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Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-07-28T13:08:05Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese_EDUARDA_versãoFinalDigital.pdf: 2657877 bytes, checksum: 2ce4a0aa738737b2947e45ed5fb9e912 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-28T13:08:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese_EDUARDA_versãoFinalDigital.pdf: 2657877 bytes, checksum: 2ce4a0aa738737b2947e45ed5fb9e912 (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / FACEPE / Devido à crescente resistência de isolados clínicos de Staphylococcus spp. a antimicrobianos e a consequente diminuição de opções terapêuticas eficazes, este estudo investigou a influência in vitro de sub-Concentrações Inibitórias Mínimas (sub-CIM) de oxacilina e tigeciclina, isoladamente e em combinação, no crescimento bacteriano e na expressão dos genes mecA, ica e tst em isolados clínicos de Staphylococcus spp.Para realização da primeira etapa deste estudo 45 isolados,identificados quanto a espécie de Staphylococcus spp. e susceptibilidade pelo Vitek2, foram obtidos de dois hospitais públicos de Recife-PE e avaliados pelas técnicas de MALDI-TOF MS e sequenciamento do rDNA 16S para confirmação das espécies bacterianas. A relação clonal dos isolados de Staphylococcus spp. foi determinada pela análise da Região Intergênica 16S-23S para posterior determinação do tipo de SCCmec e do perfil de virulência. O MALDI-TOF MS e sequenciamento do 16S se mostraram mais concordantes na identificação das espécies bacterianas quando comparadas ao Vitek2, sendo identificados isolados de Staphylococcus aureus, S. epidermidis, S.hominis, S. haemolyticus e S. saprophyticus. Trinta e um ribotipos foram determinados, demonstrando grande variabilidade genética. Os ribotipos foram encontrados dispersos nos diferentes setores dos dois hospitais investigados. A maioria dos isolados apresentaram SCCmec tipo IV (51%), seguido pelo tipo III (26%), tipo II (16%) e tipo V (7%). Foi possível encontrar nove perfis de virulência, onde o gene luk foi observado em 80% dos isolados, seguido de 51% para o gene ica, 35,5% para o hlg e 33,3% para o tstratificando a crescente evidência da presença de isolados tradicionalmente comunitários no ambiente hospitalar. Na segunda fase do estudo quatro isolados clínicos com diferentes tipos de SCCmece baixa relação clonal foram analisados in vitro para a determinação da CIM frente a oxacilina e tigeciclina. A influência in vitro destes antimicrobianos no crescimento bacteriano foi avaliada isoladamente e em associação, assim como a expressão dos genes mecA, ica e tst por RT-qPCR. O ensaioin vitro dos diferentes isolados de Staphylococcus spp. frente a tigeciclina associada à oxacilina resultou em inibição de crescimento bacteriano maior em relação a utilização isolada dos antimicrobianos, além de não influenciar ou diminuir a expressão de todos os genes analisados, dando suporte à ideia de que o uso associado da tigeciclina e oxacilina no tratamento de infecções por isolados MRS portadores dos genes tst e ica possivelmente poderiam promover benefícios na modulação destes genes. / Due to the increasing resistance of clinical isolates of Staphylococcus spp. to antimicrobial and the consequent decrease of effective therapeutic options, this study determined the in vitro influence of sub-minimum inhibitory concentrations (sub-MIC) of oxacillin and tigecycline, alone and in combination, on bacterial growth and expression ofvirulence genes in clinical isolates of Staphylococcus spp. To perform the first stage of this study 45 isolates of Staphylococcus sppwere obtained from two public hospitals of Recife-PE and evaluated by MALDI-TOF MS techniques and 16S sequencing for confirmation of bacterial species. The clonal profile Staphylococcus spp. isolates was determined by PCR-Ribotyping for subsequent determination of the type of SCCmec and virulence profile. The MALDI-TOF MS and sequencing of 16S were more effective in the identification of bacterial species when compared to Vitek2, being identified Staphylococcus aureus, S. epidermidis, S.hominis, S. haemolyticus e S. saprophyticus.Thirty-one ribotypes could be determined among the strains tested, with most harboring the SCCmec type IV (51%), followed by type III (26%), type II (16%) and type V (7%).%). 80% of the isolates presented the luk gene, 51% icaAD, 35.5% hlg and 33.3% tst. These results demonstrate a wide variability and dispersion of the isolates analysed, in different sectors of the hospitals confirming the growing evidence of the presence of traditionally community isolates in the hospital environment. In the second phase of the study, four clinical isolates were selected according to different types of SCCmec were analyzed in vitro to determine the MIC front oxacillin and tigecycline. The antimicrobial effect in vitro tests on bacterial growth was evaluated separately and in combination, as well as the expression of the mecA, ica and tst genes by RT-qPCR. Subjecting the different Staphylococcus spp. isolates in vitro to tigecycline in association with oxacillin resulted in inhibition of bacterial growth that was more potent than subjecting them to the antimicrobials separately, and this also did not influence or decrease the expression of any of the genes analyzed. The present study supports the idea that the associated use of tigecycline and oxacillin for treating infections caused by methicillin-resistant Staphylococcus that is positive for tst and ica could promote possible benefits in modulating these genes.

Orientador: Francisco Carlos Groppo / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-17T06:56:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Venancio_PauloCesar_D.pdf: 2224569 bytes, checksum: 664ae2a7eae028761da8674cbbd97e5f (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Este estudo teve por objetivo avaliar a atividade antimicrobiana de soluções de alho ( Allium tuberosum e Allium sativum) sobre a infecção estafilocócica em ratos e observar suas respectivas composições químicas. A atividade antimicrobiana in vitro das soluções foi analisada pelos testes de concentração inibitória mínima (CIM) e concentração bactericida mínima (CBM), contra a mesma cepa utilizada in vivo, e a análise da composição química dos extratos foi feita por cromatografia gasosa. Esponjas de policlorovinil (PVC) foram implantadas no dorso de 95 ratos. Após 14 dias, os granulomas formados foram infectados com Staphylococcus aureus ATCC 25923. Após 24h da infecção, os animais foram divididos aleatoriamente nos seguintes grupos: Grupo 1 - Controle A (soro fisiológico); Grupo 2 - A. sativum 100mg/kg; Grupo 3 - A. sativum 400mg/kg; Grupo 4 - A. tuberosum 100mg/kg; Grupo 5 - A. tuberosum 400mg/kg; e Grupo 6 - Amoxicilina 50mg/kg. Os animais receberam os tratamentos por via oral a cada 6 horas. Cada grupo foi dividido em três subgrupos de cinco animais cada, os quais foram mortos após 6, 12 e 24 horas, respectivamente. No Grupo 1, também foi utilizado um grupo que foi morto no tempo "zero", isto é, logo após a primeira administração do soro fisiológico. Os granulomas retirados foram acondicionados em tubos de ensaio, recebendo agitação em vórtex e a suspensão resultante foi cultivada em meio de cultura agar sal e manitol (SMA). Após 18 horas, os microrganismos foram contados manualmente. Os resultados foram comparados através do teste de Kruskal-Wallis, com nível de significância de 5%. A análise cromatográfica mostrou que a composição química foi diferente nos dois extratos, e apresentou compostosorgânicos e organossulfurados, provavelmente resultantes da degradação da alicina. Os testes de sensibilidade CIM e CBM revelaram que a solução de A. tuberosum não mostrou capacidade de inibir ou matar a cepa de S. aureus em nenhuma das concentrações utilizadas. Entretanto, o A. sativum mostrou CIM de 2mg/mL e CBM de 4mg/mL. De uma maneira geral, o peso dos granulomas no ix grupo controle foi menor (Kruskal-Wallis, p<0,05) do que nos demais grupos, considerando-se cada tempo separadamente, sendo que nos tempos 12h e 24h, o A. tuberosum mostrou maior peso do que os demais grupos. Foi possível observar que houve diminuição da concentração de UFC/mL após 24 horas para todos os grupos. Nos grupos amoxicilina e A. sativum 400mg/kg, esta redução ocorreu a partir de 12 horas. De uma maneira geral, todos os tratamentos causaram redução significativa quando comparados ao grupo controle em todos os períodos de tempo. Além disso, não houve diferenças estatisticamente significantes entre a quantidade de bactérias recuperadas do grupo amoxicilina e os demais tratamentos no período de 24 horas. Concluímos que os extratos foram capazes de inibir a infecção estafilocócica nos animais de maneira similar à amoxicilina / Abstract: The aim of this study was to observe the chemical composition and to evaluate the antimicrobial activity of garlic ( Allium tuberosum and Allium sativum) extracts against staphylococcal infection induced in rats. The in vitro antimicrobial activity was obtained by the minimum inhibitory (MIC) and bactericidal (MBC) concentrations against the same strain used in the in vivo assay. The chemical composition of the extracts was measured by gas chromatography. Polyclorovinyl (PVC) sponges were implanted on the backs of 95 rats. After 14 days, the resulting granulomas were infected with Staphylococcus aureus ATCC 25923. After 24 hours of infection, the animals were divided randomly into four groups: Group 1 - The Control (saline), Group 2 - A. sativum 100mg/kg/p.o., Group 3 - A. sativum 400mg/kg/p.o., Group 4 - A. tuberosum 100mg/kg/p.o., Group 5 - A. tuberosum 400mg/kg/p.o. and Group 6 - Amoxicillin 50mg/kg/p.o. The animals were treated every 6 hours. Each group was divided into three subgroups of five animals, which were killed after 6, 12 and 24 hours respectively. Five animals of the Group 1 were also killed at zero time, i.e., after the first administration of saline. Granulomas were removed and placed in test tubes, vortexed and the resulting suspension was spread on mannitol salt agar (SMA). After 18 hours, the microorganisms were counted manually. The results were compared by using Kruskal-Wallis test with a significance level of 5%. Chromatographic analysis showed that the two garlic species showed different chemical composition, but both presented organosulfur compounds, probably resulting from the allicin degradation. MIC and MBC of A. tuberosum showed no ability to inhibit or kill the S. aureus strain in any of the concentrations used. However, A. sativum showed MIC = 2mg/mL and MBC = 4mg/mL. The weight of the granulomas in the control group was lower (Kruskal- Wallis, p <0.05) than the other groups, considering each time separately. At times 12h and 24h, A. tuberosum showed bigger granulomatous-tissue weight than the other groups. It was observed that there was a decrease in the concentration of xi CFU/mL after 24 hours for all groups. Amoxicillin and 400mg/kg A. sativum reduced the S. aureus concentration after 12 hours. In general, all treatments caused significant reduction compared to the control group at all time periods. Furthermore, no statistically significant differences were observed regarding the number of bacteria recovered from the amoxicillin group in comparison to the other treatments at the 24 hours period. We conclude that the extracts were able to inhibit staphylococcal infection similarly to amoxicillin / Doutorado / Farmacologia, Anestesiologia e Terapeutica / Doutor em Odontologia

Orientadores: Karina Cogo Müller, Francisco Carlos Groppo / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-25T11:18:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Graziano_TalitaSignoreti_M.pdf: 1603562 bytes, checksum: 9522f75e1f8c1147c84c0fde100549ed (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: As estatinas são um grupo de fármacos que atuam como inibidores competitivos da enzima 3-Hidroxi-3-MetilGlutaril Coenzima-A Redutase (HMG-CoA redutase). Além de atuarem como importantes agentes hipolipemiantes, também apresentam outros efeitos, chamados de pleiotrópicos. Diversos estudos têm explorado um possível efeito protetor das estatinas atuando na redução na morbidade e mortalidade de várias doenças infecciosas. A atividade antimicrobiana das estatinas tem sido reportada por estudos in vivo e in vitro. O objetivo desse estudo foi avaliar os efeitos das estatinas sobre o crescimento e viabilidade de bactérias aeróbias patogênicas, e o efeito da sinvastatina sobre o biofilme de Staphylococcus aureus. Culturas das espécies de Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli e Enterococcus faecalis foram avaliadas na forma planctônica quanto à sensibilidade à atorvastatina, pravastatina e sinvastatina, através do teste de Concentração Inibitória Mínima (CIM). Além disso, diante da atividade apresentada pela sinvastatina contra S. aureus, foi determinada a ação dessa droga sobre a viabilidade celular através dos testes de Time-kill e Efeito pós-antibiótico (EPA). Também foi verificado um possível efeito sinérgico entre a sinvastatina e vancomicina. Por fim, a ação da sinvastatina foi avaliada contra biofilmes de S. aureus. Os valores de CIM da sinvastatina para o microrganismo S. aureus foram: 15,65 µg/ml (ATCC 29213) e 31,25 µg/ml (ATCC 33591, 43300, 14458 e 6538). A sinvastatina apresentou um perfil bacteriostático, e na concentração de 4xCIM seu EPA foi similar ao da vancomicina. Não foi encontrado nenhum tipo de interação entre a associação de sinvastatina e vancomicina. Entretanto, a sinvastatina foi capaz de reduzir a formação do biofilme nas concentrações entre 1/8CIM à 4xCIM. Além disso, na concentração 4xMIC foi capaz de diminuir a viabilidade, biomassa e a produção de polissacarídeos extracelulares e aumentar a produção de polissacarídeos intracelulares de biofilmes maduros de S. aureus. A produção de proteínas pelo biofilme não foi alterada. Em conclusão, os resultados encontrados mostram que a sinvastatina possui um grande potencial a ser explorado, principalmente em relação ao descobrimento de novos antimicrobianos / Abstract: Statins are drugs that competitively inhibit the enzyme 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase (HMG-CoA). Besides their important lipid-lowering action, they also are pleiotropic agents. Several studies have explored a possible protective effect of statins to reduce the morbidity and mortality of various infectious diseases. The antimicrobial activity of statins has been reported by in vivo and in vitro studies. The aim of this study was to evaluate the effects of statins on the growth, viability and biofilm formation of pathogenic aerobic bacteria. The Minimum Inhibitory Concentrations (MIC) of atorvastatin, pravastatin and simvastatin against planktonic cells of Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli and Enterococcus faecalis strains were obtained. Since simvastatin showed activity against S. aureus, its effects on cell viability were evaluated in a time-kill and post-antibiotic effect (PAE) assays. A possible synergistic effect between simvastatin and vancomycin was also assessed. In addition, the effect of simvastatin against biofilms of S. aureus was tested. The MIC values of simvastatin for S. aureus were: 15.65 µg/ml (ATCC 29213) and 31.25 µg/ml (ATCC 33591, 43300, 14458 and 6538). Simvastatin showed a bacteriostatic profile, and in a 4x>MIC concentration the PAE was similar to vancomycin. No synergistic effect was found between simvastatin and vancomycin. Simvastatin was able to reduce the formation of biofilms in concentrations ranging from 1/8MIC to 4xMIC. In addition, the 4xMIC was able to decrease the viability, biomass and production of extracellular polysaccharides and increase the production of intracellular polysaccharides on mature biofilm of S. aureus. The protein production on biofilm was not altered in the presence of simvastatin . In conclusion, our results showed that simvastatin has a great potential to be explored, especially in relation to the development new antimicrobial agents / Mestrado / Farmacologia, Anestesiologia e Terapeutica / Mestra em Odontologia

Orientadores: Marcelo Brocchi, Bruna de Araújo Lima / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-27T10:37:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cauz_AnaCarolinaGuimaraes_M.pdf: 1573090 bytes, checksum: 8314a114e9f012cb6d3d58c18c5877f1 (MD5) Previous issue date: 2015 / Resumo: Isolados de Staphylococcus aureus correspondem a importantes patógenos para humanos e outros mamíferos, frequentemente associados a doenças em tecidos moles, tanto em infecções localizadas quanto sistêmicas. Tais infecções por S. aureus são geralmente de difícil tratamento devido à ocorrência de resistência antimicrobiana. Atualmente, linhagens de S. aureus resistentes à meticilina (MRSA) são isoladas em infecções e uma das últimas drogas de escolha para tratar essas doenças é a vancomicina, um anitbiótico glicopeptídeo. Entretanto, o isolamento de S. aureus com hetero-resistência e resistência intermediária à vancomicina (VISA e HVISA) tem sido descrito em diversos países. Dessa forma, a descoberta e caracterização de novas drogas para tratar infecções por S. aureus é uma necessidade urgente. Neste trabalho, há a descrição da atividade antimicrobiana da violaceína, uma molécula isolada de algumas espécies de bactérias ambientais, para linhagens VISA e hetero-VISA (HVISA) que se apresentaram resistentes a 24 antibióticos diferentes, o que indica um fenótipo de multirresistência (MRD). Os dados indicam uma atividade antimicrobiana expressiva da violaceína, sendo este efeito também observado através da realização de ensaios de efeito pós-antibiótico e curvas de tempo-morte. O efeito antimicrobiano da violaceína para linhagens de S. aureus resistentes a 24 antibióticos pertencentes a diferentes classes indicam um mecanismo distinto de ação da violaceína. Estes resultados sugerem a violaceína como uma droga em potencial para tratar infecções por S. aureus MRD, incluindo linhagens VISA e HVISA / Abstract: Staphylococcus aureus is an important pathogen to human and other mammals frequently associated with soft tissues, causing local and systemic infections. S. aureus infections are generally difficult to treat due to antimicrobial resistance. Nowadays, methicilin-resistant S. aureus (MRSA) strains are commonly isolated from infections and one of the last options to treat these diseases is vancomycin, a glycopeptide antibiotic. However, the isolation of vancomycin-intermediate or vancomycin-resistant S. aureus (VISA and VRSA strains) has been reported in different countries. Therefore, identification of new drugs to treat S. aureus infections is an urgent need. In this work, we described the antimicrobial activity of violacein, a molecule isolated from some groups of environmental bacteria, to VISA and hetero-VISA (HVISA) strains that are resistant to 24 different antimicrobials which indicates a multi-drug resistance (MDR) phenotype. Results reported here show a significant antibacterial activity of violacein. This effect was also observed in post antibiotic assays and in time-kill curves. The antibacterial effect of violacein to S. aureus strains resistant to a panel of 24 antimicrobial agents of different classes suggests a diverse antibacterial mechanism for violacein. These results suggest violacein as a potential drug to treat MDR S. aureus infections including VISA and HVISA strains / Mestrado / Microbiologia / Mestra em Genética e Biologia Molecular

Staphylococcus schleiferi, Staphylococcus lugdunensis, and Staphylococcus epidermidis produce a high incidence of abscesses in a mouse model with an implanted foreign body. We investigated the significance of the foreign body in this process. Fourteen strains of S. schleiferi, S. epidermidis, and S. lugdunensis were tested in our model. A preadhered foreign body was implanted into one mouse group, followed by injection of a test strain. Another group received injection without implant. Abscesses were assessed at 7 days; foreign bodies and infected tissues were cultured. The percent of samples that developed abscesses or were culture positive was compared for each strain. Nearly all mice infected with S. schleiferi developed abscesses and were culture positive. The foreign body made no difference in abscess formation for three of four S. schleiferi but increased the incidence of both organism recovery and abscess for three of five S. epidermidis. The foreign body enhanced abscess formation for four of five S. lugdunensis, with all five strains yielding significantly more culture recovery. Although the pathogenicity of nine strains was increased by the foreign body, five strains yielded high abscess and culture recovery rates that were not enhanced by its presence.

Staphylococcus lugdunensis and Staphylococcus schleiferi, two newly described species, have been isolated from numerous types of human infections. We compared the pathogenicity of 30 strains of S. lugdunensis, S. schleiferi, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus warneri, and Staphylococcus hominis, using a mouse model in which a foreign body preadhered with the test strain was implanted subcutaneously, followed by injection of the test strain. All five species of staphylococci produced abscesses. Staphylococcus epidermidis, S. schleiferi, and S. lugdunensis yielded species means of 76-91% abscess formation; 80-100% of the infected foreign bodies and tissues were culture positive. These three species were more virulent than S. warneri or S. hominis, which produced abscesses in 54 and 65% of mice, respectively; only 10-48% of the infected samples were culture positive. Transmission electron microscopy of pure cultures of selected strains showed that all species possessed glycocalyx. All species produced a variety of possible virulence factors, such as α and δ hemolysins, as well as the aggressins lipase and esterase. The production of exoenzymes did not always correlate with virulence as demonstrated by abscess formation in mice.

Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase from 𝘚𝘵𝘢𝘱𝘩𝘺𝘭𝘰𝘤𝘰𝘤𝘤𝘶𝘴 𝘢𝘶𝘳𝘦𝘶𝘴 complexed with CTP (TarDₛₐ-CTP) was crystallized by the hanging drop-vapor diffusion method at 22°C. Determination of crystallization condition included examination of the amount of precipitant, investigation of the effects of small molecules, and alteration of the rate of diffusion. With these three optimization steps, crystals suitable for x-ray diffraction study were produced. During data processing, TarDₛₐ-CTP was determined to belong to the space group P3₁21, with unit-cell dimensions a=b=92.2 and c=156.1Å. The crystal structure of TarDₛₐ-CTP was solved to 3.0Å by molecular replacement, using TagD from 𝘉𝘢𝘤𝘪𝘭𝘭𝘶𝘴 𝘴𝘶𝘣𝘵𝘪𝘭𝘪𝘴 as a search model. Unlike the search model, TarDₛₐ appears as a tetramer in the asymmetric unit. This result also confirms the gel-filtration and ultracentrifugation studies that were done previously. Although TarDₛₐ crystals were grown in the presence of CTP, the crystal structure does not reveal convincing data for the location and position of this co-factor. However, the data suggests a possible location for CTP in one of the four subunits in an orientation that differs from that of TagD_Bₛ. Unfortunately, the resolution of this data set at 3.0Å is not high enough to corroborate this finding. / Thesis / Master of Science (MS)

LD2668 .T4 1942 B32 / Master of Science

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