e modelagem molecular do fator neurotrófico derivado do cérebro (BDNF) em mamíferosMattei, Fabíola Salene January 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010 / The neurotrophic factor known as BDNF has attracted considerable attention in the scientific literature, due to its involvment in critical processes related to the development and regulation of the nervous system. However, many aspects of this molecule are still unknown, while others have only been investigated in humans and model organisms. In this context, bioinformatic tools can be very useful to perform comparative analyses focusing on evolutionary, structural and functional aspects of this protein. This study aimed to characterize the patterns of conservation and variability in this molecule through the comparison of coding sequences in different mammalian lineages, as well as to investigate structural aspects by constructing a novel 3D model of a BDNF homodimer that is consistent with experimentally validated data. Our results revealed very interesting patterns of conservation and variability in different lineages, including strong evidence for the occurrence of negative natural selection (indicating constraints to evolutionary change implying functional relevance) in both the mature and the pro domains. In addition, we observed evidence of positive selection (induction of changes that are likely adaptive) in different lineages, in every case directly affecting the pro domain. These results indicate that the pro domain presents great functional relevance, and highlight the importance of focusing research efforts on this portion of BDNF. / O fator neurotrófico conhecido como BDNF tem atraído considerável atenção na literatura científica, pelo seu envolvimento em processos cruciais de desenvolvimento e regulação do sistema nervoso. Entretanto, muitos aspectos desta molécula são ainda desconhecidos, enquanto outros foram investigados apenas em humanos e organismos-modelo. Neste contexto, ferramentas de bioinformática podem ser muito úteis para realizar análises comparativas enfocando aspectos evolutivos, estruturais e funcionais. Este projeto objetivou uma caracterização de padrões de conservação e variação desta molécula através da comparação das seqüências codificantes deste gene em diferentes linhagens de mamíferos, assim como uma investigação de aspectos estruturais através da construção de um modelo 3D do BDNF consistente com dados experimentais. Os resultados revelam padrões bastante interessantes de conservação e variação de sequência em diferentes linhagens, incluindo fortes evidências da ocorrência de seleção natural negativa (indicando restrição à mudança devido à relevância funcional) tanto no domínio maduro como no domínio pro. Além disso, observou-se evidência de seleção positiva (indução de mudanças possivelmente adaptativas) em diferentes linhagens, em todos os casos afetando diretamente o domínio pro. Estes resultados indicam que o domínio pro apresenta grande relevância funcional, e salientam a importância de focar esforços de investigação experimental nesta porção do BDNF.
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Modulação do comportamento reprodutivo pela turbidez e por estímulos químicos indicadores de risco de predação no lebistePereira, Rafaela Torres. January 2018 (has links)
Orientador: Rodrigo Egydio Barreto / Resumo: Os animais se comunicam utilizando sinais de diferentes modalidades sensoriais. Contudo, as condições ambientais podem afetar quais os estímulos que serão utilizados na transmissão de sinais entre os organismos. Assim, supomos que condições desfavoráveis à exibição de estímulos visuais como a turbidez da água e a presença de predador podem afetar o comportamento de peixes, como aqueles associados à reprodução. Ao mesmo tempo, podemos supor que pode haver vias alternativas para a manutenção de dado comportamento que envolva a comunicação entre organismos (como no caso da corte e da cópula). Assim, utilizando o lebiste (Poecilia reticulata) como modelo experimental, testamos a influência da turbidez da água e de estímulos químicos indicadores de risco de predação em seu comportamento reprodutivo. Encontramos aqui que o comportamento defensivo de lebistes é influenciado por condições de turbidez e de pistas químicas indicadoras de risco de predação, com peixes apresentando redução de atividade nessas condições. Observamos que o comportamento reprodutivo é modulado por condições de turbidez e iluminação, com peixes sendo mais ativos em água não turva com luz acesa. Por fim, ao agruparmos a execução de comportamentos defensivos e reprodutivos, sob condições de turbidez e de risco de predação, verificamos maior resposta defensiva. O lebiste é uma espécie muito estudada por seus padrões visuais associados à reprodução, porém, em situação desfavorável para o uso de estímulos visuais ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Animals communicate using different modality of sensorial signals. However, environmental conditions may affect which stimuli will be used in sign transmission between organisms. Thus, we suppose that unfavorable conditions to the exhibition of visual cues like water turbidity and the presence of predators might affect fish behavior, such as linked to reproduction. At the same time, we can suppose that may have alternative ways to given behavior maintenance that involves the communication between organisms (as in the case of courtship and copulation). Thus, using the guppy (Poecilia reticulata) as experimental model, we tested the influence of water turbidity and chemical stimuli that indicates predation risk in its reproductive behavior. We found here that guppy defensive behavior is influenced by turbidity conditions and chemicals cues that indicates predation risk, with fishes showing activity reduction under these conditions. We observed that reproductive behavior is modulated by turbidity conditions and illumination, with fishes being more active in clear water with the lights on. Lastly, by grouping the execution of defensive and reproductive behaviors, under turbidity conditions and predation risk, we verified greater defensive response. Guppy is a much studied species by its visual patterns associated to reproduction, however in unfavorable situations to visual stimuli and under predation risk, they choose to defend themselves, evidencing a trade-off between survival ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Avaliação dos mecanismos de ação dos novos agentes Zalypsis, Tryptamicidin e 3´3-ditrifluormetildifenil disselenetoMachado, Miriana da Silva January 2011 (has links)
Os novos agentes alquilantes Zalypsis e o Tryptamicidin são moléculas estruturalmente relacionadas à trabectedina e possuem a habilidade de ligarem-se à volta menor do DNA. Por apresentarem potente atividade antitumoral em modelos in vitro e in vivo, estes agentes estão atualmente sendo avaliados em ensaios clínicos I e II para o tratamento de diferentes tipos de tumores sólidos e hematológicos. Por outro lado, o 3’3-ditrifluometildifenil disseneleto (DFDD) é um composto orgânico de selênio que demonstra interessantes atividades antioxidantes em modelos biológicos in vitro e in vivo e está em fase inicial de desenvolvimento. No presente trabalho, buscou-se avaliar os mecanismos de ação dos três novos agentes principalmente em relação à maquinaria macromolecular. Dentre os principais resultados encontrados, destaca-se a potente atividade citotóxica do Zalypsis e Tryptamicidin em diferentes linhagens tumorais e a capacidade de indução de quebras duplas no DNA (DSB) de maneira dependente de replicação por esses agentes. Além disso, a utilização de linhagens celulares deficientes em genes que codificam proteínas envolvidas nos sistemas de reparação por recombinação homóloga (HRR) e não-homóloga (NHEJ), permitiu a identificação do sistema HRR como a principal via implicada na reparação das lesões induzidas pelo Zalypsis e Tryptamicidin. Por outro lado, embora o NER não seja capaz de reparar as lesões induzidas pelo Tryptamicidin, este agente mostrou interferir na maquinaria do NER, impedindo a reparação de lesões induzidas pelo UV, como verificado pelo teste UDS. Considerando que linhagens tumorais resistentes a agentes platinados possuem uma alta atividade das enzimas do NER, buscou-se investigar a ação do Tryptamicidin nestas células. Como esperado, o Tryptamicidin, assim como a trabectedina, demonstrou potente atividade citotóxica nestas linhagens e ainda mostrou efeito sinérgico quando associado à cisplatina em linhagens resistentes a este agente platinado. Adicionalmente, usando linhagens celulares tumorais e extratos de ovos de Xenopus laevis, foi verificado que o Zalypsis, mesmo em baixas concentrações e curtos períodos de tratamento, também é capaz de bloquear a replicação sem causar, no entanto, parada no ciclo celular e ativação das vias clássicas de sinalização de danos no DNA (DNA damage response). Adicionalmente, foi observado pela primeira vez que o DFDD foi capaz de proteger o DNA contra os efeitos genotóxicos e mutagênicos do peróxido de hidrogênio (H2O2) em diferentes modelos biológicos. Estes resultados reforçam as atividades antioxidantes deste composto de selênio que parecem estar relacionadas à ação direta do DFDD na molécula do H2O2. Os dados apresentados nesta tese elucidaram aspectos importantes dos mecanismos de ação dos novos agentes Zalypsis, Tryptamicidin e DFDD, ressaltando a importância dessas moléculas que, como agentes únicos ou em associação, poderão contribuir para a melhoria da terapia antitumoral. / Zalypsis and Tryptamicidin are new covalent minor groove binders structurally related to trabectedin. Both compounds have shown potent antitumoral activities in vitro and in vivo tumor models and are currently under clinical phase I and II in patients with different haematological and solid tumors. 3’3- ditrifluoromethyldyphenil diselenide (DFDD) is an organic selenium compound that demonstrated interesting antioxidant activities both in vitro and in vivo and is under early phase of development. The aim of this work was evaluate the mechanism of action of these new products focusing on the macromolecular machinery. Interestingly, Zalypsis and Tryptamicidin display strong cytotoxic activities in different tumor cell lines and these drugs are able to induce replication-dependent double strand breaks (DSB). Using homologous recombination repair (HRR) and nonhomologous end-joining repair (NHEJ) deficient and proficient cell lines, it was found that the HRR is the principal pathway implicated in the repair of the DNA lesions induced by Zalypsis and Tryptamicidin. Our results also demonstrate that although Tryptamicidin is not repaired by NER, this compound is able to interfere with the NER machinery thereby attenuating the repair of specific NER substrates, as verified by UDS test. Importantly, Tryptamicidin and trabectedin show unchanged or even enhanced activity towards all four cisplatin- and oxaliplatin-resistant cell lines and combinations of these drugs and cisplatin were mostly synergistic toward both parental and cisplatin-resistant ovarian carcinoma cells. We also demonstrate for the first time that Zalypsis, even in low doses and short treatment periods, was able to block the replication in tumor cell lines and Xenopus laevis egg extracts. Interestingly, this blockage did not trigger cell cycle arrest or DNA damage response and, as a result, leads to early cell death. On the other hand, DFDD is able to protect the DNA against the genotoxicity and mutagenicity induced by hydrogen peroxide in bacteria, yeast and cultured mammalian cells. Using in vitro tests, we also illustrated that DFDD directly acts on H2O2 molecule mimicking catalase-like activity. Indeed, these results reinforce the antioxidant property of DFDD that probably play a fundamental role in the DNA protection showed by this selenium compound. Taken together, our findings elucidate important aspects of the mechanism of action of the new agents Zalypsis, Tryptamicidin and DFDD, highlighting the promising activities of these drugs which, employed as single or in association, might contribute for the antitumoral therapy.
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Implicações da seleção recorrente para caracteres adaptativos de uma população de arroz irrigadoFagundes, Paulo Ricardo Reis January 2004 (has links)
O objetivo do trabalho foi de avaliar a aptidão da população CNA 11 para melhoramento dos caracteres ciclo vegetativo e estatura de planta através de um ciclo de seleção recorrente, estimar parâmetros genéticos desses caracteres e verificar possíveis alterações nas freqüências alélicas da população.
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