Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Banca: Humberto Tonhati / Banca: Roberto Carvalheiro / Banca: Ricardo Vieira Ventura / Banca: Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da Silva / Resumo: Características economicamente importantes, como as características de carcaça, medidas post mortem, não vem sendo incluídas nos programas de melhoramento da raça Nelore devido, dentre outros fatores, aos altos custos e dificuldade de mensuração. Com a genômica, torna-se possível a seleção dos animais sem a necessidade de mensuração de seus próprios fenótipos e/ou de seus parentes, e tem-se, também, a possibilidade da realização da busca por genes ou regiões cromossômicas envolvidas com a expressão das características, por meio do estudo de associação genômica ampla (GWAS). Objetivou-se com o presente trabalho comparar diferentes modelos quanto à habilidade de predição de valores genéticos genômicos (GEBVs), e realizar um estudo de associação genômica ampla para as características: peso de carcaça quente, área de olho de lombo e espessura de gordura subcutânea, visando trazer subsídios para a incorporação da informação genômica nas avaliações genéticas de bovinos de corte no Brasil. Foram utilizados dados fenotípicos e genotípicos de 1.756 animais machos da raça Nelore. Os animais foram genotipados com um painel de alta densidade com 777.962 SNPs. Os GEBVs foram preditos utilizando três modelos: Regressão de cumeeira - (Bayesian Ridge Regression - BRR), BayesC (BC) e Lasso Bayesiano - (Bayesian Lasso - BL) e dois tipos de variáveis resposta: o valor genético tradicional e o fenótipo corrigido para os efeitos fixos. A implementação da GWAS foi realizada através da aplicação de um modelo poligênico-genômico, que considerou, simultaneamente, todas as informações disponíveis (fenótipos, pedigree e SNPs) por meio de um processo que combina a matriz de parentesco aditivo com a matriz de parentesco genômico. No geral, foi verificado que as predições genômicas sofreram influência da herdabilidade das características e do tipo de pseudo-fenótipo utilizado, sendo a... / Abstract: Economic relevant traits as carcass, measured after slaughter, are not included in the animal breeding program of Nelore breed due to the difficult and high cost to measure. With the advent of genomic selection, it is possible to select animals without the need of recording phenotypic performance of its own or from close relatives, and there is also the possibility of investigating genes or chromosome regions affecting the expression of traits using genome-wide association study (GWAS). The aim of this study was to compare different models on the predictive ability of genomic breeding values (GEBVs), and to perform a GWAS for the following traits: hot carcass weight, rib eye area, and backfat thickness, in order to contribute to the incorporation of genomic information into the genetic evaluation of beef cattle in Brazil. Genotypic and phenotypic information of 1,756 Nelore bulls were used in the analysis. Genotypes were generated based on a panel with 777.962 SNPs. The GEBVs were predicted using three models: Bayesian Ridge Regression (BRR), BayesC (BC) e Bayesian Lasso (BL), and two types of response variables: estimated breeding value and adjusted phenotypes for the fixed effects. GWAS was performed using the singlestep approach which combines all available phenotypic, pedigree and genomic information adjusting a polygenic-genomic model. In general, it was verified that heritability and response variable affected the genomic predictions, where the adjusted phenotype was the most appropriate response variable to perform SNPs estimates. It was also observed that the predictive abilities were similar among the methods (BRR, BC and BL). GWAS study detected potential genome regions that may be affecting the phenotypes. These regions can contribute to understand the genetic control of these traits and can be useful to include them into the genetic process for selecting the animals. The results showed that marker assited selection is ... / Doutor

Orientador: Telma Teresinha Berchielli / Coorientador: Bruno Ramalho Vieira / Banca: Pedro Antônio Muniz Malafaia / Banca: Izabelle Auxiliadora Molina de Almeida Teixeira / Resumo: Este estudo avaliou o efeito da suplementação fosfórica (SP) sobre o consumo de nutrientes, desempenho, parâmetros ósseos, qualidade de carne e a utilização do fósforo (P) por bovinos Nelores, durante o período de confinamento. Para tanto, utilizou-se 42 novilhos com peso médio inicial de 296±25 kg distribuídos em delineamento inteiramente casualizado com 3 tratamentos e 14 repetições. A dieta era formada por bagaço de cana (200g/kg na MS) e concentrado (800g/kg na MS). Os tratamentos dietéticos foram: sem a adição de P suplementar (T1), núcleo mineral comercial (T2) e fosfato bicálcico (T3). Os teores porcentuais de P na MS foram 0,24; 0,42 e 0,50, respectivamente. Foram avaliados os consumos de MS, PB, FDN, Ca, P e Mg, bem como a absorção aparente, retenção, excreção fecal e urinária de P, o desempenho animal e as características da carcaça. As avaliações da qualidade óssea consistiram na determinação da composição química óssea, densidade mineral óssea (DMO) e densidade em água (DA), além dos valores séricos de cálcio (Ca), P, magnésio (Mg), paratormônio (PTH), fosfatase alcalina (FA) e a concentração de P na saliva e no líquido ruminal. Os consumos de MS, PB e FDN foram similares entre os grupos que receberam ou não a SP (P>0,05). As ingestões de Ca e Mg foram superiores nos tratamentos em que se adicionou o núcleo comercial ou o fosfato bicálcico (P<0,05). O consumo, a retenção e a excreção de P foram influenciados pelo aumento do teor de P nas dietas experimentais (P<0,... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The present study was conducted to evaluate the effect of phosphorus supplementation (PS) on nutrient intake, performance and phosphorus (P) utilization by Nellore steers in a feedlot. Forty-two animals with an initial body weight of 296±25 kg were distributed in a completely randomized design consisting of 3 treatments and 14 replicates. The diet on a DM basis was comprised of sugarcane bagasse (200 g/kg) plus concentrate (800 g/kg). The treatments were without supplementary P (T1), commercial mineral supplement specific for feedlot cattle (T2) and dicalcium phosphate (T3) with 0.24, 0.42 or 0.50 % P, respectively. The DM, CP and NDF intakes were similar between the groups with or without the PS (P>0.05). The highest intakes of Ca and Mg were observed in the treatments with commercial mineral supplement or dicalcium phosphate. Intake, retention and excretion of P were influenced by the increase in P content in the experimental diets (P<0.05). Performance and carcass characteristics were not affected by P content in the diet (P>0.05). Supplementation with P significantly increased the excretion of P in the feces and urine and the feeding cost. Therefore, under Brazilian conditions, there is no justification for supplementing P in feedlot rations. The animals submitted or not to phosphorus supplementation had a similar content of Ca, Ca:P ratio and bone mineral density (BMD) at the 12th rib (P>0.05). However, animals of the T1 and T3 treatments had significant reductions in ma... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Daniel Gustavo Mansan Gordo / Banca: Lenira El Faro Zadra / Banca: Ricardo Vieira Ventura / Banca: Danisio Prado Munari / Banca: Gerardo Alves Fernandes Júnior / Resumo: O melhoramento genético animal visa melhorar a produtividade econômica das futuras gerações de espécies domésticas por meio da seleção. A maioria das características de interesse econômico na pecuária é de expressão quantitativa e complexa, isto é, são influenciadas por vários genes e afetadas por fatores ambientais. As análises estatísticas de informações de fenótipo e pedigree permite estimar os valores genéticos dos candidatos à seleção com base no modelo infinitesimal. Uma grande quantidade de dados genômicos está atualmente disponível para a identificação e seleção de indivíduos geneticamente superiores com o potencial de aumentar a acurácia de predição dos valores genéticos e, portanto, a eficiência dos programas de melhoramento genético animal. Vários estudos têm sido conduzidos com o objetivo de identificar metodologias apropriadas para raças e características específicas, o que resultará em estimativas de valores genéticos genômicos (GEBVs) mais acurados. Portanto, o objetivo deste estudo foi verificar a possibilidade de aplicação de modelos semiparamétricos para a seleção genômica e comparar a habilidade de predição com os modelos paramétricos para dados reais (características de carcaça, qualidade da carne, crescimento e reprodutiva) e simulados. As informações fenotípicas e de pedigree utilizadas foram fornecidas por onze fazendas pertencentes a quatro programas de melhoramento genético animal. Para as características de carcaça e qualidade da carne, o banco de da... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Animal breeding aims to improve economic productivity of future generations of domestic species through selection. Most of the traits of economic interest in livestock have a complex and quantitative expression i.e. are influenced by a large number of genes and affected by environmental factors. Statistical analysis of phenotypes and pedigree information allows estimating the breeding values of the selection candidates based on infinitesimal model. A large amount of genomic data is now available for the identification and selection of genetically superior individuals with the potential to increase the accuracy of prediction of genetic values and thus, the efficiency of animal breeding programs. Numerous studies have been conducted in order to identify appropriate methodologies to specific breeds and traits, which will result in more accurate genomic estimated breeding values (GEBVs). Therefore, the objective of this study was to verify the possibility of applying semi-parametric models for genomic selection and to compare their ability of prediction with those of parametric models for real (carcass, meat quality, growth and reproductive traits) and simulated data. The phenotypic and pedigree information used were provided by farms belonging to four animal breeding programs which represent eleven farms. For carcass and meat quality traits, the data set contained 3,643 records for rib eye area (REA), 3,619 records for backfat thickness (BFT), 3,670 records for meat tenderness (... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Gustavo Rezende Siqueira / Banca: Rodrigo Dias Lauritano Pacheco / Banca: Josiane Fonseca Lage / Banca: Otávio Rodrigues Machado Neto / Resumo: Objetivou-se com este trabalho avaliar o efeito da adição de um blend de óleo vegetal protegido, contendo uma mistura de ácidos graxos saturados e insaturados, sobre o desempenho e qualidade de carne de bovinos Nelore confinados. Foram utilizados 53 bovinos machos da raça Nelore, não castrados, com peso corporal (PC) inicial de 315 ± 5,9 kg e idade média de 20 meses. Seis animais foram abatidos inicialmente e 47 animais foram confinados, distribuídos em baias individuais. O delineamento experimental foi em blocos casualizados, levando em consideração o PC inicial dos animais, utilizando o animal como unidade experimental, com os seguintes tratamentos:1) dieta controle sem inclusão de gordura protegida (CON, n=16); 2) dieta com inclusão de óleo de soja protegido (NUT, n=16); 3) dieta com inclusão de um blend de óleo vegetal protegido contendo uma mistura de ácidos graxos saturados e insaturados (BPR, n=15). Animais que receberam o tratamento BRP tiveram melhor EA, em 5,88%, de 0,17 para 0,18, em comparação aos animais que receberam a dieta NUT. A ELm e a ELg foi maior para os animais que receberam o tratamento BRP quando comparado a adição de NUT (P<0.01), o aumento foi de 0,16 Mcal/kg e 0,14 Mcal/kg respectivamente. O GMDc foi maior para os animais que consumiram BRP (0,946 kg/dia) em comparação aos que consumiram NUT (0,853 kg/dia) (P=0.03). Isso proporcionou aumento de 13 kg no peso de carcaça quente para os animais do tratamento BRP (297 kg) em comparação aos animais do t... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of this work was to evaluate the effect of the addition of a blend of protected vegetable oil containing a mixture of saturated and unsaturated fatty acids on the performance and meat quality of confined Nellore cattle. A total of 53 males were used, with an initial body weight (BW) of 315 ± 5.9 kg and mean age of 20 months. Six animals were initially slaughtered and 47 animals were confined, distributed in individual pens. The experimental design was a randomized complete block design, taking into account the initial BW of the animals, using the animal as an experimental unit, with the following treatments: 1) control diet without inclusion of protected fat (CON, n = 16); 2) diet with inclusion of protected soybean oil (NUT, n = 16); 3) diet containing a blend of protected vegetable oil containing a mixture of saturated and unsaturated fatty acids (BPR, n = 15). Animals that received the BRP treatment had better G:F in 5.88%, 0.17 to 0.18, compared to animals that received the diet NUT. NEm and NEg were higher for animals receiving BRP when compared to NUT (P <0.01), the increase was 0.16 Mcal/kg and 0.14 Mcal/kg, respectively. The ADGc was higher for the animals that consumed BRP (0.946 kg/d) compared to those that consumed NUT (0.853 kg/d) (P = 0.03). This led to an increase of 13 kg hot carcass weight for animals BRP treatment (297 kg) compared to animals NUT treatment (284 kg) (P = 0.03 Animals that received diets with added protected fat had a higher EE content in the carcass, 19.1%, when compared to the animals that received the control diet, 17.1%. The meat of animals that consumed BRP had higher levels of unsaturated fatty acids (P = 0.04) and levels of hypocholesterolemic fatty acids (P = 0.05). It is concluded that the addition of BRP provides better EA, EAc, GMDc, unsaturated fatty acids and hypocholesterolemic content of feedlot terminated bovines. / Mestre

Orientador: Gustavo Rezende Siqueira / Coorientadora: Laura Franco Prados / Banca: Elizabeth Santin / Banca: Ricardo Andrade Reis / Banca: Danilo Domingues Millen / Banca: Márcia Helena Machado da Rocha Fernandes / Abstract: The study was divided into two phases. The first phase was designed to identify which mycotoxin was present in Brazillian feedlot diets, and the second phase was designed to evaluate the performance of Nellore bulls finished in feedlot fed mycotoxins, and the effects of mycotoxin adsorbent (ADS). Thus, the objective of the first phase was to identify which mycotoxins were present in ingredients used in diets fed to feedlot cattle and its concentrations. The survey covered 30 Brazillian feedlots located in the 5 largest beef-producing states. Samples of total mixed ration (TMR) and ingredients were collected on-site and sent to the 37+® Analytical Services Laboratory (KY, USA) for analysis of mycotoxins. The quantification of 38 different mycotoxins was performed using ultra-performance liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry. The mycotoxin concentrations were further interpreted according to known species- specific sensitivities and normalized according to the principles of toxic equivalent factors, determining the Risk Equivalent Quantities (REQ) expressed in µg/kg of aflatoxin B1-equivalent. Descriptive statistics were obtained using the UNIVARIATE procedure of SAS and multivariate statistics were obtained using STATISTICA. The toxins identified in TMR were: fumonisins, trichothecenes A, trichothecenes B, fusaric acid, aflatoxins and ergot (means of 2,330, 104.3, 79.5, 105, 10.5, and 5.5 µg/kg, respectively). Fumonisins were the primary mycotoxins found an... (Complete abstract click electronic access below) / Resumo: O experimento foi dividido em duas fases. A primeira fase foi desenvolvida para identificar quais micotoxinas estavam presentes nas dietas de confinamentos brasileiros e a segunda fase foi para verificar o desempenho de bovinos confinados alimentados com micotoxinas e efeito do Mycosorb A+ ADS. Assim, o objetivo da primeira fase foi identificar quais micotoxinas e em quais concentrações estavam presentes em ingredientes utilizados em dietas de bovinos de cortes confinados. A pesquisa abrangeu 30 confinamentos brasileiros localizados em 5 diferentes estados. Amostras de ração total (RT) e ingredientes foram coletadas no local e enviadas para o 37+® Analytical Services Laboratory (KY, USA) para análise de micotoxinas. A quantificação de 38 micotoxinas diferentes foi realizada utilizando cromatografia líquida de ultra-desempenho acoplada a espectrometria de massa. As concentrações de micotoxinas foram interpretadas de acordo com sensibilidades específicas de espécies conhecidas e normalizadas de acordo com os princípios de fatores equivalentes tóxicos, determinando o Risk Equivalency Quantities (REQ) expressas em µg/kg equivalente de aflatoxina B1. Estatísticas descritivas foram obtidas utilizando o procedimento UNIVARIATE do SAS e estatísticas multivariadas foram obtidas utilizando o STATISTICA. As toxinas identificadas nas RT foram: fumonisinas, tricotecenos A, tricotecenos B, ácido fusárico, aflatoxinas e ergot (média de 2330; 104,3; 79,5; 105; 10,5 e 5,5 µg/kg). As fumonisin... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor

Orientador: Flávio Dutra de Resende / Banca: Saulo da Luz e Silva / Banca: Otávio Rodrigues Machado Neto / Banca: João Marcos Beltrame Benatti / Banca: Laura Franco Prados / Resumo: Objetivou-se avaliar o efeito do tempo de confinamento sobre o desempenho, ganho em carcaça e rendimento de desossa (padrão brasileiro) de tourinhos Nelore. Trezentos e sessenta animais (peso inicial= 389± 33.8 kg e 26 meses de idade) foram distribuídos em 36 baias (unidade experimental) para avaliar os tempos de confinamento, que consistiram em 61, 89, 117 e 145 dias. Foram utilizadas 9 baias por tempo de confinamento. Ao final de cada tempo de confinamento todos os animais foram abatidos. O delineamento experimental foi em blocos casualizados (o peso corporal inicial foi o critério de blocagem). As médias foram comparadas por contrastes ortogonais polinomiais, linear e quadrático, sendo considerado o nível de significância de 5% de probabilidade. Ao longo dos dias de alimentação os animais não diferiram no CMS, em kg/dia, porém quando expresso em porcentagem do peso corporal observou-se redução linear no consumo, no GMD, no GMDcar e nas EA e EAc a medida que o peso corporal aumentou linearmente (P < 0,0001). Os pesos de abate foram de 498, 533, 555 e 583 kg, para 61, 89, 117 e 145 dias de confinamento, respectivamente. Foram observados ganhos de 1,28, 1,21, 1,10 e 1,01 kg de carcaça/dia. O RC, RG e peso de carcaça final apresentaram comportamento quadrátido (P < 0,0001) com o aumento nos dias de alimentação. O RG foi de 71,2, 75,4, 77,7 e 75,4 % e o peso de carcaça foi de 285, 315, 336 e 354 kg, para os respectivos tempos de confinamento. A composição química foi influencia... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective was evaluate the effect of feedlot time on the Nellore young bulls performance, carcass gain and meat cust yield . Three hundred and fifty - two animals (initial body weight (BW) = 389 ± 33.8 kg and 26 months old) were assigned into 36 pens (experimental unit) where was evaluated the feedlot times, which consisted in 61, 89, 117 and 145 days. Da ta were obtained from all bulls into nine pens for each feedlot time. At the beginning of the study, nine animals were slaughtered (one representative of each weight block) to determine the initial carcass weight. The carcass daily gain was calculated as t he difference betwe en the final weight hot carcass and initial estimated by reference slaughter. Carcass gain ( CG ) expressed in percentage, is the amount of casing per unit weight gain. The datas were analized using orthogonal polynomial contrasts in a ran domized block design (blocked by initial body weight) in the SAS PROC MIXED (9.0). Significance was declared at P ≤ 0. 05 . During the feeding days the animals did not differ in the DMI, in kg / day, however when expressed as a percentage of body weight, a l inear reduction in consumption, ADG, ADG car and FE and FE c was observed as body weight increased linearly (P < 0.0001). There was a linear increase (P < 0.01) for BW with increasing feedlot time. Final body weights were 498, 533, 555 and 583 kg, in their f eedlot times. There were gains of 1.28, 1.21, 1.10 and 1.01 kg of carcass / day. The dressing percen... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Flávio Dutra de Resende / Banca: Danilo Domingues Millen / Banca: Laura Franco Prados / Banca: Ivanna Moraes de Oliveira / Banca: Ricardo Andrade Reis / Resumo: O objetivo no trabalho foi avaliar o desempenho e as características de carcaça e carne de bovinos Nelore em confinamento, com utilização de monensina sódica como modulador de consumo de matéria seca. Foram utilizados 250 bovinos da raça Nelore, com peso médio de 363 kg. Os animais foram alojados em 35 baias coletivas equipadas com seis metros lineares de cocho de alimentação de concreto e bebedouros de 1500L de água. Os animais foram blocados através do peso, assim ficou disposto de forma que cada baia alojava 7 animais, sendo que o último bloco (5 baias finais) estava alojado 8 animais. De cada baia foi sorteado dois animais no início do experimento, afim de classificar os animais que seria feito coletas de sangue e coleta de dados no abate comercial, totalizando 70 animais para tais coletas. O experimentou foi de 148/156 dias no total, dividido em período de adaptação e terminação. Foram utilizadas três dietas, como os mesmos ingredientes, bagaço de cana-de-açúcar, milho grão, polpa cítrica, farelo de algodão e núcleo mineral, mas com relação a proporção de volumoso:concentrado diferente, sendo que a adaptação era 22:78; transição 17:83 e terminação 12:88 O fornecimento era feito pela manhã e durante a tarde, sendo dois fornecimentos de 50% cada um. Em todas as dietas era acrescido no núcleo mineral 25 mg/kg MS de virginiamicina e de acordo com os tratamentos era adicionado monensina sódica na dose de 20 mg/kg MS. Foram avaliados cinco tratamentos: VM - Uso de virginiamici... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aim was evaluation the performance and the characteristics of the carcass of Nelore beef in feedlot, with the use of sodium monensin as a modulator of dry matter intake. A total of 250 Nellore cattle were used, with a mean weight of 363 kg. The animals were housed in 35 collective pens equipped with six linear meters of concrete feeding trough and water troughs of 1500L. The animals were blocked by weight, so they were arranged so that each pen 7 animals, and the last block (5 final pens) housed 8 animals. From each pen, 2 animals were randomly selected at the beginning of the experiment, in order to separate the animals that carried out blood collection and data collection in slaughterhouse, totaling 70 animals for such collections. The experiment was 148/156 days in total, in the period of adaptation and termination. The types of diet, such as the ingredients themselves, sugar cane bagasse, corn grain, citrus pulp, cottonseed meal and mineral, but with regard to a proportion of bulky: a different, being a 22:78 adaptation; transition 17:83 and termination 12:88 The supply was made in the morning and during the afternoon, two supplies of 50% each. In all diets, 25 mg/kg MS of virginiamycin was added to the mineral core and according to treatments sodium monensin was added at a dose of 20 mg/kg DM. Five treatments were applied: VM - Use of virginiamycin throughout the experimental period, without addition of sodium monesin in the diet (Control); 34d - Use sodium monesin f... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Maria Eugênia Mercadante / Coorientador: Arione Augusti Boligon / Banca: Fernando Sebastián Baldi Rey / Banca: Roberto Carvalheiro / Banca: Lenira El Faro Zadra / Banca: Daniela Andressa Lino Lourenço / Resumo: A crescente demanda por produção alimentar sustentável tem motivado uma re-estruturação no setor de produção de carne objetivando a obter produtos de melhor qualidade sem aumentar os custos de produção. Alimentação animal é o componente econômico mais importante dos sistemas de produção de carne bovina. Devido ao tradicional processo de refrigeração após o abate, se faz necessário uma adequada cobertura de gordura na carcaça para garantir a sua preservação e qualidade desejável para consumo. A seleção para eficiência alimentar não tem sido eficaz, principalmente devido aos custos elevados e dificuldade para obter os fenótipos. A aplicação da seleção genômica utilizando polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) pode diminuir o custo de avaliação animal, bem como o intervalo de geração. No entanto, ainda não há consenso entre os pesquisadores sobre a melhor metodologia para a obtenção predição genômica para cada característica. O objetivo deste estudo foi comparar métodos de avaliação genômica usando o painel de marcadores do tipo SNP de alta densidade (BovineHD BeadChip - Illumina) para eficiência alimentar e identificar regiões genômicas associadas à características de carcaça em uma pequena população de bovinos de corte. Após o controle de qualidade, um total de 437197 genótipos ficou disponível para 761 animais da raça Nelore do Instituto de Zootecnia, Sertãozinho, SP, Brasil. O conjunto de dados continha 896 informações fenotípicas para as características de eficiência, como a consumo residual de alimentar (CAR), taxa de conversão alimentar (TCA), ganho em peso médio diário (GMD), e consumo de matéria seca (CMS), 2.306 informações de ultrassom para a área de olho de lombo (AOL ), 1832 para a espessura de gordura na região lombar (EGL), e 1830 para a espessura de gordura na região da garupa (EGG). Os métodos analisados foram: BLUP tradicional, single step... / Abstract: The growing global demand for safe and sustainable food production has motived a restructuring in the beef production sector aiming the production of better quality products without increasing the productive cost. Animal feeding is the most important economic component of beef production systems. Due the conventional processing of cattle carcasses refrigeration after slaughter, an adequate quality carcass must have enough fat covering to guarantee its preservation and desirable quality for consume. Selection for feed efficiency has not been effective mainly due to difficult and high costs to obtain the phenotypes. The application of genomic selection using single nucleotide polymorphisms (SNPs) can decrease the cost of animal evaluation as well as the generation interval. However, there is no consensus among researches about the best methodology to obtain genomic prediction for each trait. The objective of this study was to compare methods of genomic evaluation using high-density SNP panel (BovineHD BeadChip - Illumina) for feed efficiency traits and to identify genomic regions associated to carcass traits in a small beef cattle population. After quality control, a total of 437,197 SNP genotypes were available for 761 Nelore animals from Institute of Animal Science, Sertãozinho, SP, Brazil. The data set contained 896 records for efficiency traits, such as residual feed intake (RFI), feed conversion ratio (FCR), average daily gain (ADG), and dry matter intake (DMI), 2,306 ultrasound records for longissimus muscle area (LMA), 1,832 for backfat thickness (BF), and 1,830 for rump fat thickness (RF). Methods of analysis were traditional BLUP, single step genomic BLUP (ssGBLUP), genomic BLUP (GBLUP), a Bayesian regression method (BayesCπ) and single-step genome-wide association (ssGWAS). Average accuracies ranged from 0.10 to 0.58 using BLUP, from 0.09 to 0.48 using GBLUP, from 0.06 to 0.49 using BayesCπ and from 0.22 to 0.49 using ... / Doutor

Orientador: Américo Garcia da Silva Sobrinho / Banca: Wignez Henrique / Banca: Iraides Ferreira Furusho Garcia / Resumo: Para avaliar se a glicerina pode substituir adequadamente o milho na dieta de ovinos, foram confinados 30 cordeiros Ile de France, em baias individuais, dos 15,1 ± 0,146 kg aos 32,2 ± 0,207 kg de peso corporal, e alimentados com três dietas contendo cana-de-açúcar in natura como volumoso (50%) e concentrado (50%) sem e com inclusão de 10 e 20% de glicerina na matéria seca. As dietas continham semelhantes teores proteico (16,72% da MS) e energético (3,86 Mcal/kg MS). Foram avaliados o desempenho, o consumo e a digestibilidade aparente dos nutrientes, o balanço aparente de nitrogênio, as concentrações plasmáticas de glicose e insulina, a concentração de ácido fórmico na urina, a produção de gases in vitro, as medidas morfológicas in vivo e na carcaça, os parâmetros quantitativos da carcaça e os componentes não-carcaça. O delineamento experimental foi o inteiramente casualizado, sendo os tratamentos comparados por regressão com auxílio do programa estatístico SISVAR. Os cordeiros alimentados com as diferentes dietas tiveram desempenho semelhante, com ganho médio de peso diário de 0,239 kg, atingindo o peso corporal final em média aos 73 ± 16 dias de confinamento. O aumento de glicerina nas dietas reduziu linearmente os consumos de extrato etéreo e de carboidratos totais, mas não teve efeito sobre o consumo de outros nutrientes, havendo redução linear apenas na digestibilidade aparente do extrato etéreo, sem influenciar a digestibilidade dos demais nutrientes. O balanço aparente de nitrogênio nos cordeiros foi positivo nas três dietas e não significativamente diferente, assim como as concentrações plasmáticas de glicose e insulina, que também foram semelhantes. A concentração de ácido fórmico na urina aumentou linearmente 24,2% e 114,8%, respectivamente, conforme se elevou o teor de glicerina na dieta para 10 e 20%, sem sinais de intoxicação nos cordeiros. A produção de gases in vitro teve ... / Abstract: To assess if glycerin can properly substitute corn in sheep diets, 30 Ile de France lambs were confined, in individual pens, of 15.1 ± 0.146 kg to 32.2 ± 0.207 kg body weight, and fed with three diets containing sugarcane in natura as forage (50%) and concentrate (50%) without and with inclusion of 10 and 20% of glycerin in dry matter. Diets contained similar protein (16.72% of DM) and energy (3.86 Mcal/kg DM) levels. There were evaluated the performance, intake and apparent nutrient digestibility, apparent nitrogen balance, plasmatic glucose and insulin concentrations, urine formic acid concentration, in vitro gas production, in vivo and carcass morphological measures, quantitative parameters of the carcass and non-carcass components. Experimental design was completely randomized, and treatments compared by regression with the aid of SISVAR statistic program. Lambs fed with different diets had similar performance, with average daily weight gain of 0.239 kg, reaching final body weight usually at 73 ± 16 days of confinement. Increase of glycerin in diets reduced linearly the ingestion of ether extract and total carbohydrates, but had no effect on other nutrients consumption, with a decrease linear only in the apparent digestibility of ether extract, without affecting digestibility of other nutrients. Apparent nitrogen balance in lambs was positive in all three diets, with no significant difference, as well as plasmatic glucose and insulin concentrations, which were also similar. Urine formic acid concentration increased linearly 24.2% and 114.8%, respectively, with increased of glycerin level in diet for 10 and 20%, without signs of intoxication in lambs. In vitro gas production had linear reduction with increasing glycerin content in diet in all times assessed (24, 48 and 72 hours). Inclusions of 10 and 20% of glycerin in the diets promoted quadratic effect, with increase and reduction subsequent in rump width in vivo ... / Mestre

Orientador: Gustavo Rezende Siqueira / Banca: João Marcos Beltrame Benatti / Banca: Márcia Helena Machado da Rocha Fernandes / Resumo: Objetivou-se com o presente estudo avaliar os efeitos do processamento do milho e a inclusão de lasalocida sódica na terminação de bovinos Nelore em sistema de alta suplementação na seca, sobre o desempenho, as características de carcaça e os parâmetros ruminais. No Experimento 1, foram utilizados 12 bovinos Nelore, castrados, com peso corporal (PC) médio de 524±41,1 e aproximadamente 36 meses de idade, fistulados no rúmen para avaliação dos parâmetros ruminais, distribuídos em três quadrados latino 4×4, usando como critério de blocagem o peso inicial. Os tratamentos consistiram em um esquema fatorial 2 x 2. Fator 1: tipo de processamento do milho (milho seco moído (MSM) ou silagem de milho grão úmido (MGU) e fator 2: uso de aditivo (sem (SLS) ou com (CLS) inclusão de lasalocida sódica na dose de 32 mg/kg de matéria seca do concentrado). Os animais receberam suplemento ad libitum, com 60% de inclusão de milho no concentrado. O período experimental foi de Outubro de 2016 a Janeiro 2017, dividido em quatro períodos de 21 dias, totalizando 84 dias experimentais. As colheitas de líquido ruminal foram realizadas no 19° dia do período a fim de mensurar o pH, o nitrogênio amoniacal (N-NH3) e os ácidos graxos de cadeia curta (AGCC). No experimento 2, foram utilizados 68 bovinos, não castrados, Nelore, com média de 371±12,3 kg de PC, com aproximadamente 25 meses de idade. Deste total, quatro foram abatidos ao início do experimento (grupo referência) para estimar as características de ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of this study was to evaluate the effects of corn processing and the inclusion of lasalocid sodium on Nellore beef cattle finished in a high supplementation system, in the dry season, on performance, carcass characteristics and rumen parameters. In Experiment 1, 12 castrated Nellore cattle with mean body weight (BW) of 524±41,1 and approximately 36 months of age were used, fistulated in the rumen for evaluation of ruminal parameters, distributed in three 4 × 4 Latin squares, using the initial weight as the blocking criterion. The treatments consisted of a 2 x 2 factorial factorial arrangement. Factor 1: type of corn processing (milled dry corn (MDC) or high moisture corn (HMC) and factor 2: the use or not of additive (without inclusion (WLS) or with inclusion (ILS) of lasalocid sodium at a dose of 32 mg/kg of dry matter of the concentrate). The animals were supplemented ad libitum, with 60% corn inclusion in the concentrate. The experimental period was from October 2016 to January 2017, divided into four periods of 21 days, totaling 84 experimental days. Ruminal liquid harvests were carried out on the 19th day of the period to measure pH, ammoniacal nitrogen (N-NH3) and short-chain fatty acids (SCFA). In the experiment 2, sixty-eight Nellore bulls (371±12,3 kg of BW and 25 months of age) were used. From this total, four were slaughtered at the begin of the experiment (reference group) to estimate the initial carcass characteristics. The treatments were in a rand... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre