Akademisk avhandling--Göteborg--Universiteit, 2005. / Notes bibliogr.

Thèse--École nationale des Chartes--Paris, 1996.

Th. doct.--Biologie des populations et écologie--Montpellier 2, 1994. / Bibliogr. p. 233-244. Résumé en français et en anglais.

L'ADN environnemental (ADNe) est une approche très prometteuse pouvant faciliter le suivi des espèces aquatiques, ce qui est crucial pour la gestion des ressources aquatiques. À ce jour, relativement peu d'études se sont intéressées à l'écologie de l'ADNe, en particulier en ce qui concerne les processus influençant la détection de l'ADNe. Le manque de connaissances à propos de l'écologie de l'ADNe empêche l'utilisation de cet outil à son plein potentiel. Dans cette étude, nous avons évalué expérimentalement l'impact de plusieurs facteurs biotiques et abiotiques sur le taux de production et de dégradation de l'ADNe. Trois espèces de poissons d'eau douce ayant des caractéristiques très différentes ont été placées dans deux types d'eau ayant des caractéristiques physicochimiques distinctes et à trois différentes températures. Des échantillons d'eau ont été filtrés à des intervalles de temps prédéterminés et la PCR quantitative a été utilisée pour quantifier l'ADNe dans chaque échantillon. Nous avons trouvé que la température, l'espèce, les différentes masses d'eau, ainsi que certaines interactions entre les facteurs avaient un effet marqué sur la production et la dégradation de l'ADNe. Les résultats de cette étude vont approfondir nos connaissances sur l'écologie de l'ADNe, et donc amélioreront l'interprétation des données d'ADNe pour la gestion et la conservation des poissons d'eau douce. / Environmental DNA (eDNA) is a very promising approach to facilitate and improve the aquatic species monitoring, which is crucial for their management and conservation. In comparison with the plethora of monitoring studies in the fields, relatively few studies have focused on experimentally investigating the "ecology" of eDNA, in particular pertaining to processes influencing the detection of eDNA. The paucity of knowledge about its ecology hampers the use of eDNA analysis to its full potential. In this study, we experimentally evaluated the impact of several biotic and abiotic factors on the rate of production and degradation of eDNA. Individuals of three freshwater fish species (Brown Bullhead, Tench and Yellow Perch) with distinct ecology were placed in two types of water from the St. Lawrence River (Québec, Canada) with very distinct physicochemical characteristics and at three different temperatures. Water samples were then filtered at predetermined time intervals and quantitative PCR was used to quantify the eDNA in each sample. We found that temperature, species, water types, and some interactions between these factors hada strong effect on the production and degradation of eDNA. The results of this study enhance our knowledge about the ecology of eDNA, thus improving eDNA data interpretation.

Thèse,Linköping : Univ.2000. / Härtill 6 uppsatser.

Reproduction de : Thèse doctorat : Sciences de la vie. Spécialité : hydrobiologie : Metz : 2003. / Titre provenant de l'écran-titre. Notes bibliographiques.

Reproduction de : Thèse de doctorat : Sciences de la vie : Hydrologie : Metz : 2004. / Titre provenant de l'écran-titre. Notes bibliographiques.

Diss.--Naturwissenschaften--Konstanz--Universität Konstanz, 1988. / Bibliogr. p. 205-223.

Th. doct.-ing.--Toulouse 3, 1979. N°: 654.

La contamination des eaux de surface par les polluants agricoles soulève des inquiétudes concernant les effets potentiels sur les organismes aquatiques. L'objectif général de ce projet de maîtrise était d'évaluer le statut physiologique du poisson d'eau douce exposé de façon chronique aux pesticides et autres polluants agricoles. Dans un premier volet, des truites arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) ont été exposées durant 30 jours à un herbicide communément détecté dans les cours d'eau agricoles, le métolachlore, à des concentrations de 200, 500 et 800 µg/l. Une exposition au métolachlore en microplaque avec des cellules interrénales de truites arc-en-ciel (cellules qui sécrètent le cortisol) a aussi été réalisée. Dans un second volet, des perchaudes ont été capturées à trois reprises entre 2002 et 2003 dans la rivière Yamaska (Québec, Canada), qui est contaminée par les pesticides et autres polluants agricoles. À chacune des campagnes, un site non contaminé (lac Brome) ou très faiblement contaminé par les pesticides (rivière Yamaska Nord) était utilisé comme site de référence. Pour les deux volets, des fonctions biologiques ont été évaluées à l'aide de biomarqueurs: la fonction endocrinienne par le cortisol plasmatique; l'osmorégulation par l'activité de l'enzyme branchiale Na+/K+-ATPase et le métabolisme énergétique par le glucose plasmatique et le glycogène hépatique. L'activité de l'acétylcholinestérase plasmatique a été évaluée comme biomarqueur d'exposition aux inhibiteurs de cholinestérases. Enfin, des indices de condition tels que le facteur de condition, l'indice hépatosomatique et l'hématocrite ont permis de caractériser la condition générale des poissons. Les résultats obtenus pour le volet réalisé en laboratoire révèlent que les truites arc-en-ciel sont peu affectées par une exposition au métolachlore allant jusqu'à 800 µg/l. Une augmentation de l'hématocrite est toutefois notée à l'exposition de 200 µg/l de métolachlore. À 800 µg/l, les truites sont beaucoup plus sensibles au stress de capture. De plus, une perturbation du système d'osmorégulation est révélée par une hausse de l'activité Na+/K+ATPase des branchies, une diminution de l'hématocrite et des réserves énergétiques. L'exposition en microplaque montre que les cellules interrénales sont très résistantes au métolachlore en terme de viabilité cellulaire (concentration létale pour 50% des cellules CL50 = 1092 mg/l). Cependant, la concentration effective qui diminue de 50% la libération de cortisol est beaucoup plus faible (CE50 = 79 mg/l), ce qui suggère un potentiel de perturbateur endocrinien in vitro. Les résultats du volet réalisé en milieu naturel indiquent, pour la seconde campagne d'échantillonnage, que le milieu contaminé par les pesticides et autres polluants agricoles n'affecte pas significativement l'activité des cholinestérases plasmatiques, bien que celle-ci tende à baisser. Ce milieu affecte toutefois négativement la croissance des perchaudes et perturbe la réponse cortisolique. Les perchaudes ont une accumulation de glycogène hépatique et un indice hépatosomatique plus élevé. L'activité des enzymes Na+/K+-ATPase des branchies est plus élevée. Les résultats de ces études ont permis de dresser un portrait des effets des pesticides et autres polluants agricoles sur le statut physiologique du poisson. Ainsi, en approfondissant les différents biomarqueurs affectés, des études ultérieures pourront permettre d'évaluer l'état de santé des poissons. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Perchaude,Truite arc-en-ciel, Métolachlore, Pesticide, Cortisol, Perturbation endocrinienne, Osmorégulation, Hématocrite, Glycogène, Acétylcholinestérase, Rivière Yamaska.