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Une évolution permanente : nouveaux essais artistiques et nouveaux médias - Études de Mons 2015 et du Festival d’Art Numérique de Taipei / A permanent evolution : new artistic trials and new media - Studies of Mons 2015 and Taipei Digital Art Festival

Chiu, Hsiao-Chen 21 October 2016 (has links)
Cette thèse est une méditation sur l’art numérique et la perception, qui espère offrir un regard approfondi sur ces sujets. L’évolution technologique, comme le feu de Prométhée, apporte la lumière, et change le mode de vie humain, mais aussi les critères de l’art, en plus de nous introduire dans un monde inimaginable d’hyper-sensations. Science et technologie se déploient dans tous les domaines de la vie, le développement de l’interaction homme-machine nous inonde de dispositifs numériques et multimédia au quotidien, et nous rend familiers des mondes virtuels. Cette recherche explore les interactions entre l’art numérique et ses environnements de création et d’exposition.Deux études de terrain sont ici mises en relation : Le Festival d’Art Numérique de Taipei et Mons 2015, et soulignent un rapport art-science-société comme problématique. D’un point de vue sociologique, l’art numérique représente un microcosme de la société virtuelle et un macrocosme du monde réel, par la création d’une communauté virtuelle invisible.La science technologique incarne l’esprit humain et l’espace-temps, car la relation entre l’homme et la technologie marque la société contemporaine, où le scientifique et l’artiste peuvent créer des mondes imaginaires tout en traversant les oppositions dichotomiques entre la réalité et la virtualité. Ce travail de thèse permet ainsi d’explorer des entrecroisement entre le spectateur et l’œuvre, entre les mondes intelligible et sensible, réel et virtuel, visible et invisible. / This research is a meditation between digital art and perception of real-life, which hopes to offer a comprehensive look on these issues. Technology developments, such as the fire of Prometheus, not only bring the lights and changes in nature’s way into our daily life, but also the Principles and criteria of art. In addition, the new media bring us into unimaginable and hyper-sensations world. Science and technology are deployed and infiltrated in all area, the development of man-machine interaction flooded with digital devices and media every day, and make us rely on virtual worlds unconsciously. This research explores the interactions between digital art, digital art creation and exhibition environments.Two case studies are made here is related to: The Taipei Digital Art Festival and Mons 2015, and highlight a report art-science-society as problematic definition. From sociological point of view, digital art represents a microcosm of the virtual society and a macrocosm of the real world, by creating an invisible virtual community.Technological science embodies the human spirit and the space-time, because the relationship between man and technology marks contemporary society, where the scientist and the artist can create imaginary worlds while crossing dichotomous oppositions between reality and virtuality. This work allows us to explore the intersection between the viewer and the work, between intelligible and sensible worlds, real and virtual, visible and invisible.
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D’une perspective anthropologique vers l’élaboration d’un dispositif de management des connaissances en Afrique de l’Ouest / From an Anthropological perspective to the elaboration of a knowledge management system in West Africa

Capo Chichi, Gilbert 30 March 2016 (has links)
À l‟instar de la mutation des Sciences Humaines et Sociales soutenues par le bouleversement des paradigmes des sciences de l'information et de la communication, et des systèmes de l‟organisation des connaissances vers ceux portés par les sociétés du savoir, il est important, de réétudier la relation entre les individus, les communautés et la technologie dans un contexte d‟apprentissage pour une capitalisation des connaissances.L‟objectif de cette thèse est de proposer un modèle hybride de capitalisation des savoirs soutenu par le management des connaissances dans un contexte béninois. Cette proposition vise à une amélioration des résultats de la réutilisation des connaissances en entreprise.Ainsi, nous sommes parti d‟une interrogation sur l‟existence d‟un modèle de capitalisation des connaissances endogènes pouvant booster le développement des entreprises ouest-africaines en général et béninoises en particulier. Pour vérifier la possibilité de l‟application ou de la transposition de ce modèle traditionnel aux réalités de l‟entreprise, nous nous sommes intéressé aux facteurs pouvant affecter l‟efficacité des processus de transfert pour une capitalisation. Ces facteurs ont été identifiés lors de notre revue de littérature pendant laquelle nous avions constaté une multitude de techniques et d‟approches théoriques permettant d‟appréhender le phénomène. Cependant, au cours de cette recherche, nous sommes partagé entre deux courants de pensée dominants, dans ce champ disciplinaire, que sont le constructivisme et le positivisme.Dans cet élan, nous sommes parti d‟une perspective anthropologique vers la mise en place d‟un dispositif de capitalisation des connaissances en Afrique de l‟ouest. Ainsi, nous nous sommes inspiré de la manière dont les communautés Yoruba Nago du Fa perçoivent la vie de l‟entreprise et la transmission du savoir (quelle connaissance transférée, par quels outils, et l‟impact de ce transfert sur la communauté).Pour atteindre cet objectif évoqué plus haut, nous avons procédé par une méthode exploratoire qualitative auprès des différents acteurs de la communauté de pratique Fa et aussi auprès de certaines entreprises béninoises. Ceci a été fait à travers l‟implémentation (adaptation) d‟un dispositif de capitalisation des connaissances dans l‟entreprise en tenant compte des réalités culturelles et anthropologiques dont le cas est présenté dans cette thèse par une étude empirique. / As the mutation of Humanities and Social Science supported by the disruption of information science paradigms and communication, knowledge organization systems to those worn by knowledge societies, it‟s important to reconsider the relationship between individuals, communities and technology in a learning process environment for knowledge capitalization. The objective of this thesis is to propose a hybrid model of knowledge capitalization supported by knowledge management in Benin context.The aims of this proposal, is to improve the results of the re-use of business knowledge. So we will start with a questioning of the existence of an endogenous knowledge capitalization model which can boost the development of West African enterprises in general and Benin in particular.To verify the possibility of the application or transposition of this traditional model to the realities of the business, we focuse on the factors that may affect the efficiency of the transfer process for capitalization. These factors were identified in our literature review in which we found multitude of techniques and theoretical approaches to understand the phenomenon. However, in this research, we are divided between two dominant schools of thought in this subject area that are constructivism and positivism. In this momentum, we start from an anthropological perspective towards the establishment of a knowledge capitalization system in West Africa. Inspired by the way the Yoruba Nago communities and Fa perceive corporate life and the transmission of knowledge (what knowledge transferred, for which tools and the impact of this transfer on the community).To achieve this goal mention above, we will conduct a qualitative exploratory approach to the various players in the Fa community of practice and also in some enterprises in Benin. This through the implementation (adaptation) of a knowledge capitalization device in the company, taking into account cultural and anthropological realities whose case is presented in this thesis by an empirical study.
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L'utilisation de la 3D : enjeux et limites dans la pratique du projet, de la conception à la communication / The using of 3D modelling in project’s practice : challenges and limits in design process and communication

Elias, Eyad 06 December 2013 (has links)
Le travail de cette thèse se focalise sur le rôle de l’espace de la représentation comme un univers d’actions pour conduire la conception et l’aboutissement du projet d’aménagement et d’architecture. Il vise à renouveler les questions sur la scène actuelle de la pratique professionnelle au regard de la mutation permanente des outils de la visualisation mis en pratique. L’approche proposée par cette thèse est d’ordre systémique-compréhensive et tente de tisser des liens entre la nature de la pratique de la conception comme pratique basée de plus en plus sur des démarches collaboratives et la nature des dispositifs numériques comme univers fondés sur l’interactivité et la virtualité. Le premier univers est attaché au facteur humain, aux relations entre le praticien, son statut professionnel et les acteurs du projet ; le deuxième a pour entité l’idéalisation et l’artificialité du système numérique conçu pour répondre aux pratiques. Entre ces deux univers se place le modèle de l’utilisation, comme modèle invisible qui se forme par la conjonction entre une culture du projet et une culture numérique. Trois approches guident l’enquête ethnographique menée auprès des praticiens : une approche par l’« architecte-agence » comme entité qui a tendance à forger une identité professionnelle par la « production » et par le développement de compétences adaptées à la mutation de la profession ; une approche par le « projet » qui le présente comme environnement « organisateur » conditionnant le travail et le déroulement de la conception ; et une dernière approche par l’« appropriation » de la 3D comme phénomène que nous avons visé à identifier dès le démarrage de nos recherches. / This thesis focuses on the role of the environment of the representation, as an important sphere which leads the conception, and the development of architectural project. It aims to analyze the actual professional practice, and also the permanent evolution of the displayed tools used in these domains. The approach proposed by this thesis is based on a systematic-comprehensive matter, this approach try to develop links between the conception (as a first universe based on a collaboration between partners) and a second universe of numeric tools (marked by the interactivity and the vitality). The conception universe is attached to the human factor, to the relations between the practitioner, its professional status and the actors of the project, however the numeric environment presents a second universe based on the idealization and the artificiality of the digital system. The model of the use takes place between these two universes, as an invisible model which forms by the conjunction between a project’s culture and a numerical culture. Three approaches guide the ethnographical analyses realized with the practitioners: the first approach presents the “architect-agency” which develops a professional identity based on the “production” and on the development of adapted specific skills; the second approach concerns “the project” which is presented like a sphere influencing the work and the progress of the conception; the third and last approach is the use of 3D conception as a phenomenon which we aimed to identify in our research.
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L'expérience d'oscillation identitaire dans des dispositifs lectoriels / The Experience of Identity Fluctuations in Reading Devices

Crombet, Hélène 07 July 2015 (has links)
Ma thèse porte sur « l'expérience d'oscillation identitaire dans des dispositifs lectoriels » : à l'aune d'une approche pragmatique et interactionniste de la lecture, je considère les romans de mon corpus comme des « dispositifs », qui permettent au lecteur de faire l'expérience d'un entre-deux. Attendu que certaines « façons de lire » peuvent soulever des « manières d'être », je fais émerger une perspective ontologique du sujet, comprise dans un processus de subjectivation dual qui fait alterner des moments de battements pendulaires entre dépossession et repossession de soi. Mon corpus de romans de la littérature française du XXIe siècle a pour particularité de relater la guerre d’Algérie, dans une mise en récit qui tend à projeter le lecteur dans la pensée des personnages de fiction, constituant des supports de son identification. Il est ainsi amené à faire l’épreuve de deux expériences d’oscillation identitaire. La première serait caractérisée par une forme d’altération relative, dans la rencontre du lecteur avec une simple « inquiétante étrangeté ». Il peut ainsi faire l’expérience d’un processus d’« hallucination paradoxale ». La seconde devrait être conçue comme une expérience d’altération radicale : dans certains romans de mon corpus, le sujet est invité à se projeter dans la pensée de personnages de fiction sadiques. Cette projection ébranle catégoriquement les frontières liminaires de son identité, car il est amené à s’appréhender comme radicalement séparé de lui-même à travers un processus d’« hallucination négative ». Ce deuxième degré d’altération fait émerger une émotion duale, l’abjection, entre fascination et révulsion. On pourrait considérer que ce sentiment de révulsion le protègerait, en lui permettant de ne pas s’annihiler dans ce tréfonds déchaîné qu’il est amené à découvrir en lui-même ; et ce phénomène de ressaisissement apparaît d’autant plus tangible que ces romans, « excentriques », suscitent un phénomène de distanciation du lecteur. Il doit ainsi faire l’effort de reconfigurer de lui-même l’agencement apparemment informel qui lui est livré, tout se passant comme si l’acte de reconfiguration de la mise en récit semblait advenir avant la mise en récit elle-même. Pensés comme des dispositifs, ces romans permettent au lecteur de faire l’expérience d’un entre-deux. Cette expérience pourrait renvoyer à un seul phénomène de re-connaissance originaire. Mais l’expérience de ces romans, considérés comme des « espaces transitionnels » occupés par des personnages comme « sujets transitionnels », soulèverait également un processus de « personnation » dynamique et permanent du sujet avec lui-même. / My thesis deals with “the experience of identity fluctuations in reading devices“ : from a pragmatic and interactionist approach of reading, I regard the novels of my corpus as “devices” which allow the reader to experience a period in between. Given that certain “ways of reading“ may raise “ways of being“, I let an ontological perspective of the subject emerge, which is included in a process of dual subjectivation that alternates moments of pendular intervals between dispossession and repossession of oneself. My corpus of novels drawn from the French literature of the 21st century has the distinctive feature of relating the Algeria War in a narration setting which tends to project the reader into the minds of fictional characters, building up supports for his identification. The reader is thus brought to undergo the test of two identity fluctuations. The first would be characterized by a form of relative alteration with the reader going through a mere “disquieting queerness”. The reader may thus experience a process of “paradoxical hallucination”. The second one should be conceived as an experience of radical alteration : in some of my corpus novels, the subject is induced to project himself into the minds of sadistic fictional characters. This projection categorically disturbs the introductory boundaries of his identity, for he is brought to apprehend himself through a process of “negative hallucination”. This second degree in the alteration causes a dual emotion to emerge, abjection, half way between fascination and revulsion. One might consider that this feeling of revulsion would protect him, by enabling him not to annihilate himself in these unbridled inmost depths that he is brought to discover in himself ; and this phenomenon of reappropriation seems all the more tangible as these “eccentric” novels arouse a phenomenon of distanciation on the reader’s part. Thus he must make the effort to reconfigure by himself the apparently informal construction which is delivered to him, everything occurring as if the act of reconfiguration of the layout of the narrative seemed to happen before the layout of the narrative itself. Thought out as devices, these novels allow the reader to experience a period in between. This experience might send back to one single phenomenon of original acknowledgment. However the experience of these novels, regarded as “transitional spaces” taken up by characters as “transitional subjects”, would also raise a process of dynamic and permanent “personation” of the subject with himself.
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Les processus d’orientation des élèves en situation de handicap cognitif dans le second degré : le dispositif ULIS dans ses dimensions socialisante et capacitante / Career orientation prospects for students with cognitive disabilities in secondary education : the socializing and empowering dimensions of the ULIS device

Petry-Genay, Isabelle 14 December 2017 (has links)
La scolarisation des élèves en situation de handicap sur le plan cognitif, désignés comme handicapés mentaux, connaît en France une forte expansion depuis la loi du 11 février 2005. Le paradigme inclusif, encadré par une législation européenne et internationale, y contribue largement, tout comme l’influence des disability studies. Assurant un accompagnement pédagogique à l’inclusion des élèves dans les classes ordinaires, l’Unité Localisée pour l’Inclusion Scolaire est un dispositif dont les modalités d’organisation, particulièrement en second degré, varient selon les contextes académiques. Si l’inclusion se développe significativement au collège, la présence de ces élèves au lycée professionnel date seulement d’une dizaine d’années et se confronte à des résistances créant des effets de liminalité. À travers un recueil de données ethnographiques (observations, documents de terrain) et l’analyse d’entretiens semi-directifs de type compréhensif réalisés auprès de trente-six élèves et d’une trentaine de professionnels de l’école (coordonnateurs, enseignants, COP, responsables institutionnels), nous analysons les processus en œuvre dans les procédures d’orientation scolaire des élèves du second degré bénéficiant du cadre de l’ULIS. Fondées sur la mise en place du Parcours Avenir, ces pratiques empruntent de nouvelles voies pour des élèves dont l’orientation a été, jusque récemment, majoritairement tournée vers la filière médico-sociale. Notre analyse s’attache à montrer comment l’ULIS peut, dans certaines conditions, fournir les bases d’un environnement socialisant et capacitant afin d’ouvrir des perspectives de formation aux élèves en situation de handicap cognitif. / In France, the education of students with cognitive disorders, labelled as mentally disabled, has been growing since the act of the 11 of February 2005. The inclusion paradigm that is ruled by law at the European and international levels, has greatly influenced this development as well as the disability studies. The ULIS, provide some pedagogical support to include Special Education Needs students into mainstream classrooms. The organization of such a device varies according to context and education areas. If inclusion has significantly increased in lower secondary schools, the attendance of students with cognitive disabilities in vocational schools has started only ten years ago and the process faces liminality challenges. Thanks to the collection of ethnographic data based on observation and documents analysis as well as the completion of semi-directive face-to-face interviews conducted with 36 students and 30 educational professionals (coordinators, teachers, orientation counsellors, management staff), we set out to analyse the undergoing process for the orientation practices of ULIS students in secondary education. Based on the implementation of the Parcours Avenir project, these guidance practices open up new perspectives for these students whose orientation has been mainly guided by socio-therapeutic approaches. We show how the ULIS device, under specific conditions, can offer the basis for a socializing and empowering environment that contributes to open up new training perspectives to students with cognitive disabilities.
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Dispositif d’aiguille fibrée pour la spectroscopie de fluorescence endogène de lésions mammaires et pulmonaires ex vivo et in vivo ; vers le développement d'une méthode d’ histopathologie in situ / Fibered needle device for endogenous fluorescence spectroscopy of lung and mammary lesions ex vivo and in vivo ; towards the development of an in situ histopathology method

Toullec, Alexis 06 July 2018 (has links)
Le troisième Plan Cancer lancé en 2013 désigne la précocité du diagnostic comme l'un des enjeux majeurs pour l'amélioration de la prise en charge des patients. Malgré l’essor des modalités et des performances de l’imagerie médicale, il reste des défis à relever pour l’aide au diagnostic et optimiser le recourt à la biopsie.L’imagerie photonique et spécialement la fluorescence résolue spectralement a déjà été éprouvée pour la caractérisation ex vivo des tumeurs mammaires et pulmonaires, sans agent de contraste ou traitement des échantillons. Notre objectif est de caractériser les capacités d'un dispositif médical innovant, développé au laboratoire, utilisant une aiguille fibrée de faible calibre pour l’analyse spectrale de la fluorescence endogène de ces lésions in situ. Nos premiers travaux dans le cadre d’études précliniques et cliniques ont montré des différences significatives de signatures spectrales entre tumeurs bénignes et malignes ex vivo et in vivo. Nos résultats ont également mis en évidence les limites d’utilisation du dispositif, en termes de spécificité, pour certains types de lésions.Une étude secondaire a été entreprise sur des tumeurs mammaires afin d'identifier les entités tissulaires majeures à l'origine des signatures spectrales obtenues avec notre dispositif fibré. L'imagerie spectrale en microscopie confocale et seconde harmonique (SHG), en multiphoton, ont été mises en œuvre afin d’établir une cartographie de biomarqueurs endogènes des tissus mammaires. Nous avons confronter ses résultats aux données obtenues avec le dispositif d'aiguille fibrée afin de pouvoir le positionner non seulement comme une aide au diagnostic mais aussi comme une méthode prometteuse pour l’histopathologie in situ. / The third Cancer Plan, launched in 2013, identifies early diagnosis as one of the major challenges for improving patient care. Despite the growth in medical imaging modalities and performance, challenges remain in diagnosis aid and optimizing the use of biopsy.Photonic imaging and especially spectrally resolved fluorescence has already been tested for the ex vivo characterization of breast and lung tumors, without contrast agent or sample processing. Our goal is to characterize the capabilities of an innovative medical device, developed in the laboratory, using a low-caliber fibered needle for the spectral analysis of the endogenous fluorescence of these lesions in situ. Our early work in preclinical and clinical studies showed significant differences in spectral signatures between benign and malignant tumors ex vivo and in vivo. Our results also highlighted the limits the device, in terms of specificity, for certain types of lesions.Another study was conducted on mammary tumors in order to identify the major tissue entities at the origin of the spectral signatures obtained with our fibered device. Spectral imaging in confocal and second harmonic microscopy (SHG), in multiphoton, has been implemented in order to establish a mapping of endogenous biomarkers of mammary tissues. We compare its results with the data obtained with the fibered needle device in order to position it not only as an aid to diagnosis but also as a promising method for in situ histopathology.
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De l’espace de la scène à l’espace de la page : médiation et médiatisation du corps de mode à travers le défilé et les séries photographiques de la presse magazine / From the catwalk space to the photographic page : mediation and mediatization of fashion-body through the catwalk and the photographic series of magazines

Kireche-Gerwig, Rym 03 October 2016 (has links)
Cette recherche interroge la poétique du corps de mode contemporain à travers deux médias de la figuration du corps : le défilé de mode et les séries photographiques enchâssées dans la presse magazine. Au carrefour d’enjeux sémiotiques, discursifs, politiques et sociaux, la problématique centrale de notre thèse convoque le point de vue complexe et interdisciplinaire des Sciences de l’information et de la communication afin de réfléchir à la construction médiatique du corps de mode. Trois hypothèses qui appréhendent les dispositifs médiatisant le corps de mode et le produisant comme « forme réifiée » publicitaire et culturelle scindent la problématique posée. La première postule que les défilés et les séries mode sont des médias produisant un corps informé par la dimension dispositive propre à chacun d’eux. La seconde pose que si le corps de mode est produit à des fins marchandes et publicitaires, il n’en demeure pas moins « culturalisé » grâce à l’emprunt notamment au chorégraphique conçu comme écriture du corps dans l’espace de la scène du défilé à l’espace de la page photographique, le dotant d’un statut culturel qui lui permet de circuler dans l’espace social. La troisième enfin poursuit le mouvement de réification du corps de mode amorcé par sa médiatisation à travers le défilé en posant que sa mass-médiatisation par les séries photographiques en fait une production industrialisée et standardisée, le rendant semblable à une marchandise. / The present research interrogates the poetry of the fashion contemporary body transmitted by two media portraying the body : fashion shows and photographic series as part of fashion magazines. At the crossroads of semiotic, discursive political and social issues, the central problem investigated in this thesis is the complex and interdisciplinary point of view of the information sciences of communication with the aim to study the media construction of the fashion world. Three hypotheses divide the investigated problem by taking the mediatised part of the fashion world and produce it as “reified form” of advertisement and culture. The first postulates that fashion shows and fashion series are medias which produce an informed body by the apparatus owned by each of them. The second hypothesis postulates that the fashion body is produced for commercialand advertisement purposes. It does not persist less “culturalized” thanks to the choreography which is perceived as writing of the body in the catwalk space or in the photographic page. This gives it a culture status allowing it to circulate in the social medias. Finally, the third follows the movement of the fashion body's reification initiated by the exposure through fashion shows. It postulates that its mass exposure by photographic series, which is an industrialized and standardized production, make it similar to a merchandise.
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Mathematical modelling and integration of complex biological data : analysis of the heterosis phenomenon in yeast / Modélisation mathématique et intégration de données biologiques complexes : analyse du phénomène d’hétérosis chez la levure

Petrizzelli, Marianyela 08 July 2019 (has links)
Le cadre général de cette thèse est la question de la relation génotype-phénotype, abordée à travers l'analyse du phénomène d'hétérosis chez la levure, dans une approche associant biologie, mathématiques et statistiques. Antérieurement à ce travail, un très gros jeu de données hétérogènes, correspondant à différents niveaux d'organisation (protéomique, caractères de fermentation et traits d'histoire de vie), avait été recueilli sur un dispositif demi-diallèle entre 11 souches appartenant à deux espèces. Ce type de données est idéalement adapté pour la modélisation multi-échelle et pour tester des modèles de prédiction de la variation de phénotypes intégrés à partir de caractères protéiques et métaboliques (flux), tout en tenant compte des structures de dépendance entre variables et entre observations. J’ai d'abord décomposé, pour chaque caractère, la variance génétique totale en variances des effets additifs, de consanguinité et d'hétérosis, et j’ai montré que la distribution de ces composantes permettait de définir des groupes bien tranchés de protéines dans lesquels se plaçaient la plupart des caractères de fermentation et de traits d'histoire de vie. Au sein de ces groupes, les corrélations entre les variances des effets d'hétérosis et de consanguinité pouvaient être positives, négatives ou nulles, ce qui a constitué la première mise en évidence expérimentale d’un découplage possible entre les deux phénomènes. Le second volet de la thèse a consisté à interfacer les données de protéomique quantitative avec un modèle stœchiométrique du métabolisme carboné central de la levure, en utilisant une approche de modélisation à base de contraintes. M'appuyant sur un algorithme récent, j’ai cherché, dans l'espace des solutions possibles, celle qui minimisait la distance entre le vecteur de flux et le vecteur des abondances observées des protéines. J’ai ainsi pu prédire un ensemble de flux et comparer les patrons de corrélations entre caractères à plusieurs niveaux d'intégration. Les données révèlent deux grandes familles de caractères de fermentation ou de traits d'histoire de vie dont l'interprétation biochimique est cohérente en termes de trade-off, et qui n'avaient pas été mises en évidence à partir des seules données de protéomique quantitative. L'ensemble de mes travaux permet de mieux comprendre l'évolution de la relation entre génotype et phénotype. / The general framework of this thesis is the issue of the genotype-phenotype relationship, through the analysis of the heterosis phenomenon in yeast, in an approach combining biology, mathematics and statistics. Prior to this work, a very large set of heterogeneous data, corresponding to different levels of organization (proteomics, fermentation and life history traits), had been collected on a semi-diallel design involving 11 strains belonging to two species. This type of data is ideally suited for multi-scale modelling and for testing models for predicting the variation of integrated phenotypes from protein and metabolic (flux) traits, taking into account dependence patterns between variables and between observations. I first decomposed, for each trait, the total genetic variance into variances of additive, inbreeding and heterosis effects, and showed that the distribution of these components made it possible to define well-defined groups of proteins in which most of the characters of fermentation and life history traits took place. Within these groups, the correlations between the variances of heterosis and inbreeding effects could be positive, negative or null, which was the first experimental demonstration of a possible decoupling between the two phenomena. The second part of the thesis consisted of interfacing quantitative proteomic data with the yeast genome-scale metabolic model using a constraint-based modelling approach. Using a recent algorithm, I looked, in the space of possible solutions, for the one that minimized the distance between the flux vector and the vector of the observed abundances of proteins. I was able to predict unobserved fluxes, and to compare correlation patterns at different integration levels. Data allowed to distinguish between two major types of fermentation or life history traits whose biochemical interpretation is consistent in terms of trade-off, and which had not been highlighted from quantitative proteomic data alone. Altogether, my thesis work allows a better understanding of the evolution of the genotype-phenotype map.
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Liens entre outils de gestion et stratégies collectives : une analyse de la transaction entre producteurs et transformateurs de lait / Links between management tools and collective strategies : An analysis of the raw milk transaction.

Rat-Aspert, Olivier 11 July 2018 (has links)
Cette thèse propose d’analyser les relations entre l’appropriation des outils de gestion et l’émergence et l’efficacité des stratégies collectives, qui ont cela de commun qu'ils sont deux facettes d’un objet propre aux sciences de gestion : l'action collective. Nous avons retenu comme terrain d’étude la transaction entre producteurs de lait et industriels, en France, qui est une transaction particulière imposant l’usage de nombreux outils de gestion. Le dispositif de gestion qui encadre la transaction est fortement remis en cause aujourd’hui. Nous avons abordé ce terrain selon plusieurs angles : une approche historique du dispositif construit par les acteurs, une approche par l’étude de cas pour éclairer les évolutions contemporaines de ce dispositif, et une approche par observation longitudinale des relations entre un collectif de producteurs et leur acheteur. Nous montrons ainsi que les dispositifs et les stratégies sont encastrés. Un dispositif de gestion national est le construit stratégique de représentants des acteurs de la filière. Il constitue le socle de règles qui encadrent la construction de dispositifs locaux. Nous montrons les allers-retours entre les adaptations nationales du dispositif et les appropriations locales des outils et les desseins stratégiques qui accompagnent cette interrelation. Nous montrons également que les rapports de pouvoirs entre acteurs sont finalement préservés. Nous montrons enfin que, si des stratégies collectives émergent à un niveau local, elles ne correspondent pas forcément aux intentions stratégiques initiales : les intentions stratégiques horizontales des représentants des producteurs, visant à la captation de la valeur ont échoué ou se sont transformées en stratégies émergentes verticales, visant à la création de valeur avec l’acheteur. Nous donnons deux explications à ce phénomène : 1. L’impossibilité des représentants des producteurs à mettre en place une structure collective leur permettant de faire évoluer le rapport de pouvoir avec leur acheteur. Cela est lié à la place prise par l’acheteur dans le modelage et l’appropriation des outils de représentation des producteurs et 2. Les apprentissages collectifs permis par l’appropriation des outils de gestion de la transaction : ils peuvent conduire à la reconnaissance d’une convergence entre intérêts des producteurs et de leur acheteur, et à la construction de nouveaux outils portant leur stratégie commune. Ainsi, les outils de gestion sont à la fois le moyen permettant la mise en place de stratégies collectives et le catalyseur de leur émergence. / This thesis analyses the relationships between appropriation of management tools, and emergence and effectiveness of collective strategies, which are two sides of one object in management sciences: Collective action. The chosen field of study is the transaction between dairy farmers and factories, in France. This transaction is particular because it requires the use of several management tools and because the management system that regulate this transaction has been reconsidered. Three approaches are used in this thesis: a historical approach of the management system, a case study approach to enlighten the current evolution of this apparatus, and a longitudinal observation approach of connections between a group of dairy producers and their customer. This thesis shows that management tools and strategies are embedded. The national management system is a strategic construct of value-chain’s representatives. It constitutes the basic rules that constrained local apparatus. The thesis reveals back and forth between the national adaptations of the apparatus and the local appropriations of the tools, and the strategic designs that lead this interrelationship. It also reveals that power relationships, in the end, persist. (Last and final summary in the thesis)
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Mise en oeuvre d'un mode d'imagerie par transillumination et détection multi-vue à ultra-faible bruit dans l'imageur QOS[indice supérieur TM] pour imagerie moléculaire optique sur petit animal / Implementation of transillumination mode and ultra-low noise multi-view detection in the QOS[superscript TM] for small animal optical molecular imaging

Zarif Yussefian, Nikta January 2014 (has links)
La tomographie optique diffuse (TOD) est une technique d’imagerie médicale relativement récente qui utilise la lumière dans le proche infrarouge pour acquérir des images in vivo de façon non invasive. Cette technique est en utilisation croissante par de nombreux chercheurs et biologistes et plusieurs équipes dans le monde travaillent sur le développement de scanners par TOD y compris notre groupe de recherche (groupe TomOptUS). Le Centre d’imagerie moléculaire de Sherbrooke dispose d’un appareil pour imagerie optique sur petit animal développé par la compagnie Quidd, soit le QOS (Quidd Optical imaging System). Cet appareil est utilisé par des biologistes et chercheurs pour diverses études précliniques sur modèles animaux (souris) de maladies humaines comme le cancer. Le QOS est entièrement contrôlé par ordinateur à l’aide d’un logiciel sophistiqué (le QOSoft) qui permet d’obtenir des images en fluorescence et en bioluminescence. Il est toutefois limité en ne permettant d’acquérir que des images planaires de la lumière sortant d’un animal ; il ne permet pas la tomographie, à savoir obtenir des images tridimensionnelles (3D) des sources fluorescentes ou bioluminescentes situées en profondeur à l’intérieur de l’animal. Bien que le QOS offre une grande flexibilité en terme d’angle d’acquisition d’images autour de l’animal avec sa caméra montée sur un bras rotatif, il a une sensibilité limitée pour de l’imagerie en profondeur, notamment parce qu’il fonctionne en mode épiillumination (détection de la lumière du même côté que l’injection de la lumière excitatrice dans l’animal) et aussi à cause de la sensibilité limitée de sa caméra. Afin d’augmenter les capacités tomographiques et la sensibilité du QOS, ainsi que le contraste des images qu’il fournit, le présent projet propose des développements logiciels intégrés au QOSoft. Ces ajouts logiciels au niveau du contrôle d’instrumentation et de l’interface graphique permettent d’intégrer une caméra EMCCD à ultra-haute sensibilité et ultra-faible bruit pour remplacer la caméra CCD refroidie existante ainsi qu’un module d’illumination laser rotatif. Ce module d’illumination, développé par le groupe TomOptUS, permet l’imagerie en mode transillumination ainsi que toutes les configurations intermédiaires jusqu’à l’épi-illumination. Ce module permet en outre d’injecter une densité de puissance lumineuse supérieure à celle possible avec la configuration actuelle du QOS. Le QOS et son logiciel mis à jour avec les ajouts faisant l’objet du présent projet sont validés par des expériences de fluorescence et de bioluminescence sur fantômes et animaux vivants.

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