Orientador: Antonio de Goes / Banca: Rita de Cassia Panizzi / Banca: Nilvanira Donizete Tebaldi / Resumo: A Podridão floral dos citros (PFC), ocasionada por Colletotrichum acutatum e C. gloeosporioides, reduz consideravelmente a produção de citros nas principais áreas produtoras e a utilização de fungicidas ainda é a estratégia de controle mais eficaz. No ano de 2012 os benzimidazóis, grupo químico que por muitos anos foi importante no controle de PFC, tiveram seu uso suspenso em pomares de citros destinados à produção de suco para exportação, uma exigência de adequação aos padrões de qualidade dos EUA, principal comprador. Em decorrência disso, fez-se necessária a busca por novos fungicidas, que apresentassem boa eficiência agronômica e que atendessem às taxas de resíduos permitidas. Sendo assim, o objetivo do presente estudo foi avaliar novos grupos químicos de fungicidas, isoladamente ou em combinação, bem como reguladores de crescimento, indutores de resistência e fertilizantes químicos no controle da PFC, em pomares comerciais, nas safras 2012/13 e 2013/14. Os experimentos foram realizados em plantas de laranjeira „Pera‟ localizadas nos municípios paulistas de Itapetininga (IT), Santa Cruz do Rio Pardo (SC) e Casa Branca (CB). O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados (DBC), com cinco repetições. Dentre as novas estratégias de manejo foram avaliadas: i) Fungicidas dos grupos das estrobilurinas em combinação com outros grupos químicos; ii) Reguladores de crescimento aplicados isoladamente ou em combinação com reguladores hormonais e fungicidas; iii) Eficiência de misturas de estrobilurinas e triazóis, aplicadas em conjunto com reguladores hormonais e fertilizantes químicos; iv) Eficiência de clorotalonil combinado a estrobilurinas e triazóis, e v) Eficiência de Stimulate combinado a Hold e fungicida. Observou-se que fungicidas do grupo das estrobilurinas em combinação com triazóis ou clorotalonil, bem como a utilização de biorreguladores e indutores ... / Abstract: The postbloom fruit drop (PFD), caused by Colletotrichum acutatum and C. gloeosporioides, considerably reduces citrus production in the main producing areas and the use of fungicides is still the most effective control strategy. In 2012 benzimidazoles, chemical group which, for many years, was important in controlling PFD, have had their use suspended in citrus orchards for the production of exportation juice, an adaptation requirement to the quality standards of the USA, the main buyer. As a result, it was made necessary to search for new fungicides enhancing good agronomic efficiency and heeding the rate of waste allowed. Thus, the aim of this study was to evaluate new chemical groups of fungicides, alone or in combination, as well as growth regulators, resistance inducers and chemical fertilizers to control PFC in commercial orchards, during 2012/13 and 2013/14 crop seasons. The experiments were performed with sweet orange 'Pera' trees located in the municipalities of Itapetininga (IT), Santa Cruz do Rio Pardo (SC) and Casa Branca (CB). The experimental design was a randomized block design (RBD) with five replications. Among the new management strategies were evaluated: i) fungicides of the strobilurin group in combination with other chemical groups; ii) growth regulators applied alone or in combination with hormonal regulators and fungicides; iii) efficiency of strobilurin and triazole mixtures applied in conjunction with hormonal regulators and chemical fertilizers; iv) efficiency of strobilurins and triazoles combined with chlorothalonil, v) efficiency Stimulate® combined to Hold® and fungicide. It was observed that fungicides of the strobilurin and triazoles groups or in combination with chlorothalonil, as well as the use of bioregulators e resistance inducers are efficient alternative preventive control of the PFC / Mestre

Orientador: Antonio de Goes / Banca: Rita de Cássia Panizzi / Banca: Nilvanira Donizete Tebaldi / Resumo: A podridão floral dos citros (PFC) é uma importante doença dessa cultura, responsável por elevadas perdas de produção. Normalmente, essa doença mostra-se limitante quando ocorrem prolongados períodos chuvosos durante o florescimento das plantas ou quando existe intenso molhamento foliar. Duas espécies de Colletotrichum estão associadas à doença: C. acutatum e C. gloeosporioides. Entretanto, recentemente tem-se verificado que, mesmo sob condições não tão propícias, a doença tem ocorrido com relativa frequência; suspeitando-se do envolvimento de outras espécies de Colletotrichum ou de novas condições de adaptação das espécies descritas. Esse trabalho teve como objetivo determinar se há ou não outra espécie de Colletotrichum associada a PFC e avaliar a viabilidade do emprego de marcadores moleculares ISSR na caracterização taxonômica de isolados de Colletotrichum spp. associados a sintomas de PFC em flores, assim como de tecidos foliares e frutos cítricos assintomáticos. Para tanto, foi empregada uma combinação de iniciadores específicos, levando em conta a região ITS e marcadores moleculares ISSR. Os marcadores ISSR mostraram-se eficientes na caracterização taxonômica dos isolados de Colletotrichum analisados. A população avaliada foi constituída apenas por C. acutatum e C. gloeosporioides, descartando o envolvimento de uma espécie adicional, o que converge com os registros na literatura. Foi constatada alta diversidade genética entre os isolados analisados, o que também se mostra convergente quanto às diferenças fenotípicas observadas sob condições de campo. Entretanto, não foi encontrada relação quanto à origem e as espécies de Colletotrichum spp. associadas. De modo inédito, ainda que assintomaticamente, foi detectada a presença de um isolado de C. acutatum associado a frutos cítricos / Abstract: Postbloom fruit drop of citrus (PFD) is a serious disease of this crop, accounting for high yield losses. Usually, this disease shows to be limiting when there are prolonged rainy periods during plant flowering or when there is intense leaf wetness. Two Colletotrichum species are associated with the disease: C. acutatum and C. gloeosporioides. However, recently, it has been found that, even under not so favorable conditions, the disease has occurred with some frequency; one suspects the involvement of other Colletotrichum species or new adaptation conditions of the described species. This study aimed to determine whether there is another Colletotrichum species associated with PFD and it assess the viability of using molecular markers ISSR for taxonomic characterization of Colletotrichum spp. isolates associated with PFD symptoms in flowers, as well as of leaf tissues and asymptomatic citrus fruits. For this purpose, we used a combination of specific primers, taking into account the ITS region and ISSR molecular markers. ISSR markers have proven to be effective for taxonomic characterization of the Colletotrichum isolates analyzed. The population assessed consisted only of C. acutatum and C. gloeosporioides, discarding the involvement of an additional species, something which converges with records in the literature. We found high genetic diversity among the isolates analyzed, and this also shows to converge as for the phenotypic differences observed under field conditions. However, no relation was found regarding the origin and associated Colletotrichum spp. species. In an unprecedented way, although asymptomatically, we detected the presence of a C. acutatum isolate associated with citrus fruits / Mestre

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-11-29T12:20:35Z No. of bitstreams: 1 Ana Leticia Rocha Monteiro.pdf: 843207 bytes, checksum: 5edb6fa96d360ea08be8b1ddf9cade76 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-29T12:20:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ana Leticia Rocha Monteiro.pdf: 843207 bytes, checksum: 5edb6fa96d360ea08be8b1ddf9cade76 (MD5) Previous issue date: 2015-02-24 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Anthracnose is a major post-harvest diseases of strawberry, causing various losses and limiting the quality of the fruit. Besides the lack of studies on climatic conditions that favor the disease, lack of active ingredients registered for the management of the disease in Brazil defines the need to search for alternative control. This study aimed to study the influence of inoculum concentration, temperature and leaf wetness period and to evaluate the effect of gamma radiation on the severity of anthracnose caused by Colletotrichum acutatum in postharvest strawberry, and influence of this treatment on the physical attributes -chemical such as pH, total soluble solids (TSS), titratable acidity (TA) and TSS / TA. Inoculum concentrations tested were 102, 10³, 104, 105,106 and 107 spores / mL, for the fruits wet period were submitted to: 0, 12, 24, and 36 h of incubation, the influence of temperature on disease severity The fruits were incubated under controlled temperature for 12, 15, 20 and 25 ° C. In the control fruits with gamma radiation received doses: 0.25, 0.50, 0.75, 1.0, and 1.25 kGy in two stages: immediate and six hours after the inoculation of the fungus. The control treatment did not receive doses of gamma radiation. Disease severity was significantly influenced by the higher concentration of inoculum (107 spores / ml), incubation temperature and the wetness of the fruit, with larger lesions in the fruits exposed to 25 ° C and 36 h. The irradiation the best treatments were performed immediately after inoculation, highlighting the dose of 1.25 kGy. Treatment with gamma radiation did not alter the chemical characteristics of fruits analyzed in this study. Thus, these treatments can be given for the post-harvest treatment of strawberry. / A antracnose é uma das principais doenças pós-colheita do morango, causando diversas perdas e limitando a qualidade do fruto. Além da falta de estudos das condições climáticas que favorecem a doença, a falta de princípios ativos registrados para o manejo da doença no Brasil define a necessidade da busca de controle alternativo. Neste estudo objetivou-se estudar a influência da concentração de inóculo, temperatura e do período de molhamento, bem como, avaliar o efeito da radiação gama na severidade da antracnose causada por Colletotrichum acutatum em morango pós-colheita, além da influência desse tratamento nos atributos físico-químicos como pH, sólidos solúveis totais (SST), acidez titulável (AT) e a relação SST/AT. As concentrações de inóculo testadas foram 102, 10³, 104, 105,106 e 107 conídios/mL, para o período de molhamento os frutos foram submetidos a: 0, 12, 24, e 36 h de incubação, na influência da temperatura na severidade da doença os frutos foram incubados com temperatura controlada para 12, 15, 20 e 25 °C. No controle com radiação gama os frutos receberam as doses de: 0,25, 0,50, 0,75, 1,0 e 1,25 kGy em dois tempos: imediatamente e seis horas após a inoculação do fungo. A testemunha não recebeu doses de radiação gama. A severidade da doença foi significativamente influenciada pela mais alta concentração de inóculo (107 conídios/mL), temperatura de incubação e pelo período de molhamento dos frutos, com maiores áreas de lesão nos frutos expostos a 25 ºC e 36 h. Quanto a irradiação os melhores tratamentos foram realizados imediatamente após as inoculações, com destaque para a dose de 1,25 kGy. Os tratamentos com a radiação gama não alteraram as características químicas das frutas analisadas neste estudo. Assim, estes tratamentos podem ser indicados para o tratamento pós-colheita de morango.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-04-18T13:46:37Z No. of bitstreams: 1 Jessica Morais da Silva.pdf: 1089549 bytes, checksum: d1e717e2066bd3fd9f3853ff0b4f184e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-18T13:46:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jessica Morais da Silva.pdf: 1089549 bytes, checksum: d1e717e2066bd3fd9f3853ff0b4f184e (MD5) Previous issue date: 2016-07-29 / The cowpea is a major source of income in the North/Northeast of Brazil. But the same can be affected by a wide range of plant pathogens can damage production and productivity. Currently it is common to use resistance inducers as a means to combat the pathogens attack. This work aimed to evaluate resistance inducers, as well as the biochemical mechanisms in controlling anthracnose of cowpea (Vigna unguiculata L. Walp.). We conducted an antagonistic test with various strains of Trichoderma URM front of Colletotrichum lidemuthianum URM3149, the greenhouse was applied four abiotic inducers (salicylic acid, chitosan, amino butyric acid, acibenzolar-S-methyl) and biotic (Trichoderma) in cowpea plants. The severity of the disease, as well as enzymatic activities performed leaves was evaluated (catalase, peroxidase, polyphenol oxidase, β-1,3-glucanase and protease). Trichoderma aureorivide URM5158 showed a high rate of antagonism as well as the activity of chitinase was high. Among all the inductors in the end of the experiment only acibenzolar-S-methyl severity showed high rate and did not differ from control. Salicylic acid stood out among the abiotic inducers and T. aureorivide URM5158. The Trichoderma aureoviride URM5158 species has the potential antagonistic to Colletotrichum lindemuthianum URM3149; show potential inducers against severity of bean anthracnose. / O feijão caupi é uma das principais fontes de renda do Norte/Nordeste. Porém o mesmo pode ser afetado por uma diversidade de fitopatógenos podendo prejudicar na produção e produtividade. Atualmente, é comum o uso de indutores de resistência como meio de combater esse ataque de micro-organismos. Este trabalho teve como objetivo avaliar indutores de resistência, assim como os mecanismos bioquímicos no controle da antracnose do feijão caupi (Vigna unguiculata L. Walp.). Foi realizado um teste antagônico com diversas espécies de Trichoderma URM frente ao Colletotrichum lidemuthianum URM3149. Em casa de vegetação foi aplicado quatro indutores abióticos (ácido salicílico, quitosana, ácido amino butírico, acibenzolar-S-metil) e um biótico (Trichoderma) em plantas de feijão caupi. Foi avaliado a severidade da doença, assim como também realizado atividades enzimáticas das folhas (catalase, peroxidase, polifenoloxidase, β-1,3-glucanase e protease). Trichoderma aureorivide URM5158 apresentou uma alta taxa de antagonismo assim como a atividade da quitinase foi elevada, sendo este selecionado para os testes in vivo. Entre os indutores avaliados apenas o acibenzolar-S-metil apresentou alta taxa de severidade não diferindo do controle. O ácido salicílico se destacou entre os indutores abióticos, assim como T. aureorivide URM5158. A espécie Trichoderma aureoviride URM5158 apresenta potencial antagônico ao Colletotrichum lindemuthianum URM3149; os indutores mostram potencial contra a severidade da antracnose do feijão.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-03-14T13:55:45Z No. of bitstreams: 1 Kaliny Veiga Pessoa da Silva.pdf: 1645641 bytes, checksum: 7d934fe1a156047987054c35f1981b65 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-14T13:55:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kaliny Veiga Pessoa da Silva.pdf: 1645641 bytes, checksum: 7d934fe1a156047987054c35f1981b65 (MD5) Previous issue date: 2016-08-22 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Cotton stands out as a high value textile plant in the world market due to the quality of its fibers and the commercial derivatives that the plant produces. Ramulose is a disease that causes great damage to this crop, caused by the fungus Colletotrichum gossypii South var. cephalosporioides Costa, mainly affects young leaves, the most common symptoms being the darkening and necrosis of leaves and branches, which may compromise the whole development of the plant. Extracts and vegetable oils have been studied as an alternative to control pests and diseases such as ramulose in crops. These have as main constituents the secondary compounds, chemicals known as phytochemicals, terpenoids, alkaloids and glycosides. Among these the geraniol, monoterpene that stands out for its fungicidal property. Kenaf (Hibiscus cannabinus) belongs to the family Malvaceae and is rich in compounds known as polyphenols, alkaloids, tannins and essential oils, also being a promising source of fungicidal oil. This work aimed to analyze the effect of oils and extracts on the development of the fungus C. gossypii, which causes ramulose, by means of two researches: In the first one, we sought to prospect Geraniol synthase, the precursor enzyme of geraniol, in aromatic species, for means of molecular analyzes via PCR and qPCR, besides phytopathological tests, in order to evaluate the geraniol expression and the effectiveness of its extracts and vegetable oils in the prevention and control of ramulose; The second study evaluated the effect of Kenaf oil on the development of fungus C. gossypii under laboratory conditions. In order to carry out the first research eleven aromatic species were evaluated, among them M. pulegium, O. basilicum, O. majorana and R. officinalise, which presented satisfactory levels of expression of this enzyme in the molecular assays, being selected for bioassays in vivo against C. gossypii. O. basilicum, M. pulegium and O. majorana oils, at 2000 ppm concentration, were tested in vivo and their preventive and curative actions compared to commercial fungicide. There was effective control of the oils O. basilicum and M. pulegium under ambient conditions, and M. Polegium was distinguished with D.S.I. around 30%, lower value than that presented by the commercial fungicide (40%). These results indicate that the use of aromatic species can be an effective alternative for the treatment of ramulose, with the advantages of being a low cost method and not presenting risks of environmental contamination. In addition, the genetic characterization of aromatic species is an important source of information to expand the use of natural resources, allowing new materials that hold genes of interest to be found and serve as environmental conservation strategies. In the second study, phytopathological tests were performed on isolate 287 of C. gossypii on the effect of Kenaf oil at concentrations of 25, 50 and 75 μl / 1 ml. It was verified by regression analysis that there was no reduction in the mycelial growth of C. gossypii in the oil concentrations adopted in this work. The data presented by fungus growth, fungistatic effect and spore production did not reveal a statistical difference between the treatment with oil and control. Based on the composition of kenaf oil, rich in fungicidal ingredients, even this oil lacking control over C. gossypii in the present study, it is believed that in higher concentrations this oil may exert an effect on this pathogen. / O algodoeiro destaca-se como uma planta têxtil de alto valor no mercado mundial devido à qualidade de suas fibras e aos derivados comerciais que a planta produz. A ramulose é uma doença que causa grandes danos a esta cultura, causada pelo fungo Colletotrichum gossypii South var. cephalosporioides Costa, afeta principalmente folhas jovens, sendo os sintomas mais comuns o escurecimento e necrose das folhas e ramos, podendo comprometer todo o desenvolvimento da planta. Extratos e óleos vegetais vêm sendo estudados como alternativa para controle de pragas e doenças como a ramulose em lavouras. Estes têm como principais constituintes os compostos secundários, substâncias químicas conhecidas como fitoquímicos, terpenóides, alcalóides e glicosídeos. Dentre estes o geraniol, monoterpeno que destaca-se por sua propriedade fungicida. Já o Kenaf (Hibiscus cannabinus) pertence à família Malvaceae e é rica em compostos conhecidos como polifenóis, alcalóides, taninos e óleos essenciais, também sendo uma promissora fonte de óleo fungicida. Este trabalho buscou analisar o efeito de óleos e extratos sobre o desenvolvimento do fungo C. gossypii, causador da ramulose, por meio de duas pesquisas: Na primeira, buscou-se prospectar a Geraniol synthase, enzima precursora do geraniol, em espécies aromáticas, por meio de análises moleculares via PCR e qPCR, além de testes fitopatológicos, a fim de avaliar a expressão do geraniol e a eficácia de seus extratos e óleos vegetais na prevenção e no controle da ramulose; Na segunda pesquisa avaliou-se o efeito do óleo de Kenaf sobre o desenvolvimento do fungo C. gossypii em condições de laboratório. Para realização da primeira pesquisa onze espécies aromáticas foram avaliadas, entre elas M. pulegium, O. basilicum, O. majorana e R. officinalise, as quais apresentaram níveis satisfatório de expressão desta enzima nos ensaios moleculares, sendo selecionadas para bioensaios em in vivo contra C. gossypii. Os óleos de O. basilicum, M. pulegium e O. majorana, na concentração de 2000 ppm, foram testados in vivo e suas ações preventivas e curativas comparadas com fungicida comercial. Houve controle efetivo dos óleos O. basilicum e M. pulegium em condições ambiente, sendo que M. Polegium destacou-se com D.S.I. em torno de 30%, valor menor do que o apresentado pelo fungicida comercial (40%). Esses resultados denotam que o uso de espécies aromáticas pode se constituir numa alternativa eficaz para o tratamento da ramulose, com as vantagens de ser um método de baixo custo e de não fornecer riscos de contaminação ambiental. Além disso, a caracterização genética de espécies aromáticas é uma importante fonte de informações para ampliar a utilização dos recursos naturais possibilitando que novos materiais detentores de genes de interesse sejam encontrados e sirvam como estratégias de conservação ambiental. Na segunda pesquisa, testes fitopatológicos foram realizados no isolado 287, de C. gossypii, sobre o efeito do óleo de Kenaf em concentrações de 25, 50 e 75 μl/1ml. Verificou-se por análise de regressão que não houve redução no crescimento micelial de C. gossypii nas concentrações de óleo adotadas neste trabalho. Os dados apresentados pelo crescimento de fungos, efeito fungistático e produção de esporos não revelaram diferença estatística entre o tratamento com óleo e controle. Com base na composição do óleo de kenaf, rica em ingredientes fungicida, mesmo este óleo não apresentando controle sobre C. gossypii no presente estudo, acredita-se que em concentrações mais elevadas este óleo possa exercer efeito sobre este patógeno.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2018-06-28T15:02:41Z No. of bitstreams: 1 TESE_Patricia Migliorini.pdf: 2682211 bytes, checksum: 8bdf76d1693cb07dba37b177863fdbef (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-07-03T18:36:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TESE_Patricia Migliorini.pdf: 2682211 bytes, checksum: 8bdf76d1693cb07dba37b177863fdbef (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-07-03T18:38:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TESE_Patricia Migliorini.pdf: 2682211 bytes, checksum: 8bdf76d1693cb07dba37b177863fdbef (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-03T18:38:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE_Patricia Migliorini.pdf: 2682211 bytes, checksum: 8bdf76d1693cb07dba37b177863fdbef (MD5) Previous issue date: 2018-03-19 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / O presente trabalho teve por objetivo: a) avaliar o efeito de diferentes doses e fontes de Si por meio do recobrimento de sementes sobre a qualidade física, fisiológica e sanitária de sementes assim como, determinar a concentração de silício e cálcio absorvidos em plântulas de feijão; b) avaliar o desempenho de plântulas inoculadas com Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli e recobertas com diferentes fontes de Si, durante a emergência e na expressão dos mecanismos bioquímicos, envolvidos nas respostas pós infecção em diferentes momentos e; c) avaliar o efeito do recobrimento de sementes com Si em resposta à infecção em uma cultivar suscetível e resistente ao Colletotrichum lindemuthianum, sobre o potencial fisiológico e sanitário de sementes e plântulas, durante o desenvolvimento inicial da cultura do feijão. Testou-se diferentes doses (0; 45; 90; 135 e 180g Si 100 kg-1 de sementes) e fontes de Si [Agrosilício®, silicato de cálcio e casca de arroz carbonizada (CAC)] via recobrimento de sementes, inoculados ou não pelo método de restrição hídrica. O recobrimento das sementes composto por Agrosilício®, CAC e silicato de cálcio não altera a qualidade física das sementes e proporciona plântulas vigorosas, sem comprometer a emergência final. Sementes recobertas com doses de silicato de cálcio e CAC elevam a concentração de Si nas raízes, mas reduzem a concentração de cálcio (Ca), enquanto que o Agrosilício® aumenta a concentração de Si em folhas e do Ca nas raízes. Diferentes fontes e doses de Si não controlam patógenos associados às sementes de feijão. A associação do F. oxysporum f. sp. phaseoli nas sementes prejudica a emergência e crescimento das plântulas. O Si tem pouco efeito nas respostas em plântulas não inoculadas, mas eleva a concentração de lignina. Na presença do F. oxysporum f. sp. phaseoli, o Si desencadeia melhor desempenho inicial das plântulas, favorece e potencializa os mecanismos de defesa. A fonte de Si fornecido pelo Agrosilício® proporciona uma antecipação rápida inicial da peroxidase o que pode ter amenizado e atrasado os danos do patógeno nas plântulas. A CAC como fonte de Si, embora tenha contribuído para a potencialização das enzimas de defesa nos períodos mais avançados da infecção, não se mostrou eficiente no controle da incidência da doença. O recobrimento das sementes com Si diminui a incidência e a severidade de C. lindemuthianum e proporciona maior crescimento das plântulas de feijão. O efeito de respostas potencializadas pelo Si tem maior expressividade na cultivar de maior suscetibilidade. / The a im of this study was: a) to evaluate the effect of different doses and sources of Si through the coating of seeds on the physical quality, physiological and sanitary conditions of seeds as, to determine the concentration of silicon and calcium absorbed in bean seedlings; b) to evaluate the performance of seedlings inoculated with Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli and covered with different sources of Si, during emergence and in the expression of biochemical mechanisms, involved in post-infection responses at different times and; c) to evaluate the effect of seed coating with Si in response to infection in a susceptible and resistant Colletotrichum lindemuthianum, on the physiological and sanitary potential of seeds and seedlings, during the initial development of the bean culture. Different doses were tested (0; 45; 90; 135 and 180g Si 100 kg-1 of seeds) and sources of Si [Agrosilício®, calcium silicate and rice husk ash (AHC)] by seed coating, whether or not inoculated by the water restriction method. The covering of seeds composed of Agrosilício®, AHC and calcium silicate, does not change the physical quality of the seed, provides vigorous seedlings, without compromising the end emergency. Seeds coated with doses of calcium silicate and AHC, increase the concentration of Si in roots, but reduce the concentration of calcium (Ca), while the Agrosilício® increases the concentration of Si in leaves and Ca in the roots. Different sources and doses of Si do not control pathogens associated with bean seeds. The association of F. oxysporum f. sp. phaseoli in seeds impairs seedling emergence and growth. Si has little effect on responses in uninoculated seedlings, but raises lignin concentration. In the presence of F. oxysporum f. sp. phaseoli, Si triggered better initial seedling performance, favored and enhanced the defense mechanisms. The Si source supplied by Agrosilício® provides early rapid anticipation of peroxidase, which may have ameliorated and delayed the damage of the pathogen in the seedlings. The AHC as a source of Si, although it has contributed to the potentiation of defense enzymes in the later stages of infection was not efficient in controlling the incidence of the disease. The seed coating with Si decreases the incidence and severity of C. lindemuthianum and provides greater growth of the bean seedlings. The effect of responses potentiated by Si has greater expressiveness in the cultivar of greater susceptibility.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:04:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4458_1.pdf: 786506 bytes, checksum: 30ccb6ed2c83e0fa52dedbb745159fb1 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / Foram analisadas 20 linhagens de C. gloeosporioides quanto às características genéticas e citomorfológicas. Os marcadores moleculares, RAPD, microssatélites, Intron Spice Site Primer e região ITS do DNA ribossomal, foram utilizados para avaliar a diversidade genética entre as linhagens. A análise de agrupamento através do método UPGMA confirmou a diversidade genética intraespecífica reconhecida em C. gloeosporioides. Com a técnica de RAPD foi detectada uma maior similaridade genética entre as linhagens. As regiões de microssatélites investigadas, demonstraram alto polimorfismo genético e os introns discriminaram todos as linhagens apenas com o primer (EI-1), e revelaram maior diversidade genética em relação aos outros marcadores moleculares utilizados. As três enzimas de restrição testadas, HaeIII, DraI e MspI evidenciaram a diversidade genética entre as linhagens nos produtos de amplificação dos loci ITS1-5.8S-ITS2 do rDNA com os primers ITS1 e ITS4. Todos os marcadores empregados, foram eficientes em demonstrar o alto grau de polimorfismo genético, constatado pela formação de grupos altamente diversificados, sem apresentar correlação entre os hospedeiros. Os aspectos macroscópicos exibiram uma variação na coloração, textura e segregação de setores nas colônias, e as observações microscópicas demonstraram a formação de estruturas vegetativas e reprodutivas peculiares da espécie. A condição nuclear investigada através da técnica de HCl-Giemsa, evidenciou conídios 100% uninucleados

Made available in DSpace on 2017-07-10T18:01:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Eliete Moura de Souza Hurmann.pdf: 819870 bytes, checksum: 4302d144fe2194c2bcd5c074b31e3635 (MD5) Previous issue date: 2016-01-08 / Fundação Araucária / Trichoderma spp. is a promising antagonist, the development and use of products based on this organism gives us the opportunity not only to reduce health risks, but also costs and environmental damage. This work aimed to analyze the efficiency of Trichoderma viride extracts and Trichoderma stromaticum against some microorganisms of interest in clinical medicine, agriculture and fish farming. Among them Colletotrichum musae, banana anthracnose causes, Saprolegnia, which affects fish eggs and some bacteria that cause harm to human health. The dichlorometane extracts were tested at various concentrations, and as positive control a commercial antimicrobial. Inhibition of the pathogen was verified directly by paired cultivation technique. The antimicrobial activity of the extracts was evaluated by disk diffusion and the determination of minimum inhibitory concentration (MIC) by microdilution test broth. In situ tests were done in the fruit inoculating the pathogenic fungus and treated with the extracts and the sensory analysis where it was determined the acceptance of the product. In cultivation paired the Trichoderma spp. inhibited the growth of pathogens being 0.05% significance level. In the disk diffusion test results were positive, and for E. coli and Aeromonas hydrophila gave the best results. MIC against microorganisms of the extracts ranged from 50% to 3,125%. Given the results presented, it is concluded that the extracts were effective in in vitro inhibition of the microorganisms as well as their application in the fruits did not alter the organoleptic characteristics. / O Trichoderma spp. é um antagonista promissor, o desenvolvimento e uso de produtos à base deste microrganismo nos oferece a oportunidade, não apenas de reduzir os riscos da saúde, mas também custos e danos ambientais. Assim, este trabalho teve por objetivo analisar a eficiência dos extratos de Trichoderma viride e Trichoderma stromaticum contra alguns microrganismos de interesse na clínica médica, agricultura e piscicultura. Dentre eles o Colletotrichum musae, causador da antracnose da banana, Saprolegnia, que acomete ovas de peixes e algumas bactérias que causam danos à saúde humana. Os extratos diclorometânicos foram testados em várias concentrações, tendo como controle positivo um antimicrobiano comercial. A inibição do patógeno foi verificada, de forma direta pela técnica de cultivo pareado. A atividade antimicrobiana dos extratos foi avaliada por disco-difusão e pela determinação da concentração inibitória mínima (MIC) por teste de microdiluição em caldo. Foram feitos testes in situ no fruto inoculando o fungo patogênico e tratados com os extratos e a análise sensorial onde foi determinada a aceitação do produto. No cultivo pareado os Trichoderma spp. inibiram o crescimento dos patógenos sendo 0,05% de significância. No teste de disco-difusão os resultados foram positivos, sendo que para Aeromonas hydrophila e E. coli obteve-se os melhores resultados. O MIC (concentração inibitória mínima)dos extratos contra os microrganismos variou de 50% a 3,125 %. Diante dos resultados apresentados, evidenciou-se que, os extratos foram eficientes na inibição in vitrodos microrganismos testados, bem como sua aplicação nos frutos não alterou as características organolépticas dos mesmos.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-06-14T17:15:28Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1088159 bytes, checksum: 3e4a1e4b87da8b32eca25f8a7f62ba92 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-14T17:15:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1088159 bytes, checksum: 3e4a1e4b87da8b32eca25f8a7f62ba92 (MD5) Previous issue date: 2017-07-07 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O Coffea arabica L. é a espécie de maior importância econômica e o desenvolvimento de cultivares resistentes às principais doenças do cafeeiro, como a ferrugem (Hemileia vastatrix) e a antracnose dos frutos (Colletotrichum kahawae), é importante para obter estabilidade produtiva e diminuição dos custos de produção. Para aumentar a eficiência de seleção de cafeeiros superiores no melhoramento genético deve-se realizar a caracterização morfoagronômica dos materiais genéticos a serem selecionados e a estimação dos valores genéticos dos indivíduos. Além disso, aliar essas metodologias à seleção assistida por marcadores moleculares (SAM) é uma forma de minimizar as limitações da seleção puramente fenotípica. Essa estratégia reduz o tempo e o custo para seleção e, para a resistência a doenças, permite a busca de resistência duradoura e de amplo espectro por meio da piramidação de genes. Portanto, objetivou-se identificar cafeeiros para avanço de geração no programa de melhoramento por meio de seleção baseada na metodologia de modelos mistos (REML/BLUP) aliada à seleção assistida por marcadores. Para isso, sete características morfoagronômicas foram utilizadas para avaliar a diversidade genética, estimar os parâmetros genéticos e quantificar os ganhos com a seleção de famílias em melhoramento. Cafeeiros resistentes a doenças em campo foram analisados com marcadores moleculares para identificar indivíduos portadores de genes que conferem resistência a diferentes raças de H. vastatrix e resistência a C. kahawae, visando a piramidação de genes e obtenção de resistência múltipla. As populações analisadas neste trabalho fazem parte do Programa de Melhoramento Genético do Cafeeiro desenvolvido pela Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (EPAMIG), em parceria com a Universidade Federal de Viçosa (UFV), a Universidade Federal de Lavras (UFLA) e a Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa Café). As plantas que deram origem a essas populações, por serem potenciais fontes de resistência à H. vastatrix, foram introduzidas pela UFV, oriundas do Centro de Investigação das Ferrugens do Cafeeiro (CIFC), localizado em Oeiras/Portugal. Com base nas características morfoagronômicas e análise de agrupamento, observou-se alto grau de parentesco entre as famílias. O índice de seleção permitiu selecionar nove famílias, com ganhos de seleção superior a 26% em relação à população original. Com base em marcadores moleculares, das nove famílias selecionadas, oito apresentaram em suas progênies o gene S H 3 de resistência a H. vastatrix e a outra o gene Ck-1 de resistência a C. kahawae. A SAM permitiu, ainda, identificar uma família que embora não tenham sido selecionada nas análises morfoagronômicas, é portadora do gene para resistência às raças I, II e patótipo 001 de H. vastatrix. Os cafeeiros selecionados pelas características morfoagronômicas e SAM foram superiores às testemunhas e apresentaram genes em indivíduos diferentes, que conferem resistência às principais doenças do cafeeiro, ferrugem e C. kahawae. Esses cafeeiros podem ser utilizados como fonte de resistência para novos cruzamentos. Além disso, buscou-se avaliar novas fontes de resistência em outra população, no qual a SAM permitiu identificar 31 famílias portadoras do gene S H 3, duas com o gene Ck-1, seis para o QTL ligado ao grupo de ligação 2, e duas para o QTL ligado ao grupo de ligação 5. Esses diferentes genes foram encontrados isolados em alguns cafeeiros e também piramidados em outros, com diferentes combinações. Os cafeeiros selecionados poderão ser utilizados para avanço de geração no melhoramento e como fontes para piramidação de genes nos programas de melhoramento com vista a obter cultivar com resistência múltipla e durável. / Coffea arabica L. is the most economically important species and the development of resistant cultivars to the main coffee plants diseases, such as rust (Hemileia vastatrix) and fruit anthracnose (Colletotrichum kahawae), is important to obtain productive stability and production costs decrease. In order to increase the selection efficiency for superior coffee plants in genetic improvement, the morphological analysis of the genetic material to be selected and the estimation of the individuals’ genetic values should be carried out. In addition, combining these methodologies with molecular marker-assisted selection (MAS) is a way of minimizing the purely phenotypic selection limitations. This strategy reduces time and selection cost and, for disease resistance, allows the search for long- lasting and wide spectrum resistance through gene pyramidation. Therefore, this study’s objective was to identify coffee plants for the breeding program advance generation, based on mixed models selection (REML/BLUP), combined with markers assisted selection. For this, seven morphoagronomic characteristics were used to evaluate genetic diversity, to estimate the genetic parameters and to quantify the gains with families’ selection in breeding. Field-resistant coffee plants were analyzed with molecular markers to identify individuals carrying genes that confer resistance to different strains of H. vastatrix and resistance to C. kahawae, aiming at genes pyramiding of and obtaining multiple resistance. The populations analyzed in this work are part of the Coffee Breeding Program developed by the Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (EPAMIG), in partnership with the Universidade Federal de Viçosa (UFV), the Universidade Federal de Lavras (UFLA) and the Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa Café). The plants that gave origin to these populations, being potential resistance sources to H. vastatrix, were introduced by the UFV, from the Centro de Investigação das Ferrugens do Cafeeiro (CIFC), located in Oeiras/Portugal. Based on the morphoagronomic characteristics and cluster analysis, a high kinship degree between families was observed. The selection index allowed nine families to be selected, with selection gains higher than 26% in relation to the original population. Based on molecular markers, eight out of the nine families selected had H. vastatrix resistance S H 3 gene and the Ck-1 gene resistance to C. kahawae in their progenies. The MAS also allowed to identify a family that although has not been selected by the morphoagronomic analyzes, it is a carrier of the resistance gene to the races I, II and to H. vastatrix 001 pathotype. The coffee plants selected by MAS and morphological characteristics were superior to the controls and presented genes in different individuals, which confer resistance to the main coffee plants diseases, rust and C. kahawae. These coffee plants can be used as a resistance source for new crossings. In addition, new resistance sources in another population were evaluated, in which MAS allowed to identify 31 families carrying S H 3 gene, two with Ck-1 gene, six for the QTL linked to the linkage group 2, and two for the QTL linked to the linking group 5. These different genes were found isolated in some coffee plants and also pyramidal in others, under different combinations. The selected coffee plants may be used for generation advance and as gene pyramiding sources in breeding programs aiming to obtain a durable and multiple resistant crop.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2017-03-13T14:15:35Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) TESE HENRIQUE PADILHA!.pdf: 2745123 bytes, checksum: 6c3cc4bc0855288de567f8b22b28debe (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-03-17T21:15:43Z (GMT) No. of bitstreams: 2 TESE HENRIQUE PADILHA!.pdf: 2745123 bytes, checksum: 6c3cc4bc0855288de567f8b22b28debe (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T21:15:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE HENRIQUE PADILHA!.pdf: 2745123 bytes, checksum: 6c3cc4bc0855288de567f8b22b28debe (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-21 / O consumo de pimentas (Capsicum, Solanaceae) vem aumentando progressivamente, devido à diversidade, multiplicidade dos usos e propriedades funcionais dos seus frutos. Um dos problemas que limita a produtividade de pimentas é a antracnose, doença fúngica recorrente na região sul do Brasil, que resulta em prejuízos ao produtor e ao consumidor. Frente a esse problema, a ampla diversidade genética encontrada nas pimentas representa uma importante fonte para novas alternativas. O objetivo geral deste trabalho foi contribuir para a caracterização de recursos genéticos de pimentas do gênero Capsicum. A tese está apresentada na forma de três capítulos, cujos objetivos foram caracterizar morfologicamente acessos de pimentas do Banco Ativo de Germoplasma de Capsicum da Embrapa Clima Temperado, avaliar a divergência genética e estimar a entropia dos caracteres avaliados; avaliar a reação de acessos de pimentas à antracnose e identificar possíveis fontes de resistência; e realizar a avaliação metabolômica de acessos de pimentas contrastantes para resposta à antracnose. No primeiro capítulo, foram caracterizados 21 acessos de pimentas (C. baccatum e C. chinense) com o uso de 47 descritores morfológicos. Foi verificada ampla diversidade genética para os caracteres avaliados. Os descritores posição da flor, posição do estigma, cor de fruto maduro, pungência e comprimento de planta apresentaram elevada entropia. No segundo capítulo, os mesmos acessos foram avaliados quanto à resposta à antracnose. Os frutos foram colhidos e inoculados em duas fases de maturação. Foi possível diferenciá-los a partir da inoculação com um isolado do fungo Colletotrichum acutatum. Os acessos avaliados não apresentaram resistência total à antracnose. Foi observada variação para resposta à antracnose. A resistência de pimentas à antracnose se expressa de forma diferente de acordo com a fase de maturação do fruto. Dentre os acessos avaliados, P27 apresentou maior resistência à doença e P175 maior suscetibilidade. No terceiro capítulo, foi realizada a avaliação metabôlomica dos frutos dos acessos contrastantes para a resistência à antracnose. Para as análises foram utilizadas técnicas de cromatografia líquida, gasosa e espectrometria de massas. A concentração de metabólitos especializados em frutos de pimentas varia conforme a fase de maturação. A concentração de capsaicinoides e capsinoides dos frutos não influencia a resistência à antracnose. A produção dos compostos butano-2,3-diol, L-threitol, D-frutose e α-D-glucopyranoside nos frutos foi alterada pela incidência da antracnose. O estudo da relação dos compostos dos frutos de pimenta em resposta ao ataque do patógeno gera informações sobre o processo de resistência e suscetibilidade, assim como desperta novos estudos que busquem elucidar a compressão da interação planta-patógeno e uso de recursos genéticos para obtenção de genótipos resistentes. / The consumption of peppers (Capsicum, Solanaceae) increases progressively, due to diversity, multiplicity of usage and the functional properties of the fruits. One of the problems that limit the peppers produtivity is anthracnose, a recurrent fungal disease in South of Brazil, results in losses to producers and consumers. Facing this problem, the wide genetic diversity found in peppers represents an important source of new alternatives. The general objective of this work was to contribute to the characterization of genetic resources of Capsicum peppers. The thesis is presented in form of three chapters, whose objectives were to perform morphological characterization of peppers accessions from the Capsicum Genebank of Embrapa Temperate Agriculture, to evaluate the genetic divergence and estimate the entropy of descriptors; we performed the evaluation of peppers accessions reaction to anthracnose, as well as to identify possible new sources of resistance; and to perform the metabolomic evaluation of contrasting peppers accessions to anthracnose response. In the first chapter, 21 accessions of peppers (C. baccatum and C. chinense) were characterized using 47 morphological descriptors. A wide genetic diversity was verified for the evaluated characters. The descriptors flower positon, stigma position, ripe fruit color, pungence and plant length presented high entropy. In the second chapter, the same accessions were evaluated for anthracnose response. It was possible to differentiate them through inoculation of Colletotrichum acutatum isolate. The fruits were detached and inoculated in two maturation stage. Accessions did not present complete resistance to anthracnose. Great genetic diversity was observed to anthracnose response. Anthracnose resistance of peppers was expressed differently according to fruit maturation stage. Among evaluated accessions, P27 presented greater resistance to the disease and P175 more susceptibility. In the third chapter, metabomic evaluation of contrasting accessions for anthracnose resistance was performed. Liquid chromatography, gas chromatography and mass spectrometry were used for analyzes. Different metabolomic responses were observed for pepper accessions. The concentration of specialized metabolites in peppers fruits varies according to maturation stage. Capsaicinoids and capsinoids content in fruits did not influence resistance to anthracnose. The production of butane-2,3-diol, L-threitol, D-fructose and α-Dglucopyranoside in fruits was affected by anthracnose. The study of relationship of pepper fruit compounds in response to pathogen's attack, generates information about resistance and susceptibility process, as well as instigates new studies that aim to understand the plant-pathogen interaction and the usage of genetic resources to obtain resistant genotypes.