Retortamonads (Retortamonadida; genera Chilomastix and Retortamonas) are a small group of protists comprising intestinal commensals of both vertebrates and invertebrates and one free-living species of the genus Chilomastix. Molecular phylogenetic studies showed that retortamonads are closely related to diplomonads, Carpediemonas, Dysnectes, Hicanonectes, Kipferlia and two undescribed lineages of free-living Carpediemonas-like organisms, together forming the monophyletic excavate group Fornicata. For a long time Retortamonadida have been assumed to be a monophyletic group. However, first molecular phylogenetic study including sequence data from both Retortamonas and Chilomastix suggested that Retortamonadida are paraphyletic and that diplomonads branch within Retortamonadida. Retortamonads still remain poorly studied protist group and their phylogeny is unclear. We sequenced and analysed SSU rDNA of ten Retortamonas and four Chilomastix SSU rDNA sequences. In addition, we sequenced SSU rDNA of an undescribed enteromonad lineage. The phylogenetic tree of Fornicata was largely unresolved and the phylogenetic position of the genus Chilomastix remained unclear. On the other hand, the genus Retortamonas and diplomonads formed a robust clade. Retortamonas sequences split into three host-specific lineages. The...

Developmental modularity may facilitate morphological evolution by allowing phenotypic change of a developing body component without negatively impacting other components. I examined foregut development in Amphissa columbiana, a predatory neogastropod with a highly derived foregut and in Crepidula fornicata, a phytoplankton-feeder with a less derived foregut, for evidence of developmental modules. Histological sections revealed that the post-metamorphic buccal cavity and radula of both species form as a ventral outpocketing (ventral module) from the larval esophagus (dorsal module). However, in Amphissa columbiana the ventral outpocketing is semi-isolated from the larval esophagus and also produces an “anterior esophagus” that is not developmentally homologous to the “anterior esophagus” of herbivorous caenogastropods. Semi-isolation of the ventral and dorsal modules of the developing neogastropod foregut allows precocious development of the post-metamorphic foregut during the larval stage without compromising larval feeding. Therefore, development of diverse variants of the post-metamorphic foregut are freed from larval constraints. / Graduate / 2020-08-03

Dans un contexte de gestion des systèmes côtiers, l'approche développée dans cette étude -associer un suivi des paramètres environnementaux avec celui des peuplements pélagiques et benthiques- permet d'appréhender le fonctionnement global de l'écosystème. La veille écologique menée depuis plus de 20 ans en rade de Brest a fait apparaître un nouveau risque écologique (et économique): la prolifération d'un filtreur benthique exotique, compétiteur potentiel de la coquille Saint-Jacques, la crépidule Crepidula fornicata (L.). Ses mécanismes de prolifération étaient encore inconnus en rade, notamment concernant l'accélération récente (15-20 ans) du processus. L'approche multidisciplinaire de ce travail permet d'étudier les mécanismes d'adaptation et de régulation naturelle de la crépidule en rade de Brest face aux fluctuations naturelles de l'environnement (hydroclimat) et aux perturbations anthropiques (eutrophisation...) et d'identifier ses impacts sur le fonctionnement de l'écosystème.<br />Les causes de la prolifération actuelle de la crépidule en rade et ses impacts sur la structuration et le fonctionnement de l'écosystème ont été précisés : les filtreurs exercent un rétro-contrôle de la production primaire (filtration, biodépositions). L'analyse des conditions favorables à la prolifération de la crépidule a montré la place importante prise par cette espèce dans l'écosystème et a permis de mieux appréhender les processus d'évolution de son aire de répartition et de son stock. La description réalisée des peuplements benthiques soumis à cette invasion constitue un état de référence de la mégafaune de la rade en 2000. Les impacts de la crépidule sur l'écosystème (colonne d'eau, sédiment, biocénoses) ont été précisés. Des évolutions futures sont envisagées et des recommandations sont faites pour en limiter l'extension et pérenniser la pêcherie de coquilles Saint-Jacques en rade de Brest. Des perspectives sont proposées dans le cadre de la gestion intégrée de cet écosystème.