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Fragmentação de DNA em espermatozoides humanos com diferentes viscosidades no plasma seminal

Kussler, Ana Paula de Souza January 2012 (has links)
Introdução: Doze a 29 % dos ejaculados tem viscosidade seminal aumentada. Uma das técnicas recomendadas para diminuir a viscosidade do sêmen consiste num processo físico em que se passa o sêmen, 4 vezes, por uma seringa de 10 mL com agulha 18G. Ao fim desse processo, ter-se-ia modificado o comportamento molecular das fibrilas protéicas do esperma, tornando-o mais liquefeito, sem dano aparente a morfologia ou motilidade dos espermatozoides. Atualmente, discute-se sobre a total inocuidade desta técnica, uma vez que ela poderia provocar aumento da fragmentação do DNA dos espermatozoides. A hiperviscosidade seminal, além de reduzir a concentração e a motilidade dos espermatozoides, pode afetar a capacitação e a reação acrossômica, podendo ter implicações na integridade do DNA e no desenvolvimento embrionário normal. Objetivo: Comparar a fragmentação do DNA de espermatozoides humanos em amostras com viscosidade diminuída, fisiológica e aumentada, e avaliar se o processo de expulsão do sêmen através da agulha e seringa altera significativamente as taxas de fragmentação do DNA dos espermatozoides. Método: Após a coleta e avaliação dos parâmetros seminais das amostras de sêmen, aquelas que estiverem com viscosidade aumentada passarão pelo processo de expulsão através da seringa de 10 mL com agulha 18G por 4 vezes, para diminuir a viscosidade seminal. Posteriormente, serão feitas análises da fragmentação do DNA dos espermatozoides através da técnica de TUNEL em todas as amostras. Resultados: A fragmentação do DNA entre amostras com viscosidade fisiológica, diminuída e aumentada não apresentou diferença estatisticamente significativa (P=0,857). A fragmentação do DNA aumentou significativamente (P=0,035) nas amostras com viscosidade aumentada após passar na seringa e agulha quando comparadas com as mesmas amostras antes de passar pela mesma. Conclusão: O processo de expulsão do sêmen através de seringa e agulha visando redução da viscosidade seminal aumenta a fragmentação do DNA no espermatozoide, devendo este processo ser substituído por um processo inócuo. / Background: Twelve to 29 % of the ejaculated have the semen viscosity increased. One of the techniques recommended to decrease the viscosity of semen is a physical process in which the semen passes four times through a 10mL syringe with a 18G needle. At the end of this process would have modified the molecular behavior of the protein fibrils of the sperm making it more liquefied, without apparent damage to the morphology or motility of spermatozoa. Currently, the debate is about the complete safety of this technique since it could result in increased DNA fragmentation of spermatozoa. The seminal viscosity moreover reduces the concentration and motility of sperm, can affect the capacitation and acrosome reaction which may have implications for DNA integrity and normal embryonic development. Objective: To compare the DNA fragmentation in human semen samples with reduced, physiological and increased viscosity and evaluate if the process of expulsion of semen through the needle and syringe significantly alter rates of sperm DNA fragmentation. Methods: After collecting and evaluating semen parameters of semen samples, those that are with increased viscosity will pass through the process of expulsion through the 10 mL syringe with a 18G needle four times to reduce the viscosity of semen. After that, analysis of spermatozoa DNA fragmentation through the TUNEL technique will be made in all samples. Results: The fragmentation of DNA between samples with physiological, reduced and increased viscosity is not statistically significant (P=0.857). The DNA fragmentation increased significantly (P=0.035) in samples with increased viscosity after passing the syringe and needle when compared with the same samples before going through the same. Conclusion: The process of expulsion of semen through a syringe and needle in order to reduce the semen viscosity increases the DNA fragmentation in sperm, and this shall be replaced by a harmless process.
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Classification and structural connectivity of urban vegetation : A comparative study using different datasets

Lundberg, Malin January 2018 (has links)
Urban greenspace has an important role in supporting biodiversity and providing structural and functional connectivity between natural habitats. However, the mapping of vegetation in urban areas presents challenges, as urban vegetation is highly fragmented and heterogeneous. This study compared maps with respect to their strengths and weaknesses in providing ecologically relevant information in an urban area with the purpose to find how useful they are for local planning. The study took place in the urban part of Dún Laoghaire-Rathdown County, Ireland. The maps analysed were the Urban Atlas 2012 provided by Copernicus, the Prime 2 database provided by the Ordnance Survey Ireland, and two maps that were generated by this project from Sentinel 2 satellite imagery, one which showed vegetation based on calculated NDVI and one with four land cover classes calculated with a supervised classification. These maps were compared from three points of view: correspondence of vegetation classes, structural connectivity, and quality of vegetated areas. Analyses of structural connectivity were based on several landscape metrics, one of them was the degree of coherence (Cm) which reflects how connected the vegetation patches are in the landscape. Definition of quality was based on contextual indicators, such as the proximity to streams and areas with high conservation value, and vegetation present on a historical map from the 1830s. The results showed that the overlap of vegetation between the datasets varies between 27.0-89.1%. The different datasets definitions of vegetation affect how well they correspond in terms of where vegetation can be found. Resolution is also an important factor, as urban vegetation patches tend to be small and thus a coarse minimum mapping unit – as is the case for the Urban Atlas – masks important information on the configuration of vegetated areas in the urban area. The structural connectivity of vegetation differed little between Prime 2 (Cm = 7.95×10-2%) and the Urban Atlas (Cm = 5.87×10-2%). However, the distance between vegetated patches was on average shorter in Prime 2. This suggests that the Prime 2 dataset, because of its higher spatial resolution, contains more information on potential stepping stones for species to move around the landscape. The distribution of vegetated areas with higher contextual quality was mainly close to the boundaries of the urban area. Connectivity in a fragmented landscape like this urban study area plays a crucial role in maintaining populations of flora and fauna. It is therefore important to consider in the management of urban vegetation and in planning for development. This study offers a first insight in the structural connectivity of Dún Laoghaire-Rathdown County, which can be used to make more informed decisions that will sustain urban biodiversity.
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Avaliação do efeito de borda sobre a vegetação do cerrado stricto sensu inserido em matriz de pastagem / Edge effects on plant community of cerrado sensu stricto inserted into a matrix of pasture

Augusto Hashimoto de Mendonça 19 July 2010 (has links)
O Cerrado é o bioma brasileiro que mais perdeu área para o agronegócio em anos recentes, verificando que a expansão da fronteira agrícola sobre o Cerrado provocou a pulverização dos remanescentes em fragmentos cada vez menores, imersos em matrizes de baixa similaridade, causando uma série de impactos negativos sobre o ecossistema natural. A fragmentação de habitats é considerada uma das mais graves ameaças à conservação da biodiversidade, com consequências ecológicas variáveis, intensificadas na faixa de transição entre matriz e fragmento. Os efeitos de borda são decorrentes de mudanças físicas e bióticas nas faixas marginais das ilhas de vegetação natural, que promovem modificações nas características microclimáticas, as quais conduzem a uma série de alterações importantes nas comunidades que compõem os ecossistemas. O objetivo deste estudo foi investigar a existência de efeito de borda e suas consequências sobre a comunidade vegetal do Cerrado stricto sensu. O estudo foi realizado em fragmento de Cerrado com área de 980,8 ha, localizado no município de Iaras, SP, cujo entorno foi ocupado por pastagem durante cerca de um século. Efetuou-se a caracterização estrutural e florística de diferentes estratos da vegetação em diferentes distâncias da borda (0, 10, 20, 40, 80 m) e coletaram-se dados microclimáticos na matriz (a 10 m de distância da borda) e no interior do fragmento, nas diferentes distâncias da borda e em duas estações do ano (seca e chuvosa). Investigou-se a existência de um possível gradiente de estrutura ou composição da vegetação relacionado com a distância da borda e com as variáveis microclimáticas. Os resultados obtidos mostraram não existir variações de microclima e de estrutura e composição do componente arbóreo e herbáceo-arbustivo em relação à distância da borda do fragmento. Embora independente do microclima e, portanto, diferente dos clássicos efeitos de borda, a invasão pela braquiária (Urochloa decumbens) foi detectada como a única consequência da exposição da periferia do Cerrado stricto sensu às pressões da matriz, causando exclusão das gramíneas nativas e inibindo o desenvolvimento de plantas lenhosas de pequeno porte. A ausência de efeito de borda sobre os demais componentes da vegetação sugere, em um primeiro momento, que esta não é uma ameaça importante para a conservação do cerrado. Porém, a invasão biológica pela gramínea africana é relativamente recente (foi introduzida há cerca de três décadas na propriedade) e suas consequências ainda não podem ser avaliadas adequadamente. É possível que seus impactos sobre os estratos superiores da vegetação venham a ser observados no futuro, quando a inibição da regeneração das espécies arbustivas e arbóreas comprometer a dinâmica da comunidade vegetal e a substituição dos adultos nas populações dessas espécies. Além disso, hoje a invasão só causa impactos significativos sobre a faixa de 0 a 20 m de distância da borda, mas não é possível prever se a gramínea invasora vai se expandir rumo ao núcleo do fragmento no futuro. / From the Brazilian biomes, the Cerrado has been the most widely and rapidly converted to agribusiness in recent years. The expansion of agricultural frontier over the Cerrado domain resulted in thousands of small fragments embedded in matrices of low similarity, causing a series of negative impacts on the natural ecosystem. Habitat fragmentation is considered one of the most serious threats to the conservation of biodiversity and ecological consequences vary, being intensified in the range of transition between matrix and fragment. The edge effects are caused by biotic and physical changes in marginal areas of the islands of natural vegetation, promoting changes in microclimatic characteristics, which leads to a series of important changes in the ecosystems. The aim of this study was to investigate the existence of edge effect and their consequences on the plant community of Cerrado sensu stricto. The study was conducted in Cerrado fragment with an area of 980.8 ha, located in the municipality of Iaras, SP, whose surrounding area was occupied by pasture for about a century. Structure and floristic composition of distinct vegetation layers was assessed at different distances from the edge (0, 10, 20, 40 and 80 m). Climatic data were collected in two seasons (dry and wet), at the same distances withing the fragment and also in the matrix (10 m away from the edge). The existence of a gradient of vegetation composition or structure and the microclimatic variables related to distance from the edge was investigated. No changes in microclimate and structure or composition of the wood layers related to distance from the edge was observed. Although independent of the microclimate and therefore different from classic edge effects, invasion by the African grass Urochloa decumbens (braquiária) was detected as the only consequence of exposure of the periphery of the cerrado sensu stricto to the pressures of the matrix, causing the exclusion of native grasses and inhibiting the development of small woody plants. The absence of edge effect on other components of the vegetation suggests, at first, that this is not a major threat to the conservation of the Cerrado. However, the biological invasion by the African grass is relatively recent (it was locally introduced about three decades ago) and its consequences have not been adequately assessed. It is possible that their impacts on the upper strata of the vegetation may be observed in future, when the inhibition of regeneration of shrub and tree species jeopardize the dynamics of plant community and the replacement of adults in the populations of these species. In addition, at present the invasion has significant impacts only over 0-20 m from the edge, but it is impossible to predict whether the invasive grass will expand or not into the core area of the fragment in the future.
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Efeitos do uso do solo sobre a vegetação: estudo de caso em inselberg no Cariri paraibano / Effects of land use on vegetation: a case study in inselberg in cariri paraibano

Menezes, Marcelo Costa de 28 March 2016 (has links)
Submitted by Vasti Dinizmm (vastijpa@hotmail.com) on 2017-07-26T13:13:23Z No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 6682075 bytes, checksum: d3f1f46a995a80be149d241bcf26426a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-26T13:13:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 6682075 bytes, checksum: d3f1f46a995a80be149d241bcf26426a (MD5) Previous issue date: 2016-03-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Caatinga is a very important biome in the social, economic and environmental context, however is little valued, studied and poorly maintained. The main objective was to make a comparison of the structure and composition of trees - shrubs and cactuses between 3 areas of different land uses. The specific objectives were to make a phytosociological survey of the site and a bibliographic study of the use and importance of the species found. The methodology applied to the phytosociological survey consisted of marking 50 plots of 50 x 2 m, for a total of 0.5 hectares. Within the plots were identified all sized individuals tree, shrub, subshrubby and cacti, and measuring the height and the diameter at chest level of individuals (DBH> 2cm) in subjects with PAD <2cm were only measured height. ecological parameters of wealth were calculated number of individuals, frequency, dominance, diversity of Shannon - Wiener, Pielou evenness and importance value. The land use maps of the area were made with GIS data. To quantitatively compare the areas of different land uses, it was held the Shapiro-Wilk normality test and analysis of variance (ANOVA / unifactorial) or Kruskal-Wallis. Multivariate analysis was used of the main components (PCA) to verify structural differences in different areas. For flora similarity test was done by cluster analysis (cluster) by averaging method UPGMA group being made a qualitative and quantitative comparison with the Jaccard coefficients and Bray Curtis. The survey of the use and importance of the species was made a bibliographic reference. They were found in 2623 individuals in 82 species, 72 genera and 32 families. The families with the highest number of individuals and species were Fabaceae (16), Euphorbiaceae (11) and Cactaceae (5). The Tacinga inamoema species (K. Schum.) N.P. Taylor & Stuppy, Croton blanchetianus Baill.e Bauhinia cheilantha (Bong.) Steud stood out for having highest importance values. The land use maps of the area confirmed the progress of identified areas of very serious risk of desertification and also showed that forest fragment is currently one of the only in the city of Congo. There were statistical differences in different areas as the structure of the community according to the tste variance and PCA. The floristic similarity showed no differences in species composition in different areas of land use. 61 species were found to have obtained 11 kinds of uses, and the medical, construction and uses honey that stood out in the species. We conclude that the studied forest fragment is a priority for conservation because it is one of the only in the region, has razoálvel ecological diversity, contains useful species for the population, is home to species at risk of extinction due to misuse of land and contain species invasive. However, it is necessary to create a conservation unit that area and a management plan activities to develop socio-economic and environmental. / A Caatinga é um bioma brasileiro muito importante no contexto social, econômico e ambiental, todavia é pouco valorizado, estudado e pouco conservado. O objetivo principal foi fazer uma comparação da estrutura e composição da vegetação arbórea - arbustiva e cactáceas entre 3 áreas de diferentes usos de solo. Os objetivos específicos foram fazer um levantamento fitossociológico do local e um estudo bibliográfico do uso e importância das espécies encontradas. A metodologia aplicada no levantamento fitossociológico consistiu na marcação de 50 parcelas de 50 x 2 m, perfazendo um total de 0,5 hectares. Dentro das parcelas foram identificadas todos os indivíduos de porte arbóreo, arbustivo, subarbustivo e cactáceas, sendo medido a altura e o diâmetro no nível do peito dos indivíduos com (DAP > 2cm), em indivíduos com DAP < 2cm foram medidos somente a altura. Foram calculados parâmetros ecológicos de riqueza, número de indivíduos, frequência, dominância, diversidade de Shannon – Wiener, equabilidade de Pielou e valor de importância. Os mapas de uso de solo da região foram feitos com dados de geoprocessamento. Para comparar quantitativamente as áreas de uso de solo diferentes, foi realizado o teste de normalidade de Shapiro Wilk e as análises de variância (ANOVA/ unifatorial) ou Kruskal- Wallis. Foi usada a analise multivariada dos componentes principais (PCA) para se verificar diferenças estruturais das diferentes áreas. O teste de similaridade florística foi feito através da análise de agrupamento (Cluster) pelo método de média de grupo UPGMA, sendo feito uma comparação qualitativa e quantitativa com os coeficientes de Jaccard e Bray Curtis. O levantamento do uso e importância das espécies foi feito por uma consulta bibliográfica. Foram encontrados 2623 indivíduos distribuídos em 82 espécies, 72 gêneros e 32 famílias botânicas. As famílias com maiores números de indivíduos e espécies foram Fabaceae (16), Euphorbiaceae (11) e Cactáceae (5). As espécies Tacinga inamoema (K. Schum.) N.P. Taylor & Stuppy, Croton blanchetianus Baill.e Bauhinia cheilantha (Bong.) Steud destacaram- se por terem maiores valores de importância. Os mapas de uso de solo da região comprovaram o avanço das áreas identificadas como de risco muito grave de desertificação e mostraram também que esse fragmento florestal atualmente é um dos únicos no município do Congo. Houve diferenças estatísticas nas diferentes áreas quanto à estrutura da comunidade de acordo com o teste de variância e PCA. A similaridade florística mostrou haver diferenças na composição de espécies nas diferentes áreas de uso de solo. Foram encontradas 61 espécies que obtiveram 11 tipos de usos, sendo o medicinal, para construção e melíferas os usos que mais se destacaram nas espécies. Conclui-se que o fragmento florestal estudado é prioritário para a conservação, pois é um dos únicos da região, tem razoálvel diversidade ecológica, contém espécies potencialmente úteis para a população, abriga espécies em risco de extinção devido ao mau uso do solo e conter espécies invasoras. Contudo, faz se necessário a criação de uma unidade de conservação nessa área e um plano de manejo que proponha atividades sócio econômicas e ambientais.
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O efeito da fragmentação na diversidade específica e funcional de primatas no Brasil / Effect of fragmentation in specific and functional diversity of primates in Brazil

Campos, Vanessa Ellen Wendt [UNESP] 30 March 2016 (has links)
Submitted by VANESSA ELLEN WENDT CAMPOS null (vanessaellen@hotmail.com) on 2016-07-14T18:11:05Z No. of bitstreams: 1 Vanessa_Completo.pdf: 3530663 bytes, checksum: fa3beebf319fc93620723a321d5c7529 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-07-18T20:26:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 campos_vew_me_rcla.pdf: 3530663 bytes, checksum: fa3beebf319fc93620723a321d5c7529 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-18T20:26:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 campos_vew_me_rcla.pdf: 3530663 bytes, checksum: fa3beebf319fc93620723a321d5c7529 (MD5) Previous issue date: 2016-03-30 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As florestas tropicais representam um dos biomas mais ameaçados pelas ações antrópicas no mundo. Os primatas representam 40% da biomassa de vertebrados frugívoros nas florestas tropicais, mas mais da metade das espécies estão ameaçadas de extinção. Tendo em vista a importância dos primatas no funcionamento dos ecossistemas devido a sua função de dispersores de sementes, é de extrema relevância entender como a fragmentação das florestas tropicais afetam as comunidades de primatas e suas funções. Portanto, nossos objetivos são: 1) analisar a relação entre diversidade funcional e filogenética de primatas e como esses índices são influenciados pela riqueza; 2) determinar o efeito da fragmentação das florestas tropicais na riqueza específica e funcional dos primatas; 3) determinar quais características funcionais são perdidas com a fragmentação, na Amazônia e na Mata Atlântica brasileira. Para isso, montamos bancos de dados de ocorrência dos primatas e de suas características funcionais ligadas à dispersão de sementes para gerar os índices de diversidade funcional (FD), regularidade funcional (FEve) e divergência funcional (FDiv) e relacioná-los com métricas da paisagem: área do fragmento, isolamento médio entre os fragmentos, distância em relação à zona urbana, distância à floresta contínua, conectividade funcional e porcentagem de cobertura vegetal no entorno do fragmento. A diversidade funcional dos primatas é fortemente correlacionada com a diversidade filogenética (R2= 0.94 e p<0.001). A redução da área dos fragmentos e da conectividade funcional, assim como o aumento do isolamento médio entre os remanescentes florestais diminuem a diversidade (FD), a regularidade (FEve) e a divergência funcional (FDiv) dos primatas. As espécies de primatas de grande porte que possuem grandes áreas de vida e que dispersam grandes sementes são as espécies mais prejudicadas pela fragmentação. Nosso trabalho permitiu ressaltar que além da perda de riqueza específica de primatas, a fragmentação nas florestas tropicais também afeta o serviço de dispersão de sementes, o que, consequentemente, pode alterar a estrutura das comunidades vegetais. / Tropical forests are the most threatened biome by human activities worldwide. Primates represent almost 40% of the frugivore vertebrate biomass in tropical forests and more than half of their species are threatened by extinction. Given the importance of primates as seed dispersers for the ecosystem functioning, it is extremely important to understand how the fragmentation of tropical forests affects primate communities and the functions they provide. Therefore, this project aims at: 1) analyzing the relationship between primate functional and phylogenetic diversities and how those indices are influenced by species richness; 2) determining the influence of forest fragmentation on primate species richness and functional diversity; 3) determining which functional traits are lost with habitat fragmentation, in Amazonian and Atlantic Forests of Brazil. To do this, we built a database of primates’ occurrence and their functional traits related to seed dispersal to compute indices of functional diversity (FD), functional evenness (Feve) and functional divergence (FDiv). Then, we related these indices to landscape metrics: patch size, average isolation between patches, distance to the nearest urban area, distance to the nearest continuous forest, functional connectivity and percentage of forest cover surrounding the fragment. Functional diversity is strongly correlated with phylogenetic diversity (R2= 0.94 e p<0.001). The decrease of fragment areas and functional connectivity, and the increase of average isolation between forest remnants, reduce primate functional diversity (FD), regularity (FEve) and divergence (FDiv). Large primates with large home ranges that disperse large seeds are the most affected by fragmentation. Our results enable highlighting that beyond the loss of primate species richness, the fragmentation of tropical forests also affect seed dispersal service, which consequently may alter the structure of plant communities. / FAPESP: 2014/14739-0 / CNPq: 830816/1999-2
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Fragmentação de DNA em espermatozoides humanos com diferentes viscosidades no plasma seminal

Kussler, Ana Paula de Souza January 2012 (has links)
Introdução: Doze a 29 % dos ejaculados tem viscosidade seminal aumentada. Uma das técnicas recomendadas para diminuir a viscosidade do sêmen consiste num processo físico em que se passa o sêmen, 4 vezes, por uma seringa de 10 mL com agulha 18G. Ao fim desse processo, ter-se-ia modificado o comportamento molecular das fibrilas protéicas do esperma, tornando-o mais liquefeito, sem dano aparente a morfologia ou motilidade dos espermatozoides. Atualmente, discute-se sobre a total inocuidade desta técnica, uma vez que ela poderia provocar aumento da fragmentação do DNA dos espermatozoides. A hiperviscosidade seminal, além de reduzir a concentração e a motilidade dos espermatozoides, pode afetar a capacitação e a reação acrossômica, podendo ter implicações na integridade do DNA e no desenvolvimento embrionário normal. Objetivo: Comparar a fragmentação do DNA de espermatozoides humanos em amostras com viscosidade diminuída, fisiológica e aumentada, e avaliar se o processo de expulsão do sêmen através da agulha e seringa altera significativamente as taxas de fragmentação do DNA dos espermatozoides. Método: Após a coleta e avaliação dos parâmetros seminais das amostras de sêmen, aquelas que estiverem com viscosidade aumentada passarão pelo processo de expulsão através da seringa de 10 mL com agulha 18G por 4 vezes, para diminuir a viscosidade seminal. Posteriormente, serão feitas análises da fragmentação do DNA dos espermatozoides através da técnica de TUNEL em todas as amostras. Resultados: A fragmentação do DNA entre amostras com viscosidade fisiológica, diminuída e aumentada não apresentou diferença estatisticamente significativa (P=0,857). A fragmentação do DNA aumentou significativamente (P=0,035) nas amostras com viscosidade aumentada após passar na seringa e agulha quando comparadas com as mesmas amostras antes de passar pela mesma. Conclusão: O processo de expulsão do sêmen através de seringa e agulha visando redução da viscosidade seminal aumenta a fragmentação do DNA no espermatozoide, devendo este processo ser substituído por um processo inócuo. / Background: Twelve to 29 % of the ejaculated have the semen viscosity increased. One of the techniques recommended to decrease the viscosity of semen is a physical process in which the semen passes four times through a 10mL syringe with a 18G needle. At the end of this process would have modified the molecular behavior of the protein fibrils of the sperm making it more liquefied, without apparent damage to the morphology or motility of spermatozoa. Currently, the debate is about the complete safety of this technique since it could result in increased DNA fragmentation of spermatozoa. The seminal viscosity moreover reduces the concentration and motility of sperm, can affect the capacitation and acrosome reaction which may have implications for DNA integrity and normal embryonic development. Objective: To compare the DNA fragmentation in human semen samples with reduced, physiological and increased viscosity and evaluate if the process of expulsion of semen through the needle and syringe significantly alter rates of sperm DNA fragmentation. Methods: After collecting and evaluating semen parameters of semen samples, those that are with increased viscosity will pass through the process of expulsion through the 10 mL syringe with a 18G needle four times to reduce the viscosity of semen. After that, analysis of spermatozoa DNA fragmentation through the TUNEL technique will be made in all samples. Results: The fragmentation of DNA between samples with physiological, reduced and increased viscosity is not statistically significant (P=0.857). The DNA fragmentation increased significantly (P=0.035) in samples with increased viscosity after passing the syringe and needle when compared with the same samples before going through the same. Conclusion: The process of expulsion of semen through a syringe and needle in order to reduce the semen viscosity increases the DNA fragmentation in sperm, and this shall be replaced by a harmless process.
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Investigation into the contribution of the MC-DC process on microstructural evolution of direct chill cast round ingots of 6XXX series aluminium alloys with an aim to reduce homogenisation

Jones, Simon John January 2014 (has links)
Aluminium applications can be found in the vast majority of industries – particularly the automotive, aerospace and building sectors. Light weight, good corrosion resistance, high strength with good machining and weldability has led 6xxx series alloy to be the most widely used for extrusion products. Semi-continuous direct-chill (DC) casting is a well established process and the most widely used in the production of wrought aluminium extrusion billets. The techniques have continuously evolved since its invention in the 1930s. To ensure high productivity and a quality billet by DC casting, grain refiners are added during casting prior to solidification. It is efficient, cost effective and considered optimized in modern production techniques. However, some problems still persist, for example, macrosegregation, centerline cracking, porosity, hot tearing, etc. For surface finish critical products, particles in added grain refiners may cause surface defects during downstream processing. Additions of grain refiners are also not desirable for recycling of the end use products. As a novel DC casting technology, the melt conditioned DC casting (MC-DC) technology is developed to achieve uniform fine equiaxed grains without deliberate additions of grain refiners. The MC-DC process is implemented by submerging a rotor-stator high shear device into the mould assembly of a conventional hot-top vertical DC caster. In this work, the fundamentals of MC-DC process has been investigated by studying the flow patterns in the sump using computer modelling in combination with thermal field measurement and delineation of the sump profile. Followed is the microstructural evolution of the MC-DC castings. Then the formation of Fe-bearing intermetallics which are critical to the arrangement of homogenisation treatment are presented. The grain refining mechanism by MC-DC is due to enhanced heterogeneous nucleation on dispersed oxides and grain fragments by intensive melt shearing, in combination with dendrite fragmentation and transportation in a uniform temperature and solute field. By optimising MC-DC parameters, alleviation of macrosegregation can be achieved even compared with DC-GR castings. Another finding is the correlation between grain structure and the distribution of the Fe-intermetallic particles. It has been demonstrated that equiaxed dendritic grains with fine secondary dendritic arm spacings achieved in MC-DC are preferred rather than finer granular grains in grain refined material. MC-DC also promotes the formation of α- Fe-bearing intermetallics. All these offer the potential for the reduction of homogenisation practices currently required as part of the DC process.
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Avaliação da influência da matriz no efeito de borda em fragmentos de floresta estacional semidecidual em Piracicaba-SP / Evaluation of the influence of the matrix on the edge effect in seasonal semideciduous forest fragments in Piracicaba-SP

Mariane Martins Rodrigues 02 February 2018 (has links)
O desmatamento se faz presente na história do Brasil desde a era colonial. Dados recentes evidenciam que o cenário só piorou nos últimos anos, especialmente no bioma da Mata Atlântica. No estado de São Paulo a cobertura por florestas decaiu de 80% para apenas 16,3% em um período de tempo relativamente curto. O processo de desmatamento resultou um grande arquipélago de pequenos fragmentos florestais sem conexão. Criou-se assim uma necessidade de se identificar os efeitos da fragmentação florestal e entender qual a relação existente entre esses remanescentes e o seu entorno. A importância dos efeitos da matriz circundante sobre os fragmentos tem implicação direta sobre as estratégias de conservação nas paisagens fragmentadas. Neste trabalho objetivou-se avaliar o efeito de borda de fragmentos florestais divididos em duas classes de tamanho e analisar como diferentes tipos de ocupação antrópica influenciam no estado de manutenção da biodiversidade e nos estoques de carbono, partindo do pressuposto de que diferentes tipos de matrizes influenciam o efeito de borda de maneira distinta. Foram analisadas as seguintes situações de interface: 1. cana-de-açúcar, 2. pastagem e 3. eucalipto, presentes no entorno de fragmentos de floresta Estacional Semidecidual localizados no município de Piracicaba-SP. O intuito desta pesquisa foi verificar quais situações são mais ou menos favoráveis à proteção do fragmento, verificando as alterações de estrutura, composição florística e estoques de carbono e biomassa. No contexto, analisou-se os principais mapeamentos existentes de uso e ocupação do solo do município de Piracicaba, verificando a porcentagem de áreas de floresta, cana-de-açúcar, pastagens e plantios monoculturais de eucalipto. Os fragmentos avaliados apresentaram claros indícios de efeito de borda até os 50 m. A interface de eucalipto apresentou maior riqueza de espécies e maior estabilidade de estoque de carbono na borda e no centro. Quanto à composição da paisagem, há a predominância do componente agropecuário no município de Piracicaba. A quase totalidade destes remanescentes estão circundados por estas ocupações, havendo pouca ou nenhuma conexão entre eles. Procura-se assim verificar a possibilidade de se utilizar as áreas de produção também como forma de preservação. / Deforestation is present in Brazil\'s history since colonial era. Recent data shows that the scenario has worsened in the last years, especially in the Atlantic Forest biome. In São Paulo the coverage by forests declined from 80% to only 16,3% over a relatively short time. The deforestation process resulted in a large archipelago of small forest fragments with no connection. Thus, has created a need to identify the effects of forest fragmentation and understand which is the relationship between these remains and their surrounding. The importance of the effects of the surrounding matrix on the fragments have direct implications on strategies for conservation in fragmented landscapes. This study aimed to evaluate the effect of edge of forest fragments divided into two size classes and analyze how different types of anthropic occupation influence in maintenance of biodiversity and carbon stocks, on the assumption that different types of matrices influence the effect of edge differently. The following interface situations was analyzed: 1. sugar cane, 2. grassland and 3. eucalyptus, present in around of seasonal semideciduous forest fragments, located in Piracicaba-SP. The purpose of this research was to verify which situations are more or less favorable to the protection of the fragment, checking the structural alterations, floristic composition and carbon and biomass\' stocks. In addition, was analyzed the main mapping of land use and occupation of the municipality of Piracicaba, verifying the percentage of areas of forest, sugarcane, pasture and monoculture eucalyptus plantations. The fragments evaluated presented clear signs of edge effect up to 50 m. The eucalyptus interface presented greater species richness and greater stability of carbon stock at the edge and at the center. Regarding the composition of the landscape, there is predominance of the agricultural component (sugar cane and pasture) in the municipality of Piracicaba. Almost all of these remnants are surrounded by these occupations, with little or no connection between them. This study seeks to verify the possibility of using the production areas also as a way of preservation.
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Pequenos mamíferos em um mosaico de habitats remanescentes e antropogênicos: qualidade da matriz e conectividade em uma paisagem fragmentada da Mata Atlântica / Small mammals in a mosaic of remnant and anthropogenic habitats: matrix quality and connectivity in a fragmented Atlantic forest landscape

Fabiana Umetsu 18 November 2005 (has links)
Esta dissertação fez parte do projeto temático “Conservação da Biodiversidade em Paisagens Fragmentadas no Planalto Atlântico de São Paulo”, que teve como objetivo geral estudar os efeitos da fragmentação da Mata Atlântica sobre diversas comunidades e processos ecológicos na região de Caucaia do Alto, SP. A dissertação está dividida em três capítulos centrais e duas abordagens principais. A primeira delas utilizou dados coletados por mim e outros pesquisadores com o objetivo de testar o uso de uma metodologia de captura de pequenos mamíferos relativamente nova e pouco utilizada nos trópicos, comparando a sua eficiência com a da metodologia mais tradicional de coleta de dados sobre estes animais (capítulo 2). Estudos recentes demonstram que a matriz, conjunto de ambientes alterados que circundam os remanescentes em paisagens fragmentadas, considerada inicialmente inóspita e homogênea, funciona como um mosaico de unidades com diferentes permeabilidades ao deslocamento ou à ocorrência das espécies. Dentro deste contexto, a segunda abordagem desta dissertação corresponde à descrição e comparação do uso, pelos pequenos mamíferos, dos ambientes alterados que envolvem os remanescentes de floresta (capítulo 3) e à utilização deste tipo de informação para o estudo da influência da estrutura da paisagem sobre a distribuição de espécies (capítulo 4). No capítulo 2, para avaliar a eficiência e a congruência entre tipos de armadilhas, amostramos a comunidade de pequenos mamíferos de forma padronizada usando armadilhas Sherman e de queda em 26 sítios, 20 localizados em fragmentos florestais e seis em floresta contínua. Os resultados sugerem que armadilhas de queda, quando constituídas por baldes grandes e profundos e utilizadas nas épocas chuvosas e quentes, não só complementam a diversidade encontrada com o uso de armadilhas tradicionais, como podem triplicar a riqueza por sítio de amostragem, incluindo espécies raras, de hábitos semi-fossoriais e espécies escansoriais/arborícolas geralmente não atraídas pela isca das armadilhas tradicionais. Apesar das diferenças de eficiência, os resultados sugerem que os dados obtidos com os dois tipos de armadilhas são congruentes e que variações de diversidade e abundância entre sítios são semelhantes entre os métodos. As armadilhas de queda também parecem ser essenciais em estudos demográficos, já que capturam indivíduos em uma amplitude maior de peso, incluindo os jovens, raramente capturados nas armadilhas tradicionais. No capítulo 3, para avaliar a qualidade da matriz para os pequenos mamíferos na região de Caucaia do Alto, utilizamos os dados de amostragens padronizadas realizadas em 23 sítios, sete localizados em remanescentes florestais (floresta contínua e fragmentos) e 16 distribuídos nos quatro tipos predominantes de habitats da matriz (vegetação nativa em estádios iniciais de regeneração, plantações de eucalipto, áreas de agricultura e áreas rurais com construções). Houve forte segregação na comunidade de pequenos mamíferos entre a vegetação nativa e demais habitats, indicando a capacidade extremamente reduzida das espécies florestais de ocupar habitats antropogênicos. A vegetação nativa em estádios iniciais apresentou uma razoável permeabilidade para as espécies florestais, sugerindo o potencial da regeneração natural para a restauração de paisagens fragmentadas de Mata Atlântica. Os habitats antropogênicos foram dominados por espécies generalistas, exóticas ou típicas de biomas abertos, sugerindo que paisagens muito alteradas possam ser dominadas por estas espécies, com conseqüências para a regeneração das florestas e para a saúde humana. No capítulo 4, a partir dos resultados da distribuição das espécies de pequenos mamíferos nos habitats do mosaico, informações sobre a qualidade destes habitats foram utilizadas na avaliação da influência da estrutura da paisagem sobre a ocorrência das espécies em 20 fragmentos florestais, com o objetivo de comparar o poder explanatório de métricas que consideram ou não a qualidade da matriz e investigar a importância da escala espacial. Os resultados indicam que a influência da estrutura da paisagem é maior para as espécies que não ocorrem na matriz, ou entre as que ocorrem, para aquelas que não ocupam todos os ambientes da paisagem. Em geral, os modelos com as métricas que consideram a qualidade da matriz apresentaram maior poder explanatório sobre a distribuição das espécies nos fragmentos. Dentre as métricas que consideram a qualidade da matriz, aquelas que incorporam a distância entre as diferentes manchas de habitat mostraram vantagens em relação às que consideram apenas a área das manchas, pois apresentaram maior poder explanatório sobre a ocorrência de um maior número de espécies e menor variação do poder explanatório em relação a mudanças na escala espacial considerada. Esta ultima característica é importante dada a falta de uniformidade observada na resposta das espécies à variação da escala espacial e a escassez de informações que embasem a escolha de escalas espaciais adequadas para espécies tropicais. / This dissertation was developed as part of the thematic project “Biodiversity Conservation in Fragmented Landscapes at the Atlantic Plateau of São Paulo”, which aimed at studying the effects of the fragmentation of the Atlantic forest on several communities and ecological processes in Caucaia do Alto, SP. This dissertation is divided in two main approaches that comprise three chapters. In the first approach, I used data collected by myself and by other researchers with the objective of testing the use of a relatively new and little explored methodology to capture small mammals in the tropics, comparing its efficiency to the methodology that is tradicionally ised to collect data about these animals (chapter 2). Recent studies have shown that the matrix of altered habitats surrounding remnants in fragmented landscapes, considered initially as inhospitable and homogeneous, act as a mosaic of units presenting different degrees of permeability to the movement or to the occurrence of species. Within this context, the second approach of this dissertation concerns the description and comparison of use of the altered habitats surrounding forest remnants by small mammals (chapter 3) and to the use of this type of information for the study of the influence of landscape structure on species distribution (chapter 4). In chapter 2, aiming at the evaluation of the efficiency and congruence of different types of traps, we sampled the small mammal community using a standardized procedure, with Sherman and pitfall traps in 26 study sites, 20 located in forest fragments and six in the continuous forest. Results suggest that large and deep enough pitfall traps used during wet and warm periods, not only complement the diversity found using traditional traps, but also leads to an considerable increase in the number of species found at each study site, including rare species, semi-fossorial species and scansorial/arboreal species that are usually not attracted to the bait used in traditional traps. Despite differences in efficiency, results suggest that data gathered with the two types of traps are congruent and that the variation in diversity and abundance among study sites is similar between the two methods. Pitfall traps also seem to be essential in demographic studies because they are able to capture individuals within a larger range of weights, including young individuals, which are rarely captured using traditional traps. In the chapter 3, to evaluate matrix quality for the small mammals in Caucaia do Alto, we used data from standardized sampling in 23 study sites, seven of which were located in forest remnants (continuous and fragmented forest) and 16 were distributed in the four main types of matrix habitats (native vegetation in initial stages of regeneration, eucalyptus plantation, areas of agriculture and rural areas with buildings). There was a strong segregation in the small mammal community between native vegetation and the other habitats, indicating the extremely low capacity of forest species to occupy anthropogenic habitats. Native vegetation in initial stages presented a reasonable permeability to forest species, suggesting the potential of natural regeneration to restore fragmented Atlantic forest landscapes. Anthropogenic habitats were dominated by generalist species, exotic species or species that are typical from open biomes, suggesting that highly altered landscapes may be dominated by these species, with consequences to forest regeneration and to human health. In chapter 4, using the results of the distribution of the small mammal species in the habitats of the mosaic, information on the quality of these habitats was applied in the evaluation of the influence of landscape structure on the occurrence of species in 20 forest fragments, aiming to compare the explanatory power of metrics that consider or not matrix quality and to investigate the importance of spatial scale. Results indicate that the influence of landscape structure is stronger for species that do not occur in the matrix, or for species that do not occur in all habitats in the mosaic. In general, the models using metrics that consider matrix quality presented higher explanatory power on the distribution of species. Among the metrics that consider matrix quality, those that incorporate distance among different habitat patches presented advantages in relation to those that consider only patch area, because they presented a higher explanatory power to the occurrence of a larger number of species and lower variation in the explanatory power in relation to changes in spatial scale. The later characteristic is important given the lack of uniformity observed in species response to variations in spatial scale, and the scarcity of information that could support the choice of adequate spatial scales for tropical species.
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Alterações no uso de hábitat por aves de subosque em paisagens fragmentadas / Change in habitat use by understory birds in fragmented landscapes

Júlia Ferrúa dos Santos 29 July 2016 (has links)
Os efeitos da perda de hábitat e da fragmentação já estão bem estabelecidos na literatura, porém pouco se sabe sobre como o uso do habitat pode ser modificado em função de alterações na quantidade e na qualidade da mata. Este trabalho tem como objetivo compreender melhor como a perda e modificação do hábitat afeta o uso do espaço pelas aves de subosque na escala da comunidade e população. Para isso, utilizamos um banco de dados de aves, que inclui informação sobre captura e recaptura de 2.121 indivíduos, coletados em um gradiente de cobertura florestal, com fragmentos de 2,85 ha a 10.000 ha, localizados em Mata Atlântica no estado de São Paulo. As análises foram feitas por espécie, por grupos de espécies de acordo com guilda trófica e grau de sensibilidade a alterações antrópicas, e para a comunidade de forma geral. Para testar se a qualidade da vegetação influencia a abundância e frequência de uso do espaço, utilizamos dados de três áreas de florestas contínuas, com diferentes níveis de alteração (floresta secundária, mata com corte seletivo e mata madura). Observamos que, apesar de haver uma queda na abundância total da comunidade em fragmentos pequenos, há um aumento na frequência de uso do ambiente, evidenciado pelo aumento na taxa de recaptura com a perda de habitat. O mesmo padrão foi encontrado para aves com média sensibilidade, frugívoras e insetívoras. Aves com baixa sensibilidade, no entanto, mostraram maiores abundancia e taxa de recaptura em fragmentos menores e áreas mais desmatadas. Verificamos também que a frequência de uso do espaço foi maior em floresta secundária, bem como a abundância de aves. Nossos resultados sugerem que além de conduzir a uma perda de espécies e de indivíduos, a perda de hábitat também leva ao aumento na intensidade do uso do habitat. Este aumento se dá em particular para espécies de média sensibilidade, uma vez que espécies com alta sensibilidade estão ausentes de fragmentos pequenos. Observamos que, além da matriz como barreira à dispersão, a própria qualidade da mata se apresenta como um fator que modifica o uso do habitat. Esta variação no uso do habitat pode impedir que as mesmas desenvolvam seu papel de dispersores de sementes entre os fragmentos. Por fim, estudos sobre uso do espaço hoje praticamente não abordam a intensidade com que o hábitat é utilizado pelos indivíduos, sendo uma informação importante que pode ser facilmente estudada através de dados de captura e recaptura, geralmente subutilizados / The effects of habitat loss and fragmentation area well established in the literature, however not much is known about how habitat use can be modified due to alterations in habitat quantity and quality. This work aims to understand how habitat loss and changes to habitat quality affects the habitat use by understory birds at the community and population level. We analysed a database, which includes capture and recapture data from 2.121 individuals, of birds sampled along a gradient of Atlantic Forest cover and fragment size varying from 2,85 ha to 10.000 ha in the São Paulo State. We analysed data by species, by groups of species according to their trophic guilds and sensitivity to habitat change, and at the community level. To test if the quality of vegetation affects species abundance and the intensity of habitat use, we used data from three continuous forests, with different levels of habitat modification (secondary forest, forest selective logged and mature forest). Our results show that, although the total species abundance decreased in small fragments, the intensity of habitat use increases, as shown by the increase in recapture rates with habitat loss. This pattern was observed for birds with high and medium sensitivity, frugivorous and insectivorous. Species with low sensitivity, however, showed higher species abundance and recapture rate in small fragments. We also show that the frequency of habitat use was higher in secondary forest, as was the abundance of individuals. Our results suggest that habitat loss not only leads to smaller populations, but it also modifies the intensity of habitat use. This pattern was mostly observed for species with medium levels of sensitivity, as highly sensitive species were no longer present in small patches. Our results indicate that the matrix may act as a barrier for dispersal, but habitat quality may also further influence habitat use. This variation in habitat use can affect birds ability to disperse seeds between the fragments. Finally, studies of habitat use almost never focuses on the intensity of habitat use, even though this information can be easily evaluated using capture and recapture data, with the latter being usually underused

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