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Reconhecimento de ações em vídeo utilizando descritores de pontos de interesse espaço-temporais (STIPS)Almeida, Ana Paula Gonçalves Soares de 30 January 2017 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Mecânica, 2017. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2017-03-02T17:09:14Z
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2017_AnaPaulaGonçalvesSoaresdeAlmeida.pdf: 7525477 bytes, checksum: c35564af81c0b7ab47f3eeeffc18b743 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-04-04T22:01:18Z (GMT) No. of bitstreams: 1
2017_AnaPaulaGonçalvesSoaresdeAlmeida.pdf: 7525477 bytes, checksum: c35564af81c0b7ab47f3eeeffc18b743 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-04T22:01:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1
2017_AnaPaulaGonçalvesSoaresdeAlmeida.pdf: 7525477 bytes, checksum: c35564af81c0b7ab47f3eeeffc18b743 (MD5) / Nas últimas três décadas, o reconhecimento de ações humanas em vídeo se tornou um tópico amplamente estudado na visão computacional e várias técnicas foram apresentadas para solucionar esse problema com robustez e eficiência. Dentre essas técnicas, os trabalhos que utilizam descritores com características locais espaço-temporais chamam a atenção por terem a capacidade de fazer o reconhecimento em ambientes não-controlados, ou seja, ambientes próximos ao do mundo real. Neste trabalho são avaliadas duas técnicas de pontos de interesse espaço-temporais, uma sendo o estado-da-arte e uma evolução da primeira, para o reconhecimento de ações humanas em sequências de imagens. Estas são colocadas frente a frente, comparando os parâmetros de configuração e classificando a matriz de pontos obtidos de modo que o reconhecimento de ações tanto em bases de vídeos complexas quando em bases simples possa ser realizado. A metodologia proposta utiliza os pontos de interesse em sua forma pura, como um descritor, uma abordagem inédita de ambas as técnicas apresentadas, bem como realizando a classificação com três tipos de classificadores distintos demonstrando a robustez e eficiência exigidas no processo de reconhecimento de ações em vídeo. / Over the last three decades, human action recognition has become a widely studied topic in computer vision and several techniques have been presented to solve this problem in a robust and effective way. Among these techniques, the works that use local spatio-temporal characteristics draw attention because they have the capacity to recognize human action in uncontrolled environments, that is, environments that are similar to the real world. In this work, two techniques of spatio-temporal points of interest are presented, one in stateof- the-art and an evolution of the first, for the recognition of human actions in sequences of images. They are placed face to face, comparing the configuration parameters and classifying the obtained points matrix so that the recognition of actions both in complex bases and in simple bases can be performed. The proposed methodology uses the interest points in its pure form as a descriptor, an unseen approach, not even by the main author of both techniques presented, and classified them with three distinct classifiers, showing the robustness and efficiency required in the process of action recognition in video.
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Distribuição dos Dados em Ambientes de Data Warehousing: O Sistema WebD2W e Algoritmos Voltados à Fragmentação Horizontal dos DadosDutra de Aguiar Ciferri, Cristina January 2002 (has links)
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Previous issue date: 2002 / Um ambiente de data warehousing consolida dados de interesse de provedores de
informação autônomos, distribuídos e heterogêneos em uma única base de dados, chamada
de data warehouse. Esse ambiente garante eficiência e flexibilidade na recuperação de
informações estratégicas voltadas aos processos de gerência e tomada de decisão, e mantém
os dados integrados no data warehouse com alta qualidade e confiabilidade. Os dados
extraídos de cada provedor de informação são traduzidos, filtrados quando necessário e
integrados com informações relevantes de outros provedores antes de serem armazenados
no data warehouse. Este processo de carregamento dos dados é realizado de forma que
consultas OLAP (on-line analytical processing) possam ser respondidas diretamente a
partir do data warehouse, sem a necessidade de acesso aos provedores de informação
originais. Em geral, o data warehouse representa uma única base de dados centralizada.
Distribuir os dados armazenados nessa base de dados levando-se em consideração as
características intrínsecas de aplicações de data warehousing e as necessidades dos
usuários de sistemas de suporte a decisão apresenta várias vantagens, porém introduz novos
desafios a ambientes de data warehousing. Dentro deste contexto, esta tese tem por
objetivo propor o sistema WebD2W, enfocando um dos seus principais objetivos: a
distribuição dos dados do data warehouse. O sistema WebD2W (Web Distributed Data
Warehousing) é um ambiente de data warehousing distribuído clienteservidor que visa não
somente a distribuição dos dados do data warehouse, mas também o acesso distribuído a
esses dados usando a tecnologia Web como infra-estrutura. As suas metas genéricas
consistem em: aumentar a disponibilidade dos dados do data warehouse, aumentar a
disponibilidade de acesso a esses dados, manter a consistência dos dados distribuídos,
proporcionar aumento no desempenho do processamento de consultas submetidas ao
ambiente de data warehousing, garantir as transparências de fragmentação, de replicação e
de localização na manipulação dos dados, e oferecer suporte a um grande número de
usuários. Além de apresentar a arquitetura do sistema WebD2W, esta tese também propõe
um conjunto de algoritmos voltados à fragmentação horizontal dos dados do data
warehouse: algoritmo FHU D, algoritmo FHU DHA, algoritmo FHM D, algoritmo
FHM DHA e algoritmo FH MN. Esses algoritmos são baseados nos conceitos de grafo de
derivação, de propagação das dimensões sendo fragmentadas aos vértices do grafo e de
fragmentação ou reconstrução de agregações. Os algoritmos propostos constituem a
fundamentação para o sistema WebD2W. Os diferenciais dos algoritmos propostos nesta
tese referem-se ao fato de que esses algoritmos: (i) levam em consideração a organização
dos dados do data warehouse em diferentes níveis de agregação; (ii) podem ser aplicados a
diferentes cenários, de acordo com as características do grafo de derivação que representa a
aplicação de data warehousing sendo fragmentada e com a dimensionalidade do processo
de fragmentação; (iii) priorizam a execução de consultas drill-down e roll-up nos sites
individuais, além de enfocarem consultas slice and dice; (iv) independem da forma de
armazenamento dos dados multidimensionais em estruturas de dados relacionais (isto é,
sistemas ROLAP) ou em estruturas de dados especializadas (ou seja, vi sistemas MOLAP);
(v) podem ser aplicados tanto em situações nas quais todas as agregações que podem ser
geradas a partir dos dados detalhados são armazenadas no data warehouse quanto em
situações nas quais nem todas essas agregações são materializadas no data warehouse; e
(vi) oferecem um tratamento simétrico das dimensões e das medidas numéricas. Por fim, o
sistema WebD2W foi contextualizado por meio de uma aplicação de data warehousing real
voltada à análise de diagnósticos de saúde no Município de Belo Horizonte. Essa aplicação
foi investigada em termos da importância da distribuição dos seus dados e do uso da Web
como infra-estrutura de acesso. Em particular, um subconjunto dos dados da referida
aplicação foi fragmentado horizontalmente pelo algoritmo FHU D
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Virtual.prob- ambiente virtual para auxílio e verificação do aprendizadoISLABÃO, Márcia Häfele January 2004 (has links)
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Previous issue date: 2004 / Este trabalho apresenta o ambiente virtual de aprendizagem, Virtual.Prob, cujo objetivo
´e auxiliar o aluno no estudo de Probabilidade da disciplina Estat´ıstica e Probabilidade
para Computa¸c ao (ET 586), dos cursos de Ci encia da Computa¸c ao e Engenharia da
Computa¸c ao, ambos da UFPE.
Virtual.Prob ´e baseado na t´ecnica de aprendizado de m´aquina conhecida como Redes
Bayesianas (RB). As RB s ao formadas por uma parte qualitativa e uma quantitativa.
A parte qualitativa ´e o modelo Gr´afico (Grafo Ac´ıclico Direcionado - GAD) onde as
vari´aveis s ao os n´os que comp oem a rede. Esta inclui tamb´em as regras (links), que
s ao as rela¸c oes de depend encia entre as vari´aveis. A parte quantitativa ´e o conjunto
de probabilidades condicionais associadas aos arcos existentes no modelo gr´afico e as
probabilidades estimadas das vari´aveis.
No ambiente Virtual.Prob cada aluno tem sua RB, sendo nela armazenadas as probabilidades
que representam o seu desempenho em rela¸c ao ao conte´udo de cada n´o. O
ambiente conta com a presen¸ca de um assistente virtual que fornece sugest oes ao usu´ario
de acordo com o seu desempenho. No Virtual.Prob est´a dispon´ıvel ao usu´ario al´em do
conte´udo de Probabilidade, incluindo exemplos e exerc´ıcios a serem solucionados, outros
recursos, tais como ajuda, mural de not´ıcias e navega¸c ao na Web.
Virtual.Prob possui um sistema de monitora¸c ao do desempenho de cada aluno. O
professor ou monitor tem acesso a este sistema, onde as informa¸c oes fornecidas tornamse
importantes ferramentas para verificar em que t´opicos espec´ıficos os alunos est ao
encontrando dificuldades. O aluno tamb´em tem acesso ao seu pr´oprio desempenho,
tornando poss´ıvel que ele verifique em que determinado assunto deve concentrar esfor¸cos.
O ambiente Virtual.Prob foi testado, com exito, pelos alunos dos cursos de Ci encia da
Computa¸c ao e Engenharia da Computa¸c ao (CIn-UFPE). Atrav´es dos resultados obtidos,
sugest oes de trabalhos futuros surgiram, tais como, expans ao da Rede Bayesiana e da
base de conhecimento, refinamento da proposta do assistente virtual, implementa¸c ao de
um corretor de respostas, visualiza¸c ao gr´afica e a implanta¸c ao de um chat.
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Navegação em jogos digitaisMoura Barbosa Lima e Silva, Dinara January 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Nos últimos anos, o faturamento da indústria de jogos digitais tem sido superior ao da indústria
cinematográfica americana. No Brasil, empresas especializadas na criação de tais produtos têm
crescido significativamente. Assim, é necessário investimento em pesquisas que auxiliem o
processo de design de jogos brasileiros para que eles sejam competitivos com os do mercado
internacional.
Os ambientes dos jogos eletrônicos estão repletos de sinais de navegabilidade que influenciam o
processo de deslocamento dos usuários, por isso, falhas que comprometam o avanço do jogador
impedirão que ele conclua o jogo, frustrando-o. Norman (2005) afirma que a disposição dos
elementos em um espaço sugere uma ação a ser tomada pelo indivíduo. Além disso, o estudo da
navegação em ambientes reais tem contribuído para o aperfeiçoamento do design de sistemas de
navegação em ambientes virtuais, como websites, por exemplo. Partindo desses argumentos, o
objetivo dessa pesquisa é comparar a navegação em ambientes reais e em jogos digitais através das
informações visuais navegacionais, disponíveis em tais ambientes, e das ferramentas utilizadas no
processo de navegação.
Essa é uma pesquisa descritiva e exploratória, com análise qualitativa dos dados. Para sua
realização, analisamos dezessete jogos no intuito de identificarmos os componentes navegacionais
utilizados nos mesmos. Através dos resultados dessa análise, somados à revisão da literatura,
identificamos quinze parâmetros para comparação da navegação em ambientes físicos e em jogos
digitais. A discussão dessa comparação proporcionou a sugestão de cinco critérios passíveis de
serem utilizados no balanceamento do sistema de navegação em jogos digitais.
Concluímos que existem mais diferenças do que comunalidades nos aspectos referentes à
navegação em ambientes reais e em games. No entanto, os resultados apontam que a comparação
dos dois ambientes é bastante proveitosa para compreensão e adequação dos sistemas de
navegação em jogos digitais. Observar o mundo físico é uma perspectiva bastante enriquecedora já
que a arquitetura convencional tem evoluído ao longo dos anos e pode contribuir para que o usuário
crie identificação com o cenário do jogo.
Por fim, ressaltamos que os jogos digitais são ambientes virtuais que inspiram criatividade. Muitos
elementos utilizados nesses ambientes não podem ser experimentados no ambiente real. Desse
modo, cabe ao designer apreender os conceitos e ferramentas para criação de cenários consistentes
e navegáveis, que sejam, ao mesmo tempo, inusitados, surpreendentes e provocativos
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Avaliação em educação a distância mediada pela internet: um estudo das possibilidades e limitaçõesda Silva Santos, Sandra 31 January 2008 (has links)
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Previous issue date: 2008 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A presente pesquisa teve como objetivo analisar as potencialidades dos recursos
disponíveis nos ambientes virtuais de ensino para a prática avaliativa, a fim de obter
subsídios para a construção de ferramentas que auxiliem o professor a avaliar a
aprendizagem dos alunos no contexto da EaD. Para tanto, analisamos os recursos
disponibilizados pela plataforma VirtusClass para o processo avaliativo. Tal
ambiente foi utilizado no curso de Pós-graduação Lato Sensu, na modalidade a
distância, o qual participamos ministrando a disciplina Avaliação da Aprendizagem
em EaD. Realizamos, portanto, a análise do conteúdo das interações resultantes do
uso de ferramentas síncrona (Sala de Bate-papo) e assíncronas (Mural Virtual,
Central de Documentos e Correio Eletrônico). Os resultados sinalizam que a análise
das mensagens da Sala de Bate-papo possibilita identificar concepções e
dificuldades dos participantes a respeito dos assuntos estudados, que são
expressos de forma espontânea durante a conversação. As mensagens do Mural
Virtual e Central de Documentos foram, em sua maioria, respostas às tarefas
avaliativas, apresentando-se portanto em forma de textos longos e fundamentados
na literatura consultada. Dessa forma, os dados gerados por essas ferramentas
também possibilitam analisar a compreensão dos aprendizes sobre os assuntos
abordados, mas não favorecem a discussão no ambiente além de dificultar a tarefa
do avaliador, na emissão de pareceres individuais. Concluímos que, para uma
avaliação contínua em EaD on-line, o ambiente virtual de aprendizagem adotado
pode contribuir não só possibilitando uma maior interação entre os envolvidos no
processo educativo, mas também na emissão de relatórios sobre o material
resultante dessas interações. Contudo, dependendo do nível de interatividade
incentivado no desenvolvimento da disciplina, o material gerado pode ser muito
extenso e, nesse caso, sentimos falta de recursos que nos auxiliem na seleção e
análise qualitativa desses registros
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Dispersão Do Chumbo Em Ambientes Aquáticos Da Região De Belo Jardim - PePAIVA, Ana Claudia de January 2005 (has links)
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Previous issue date: 2005 / O município de Belo Jardim-PE é drenado por rios que formam a Bacia do
Ipojuca, tendo o Rio Bitury como a microbacia mais importante. A principal
atividade industrial da cidade é a produção de baterias chumbo-ácidas, processo
que oferece riscos de contaminação ambiental por chumbo pela emissão de
efluentes para as regiões externas da área de produção. Assim, este trabalho
teve como objetivo realizar um diagnóstico da dispersão do chumbo em
ambientes aquáticos de Belo Jardim. Foram selecionados 12 pontos de coletas
distribuídos por barragens e açudes da região e determinadas as concentrações
do metal em amostras de água, material particulado em suspensão, exemplares
de peixes e perfis de sedimentos, através da técnica de Absorção Atômica com
Forno de Grafite. As concentrações de chumbo encontradas na forma dissolvida
na água (máximo de 0,04 mg/L), estiveram acima do estabelecido pela legislação
para águas de classe 2. Na forma particulada em suspensão foram encontrados
valores de até 89 mg/kg de Pb, ficando abaixo da média global de 150 mg/kg.
Para os peixes, os resultados obtidos nas análises dos músculos também se
apresentaram abaixo dos limites máximos de tolerância para contaminantes
inorgânicos em pescados, estipulado em 2 mg/kg, não oferecendo riscos de
contaminação para a população. Os sedimentos foram as matrizes que
evidenciaram os mais altos níveis de chumbo (mínimo de 21 mg/Kg e máximo de
245mg/kg) nas camadas mais superficiais, oferecendo um grande risco ao
ecossistema, pois esse compartimento representa um potencial de degradação
continuada desses ambientes
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Dispersão do chumbo em ambientes aquáticos da região de Belo Jardim-PEPAIVA, Ana Claudia de January 2005 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T17:42:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2
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Previous issue date: 2005 / O município de Belo Jardim-PE é drenado por rios que formam a Bacia do
Ipojuca, tendo o Rio Bitury como a microbacia mais importante. A principal
atividade industrial da cidade é a produção de baterias chumbo-ácidas, processo
que oferece riscos de contaminação ambiental por chumbo pela emissão de
efluentes para as regiões externas da área de produção. Assim, este trabalho
teve como objetivo realizar um diagnóstico da dispersão do chumbo em
ambientes aquáticos de Belo Jardim. Foram selecionados 12 pontos de coletas
distribuídos por barragens e açudes da região e determinadas as concentrações
do metal em amostras de água, material particulado em suspensão, exemplares
de peixes e perfis de sedimentos, através da técnica de Absorção Atômica com
Forno de Grafite. As concentrações de chumbo encontradas na forma dissolvida
na água (máximo de 0,04 mg/L), estiveram acima do estabelecido pela legislação
para águas de classe 2. Na forma particulada em suspensão foram encontrados
valores de até 89 mg/kg de Pb, ficando abaixo da média global de 150 mg/kg.
Para os peixes, os resultados obtidos nas análises dos músculos também se
apresentaram abaixo dos limites máximos de tolerância para contaminantes
inorgânicos em pescados, estipulado em 2 mg/kg, não oferecendo riscos de
contaminação para a população. Os sedimentos foram as matrizes que
evidenciaram os mais altos níveis de chumbo (mínimo de 21 mg/Kg e máximo de
245mg/kg) nas camadas mais superficiais, oferecendo um grande risco ao
ecossistema, pois esse compartimento representa um potencial de degradação
continuada desses ambientes
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Educação de líderes em diversidade, identidade, gênero e modos de existência em ambientes corporativos /Santos, Elaine Regina Terceiro dos January 2020 (has links)
Orientador: Maria Regina Momesso / Resumo: Na contemporaneidade, as questões relacionadas à diversidade e inclusão tornaram-se tema da agenda estratégica das empresas, dentro do bojo da governança corporativa. Nesse contexto, o problema de pesquisa desta dissertação foi o de identificar e refletir sobre as práticas educativas, discursivas e ações adotadas no mundo corporativo sobre diversidade, identidade, gênero e modos de existência, cujas práticas e ações estão voltadas à educação dos líderes em ambiente organizacional. Em relação aos procedimentos metodológicos, o trabalho realizou-se por meio de levantamento bibliográfico e pesquisa de campo quantitativa através da aplicação de questionário, com 15 perguntas, cuja amostra foi realizada em uma empresa multinacional com diversos polos em todo o Brasil, perfazendo a participação de 956 colaboradores. O norte teórico-metodológico centrou-se na análise de discurso, em especial na arquegenealogia foucaultiana. Recortou-se do corpus os principais discursos que trazem à tona os efeitos de “verdade” sobre diversidade, identidade, gênero e modos de existência na organização pesquisada e na concepção dos colaboradores. A partir dos dados coletados, realizou-se a análise discursiva dos resultados procurando identificar quais efeitos de sentido de “verdades” emergem nas respostas sobre as temáticas em questão, que relações de poder estão aí imbricadas e sendo o poder circular e operatório, consequentemente, que efeitos de poder positivo são produzidos para a constituição de s... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In contemporary years, issues related to diversity and inclusion have become the subject of the strategic agenda of companies, within the bulge of corporate governance. In this context, the research problem of this dissertation was to identify and reflect on educational, discursive practices and actions adopted in the corporate world on diversity, identity, gender and modes of existence, whose practices and actions are education of leaders in an organizational environment. Regarding methodological procedures, the work was carried out through bibliographic survey and quantitative field research through the application of a questionnaire, with 15 questions, whose sample was carried out in a multinational company with several centers throughout Brazil, making up the participation of 956 employees. The theoretical-methodological north focused on discourse analysis, especially in Foucaultian archegenealogy. The main discourses that bring to light the effects of "truth" on diversity, identity, gender and modes of existence in the organization surveyed and on the conception of employees were cut out of the corpus. From the collected data, the discursive analysis of the results was performed, trying to identify what sense effects of "truths" emerge in the answers on the themes in question, which power relations are there intertwined and the circular power being and operative, consequently, what positive power effects are produced for the constitution of subjectivities and how this ca... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Projeto de um ambiente 3D de visualização e reprodução de eventos capturados e interpretados a partir de ambientes físicos cientes de contexto para aplicações de preparação para emergência.Lopes, Altieres Ribeiro 25 May 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:05:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2006-05-25 / Universidade Federal de Sao Carlos / Systems for emergency preparedness support, especially those for accurate monitoring
of physical environments subjected to emergency situations, are valuable resources for
companies and civil defense public institutions, since these systems can help avoiding and/or
reducing lives and patrimony losses. Most of the existing monitoring systems described in the
literature have limitations, such as: no posterior visualization of emergency situations that
have occurred; limited to specific types of applications; inaccurate identification of risk
situations; etc. In this work, a system was proposed and evaluated that aims to overcome these
limitations through the integrated use of wireless actor and sensor networks, context aware
computing and virtual reality. The work consisted on the creation, implementation and
evaluation of a recording and playing 3D media in which physical environments subjected to
emergency situations are deployed sensors with processing and communication resources.
These sensors capture and interpret contexts, which are mapped, through a visual language,
on a 3D virtual environment that mimics the physical environment. The use of virtual reality
for visualization and access in real-time2 or afterwards of situations that are occurring in the
physical environment, through a 3D Virtual Environment, can overcome the limitations of
hypermedia interfaces or continuous media, like video, when the experiences of the real world
are very complex. This work describes the project of a recording and playing system, which
allows users to play live experiences gathered from the real world for analysis, evaluation,
monitoring and training. The novelty of the system resides in two aspects: it uses an
optimized recording technique that saves processing time and storage space; it records scene
updating commands independent from 3D Players, allowing the visualization of the
collaborative virtual environment (CVE) through any existing 3D web players. In
collaboration with the Arts and Communication Department (DAC) of UFSCar, a visual
language to prompt identification of emergency situations was created as well as an interface
to complex systems. Examples of use include the monitoring of industrial plants, flight
rehearsals, petrol exploration platforms, etc. This work is part of a collaborative Project
between the Networked Virtual Reality Lab (LRVNet) of the Computer Science Department
at UFSCar and PARADISE Lab of SITE at University of Ottawa. / Sistemas de apoio à preparação para emergências, em especial o monitoramento
preciso de ambientes físicos sujeitos a situações de emergência, são recursos importantes para
empresas e órgãos públicos de defesa civil, pois podem ajudar a evitar e/ou reduzir riscos de
perda de vidas e de patrimônio. A maioria dos sistemas de monitoramento de ambientes
físicos descritos na literatura apresenta limitações, tais como: não permitem visualização
posterior da situação de emergência; são limitados a determinados tipos de aplicação; não
permitem a identificação precisa das situações de risco; etc. Neste trabalho foi proposto e
avaliado um sistema que visa superar essas limitações, através do uso integrado de redes de
atuadores e de sensores sem fio, computação ciente de contexto e de realidade virtual. O
trabalho consistiu da criação, implementação e avaliação de um sistema de gravação e
reprodução de mídia 3D em que ambientes físicos sujeitos a situações de emergência são
munidos de sensores com potencial computacional e de comunicação. Esses sensores
capturam e interpretam contextos que são mapeados em uma linguagem visual, que é refletida
em um ambiente de realidade virtual que simula o ambiente físico. O uso de realidade virtual
para fins de visualização e acesso em tempo- real1 ou posteriormente de um ambiente que
apresenta características de segurança crítica visa superar as limitações de interfaces do tipo
hipermídia, ou mídia contínua, como vídeo, quando as experiências do mundo real são muito
complexas. No sistema criado como resultado deste trabalho, usuários podem reproduzir as
experiências capturadas do mundo real para análise, avaliação, monitoramento e treinamento.
As inovações deste trabalho residem em dois aspectos: utiliza uma técnica otimizada de
gravação que economiza tempo de processamento e espaço de armazenamento; e os
comandos de atualização de cena são independentes de navegador, permitindo a visualização
do ambiente virtual colaborativo (AVC) através de diferentes navegadores 3D para Web. Com
a colaboração do Departamento de Artes e Comunicação (DAC) da FSCar, foi criada também
uma linguagem visual para a pronta identificação de situações emergenciais e uma interface
para melhor navegação do usuário em sistemas complexos. Exemplos de uso incluem o
monitoramento de diferentes plantas industriais, aeronaves em situações de ensaios de vôo e
solo, plataformas de exploração de petróleo, etc. Este trabalho é parte de um projeto
colaborativo entre o Laboratório de Realidade Virtual em Rede (LRVNet) do Departamento
de Computação da UFSCar e o PARADISE Lab do SITE da University of Ottawa.
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Búsqueda e identificación de relaxasas y genes mob en el ambiente marinoStuardo Olivares, Camila José January 2019 (has links)
Seminario de Título entregado a la Universidad de Chile en cumplimiento parcial de los requisitos para optar al Título de Ingeniera en Biotecnología Molecular. / El océano comprende el 71% de la superficie de la Tierra, participando en el control del clima, y proveyendo más del 50% del oxígeno disponible en la atmósfera. Las comunidades microbianas que habitan los ambientes marinos se caracterizan por ser determinantes en la producción primaria, además de ser diversas en sus funciones y distribución, siendo fundamentales en la mantención de los ciclos biogeoquímicos. Éstas poseen distintas estrategias para habitar estos ambientes, ya que en estos existen variaciones en los factores abióticos, tales como temperatura, disponibilidad de oxígeno o salinidad, que determinan cambios a nivel biótico. El dinamismo de los ambientes marinos favorece el intercambio de información genética mediado por la transferencia horizontal de genes (HGT). Está descrito que la conjugación es el mecanismo que posee una mayor tasa de ocurrencia en estos ambientes, por lo que estudiar los elementos genéticos móviles (EGM) conjugativos resulta necesario para comprender que genes son potencialmente transferidos. Este proceso se inicia cuando la enzima relaxasa, codificada por el EGM identifica el origen de transferencia (oriT) en el ADN del elemento a transferir, y realiza el corte con el que se inicia la movilización del elemento conjugativo a la célula receptora por medio del sistema de secreción de tipo IV (T4SS). Esta misma relaxasa es la que empalma el ADN transferido. Lo particular de esta enzima, es que es un elemento ubicuo para los elementos conjugativos, lo que la convierte junto a los genes que la codifican (genes mob) en marcadores de movilidad génica por conjugación, y por tanto en un sistema de clasificación de estos elementos.
Se ha descrito que los genes transferidos en plásmidos movilizables o conjugativos son capaces de conferir capacidades adaptativas a determinados microorganismos, tales como resistencia a antibióticos o a metales pesados, mientras que a nivel comunitario su efecto aún requiere de mayor estudio. En este seminario de título se planteó la búsqueda e identificación de relaxasas y genes mob, tanto in sílico como in situ, en muestras marinas de la región de Valparaíso. In sílico, se identificaron 28 proteínas con dominios funcionales descritos para relaxasas mediante la utilización de modelos ocultos de Markov (HMM) en un metagenoma obtenido desde el proyecto “TARA Oceans”, correspondiente a una estación ubicada frente a las costas de la región central de Chile, realizando además una cuantificación de los genes mob correspondientes a las proteínas identificadas, obteniendo que más del 70% de las lecturas reclutadas respondían a sólo dos familias de relaxasas (MOBP y MOBH). Para el estudio in situ se analizaron muestras marinas colectadas de una zona intermareal en Montemar, región de Valparaíso, en los meses de enero, marzo y julio de 2018. Estas muestras se trataron utilizando distintos protocolos de extracción de ADN, diferenciando ADN total y ADN plasmidial. Se evaluó la presencia de genes codificantes para relaxasas en los distintos tratamientos de las muestras mediante DPMT (Degenerate Primer Mob Typing) donde se logró identificar la presencia de la familia MOBQu mediante esta técnica. Posteriormente se realizó una cuantificación del gen codificante para esta familia mediante q-PCR, obteniendo que la muestra extraída con un kit comercial para extracción de ADN plasmidial se encontraba enriquecida en estos genes. Con estos resultados podemos demostrar que estas estrategias permitieron la identificación de relaxasas y los genes que las codifican en sistema marino, y así inferir la presencia de elementos conjugativos en estos. / The ocean comprises 71% of the Earth's surface, participating in climate control, and providing more than 50% of the oxygen available in the atmosphere. The microbial communities that inhabit marine environments are characterized by being determinant in primary production, diverse in their functions and distribution, and fundamental in the maintenance of biogeochemical cycles. These communities have different strategies to inhabit these environments, since in these there are variations in the abiotic factors, such as temperature, availability of oxygen or salinity, which determine changes at the biotic level. The dynamism of marine environments favors the exchange of genetic information by horizontal gene transfer (HGT).
It is reported that conjugation is the mechanism that has a higher rate of occurrence in these environments, so studying the conjugative mobile genetic elements (EGM) is necessary to understand which genes are potentially transferred. This process is initiated when the relaxase enzyme, encoded by the EGM, identifies the origin of transfer (oriT) in the DNA of the element to be transferred, and performs the cut with which the mobilization of the conjugative element to the recipient cell is initiated through the Type IV secretion system (T4SS). This same relaxase enzyme is the one that splices the transferred DNA. A particular issue about this enzyme is that it is a ubiquitous element for the conjugative elements, which converts it together with the genes that code it (mob genes) into markers of gene mobility by conjugation, and therefore in a classification system of these elements.
It has been reported that genes transferred in mobilizable or conjugative plasmids are able to confer adaptive capacities to certain microorganisms, such as resistance to antibiotics or heavy metals, while at the community level their effect still requires further V-ix
study. In this work we proposed the search and identification of relaxases and mob genes, both in silico and in situ, in marine samples from the Valparaíso region. In silico, 28 proteins with functional domains described for relaxases were identified by using hidden Markov models (HMM) in a metagenome obtained from the "TARA Oceans" project, corresponding to a station located off the coasts of the central region of Chile, also carrying out a quantification of the mob genes corresponding to the identified proteins, obtaining that more than 70% of the readings recruited responded to only two families of relaxases (MOBP and MOBH).
For the in situ study, marine samples collected from an intertidal zone in Montemar, Valparaíso region, in the months of January, March and July 2018 were analyzed. These samples were subjected to different protocols for total DNA and plasmid DNA extraction, evaluating the presence of genes coding for relaxases in the different treatments of the samples by means of DPMT (Degenerate Primer Mob Typing) where it was possible to identify the presence of the MOBQu family. A quantification of the gene coding for this family was performed by q-PCR, obtaining that the sample extracted with a commercial kit for plasmid DNA extraction was enriched in these genes. With these results we can demonstrate that these strategies allowed the identification of relaxases and the genes that codify them in the marine system, and thus infer the presence of conjugative elements in them.
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