Made available in DSpace on 2015-03-26T13:32:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 358534 bytes, checksum: 24e75168f2f6257c7ffe917ef5ade7c8 (MD5) Previous issue date: 2009-02-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Nowadays research often collect information on many variables from a great number of experimental units, hence produce and store large amount of data, which in turn requires methods that can handle such situations. Statistical methods such as the principal component analysis (PCA), that can reduce the dimensionality of the analysis without significant information loss, are of great interest. PCA can use either the covariance (S) or the correlation (R) matrix among variables, but the analysis may result in different Principal Components (PC) resulting from R or S. In order to indicate the best strategies for different scenarios, we conducted a simulation study to investigate the effects of variable scaling over the viability and quality of the results from PCA analysis used to cluster experimental units. In addition to this first simulation study, we also conducted a second one using animal science and economical variables from 255 dairy producers from three locations of Minas Gerais State. The goal was to verify the most appropriate data structure for cluster analysis, such that it best classifies the most economically viable producers. In both studies we used a transformation of variables based on its coefficient of variation, which resulted in a new covariance matrix named S*. Results showed that the use of matrix S favored economical variables with larger variances, while use of R matrix resulted as the most important variables the ones with larger correlations among them. Calculations of PC using matrix S* minimized these scaling problems when S and R matrices are used. Analysis using S is entirely affected by the variable scale while using R is not affected by the scale at all. We concluded that the S* matrix was the most appropriate for the present case study because it considered the most important economical variables to be the ones most related to the animal science variables. / Com o aumento substancial na quantidade de dados armazenados, surge a necessidade da utilização de métodos que permitam analisar simultaneamente várias variáveis medidas em cada elemento amostral, e ainda com a possibilidade de reduzir a dimensionalidade desse conjunto sem perda significativa de informação. Entre eles, pode-se citar o método dos componentes principais, cuja obtenção pode envolver a matriz de covariâncias (S) ou a de correlações (R) das variáveis de interesse. Como a utilização dessas matrizes pode fornecer diferentes componentes, objetivou-se investigar, por meio da simulação de dados, os efeitos das escalas das características sobre a qualidade e a viabilidade da classificação dos elementos amostrais, buscando assim, indicar estratégias de análise mais adequadas em diferentes casos. Além do estudo de simulação, foi realizado outro com variáveis zootécnicas e econômicas referentes a 255 produtores de leite de três regiões do estado de Minas Gerais, com o objetivo de verificar qual a melhor estrutura de dados em classificar de forma mais apropriada os produtores mais viáveis economicamente. Em ambos os estudos, foi efetuada uma transformação nos valores das variáveis baseada nos respectivos coeficientes de variação, cuja matriz de covariâncias foi denominada de S*. Observou-se que a utilização da matriz S privilegiou as variáveis econômicas de maiores variâncias, enquanto a matriz R considerou as variáveis mais correlacionadas entre si como as mais importantes. A obtenção dos CPs com base na matriz S* minimizou os problemas das escalas inerentes aos usos das matrizes S e R. A primeira, por considerá-la totalmente e, a segunda, por desconsiderá-la. Desta forma, considerou-se a matriz S* como a mais indicada no presente estudo de caso, uma vez que priorizou como mais importantes, as variáveis econômicas mais relacionadas às variáveis zootécnicas.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:55:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2381950 bytes, checksum: 3e57a6a4857e06c924b3a18669ef4389 (MD5) Previous issue date: 2013-08-08 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / This study aimed to compare different scenarios including methods of selection, mating and sexual reasons economic interest characteristics of quails in the long term. Were simulated for each trait (slaughter weight, carcass yield and mortality) different genomes similar to the European quail through the computer program GENESYS. From each genome was originally obtained from a population base of 1200 patients (600 males and 600 females) heterozygotes with no relationship to one another. Subsequently, the initial population was formed by random sampling and mating of 204 males and 204 females obtaining an initial population of 2040 individuals corresponding to an average number of offspring per female 10. Formed after the initial populations began the formation of the selected populations, a total of 24 for each characteristic, corresponding to scenarios formed by two selection methods (SI= Single and BP= BLUP), four sex ratios (D1= 204 males: 204 females; D2= 102 males: 204 females; D3= 68 males: 204 females, and D4= 51 males: 204 females) and three mating systems (RAA= Players randomly mated; EIC= Deleting Brothers Completion; EICMI= Deleting Brothers Full and Half-Brothers) over 20 generations with 10 repetitions. Populations under selection were compared using the parameters: phenotypic value, the average coefficient of inbreeding, fixation of favorable and unfavorable alleles and selection limit. It was observed that the method of selection, the phenotypic values were generally higher for the BLUP, especially in the characteristic slaughter weight. However, individuals undergoing BLUP resulted in higher increase in inbreeding coefficient, the greater percentage of fixation favorable and unfavorable alleles and greater reduction in threshold selection. The increase in sex ratios mainly influenced coefficients of inbreeding within the population. Mating systems that excluded the crossing among relatives (EIC and EICMI) were instrumental in reducing inbreeding, besides providing an increased fixation of favorable alleles and reduction in unfavorable allele fixation and selection limit. / Objetivou-se comparar diferentes cenários incluindo métodos de seleção, tipos de acasalamento e razões sexuais em características de interesse econômico de codornas de corte a longo prazo. Foram simulados para cada característica (peso ao abate, rendimento de carcaça e mortalidade) diferentes genomas similares ao da codorna européia por meio do programa computacional GENESYS. A partir de cada genoma foi obtido inicialmente uma população base de 1200 indivíduos (600 machos e 600 fêmeas) heterozigotos sem nenhum parentesco entre si. Posteriormente, foi formada a população inicial através da amostragem e acasalamento aleatório de 204 machos e 204 fêmeas obtendo uma população inicial de 2040 indivíduos correspondentes a um número médio de 10 descendentes por fêmea. Depois de formadas a populações iniciais, teve início à formação das populações de seleção, num total de 24 para cada característica, correspondendo aos cenários formados por dois métodos de seleção (SI= Individual e BP= BLUP), quatro razões sexuais (D1= 204 machos: 204 fêmeas; D2= 102 machos: 204 fêmeas; D3= 68 machos: 204 fêmeas; e D4= 51 machos: 204 fêmeas) e três sistemas de acasalamento (RAA= Reprodutores Acasalados Aleatoriamente; EIC= Exclusão de Irmãos Completos; EICMI= Exclusão de Irmãos Completos e Meio-Irmãos) ao longo de 20 gerações com 10 repetições. As populações sob seleção foram comparadas através dos parâmetros: valor fenotípico, coeficiente médio de endogamia, fixação de alelos favoráveis e desfavoráveis e limite da seleção. Observou-se que quanto ao método de seleção, os valores fenotípicos médios em geral foram superiores para o BLUP, principalmente na característica peso ao abate. Entretanto, os indivíduos submetidos ao BLUP resultaram em maior incremento do coeficiente de endogamia, maior percentagem de fixação de alelos favoráveis e desfavoráveis e a maior redução no limite de seleção. O aumento das razões sexuais influenciou principalmente os coeficientes de endogamia dentro da população. Os sistemas de acasalamento que excluíram o cruzamento entre aparentados (EIC e EICMI) foram determinantes na redução da endogamia, além de proporcionarem um aumento da fixação de alelos favoráveis e redução na fixação de alelos desfavoráveis e no limite da seleção.

O sistema especialista SISTEMAT tem por objetivo auxiliar pesquisadores da área de produtos naturais no processo de determinação estrutural de substâncias. Para tanto, utilizando dados provenientes de várias técnicas espectrométricas e espectroscópicas, principalmente RMN 13C, inúmeros programas foram desenvolvidos com a finalidade de propor o provável esqueleto de uma substância. Essa informação, juntamente com as substruturas apresentadas a partir de um conjunto de dados, é utilizada por geradores estruturais como grandes restrições, a fim de impedir a explosão combinatória e a geração de propostas estruturais incompatíveis com produtos naturais, além de reduzir o elevado tempo computacional gasto durante uma análise. Esse trabalho descreve o desenvolvimento e utilização dos módulos de reconhecimento de esqueletos, determinação e geração estrutural e simulação de dados de RMN 13C de esteróides. Assim, foi elaborada uma base de dados com 1436 substâncias distribuídas entre 119 tipos de esqueletos provenientes das mais diversas fontes naturais. Vários testes foram realizados e bons percentuais de acerto foram obtidos para o reconhecimento de esqueletos e geração de propostas estruturais através da sobreposição dos tipos de anéis encontrados em esqueletos de esteróides. Para validar as propostas estruturais apresentadas pelo gerador, bem como para prever os dados de deslocamentos químicos de novos esteróides, o simulador de dados de RMN 13C foi usado e, quando comparado a um programa comercial de mesma finalidade, apresentou maior exatidão na previsão dos dados. / The aim of the expert system SISTEMAT is to aid natural product researchers in the process of structural determination of organic substances. For that, using data from various spectrometric and spectroscopic techniques, mainly 13C NMR, countless programs were developed to propose the most probable skeleton of a substance. This information together with the substructures shown from the data set are utilized by structural generators as important constraints in order to avoid the combinatorial explosion problem and the generation of incompatible structural proposals for natural products, besides reducing the computational time spent during the analysis. This work describes the development and use of the modules of skeleton identification, structural determination and generation, and the 13C NMR data prediction of steroids. Thus, was built a database containing 1436 steroids distributed in 119 different skeletons originated from the most varied natural sources. Several tests were performed, wherein good hit percentuals were obtained for the skeleton identification and structural generation through the overlapping of the types of rings found in the steroid skeletons. For validation of the structural proposals shown by the generator as well as for prediction of the chemical shift data of new substances, the simulator of 13C NMR data was used and next compared with a commercial program of the same purpose, and exhibited higher accuracy in the data prediction.

O sistema especialista SISTEMAT tem por objetivo auxiliar pesquisadores da área de produtos naturais no processo de determinação estrutural de substâncias. Para tanto, utilizando dados provenientes de várias técnicas espectrométricas e espectroscópicas, principalmente RMN 13C, inúmeros programas foram desenvolvidos com a finalidade de propor o provável esqueleto de uma substância. Essa informação, juntamente com as substruturas apresentadas a partir de um conjunto de dados, é utilizada por geradores estruturais como grandes restrições, a fim de impedir a explosão combinatória e a geração de propostas estruturais incompatíveis com produtos naturais, além de reduzir o elevado tempo computacional gasto durante uma análise. Esse trabalho descreve o desenvolvimento e utilização dos módulos de reconhecimento de esqueletos, determinação e geração estrutural e simulação de dados de RMN 13C de esteróides. Assim, foi elaborada uma base de dados com 1436 substâncias distribuídas entre 119 tipos de esqueletos provenientes das mais diversas fontes naturais. Vários testes foram realizados e bons percentuais de acerto foram obtidos para o reconhecimento de esqueletos e geração de propostas estruturais através da sobreposição dos tipos de anéis encontrados em esqueletos de esteróides. Para validar as propostas estruturais apresentadas pelo gerador, bem como para prever os dados de deslocamentos químicos de novos esteróides, o simulador de dados de RMN 13C foi usado e, quando comparado a um programa comercial de mesma finalidade, apresentou maior exatidão na previsão dos dados. / The aim of the expert system SISTEMAT is to aid natural product researchers in the process of structural determination of organic substances. For that, using data from various spectrometric and spectroscopic techniques, mainly 13C NMR, countless programs were developed to propose the most probable skeleton of a substance. This information together with the substructures shown from the data set are utilized by structural generators as important constraints in order to avoid the combinatorial explosion problem and the generation of incompatible structural proposals for natural products, besides reducing the computational time spent during the analysis. This work describes the development and use of the modules of skeleton identification, structural determination and generation, and the 13C NMR data prediction of steroids. Thus, was built a database containing 1436 steroids distributed in 119 different skeletons originated from the most varied natural sources. Several tests were performed, wherein good hit percentuals were obtained for the skeleton identification and structural generation through the overlapping of the types of rings found in the steroid skeletons. For validation of the structural proposals shown by the generator as well as for prediction of the chemical shift data of new substances, the simulator of 13C NMR data was used and next compared with a commercial program of the same purpose, and exhibited higher accuracy in the data prediction.