Según la OMS la mortalidad perinatal representa más de la mitad de la mortalidad infantil; en el Perú representa el 52.9%1,2, esta puede disminuir tomando acciones que sean oportunas a nivel primario de salud. OBJETIVO: Determinar los factores de riesgo que se asocian a score de Apagar bajo en el servicio de Neonatología del Hospital de Ventanilla. MÉTODOS: se realizó una investigación analítica, retrospectiva de tipo caso control en 160 recién nacidos en el servicio de neonatología del Hospital de Ventanilla periodo de julio a diciembre del 2016 divididos en 2 grupos:80 recién nacidos con Apgar <7 y 80 con Apgar ≥7.Los datos fueron procesados mediante el paquete estadístico SPSS V 22.0 utilizando para el análisis OR con IC95%, y la prueba chi -cuadrado p<0.05. RESULTADOS: el análisis estadístico encontró que los factores de riesgo fueron el embarazo adolescente (OR=3.6 p<0.003), ITU en gestantes (OR=4.0 p <0.000), Preeclampsia (OR=4.5 p=0.015), cesárea (OR=2.33 p<0.020), prematuridad (OR=4.0 p <0.012), bajo peso al nacer (OR=5.5 p <016), liquido meconial espeso (OR=8.2 p<0.002) circular de cordón (OR= 4.9 p<0.00), control prenatal deficiente (OR= 4.5 p =0.00) CONCLUSIONES: Los factores de riesgo que se asocian a score de Apagar bajo al nacer fueron el embarazo adolescente, la Preeclampsia, ITU en gestante, el tipo de parto “Cesárea”, el líquido meconial espeso, la prematuridad, el bajo peso al nacer, el circular de cordón y la atención prenatal deficiente