La brûlure foliaire causée par Alternaria dauci est la maladie foliaire la plus dommageable pour les cultures de carottes, entravant la récolte mécanique. Seuls des cultivars partiellement résistants sont connus et commercialisés, mais leurs niveaux de résistance sont insuffisants. Les mécanismes de la résistance quantitative des plantes aux agents pathogènes sont mal caractérisés. Nous avons choisi d'étudier ces mécanismes dans l'interaction A. dauci-carotte. Auparavant, plusieurs résultats expérimentaux convergents ont montré que la résistance aux toxines fongiques entre en jeu dans cette interaction. Les tests de toxicité effectués avec des suspensions cellulaires de carotte ont révélé une corrélation entre la résistance des carottes à A.dauci et la résistance des cellules de carotte aux exsudats du champignon. Ces résultats nous ont incités à étudier les toxines impliquées dans le pouvoir pathogène d'A. dauci et afin de pouvoir étudier la réponse de la plante à celles –ci. En utilisant les profils HPLC de la phase organique d'exsudats de différentes souches de champignons, nous avons découvert une corrélation entre la production de toxines et l’agressivité de ces souches suggérant que la production de toxines joue un rôle majeur dans l’interaction A. dauci-carotte. Nous avons effectué l'extraction, la purification et la caractérisation de l'une des molécules candidates que nous avons nommé aldaulactone. Nous avons démontré sa toxicité grâce à un nouveau protocole de quantification de cellules mortes et vivantes. Un transcriptome d’A. dauci et une étude de l’expression des gènes en fonction de la production d’aldaulactone ont été utilisées pour étudier sa voie de biosynthèse. / Alternaria leaf blight, caused by the necrotrophic fungus Alternaria dauci, is the most damaging foliar disease of carrots, especially because it hampers leaf-pull harvesting. Only partially – and insufficiently – resistant cultivars exist. In general, partial resistance mechanisms are poorly understood, so we chose to study them in this interaction. Previous results obtained in the lab highlighted a correlation between plant resistance to the fungus and plant cell resistance toward fungal toxins. It was also shown using carrot cell suspensions that fungal exudates’ toxicity was only present in the organic phase. These results led us to better characterize the toxins produced by A. dauci, in order to get a deeper understanding of carrot cell resistance mechanisms toward those toxins. HPLC analysis of the exudates from different fungal strain uncovered a correlation between toxin production and the aggressiveness of the fungal strains, suggesting that toxin production is an important component of said aggressiveness. We extracted, purified and characterize one of these candidates, and named it aldaulactone. Using a new image analysis protocol, we demonstrated the toxicity of Aldaulactone on carrot cell suspensions. Transcriptomic data from Alternaria dauci were used to explore the biosynthesis pathway of Aldaulactone. Candidate Genes were selected and their level of expression compared with aldaulactone production in various A. dauci cultures.

Submitted by Socorro Pontes (socorrop@ufersa.edu.br) on 2017-07-04T13:48:44Z No. of bitstreams: 1 JoseMC_TESE.pdf: 3634440 bytes, checksum: 6ac32b0fb28add3a21ce28608edd3cdf (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2017-07-04T16:47:51Z (GMT) No. of bitstreams: 1 JoseMC_TESE.pdf: 3634440 bytes, checksum: 6ac32b0fb28add3a21ce28608edd3cdf (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-04T16:57:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JoseMC_TESE.pdf: 3634440 bytes, checksum: 6ac32b0fb28add3a21ce28608edd3cdf (MD5) Previous issue date: 2017-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The objective of the present work was to identify sources of resistance in melon accessions to Liriomyza sativae; Alternaria spp., and Acidovorax avenae. Two experiments were performed in a greenhouse and in the Laboratory of Applied Entomology (UFERSA) in a completely randomized design, with ten replicates, each plant being a plot. In the first experiment 38 accessions and two hybridswere evaluated. The infestation was held in cages coated with antiophidic screen. The second experiment was performed with the accessions that revealed to be promising and some were susceptible in the first trial. In the evaluations, the number of mines, larvae, pulps and adult flies were determined. In some materials, leaf colorimetry, number, size of stomata and trichomes were analyzed. The accessions AM 55 and Nantais Oblong as well as the Ruthenium hybrid are resistant to Liriomyza sativa. The number of mines, larvae and adult flies correlated negatively with the number of trichomes and positively with the size of the stomata. Regarding the Alternaria leaf blight, fifty-eight accessions were initially evaluated in a randomized block design (DBC) with three replications under field conditions. In a second experiment, twelve accessions were also evaluated under field conditions, in both tests the evaluations were accomplished 50 days after the transplanting, as far as the severity and incidence of plants with Alternaria. It was concluded that there is variability in the germplasm of melon for reaction to the Alternaria leaf blight, being the accessions C-AC-04, C-AC-08, C-AC-26, C-AC-31, I 162, I 173 e MR-1 with lower severity averages and incidence of diseased plants, being evaluated as promising for use in breeding programs of melon for resistance to the pathogen. For the reaction to A. avenae, fifty accessions were evaluated in greenhouse and in field conditions. There has been accomplished inoculations with bacterial suspension in the concentration os 1,0 x 108 UFC ml-1. There were evaluated leaves (in a controlled environment), leaves and fruits (in field) with bacteriose symptoms. The C-AC-12 accession has intermediate resistance Acidovorax avenae / Os objetivos do presente trabalho foram: identificar fontes de resistência em acessos de meloeiro a Liriomyza sativae, Alternaria spp. e Acidovorax avenae. Dois experimentos foram realizados em casa de vegetação e no Laboratório de Entomologia Aplicada da (UFERSA) em delineamento inteiramente casualizado, com dez repetições, sendo cada planta uma parcela. No primeiro experimento foram avaliados 38 acessos e dois híbridos de meloeiro. A infestação foi realizada em gaiolas revestidas com tela antiafídica. O segundo experimento foi realizado com os acessos que se mostraram promissores e alguns suscetíveis no primeiro ensaio. Nas avaliações, determinou-se o número de minas, larvas, pupários e moscas adultas, em alguns materiais fez-se analise de colorimetria das folhas, número, tamanho de estômatos e tricomas. Os acessos AM 55 e Nantais Oblong bem como o híbrido Rutênio são resistentes a Liriomyza sativae. O número de minas, larvas e moscas adultas correlacionaram negativamente com o número de tricomas e positivamente com o tamanho dos estômatos. Com relação a mancha de alternaria, inicialmente foram avaliados 58 acesso sem delineamento em blocos casualizados (DBC) com três repetições em condições de campo. Em um segundo experimento, foram avaliados 12 acessos também em condições de campo, em ambos os ensaios as avaliações foram realizadas aos 50 dias pós o transplantio, quanto a severidade e incidência de plantas com alternariose.Concluiu-se que, existe variabilidade no germoplasma de meloeiro para reação a mancha de alternaria, sendo os acessos C-AC-04, C-AC-08, C-AC-26, C-AC-31, I 162, I 173 e MR-1 com menores médias de severidade e incidência de plantas doentes, sendo avaliados como promissores para uso em programas de melhoramento genético do meloeiro visando resistência ao patógeno. Para a reação a A. avenae, foram avaliados 50 acessos de meloeiro em estufa e em condições de campo. Realizou-se inoculações com suspensão bacteriana na concentração de1, 0 x 108 UFC ml-1.Avaliou-se folhas (em ambiente controlado), folhas e frutos (em campo) com os sintomas da bacteriose. O acesso C-AC-12 possui resistência intermediaria a Acidovorax avenae / 2017-07-04

Alternaria spot, caused by Alternaria tenuis, is an important disease of cladodes of the prickly pear cactus (Nopalea cochenillifera) in Brazil. There are no standard methods for assessment of the disease, so a standard area diagram set (SAD) was developed based on disease severity encompassing 2, 4, 7, 12, 22 and 40% of the cladode area spotted. SAD was validated by 10 raters, who analysed 50 cladodes with a range of disease severity, without and with SAD as an assessment aid. The accuracy, precision, reproducibility and repeatability of the estimates with and without the scale were determined using simple linear regression analysis. Without SAD the accuracy and precision of raters estimates were poor, with significantly constant and systematic bias, and determination coefficients (R2) ranging from 0.56 to 0.78. When raters employed SAD, significant reductions were observed in both constant and systematic bias, with R2 ranging from 0.91 to 0.96. In fact, raters achieved the highest repeatability (mean R2 = 0.95) and reproducibility (R2 0.80 in all cases) of estimates when using SAD. The proposed SAD set is suitable for assessment of Alternaria spot of prickly pear cladodes and improves the accuracy and precision of assessments. / A mancha de alternária, causada por Alternaria tenuis, foi detectada em cladódios de palma forrageira miúda (Nopalea cochenillífera) no Brasil em 2001 e, desde então, os relatos de sua ocorrência é conseqüente defoliação de palmas no campo se tornou constante. Devido à inexistência de métodos padronizados para quantificação desta doença desenvolveu-se uma escala diagramática com os seguintes níveis de área lesionada: 2, 4, 7, 12 ,22 e 40%. A validação da escala foi realizada por 10 avaliadores que estimaram a severidade da mancha de alternaria em 50 imagens de cladódios com diferentes níveis de intensidade da doença. A validação se deu em três etapas: i. sem o uso da escala; e ii. Primeira avaliação com a escala; e iii. Segunda avaliação com a escala. O intervalo entre etapas foi de 15 dias. A acurácia, precisão, reprodutibilidade e repetibilidade das estimativas foram avaliadas por meio de análise de regressão linear simples entre a severidade real e a estimada, com e sem auxílio da escala. A escala confeccionada foi de fácil utilização e proporcionou melhoria significativa nas estimativas de severidade, possibilitando bons níveis de acurácia e excelentes níveis de precisão, reprodutibilidade e repetibilidade, podendo ser utilizada em levantamentos de campo, estudos epidemiológicos e comparação de medidas de controle da doença.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The occurrence of disease has been one of the main problems of the sunflower crop over the years. The objective of this study was to evaluate the effect of irrigation and the application of fungicides on the occurrence of diseases and yield of achenes of two genotypes of sunflower crop in the main and second crop season in the central region of Rio Grande do Sul. The experiments were carried out at Plant Science Department of the Federal University of Santa Maria, Santa Maria, RS, Brazil during the main season at 2007 and the second crop season of 2008. Following growth and development of plants during the crop season through phenometrical and phenological observations. The meteorological data were collected in the center of the experimental area with an automatic weather station and psychrometric pairs at different levels. Twelve treatments were used arranged in a completely randomized design with four replications. The treatments consisted of irrigated and non irrigated controls and different forms of protection with fungicide according to the accumulated severity values (SV) estimated by the FAST (VS = 16, 22, 28) without irrigation and with irrigation and protection with fungicide with 16 VS. The theoretical values of severity (VS) were calculated using the FAST system, considering the duration of the period with relative humidity greater than 90% and air temperature during this period. When the values of the severity of the treatment were achieved the fungicide was applied, and a new count of VS began. The progress of the disease was analyzed based on weekly observations of the severity of the symptoms of the disease in three plants per plot. It was found that irrigation increases the productivity of achenes of sunflower cultivation in the main season, provided that weather conditions are not favorable for the occurrence of the alternaria blight and Septoria leaf blight, or that fungicides to control these diseases are applied before flowering. In the second crop season the effect of irrigation on yield of achenes is negative due to higher occurrence of the alternaria blight and Septoria leaf blight in sunflower. The prediction of the occurrence of diseases in sunflower can be made from weather elements, but adjustments are needed to define the most appropriate criteria. / A ocorrência de doenças vem sendo um dos principais problemas da cultura do girassol ao longo dos anos. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da irrigação e da aplicação de fungicidas na ocorrência de doenças e na produtividade de aquênios de dois genótipos de girassol em cultivos de safra e safrinha, na região central do Rio Grande do Sul. Os experimentos foram conduzidos junto ao Departamento de Fitotecnia da Universidade Federal de Santa Maria, Santa Maria, nos períodos de safra de 2007 e safrinha de 2008, acompanhando-se o crescimento e o desenvolvimento das plantas no decorrer do ciclo da cultura através de observações fenométricas e fenológicas. Os dados meteorológicos foram coletados no centro da área experimental com uma estação meteorológica automática e com pares psicrométricos instalados em diferentes níveis. Foram utilizados doze tratamentos arranjados no delineamento inteiramente casualizado, com quatro repetições. Os tratamentos constaram de testemunha irrigada e não irrigada e de diferentes esquemas de proteção com fungicida em função dos valores acumulados de severidade (VS) estimados pelo sistema FAST (VS = 16, 22, 28) sem irrigação, bem como, com irrigação e proteção com fungicida com 16 VS. Os valores de severidade teórica (VS) foram calculados através do sistema FAST, considerando a duração do período com umidade relativa maior do que 90% e a temperatura do ar nesse período. No momento em que os respectivos valores de severidade do tratamento foram alcançados foi realizada a aplicação do fungicida e iniciou-se uma nova contagem de VS. O progresso da doença foi analisado com base nas observações semanais da severidade dos sintomas da doença em três plantas por parcela. Verificou-se que a irrigação aumenta a produtividade de aquênios de girassol no cultivo de safra, desde que as condições meteorológicas não sejam favoráveis para a ocorrência de mancha de alternaria e septoriose, ou desde que se aplique fungicidas para o controle dessas doenças antes da floração. Na safrinha o efeito da irrigação na produtividade de aquênios é negativo devido à maior ocorrência de mancha de alternaria e septoriose em girassol. A previsão de ocorrência de doenças em girassol pode ser feita a partir de elementos meteorológicos, mas são necessários ajustes para definir os critérios mais adequados.

This study aimed to determine the occurrence of values of severity of injury caused by alternaria leaf spot and water deficit during the developmental cycle of three genotypes of sunflower and its relationship with meteorological conditions in seven sowing dates. In addition, aimed to quantify the final yield of grain and determine its relationship with water deficit and alternaria leaf spot severity for three sunflower genotypes grown in seven sowing dates. Rainfed experiments with three sunflower genotypes were conducted in Santa Maria nanthly planting dates from August 2007 to February 2008. Phenometric, phenological and alternaria leaf spot severity observations wise made. The soil water balance was calculated resulting in daily variation of water storage in the soil, the actual crop evapotranspiration and water deficit, based on data obtained with an automatic and a conventional weather stations. The highest values of final disease severity were observed in the sixth planting date for the three genotypes grown, indicating that the later the planting date the greater risk of alternaria leaf spot. There is a close relationship between days of healthy leaf area, area under the curve of progress of the disease, severity of observed final alternaria leaf spot and yield of achenes of sunflower. The highest yield for the three genotypes was obtained in the first two sowing dates and sowing after November should be availed in Santa Maria-RS. / Neste trabalho objetivou-se determinar a ocorrência de valores de severidade de injúria causada por mancha de alternaria e a ocorrência de deficiência hídrica ao longo do ciclo de desenvolvimento de três genótipos de girassol e sua relação com as condições meteorológicas e quantificar a produtividade final de aquênios e verificar sua relação com a ocorrência de deficiência hídrica e de severidade por mancha de alternaria para os três genótipos de girassol em sete datas de semeadura. Para isso, foram conduzidos experimentos não irrigados em sete épocas de semeadura, distribuídas de agosto de 2007 até fevereiro de 2008, com três diferentes genótipos de girassol. Foram realizadas observações fenométricas, fenológicas e de severidade da mancha de alternaria. Foi calculado o balanço hídrico diário do solo, obtendo-se valores diários da variação de armazenamento de água no solo, da evapotranspiração real da cultura e a deficiência hídrica, a partir de dados obtidos das estações meteorológicas automática e convencional de Santa Maria. Os maiores valores de severidade final foram observados na sexta época para os três genótipos cultivados, mostrando que quanto mais tardia a época de semeadura maior é o risco de ocorrência de mancha de alternaria. Verificouse que existe estreita relação entre dias de área foliar sadia, área abaixo da curva de progresso da doença, severidade final observada de mancha de alternaria e a produtividade de aquênios de girassol. A maior produtividade para os três genótipos é obtida nas duas primeiras épocas de semeadura, devendo ser evitadas as semeaduras após novembro em Santa Maria-RS.

Submitted by Claudia Rocha (claudia.rocha@udesc.br) on 2018-02-27T13:53:05Z No. of bitstreams: 1 PGPV16MA203.pdf: 908261 bytes, checksum: 6995a58175258b823c7f65f05960ce84 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-27T13:53:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV16MA203.pdf: 908261 bytes, checksum: 6995a58175258b823c7f65f05960ce84 (MD5) Previous issue date: 2016-03-30 / Capes / Some fungi remain associated with the bean seeds during storage, it can remain viable until the sowing date. The first study aimed to evaluate the survival and viability of the fungi associated with bean seeds and determine the possibility of seed seed – to – seedling transmission. The seeds were stored during six months in seed storage units, which corresponds to the inter harvest in southern Brazil. Every 45 days bean samples of the cultivars BRS Estilo seeds, IPR Tanagará, IPR Tuiuiu and IPR Uirapuru, were sent to the Plant Pathology Laboratory at UDESC. The seeds of each cultivar and lot were disinfected and subjected to seed health testing on potato dextrose agar culture (PDA) and V8 (tomato juice) and the incubation method on roll paper. The incidence of fungi in storage time function data were submitted to regression analysis. The fungus Alternaria sp. was detected in all varieties and fite showing cultivars reduction effectiveness average 48.4% to 16.7% and viability of 34.5% at the end of the storage period. The fungi Aspergillus, Penicillium sp., Fusarium graminearum, Fusarium semitectum, Phomopsis sp., Colletotrichum lindemuthianum and Sclerotinia sclerotiorum were also detected in the health tests, but were not observed at all times, not being possible to make linear incidence equations. Alternaria leaf spot symptoms were not detected at the of BRS Estilo, IPR Tangará, and IPR Tuiuiu cultivarsIn the field, als symptons were not detected at the seedling stage for all cultivars tested. The second study aimed to test fungicides for BRS Estilo and IPR Tuiuiu bean seeds treatment for control of the fungus Alternaria sp. and its effect on plant emergence and height, root length and dry weight. The tests were developed in the laboratory and greenhouse. Fluazinam, fluxapyroxad + carbendazim + thiram, metalaxyl + thiabendazole + fludioxonil, metalaxyl + fludioxonil + carbendazim + thiram, metalaxyl + fludioxonil and thiophanate methyl + fluazinam obtained incidence control between 93% to 100%, assigning the good performance of these mixture to the fluazinam, tiram and fludioxonil active ingredients. The fungus Alternaria sp. had no effect on seedling emergence, plant height, root length and dry weight / Alguns fungos permanecem associados às sementes de feijão durante o armazenamento, podendo se manter viáveis até a data de semeadura. O primeiro estudo objetivou avaliar a sobrevivência e viabilidade de fungos associados às sementes de feijão e determinar a possibilidade de transmissão do inóculo da semente para a plântula. As sementes ficaram armazenadas durante seis meses em unidades de beneficiamento de sementes, o que corresponde ao período de entressafra na região Sul do Brasil. A cada 45 dias amostras de sementes de feijão cultivares BRS Estilo, IPR Tangará, IPR Tuiuiu e IPR Uirapuru, foram enviadas ao Laboratório de Fitopatologia da Universidade do Estado de Santa Catarina. As sementes de cada cultivar e lote foram desinfestadas e submetidas ao teste de sanidade de sementes em meio de cultura batata-dextrose-ágar (BDA) e V8 (Suco de tomate) e ao método de incubação em rolo de papel. Os dados de incidência dos fungos em função do tempo de armazenamento foram submetidos à análise de regressão. O fungo Alternaria sp. foi detectado em todas as cultivares e lotes mostrando redução de incidência na média das cultivares de 48,4% para 16,7% e viabilidade de 34,5% ao final do período de armazenamento. Os fungos Aspergillus sp, Penicillium sp., Fusarium graminearum, Fusarium semitectum, Phomopsis sp., Colletotrichum lindemuthianum e Sclerotinia sclerotiorum também foram detectados nos testes de sanidade, porém não foram constatados em todas as épocas, não sendo possível gerar equações lineares de incidência. Não foi detectado sintomas de mancha de alternaria em plantas jovens de feijão das cultivares BRS Estilo, IPR Tangará, IPR Tuiuiu e IPR semeadas em lavoura no município de Muitos Capões, RS. O segundo estudo teve como objetivo testar fungicidas no tratamento de sementes de feijão BRS Estilo e IPR Tuiuiu visando o controle do fungo Alternaria sp. e seu efeito na emergência e altura de planta, comprimento de raiz e massa seca. Os testes foram desenvolvidos no laboratório e em casa de vegetação. Os fungicidas fluazinam, fbsf 01 + carbendazim + tiram, metalaxil + tiabendazol + fludioxonil, metalaxil + fludioxonil + carbendazim + tiram, metalaxil + fludioxonil e tiofanato metílico + fluazinam obtiveram controle do fungo de 93% a 100%, atribuindo-se o bom desempenho destas misturas aos princípios ativos fluazinam, tiram e fludioxonil. O fungo Alternaria sp. não influenciou na emergência de plântulas, altura de planta, comprimento de raiz e massa seca

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV10MA034.pdf: 1439904 bytes, checksum: 4db5cc7ffec224395655a5207d466072 (MD5) Previous issue date: 2010-12-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Tomato plants (Solanum lycopersicum L.) cultivated under conventional production systems are frequently disturbed by insects and diseases. Synthetic organic pesticides that are used to manage tomato crops have been harmful to human being and environment as well. Fruits of tomato are very sensitive to handling and its quality is highly influenced by the crop system and post-harvest practices. The objective of this research was to evaluate the effect of high dilution preparations to manage pest and disease, and post-harvest conservation of tomatoes under organic production systems. Experiments were conducted as follow: a) Two experiments under field conditions; b) one experiment in greenhouse; c) one bio-assay concerning post-harvesting; d) twelve bio-assays in vitro conditions. The experiments were conducted in the Lages Experimental Station area of EPAGRI and at Centro Agroveterinario of University of Santa Catarina State, SC. Treatments consisted of high dilutions of Staphysagria, Arsenicum album, Sulphur at 12CH (centesimal hahnemaniana dilution), and Arnica montana, Sulphur, tomato, and jua (Solanum aculeatissimum), nosodes at 12 and 24DH. Bourdoux mixture at 0.3%, Cupric formulation EEC at 50 ppm, and Bacillus thuringiensis were included as standard treatments. Data were from field experiments consisted of septoriosis incidence (Septoria lycopersici), insect occurrence, damage caused by Agathomerus sellatus, yields, and fruit quality attributes. Data analysis was performed throughout statistical package. Results showed that Staphysagria 12CH and Arnica Montana 12DH could increase tomato fruit weigh. Damage caused by tomato caterpillars were reduced by spraying Sulphur 12CH and Bacillus thuringiensis. B. thuringiensis reduced also the incidence of septoriosis. High dilution preparation interfered to insect occurrence and reduced the damage of Agathomerus sellatus in the stages of larvae and adults. Tomato plants treated by jua nosodes at 12 and 24CH increased the SST (° Brix) contents, which gives better qualities of processing and palatability, as well. In the greenhouse experiment, it was evaluated the treatments of Arnica montana, Sulphur, tomato and jua nosodes, all at 12 and 24DH dinamization. Bourdoux mixture at 0.3% and cupric formulation EEC at 50 ppm were considered as standard treatments. It was observed that tomato nosodes at 12DH and 24DH supressed the septorioris incidence. In the post-harvest bio-assay, fruits were treated with Calcarea carbonica at 6, 12, 24CH dinamizations. The evaluation was concerning chemical contents and physical attributes. Calcarea carbonica post-harvest treatment did not affected the acidity, SST (° Brix), hardness or the weight losses of tomato fruits. However, Calcarea carbonica 24CH delayed the fruit maturation in such way that the kind sauce fruit was reduced. In the laboratory bio-assays the follow high dilution preparations were studied: Staphysagria, Arsenicum album, and Nitricum acidum at 6, 12, 25, 30, 50, 60, 80, and 100CH 11 dinamizations. All preparations were tested in two media combined by two application methods into Petry dishes with colonies of the fungus Alternaria solani. Bioassay was studied by measuring the diameter of the colonies. The measurements were made from 24h until the 10th day after install the assays. It was observed that the media with basic composition were more suitable to screening high dilution preparations against A. solani before to test in the field. The application method of high dilution preparations over the fungus colony was better than incorporated one. The use of high dilution preparations has the potential effect to replace pesticide used on tomato crops and it would be a suitable management strategy to fill legal requirements for organic production systems. / O tomateiro (Solanum lycopersicum L.) sob sistema de produção convencional está constantemente sujeito à pragas e doenças. Pesticidas orgânicos sintéticos usados para seu manejo podem causar graves pertubações ao meio ambiente e a saúde humana. Frutos de tomateiro também são sensíveis ao manuseio e sua qualidade é afetada pelo sistema de cultivo e pelas práticas de conservação pós-colheita. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de preparados em altas diluições no manejo fitossanitário e pós-colheita da cultura do tomateiro sob sistema orgânico de produção. Foram conduzidos (a) dois experimentos em condições de campo, (b) um experimento em casa de vegetação, (c) um ensaio de conservação pós-colheita em laboratório e (d) doze bioensaios in vitro. Os experimentos foram conduzidos na Estação Experimental da EPAGRI de Lages e, no Centro de Ciências Agroveterinárias da UDESC. Os tratamentos avaliados nos experimentos a campo foram os preparados em altas diluições de Staphysagria, Arsenicum album, Sulphur na dinamização 12CH (centesimal hahnemaniana); Arnica montana, Sulphur, nosódios de tomateiro e de juá (Solanum aculeatissimum), nas dinamizações 12 e 24DH (decimal hahnemaniana). Calda bordalesa 0,3%, Calda cúprica EEC a 50 ppm e Bacillus thuringiensis foram incluídos em doses ponderais e considerados tratamentos padrões. Nos experimentos a campo avaliou-se a incidência de septoriose (Septoria lycopersici), ocorrência e danos por insetos, produtividade e atributos químicos de qualidade dos frutos. A análise dos dados mostrou que os preparados Staphysagria 12CH e Arnica montana 12DH proporcionaram a maior peso de frutos. Danos causados por brocas foram reduzidos com a aplicação de Sulphur 12CH igualando a Bacillus thuringiensis. B. thuringiensis também reduziu a incidência de septoriose. Observou-se que os preparados em altas diluições interferiram na ocorrência de insetos em plantas de tomateiro e reduziram os danos causados por Agathomerus sellatus, tanto na fase larval quanto na fase adulta. Tomateiros tratados com nosódio de juá 12 e 24DH tiveram incremento no teor de SST (° Brix) dos frutos, atributo que melhora a palatabilidade e a qualidade para a industrialização. No experimento em casa de vegetação, avaliou-se Arnica montana, Sulphur, nosódios de tomateiro e de juá, nas dinamizações 12 e 24DH. Calda bordalesa 0,3% e calda cúprica EEC a 50 ppm também foram incluídas em doses ponderais e considerados tratamentos padrões. Observou-se que o nosódio de tomateiro na 12DH e 24DH suprimiram a incidência de septoriose nas plantas tratadas. No ensaio em laboratório de conservação pós-colheita, frutos foram tratados com Calcarea carbonica nas dinamizações 6, 12, 24CH. Avaliou-se atributos químicos e físicos dos frutos. Calcarea carbonica em tratamento pós-colheita não interferiu na acidez, SST (° Brix), firmeza e perda de massa fresca dos frutos. Embora, Calcarea9 carbonica 24CH retardasse a formação de frutos do tipo molho. Nos estudos in vitro foram avaliados os preparados Staphysagria, Arsenicum album e Nitricum acidum nas dinamizações 6, 12, 25, 30, 50, 60, 80 e 100CH, em meios de cultivo básico e enriquecido e, em dois métodos de aplicação. Nos bioensaios foi avaliado o diâmetro das colônias do fungo Alternaria solani iniciando-se 24 horas após a instalação do ensaio e estenderam-se até o décimo dia. Observou que meios de cultivo com composição básica foram mais adequados para o screening de preparados em altas diluições e suas dinamizações, em estudos in vitro com A. solani. A aplicação dos preparados em altas diluições sobre a colônia do fungo foi o método mais adequado para estudos in vitro. Preparados em altas diluições tem potencial para serem eficazes na substituição de agrotóxicos que são utilizados na cultura do tomateiro, e poderiam ser adequados para preencherem requisito legal em sistemas orgânicos de produção

O presente estudo objetivou avaliar a microbiota fúngica e a ocorrência de micotoxinas por Cromatografia Líquida de Alta Eficiência acoplada à Espectrometria de Massas em amostras de grãos de trigo recém-colhidas e armazenadas. Os resultados revelaram a predominância do gênero Alternaria nas amostras de todas as coletas, seguido de Epicoccum (12,6%), Fusarium (8,3%) e mais 16 outros gêneros de fungos filamentosos. As espécies de Fusarium e Alternaria foram identificadas utilizando métodos moleculares, sendo F. graminearum e A. alternata as espécies mais frequentes. De 70 amostras, 69 (98,6%) estavam contaminadas com a toxina DON (210-2910 ppb) e 3 (4,3%) amostras contaminadas com a toxina ZEA (20-30,1 ppb). O nível de contaminação por DON é inferior aos limites estabelecidos recentemente pela legislação brasileira (3000 ppb), porém superam os limites da Comunidade Européia (1750 ppb). É prudente que se realize um monitoramento contínuo de grãos de trigo a fim de avaliar a exposição dos consumidores às contaminações e estabelecer diretrizes de segurança alimentar. / The present study aimed to evaluated the mycoflora and occurrence of mycotoxins by high performance liquid chromatography coupled to tandem mass in freshly harvested and stored wheat samples. The results showed the predominance of genus Alternaria in all samples, followed by Epicoccum (12.6%), Fusarium (8.3%) and over 16 other genera of filamentous fungi. The species of Fusarium and Alternaria were identified using molecular methods, and F. graminearum and A. alternata were the most frequent species. Of 70 samples, 69 (98.6%) were contaminated with toxin DON (210-2910 ppb), and 3 (4.3%) samples contaminated with the toxin ZEA (20-30.1 ppb). The level of DON contamination is below of the limits recently established by Brazilian legislation (3000 ppb), but exceed the limits of the European Community (1750 ppb). It is prudent to perform a continuous monitoring of wheat to assess consumer exposure to contaminants and establish guidelines for food safety.

Orientador: Marcos Antonio Machado / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-19T08:49:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Stuart_RodrigoMakowiecky_D.pdf: 10894472 bytes, checksum: 8404d2f1c15c931acb79f33e98ddde90 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: O patótipo tangerina do fungo Alternaria alternata produz a toxina hospedeiro específica ACT que afeta tangerinas e seus híbridos e causa a doença conhecida como mancha marrom de alternaria (MMA). A toxina ACT causa necrose em plantas susceptíveis, afetando ramos, folhas novas e frutos. Os sintomas incluem pontos marrons a negros circundados por um halo amarelado. Laranjas doces eram consideradas resistentes à doença uma vez que MMA nunca havia sido descrita no campo. Foi demonstrado que uma linhagem do fungo A. alternata produtor de toxina ACT é capaz de penetrar e colonizar de forma assintomática folhas de laranja 'Pera' sem perder a capacidade de causar necrose em genótipos susceptíveis. Microscopia óptica, inoculação e isolamento de A. alternata em plantas de laranja doce seguida pela inoculação cruzada em folhas susceptíveis de tangor 'Murcott', em adição a detecção por PCR do fungo em folhas assintomáticas de laranja doce no campo confirmam que laranja 'Pera' atua como hospedeiro assintomático do patógeno. A análise de genes (RT-qPCR) e proteínas (2DE) expressas durante a infecção com o fungo demonstrou que diferentes vias de sinalização foram ativadas em plantas de citros em resposta a A. alternata. Durante a resistência plantas responderam ativando as vias de sinalização mediadas por etileno e ácido jasmônico, as quais estão tipicamente envolvidas na defesa de plantas contra microrganismos necrotróficos. Aparentemente a produção de etileno também é requerida durante a susceptibilidade. Genes envolvidos na síntese de etileno aparecem induzidos durante a infecção e desenvolvimento de sintomas. Durante a infecção assintomática as plantas cítricas ativaram genes e proteínas associadas à síntese de fenilpropanóides, indicando o possível papel destes em plantas de laranja / Abstract: The tangerine pathotype of Alternaria alternata produces the host-specific ACT-toxin that affects mandarins and their hybrids and causes the disease known as Alternaria brown spot (ABS). ACT-toxin causes necrosis in susceptible plants, and the disease affects twigs, young leaves and fruits. The symptoms include brown to black necrotic spots that are surrounded by a yellow halo. Sweet oranges were considered resistant to the disease since ABS symptoms have never been reported in the field. It was demonstrated that an ACT-toxin-producing strain of A. alternata is able to penetrate and colonize Pera sweet orange leaves asymptomatically without losing its ability to cause necrosis on susceptible genotypes. Light microscopy, inoculation and recovery of A. alternata from sweet orange leaves followed by subsequent cross-inoculation in susceptible leaves of Murcott tangor and PCR detection of the fungus in sweet orange symptomless leaves collected in the field confirmed that Pera sweet orange may act as an asymptomatic host for the pathogen. The analysis of genes (RT-qPCR) and proteins (2DE) expressed during fungal infection demonstrated that different signaling pathways were activated in citrus plants in response to A. alternata. During resistance, plants respond activating ethylene and jasmonic acid signaling pathways which are typically involved in plant defense against necrotrophic pathogens. Apparently the production of ethylene is also required during susceptibility. Genes involved in ethylene biosynthesis appear to be induced during infection and symptoms development. During asymptomatic infection, citrus plants activate genes and proteins associated to phenylpropanoids biosynthesis, indicating their possible role in sweet orange plants response to the disease / Doutorado / Genetica de Microorganismos / Doutor em Genetica e Biologia Molecular

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The tomato (Lycopersicon esculentum Mill) is an important crop in the world and an important product for trade "in nature and for industry. The amount of fungicides used in tomato crop for control of diseases is high and contributes significantly to production costs of tomato, besides the high risk of intoxication of the applicator and environmental problems. So, the use of disease forecasting systems based on mathematical models to manage the applications of fungicides for foliar diseases control in tomato may to reduce production costs, by decreasing the number of fungicide applications and machinery operation during the culture cycle. The objective was to test the systems for predicting occurrence of late blight (Phytophthora infestans) and early blight (Alternaria solani) on irrigated tomato under two climatic conditions and estimate the cost of deployment. Three experiments were conducted, the first experiment in the spring of 2007, in Santa Maria - RS. The other two were accomplished in Cristalina - GO. There were two seasons of transplanting (01/04/08 and 03/05/08). Used the hybrid U2006 (UNILEVER), with growth habit determined. The spacing between the rows of plants was 1.3 m between plants in rows of 0,3 m. The randomized block design with three replications was used, each plot of 5,2 m wide, consisting of 4 rows of plants with 5 m long. The systems for predicting disease FAST, to early blight, and Blitecast to late blight were used. Irrigation was performed by spraying in Santa Maria and sprinkler, surface drip and subsurface in Cristalina-GO. The results showed that the use of disease forecasting systems is the most appropriate way to control diseases in tomato, as with the use of disease forecasting systems that can significantly reduce the number of fungicide applications in relation the calendar, based on weekly applications in areas with conditions generally unfavorable to the development of disease. Considering the scenarios of reductions of the number of fungicide applications (30, 43 and 65%), compared to the weekly application, in climatic conditions unfavorable to disease development, it is possible to recover the costs of implementing the system prediction in all scenarios. / A cultura do tomate (Lycopersicon esculentum Mill) é uma das mais expressivas culturas no cenário agrícola mundial, constituindo importante produto para o comércio in natura e indústria de extratos. O volume de fungicidas utilizado na cultura do tomateiro no controle das principais doenças é elevado e contribui significativamente nos custos de produção de tomate, além do elevado risco de intoxicação do aplicador e dos problemas ambientais. Nesse sentido, utilização de sistemas de previsão e aviso, baseados em modelos matemáticos para gerenciar o manejo das aplicações de fungicidas para o controle das principais doenças foliares no tomateiro poderá auxiliar na redução dos custos de produção, através da diminuição do número de aplicações de fungicidas e de operações de máquinas durante o ciclo de desenvolvimento da cultura. O objetivo do trabalho foi testar os sistemas de previsão de ocorrência de requeima e alternaria em tomateiro industrial irrigado sob duas condições climáticas e estimar o seu custo de implantação. Foram realizados três experimentos, o primeiro experimento no segundo semestre de 2007, em Santa Maria RS. Os outros dois foram realizados no município de Cristalina GO. Realizaram-se duas épocas de transplante (01/04/08 e 03/05/08). Utilizou-se a cultivar híbrida U2006 (UNILEVER), de hábito de crescimento determinado. O espaçamento entre as fileiras de plantas foi de 1,3 m e entre as plantas nas fileiras de 0,3 m. Utilizou-se o delineamento experimental de Blocos ao Acaso com três repetições, sendo cada parcela de 5,2 m de largura, composta de 4 fileiras de plantas com 5 m de comprimento. Utilizaram-se os sistemas de previsão de doenças FAST, para mancha de alternaria, e BLITECAST, para requeima. A irrigação foi realizada por aspersão em Santa Maria e por aspersão, por gotejamento superficial e subsuperficial em Cristalina. Os resultados mostraram que o uso de sistemas de previsão de doenças é a maneira mais adequada para o controle de doenças na cultura do tomateiro, pois com o uso de sistemas de previsão de doenças se consegue reduzir significativamente o número de aplicações de fungicidas, em relação ao calendário semanal, em regiões com condições geralmente desfavoráveis ao desenvolvimento de doenças. Considerando-se os cenários de reduções do número de aplicação de fungicidas (30, 43 e 65%), em relação ao calendário semanal de aplicação, condições climáticas desfavoráveis ao desenvolvimento de doenças, é possível recuperar os custos de implantação do sistema de previsão em todos os cenários.