Descrevem-se os achados clínicos e patológicos da paratuberculose em uma criação intensiva de bovinos de leite no municí pio de Capela de Santana, RS. Os sinais clínicos foram observados em oito de um total de 345 bovinos, consistindo em diarréia crônica refratária aos tratamentos, emagrecimento progressivo e queda na produção de leite. As principais lesões macroscópicas, observadas nos oito animais necropsiados, incluíam intestino delgado com acentuado espessamento da parede e superfície mucosa de aspecto reticulado, semelhante às circunvoluções cerebrais, lesão essa perceptível, através da serosa. A luz intestinal estava preenchida com conteúdo fluido e de aspecto leitoso. Os vasos linfáticos do mesentério mostravam-se mais evidentes sendo que alguns tinham aspecto varicoso. Os linfonodos mesentéricos estavam aumentados de volume e, ao corte, fluía grande quantidade de líquido leitoso. Focos de mineralização foram observados na íntima das artérias, nas válvulas cardíacas e na serosa do rúmen. As principais lesões macroscópicas incluíam enterite, linfadenite e linfangite granulomatosa caracterizada por infiltrado inflamatório com macrófagos, células gigantes de Langhans que continham grande quantidade de bacilos álcool-ácido-resistentes. As lesões vasculares consistiam em degeneração e mineralização das túnicas í ntimas e média das artérias de grande calibre associada a proliferação de colágeno. Havia calcificação da serosa do rúmen atrofia hepatocelular difusa e hepatite granulomatosa multifocal. O M. avium subsp. paratuberculosis (Map) foi isolado em amostras de intestino e linfonodos de 8 vacas Holandesas (3,5%) com doença de Johne, dentre 229 amostras cultivadas provenientes de um rebanho leiteiro. Amostras inoculadas em HEYM com micobactina produziram colônias identificadas como Map, segundo as caracterí sticas fenotí picas próprias como: crescimento lento, coloração álcool-ácido-resistente (A.A.R.) e dependência a micobactina. O laboratório de Referência da OIE confirmou a amostra isolada. O M. avium subsp. paratuberculosis (Map) foi isolado em amostras de intestino e linfonodos de 8 vacas Holandesas (3,5%) com doença de Johne, dentre 229 amostras cultivadas provenientes de um rebanho leiteiro Amostras inoculadas em HEYM com micobactina produziram colônias identificadas como Map, segundo as caracterí sticas fenotí picas próprias como: crescimento lento, coloração álcool-ácido-resistente (A.A.R.) e dependência a micobactina. O laboratório de Referência da OIE confirmou a amostra isolada. Não houve isolamento do agente em 221 amostras intestinais quando processadas, após 2 anos de sua colheita. O teste de IDGA aplicado como “screening”, detectou 26 vacas (11,4%) positivas, dentre 228 animais testados e sacrificados em matadouro. O teste de ELISA adsorvido, utilizando o antí geno PPA-3 detectou 125 (39,8%) amostras positivas. O ELISA não adsorvido detectou mais 32 (10,1%) reagentes positivos, dentre os 314 bovinos testados. A prevalência da infecção causada pelo Map em 36 rebanhos leiteiros procedentes de 25 municí pios do Rio Grande do Sul foi estimada em 44,6% das 1316 amostras testadas. A infecção foi identificada em 35 (97,2%) dos 36 rebanhos testados e presentes em todos os municí pios incluí dos. A ocorrência da doença de Johne foi enfatizada, tanto a forma clí nica quanto a infecção subclí nica no Rio Grande do Sul, sugerindo a adoção de medidas de controle sejam aplicadas na proteção dos rebanhos leiteiros nacionais. / The clinical and pathological aspects of bovine paratuberculosis in a dairy herd in the county of Capela de Santana, Rio Grande do Sul, southern Brazil are described. Clinical signs in eight cows out 345 cattle included chronic diarrhea refractory to treatment, progressive emaciation and decreased milk production. Necropsy findings included severe and diffuse thickening of the mucosa of the small intestine with exaggerated reticular pattern, reflected in the serosal surface, similar to cerebral gyri. Intestinal loops were filled with whitish watery contents. The lymphatic vessels of the intestinal serosa and of the mesentery were thickened and tortuous. The mesenteric lymph nodes were enlarged and, on cut surface, there were oozing of milky fluid. Plaques of mineralization were evident in the intima of larger arteries, in the endocardium of the heart valves and in the ruminal serosa. There was also edema of abomasal folds and atrophy of caudate lobe of the liver. The main histopathological findings were granulomatous enteritis, lymphadenitis and lymphangitis. The inflammatory infiltrate was composed of macrophages, epithelioid cells and Langhan`s giant cells containing large numbers of acid-fast bacilli. Vascular lesions included degeneration, calcification and collagen proliferation of the intima and media of larger arteries. Other microscopic lesions included calcification of the ruminal serosa, diffuse hepatocellular atrophy and multifocal granulomatous hepatitis. M. avium subsp. paratuberculosis (Map) was isolated from intestines and lymph nodes samples obtained from 8 Holstein cows (3.5%) with Johne’s Disease among 229 inoculated samples from a unique dairy herd in Rio Grande do Sul State, South Brazil. Cultures on HEYM supplemented with mycobactin yielded colonies identified like Map by phenotypic properties: Slow growth, acid-fast stain and mycobactin dependency. OIE Reference Laboratory in Argentine confirmed the strain like Map. The attempts to isolate the agent from 221 intestinal samples processed after 2 years were unsuccessful. The AGIDT applied as a screening test detected 26 positive cows (11.4%) among 228 tested animals at slaughterhouse. The absorbed ELISA test using PPA-3 antigen detected 125 positive animals (39.8%) and 47 (14.9%) suspect samples among 314 animals tested. Nonabsorbed ELISA test detected more 32 (10.1%) positive animals and 18 (5.7%) suspect samples than absorbed ELISA test. The prevalence of infection caused by Map was estimated in 35 bovine dairy herds in Rio Grande do Sul State by absorbed ELISA using PPA-3 commercial antigen. The ELISA test identified 558 positive (44.6%) animals among 1316 samples tested. The infection was detected in 35 dairy herds (97.2%) among 36 tested and was present in all 25 countries performed. The infection by Map was disseminated in dairy herds in Rio Grande do Sul State. It’ s emphasized the occurrence of clinical and subclinical forms of Johne’ s disease in Rio Grande do Sul and should be necessity the adoption of control measures in the protection of National dairy herds.

Orientador: Luiz Carlos Marques / Banca: Janio Morais Santurio / Banca: Thais Helena Constantino Patelli / Banca: Sandra de Moraes Gimenes Bosco / Banca: Fabianao Antonio Cadioli / Resumo: Pythium insidiosum causa doença de pele e ocasionalmente de outros tecidos de mamíferos e aves que vivem em estreito contato com águas contaminadas. Pelas características bioclimáticas e ambientais da região do Pantanal, estima-se que seja uma das áreas com maior prevalência do mundo. Não obstante, certifica-se na literatura compilada poucos estudo enfatizando aspectos epidemiológicos nessa região, sendo esse o principal objetivo dessa pesquisa. As normais climatológicas foram obtidas de duas estações metereológicas de Instituição pública, que abrange a sub-região do estudo, complementados por dados dispostos em outras fontes. Obteve-se validação de 76 casos em equideos e sete bovinos, através do ELISA-teste, PCR, histopatologia e isolamento do agente. A doença apresentou dinâmica sazonal, com picos de incidência emergindo após os maiores índices pluviométricos. Evidenciaram-se também, um número expressivo de enfermidades confundíveis, coinfecções e reinfecções, demonstrando frágil imunidade do hospedeiro equino ao patógeno. Cabe ressaltar ainda, que ferramentas de diagnóstico são pouco utilizadas a campo. Resposta significativa relativa à imunoterapia (Pitium Vac®) no grupo de equideos tratados e aumento do intervalo de reinfecções, indica que o fármaco poderá ser aperfeiçoado, de modo a agregar características profiláticas, além das terapêuticas / Abstract: The disease caused by Pythium insidiosum affects the skin and occasionally other tissues of mammals and birds which live in close contact with contaminated water. Due to its bio-climatic and environmental characteristics, the Pantanal region is estimated to be one of the areas with higher prevalence of pythiosis in the world. However, few studies have focused on epidemiological aspects this region, the main objective of this work. Climatological normals were obtained from two meteorological stations of a public institution which covers the subregion studied. Data from other sources were also used to complement the study. Seventy six cases of pythiosis in equidae and seven in cattle were confirmed by ELISA-test, PCR, histopathology and isolation of Pythium insidiosum. The disease showed seasonal dynamics with peaks of incidence emerging after the wettest pluviometric gradients. Similar diseases, co infections and reinfections were also realized, suggesting a suppression of equine immune system to Pythium insidiosum. It is worth mention that diagnosis tests tools available are not widely adopted in the field. Significant response on immunotherapy (Pitium Vac®) in equine treated group and increased of the intervals the reinfection, indicating that the drug could be improved by adding prophylactic and therapeutical properties / Doutor

O Brasil ocupa uma posição de destaque mundial em relação à produção agropecuária, sendo necessário fornecer segurança microbiológica aos consumidores. Salmonella é um agente causador de infecções alimentares em seres humanos, de forma que os produtos de origem suína são responsáveis por cerca de 5-10% dos surtos em humanos. O controle depende do conhecimento da distribuição da bactéria desde o rebanho até o frigorífico. Em regiões com altas prevalências no campo, esforços direcionados primeiramente em reduzir a prevalência nos rebanhos visam minimizar os riscos de contaminação dos produtos. Neste sentido, medidas de biossegurança, seguindo boas práticas de produção agropecuária, são fundamentais. Além disso, a aplicação de intervenções complementares são, possivelmente, formas de reduzir a prevalência em um período de tempo mais curto. Desta forma o objetivo deste trabalho foi validar três estratégias: 1) utilização de um prebiótico Actigen®™ na ração dos animais, (PRE); 2) uma vacina viva Enterisol SC 54®, (VAC) e 3) o sistema de wean-to-finish, (WTF). Estes grupos foram comparados entre si e com o sistema tradicional em três sítios, o grupo controle (GC), frente à soroprevalência e contaminação em carcaças. Cada estratégia foi realizada em três repetições, sendo colhidas amostras de sangue de 55 animais de cada lote no dia do alojamento na terminação e quatro dias antes do abate. Suabe de 40 carcaças de cada lote foram colhidas antes do resfriamento. As soroprevalências e frequências de isolamento foram comparadas entre os grupos por meio de teste de qui-quadrado. A soroprevalência pré-abate foi estatisticamente menor no grupo PRE 50,3% em relação ao WTF, VAC e GC, com 99%, 96,9% e 98,8% respectivamente. As frequências de isolamentos em superfície de carcaça variaram de 0% a 29,1% nos grupos PRE e VAC respectivamente, sendo que ambas diferem significativamente entre si e dos grupos CG 18,33% e WTF 15% (p<0,05). Pode-se comprovar a eficácia do prebiótico em prevenir a infecção a campo frente às demais estratégias. Em relação às contaminações de carcaças, os resultados corroboram com os conhecimentos acerca do papel da pressão de infecção do campo nas contaminações na planta frigorífica. / Brazil has been increasing its worldwide position in relation to agricultural production, and is necessary providing food safety to consumers. Salmonella is a foodborne pathogen for humans and pork products play an important role in the amount of outbreaks. The control depends on the knowledge of the distribution of the bacteria occurrence from the herd to the slaughterhouse. In regions with high on farm prevalence, efforts are primarily directed to reduce the prevalence in the swine population in order to minimize the risks of products contamination. In this sense, biosecurity measures and good production practices are useful. Moreover, increase the knowledge about additional interventions, to reduce on farms prevalence in a shorter period of time, also is important. Therefore, the objective of this work was to validate three strategies: 1) use of Actigen ® ™ prebiotic in animal feed, (PRE); 2) a live vaccine Enterisol SC54® (VAC); and 3) the system of wean- to-finish, (WTF). Seroprevalence and contamination on carcasses surface in these groups were compared with the traditional system in three sites (the control group-CG). Each strategy was performed in three replicates, and blood samples were collected from 55 animals of each batch at the first day of finishing phase and four days before slaughter. Swabs of 40 carcasses were taken from each batch before chilling. The seroprevalence and isolation frequencies were compared between groups using logistic regression. The seroprevalence before slaughter was lower in PRE (50.3%) compared with the WTF, VAC and GC groups, with 99%, 96.9% and 98.79%, respectively. The frequency of Salmonella isolation was lower in PRE group 0%, when compared with the other groups (p<0.05). The results prove that prebiotic is able to prevent infection in the field compared to the other strategies. Regarding the carcass contamination, these finds are consistent with the knowledge on the role of infection pressure in the field contamination in the plant.

Descrevem-se os achados clínicos e patológicos da paratuberculose em uma criação intensiva de bovinos de leite no municí pio de Capela de Santana, RS. Os sinais clínicos foram observados em oito de um total de 345 bovinos, consistindo em diarréia crônica refratária aos tratamentos, emagrecimento progressivo e queda na produção de leite. As principais lesões macroscópicas, observadas nos oito animais necropsiados, incluíam intestino delgado com acentuado espessamento da parede e superfície mucosa de aspecto reticulado, semelhante às circunvoluções cerebrais, lesão essa perceptível, através da serosa. A luz intestinal estava preenchida com conteúdo fluido e de aspecto leitoso. Os vasos linfáticos do mesentério mostravam-se mais evidentes sendo que alguns tinham aspecto varicoso. Os linfonodos mesentéricos estavam aumentados de volume e, ao corte, fluía grande quantidade de líquido leitoso. Focos de mineralização foram observados na íntima das artérias, nas válvulas cardíacas e na serosa do rúmen. As principais lesões macroscópicas incluíam enterite, linfadenite e linfangite granulomatosa caracterizada por infiltrado inflamatório com macrófagos, células gigantes de Langhans que continham grande quantidade de bacilos álcool-ácido-resistentes. As lesões vasculares consistiam em degeneração e mineralização das túnicas í ntimas e média das artérias de grande calibre associada a proliferação de colágeno. Havia calcificação da serosa do rúmen atrofia hepatocelular difusa e hepatite granulomatosa multifocal. O M. avium subsp. paratuberculosis (Map) foi isolado em amostras de intestino e linfonodos de 8 vacas Holandesas (3,5%) com doença de Johne, dentre 229 amostras cultivadas provenientes de um rebanho leiteiro. Amostras inoculadas em HEYM com micobactina produziram colônias identificadas como Map, segundo as caracterí sticas fenotí picas próprias como: crescimento lento, coloração álcool-ácido-resistente (A.A.R.) e dependência a micobactina. O laboratório de Referência da OIE confirmou a amostra isolada. O M. avium subsp. paratuberculosis (Map) foi isolado em amostras de intestino e linfonodos de 8 vacas Holandesas (3,5%) com doença de Johne, dentre 229 amostras cultivadas provenientes de um rebanho leiteiro Amostras inoculadas em HEYM com micobactina produziram colônias identificadas como Map, segundo as caracterí sticas fenotí picas próprias como: crescimento lento, coloração álcool-ácido-resistente (A.A.R.) e dependência a micobactina. O laboratório de Referência da OIE confirmou a amostra isolada. Não houve isolamento do agente em 221 amostras intestinais quando processadas, após 2 anos de sua colheita. O teste de IDGA aplicado como “screening”, detectou 26 vacas (11,4%) positivas, dentre 228 animais testados e sacrificados em matadouro. O teste de ELISA adsorvido, utilizando o antí geno PPA-3 detectou 125 (39,8%) amostras positivas. O ELISA não adsorvido detectou mais 32 (10,1%) reagentes positivos, dentre os 314 bovinos testados. A prevalência da infecção causada pelo Map em 36 rebanhos leiteiros procedentes de 25 municí pios do Rio Grande do Sul foi estimada em 44,6% das 1316 amostras testadas. A infecção foi identificada em 35 (97,2%) dos 36 rebanhos testados e presentes em todos os municí pios incluí dos. A ocorrência da doença de Johne foi enfatizada, tanto a forma clí nica quanto a infecção subclí nica no Rio Grande do Sul, sugerindo a adoção de medidas de controle sejam aplicadas na proteção dos rebanhos leiteiros nacionais. / The clinical and pathological aspects of bovine paratuberculosis in a dairy herd in the county of Capela de Santana, Rio Grande do Sul, southern Brazil are described. Clinical signs in eight cows out 345 cattle included chronic diarrhea refractory to treatment, progressive emaciation and decreased milk production. Necropsy findings included severe and diffuse thickening of the mucosa of the small intestine with exaggerated reticular pattern, reflected in the serosal surface, similar to cerebral gyri. Intestinal loops were filled with whitish watery contents. The lymphatic vessels of the intestinal serosa and of the mesentery were thickened and tortuous. The mesenteric lymph nodes were enlarged and, on cut surface, there were oozing of milky fluid. Plaques of mineralization were evident in the intima of larger arteries, in the endocardium of the heart valves and in the ruminal serosa. There was also edema of abomasal folds and atrophy of caudate lobe of the liver. The main histopathological findings were granulomatous enteritis, lymphadenitis and lymphangitis. The inflammatory infiltrate was composed of macrophages, epithelioid cells and Langhan`s giant cells containing large numbers of acid-fast bacilli. Vascular lesions included degeneration, calcification and collagen proliferation of the intima and media of larger arteries. Other microscopic lesions included calcification of the ruminal serosa, diffuse hepatocellular atrophy and multifocal granulomatous hepatitis. M. avium subsp. paratuberculosis (Map) was isolated from intestines and lymph nodes samples obtained from 8 Holstein cows (3.5%) with Johne’s Disease among 229 inoculated samples from a unique dairy herd in Rio Grande do Sul State, South Brazil. Cultures on HEYM supplemented with mycobactin yielded colonies identified like Map by phenotypic properties: Slow growth, acid-fast stain and mycobactin dependency. OIE Reference Laboratory in Argentine confirmed the strain like Map. The attempts to isolate the agent from 221 intestinal samples processed after 2 years were unsuccessful. The AGIDT applied as a screening test detected 26 positive cows (11.4%) among 228 tested animals at slaughterhouse. The absorbed ELISA test using PPA-3 antigen detected 125 positive animals (39.8%) and 47 (14.9%) suspect samples among 314 animals tested. Nonabsorbed ELISA test detected more 32 (10.1%) positive animals and 18 (5.7%) suspect samples than absorbed ELISA test. The prevalence of infection caused by Map was estimated in 35 bovine dairy herds in Rio Grande do Sul State by absorbed ELISA using PPA-3 commercial antigen. The ELISA test identified 558 positive (44.6%) animals among 1316 samples tested. The infection was detected in 35 dairy herds (97.2%) among 36 tested and was present in all 25 countries performed. The infection by Map was disseminated in dairy herds in Rio Grande do Sul State. It’ s emphasized the occurrence of clinical and subclinical forms of Johne’ s disease in Rio Grande do Sul and should be necessity the adoption of control measures in the protection of National dairy herds.

O Brasil ocupa uma posição de destaque mundial em relação à produção agropecuária, sendo necessário fornecer segurança microbiológica aos consumidores. Salmonella é um agente causador de infecções alimentares em seres humanos, de forma que os produtos de origem suína são responsáveis por cerca de 5-10% dos surtos em humanos. O controle depende do conhecimento da distribuição da bactéria desde o rebanho até o frigorífico. Em regiões com altas prevalências no campo, esforços direcionados primeiramente em reduzir a prevalência nos rebanhos visam minimizar os riscos de contaminação dos produtos. Neste sentido, medidas de biossegurança, seguindo boas práticas de produção agropecuária, são fundamentais. Além disso, a aplicação de intervenções complementares são, possivelmente, formas de reduzir a prevalência em um período de tempo mais curto. Desta forma o objetivo deste trabalho foi validar três estratégias: 1) utilização de um prebiótico Actigen®™ na ração dos animais, (PRE); 2) uma vacina viva Enterisol SC 54®, (VAC) e 3) o sistema de wean-to-finish, (WTF). Estes grupos foram comparados entre si e com o sistema tradicional em três sítios, o grupo controle (GC), frente à soroprevalência e contaminação em carcaças. Cada estratégia foi realizada em três repetições, sendo colhidas amostras de sangue de 55 animais de cada lote no dia do alojamento na terminação e quatro dias antes do abate. Suabe de 40 carcaças de cada lote foram colhidas antes do resfriamento. As soroprevalências e frequências de isolamento foram comparadas entre os grupos por meio de teste de qui-quadrado. A soroprevalência pré-abate foi estatisticamente menor no grupo PRE 50,3% em relação ao WTF, VAC e GC, com 99%, 96,9% e 98,8% respectivamente. As frequências de isolamentos em superfície de carcaça variaram de 0% a 29,1% nos grupos PRE e VAC respectivamente, sendo que ambas diferem significativamente entre si e dos grupos CG 18,33% e WTF 15% (p<0,05). Pode-se comprovar a eficácia do prebiótico em prevenir a infecção a campo frente às demais estratégias. Em relação às contaminações de carcaças, os resultados corroboram com os conhecimentos acerca do papel da pressão de infecção do campo nas contaminações na planta frigorífica. / Brazil has been increasing its worldwide position in relation to agricultural production, and is necessary providing food safety to consumers. Salmonella is a foodborne pathogen for humans and pork products play an important role in the amount of outbreaks. The control depends on the knowledge of the distribution of the bacteria occurrence from the herd to the slaughterhouse. In regions with high on farm prevalence, efforts are primarily directed to reduce the prevalence in the swine population in order to minimize the risks of products contamination. In this sense, biosecurity measures and good production practices are useful. Moreover, increase the knowledge about additional interventions, to reduce on farms prevalence in a shorter period of time, also is important. Therefore, the objective of this work was to validate three strategies: 1) use of Actigen ® ™ prebiotic in animal feed, (PRE); 2) a live vaccine Enterisol SC54® (VAC); and 3) the system of wean- to-finish, (WTF). Seroprevalence and contamination on carcasses surface in these groups were compared with the traditional system in three sites (the control group-CG). Each strategy was performed in three replicates, and blood samples were collected from 55 animals of each batch at the first day of finishing phase and four days before slaughter. Swabs of 40 carcasses were taken from each batch before chilling. The seroprevalence and isolation frequencies were compared between groups using logistic regression. The seroprevalence before slaughter was lower in PRE (50.3%) compared with the WTF, VAC and GC groups, with 99%, 96.9% and 98.79%, respectively. The frequency of Salmonella isolation was lower in PRE group 0%, when compared with the other groups (p<0.05). The results prove that prebiotic is able to prevent infection in the field compared to the other strategies. Regarding the carcass contamination, these finds are consistent with the knowledge on the role of infection pressure in the field contamination in the plant.

Orientador: Antonio Nader Filho / Banca: Luiz Augusto do Amaral / Banca: Carlos Augusto Fernandes de Oliveira / Banca: Nilson Roberti Benites / Banca: Helio Langoni / Resumo: o presente estudo teve como objetivo verificar a prevalência da mastite caprina causada por Staphylococcus spp. em três rebanhos do Estado de São Paulo, bem como conhecer as características fenotípicas e genotípicas das cepas isoladas. Por outro lado, através dos testes de susceptibilidade a antimicrobianos e da PCR-ribotipagem, pretendeu-se, também, verificar a relação epidemiológica existente entre as cepas de Staphylococcus spp. isoladas em amostras de leite, óstio do teto, lesão em pele do teto e ordenhadeira, assim como de mãos, tonsilas e fossas nasais de ordenhadores. A prevalência da mastite subclínica foi de 12,0%, 10,7% e 26,6% nos rebanhos pertencentes às três propriedades estudadas, nos quais Staphylococcus coagulase negativa foi o principal agente envolvido na etiologia dos casos. O teste de susceptibilidade a antimicrobianos revelou que 100% das cepas foram sensíveis à gentamicina, a neomicina e ao cefoperazone e, ainda, que a resistência frente a ampicilina e penicilina foi observada em 25,2% das cepas. A análise molecular revelou estreita relação entre as cepas isoladas de amostras de leite e óstio de teto. Cepas isoladas dos insufladores da ordenhadeira, assim como as de fossas nasais dos ordenhadores, têm participação na epidemiologia das mastites em cabras. A PCR-ribotipagem permitiu avaliar a relação epidemiológica existente entre as cepas isoladas de forma mais eficiente que o teste de susceptibilidade a antimicrobianos. A compreensão dessas relações epidemiológicas é necessária para a implementação de medidas eficazes no controle e prevenção das mastites em cabras. / Abstract: The present study aimed to investigate the prevalence of goat mastitis due to Staphylococcus spp. in three flocks from São Paulo State, as well as understand the phenotypic and genotypic characteristics of the strains isolated. Otherwise, epidemiological relationship between the strains isolated from milk, teat ends, skin lesions, milking units and milking personnel was investigated by the antimicrobial susceptibility and PCR-ribotyping. The prevalence of subclinical mastitis was 12,0%, 10,7% and 26,6% for the three flocks studied and coagulase negative Staphylococcus was the most prevalent agent isolated. Antimicrobial susceptibility test revealed 100% of sensibility to gentamicin, neomycin and cephoperazon and, in addition, the resistance to ampicillin and penicillin in 25,2% of the strains isolated. Molecular analysis showed close relationship between strains isolated from milk and teat ends. Strains isolated from milking units, as well as strains isolated from nasal swabs of the milking personnel, play an important role on goat mastitis epidemiology. PCR-ribotyping was more efficient than antimicrobial susceptibility test to evaluate the epidemiological relationship between the strains isolated. An understanding of these epidemiological relationships is necessary for the design of more effective mastitis control programs. / Doutor

O vírus da diarreia viral bovina (BVDV) causa uma das doenças mais importantes de bovinos em termos de custos econômicos e sociais, uma vez que é largamente disseminado na população de gado leiteiro. Os objetivos do trabalho foram estimar a prevalência em nível de rebanho e investigar fatores associados aos níveis de anticorpos em leite de tanque através de um estudo transversal, bem como discutir e comparar diferentes técnicas de modelagem, as tradicionais como regressão e as menos usuais para este fim, como as de Machine learning (ML) como Random Forest. O estudo transversal foi realizado no estado do Rio Grande do Sul para a estimação da prevalência de doenças reprodutivas baseados em amostras de tanque de leite, partindo de uma população total de 81.307 rebanhos. Foram coletadas 388 amostras de tanque de leite, e nas propriedades selecionadas foi aplicado um questionário epidemiológico. Como resultados se identificou uma prevalência de 23,9% (IC95% = 19,8 - 28,1) de propriedades positivas. Através de análise de regressão de Poisson se identificou como fatores associados o BVDV: o exame retal como rotina para o diagnóstico de prenhes, Razão de Prevalência [PR] = 2,73 (IC 95%: 1.87-3.98), contato direto entre animais (contato via cerca de propriedades lindeiras) (PR=1,63, IC 95%: 1.13-2.95) e propriedades que não utilizavam inseminação artificial (PR=2.07, IC 95%: 1.38-3.09) Na técnica de Random Forest pôde-se identificar uma dependência na ocorrência de BVDV devido a: inseminação artificial quando realizada pelo proprietário da propriedade ou capataz, o número de vizinhos que também possuem criação de bovinos, e em concordância com os resultados da regressão quanto a dependência da ocorrência de BVDV devido a palpação retal. Como resultado, pôde-se perceber que o BVDV está distribuído no estado do RS e caso seja de interesse do poder público, o desenvolvimento de um programa de controle da doença pode ser baseado nos resultados encontrados. Por outro lado, a contribuição deste estudo vai além das tradicionais análises realizadas em epidemiologia veterinária, principalmente devido os bons resultados obtidos com a abordagem por ML neste estudo transversal. Por fim, a utilização de técnicas estatísticas mais avançadas contribuiu para elucidar melhor os fatores possivelmente envolvidos com a ocorrência de BVDV no rebanho leiteiro gaúcho. / The bovine viral diarrhea virus (BVDV) causes one of the most important disease of cattle in terms of economic and social costs, since it is widely disseminated in dairy cattle population. The objectives were to estimate the herd level prevalence at and investigate factors associated with antibody levels in bulk tank milk through a cross sectional study, discuss and compare different modeling techniques such as the traditional regression with the ones less used for this approach machine learning (ML). The cross sectional study was conducted in Rio Grande do Sul state to estimate the prevalence of reproductive diseases based on bulk tank milk samples, from a total population of 81,307 herds. Milk samples from 388 bulk tank were sampled, and an epidemiological questionnaire was applied in each farm. The prevalence was 23.9% (95% CI 19.8 - 28.1). Through the Poisson regression analysis, the following factors associated with BVDV were found: routine use of rectal examination for pregnancy (Prevalence Ratio [PR] = 2.73 (IC 95%: 1.87-3.98), direct contact between/among animals (contact over the fence of neighboring farms) (PR = 1.63, IC 95%: 1.13-2.95) and properties that did not use artificial insemination (PR = 2.07, IC 95%: 1.38-3.09). On the other hand, using ML techniques, it was identify a dependency upon the occurrence of BVDV due to: artificial insemination when carried out by the owner of the property or foreman; the number of neighbors who also have cattle, and in accordance with the regression results as the dependence of the occurrence of BVDV due to routine use of rectal examination for pregnancy. BVDV is spread across the State and if the government's interest to launch a disease control program measures should be focusing mainly on better conditions and care in reproduction. On the other hand, the contribution of this study goes beyond traditional analyzes in veterinary epidemiology, mainly due to the good results obtained with the approach by ML in this cross-sectional study. Finally, the use of advances statistics techniques it has been made progress to better elucidate the factors possibly involved in the occurrence of BVDV in state dairy herds.

Orientador: Adolorata Aparecida Bianco Carvalho / Coorientador: Daniel Figuglietti Brandespim / Banca: Fumio Honma Ito / Banca: Darci Lara Perecin Nocitti / Banca: Luís Antônio Mathias / Banca: Maria da Glória Buzinaro / Resumo: A raiva é uma antropozoonose de evolução letal causada por vírus do gênero Lyssavirus. É uma das doenças infecciosas responsáveis por causar prejuízos aos produtores rurais, levando a impactos econômicos significativos no agronegócio. Objetivou-se com o presente trabalho determinar o perfil epidemiológico da raiva em herbívoros no Estado de Pernambuco, Brasil, no período de 2007 a 2012. Foi realizado um estudo retrospectivo dos dados relativos aos casos positivos de raiva de herbívoros, levando em consideração o mês e o ano da ocorrência e a região geográfica. As análises moleculares foram desenvolvidas a partir de amostras de encéfalos provenientes das cinco Mesorregiões (Agreste, Mata, Sertão, Metropolitana e São Francisco) do Estado. No período estudado foram detectados 238 resultados positivos para o vírus da raiva em herbívoros, distribuídas espacialmente nas cinco mesorregiões, em 78 (42,1%) dos 185 municípios. Observou-se no decorrer do período uma diminuição significativa na taxa de incidência, com ausência de sazonalidade. Quando se analisou a taxa de incidência levando em consideração as Mesorregiões, observou-se que a Mata foi a que apresentou maior oscilação. Para complementar a análise epidemiológica, 16 amostras foram submetidas à técnica de RT-PCR para amplificação parcial do gene N. As sequências geradas foram alinhadas com sequências homólogas obtidas no GenBank para a construção da árvore filogenética, pelo método Bayesiana. Todas as amostras foram homólogas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Rabies is an anthropozoonosis with lethal evolution caused by genus lyssavirus viruses. It is one among infectious diseases who are responsible for causing losses to farmers, leading to a significant economic impacts on agribusiness. The objective of this study was to determine the epidemiological profile in herbivores whithin the State of Pernambuco, Brazil, from 2007 to 2012. A retrospective study was conducted based on data from positive cases of rabies of herbivores, considering the month, the year of occurrence and geographic region. The molecular analyzes were developed using brain samples from the five Mesoregions (Agreste, Mata, Sertão, Metropolitana and São Francisco) within the State. During the study period, were detected positive for rabies 238 from herbivores, spatially distributed in 78 (42.1%) of 185 municipalites from the five mesoregions. It was observed, during the period cited, a significant decrease in the incidence rate, with no seasonal nature. While analyzing the incidence rate considering the mesoregions, the Mata region showed the greatest oscillation. As a complement to the epidemiological analysis, 16 samples were subjected to RT-PCR for the partial amplification of the gene N. The generated sequences were aligned with homologous sequences obtained from the GenBank to build the phylogenetic tree by bayesian method. On the results, it was found that the rabies virus is present all over the state of Pernambuco, related to the lineage of vampire bat De... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005-01-18Bitstream added on 2014-06-13T18:44:24Z : No. of bitstreams: 1 lemos_raa_dr_jab.pdf: 1737624 bytes, checksum: c2016f6060efda5b253270dcfa2f39fb (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Foi realizado um estudo em 1437 materiais de bovinos encaminhados para o setor de Anatomia Patológica do Núcleo de Ciências Veterinárias da Universidade Federal do Mato Grosso do Sul (SAP/NCV/UFMS), no período de janeiro de 2000 a dezembro de 2004. Os casos estudados consistiam tanto de casos acompanhados por técnicos do SAP/NCV/UFMS, como por casos encaminhados ao setor por médicos veterinários que atuam no campo. Dos protocolos dos casos foram extraídas informações sobre a epidemiologia, sinais clínicos, achados de necropsia, histopatológicos e exames laboratoriais complementares desses casos. A raiva (13% dos casos), o botulismo (10% dos casos), a meningoencefalite causada pro herpesvírus bovino tipo 5 (2% dos casos) e a polioencefalomalacia (5% dos casos), foram as enfermidades de maior prevalência. Cento e quarenta e nove exames eram provenientes de bovinos importados que não estavam mais aptos para a reprodução e foram sacrificados e seus cérebros encaminhados para o diagnóstico da encefalopatia espongiforme dos bovinos (sigla em inglês BSE). Todos os materiais estudados foram testados para raiva nas provas de imunofluorescência direta e inoculação intracerebral em camundongos. Outras enfermidades como as intoxicações por chumbo, por Vernonia rubricaulis, por Senna occidentalis, por uréia, por abamectina, a febre catarral maligna, cetose, abscessos cerebrais e de vértebras que comprimem a medula espinhal, meningites bacterianas, traumatismos que afetam o SNC, hipotermia, , tétano, listeriose e a meningoencefalite tromboembólica foram ocasionalmente diagnosticadas. Quinhentos e trinta materiais encaminhados (38%) apresentaram resultados inconclusivos e em 9% dos casos as lesões histológicas eram de meningoencefalite não supurativa (mens). A grande maioria dos casos diagnosticados como mens, apresentava a distribuição... / An analysis of 1437 bovine samples brought to the Pathology Section of the NCV of UFMS was performed from January 2000 to December 2004. The studied materials came from cases either assisted by the technicans from the NCV or drawn to the Pathology section by other veterinarians. There have been pointed out information about epidemiology, clinical signs, necropsy findings as well as hystopathological and other laboratorial / findings. The most prevalent diseases were rabies (13% of cases), botulism (10%), bovine herpesvirus 5, meningoencephalitis (2% of cases) and polioencephalomalacia (5% of cases). One and forty nine exames were from imported cattle that were not able for reproductive use, so that after being euthanazied, had their brains submitted for the diagnosis of Bovine Spongiphorm Encephalopathy (BSE). All the studied samples have been tested for rabies by direct immunofluorescence assay and intracerebral inoculation in mice. There have been diagnosed other diseases such as poisonig to Vernonia rubricaulis, to Senna occidentalis, to urea, to abamectin, malignant catharral fever, cetosis, abscesses in the brain and in vertebral that compress the espinal cord, bacterial meningitis, trauma to the central nervous system (CNS), hypotermia, tetanus, lysteriosis and thromboembolic meningoencephalitis. Five hundred and thirty samples (38%) had not conlusive results and in 9% of the cases the hystologic lesions were characteristic of non suppuractive meningoencephalitis (NSME). A great number of the cases of NSME showed the same lesions distribution as in the bovine rabies as well as the epidemiologic and clinical aspects of this disease.

Orientador: Helio Langoni / Banca: Paulo Francisco Domingues / Banca: Marcos Veiga dos Santos / Resumo: A mastite é a afecção que mais onera o setor leiteiro mundial, sendo ainda importante entrave para melhoria da produção. O objetivo deste estudo epidemiológico prospectivo foi desenvolver um plano de controle de mastite em um rebanho de vacas Holandesas. A propriedade foi visitada durante 18 meses para colheita de dados e instituição do plano de controle. Os primeiros quatro meses corresponderam à fase de diagnóstico, seguida de uma fase de intervenção perfazendo 14 meses. O plano de controle reduziu de 53,7% para 23,3% a mastite subclínica. A contagem de células somáticas do tanque reduziu de 1446 x 103 células/mL para 214 x 103 células/mL. A prevalência de mastite clínica foi 11,11% e a incidência média foi de 7,6%. Do total de 704 casos, 30,1% (217/704) não puderam ser avaliados quanto à cura bacteriológica, por não haver a amostras pós-tratamento, 51,3% (249/485) curaram, 49,7% (236/485) falharam e repetiram o mesmo patógeno ou falharam com isolamento de um novo patógeno. Do total de 485 casos que puderam ser avaliados quanto à cura bacteriológica 71,9% (349/485), 19% (92/485), 7,4% (36/485) e 1,6% (8/485) eram, respectivamente, referentes aos primeiros, segundos, terceiros e quartos casos de mastite clínica na mesma glândula mamária. Houve falha no tratamento em 53,65% (44/82), 47,5% (165/347) e 48,21% 27/56, severidade um, dois e três, respectivamente. O plano de controle de mastite foi eficiente em reduzir a prevalência de mastite subclínica e elucidar os índices de mastite clínica, através de medidas simples de manejo e embasada no adequado diagnóstico epidemiológico / Abstract: Mastitis is a disease that more burdens the world dairy sector still major obstacle to improving production. The aim of this prospective epidemiological study was to develop a mastitis control plan in a Holstein cow herd. The property has been visited for 18 months to harvest data and control plane of the institution. The first four months corresponded to the diagnostic phase, followed by an intervention phase amounting to 14 months. The control plan has reduced from 53.7% to 23.3% subclinical mastitis. The somatic cell count of the tank reduced from 1446 x 103 cells / ml to 214 x 103 cells/ml. The prevalence of clinical mastitis was 11.11% and the average incidence was 7.6%. Of the total 704 cases, 30.1% (217/704) could not be evaluated for bacteriological cure because there is no post-treatment samples, 51.3% (249/485) healed, 49.7% (236/485) failed and repeated the same pathogen or failed to isolation of a new pathogen. Of the total 485 cases that could be evaluated for bacteriological cure 71.9% (349/485), 19% (92/485), 7.4% (36/485) and 1.6% (8/485) They were, respectively, related to the first, second, third and fourth cases of clinical mastitis in the same mammary gland. There was treatment failure in 53.65% (44/82), 47.5% (165/347) and 48.21% 27/56, severity one, two and three, respectively. The mastitis control plan was effective in reducing the prevalence of subclinical mastitis and elucidate the clinical mastitis rates through simple measures of management and grounded in proper epidemiological diagnosis / Mestre