Made available in DSpace on 2016-08-10T10:44:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 NICELLY BRAUDES ARAUJO.pdf: 459324 bytes, checksum: 86c3d7c381647de67fdebaa900b6869a (MD5) Previous issue date: 2006-09-25 / The Ribeirão Ouvidor basin is located in the Southeast of the State of Goiás. This stream is formed by the junction of the Taquara I and Taquara II streams and belongs to the Paranaíba River basin, high Paraná River basin. This study aims to describe the fish assemblage using ecological descriptors and to determine the fish-environment interaction considering ten environmental parameters (presence of environmental impacts, channel substrate, water temperature, dissolved oxygen, pH, conductivity, turbidity, luminosity, water flow velocity, and channel width). Fish sampling and measurement of environmental parameters were carried out from August/2004 to June/2005) in a stretch 50m long of nine tributaries and in the main channel of the Ribeirão Ouvidor. Fishes were collected using electric fishing equipment. Four thousand forty-nine individuals were collected, reaching the saturation of species with a total richness of 35 species, from which 42.8% are constant in the sampled watercourses. The richness, diversity (Shannon-Wiener) and uniformity are highest in courses with greater water volume, as the Ribeirão Ouvidor, than in streams. This result was corroborated by the rarefaction analysis. The multivariate analysis of Co-inertia indicates that of the ten environmental parameters considered, the water flow velocity, channel width, pH and water temperature structure the fish assemblage. The interaction of the water flow velocity and channel width with the ichthyofauna is influenced by the anthropogenic activities, while that involving pH and water temperature is influenced by the regional seasonality. / A bacia do Ribeirão Ouvidor está localizada no sudeste do estado de Goiás. O ribeirão nasce da junção dos córregos Taquara I e Taquara II e deságua no rio Paranaíba, pertencendo assim, à bacia do rio Paraná. Este estudo tem como objetivo descrever ecologicamente a comunidade ictiofaunística e determinar a interação peixe-ambiente considerando dez parâmetros ambientais (presença de impactos ambientais, substrato da calha, temperatura da água, oxigênio dissolvido, pH, condutividade, turbidez, luminosidade, velocidade da água e largura da calha). As amostragens da ictiofauna e dos parâmetros ambientais foram realizadas bimestralmente (de Agosto/2004 a Junho/2005) num trecho de 50m de comprimento de nove afluentes e na calha principal do Ribeirão Ouvidor. A coleta dos peixes foi realizada utilizando-se a pesca elétrica. Foram coletados 4049 indivíduos, a saturação de espécies foi atinginda com uma riqueza total de 35 espécies, das quais 42,8% são constantes nos locais amostrados. A riqueza, diversidade (Shannon-Wiener) e uniformidade são maiores em cursos com maior volume de água, como o Ribeirão Ouvidor, que em córregos, resultado este corroborado pela análise de rarefação. A análise multivariada de Co-inércia indica que dos dez parâmetros ambientais considerados, a velocidade da água, largura da calha, pH e temperatura da água estruturam as assembléias de peixes. A interação da velocidade da água e largura da calha com a ictiofauna é influenciada pelas atividades antropogênicas, enquanto que as variáveis pH e temperatura tem influência da escala temporal regional.

Made available in DSpace on 2016-08-10T10:45:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Monique Pazete de Oliveira.pdf: 358624 bytes, checksum: bd88033e1fca61aa46093f7540c26318 (MD5) Previous issue date: 2008-01-25 / The Meia Ponte River basin occupies an area of 12.180 km² of the Goiás State and it is affluent of the right margin of the Paranaíba River, upper Paraná River basin. The water of this basin supplies industrial and production activities with more than 290 enterprises related mainly to industry, mining, cattle raise, agriculture, aquiculture and electric power production. Receives also domestic sewage generated by several urban areas installed along the basin including the city of Goiânia. This study aims to compares the differences among fish assemblages considering the abundance, richness, the Shannon-Wiener diversity Index and constancy; to determine the quality of the aquatic environment taking into account the relation biomass/abundance; and to determine which among hydrological (water velocity, channel width, channel water depth) and physico-chemical variables (luminosity, Secchi water transparency, conductivity, water temperature, turbidity, and dissolved oxygen) determines the fish assemblage structure. Samples of environmental variables and fish were conducted in five stretches (1000 m) located along the main channel of the Meia Ponte River every two month between March 2006 and February 2007, totalizing six collections and embracing the low and high waters seasons. Fish were captured using four set of nets (meshes 12, 15, 20, 25, 30, 35, 50 and 70 mm) and five minnow-traps. It was collected 2.736 individuals distributed in 64 species. Results show that the pattern of the number of constant species along the channel river contrasts with those of the accessory and occasional species. Significant differences among stretches are observed considering the abundance, richness and Shannon-Wiener diversity Index. The analysis cluster indicates that the fish assemblages of the stretches 1, 2 and 3 are different from those downstream the hydroelectric reservoir of Rochedo (stretches 4 and 5). The ABC curves suggests that upperstream stretches (1 to 3) are less polluted that those (4 and 5) downstream the Rochedo reservoir. Two environmental variables structure the fish assemblages the width channel and the water velocity. Anthropogenic impacts influence on the results obtained. / A bacia do Rio Meia Ponte ocupa uma área de 12.180 km² do Estado de Goiás e está localizado na margem direita do Rio Paranaíba, alto rio Paraná. A água desta bacia abastece de forma direta atividades industriais e de produção, com mais de 290 empreendimentos relacionados principalmente com indústrias diversas, extração mineral, pecuária, agricultura, aqüicultura e produção de energia elétrica. Ela é receptora do esgoto doméstico gerado por várias cidades instaladas ao longo na mesma incluindo a cidade de Goiânia. Este estudo objetiva comparar as diferenças entre as assembléias de peixes considerando a abundância, riqueza, índice de diversidade de Shannon- Wiener, uniformidade e constância, determinar a qualidade do ambiente aquático levando em conta a relação biomassa/abundância, assim como as variáveis que estruturam as assembléias de peixes considerando a velocidade da água, largura do canal, profundidade do canal, luminosidade, condutividade, temperatura da água, turbidez, e oxigênio dissolvido. As amostras das variáveis ambientais e dos peixes foram realizadas bimestralmente em cinco seções (1000 m) localizadas ao longo do canal principal do rio Meias Ponte entre março de 2006 e fevereiro de 2007, totalizando seis coletas. Os peixes foram capturados utilizando quatro conjuntos de redes (malhas 12, 15, 20, 25, 30, 35, 50 e 70 mm) e cinco armadilhas do tipo Gee. Foram coletados 2.736 indivíduos distribuídos em 64 espécies. Os resultados mostram que o padrão do número de espécies constantes ao longo da calha contrasta com este das acessórias e ocasionais. Diferenças significativas entre os trechos são observadas considerando a abundância, índice de diversidade de Shannon-Wiener e riqueza. A análise de Cluster indica que as assembléias de peixe dos trechos 1, 2 e 3 são diferentes daquelas a jusante do reservatório hidroelétrico do Rochedo (seções 4 e 5). As curvas ABC sugerem que os trechos superiores (1 a 3) estão menos poluídos do que aqueles a jusante do reservatório do Rochedo (4 e 5). Duas variáveis ambientais estruturam as assembléias de peixe, a largura do canal e a velocidade da água. As atividades antropogênicas presentes na bacia influenciam nos resultados encontrados.

Muitos procedimentos vêm sendo desenvolvidos para auxiliar no diagnóstico precoce do câncer de mama. Devido a subjetividade na interpretação de imagens, os sistemas de diagnóstico auxiliado por computador (CADx) têm oferecido ao especialista uma segunda opinião mais precisa e confiável. Nesse propósito, essa pesquisa apresenta uma metodologia de investigação da potencialidade diagnóstica de um sistema computacional na classificação de achados suspeitos em imagens de ultrassom modo-B e de elastografia da mama. A base de dados foi constituída por 31 lesões malignas e 52 benignas e um conjunto adicional contendo 206 lesões de ultrassom modo-B (144 benignas e 62 malignas) para a realização dos testes de aprendizado de máquina. O contorno foi determinado automaticamente e através do delineamento manual de três radiologistas sob a imagem de ultrassom modo-B e, em seguida, mapeado na imagem elastográfica. As lesões foram classificadas pelo sistema CADx desenvolvido para ultrassom modo-B e elastografia do tipo strain. Os dados foram avaliados por meio da sensibilidade, especificidade e AUC. O sistema CADx desenvolvido proporcionou equivalência diagnóstica para a classificação das lesões a partir das diversas formas de determinação do contorno (manual e automática), permitindo a redução da variabilidade. Além disso, o sistema apontou resultados superiores à análise visual do radiologista que, quando considerado o resultado fornecido pela associação entre as imagens de ultrassom modo-B e elastografia, proporcionou um aumento comparativo de cerca de 7% em sensibilidade e 17,2% em especificidade nos testes com o sistema CADx usando o contorno feito pelo radiologista mais experiente. Além disso, constatou-se uma influência positiva no uso da ferramenta computacional pelos radiologistas, pois, na média, seus índices de sensibilidade e especificidade diagnóstica aumentaram também em relação à situação de análise convencional, passando de 87,1% e 55,8% para 90,3% e 73,1%, respectivamente. / Many procedures have been developed to aid in the early detection and diagnosis of breast cancer. In this context, Computer-Aided Diagnosis (CADx) systems were designed to provide to the specialist a reliable second opinion. This study presents the proposal of investigating the diagnostic ability of a computational system in the characterization of suspicious findings in B-mode ultrasound and breast elastography imaging. The database consisted of 31 malignant and 52 benign lesions and an additional data set containing 206 lesions (144 benign and 62 malignant) seen only on the B-mode ultrasound for performing the machine learning tests. Three radiologists drew manually the contour of the lesions in B-mode ultrasound and we used an automatic technique to segment the lesions. Then, the contour was mapped in the elastography image. The lesions were classified using the CADx system developed for B-mode ultrasound and strain elastography. We calculated the sensitivity, specificity and AUC to evaluate the data. The developed CADx system provided a diagnostic concordance in the classification of breast lesions from the different ways of contour determination (manual and automatic), allowing to reduce the diagnostic variability. In addition, the CADx system showed superior results to the visual analysis of the radiologist. When the radiologist associated both examinations (B-mode ultrasound and elastography), his visual analysis provided 87.10%, 55.77% and 0.714 of sensitivity, specificity and AUC, respectively. When we considered the result provided by the association between B-mode ultrasound and elastography images, the CADx system provided a comparative increase of about 7% of sensitivity and 17.2% of specificity, using the contour delimited by the most experienced radiologist. In addition, a positive influence was observed in the use of the computational tool by radiologists, since, on average, their sensitivity and specificity indexes also increased in relation to the conventional analysis, from 87.1% and 55.8% to 90.3% and 73.1%, respectively.

TEMA: a questão complexa sobre terminologia de uma área do saber, aqui a Fonoaudiologia, ciência em fase de amadurecimento. OBJETIVO: proposição de tesauro específico sobre a Fonoaudiologia, nas Línguas Inglesa, Portuguesa e Espanhola, a partir dos descritores existentes nos Descritores em Ciências da Saúde (DeCS). MÉTODO: baseado no estudo piloto de Campanatti-Ostiz e Andrade (2008), que teve por objetivo a verificação da viabilidade metodológica para a criação da categoria específica da Fonoaudiologia brasileira no DeCS. As bases de dados selecionadas para o acesso aos títulos, resumos e palavraschave dos artigos científicos analisados foram a National Library of Medicine (NLM) e a Scientific Eletronic Library On Line (SciELO). As revistas científicas selecionadas para a análise de artigos científicos foram as de Fonoaudiologia indexadas na SciELO e publicadas durante 24 meses: Pró- Fono Revista de Atualização Científica, Revista Cefac Atualização Científica em Fonoaudiologia e Revista da Sociedade Brasileira de Fonoaudiologia. As partes constituintes dos artigos científicos eleitas para o levantamento e tratamento dos termos foram os títulos, resumos e palavras-chave. Primeiramente foi realizada a recuperação dos Descritores em Língua Inglesa (Medical Subject Headings - MeSH) e, posteriormente, a recuperação e hierarquização dos descritores em Língua Portuguesa (DeCS). As análises realizadas dos dados foram: análise descritiva dos dados e análise de relevância relativa das áreas do DeCS. A partir da análise descritiva dos dados, decidiu-se pela participação de todos os 761 descritores, com todos os seus números hierárquicos, independente de seus números de ocorrência (NO). A partir da análise de relevância relativa das XIV áreas do DeCS, optou-se pela proposição do tesauro da Fonoaudiologia, excluindo-se as áreas menos relevantes e as áreas exclusivas do DeCS (sem equivalência às áreas do MeSH). RESULTADOS: nos 311 artigos analisados, inicialmente foram encontradas 3511 ocorrências de descritores MeSH (média de 11,29 descritores MeSH por artigo) e 3492 ocorrências de descritores DeCS equivalentes (761 diferentes descritores DeCS). Para o arranjo dos descritores DeCS levantados em sub-areas da Fonoaudiologia, optou-se pela utilização das hierarquizações das áreas propostas pelo DeCS. Após a exclusão das áreas não relevantes e exclusivas do DeCS, e inserção dos descritores faltantes para que todos os níveis hierárquicos fossem contemplados, desde os mais específicos até os mais amplos, a proposição foi finalizada com um total de 1676 ocorrências de descritores DeCS, sendo 1189 ocorrências (71%) advindas de descritores levantados durante a pesquisa e 487 ocorrências (29%) advindas de descritores acrescentados para a complementação dos níveis. CONCLUSÃO: a proposição de tesauro apresentada contém os termos de domínio da Fonoaudiologia brasileira e refletem os descritores da produção científica das publicações pesquisadas. Sendo o DeCS um vocabulário trilingue (Português, Inglês e Espanhol), esta proposição de organização dos descritores poderá ser apresentada nestas três Línguas, propiciando maior intercâmbio cultural entre as diferentes nações / BACKGROUND: the complex issue related to terminology of a field of knowledge; in the present work the Speech-Language and Hearing Science, an area in development. AIM: to propose a specific thesaurus about the Speech-Language and Hearing Science, for the English, Portuguese and Spanish languages, based on the existing keywords available on the Health Sciences Descriptors (DeCS). METHOD: methodology was based on the pilot study developed by Campanatti-Ostiz and Andrade (2008) that had as a purpose to verify the methodological viability for the creation of a Speech-Language and Hearing Science category in the DeCS. The selected data base that gave access to titles, abstracts and keywords of the analyzed scientific articles were the National Library of Medicine (NLM) and the Scientific Eletronic Library On Line (SciELO). The scientific journals selected for analyses were those in the field of the Speech-Language and Hearing Science, indexed on the SciELO and published in the last 24 months: Pró-Fono Revista de Atualização Científica, Revista Cefac Atualização Científica em Fonoaudiologia and Revista da Sociedade Brasileira de Fonoaudiologia. The titles, abstracts and keywords of all scientific articles were selected for terminology analyses. First of all, the recovery of the Descriptors in the English language was done (Medical Subject Headings - MeSH). After that, the recovery and hierarchic organization of the descriptors in the Portuguese language was done (DeCS). The obtained data was analyzed as follows: descriptive analyses and relative relevance analyses of the DeCS areas. Based on the descriptive data analyses, we decided to select all 761 descriptors, with all the hierarchic XVI numbers, independently of their occurrence (occurrence number - ON). After the relative relevance analyses of the DeCS areas, we decided to propose the thesaurus for the Speech-Language and Hearing Science, excluding the less relevant areas and the exclusive DeCS areas (with no equivalence to the MeSH areas). RESULTS: out of the 311 analyzed articles, 3511 MeSH descriptor occurrences (mean of 11.29 MeSH descriptors per article) and 3492 equivalent DeCS descriptor occurrences (761 different DeCS descriptors) were found. For the arrangement of the DeCS descriptors found in the subareas of the Speech-Language and Hearing Sciences, we decided to use the hierarchic areas proposed by the DeCS. After the exclusion of the nonrelevant and exclusive DeCS areas, and the insertion of the lacking descriptors so that all hierachic levels were contemplated specific and broad the proposal was finished with a total of 1676 occurrences of DeCS descriptors, being 1189 occurrences (71%) of descriptors found during the research and 487 occurrences (29%) of descriptors that were added in order to complement all levels. CONCLUSION: the presented proposal of a thesaurus contains the specific terminology of the Brazilian Speech-Language and Hearing Sciences and reflects the descriptors of the published scientific production. Being the DeCS a trilingual vocabulary (Portuguese, English and Spanish), the present descriptors organization proposition can be used in these three languages, allowing greater cultural interchange between different nations

Esta dissertação faz um estudo da aplicação da técnica estatística denominada Análise de Dados Funcionais (ADF) à geração de descritores usados em reconhecimento de padrões, mais especificamente, no reconhecimento de objetos de interesse em imagens. Estes objetos podem ser representados por vetores de características, também chamados de assinaturas, obtidos por uma técnica chamada de Dimensão Fractal Multiescala (DFM). Ocorre que estes vetores apresentam alta dimensionalidade (número de elementos), fazendo-se assim necessário o uso de uma abordagem que reduza este número de valores, sem que haja uma grande perda da informação transmitida pela assinatura. Neste contexto, diversas técnicas de extração de um reduzido conjunto de descritores da assinatura são apresentadas pela literatura. Entre estas, as mais populares são Fourier e \\emph, ambas relativamente simples de se apresentar e com resultados satisfatórios. A proposta aqui apresentada é de se utilizar ADF em combinação com DFM na geração de descritores de padrões. Os resultados obtidos com o uso desta abordagem na geração de descritores demostraram que a técnica possibilita bons resultados, mesmo em situações em que não é possível o uso de muitos descritores. Os experimentos demostraram que ADF apresenta um bom potencial para aplicação neste tipo de problema, permitindo que o método de classificação alcance bons resultados mesmo com poucos descritores. São sugeridos trabalhos futuros em que ADF possa ser usada, pesquisando-se por métodos ainda mais eficazes. / This work studies the application of a statistical technique named Functional Data Analysis (FDA) for the generation of descriptors. These descriptors can be used for pattern recognition, more specifically, for the recognition of relevant objects in an image. These objects can be represented by features vectors, also known as signatures, obtained by a technique named Multi-scale Fractal Dimension (MFD). These vectors present a high dimensionality (number of elements), causing to be necessary the use of an approach for the reduction of this number of values, but without a large loss of information carried by the signature. In this context, several techniques for the extraction of a reduced set of signature descriptors are studied in the literature. Among these techniques, the most classic are Fourier and wavelets, both with simple presentation and providing satisfactory results. The proposal presented here is the use of FDA combined with MFD for the generation of pattern descriptors. The results obtained by the use of this approach for the generation of descriptors showed that this technique allows the obtention of good results, even in situations in wich is not possible the use of many descriptors. FDA was also applied to the extraction of descriptors of MFD texture signatures. Also in this case, the results were interesting. The experiments showed the FDA presents a good potential for the application to this type of problem, allowing the obtention of good results even by using a few descriptors. It is suggested future works in which FDA can be used, researching for still more efficient methods.

Muitos procedimentos vêm sendo desenvolvidos para auxiliar no diagnóstico precoce do câncer de mama. Devido a subjetividade na interpretação de imagens, os sistemas de diagnóstico auxiliado por computador (CADx) têm oferecido ao especialista uma segunda opinião mais precisa e confiável. Nesse propósito, essa pesquisa apresenta uma metodologia de investigação da potencialidade diagnóstica de um sistema computacional na classificação de achados suspeitos em imagens de ultrassom modo-B e de elastografia da mama. A base de dados foi constituída por 31 lesões malignas e 52 benignas e um conjunto adicional contendo 206 lesões de ultrassom modo-B (144 benignas e 62 malignas) para a realização dos testes de aprendizado de máquina. O contorno foi determinado automaticamente e através do delineamento manual de três radiologistas sob a imagem de ultrassom modo-B e, em seguida, mapeado na imagem elastográfica. As lesões foram classificadas pelo sistema CADx desenvolvido para ultrassom modo-B e elastografia do tipo strain. Os dados foram avaliados por meio da sensibilidade, especificidade e AUC. O sistema CADx desenvolvido proporcionou equivalência diagnóstica para a classificação das lesões a partir das diversas formas de determinação do contorno (manual e automática), permitindo a redução da variabilidade. Além disso, o sistema apontou resultados superiores à análise visual do radiologista que, quando considerado o resultado fornecido pela associação entre as imagens de ultrassom modo-B e elastografia, proporcionou um aumento comparativo de cerca de 7% em sensibilidade e 17,2% em especificidade nos testes com o sistema CADx usando o contorno feito pelo radiologista mais experiente. Além disso, constatou-se uma influência positiva no uso da ferramenta computacional pelos radiologistas, pois, na média, seus índices de sensibilidade e especificidade diagnóstica aumentaram também em relação à situação de análise convencional, passando de 87,1% e 55,8% para 90,3% e 73,1%, respectivamente. / Many procedures have been developed to aid in the early detection and diagnosis of breast cancer. In this context, Computer-Aided Diagnosis (CADx) systems were designed to provide to the specialist a reliable second opinion. This study presents the proposal of investigating the diagnostic ability of a computational system in the characterization of suspicious findings in B-mode ultrasound and breast elastography imaging. The database consisted of 31 malignant and 52 benign lesions and an additional data set containing 206 lesions (144 benign and 62 malignant) seen only on the B-mode ultrasound for performing the machine learning tests. Three radiologists drew manually the contour of the lesions in B-mode ultrasound and we used an automatic technique to segment the lesions. Then, the contour was mapped in the elastography image. The lesions were classified using the CADx system developed for B-mode ultrasound and strain elastography. We calculated the sensitivity, specificity and AUC to evaluate the data. The developed CADx system provided a diagnostic concordance in the classification of breast lesions from the different ways of contour determination (manual and automatic), allowing to reduce the diagnostic variability. In addition, the CADx system showed superior results to the visual analysis of the radiologist. When the radiologist associated both examinations (B-mode ultrasound and elastography), his visual analysis provided 87.10%, 55.77% and 0.714 of sensitivity, specificity and AUC, respectively. When we considered the result provided by the association between B-mode ultrasound and elastography images, the CADx system provided a comparative increase of about 7% of sensitivity and 17.2% of specificity, using the contour delimited by the most experienced radiologist. In addition, a positive influence was observed in the use of the computational tool by radiologists, since, on average, their sensitivity and specificity indexes also increased in relation to the conventional analysis, from 87.1% and 55.8% to 90.3% and 73.1%, respectively.

Made available in DSpace on 2017-05-12T14:47:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sergio_ Bazilio.pdf: 3134289 bytes, checksum: 8461a5a239e9c7674bb3db224824dc63 (MD5) Previous issue date: 2015-02-12 / Benthic macroinvertebrate community is very important to streams, since they make part of the energy flow and are also an important food source for adjacent and upper trophic levels. They form a very diversified fauna and their structure may be influenced by several environmental factors, which vary in time, space and in an analyzed scale. Samples were taken from benthic macroinvertebrates and environmental descriptors during winter, spring and summer of 2012 and autumn of 2013 in ten sampling points in Lontra river watershed (Paraná, Brazil). Thus, this study aimed at: a) characterizing the watershed morphometry in Lontra river with data from the Shuttle Radar Topography Mission (SRTM); b) analyzing the structure of benthic macroinvertebrate community according to their taxonomic family level and functional groups; c) investigating seasonal variation (during the four seasons) and spatial variation of this community structure due to spatial differences in morphological and physiographic characteristics of the sampled sections; d) identifying the community variability of benthic macroinvertebrates at three spatial scales (river, river segment and mesohabitat) emphasizing spatial scales, which best explain the community structure in this watershed; e) investigating which measured environmental descriptors influence on the community structure and f) which variability percentage in organisms richness can be explained by the measured local environmental descriptors. / Os macroinvertebrados bentônicos constituem uma importante comunidade em riachos, pois participam do fluxo de energia, logo são um importante recurso alimentar para níveis tróficos adjacentes e superiores. Formam uma fauna bastante diversificada e a estrutura dessa comunidade pode ser influenciada por diversos fatores ambientais, os quais variam no tempo, no espaço e na escala analisada. Realizaram-se amostragens de macroinvertebrados bentônicos e descritores ambientais nos períodos de inverno, primavera e verão de 2012 e outono de 2013 em dez pontos amostrais na bacia do Rio Lontra (PR, Brasil). O presente estudo objetivou: a) caracterizar morfometricamente a microbacia do Rio Lontra com dados do projeto da Missão do Radar Transportado Espacial (SRTM). b) analisar a estrutura da comunidade de macroinvertebrados bentônicos em nível taxonômico de família e de grupos funcionais; c) investigar a variação sazonal (nas quatro estações do ano) e a variação espacial da estrutura da comunidade em função de diferenças espaciais nas características morfofisiográficas dos trechos amostrados; d) identificar a variabilidade da comunidade de macroinvertebrados bentônicos em três escalas espaciais (rio, segmento de rio e mesohabitat) com ênfase nas escalas espaciais que melhor explicam a estrutura da comunidade nesta bacia; e) investigar quais descritores ambientais mensurados influenciam a estrutura da comunidade e f) qual porcentagem da variabilidade na riqueza de organismos pode ser explicada pelos descritores ambientais locais mensurados.

Made available in DSpace on 2016-08-12T19:18:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FernandoASA_TESE.pdf: 1416076 bytes, checksum: b1c98d86beac7a63692f0bd1fd27af60 (MD5) Previous issue date: 2010-04-29 / The Brazilian melon agribusiness is in expansion, reaching almost 500 thousand tons per year and making melon the main domestic fruit in both exported volume and value, with this activity being concentrated in the Brazilian Semiarid region. However, Brazil ranks only twelfth among the producing countries in area planted and production and the twentieth-third in productivity, demonstrating that there is still much to do on melon breeding and genetic resources of this crop. Thus, the objectives of this work were to estimate the genetic diversity of melon accessions collected from the traditional agricultural areas of the Brazilian Northeastern region by using descriptors for the fruit and microsatellite markers, and to study the nature of genotype vs. environment interaction and to estimate genetic parameters and gains by selection of melon families, in the Jaguaribe/Assú irrigation projects (Ceará and Rio Grande do Norte States, Brazil). The study of genetic diversity showed great variability among accessions, within and among the botanical groups, enabling advances in genetic improvement of fruit quality traits. Cluster analysis by fruit descriptors formed eight groups, without taxonomic criteria. The characters fruit longitudinal diameter, number of fruits per plant, cavity thickness and total soluble solids were descriptors that contributed most to the dissimilarity of the genotypes. The SSR markers amplified 41 alleles with average of 2.41 alleles and three genotypes per locus. A phylogenetic molecular analysis separated the accessions into 13 groups, also without taxonomic coherence in groups formed. The degree of association between genetic distance morpho-agronomic and molecular matrices was null. Then, there was no significant association between the descriptors and SSR markers, which was predictable due the number of distinct groups, the quantitative nature of the descriptors and the distribution of SSR markers in the genome. In the study of genotype vs. environment interaction, there was heterogeneity among the families for all traits. Heritability estimates in the combined analysis were consistently lower than those estimated for each environment. The simple part of G vs. E interaction was always above 99%, except for pulp firmness, with a predominance of the large complex part between the pairs of environments A1 and A3 and A2 and A3. The direct gains by selection were higher than the indirect gains for all traits in all environments evaluated. Gains were closer to the direct genetic gains when the selection was based on the average of the three environments. Estimates of genetic parameters associated with the simple nature of the family vs. environment interaction allowed genetic progress by simple breeding methods. As the genotype-environment interaction overestimates the coefficient of genetic variation and genetic variance among families in an environment, genotype assessments in more than one location are necessary since that selection is made considering the average of the families on the environments. Therefore, the potential of genetic improvement was demonstrated for the germplasm used in the study of genetic diversity as well as for the germplasm evaluated in the analysis of genotype-environment interaction. / O agronegócio do melão brasileiro tem se expandido bastante, alcançando quase 500 mil toneladas de frutos por ano e tornando o melão a principal fruta nacional, tanto em volume de exportação quanto em valor exportado, estando esta atividade concentrada no semiárido brasileiro. Contudo, o Brasil é apenas o décimo segundo país em produção e área plantada e vigésimo terceiro em produtividade, evidenciando que ainda existe muito por ser feito em termos do melhoramento e recursos genéticos desta cultura. Assim sendo, os objetivos deste trabalho foram estimar a divergência genética de acessos de meloeiro coletados em propriedades de agricultura tradicional do Nordeste brasileiro, tanto por descritores do fruto quanto por marcadores microssatélites e estudar a natureza da interação genótipo x ambiente (G x A) bem como estimar parâmetros genéticos e ganhos por seleção de famílias de melão, no polo Jaguaribe-CE/Assu-RN. O estudo de divergência genética mostrou grande variabilidade entre os acessos, entre e dentro dos grupos botânicos, possibilitando avanços no melhoramento genético dos caracteres de qualidade dos frutos. A análise de agrupamento por descritores do fruto formou oito grupos, sem critérios taxonômicos. Os caracteres diâmetro lateral, número de frutos por planta, espessura da cavidade e sólidos solúveis foram os descritores que mais contribuíram para a dissimilaridade dos genótipos. Os marcadores SSR amplificaram 41 alelos com média de 2,41 alelos e três genótipos por loco. A análise filogenética molecular separou os acessos em 13 grupos, também sem coerência taxonômica nos grupos formados. O grau de associação entre as matrizes de distâncias genéticas morfoagronômica e molecular foi nulo, não havendo associação entre os descritores e os marcadores SSR, o que era previsível devido ao número distinto de grupos, a natureza quantitativa dos descritores e a forma de distribuição dos marcadores SSR no genoma. No estudo de interação genótipo x ambiente, houve heterogeneidade entre as famílias para todas as características avaliadas. As herdabilidades estimadas nas análises conjuntas foram sempre inferiores àquelas estimadas em cada ambiente. A parte simples da interação G x A foi sempre superior a 99%, exceto para firmeza da polpa, com amplo predomínio da parte complexa entre pares de ambientes A1 e A3 e A2 e A3. Os ganhos diretos com seleção foram maiores do que os ganhos indiretos para todas as características, em todos os ambientes avaliados. Os ganhos foram mais próximos dos ganhos genéticos diretos quando se praticou a seleção pela média dos três ambientes. As estimativas de parâmetros genéticos associadas à natureza simples da interação família x ambiente permitem progresso genético por meio de métodos de melhoramento menos sofisticados. Como a interação genótipo x ambiente superestima o coeficiente de variação genético e a variância genética entre famílias em um ambiente, são necessárias avaliações dos genótipos em mais de um local, desde que a seleção seja praticada considerando a média das famílias nos ambientes. Portanto, ficou comprovado o potencial de melhoramento genético tanto no germoplasma utilizado no estudo de divergência genética quanto do germoplasma avaliado nas análises da interação genótipo x ambiente.

A microtomografia computadorizada (computed microtomography - μCT) permite uma análise não destrutiva de amostras, além de possibilitar sua reutilização. A μCT permite também a reconstrução de objetos tridimensionais a partir de suas seções transversais que são obtidas interceptando a amostra através de planos paralelos. Equipamentos de μCT oferecem ao usuário diversas opções de configurações que alteram a qualidade das imagens obtidas afetando, dessa forma, o resultado esperado. Nesta tese foi realizada a caracterização e análise de imagens de μCT geradas pelo microtomógrafo SkyScan1174 Compact Micro-CT. A base desta caracterização é o processamento de imagens. Foram aplicadas técnicas de realce (brilho, saturação, equalização do histograma e filtro de mediana) nas imagens originais gerando novas imagens e em seguida a quantificação de ambos os conjuntos, utilizando descritores de textura (probabilidade máxima, momento de diferença, momento inverso de diferença, entropia e uniformidade). Os resultados mostram que, comparadas às originais, as imagens que passaram por técnicas de realce apresentaram melhoras quando gerados seus modelos tridimensionais. / X-ray Computed Microtomography (μCT) allows a non destructive analysis of samples besides making it possible to reuse them. μCT also allows the reconstruction of tridimensional objects from its transverse sections obtained intersecting the sample through parallel planes. μCT devices offer the user several configuration options which alter the quality of the images obtained affecting, this way, the results expected. In this study, the characterization and analysis of μCT images generated by the X-ray tomograph scannerSkyScan1174 Compact Micro-CT was performed. The basis of this characterization is the processing of images. Enhancement techniques were applied (brightness, saturation, histogram equalization and median filter) in the original images creating new images. Next, the quantification of both sets was performed, using texture descriptors (maximum likelihood, moment of difference, inverse difference moment , entropy and uniformity). The results show that, compared to the originals, the images which went through enhancement techniques had improved when their three-dimensional models were generated.

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As principais alterações do ciclo hidrológico dizem respeito à quantidade de água disponível para o escoamento que é adequadamente representada pelo Índice de Umidade (IU) e como o ecossistema da bacia utiliza esta água, o que o Índice de Horton (IH) estima. No canal dos rios os Indicadores de Alterações Hidrológicas (IAH), permitem acompanhar eventuais modificações de regime hidrológico enquanto o número de Froude (Fr) é um indicador das características hidráulicas do canal. A substituição da cobertura vegetal para pastagem e agricultura já abrange cerca da metade da área da Bacia do Alto Paraguai (BAP), e já constituem uma possibilidade real de modificação do ciclo hidrológico nessa bacia. Desse modo, o objetivo deste trabalho é avaliar a influência de indicadores relacionados com as características da paisagem e do clima (IH e IU) sobre os indicadores que representam as características físicas do habitat fluvial no canal (Fr e IAH) na porção norte da BAP. As coletas dos parâmetros hidroclimáticos utilizados nos cálculos dos indicadores, foram extraídos de banco de dados com séries históricas da Agência Nacional de Águas, onde foram selecionadas 17 estações fluviométricas e pluviométricas. Nessas 17 estações foram delimitados os polígonos das sub-bacias de drenagem, com base no modelo digital de elevação e posteriormente ajustada a precipitação regionalizada para cada sub-bacia, com base em curvas de isoietas. Para averiguar se os processos que ocorrem em escala da bacia (representados por IH e IU) estão influenciando os processos que ocorrem na escala dos canais fluviais (representados por Fr e IAH), foi feita uma análise de correlação, com coeficiente Pearson, entre estes indicadores. Como o IAH produz uma série de indicadores, uma análise de componente principal foi efetuada para reduzir esta complexidade e extrair a variável mais significativa que foi a vazão mínima de 90 dias (Min90dias). O IH cuja média é de 0,76 (variando entre 0,50 a 0,93) é similar a valores encontrados na literatura e correlaciona significativamente (p<0,05) com a Min90dias e Fr. O IU cuja a média é 0,85, varia de 0,55 a 1,30 e não correlaciona com os indicadores de habitat físico nos canais. Os valores de IU caracterizam o clima da BAP como de clima úmido (> 0,65), com pequena variação na classe sub-úmido seco. A pequena variação de IU, quando comparado a estudo em clima temperado-úmido na América do Norte (0,2 a 5,0), possivelmente explica porque não foram observadas correlações significativas entre IU e Min90dias e Fr. Uma análise de correlação foi também efetuada em cada uma das subbacias, assim como uma análise de tendência por sub-bacia para avaliar a variação ao longo do tempo dos indicadores. A Min90dias e o Fr foram mais frequentemente correlacionados significativamente com tempo, do que IU e IH. Em geral, a Min90dias reduziu ao longo do tempo (salvo em uma sub-bacia), o que é atribuído ao aumento da compactação do solo com consequente redução da vazão de base. Em 5 sub-bacias, o Fr aumentou ao longo do tempo e em 2 reduziu com o tempo. O Fr também pode estar sendo afetado pelo uso e ocupação do solo, destacando-se o assoreamento, causado pela erosão e degradação de matas ciliares. De modo geral, os indicadores Fr e Min90dias parecem refletir melhor o histórico de uso e ocupação do solo da BAP, do que os indicadores de processos de bacia (IU e IH), que praticamente não se correlacionam com o tempo. / The change of land use causes changes in the hydrological cycle of drainage basins and consequently in river channels and the habitats of aquatic organisms. The main changes of the hydrological cycle relate to the amount of water available for runoff that is adequately represented by humidity index (UI) and how the basin ecosystem uses this water that the Horton index (HI) estimates. In rivers channels the Indicators of Hydrologic Alteration (IHA) allow to track any changes to hydrological regime while the Froude number (Fr) is an indicator of the hydraulic characteristics of flow in the channel. The substitution of natural vegetation by pastureland and crops already occurs in about half the area of the Upper Paraguay River Basin (BAP) and already constitutes a real possibility of modifying the hydrological cycle of that basin. Thus, the goal of this work is to evaluate the influence of landscape characteristics and climate as represented by humidity and Horton indexes on the physical characteristics of river habitat in the channel as represented by Fr and IHA in the northern portion of BAP. The hydro-climatic parameters used in the calculation of the indicators were obtained from the database of the National Water Agency. Data from 17 rainfall and fluvial stations were selected. In those 17 seasons the polygons of sub-watersheds were delimited based on digital elevation model and subsequently adjusted to regionalized rainfall for each sub-basin based on available isohyet maps. To investigate whether the processes that occur at the basin scale (represented by IH and IU) are influencing the processes that occur on the scale of fluvial channels (represented by Fr and IHA), a Pearson correlation analysis was carried. As IHA produces a series of indicators, a principal component analysis was performed to reduce this complexity and extract the most significant variable, which was the minimum flow rate of 90 days (90daysMin). The average value of IH was 0.76 (ranging from 0.50 to 0.93) is similar to values found in the literature and correlates significantly (p <0.05) with 90daysMin and Fr. The average UI is 0.85 (ranging from 0.55 to 1.30) and does not correlate significantly with indicators of physical habitat in the channels. The range of the humidity index characterizes the climate of the BAP mostly as humid (> 0.65) and somewhat less in the dry sub-humid class. The small variation of UI when compared to study in temperate-humid climate in North America (0.2 to 5.0), possibly explains why no significant correlations between UI and 90daysMin and Fr were observed. A correlation analysis was also performed for each of the sub-basins, as well as a trend analysis by sub-basin to evaluate how the indexes varied over time. The 90daysMin and Fr are most often correlated significantly with time than IH and IU. In general, 90daysMin diminished with time, except in one sub-basin and this is attributed to increased soil compaction with consequent reduction in base flow. In 5 sub-basins, Fr increased over time while it decreased in two others. This maybe due to land use change provoking degradation of riparian areas and channel erosion (decreasing Fr) with subsequent siltation downriver (increasing Fr).In general, the channel indexes, Fr and 90daysMin, seem to reflect the historical use and occupation of BAP better than indicators of watershed processes (IU and IH), which practically do not correlate with time.