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Estudo computacional da enzima gGAPDH do Trypanosoma cruzi / Computational study of the gGAPDH enzyme from Trypanosoma cruzi

Oliveira, Osmair Vital de 05 June 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T20:34:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2694.pdf: 3100677 bytes, checksum: e539b70bd59d8ae168c5b5d00b544881 (MD5) Previous issue date: 2009-06-05 / Universidade Federal de Sao Carlos / Theoretical methods in computational chemistry were used to study the gGAPDH enzyme from Trypanosoma cruzi. This protozoan is responsible by the Chagas diseases. Molecular dynamics simulations were performed to obtain the time evolution of the gGAPDH enzyme in the holo (with the cofactor NAD+) and apo (without the cofactor) forms in aqueous solution. The calculations were performed in the NpT ensemble with T = 300K e p = 1bar. In these simulations little conformational changes were observed in both holo and apo forms of the enzyme along 20.0 ns simulation time. Docking calculations were carried out to fit some drugs in enzyme active site using the ensemble docking methodology. Therefore, multiple enzyme conformations of both holo and apo forms were obtained at time intervals of 2.0 ns along the molecular dynamics simulation. This procedure was used to take in into account the flexibility of the enzyme. The results from these calculations indicate that the best way to develop a drug molecule is to consider both enzyme forms (holo and apo forms). In this way, one drug will inhibit the apo form and other, the holo form. To characterize the enzymatic mechanism, the glyceraldehyde 3-phosphate (G3P) was placed in the active site (via docking calculations) of the holo form conformation obtained in the end of the 20.0 ns trajectory. A 1.0 ns molecular dynamic simulation was performed in the (gGAPDH-NAD+-G3P) system. Quantum chemical calculations were performed to study reactive process in the enzyme catalytic site. A convenient model was built using about 698 atoms carefully chosen to represent the active site and its surroundings. The calculations were performed using a combination of MOZYME and the usual SCF procedure implemented in the MOPAC2009 program. The calculations were performed at the PM6 level. One of the reaction mechanisms proposed in the literature was characterized xix calculating the energy profile along the reaction path to transfer a proton from Cys166 to His194. Using a second structure obtained from molecular dynamics, a new mechanism for the gGAPDH enzyme was proposed and characterized by a similar MOPAC2009 calculation. In this mechanism, the hydroxyl group of the G3P acts as a bridge to transfer the proton from the Cys166 to His194 residue. / Métodos de química computacional foram utilizados para estudar a enzima gGAPDH do Trypanosoma cruzi, protozoário responsável pela doença de Chagas. Simulações por dinâmica molecular foram realizados para obter a evolução temporal da enzima gGAPDH na forma holo (com o cofator NAD+) e apo (sem o cofator) em solução. Os cálculos foram efetuados no ensemble NpT a T = 300K e p = 1bar. Nessas simulações ficaram evidenciadas pequenas mudanças conformacionais entre as formas holo e apo no tempo de simulação de 20,0 ns. Para posicionar ou encaixar algumas moléculas candidatas a fármacos no sítio ativo da enzima, cálculos de docking foram realizados utilizando a metodologia de ensemble docking, utilizando múltiplas conformações obtidas a cada intervalo de 2,0 ns de simulação da enzima na forma holo e apo. Essa metodologia foi adotada para levar em consideração a flexibilidade da enzima. Os resultados desses cálculos mostraram que a melhor estratégia para elaborar compostos candidatos a fármacos é considerar as duas formas da enzima (holo e apo). Com esta estratégia, um composto inibiria a forma apo e outro, a forma holo. Para caracterizar o mecanismo enzimático, o gliceraldeído 3-fosfato (G3P) foi colocado no sítio ativo (via cálculos de docking) da enzima gGAPDH na forma holo, a qual foi obtida a 20,0 ns de simulação. Nesse sistema (gGAPDHNAD+- G3P), foi realizado 1,0 ns de simulação por dinâmica molecular para a relaxação e equilibração do sistema. Ao longo dessa simulação, duas estruturas foram escolhidas para a realização de cálculos de química quântica relacionados com a atividade enzimática. Em uma dessas estruturas, um dos mecanismos propostos na literatura foi caracterizado a partir da coordenada de reação de transferência do próton da Cys166 para a His194. Estes cálculos foram efetuados utilizando um procedimento que combina a utilização da metodologia xvii MOZYME com o cálculo SCF usual implementado no programa MOPAC2009. Nestes cálculos, a parametrização PM6 foi utilizada. A partir de uma segunda estrutura obtida da dinâmica molecular, um novo mecanismo para a enzima gGAPDH foi proposto e caracterizado via cálculos quânticos. Nesse mecanismo, o grupo hidroxila da G3P age como uma ponte para a transferência do próton da Cys166 para a His194.
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Integração de métodos in silico e in vitro para o planejamento de inibidores da enzima cruzaína

Wiggers, Helton José 30 June 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T20:34:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3825.pdf: 11572588 bytes, checksum: 5139f6f8274e9d9b46982514e6a5c21e (MD5) Previous issue date: 2011-06-30 / Universidade Federal de Minas Gerais / Chagas disease, caused by the flagellate protozoan of the family Trypanosomatidae Trypanosoma cruzi, is endemic in Latin America. The available drugs are ineffective and cause severe side effects. Therefore, it is necessary the discovery and development of new drugs for Chagas disease chemotherapy. The cruzain enzyme (EC 3.4.22.51) is expressed in all T. cruzi life cycle and represents a valid target against Chagas disease. The search for new cruzain enzyme inhibitors was carried out through the development of a new strategy using in silico methods, based on integrated ligand and target virtual screening. The consensus of different virtual screenings allowed the selection of 23 molecules for in vitro assays, from a virtual library containing approximately 8.5 million structures collected from the commercial database ZINC. The compounds were assayed against the cruzain and human homologous cathepsin-L and 12 presented inhibitory activity. The IC50 values ranged from 5.6 to 73.9 μM for cruzain and 8.6 to 89.1 μM for cathepsin-L. The apparent inhibition constant (Ki app) of the identified compounds ranged from 3.7 and 64.5 μM for cruzaínain and 3.8 to 87.1 μM for the cathepsin-L and showed competitive inhibition mechanisms. New molecular classes of non-covalent inhibitors of the enzyme cruzain were identified. Two substances were validated as inhibitors by evaluating compound analogs to establishing relationships between molecular structure and biological activity; a substance with the ligand efficiency of 0.33 kcal mol-1 NA-1 was identified. Two enzyme inhibitors showed trypanocidal activity against the Y strain of T. cruzi trypomastigotes with potency comparable to the drug benznidazole®. The micromolar activity of the compounds against the cruzain enzyme and the confirmed activity against the parasite provide the opportunity for molecular optimization and improve the bioactive compounds design with known mode of action. / A doença de Chagas, causada pelo parasito tripanossomatídeo Trypanosoma cruzi, é uma doença endêmica distribuída por toda América Latina. Os fármacos disponíveis são ineficientes e apresentam sérios efeitos colaterais. Portanto, são necessários novos fármacos para a quimioterapia da doença de Chagas. A enzima cruzaína (EC 3.4.22.51) de T. cruzi é expressa durante todo o ciclo de vida e representa um alvo validado contra a doença da Chagas. A busca de novos inibidores da enzima cruzaína foi realizada pelo desenvolvimento de uma estratégia integrada utilizando métodos in silico baseados na estrutura do ligante e do receptor e métodos in vitro. O consenso dos diferentes métodos de ensaios virtuais permitiu a seleção de 23 moléculas para os ensaios in vitro, a partir de uma coleção virtual com cerca de 8,5 milhões de estruturas provenientes do banco de moléculas comerciais ZINC e 12 apresentaram atividade inibitória frente à enzima cruzaína e sua homóloga catepsina-L de humanos. Os valores de IC50 variaram entre 5,6 e 73,9 μM para cruzaína e 8,6 a 89,1 para catepsina-L. As constantes de inibição aparentes (Ki app) da série de compostos identificados variaram entre 3,7 e 64,5 μM para a cruzaína e 3,8 a 87,1 μM para a catepsina-L e apresentaram mecanismos competitivos de inibição. Novas classes moleculares inéditas de inibidores não covalentes da enzima cruzaína foram identificadas. Duas substâncias foram validadas como inibidores através de avaliação de análogos para o estabelecimento de relações entre a estrutura molecular e atividade biológica, uma substância com eficiência do ligante de 0,33 kcal mol-1 NA-1 foi identificada. Dois inibidores enzimáticos apresentaram atividade tripanossomicida frente à cepa Y do T. cruzi em sua forma tripomastigota com potência comparável ao Benzonidazol®. A inibição da enzima cruzaína com atividade confirmada frente ao T. cruzi oferece a oportunidade de otimização da estrutura molecular da substância matriz e valoriza a racionalização do processo de identificação de substâncias bioativas com modo de ação conhecido.
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Planejamento de inibidores da cruzaína baseado em fragmentos / Fragment based drug design of cruzain inhibitors

Fonseca, Emanuella Maria Barreto 27 July 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T20:36:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3869.pdf: 12129966 bytes, checksum: 7f17c5b063ae127e4d58be4e1f14b434 (MD5) Previous issue date: 2011-07-27 / Financiadora de Estudos e Projetos / The Chagas disease, described in 1909 by the Brazilian sanitary physician, scientist and bacteriologist Dr. Carlos Chagas, is caused by the Trypanosomatid parasite Trypanosoma cruzi. Current treatments involve the use of drugs benznidazole and nifurtimox, which are effective only in the early stage of the disease (acute phase), but have severe side effects. The enzyme cruzain is a validated target for searching small molecules to act against Chagas disease. Cruzain inhibition has been studied for the discovery and development of new drugs. In this work, the planning strategy was based on molecular fragments, using a computational approach for selecting them. Using GRID/CPCA, important residues such as Ser207 and Asp69 were identified in an adjacent cavity to the S2 sub-site of the enzyme. These residues can take part on hydrogen-bond interactions and have not been explored in the search for inhibitors for this target. In addition, we identified patterns of molecular recognition of the enzyme, based on the structures deposited in the Protein Data Bank, which are co-crystallized with inhibitors at the site of the enzyme. These inhibitors were used to guide the search via SMARTS pattern to build a fragment database. Docking and molecular dynamics were used to select the fragments for an in vitro assay. Many fragments were acquired and tested against cruzain using the technique of fluorescence spectroscopy. One fragment (Nequimed147) showed activity, inhibiting the enzyme with IC50 equal to 2.39 mM, resulting in a ligand efficiency of 0.23 kcal mol-1 weight atom-1. Based on this fragment, new inhibitors were identified with IC50 between 1.25 and 4.29 mM. Their ligand efficiencies were in the range of 0.21 and 0.26 kcal mol-1 weight atom-1 whose molecular recognition features are suitable for the search of new enzyme inhibitors likely to bind the cavity near the S2 sub-site that has not been explored yet. / A Doença de Chagas, descrita em 1909 pelo médico sanitarista brasileiro Dr. Carlos Chagas, é causada pelo parasito tripanossomatídeo Trypanosoma cruzi. Os tratamentos atuais consistem no uso dos fármacos benzonidazol e nifurtimox que são eficazes apenas no estágio inicial da doença (fase aguda), mas possuem efeitos colaterais severos. A enzima cruzaína constitui um alvo validado contra a doença de Chagas e sua inibição vem sendo estudada para o planejamento de fármacos. Neste trabalho a estratégia adotada foi o planejamento baseado em fragmentos moleculares, através de uma abordagem computacional para a seleção dos mesmos. Utilizando a técnica GRID/CPCA, foram identificados resíduos importantes, como Ser207 e Asp69, em uma região adjacente ao sub-sítio S2 da enzima. Estes resíduos são capazes de realizar interações do tipo ligação de hidrogênio e ainda não foram explorados na busca de inibidores para esse alvo. Além disso, foram identificados padrões de reconhecimento molecular da enzima, baseado nas estruturas depositadas no Protein Data Bank com inibidores cocristalizados no sítio da enzima, que foram utilizados para fazer uma busca guiada com a utilização de padrão SMARTS para construção de um banco de fragmentos. As técnicas de docagem e dinâmica molecular foram usadas para selecionar os fragmentos, os quais foram adquiridos para os ensaios in vitro. Vários fragmentos foram testados contra a enzima cruzaína utilizando a técnica de fluorimetria, sendo que um deles (Nequimed147) mostrou-se capaz de inibir a enzima com IC50 igual a 2,39 mM, resultando em uma eficiência do ligante de 0,23 kcal mol-1 átomo pesado-1. Baseado nesse fragmento, novos inibidores foram identificados com potência entre 1,25 e 4,29 mM e eficiência do ligante entre 0,21 e 0,26 kcal mol-1 átomo pesado-1, com características apropriadas para o reconhecimento molecular pela enzima cruzaína na região do sub-sítio S2.
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Estudo Farmacognóstico e Screening Biológico de Solanum lycocarpum St. Hill (Solanaceae)

Martins, Gilmarcio Zimmermann [UNESP] 26 June 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:29Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-06-26Bitstream added on 2014-06-13T18:45:15Z : No. of bitstreams: 1 martins_gz_dr_arafcf.pdf: 1489447 bytes, checksum: 0af9b576dfb9149599192bc470b24ff5 (MD5) / Devido ao negligenciamento e ao aumento de números de casos das doenças microbianas e parasitárias no Brasil, o aprimoramento da investigação científica e tecnológica na área de plantas medicinais faz-se indispensável para à busca de novos produtos antimicrobianos e antiparasitários. A Solanum lycocarpum St. Hill. (Solanaceae) é uma planta medicinal tradicionalmente utilizada na forma de polvilho de lobeira como terapia complementar para o tratamento do Diabetes Mellitus, hipocolesterolêmico e na hipertensão. Os efeitos terapêuticos são atribuídos aos dois glicoalcaloides predominantes nas espécies do gênero Solanum, a solamargina e a solasonina. Em face ao exposto o objetivo desta pesquisa foi o isolamento de solasonina e solamargina de frutos maduros de S. lycocarpum e o screening de atividades antimicrobiana, antiparasitária, antioxidante e citotóxica do extrato etanólico 96 % bruto, frações e dos glicoalcaloides. O extrato etanólico 96 % bruto foi obtido por refluxo utilizando como solvente etanol 96 ºGL e seco sobre pressão reduzida. O isolamento dos glicoalcalóides foi realizado por meio de sequência de técnicas cromatográficas. Foram analisadas as atividades, antimicrobiana (E. faecalis, S. salivarius, S. sobrinus, S. mutans, S. mitis, S. sanguinis, L. casei, B. subtilis, P. aeruginosa, Salmonella enterican, E. faecalis, S. aureus, E. coli, C. albicans, A. niger, A. flavus e Fusarium sp.), antiparasitária (Giardia lamblia, Leishmania infantum, Trypanosoma cruzi e Trypanosoma brucei), antioxidante e citotóxica. No processo de purificação foram obtidas 6 frações e nas sub-frações 2.5 e 2.7 foram isolados os glicoalcalóides solasonina (Rf = 0,46) e solamargina (Rf = 0,57), respectivamente. Apresentaram atividade parasitária para Giardia lamblia (extrato etanólico 96 % (v/v) bruto, fração etanólica 40 % (v/v) frações F1 e F2), Leishmania infantum... / The neglect and increased of the numbers of cases of microbial and parasitic diseases in Brazil and the improvement of scientific and technological research in the medicinal plants has contributed for the search of new antimicrobials and antiparasitic. The Solanum lycocarpum St. Hill. (Solanaceae) is a medicinal plant traditionally used as complementary therapy for the treatment of Diabetes Mellitus, hypocholesterolemic and hypertension. The therapeutic effects are attributed to the two predominant glycoalkaloids in Solanum species, the solamargine and the solasonina. In view of the above, the objective of this research was to isolate solasonina and solamargine of ripe fruits of S. lycocarpum and screening of antimicrobial, antiparasitic, antioxidant and cytotoxicity activities of crude extract 96% ethanol, fractions and glycoalkaloids. The crude extract 96% ethanol was obtained by reflux with as solvent ethanol 96 º GL and reduced pressure dried. The isolation of glycoalkaloids was performed by chromatographic techniques. We analyzed the activity, antimicrobial (E. faecalis, S. salivarius, S. sobrinus, S. mutans, S. mitis, S. sanguinis, L. casei, B. subtilis, P. aeruginosa, Salmonella enterican, E. faecalis, S. aureus, E. coli, C. albicans, A. niger, A. flavus and Fusarium sp.), antiparasitic (Giardia lamblia, Leishmania infantum, Trypanosoma cruzi and Trypanosoma brucei), antioxidant and cytotoxicity. In the purification process were obtained six fractions and the in the sub-fractions 2.5 and 2.7 were isolated the glycoalkaloids, solasonina (Rf = 0.46) and solamargine (Rf = 0.57). Showed activity for parasite Giardia lamblia (crude extract 96% ethanol, ethanol fraction 40%, fractions F1 and F2), Leishmania infantum (crude extract 96% ethanol, ethanol fraction 40%, fractions F1, F2 and F3)... (Complete abstract click electronic access below)
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Utilização da espectroscopia com análise multivariada na identificação de diferentes DTUs do Trypanosoma cruzi em Triatoma brasiliensis infectados experimentalmente

Jales, Jéssica Teixeira 16 February 2018 (has links)
Submitted by Automação e Estatística (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-07-02T21:32:55Z No. of bitstreams: 1 JessicaTeixeiraJales_DISSERT.pdf: 1910451 bytes, checksum: e7f1801b5eb5bf661f06cfbba7ef2fe1 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-07-09T11:25:48Z (GMT) No. of bitstreams: 1 JessicaTeixeiraJales_DISSERT.pdf: 1910451 bytes, checksum: e7f1801b5eb5bf661f06cfbba7ef2fe1 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-09T11:25:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JessicaTeixeiraJales_DISSERT.pdf: 1910451 bytes, checksum: e7f1801b5eb5bf661f06cfbba7ef2fe1 (MD5) Previous issue date: 2018-02-16 / A infecção pelo Trypanosoma cruzi é um problema de saúde pública, e é importante que seu diagnóstico seja realizado com rapidez e eficiência. Entretanto, as técnicas aplicadas para esse fim apresentam baixa sensibilidade e especificidade no que concerne a vigilância entomológica e epidemiológica do parasito. Pensando nesta problemática, a bioespectroscopia com análise multivariada foi utilizada neste trabalho para avaliar a eficiência na identificação da infecção experimental de Triatoma brasiliensis por diferentes Unidades de tipagem discreta (DTU) do T. cruzi. Na padronização do modelo de classificação foram utilizadas ninfas de 4° e 5º estádio de T. brasiliensis, infectadas experimentalmente com diferentes DTUs do parasito (TcI, TcII, TcIII ou infecção mista), na concentração de 40.000 parasitos/mL de sangue. Seguidos 15 e 30 dias após infecção (DAI), espectros de infravermelho foram coletados do abdômen de cada inseto; 30 DAI, dejetos intestinais foram coletados e posteriormente utilizados para análise do kDNA. A padronização do modelo de calibração mostrou que a aplicação do infravermelho médio utilizando o Infravermelho médio com transformada de Fourrier com reflexão total atenuada (ATR-FTIR) discriminou os triatomíneos não infectados e infectados com o T. cruzi. Além disso, a técnica foi capaz de distinguir as DTUs utilizadas, e separar os 5 grupos estudados apenas com a análise exploratória de dados por meio da aplicação da Análise dos componentes principais (PCA), a qual identificou diferencialmente grupamentos proteicos, ácidos nucleicos e em menor proporção, lipídeos. A análise do kDNA confirmou 92,5% das infecções, enquanto o ATR-FTIR identificou corretamente todas as amostras. Desta forma, a bioespectroscopia foi eficiente, simples e acurada na identificação da infecção de T. brasiliensis por T. cruzi, podendo ser utilizado como ferramenta de diagnóstico futura, auxiliando na vigilância entomológica da infecção por este parasita. / The Trypanosoma cruzi infection is a public health problem and it is substancial that its diagnosis be performed quickly and efficiently. However, the techniques applied on the diagnosis of T. cruzi infection present low sensitivity and specificity regarding the entomological and epidemiological surveillance of the parasite. Considering this problem, the biospectroscopy with the use of ATR-FTIR was used in this study to evaluate its efficiency in the identification of the experimental infection of Triatoma brasiliensis by different DTUs of T. cruzi. The standardization of the calibration model included the use of fourth and fifth instars of T. brasiliensis, which were infected with different DTUs of the parasite (TcI, TcII, TcIII or mixed infection) at a concentration of 40,000 parasites / ml of blood. Followed 15 and 30 days after infection (DAI), infrared spectra were collected from the abdomen of each insect; 30 DAI, intestinal wastes were collected and later used for kDNA analysis. The standardization of the calibration model showed that the application of the mild-infrared using the ATR-FTIR distinguished the triatomines that were not infected and experimentally infected with T. cruzi. In addition, the technique was able to identify the DTUs used, separating the 5 distinct groups only with the exploratory data analysis through the application of Principal Component Analysis (PCA), which differentially identified protein clusters, nucleic acids and to a lesser extent, lipids. The kDNA analysis confirmed 92.5% of the infected insects, while the ATR-FTIR correctly identified all samples. Thus, biospectroscopy applied with the use of ATR-FTIR was efficient in the identification of the T. brasiliensis infection by T. cruzi, and could be used as a diagnostic tool for the future, assisting in the entomological surveillance of the infection by this parasite.
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Detecção de reações cruzadas por Leishmania spp. e Trypanosoma spp. em cães pelo ensaio imunoenzimático indireto, pela reação de imunofluorescência indireta e reação em cadeia de polimerase

Viol, Milena Araúz [UNESP] 18 August 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-08-18Bitstream added on 2014-06-13T20:16:26Z : No. of bitstreams: 1 viol_ma_me_araca.pdf: 293015 bytes, checksum: bdc10c5bc3d8d20c951f2fc3b6dc7f4e (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O objetivo deste estudo foi detectar reações cruzadas por Leishmania spp. e Trypanossoma cruzi pelo Ensaio Imunoenzimático Indireto (ELISA), pela Reação de Imunofluorescência Indireta (RIFI) e pela Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). Assim, foram colhidas 408 amostras sanguíneas de cães domiciliados no município de Araçatuba,SP, de ambos os sexos, de diversas raças e com idade a partir de seis meses. Em relação à Leishmania spp., pela RIFI, 14,95 % (61/408) foram reagentes. A positividade por meio do ELISA, foi de 20,10% (82/408) e pela PCR, 29,66% (121/408), com diferença significativa para o sexo e a idade destes animais (p<0,05). Para Trypanosoma spp., a ocorrência de anticorpos pelo ELISA foi de 10,54% (43/408) e pela PCR, 2,45% (10/408) cães foram positivos. Pela RIFI, 10,29% (42/408) dos animais foram considerados positivos e somente o sexo apresentou diferença significativa (p<0,05). Neste trabalho, constatou-se que 10,54%(43/408) dos animais foram soropositivos por ELISA para Trypanosoma spp., sendo que 79,07%(34/43) obtiveram resultados positivos no diagnóstico molecular para Leishmania spp. e dos 10,29% (42/408) positivos por RIFI, 95,24% (40/42) dos cães confirmaram a infecção por este parasita. Por meio dos resultados obtidos, pode-se inferir que foram evidenciadas reações cruzadas nos ensaios sorológicos para ambos os protozoários, nos animais analisados neste trabalho / The aim of this study was to detect cross-infection by Leishmania spp. and Trypanosoma spp. by indirect immunosorbent assay (ELISA), by Indirect Immunofluorescence (IFA) and by the Polymerase Chain Reaction (PCR). Thus, blood samples were collected from 408 domestic dogs of both sexes, different races and ages from six months. For Leishmania spp. by IFA, 14.95% (61/408) were positive. Positive by ELISA, was 20.10% (82/408), and PCR 29.66% (121/408), with significant difference for sex and age of animals (p <0.05). For Trypanosoma spp., the occurrence of antibodies by ELISA, was 10.54% (43/408), and PCR, 2.45% (10/408) dogs were positive. By IFA, 10.29% (42/408) of the animals were considered positive and only sex was significant difference (p <0.05). In this work it was found that 10.54% (43/408) animals were seropositive by ELISA for Trypanosoma spp., 79.07% (34/43) had positive results in molecular diagnostic for Leishmania spp. and 10.29% (42/408) positive by IFA, 95.24% (40/42) dogs confirmed the infection by this parasite. Through the results obtained can be inferred that cross-infection were observed by both protozoa in animals of this paper
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Síntese e avaliação biológica de novos compostos das séries LAPDESF FUR-PQ E LAPDESF FUR-TS contra Trypanosoma cruzi

Chiba,Diego Eidy [UNESP] 03 July 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2016-06-07T17:12:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-07-03. Added 1 bitstream(s) on 2016-06-07T17:16:55Z : No. of bitstreams: 1 000864103.pdf: 4214125 bytes, checksum: 96b80eb0d58d2e5a5f75758824bad053 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A doença de Chagas, também conhecida como Tripanossomíase Americana, causada pelo parasita hemoflagelado Trypanosoma cruzi, é tipicamente endêmica em países das Américas Central e Latina, mas devido ao processo de migração, a doença já atinge outros países como Estados Unidos e alguns países europeus. Estima-se que haja aproximadamente 7 - 8 milhões de pessoas infectadas no mundo e mais de 25 milhões correm risco de infecção. Os fármacos aprovados para o tratamento da doença são o benznidazol e o nifurtimox, ambos ativos somente na fase aguda da doença. No Brasil, apenas o benznidazol está disponível na terapêutica. Neste sentido, o presente projeto propõe a obtenção de duas séries de compostos. A série 1 é constituída de sete derivados inéditos híbridos de furoxanos e primaquina. Já a série 2 constitui-se de seis derivados inéditos bioisósteros de nitrofural, substituindo o núcleo nitrofurânico pelo núcleo furoxânico. Os derivados furoxânicos apresentam a capacidade de doação de NO, propriedade anti-inflamatória e tem demonstrado atividade antiparasitária interessante. A primaquina é um fármaco antimalárico, que foi previamente avaliado e demonstrou potencial atividade tripanossomicida. Foram obtidos seis derivados furoxânicos intermediários e caracterizados por espectrometria de infravermelho (IV) e por Ressonância Magnética Nuclear (RMN) e seis compostos finais, sendo caracterizados por espectrometria de infravermelho (IV) e por Ressonância Magnética Nuclear (RMN). Os compostos finais obtidos foram avaliados quanto a atividade tripanossomicida em formas epimastigotas e amastigotas, a capacidade de doação de óxido nítrico e quanto a mutagenicidade in vivo. Os compostos apresentaram boa atividade tripanossomicida contra as formas epimastigotas e também se mostraram não mutagênicos no ensaio realizado. / Chagas disease, also known as American trypanosomiasis, caused by the hemoflagellate parasite Trypanosoma cruzi, is typically endemic in countries of Central and Latin America. However, due to the migration process, this disease has already reached other countries like the United States and some European countries. It is estimated that there are approximately 7 - 8 million people infected worldwide and more than 25 million are at risk of infection. The drugs approved for the treatment are benznidazole and nifurtimox, both active only in the acute phase of the disease. In Brazil, only benznidazole is available. Due to the above, this project proposes to obtain two series of compounds. The Series 1 consists of seven new compounds derived from furoxanos and primaquine. The second series consists of six new bioisosters of nitrofurazone, replacing the nitrofuran group with furoxan. Furoxans derivatives have the ability to donate NO, anti-inflammatory properties and have shown interesting anti-parasitic activity. Primaquine is an antimalarial drug, which was previously demonstrated to have potential trypanocidal activity. Six furoxans intermediates and six finals derivatives were synthesized and characterized by infrared spectrometry (IR) and Nuclear Magnetic Resonance (NMR). Was evaluated the trypanocidal activity against epimastigote form of T. cruzi, the capability of NO donation and the mutagenicity in an in vivo assay. They presented good activity against epimastigote forms of parasite and show no mutagenicity in the in vivo assay.
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Avaliação do metabolismo oxidativo em cepa Y de Trypanosoma cruzi tratadas com o composto derivado do benzofuroxânico LAPDESF - BZFS

Silva, Flávia Alves de Jesus [UNESP] 07 December 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2016-08-12T18:48:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-12-07. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-12T18:51:10Z : No. of bitstreams: 1 000865801_20171231.pdf: 1061346 bytes, checksum: efe45af74713a03a299062d24c3f7820 (MD5) Bitstreams deleted on 2018-01-02T17:04:40Z: 000865801_20171231.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2018-01-02T17:05:44Z : No. of bitstreams: 1 000865801.pdf: 3646553 bytes, checksum: e4296295ee6540afe7731bb02d9b4994 (MD5) / A tripanossomíase Americana, mais conhecida por doença de Chagas, é transmitida por triatomíneos infectados pelo agente etiológico Trypanosoma cruzi. Desde que foi descrita pela primeira vez em 1909, a doença tem se expandido pelo mundo infectando milhões de pessoas, principalmente na America Latina, onde ela é endêmica. Atualmente, apenas dois fármacos estão disponiveis para o tratamento, o nifurtimox, que não é usado no Brasil, e o benzonidazol, que teve sua produção industrial bastante reduzida. No entanto, ambos os fármacos tem ações limitadas. Assim, a busca de novas substâncias e a compreensão do mecanismo de resistência aos fármacos tripanossomicidas disponíveis e aos que ainda estão em fase de pesquisa, tem sido motivo de vários estudos. Alguns estudos relatam um aumento na produção de enzimas que atuam na defesa celular, as quais, provavelmente, poderiam ser responsáveis pela resistência do parasito. Algumas enzimas têm funções importantes na sobrevivência e crescimento dos parasitos: superóxido dismutase (SOD), metaloenzima que elimina radicais superóxido ao convertê-los em peróxido de hidrogênio e oxigênio molecular; old yellow enzyme (OYE), uma NADPH flavina oxidoredutase que pode estar envolvida na redução de substâncias tripanossomicidas, e peroxiredoxina (Prx), que catalisa a redução de peróxidos. Por meio de Western blotting analisou-se as modificações em nível de expressão das enzimas SOD, OYE e Prx em cepas de T. cruzi tratadas ou não com um composto derivado benzofuroxânico, LAPDESF-BZFS (6-((metil)benzo[c](2-carbamoilidrazona)-1-Nóxido-1,2,5-oxadiazol). O IC50 (índice de citotoxicidade) desse composto foi de 6,88 µg/mL, e promoveu alterações na expressão das enzimas Prx e OYE, provavelmente promovendo o estresse oxidativo em formas epimastigotas. / The American trypanosomiasis, also known for Chagas disease, and transmitted for infected triatomine by etiological agent Trypanosoma cruzi. Since it was first described in 1909, this disease has expanded the world infecting millions of people, mostly in Latin America, where it is endemic. Currently only two drugs are available for Chagas disease treatment, nifurtimox, which is not used in Brazil, and benznidazole, which had its much reduced industrial production. However, both drugs have limited actions. Thus, the search for new compounds and to understand the mechanism of resistance to trypanocidal drugs available and that are still in the research phase, have been the subject of several studies. Some studies report an increase in the production of enzymes that action in cellular defense, which probably could be responsible for parasite resistance. Some enzymes have important functions in the survival and growth of parasites: superoxide dismutase (SOD), metalloenzyme that eliminates superoxide radicals to convert them hydrogen peroxide and molecular oxygen; old yellow enzyme (OYE) a NADPH- flavin oxidoreductase that may be involved in the reduction of trypanocidal substances and peroxiredoxin (Prx), which catalyzes the reduction of peroxides. By means of Western blotting analyzed for changes in expression level of SOD, Prx and OYE in strains of T. cruzi treated or not with a compound derived benzofuroxânico, LAPDESFBZFS ( 6 - (( methyl) benzo [c ] (2- carbamoilidrazona ) -1 -N-oxide -1,2,5- oxadiazol ). The CI50 (cytotoxicity index) of this compound was 6.88 µg/mL, and promoted changes in the expression of PRX and OYE enzymes, probably by promoting oxidative stress in epimastigotes .
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Síntese de derivados piridínicos inspirados na (-)-espectalina na busca de hits para doenças negligenciadas / Synthesis of (-)-spctaline-inspired pyridine derivatives in search of hits for neglected diseases

Prates, João Lucas Bruno [UNESP] 24 July 2017 (has links)
Submitted by JOÃO LUCAS BRUNO PRATES null (jhonylprates@yahoo.com.br) on 2017-08-30T20:18:59Z No. of bitstreams: 1 Dissertação de mestrado - João Lucas.pdf: 6449742 bytes, checksum: 4da0e1cbddc21aa321ccfa9245fbb63b (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-09-01T13:02:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 prates_jlb_me_araiq.pdf: 6449742 bytes, checksum: 4da0e1cbddc21aa321ccfa9245fbb63b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-01T13:02:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 prates_jlb_me_araiq.pdf: 6449742 bytes, checksum: 4da0e1cbddc21aa321ccfa9245fbb63b (MD5) Previous issue date: 2017-07-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Na presente pesquisa foram sintetizados vários derivados piridínicos objetivando a descoberta de constituintes com atividade antiparasitária potencial. Estes compostos foram planejados a partir do alcaloide (–)-espectalina isolado de Senna spectabilis (Fabaceae), empregando alguns processos usuais da química medicinal como a simplificação molecular, isosterismo clássico e funcional. Deste procedimento experimental, foram sintetizados 18 substâncias, sendo todas obtidas por meio de reações simples, a partir de compostos comerciais. Das substâncias sintéticas produzidas, 14 foram submetidas à avaliação para atividade em Trypanosoma cruzi, visando potenciais antichagásicos, e em Leishmania infantum para identificar potenciais leishmanicidas. Os compostos testados mostraram-se inativos na inibição destes protozoários. Contudo, dois análogos (48 e 52) apresentaram atividade inibitória das cepas de Plasmodium falciparum, com CI50 = 5,0 µM e índice de seletividade bastante interessante (IS >50). / In the present research, several pyridine derivatives were synthesized aiming at the discovery of new constituents with potential antiparasitic activity. All compounds were planned from the (-)-spectaline alkaloid isolated from Senna spectabilis (Fabaceae), employing some usual medicinal chemistry procedures, such as molecular simplification, classical and functional isosterism. From this experimental procedure, 18 compounds were synthesized, and all of these were obtained by means of simple reactions, from commercial compounds. Of the synthetic substances produced, 14 were evaluated for activity in Trypanosoma cruzi, aimed at the search for potential antichagasics, and against Leishmania infantum to identify potential leishmanicidal derivatives. All compounds tested were inactive to the inhibition of these protozoa. However, two analogues (48 and 52) showed inhibitory activity against Plasmodium falciparum strains, with IC50 = 5.0 μM and an interesting selectivity index (IS> 50).
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Efeito de extratos vegetais na parasitemia do Trypanosoma cruzi e na biodistribui??o do pertecnetato de s?dio (Na99mTcO4)

Silva, Roseane Pereira da 14 December 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T14:13:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RoseanePS_Dissert.pdf: 3732658 bytes, checksum: 742911363ad84dd9ebc1a2c58e9d1d3f (MD5) Previous issue date: 2009-12-14 / Artemisia vulgaris (AV) is an antihelmintic and antimalarial drug; Aloe vera(babosa) acts as antidiabetic, laxative and anti-inflammatory; Benznidazole (BZ) is a trypanocidal of Trypanosoma cruzi (TC). Technetium-99m (99mTc) has been used in nuclear medicine to obtain diagnostic images. This study evaluated the plant effects in TC parasitemia and in the biodistribution of 99mTc in mice. Twenty mice were infected by TC. At the peak of parasitemia, 5 mice received babosa; 5 received AV and 5 received BZ. The parasitemia was determined in 0, 2, 4 and 6 h of drugs administration. Five infected mice without drugs, 5 mice without TC and the group treated with AV, received 99mTc. The radioactivity was calculated. Infected mice that received babosa reduced significantly (p<0.05) the parasitemia. The percentage of activity (%ATI) decreased significantly in the AV group. These results indicate that babosa possibly is an anti-TC drug and AV reduces the %ATI probably due to its biological effects / Artemisia vulgaris (AV) ? um vegetal com propriedades antihelm?ntica e antimal?rica; Aloe vera (babosa) tem ??o antidiab?tica, laxante e anti-inflamat?ria; Benzonidazol (BZ) ? um tripanomicida. O tecn?cio-99m (99mTc), na forma de pertecnetato de s?dio (Na99mTcO4), tem sido usado na medicina nuclear para obten??o de imagens diagn?sticas. Este estudo avaliou o efeito de plantas na parasitemia do T. cruzi e na biodistribui??o do 99mTc em camundongos. Vinte camundongos foram infectados por T. cruzi. No pico da parasitemia, 5 camundongos foram tratados com extrato aquoso de babosa, 5 AV e 5 BZ. A parasitemia foi determinada durante os tempos 0, 2, 4 e 6 horas ap?s administra??o das drogas. Cinco camundongos infectados e que n?o receberam drogas, 5 camundongos n?o infectados e o grupo tratado com AV receberam Na99mTcO4. O percentual de Atividade Total Injetada nos ?rg?os (%ATI/g), correspondente ? energia gama emitida ou radioatividade, foi calculada no contador gama. Os camundongos infectados que receberam babosa reduziram significativamente (p<0,05) a parasitemia. A porcentagem da radiatividade total (%ATI/g) diminuiu significativamente no grupo tratado com AV. Estes resultados indicam que a babosa possivelmente ? uma droga anti-T. cruzi e a AV reduz a %ATI/g provavelmente devido seus efeitos biol?gicos. Este trabalho teve a participa??o de pesquisadores das ?reas de Parasitologia, Estat?stica, Cirurgia, Medicina Nuclear e An?lises Cl?nicas, atestando seu car?ter multidisciplinar

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