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Identificação dos alvos celulares das proteínas de transdução de sinal PII do diazotrófico de vida livre Azospirillum amazonense

Trentini, Débora Broch January 2010 (has links)
A superfamília PII de proteínas de transdução de sinal é conhecida por conter as proteínas sinalizadoras mais amplamente distribuídas na natureza, sendo ubíquas entre bactérias. Elas desempenham um papel chave na coordenação da regulação de processos metabólicos centrais, especialmente aqueles relacionados ao metabolismo de nitrogênio. As proteínas PII atuam por interação direta com uma variedade de alvos celulares, tais como fatores transcricionais, enzimas e transportadores, resultando na modulação da atividade desses receptores. A sinalização realizada por PII apresenta o potencial de responder a três sinais metabólicos: o sinal de energia ATP, o sinal de carbono 2- oxoglutarato e o sinal de nitrogênio glutamina. Os dois primeiros são transmitidos diretamente pela ligação das moléculas efetoras, enquanto que os níveis de nitrogênio são refletidos pela uridilação reversível de PII pela enzima GlnD, em condições de deficiência de nitrogênio. Em microrganismos diazotróficos, o papel das proteínas PII é estendido para o controle do processo de fixação de nitrogênio. O gênero Azospirillum é composto de diazotróficos de vida livre capazes de se associar de forma benéfica com diversas gramíneas, como por exemplo, cana-de-açúcar e arroz. Com o objetivo de analisar os sistemas regulatórios do metabolismo e da fixação de nitrogênio no modelo de estudo Azospirillum amazonense, foi proposta uma investigação da função das proteínas PII nessas vias. Os alvos celulares dos parálogos de PII presentes em A. amazonense – chamados de GlnB e GlnK – foram investigados utilizando experimentos de pull-down. Dois extratos de A. amazonense foram testados, referindo-se a condições de crescimento em abundância e limitação de nitrogênio. Ao todo, 42 prováveis proteínas de interação das formas não modificadas das duas proteínas PII foram identificadas por espectrometria de massas em tandem, no entanto as interações mapeadas devem ser confirmadas por métodos alternativos. Entre as proteínas isoladas, destaca-se a presença de 10 fatores transcricionais. Esses podem representar pontos de conexão com outros sistemas regulatórios, tais como o sistema de controle do conteúdo celular de exopolissacarídeos e o sistema de controle redox de processos energéticos. Além desses reguladores, nossos resultados incluem 2 proteínas envolvidas no metabolismo de metais, 2 transportadores, 12 enzimas metabólicas, 7 proteínas de funções basais e 9 proteínas de função desconhecida. / The PII superfamily of signal transduction proteins is known to contain the most widely distributed signaling proteins in nature, being ubiquitous among bacteria. They play a major role in coordinating the regulation of central metabolic processes, especially those related to nitrogen metabolism. PII proteins act by direct interaction with a variety of cellular targets, such as transcription factors, enzymes and transporters, resulting in modulation of receptor activities. PII signaling has the potential to respond to three central metabolic signals: the energy signal ATP, the carbon signal 2- oxoglutarate and the nitrogen signal glutamine. The first two are sensed directly by the binding of the effector molecules. The nitrogen levels are reflected by reversible uridylation of the PII by the glutamine-sensor enzyme GlnD, under nitrogen deficiency conditions. Thus, PII proteins serve as the central processing unit for the integration of antagonistic signals of carbon and nitrogen status, and use this information to control nitrogen assimilation. In diazotrophic microorganisms, PII proteins role is extended to the control of the nitrogen fixation process. The genus Azospirillum is composed of free-living diazotrophs capable of beneficial association with a variety of Graminae plants, such as sugarcane and rice. In order to appraise the regulatory systems of nitrogen fixation and metabolism in the model organism Azospirillum amazonense, an investigation of the PII proteins functions in these networks was proposed. The cellular targets of each of the PII paralogues found in A. amazonense – named GlnB and GlnK – were investigated by pull-down assays. Two protein extracts of A. amazonense were tested, referring to growth conditions of nitrogen limitation and sufficiency. Altogether, 42 potential interacting partners of the unmodified form of the two PII proteins were identified by LC-MS/MS, and these interactions are to be further confirmed by alternative methods. It is noteworthy that 10 transcriptional factors were isolated in our experiments. These factors may represent linking points for the cross-talk between nitrogen regulation and other regulatory systems, such as the control of exopolysaccharide biosynthesis and the redox control of energetic processes. Besides these transcriptional regulators, our results comprise 2 proteins related to heavy metals metabolism, 2 transporters, 12 metabolic enzymes, 7 housekeeping function proteins and 9 unknown function proteins.
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Processamento de sinal turbo em sistemas de comunicações ópticas

Reboredo, Hugo Filipe Pereira da Silva January 2009 (has links)
Tese de mestrado integrado. Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Major Automação). Faculdade de Engenharia. Universidade do Porto, Faculdade de Ciências. Universidade do Porto. 2009
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Missing signal restoration by means of an entropy criterion

Silva, Igor Vladimiro Agostinho Proença da January 2009 (has links)
Tese de mestrado. Engenharia Electrotécnica e de Computadores. Faculdade de Engenharia. Universidade do Porto. 2009
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Identificação dos alvos celulares das proteínas de transdução de sinal PII do diazotrófico de vida livre Azospirillum amazonense

Trentini, Débora Broch January 2010 (has links)
A superfamília PII de proteínas de transdução de sinal é conhecida por conter as proteínas sinalizadoras mais amplamente distribuídas na natureza, sendo ubíquas entre bactérias. Elas desempenham um papel chave na coordenação da regulação de processos metabólicos centrais, especialmente aqueles relacionados ao metabolismo de nitrogênio. As proteínas PII atuam por interação direta com uma variedade de alvos celulares, tais como fatores transcricionais, enzimas e transportadores, resultando na modulação da atividade desses receptores. A sinalização realizada por PII apresenta o potencial de responder a três sinais metabólicos: o sinal de energia ATP, o sinal de carbono 2- oxoglutarato e o sinal de nitrogênio glutamina. Os dois primeiros são transmitidos diretamente pela ligação das moléculas efetoras, enquanto que os níveis de nitrogênio são refletidos pela uridilação reversível de PII pela enzima GlnD, em condições de deficiência de nitrogênio. Em microrganismos diazotróficos, o papel das proteínas PII é estendido para o controle do processo de fixação de nitrogênio. O gênero Azospirillum é composto de diazotróficos de vida livre capazes de se associar de forma benéfica com diversas gramíneas, como por exemplo, cana-de-açúcar e arroz. Com o objetivo de analisar os sistemas regulatórios do metabolismo e da fixação de nitrogênio no modelo de estudo Azospirillum amazonense, foi proposta uma investigação da função das proteínas PII nessas vias. Os alvos celulares dos parálogos de PII presentes em A. amazonense – chamados de GlnB e GlnK – foram investigados utilizando experimentos de pull-down. Dois extratos de A. amazonense foram testados, referindo-se a condições de crescimento em abundância e limitação de nitrogênio. Ao todo, 42 prováveis proteínas de interação das formas não modificadas das duas proteínas PII foram identificadas por espectrometria de massas em tandem, no entanto as interações mapeadas devem ser confirmadas por métodos alternativos. Entre as proteínas isoladas, destaca-se a presença de 10 fatores transcricionais. Esses podem representar pontos de conexão com outros sistemas regulatórios, tais como o sistema de controle do conteúdo celular de exopolissacarídeos e o sistema de controle redox de processos energéticos. Além desses reguladores, nossos resultados incluem 2 proteínas envolvidas no metabolismo de metais, 2 transportadores, 12 enzimas metabólicas, 7 proteínas de funções basais e 9 proteínas de função desconhecida. / The PII superfamily of signal transduction proteins is known to contain the most widely distributed signaling proteins in nature, being ubiquitous among bacteria. They play a major role in coordinating the regulation of central metabolic processes, especially those related to nitrogen metabolism. PII proteins act by direct interaction with a variety of cellular targets, such as transcription factors, enzymes and transporters, resulting in modulation of receptor activities. PII signaling has the potential to respond to three central metabolic signals: the energy signal ATP, the carbon signal 2- oxoglutarate and the nitrogen signal glutamine. The first two are sensed directly by the binding of the effector molecules. The nitrogen levels are reflected by reversible uridylation of the PII by the glutamine-sensor enzyme GlnD, under nitrogen deficiency conditions. Thus, PII proteins serve as the central processing unit for the integration of antagonistic signals of carbon and nitrogen status, and use this information to control nitrogen assimilation. In diazotrophic microorganisms, PII proteins role is extended to the control of the nitrogen fixation process. The genus Azospirillum is composed of free-living diazotrophs capable of beneficial association with a variety of Graminae plants, such as sugarcane and rice. In order to appraise the regulatory systems of nitrogen fixation and metabolism in the model organism Azospirillum amazonense, an investigation of the PII proteins functions in these networks was proposed. The cellular targets of each of the PII paralogues found in A. amazonense – named GlnB and GlnK – were investigated by pull-down assays. Two protein extracts of A. amazonense were tested, referring to growth conditions of nitrogen limitation and sufficiency. Altogether, 42 potential interacting partners of the unmodified form of the two PII proteins were identified by LC-MS/MS, and these interactions are to be further confirmed by alternative methods. It is noteworthy that 10 transcriptional factors were isolated in our experiments. These factors may represent linking points for the cross-talk between nitrogen regulation and other regulatory systems, such as the control of exopolysaccharide biosynthesis and the redox control of energetic processes. Besides these transcriptional regulators, our results comprise 2 proteins related to heavy metals metabolism, 2 transporters, 12 metabolic enzymes, 7 housekeeping function proteins and 9 unknown function proteins.
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Identificação dos alvos celulares das proteínas de transdução de sinal PII do diazotrófico de vida livre Azospirillum amazonense

Trentini, Débora Broch January 2010 (has links)
A superfamília PII de proteínas de transdução de sinal é conhecida por conter as proteínas sinalizadoras mais amplamente distribuídas na natureza, sendo ubíquas entre bactérias. Elas desempenham um papel chave na coordenação da regulação de processos metabólicos centrais, especialmente aqueles relacionados ao metabolismo de nitrogênio. As proteínas PII atuam por interação direta com uma variedade de alvos celulares, tais como fatores transcricionais, enzimas e transportadores, resultando na modulação da atividade desses receptores. A sinalização realizada por PII apresenta o potencial de responder a três sinais metabólicos: o sinal de energia ATP, o sinal de carbono 2- oxoglutarato e o sinal de nitrogênio glutamina. Os dois primeiros são transmitidos diretamente pela ligação das moléculas efetoras, enquanto que os níveis de nitrogênio são refletidos pela uridilação reversível de PII pela enzima GlnD, em condições de deficiência de nitrogênio. Em microrganismos diazotróficos, o papel das proteínas PII é estendido para o controle do processo de fixação de nitrogênio. O gênero Azospirillum é composto de diazotróficos de vida livre capazes de se associar de forma benéfica com diversas gramíneas, como por exemplo, cana-de-açúcar e arroz. Com o objetivo de analisar os sistemas regulatórios do metabolismo e da fixação de nitrogênio no modelo de estudo Azospirillum amazonense, foi proposta uma investigação da função das proteínas PII nessas vias. Os alvos celulares dos parálogos de PII presentes em A. amazonense – chamados de GlnB e GlnK – foram investigados utilizando experimentos de pull-down. Dois extratos de A. amazonense foram testados, referindo-se a condições de crescimento em abundância e limitação de nitrogênio. Ao todo, 42 prováveis proteínas de interação das formas não modificadas das duas proteínas PII foram identificadas por espectrometria de massas em tandem, no entanto as interações mapeadas devem ser confirmadas por métodos alternativos. Entre as proteínas isoladas, destaca-se a presença de 10 fatores transcricionais. Esses podem representar pontos de conexão com outros sistemas regulatórios, tais como o sistema de controle do conteúdo celular de exopolissacarídeos e o sistema de controle redox de processos energéticos. Além desses reguladores, nossos resultados incluem 2 proteínas envolvidas no metabolismo de metais, 2 transportadores, 12 enzimas metabólicas, 7 proteínas de funções basais e 9 proteínas de função desconhecida. / The PII superfamily of signal transduction proteins is known to contain the most widely distributed signaling proteins in nature, being ubiquitous among bacteria. They play a major role in coordinating the regulation of central metabolic processes, especially those related to nitrogen metabolism. PII proteins act by direct interaction with a variety of cellular targets, such as transcription factors, enzymes and transporters, resulting in modulation of receptor activities. PII signaling has the potential to respond to three central metabolic signals: the energy signal ATP, the carbon signal 2- oxoglutarate and the nitrogen signal glutamine. The first two are sensed directly by the binding of the effector molecules. The nitrogen levels are reflected by reversible uridylation of the PII by the glutamine-sensor enzyme GlnD, under nitrogen deficiency conditions. Thus, PII proteins serve as the central processing unit for the integration of antagonistic signals of carbon and nitrogen status, and use this information to control nitrogen assimilation. In diazotrophic microorganisms, PII proteins role is extended to the control of the nitrogen fixation process. The genus Azospirillum is composed of free-living diazotrophs capable of beneficial association with a variety of Graminae plants, such as sugarcane and rice. In order to appraise the regulatory systems of nitrogen fixation and metabolism in the model organism Azospirillum amazonense, an investigation of the PII proteins functions in these networks was proposed. The cellular targets of each of the PII paralogues found in A. amazonense – named GlnB and GlnK – were investigated by pull-down assays. Two protein extracts of A. amazonense were tested, referring to growth conditions of nitrogen limitation and sufficiency. Altogether, 42 potential interacting partners of the unmodified form of the two PII proteins were identified by LC-MS/MS, and these interactions are to be further confirmed by alternative methods. It is noteworthy that 10 transcriptional factors were isolated in our experiments. These factors may represent linking points for the cross-talk between nitrogen regulation and other regulatory systems, such as the control of exopolysaccharide biosynthesis and the redox control of energetic processes. Besides these transcriptional regulators, our results comprise 2 proteins related to heavy metals metabolism, 2 transporters, 12 metabolic enzymes, 7 housekeeping function proteins and 9 unknown function proteins.
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Estimação de sinais multifrequencias por filtragem adaptativa

Brandão, Andre Louzada 27 June 1990 (has links)
Orientador : João Marcos Travassos Romano / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Eletrica / Made available in DSpace on 2018-07-13T21:51:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Brandao_AndreLouzada_M.pdf: 4994617 bytes, checksum: 4276ba85bed905bd59c382437303d05b (MD5) Previous issue date: 1990 / Resumo: Os filtros seletivos adaptativos têm sido consagrados como ferramentas eficientes na tarefa de detecção e estimação de sinais senoidais. Neste tipo de filtro concentra-se nosso trabalho. Inicialmente no capítulo 1 abordamos os aspectos ligados à problemática de estimação dos sinais multifrequenciais utilizados na sinalização telefônica. No capítulo 2, a predição linear é apresentada, bem como os algoritmos do Gradiente e Mínimos Quadrados utilizados nos filtros adaptativos. Com base no estudo da predição linear, os filtros seletivos são introduzidos no capítulo S como sendo um sistema formado pela união de um filtro passa-banda em cascata com um filtro de erro de predição. A partir daí, propomos um método de adaptação desse filtro seletivo baseado no comportamento dinâmico dos coeficientes complexos do filtro preditor. Verificamos a velocidade do método no processo de estimação de frequências e sua facilidade para a determinação da potência do sinal de entrada. Aplicamos os resultados teóricos para a solução dos problemas de filtragem da sinalização telefônica MFC e DTMF. Por fim, mostramos uma implementação prática do filtro seletivo adaptativo através da utilização de um microprocessador dedicado ao processamento digital de sinais (TMSS2010), trabalhando em tempo real na tarefa de detecção de sinais multifrequenciais / Abstract: A daptive notch filtering has bccn introduccd as an efficient technique for the retrieval of sinusoids ín noíse. In this work we study a partícular notch filter that can solve the problems of detection and estimation of multifrequency signals used in telephone signalling codes, that are presented in chapter 1. In chapter 2, the prediciion error filtcrs are presented based on linear prediction and there are viewed the algoritms of adaptation of Gradient and Least Squares for adaptive filters. The adaptíve notch filters are presented in chapter :; and we propose a method of adaptation dealíng with complex coefficients instead of re.al ones. The method provides a simple and fast estimation of frequency and powcr of the input sinusoids. We apply the method to MFC/DTMF digital tclephone signaling, obtaining useful results for real time practical applications with a DSP - microproccssor (TMS320JO) / Mestrado / Mestre em Engenharia Elétrica
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Localização do locutor em ambiente de videoconferência utilizando sinal de áudio e vídeo

Blauth, Dante Augusto 25 March 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-05T14:01:49Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 25 / Hewlett-Packard Brasil Ltda / A localização do locutor ativo em ambientes de videoconferência traz benefícios importantes, como transmitir apenas o sinal relativo a este locutor, reduzindo a quantidade de informações trafegadas na rede, eliminar ruídos indesejados e ainda possibilitar focar a câmera no locutor. Embora essa tarefa não seja inovadora, ainda está sendo aperfeiçoada, visto que ambientes reais de videoconferência possuem ruído, problemas de iluminação, etc., o que torna o objetivo mais difícil de ser alcançado de maneira satisfatória. O presente trabalho apresenta uma metodologia para localização do locutor ativo em videoconferência, utilizando o sinal de áudio capturado por um arranjo de microfones e o sinal de vídeo capturado por uma web-câmera. No tratamento do sinal de vídeo, utiliza-se um algoritmo para detecção de faces, que é modificado para para diminuir seu custo computacional. O sinal de áudio é processado no domínio de frequência, utilizando-se o algoritmo SRP-PHAT para localizar a fonte sonora. A fusão dos dois
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Singing voice detection in polyphonic music signals

Allegro, Pedro Luís Cameira Sollari January 2008 (has links)
Estágio realizado no INESC e orientado pelo Prof. Fabien Gouyon / Tese de mestrado integrado. Engenharia Electrotécnica e de Computadores (Ramo Telecomunicações). Faculdade de Engenharia. Universidade do Porto. 2008
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Muscle-Computer Interface Based On Pattern Recognition Of Myoeletric Signals For Control Of Dexterous Hand And Finger Movements Of Protheses For Forearm Amputees

MAYOR, J. J. V. 03 March 2017 (has links)
Made available in DSpace on 2018-08-02T00:01:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_10772_John Jairo Villarejo Mayor.pdf: 4399060 bytes, checksum: 4eea756bc334565688034eaccb7041f6 (MD5) Previous issue date: 2017-03-03 / O controle intuitivo de uma prótese é um dos desafios mais importantes para reduzir o esforço do usuário em aprender a usar uma mão artificial. Este trabalho apresenta a análise de técnicas de reconhecimento de padrões para sinais mioelétricos de baixo nível para classificar movimentos de destreza dos dedos e da mão em sujeitos com amputação do antebraço. Dez indivíduos com amputação e dez indivíduos sem amputação foram analisados e o desempenho das técnicas propostas no presente estudo foi comparado levando em consideração ambos os grupos. A classificação foi realizada para a flexão de cada um dos dedos, movimentos da mão e diferentes tipos de preensão palmar utilizando quatro eletrodos e considerando a baixa contração muscular durante estes movimentos. Dezessete características dos sinais mioelétricos baseadas na magnitude do sinal e em análise de fractais foram comparadas para os dois grupos de sujeitos (com e sem amputação) com nível de significância de 95%. Os resultados, usando um conjunto de características mostraram uma exatidão máxima das médias de 92,7% de reconhecimento de padrão do movimento para o grupo de indivíduos amputados utilizando máquinas de vetores de suporte (SVM). A segunda melhor exatidão foi obtida utilizando o método de k vizinhos mais próximos (KNN). A melhor combinação das técnicas analisadas mostrou-se adequada para realizar o controle da próstese com precisão e destreza dos dedos e da mão, proporcionando maior funcionalidade e melhor aceitação para os sujeitos com amputação.
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Uma abordagem unificada para algoritmos de equalização autodidata

Neves, Aline de Oliveira 31 July 2018 (has links)
Orientadores : João Marcos Travassos Romano, Maria D. Miranda / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Eletrica e de Computação / Made available in DSpace on 2018-07-31T15:18:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Neves_AlinedeOliveira_M.pdf: 10627035 bytes, checksum: 08ca007829ee69f5498c31fa9fd4649d (MD5) Previous issue date: 2001 / Mestrado

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